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Visita guiada por el sólido sistema de enseñanza de bioquímica de McKee Los ensayos "Bioquímica en perspectiva" muestran la relevancia en el mundo real de los procesos bioquímicos estudiados. La cuarta edición incluye más de una docena de ensayos nuevos, que ahora comienzan con una pregunta que estimula el pensamiento y concluyen con un resumen de conceptos. , \ , , , \ 164 CAPíTULO CINCO Aminoácidos, pépt idosyproteinas BIO QuíMICA EN PERSPECTIVA Plegamiento de proteínas y enfermedades humanas ¿Cuáles son los efectos del plegamiento in- correcto de proteínas en la salud humana? La acumulación de protnas mal plegadas insolubles es una canlc- terística importante de varias enfermedades ncurudcgencrati vas de l se r humano. Las enrcnnedaucs de Alzhe imcr y de HUlltington son ejemplos nnwbles. ¡\ pesar de las dircn::n.: ias en los sucesos que las ¡nióan. de las zonas cspedlkas del cerebro que son arec- tadas y de los síntomas. ambas tienen en cOImín procesos disfun- cionulcs destructores de lulas inici,¡dos por proteínas tóxicas . Una car acter íst ica dav\! dd in icio de la enfe rmedad es kl conver- sión de la estructura proteínica normal. 1l1;b; a IIl enudo li ces a y enrollmnicntos aleatorios. en \:onformaciones de l¡Ímina plegada fJ anonnul es. A co nt inuan Se presl! nta un reS Ulll en de las basl:s mol eculares L1e cada trastorno. Enfermedad de Alzheimer La enfermedad de Alzhe imcr (AD) es una afección progresiva y le tal q ue se caracteriza por deterioro intelectual grave. Ln AD se manifiesta inicialmente L 'on breves lapsos de pérdida de la memo- ri a. Con el tiempo. dete ri oro grave de la memoria, desor ientación la edad madura). La AD es porádica súele diagnos li cardespués de los 65 años de edad. Los genes vinculados con las formas fam il iares (hereditarias) de la AD cod ifi can versiones 111lllantcs de 1 ,1 APP. presenilina I (PS 1), presen ilina 2 (PS2) y apolipoproteína E4 (pág. 392). La APP es una proteína truns- mCl llbrana con funci ón de sconocida qlle tiene una gran región extrace lular, la cual ex perimenta varias reacciones de procesa- mi ento prO!eolítico. PS I y PS2 son cu mponentes de la secretasa y. una dc varias prut casas que intcrv it!ncn en el procesamiento de la APP. Las \!n los gcnes de la APP, de lu PS I y de la PS 2 se: han relacionado con la libe r;1ción de los fragmentos tóx icos AtJ40 y Afj42. Siguen si n di lucidarse los meca ni s mos por los <:ua les los pacientes con AD desarroll an la rorma es- por{¡ dicól de la enfermedad en ausencia de factores de riesgo conocidos. Enfermedad de Huntington 1 ,Y acompañan a .una pérdida de personal.idad del Los recuadros " Métodos - -- bioquímicos" introducen al lector a técnicas de investigación modernas y clásicas, lo cual refuerza la teoría que asevera que ¡la mejor manera de aprender ciencias, es haciendo ciencia! " es de la RESUMEN: La acumulac ión de prote inas mal plegadas impide el funcionamiento celular. C on el tiempo los agregados proteinicos causan la muerte de la lula . '\bilidades ia progrc- . frontales 172 C APi TULO CINCO Aminoácidos,péptidosyproteínas MÉTODOS BIO QuíMICOS Tecnología de proteínas L os seres vivos producen una impresionante vi\ried;1c! de pro- teínas. Como resu lt ado. no es sorprendente que se hayan dedicado tiempo. es fuerzo y fondos considerables a inves- tigar sus propiedades. Desde que Fredcrick Sanger delerminó la secuencia de la insulina bovina en 1 953. se han dilucidado las es tructuras de mil es de protcínas. En contraste con los 10 años que se requirieron para secu\!n- ciar la insulina. las tecnologías actuales per mi ten dete1l11inar la secuencia de aminoácidos de una pruteína en unos L"lIantos tlías. Además de lmélodo d ... degradación (h: Edll1an y de: la espt'ctro- metría de masas. t's pos ib le ge ne:rar 1;1 sel·ucnci .. de residuos de un a proteína a p;ln ir dI.! s u sCl'llenc ia Je DNA o de IllR N¡\ si se d is pone de es t'l inl"onmll'ión. Después de un brcn: repaso dc los m¿todos de puriíiL·iII.:iün de proteína): . aquí des er ibidn el mé- lodo de dt:g radaci6n Jc Edma n y la .. de 1ll.)sas. Ob- serves!! que todas las tec nicas para aislar. purificar y caracterizar protcínllS aprovecban l'ls diferencias de carg.a. el peso molecular y las afin idades de unión . Muchas de estas tec nologías se aplican a la inves ti gación de otras bioilloJécuJas. Purificació n El unálisis de prOleínas comienza con e l ai slami ento y la puri- ficación. La extracción de una proteína requiere la rQlura y la homogenci zación de la l'élula todos bioquímicos: tec- nología ce lular. en el enp. 2). A menudo este pruceso es segu ido por L'entrifugación diferencial y. si ia prOleína es un componente de un organclo. por centrifugución en gradiente de densidad. Tras ob!ener 1 .. fracci ón que contiene la prote ína, para potenciar la pu- rificación pueden ulilizarse varios métodos relativamente crudos. La precipitnción de proteínas por medio de sales es una técni- ca e n la que se utilizan concentrac iones elevadas de sales como el sulfato de amonio [(NHolhSOol]' Debido <l que cadu proteína codifica onocida y En todos los lllél0dos L'romatográficos, la mezcla proteínica se disuelve en un líquido conocido C0l110 fase móvil. Al pasar las proteínas a través de la fase estacionaria (una matriz sólida), se separan unas de o!ras debido a su distrihución direrente entre las dos fases. El movimiento relativo de cad¡.l molécula es con- sec uenL'ia de su capnL·idad para pe nnanece r asociada con la fase mientras que continúa nu ycndo la fase móvi l. Los tres me lodos crolllalográlicns que se emplean de forma habitua l en la puri fk'ac ióll de protC'Ínns son la cromatografía de lilt ración cn gdcs. la cronwtograría de intercambio iónico y la cromatografía por atinitlad. La c rumat ografíu de filtración en geles (Fig. 5D) es un a forma de croma tografía por exclusión de tamaños la c ual una columna empaquetada con un polímero gelatinoso sepa ra a las lllol éculas scg lín su l¡¡mallO y su forma. Las moleculas que son mayores que los poros del gel quedan excluidas y por lo tal110 Sl.! llluewn co n rap idez a través de la co lu mna. Las mol él..: ulas que son más pequeñas que los poros del gel se difunden dentro y fuera de los poros. de forma que se ret rasa su movimiento a tra vés de la co lumna. Las diferencias de estas velocidades separan 1:1 mezL"la de proteínas cn handas. que se recogen separadas La cromatognllía de int crclIl1lbio ió nico SCpilr<l las proteí- lIas según su carga. Las resi nas dc interL·alllbio a ni ónico. que es- tán furmadas por material es con l'arga posit iva, se unen de for ma reversible co n los grupos con carga negativa de una proteína. De igual forma. las resinas de int ercambio catió ni co se unen a los grupos co n carga positiva. Tras eliminar las proteínas que 11 0 se 1 1<111 uni do a la rcsinn. se recupera In protna de interés por medio de un cambio adecuado del pH del solvente y de la concentración s<l lina, o de ambos. (Un cambio de pH a lt era la carga neta de la proteína.) La cromatografía por afinidad utili za las singulares propie- XXI

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Visita guiada por el sólido sistema de enseñanza de bioquímica de McKee

Los ensayos "Bioquímica en perspectiva" muestran la relevancia en el mundo real de los procesos bioquímicos estudiados. La cuarta edición incluye más de una docena de ensayos nuevos, que ahora comienzan con una pregunta que estimula el pensamiento y concluyen con un resumen de conceptos.

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164 CAPíTULO CINCO Aminoácidos, péptidosyproteinas

BIOQuíMICA EN PERSPECTIVA

Plegamiento de proteínas y enfermedades humanas ¿Cuáles son los efectos del plegamiento in­correcto de proteínas en la salud humana? La acumu lación de proteínas mal plegadas insol ubles es una canlc­terística importante de varias en fermedades ncurudcgencrati vas de l se r humano. Las enrcnnedaucs de Alzhe imcr y de HUllt i ngton

son ejemplos nnwbles. ¡\ pesar de las dircn::n.: ias en los sucesos que las ¡nióan. de las zonas cspedlkas del cerebro que son arec­tadas y de los síntomas. ambas tienen en cOImín procesos disfun­

cionulcs destructores de cé lulas inici,¡dos por proteínas tóx icas . Una característ ica dav\! dd in icio de la enfe rmedad es kl conver­sión de la estructura proteínica normal. 1l1 ;b; a IIl enudo hé li ces a y enrollmnicntos aleatorios. en \:on formacio nes de l¡Ímina plegada fJ anonnules. A co nt inuadón Se presl!nta un reS Ulllen de las basl:s moleculares L1e cada trastorno.

Enfermedad de Alzheimer La enfermedad de Alzheimcr (AD) es una afección progresiva y le tal que se carac te riza por deterioro intelectual grave. Ln AD se manifiesta inicialmente L'on breves lapsos de pérdida de la memo­ri a. Con el tiempo. dete rioro grave de la memoria, desorientación

la edad madura). La AD esporádica súele diagnoslicarsé después de los 65 años de edad. Los genes vinculados con las formas fam il iares (hereditarias) de la AD cod ifican vers io nes 111lllantcs de 1,1 APP. presenil ina I (PS 1), presen ilina 2 (PS2) y apolipoproteína E4 (pág. 392). La APP es una proteína truns­mCl llbrana con función desconocida qlle tiene un a gran región extrace lular, la cual ex perimenta varias reacciones de procesa­miento prO!eolítico. PS I y PS2 son cumponentes de la sec retasa y. una dc varias prutcasas que intcrv it!ncn en el procesamiento de la APP. Las nltll~cioncs \!n los gcnes de la APP, de lu PS I y de la PS 2 se: han re lacionado con la libe r;1c ión de los fragmentos tóx icos AtJ40 y Afj42. Siguen si n di lucidarse los mecani smos por los <:ua les los pacientes con A D desarroll an la rorma es­por{¡dicól de la enfe rmedad en ausenc ia de factores de riesgo conocidos.

Enfermedad de Huntington 1 ,Y a~ itación acompañan a .una pérdida to.t~1 de .~a personal.idad del r-~~--~----~~~~~~~~~~~~-iliili-~~~-=~~~~~~~Ld~~~~~~~~~~ grupode

Los recuadros "Métodos - - - ~. bioquímicos" introducen al lector a técnicas de investigación modernas y clásicas, lo cual refuerza la teoría que asevera que ¡la mejor manera de aprender ciencias, es haciendo ciencia!

" es de la RESUMEN: La acumulac ión de proteinas mal plegadas impide el funcionamiento celular. Con el tiempo los agregados proteinicos causan la muerte de la célula .

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172 C APiTULO CINCO Aminoácidos,péptidosyproteínas

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MÉTODOS BIOQuíMICOS Tecnología de proteínas

Los seres vivos producen una impres ionante vi\ried;1c! de pro­te ínas. Como resu ltado. no es sorprendente que se hayan dedicado tiempo. es fuerzo y fondos considerables a inves­

tigar sus propiedades. Desde que Fredcrick Sanger delerminó la secuencia de la insul ina bov ina en 1953. se han diluc idado las estructuras de miles de protcínas.

En con traste con los 10 años que se req uirieron para secu\!n­ciar la insulina. las tecnologías actuales permi ten dete1l11inar la secuenc ia de aminoácidos de una pruteína en unos L"lIantos tlías. Ade más de lmélodo d ... degradación (h: Edll1an y de: la espt'ctro­metría de masas. t's pos ible ge ne:rar 1;1 sel·ucnc i .. de resi duos de un a prote ína a p;ln ir dI.! s u sCl'llenc ia Je DNA o de IllR N¡\ s i se d ispone de est'l inl"onmll'ión. Después de un brcn: repaso dc los m¿todos de puriíiL·iII.:iün de proteína): . aquí ~e deseribidn e l mé­

lodo de dt:g radaci6n Jc Edma n y la ~spectrolllelr í .. de 1ll.)sas. Ob­serves!! que todas las tecnicas para ais lar. purificar y caracterizar protc ínllS aprovecban l'ls diferencias de carg.a. el peso molec ular y las afin idades de unión . Muchas de estas tecnologías se aplican a la investi gación de otras bioilloJécuJas.

Purificación El unális is de prOleínas comienza con e l ai slamiento y la pu ri­ficación. La ex tracción de una proteína req uiere la rQlura y la homogencización de la l'élula (\'¿as~ Métodos bioquímicos: tec­nología ce lular. en el enp. 2). A menudo este pruceso es segu ido por L'entrifugació n dife renc ial y. s i ia prOleína es un componente de un organclo. por centrifugución en gradi ente de densidad. Tras ob!ener 1 .. fracci ón que contiene la prote ína, para potenc iar la pu­rificac ión pueden ulilizarse varios métodos relativamente crudos. La precipitnción de proteínas por medio de sales es una técni­ca en la que se utilizan concentrac iones elevadas de sales como

e l sulfato de amonio [(NHolhSOol] ' Debido <l que cadu proteína

codifica onocida y

En todos los lllél0dos L'romatográficos, la mezcla proteínica se d isuelve en un líqu ido conocido C0l110 fase móvil. Al pasar las proteínas a través de la fase estacionaria (una matriz sólida), se se paran unas de o!ras debido a su di strihución direrente entre las dos fases. El movimiento relativo de cad¡.l molécula es con­secuenL'ia de su capnL·idad para pennanece r asociada con la fase e~tacion aria mientras que cont inúa nu ycndo la fase móvi l.

Los tres me lodos crolllalográlicns que se emplean de forma habitua l en la puri fk'ac ióll de protC'Ínns son la cromatografía de lilt ración cn gdcs. la cronwtogra ría de intercambio iónico y la cromatografía por atin itlad . La crumatografíu de filtración en geles (Fig. 5D) es un a forma de croma tog rafía por excl usión de tamaños ~n la cual una colum na empaque tada con un polímero gelatinoso sepa ra a las llloléculas scg lín su l¡¡mallO y su forma. Las molecu las que son mayores que los poros del gel quedan excl uidas y por lo tal110 Sl.! llluewn con rap idez a través de la co lu mna. Las mol él..:ulas que son más pequeñas que los poros del ge l se difunden dentro y fuera de los poros. de forma que se ret rasa su movimiento a tra vés de la co lumna. Las di fe renc ias de estas velocidades separan 1:1 mezL"la de proteínas cn handas. que se recogen separadas

La cromatognllía de intcrclIl1lbio iónico SCpilr<l las proteí­lIas según su carga. Las resi nas dc interL·alllbio ani ónico. que es­tán fu rmadas por materiales con l'arga posit iva, se unen de forma reve rs ible con los grupos con carga negativa de una proteína. De igual fo rma. las res inas de intercambio catió nico se unen a los grupos con carga positiva. Tras e liminar las proteínas que 11 0 se 11<111 unido a la rcsi nn . se rec upera In proteína de interés por medio de un cambio adecuado de l pH del solvente y de la concentración s<l lina , o de ambos. (Un cambio de pH a ltera la carga neta de la proteína.)

La cromatografía por afinidad utili za las singulares propie-

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El incomparable sistema de resolución de . problemas le proporciona al lector múltiples oportunidades y métodos para desarrollar sólidas habilidades analíticas.

los problemas resueltos que se encuentran en el libro llevan al lector paso por paso a través de las soluciones de cada problema.

Cientos de Preguntas - - - - - - • incluidas en el texto utilizan situaciones aplicables en el mundo real para fomentar el interés del lector y estimular pensamientos más profundos sobre los principios bioquímicos.

134 CAPíTULO CINCO Aminoácidos, péptidos y proteínas

;;rr PROBLEMA 5 .1 Considérese el siguiente aminoácido y sus valores de pKa:

~ Ha- fi-CH,-CH'-iH-c-aH

a +NH3

pKol = 2.19, pK,z = 9.67, pK'R = 4.25 a. Dibújese la estructura del aminoácido al cambiar el pH de la di solución de muy ác ido a muy básico.

Solución (a) a a

HO-C- CH - CH - cH - g -aH ~ Ha-C-CH -CH - CH-g-O-11 2 2 1 11 ' '1 o +NH

3 o +NH:3

a a

~-a-C-CH -CH-cH-g-a-~ - a -C-CH-CH-cH-g-a-11 2 '1 1 2 2 1 o +N H3 o NH2

Los hidrógenos ionizables se pierden en el orden de la acidez. ion izándose primero los más ácidos. b. ¿Qué fOfma del aminoácido se observa en el punto isocléctrico?

Solución (b)

PREGUNTA 5.4rl'

En los líquidos extracelulares , como la sangre (pH de 7.2 a 7.4) y la orina (pH 6.5 ). los gmpos su lfhidrilo de la cisteína (pKa 8.1) están protonados y experimentan oxi­dación para formar cistina. En Jos péptidos y en las proteínas. e l carácter nuc!cólilo de los grupos tiol pro tonados libres se aprovecha para estabil izar la es tructura pro­teínica y en reacciones de transferencia de tiol. no obstante tos aminoácidos libres en los líquidos hísticos pueden ser problemáticos debido a la baja solubilidad de la cistina. En una enfermedad genética denominada cislill/./ria , el transporte defectuoso de la cistina a través de la membrana o rigina una eliminación excesiva de cist ina en la orina. La cristalización del amino,icido produce la formación de cálculos (piedras) en tos riñones. e n los uréteres o en la vej iga urinaria. Los c¡ílculos pueden producir dolor. infecc iones y hematuria. La concentración de cisl ina en el riñón se reduce aumentando de forma masiva la ingestión de líquidos y la administración de penici­lamina lJ. Se cree que la pcnicilamina (Í'ig. 5. 14) es eficaz debido a la formación del disulfuro de pcnicilamina-cistcína. que es sustancialmente más soluble que la cislina. ¿Cuúl es la estructura del disulfuro de penicilamina-cisteína?

iH3 ~ H3C-i-iH-c-aH

SH NH2

FIGURA 5 . 14

Estruclur'l de la penicilllminu

.1f Preguntas de revisión

Las Preguntas de revisión ;' que se encuentran al final de cada capítulQ permiten practicar las habilidades básicas adquiridas, mientras que las Preguntas para razonar representan un reto '- '­para recapacitar conceptos a través de los capítulos, evaluando la capacidad del lector para sintetizar el material estudiado.

XXII

;'

Estas pregHl!t(U eSllÍn disel1at!as para pone/' a prueba el cOllocimienTO del lector sohre tus conceptos dal'e expllestos en este capítl/lo, al/res de pasar al siguiellfe. Ellecror pllede comparar sus /'espuesws cOlllas sO{lIcirllles que .\'(' pmporciol/(l1/ al fl1/al del libro y ell la Guía de estlldio de apoyo, si tlsí lo desea.

l Escribase la diferencia ent re proteínas. péptidos y polipépti­dos. Indíquese cuáles de los s iguientes amino;:ícidos son polares. no polares, ácidos o bás it'Os: a. glicina b. tirosina c. ácido g lutámico d. histidina e. prolina

~ Preguntas para razonar

r. lisina g. cisteína h. asparag ina i. valina j . leucina

3. La arginina liene los va lores de pK. siguientes' pK, = 2.1 7. pK, = 9.04. pKII = 12.48 Establézcanse la estructura y la carga nela de la arginina a los valores de pH sigu ientes : 1, 4 , 7.10.12.

El objetivo de eSf{/.\' preglllltas es relo r:ar la (.'o /ll¡II't!lIsirín de rotlo.\' los concep fos c/allí' eXfJlu'stns ell ellihm f/{/Sf{¡ e/moJl/elllo. E.\'foC1ibl(' que /10 tengan sólo 1/1lt1 respllesw co/'recW. Los al/tores proporcionan soll/ciollC's posibles a estas preglllllas al filial del lihm y (,II/a Guía de estl/dio de apoyo. pl/m referellcia dc/lc(:ror

28. En el interior de las proteínas suele n encont rarse res iduos como la valina. la leuci na.l a isoleuc ina. la metionina y la renil ­alanina. mientras que la arginina. la li sina, t!1 .ícido aspártico y el ácido glulámico en general se encuentran en la superfic ie de las prote ínas. Sugiérasc un a razón para esta observílción. ¿Dónde se es peraría encol1trar gJu tamina. glicina y alanina?

29 Las proteínas que sintetizan los seres vivos adoptan una con­formación con actividad biológica. pero cuando estas proteínas se preparan en ellaboratorin normalmente no suelen adoptar de forma espontánea sus conformaciones activas. ¿Por qué?

30. El sitio activo de una enzima contiene secuencias que están conservadas debido a que participan en la actividad catalítica de la proteína. S in embargo. la masa de una enzima no es parte del sitio activo. Debido a que se requiere una cantidad ",,"n"¡,1 rl . ,nou,,,"

36. La Cfu imiotrips ina es una cnl.ima tjue divide a oLra s enzimas durante la secuenciación. ¿Por qué 11 0 se aLacan las moléculas de quimiotrips ina en tre sí'?

37. La mayoría de los amino.ícidos se lOman de co lor morado azulado cuando se trata n con el reacti vo ninh iJ rina. La prolina y la hidroxiprolina se hacen amarillas. Sugiérase una razón para esta diferencia.

3H. Cuando la protcína 1llultiru ll c iollal dcshidrogcnasa de glicera ldehído-J-rosrato de (G APD) cataliza una react:illll clave cn la glu t:ó li s is (una vía metabólica s ituada en el citoplasma). lo hace como un homotetrúl11ero (con cuatro subu nidadcs idénticas). El monómcro GAPD es una enzima de reparación del DNA nuclear. Descríballsc en términos generales las propiedades de la es tructura de l a~

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Proteína desnaturalizada

~ \.. hsp70

+-- ---------------- Las Figuras, atractivas y precisas, dan claridad a lo expuesto en el texto e ilustran importantes conceptos y pro­cesos que el lector necesitará saber para sus exámenes.

:~=l~ En to<!o el texto se han in­cluido Iconos conceptuales para indicar la cobertura de importantes aplicaciones bio­q"-ímicas. ,

," , Medicina

Complejo Protefna plegada proteínico hsp60

@;I AOP +-"'" t

F IGURA 5 .32

Chaperones moleculares

Los chaperones moleculares se unen de fomla transitoria a las proteínas nacientes y a las proteínas desplegadas (desnaturali7..ada.~ por condiciones agresivas). Los miembros de la familia hsp70 estabilizan las proteína.'I nacientes y reactivan algunas proteínas desnaturalizadas. Muchas proteínas requieren también las proteínas hsp60 p.'lra aJcaJ17..ar sus confommciones finales. Si una proteína no puede s.11varse, los chaperones moleculares ayudan a destruirla

" Mecanismo de regulación metabólica

Proteólisis (degradación) ~

TP r:{9jp AOP ~ '\

Proteína plegada

Aminoácidos, péptidos y proteínas

Sinopsis

Las Sinopsis ubicadas al prin­cipio de cada capítulo ayudan a concentrarse en el "panorama completo", mientras que los resúmenes, las lecturas reco­mendadas y las palabras cla­ve refuerzan los conocimientos adquiridos y fomentan investi­gaciones posteriores. ,

LAS PROTEiNAS SON CONSTITUYENTES ESENCIALES DE TODOS LOS ORGANISMOS.

LA MAYORiA DE LAS TAREAS QUE REALIZAN LAS CÉLULAS REQUIEREN PROTEiNAS,

Las cuales tienen una asombrosa diversidad de funci ones . Además de servir como materiales estructurales en todos los seres vivos (p. ej .. como componentes

estructurales en el músculo y en el tejido conjuntivo de animales o como componentes de la pared celular de las procariotas). las proteínas participan en funciones tan diversas como la regulación metabólica, el transporte, la defensa y la catál isis. La d iversidad funcional que exhibe eS la clase de biomoléculas está

relacionada de forma directa con las posibilidades de combinación de las unidades monoméricas, los 20 aminoácidos.

Palabras clave

ald iminas.OOO enanl iómeros. 000

alosterismo.ooo enfermedad de Alzheimer. 000

antígeno, 000 enfermedad de Huntington, 000

apoproteína,Ooo enfennedades moleculares, 000

bases de Sch iff. 000 enlaces peptídicos. 000

carbono asimétrico. 000 estereoisómcros.OOO

carbono quiral. 000 estructurá cuaternaria, 000

chaperones moleculares. 000 eSlrucmra primaria. 000

chaperoninas, /62 estructura secundaria. 000

condensación aldólica. 000 estructura supersecu ndaria. 000

cromatografía por afinidad. 000 estruct ura terciaria, 000

cromatografía de filtración en geles, 000

cromatografía de intercambio iónico, OOO

desnaturali zación. 000

dicroísmo ci rcu lar. 000

efectores. 000

electroforesis, 000

electroforesis en SOS-gel de poliacri1amida, ooo

elemento de respuesta, v

familias de proteínas. 000

fase estac ionari a, 000

fase móvi l. 000

fosfoprote(na.OOO

glóbulo fundido. 000

glucoproteínas, 000

grupo protésico, 000

hemoproteína. 000

hidrocarburo alifático, 000

hidrocarburo aromático. v

ho loprotcína. 000

honnonas, 000

hsp60,000

hsp70,000

isómeros ópt icos. 000

ligandos. 000

lipoprOleínas.OOO

metaloprotefnas, 000

moduladores, 000

molécula anfipática, 000

molécula anfÓtera. 000

motivos. /47

mutagénesis de s itio específico dirigida. 000

neurotransmisores, 000

oli gómeros,OOO

péptidos.OOO

plegamienlo proteínico, 000

pliegue. 000

poJi péptidos. OOO

polipéptido homó logo. 000

proteína. 000

proteína conjugada. 000

proteínas fibrosas, 000

proteínas globulares. 000

proteínas intrínsecamente no estruct uradas. 000

proteína modular, 000

proteínas motoras, 000

proteínas multifuncionales. 000

proteínas ori ginalmente desplegadas, 000

proteínas de choque témlico, 000

protóllleros. 000

puente disulfuro. 000

puentes salinos. 000

punto isoeléctrico. 000

residuos de aminoácidos, 000

separación por sal. 000

superfamilia de proteínas. 000

transición alostérica. 000

uni ón cooperativa , 000

zwitteriones. OOO

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Abreviaturas habituales en bioquímica

A ACTH ACP ADP ALA AMP ATP BCAA BH2 BH4 bp BPG C CAP CDP CMP CTP CoA o CoASH cAMP cGMP cyt DAG DHAP DNA ssDNA dsDNA DNasa DNP EAA EF EGF ER ESR FAD FADH2 fMet FMN G GH GDP GMP GSH GSSG GTP Hb HDL HETPP HGPRT VIH HMG-CoA HPLC HRE hsp IF IGF IgG IL IMP

adenina hormona adrenocorticotrópica proteína transportadora de acilo adenosina-5' -difosfato d-aminolevulinato adenosina-5' -monofosfato adenosina-5' -trifosfato . aminoácido de cadena ramificada dihidrobiopterina (forma oxidada) tetrahidrobiopterina (forma reducida) par de bases 2,3-difosfoglicerato citosina proteína activadora del catabolismo citidina-5' -difosfato citidina-5' -monofosfato citidina-5' -trifosfato coenzimaA adenosina-3' -5' -monofosfato cíclico guanosina-3' -5' -monofosfato cíclico citocromo diacilglicerol fosfato de dihidroxiacetona ácido desoxirribonucleico DNA de cadena individual DNA bicatenario desoxirribonucleasa 2,4-dinitrofenol aminoácido esencial factor de elongación factor de crecimiento epidérmico retículo endoplásmico resonancia de espín electrónico dinucleótido de flavina y adenina (forma oxidada) dinucleótido de flavina y adenina (forma reducida) N -formilmetionina mononucleótido de flavina (forma oxidada) guanina o energía libre de Gibbs hormona de crecimiento guanosina-5' -di fosfato guanosina-5' -monofosfato glutatión glutatión (forma oxidada) guanosina-5' -trifosfato hemoglobina lipoproteína de alta densidad hidroxietil-pirofosfato de tiamina guaninafosforribosiltransferasa de hipoxantina virus de inmunodeficiencia humana fJ-hidroxi -fJ-metilgl u taril-CoA cromatografía líquida de alta presión elemento de respuesta a las hormonas proteína de choque térmico factor de iniciación factor de crecimiento insuliniforme inmunoglobulina G interleucina inosina-5' -monofosfato

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IP3

Km kb kD LDL LHC Man NAA NAD+ NADH NADP+ NADPH NDP NMR NO NTP P

1

PAPS PC PDGF PEP PFK PIP2 PP Pr~teína G PRPP PS PQ(Q) PQH

2(QH

2)

RER RF RFLP RNA dsRNA hnRNA mRNA rRNA snRNA ssRNA tRNA snRNP RNasa S SAH SAM SDS SER sida SRP T THF TPP U UDP UMP UTP UQ UQH2 VLDL XMP

inositol-l,4,5-trifosfato constante de Michaelis kilobases kilodaltones lipoproteína de baja densidad complejo recolector de luz manosa aminoácido no esencial dinucleótido de nicotinamida y adenina (forma oxidada) dinucleótído de nicotinamida y adenina (forma reducida) dinucleótido de nicotinamida y adenina fosfato (forma oxidada) dinucleótido de nicotinamida y adenina fosfato (forma reducida) nucleósido-5' -difosfato resonancia magnética nuclear óxido nítrico nucleósido-S' -trifosfato ortofosfato (fosfato inorgánico) 3' -fosfoadenosina-5' -fosfosulfato plastocianina factor de crecimiento derivado de plaquetas fosfoenolpiruvato fosfofructocinasa fosfatidilinosito 1-4,5 -difosfato piro fosfato proteína de unión a guanina fosforribosilpirofosfato fotosistema o fosfatidilserina plastoquinona (oxidada) plastoquinona (reducida) retículo endoplásmico rugoso factor de liberación polimorfismo de longitud de los fragmentos de restricción ácido ribonucleico RNA bicatenario RNA nuclear heterogéneo RNA mensajero RNA ribosomal RNA nuclear pequeño RNA de cadena individual RNA de transferencia ribonucleoproteínas nucleares pequeñas ribonucleasa unidad Svedberg S-adenosilhomocisteína S-adenosilmetionina dodecil sulfato de sodio retículo endoplásmico liso síndrome de inmunodeficiencia adquirida partícula de reconocimiento de la señal tímina tetrahidrofolato pirofosfato de tiamina uracilo uridina-5' -difosfato uridina-5' -monofosfato uridina-5'-trifosfato ubiquinona (coenzima Q) (forma oxidada) ubiquinona (forma reducida) lipoproteína de muy baja densidad xantosina-5' -monofosfato

xxv

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Nombres y abreviaturas de los aminoácidos estándar

Aminoácido Abreviatura de tres letras Abreviatura de una letra

Ácido aspártico Asp D

Ácido glutámico Glu E

Alanina Ala A

Arginina Arg R

Asparagina Asn N

CisteÍna Cys C

Fenilalanina Phe F Glicina Gly G

Glutamina Gln Q Histidina His H

Isoleucina He

Leucina Leu L

Lisina Lys K

Metionina Met M

Prolina Pro P

Selina Ser S

Tirosina Tyr Y

Treonina Thr T

Triptófano Trp W

Valina Val V

Código genético

Segunda posición U e A G

UUU } Phe UCU } UAU } Tyr UGU } Cys U

U UUC UCC Ser UAC UGC C UUA } Leu UCA UAA } ALTO UGA ALTO A UUG UCG UAG UGG Trp G ,-.,

Ifl !"'l o o S CUU } CCU

} CAU } His CUG } U S Q.I .. Q.I

t< CUC Leu CCC Pro CAC CGC Arg C .. C t<

~ CUA CCA CAA } Gln CGA A ~

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} } } } c.. AUU ACU AAU Asn AGU Ser U o c.. o: AUC He ACC Thr AAC AGC C o: .. A Q.I .. S AUA ACA AAA } Lys AGA } Arg A Q.I

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Q.. ~

GUU

} GCU

} GAU } Asp GGU } U

G GUC Val GCC Ala GAC GGC Gly C GUA GCA GAA } Glu GGA A GUG GCG GAG GGG G

XXVI