Preguntas y respuestas de química orgánica y biológicahttps://parcialesingenieria.wordpress.com/

Del. = primer parcial

1) Explicar halogenación de alcanosEn presencia de luz solar o a altas temperaturas, se produce una reacción exotérmica, donde uno o más átomos de hidrogeno se sustituyen por átomos de un algún metal halógeno.Cuenta de 3 pasos:a) Ruptura hemolítica: Como el enlace halogeno-halogeno es más débil         que los enlaces C-H, C-C, por lo que en presencia de luz o temperaturas altas se rompe el enlace:X-X--->X + Xb) Propagación: Debido a que el halógeno es muy reactivo por tener incompleta su última capa puede reaccionar fácilmente con:

Otro halógeno Con un alcano, en caso de ser así dará origen a un halogenuro de alquilo:

Primero: se formara el radical alquilo a partir de un alcano y un halógeno ya que este abstrae el H.R-H +X--> Rº + H-XSegundo: El radical es muy reactivo por lo que si se choca con un halógeno formara el halogenuro de alquiloRº + X-X->R-X + Xc) Terminación: Según como transcurra la reacción quedaran pocos radicales libres, pero cuando estos se combinan se da por finalizada la cadena.X + X--->X-XRº + X--->R-X

2)Enlace y estructura de alquenosCada uno de los carbonos de la molécula tiene hibridación sp2.  Su geometría es plana, con ángulos de enlace próximos a los 120º.El doble enlace está formado por un enlace  que se obtiene por solapamiento frontal de los orbitales híbridos sp2, y en el plano perpendicular un enlace  formado por solapamiento frontal de orbitales p que no hibridaron (orbitales p puros).El doble enlace es más fuerte y corto que el simple.

3)Porque está restringida la rotación en los alquenos?Se encuentra más restringida la rotación porque poseen más electrones compartidos y por lo tanto mayor atracción al núcleo lo que impide la rotación.Además, para que haya rotación alrededor de un doble enlace, se debe romper temporalmente el enlace . Por consiguiente, la energía requerida para realizar la rotación deberá ser mayor a la que mantiene formado al enlace , la cual es mucha más de la que puedo obtener a temperatura ambiente.

4)Explique el modelo orbital del bencenoEn el Benceno, cada Átomo de Carbono esta unido solamente a otros 3 átomos: dos carbonos y 1 hidrogeno. Cada átomo presenta por lo tanto, una hibridación sp2. Dos

orbitales sp2 de cada átomo de carbono solapan con orbitales similares de átomos de carbono adyacentes para formar enlaces del anillo hexagonal. El tercer orbital sp2 de cada carbono interacciones con el orbital 1s de un hidrogeno para formar enlaces  C-H.En un plano perpendicular al de los 3 orbitales sp2, cada carbono tiene un orbital p que contiene un electrón, el cuarto electrón de valencia. Estos orbitales p, de los 6 átomos de carbono pueden solaparse lateralmente para formar orbitales  que crean una nube electrónica por encima y por debajo del plano del anillo.

5)Defina energía y valor de resonancia y explicar que pasa en el bencenoLa energía de resonancia es la diferencia entre la energía  observada para la molécula real (el hibrido de resonancia), y la energía calculada  para la estructura de resonancia más estable.El benceno es insaturado, lo cual implica que debería ser inestable, sin embargo, no se comporta así. Esto se debe a que el benceno en un hibrido de resonancia entre las 2 estructuras que plantea Kekulé, que contribuyen a la estructura final.

6)Porque la reacción SN2 está impedida o con velocidad reducida en los alquinos terciarios?En esta reacción el ión hidróxido debe atacar al alquino desde la parte posterior del carbono, por lo que la reacción SN2 está impedida o tiene velocidad reducida en los alquinos terciarios porque, en este tipo de moléculas, el sector posterior está muy impedido estéricamente, ya que se encuentran muchos grupos unidos a él.

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9) Porqué los ácidos son más ácidos que los alcoholes?Los ácidos carboxílicos son más ácidos que los alcoholes porque, el alcohol tiene la carga negativa localizada, solamente, sobre un átomo de oxígeno, mientas que en el caso del ácido la carga negativa, puede deslocalizarse por resonancia, con lo que cada oxigeno sobrelleva solamente la mitad de la carga negativa, haciendo que se estabilice por resonancia a esto se le suma que el grupo carbonilo tiene carga parcialmente positiva.Esta estabilización provoca que el ácido, produzca mayor cantidad de H+.Resumiendo, los ácidos presentan mayor acidez que los alcoholes debido a la carga positiva del carbono carbonílico, y la deslocalización del ion carboxilato(estabilización por resonancia).                                                      

10) Formación de hemiacetal y acetalEl mecanismo de la formación del hemiacetal involucra tres pasos.1-Primero, se protona el carbonilo mediante el catalizador ácido.2-Después, el oxígeno del alcohol ataca al carbono carbonílico3-Y por último se pierde un protón del oxígeno positivo resultante.En presencia de alcohol en exceso, los hemiacetales reaccionan nuevamente para formar acetales.El grupo hidroxilo del hemiacetal se remplaza por otro grupo alcóxido, los acetales tienen dos funciones éter sobre el mismo átomo de carbono.Los pasos en el mecanismo de la formación de acetal se muestran a continuación:

Se puede protonar cualquiera de los oxígenos del hemiacetal. Cuando se protona el oxígeno del hidroxilo, la pérdida de una molécula de agua conduce a un carbocatión que se estabiliza por resonancia. La reacción de este carbocatión con el alcohol, que normalmente es el disolvente y está presente en gran exceso, produce (después de la pérdida de un protón) el acetal. El mecanismo es semejante a una reacción SN1. Cada paso es reversible.

11) Explicar enlace amidas y comparar con aminasLas amidas tienen una geometría plana. Y la rotación del enlaceC-N se encuentra impedida por resonancia.El átomo de nitrógeno de las aminas es trivalente, además de poseer un par electrónico sin compartir. Por lo tanto, los orbitales del nitrógeno, presentan hibridación sp3, y su geometría es piramidal (casi tetraédrica) para la trimetilamina.

12) Porqué un ión tri sustituido de un ácido genera acidez mucho mayor?El factor más importante que influye en la acidez del ion, es el efecto inductivo de  los grupos cercanos al grupo carboxilo. Este efecto distribuye la carga entre los enlaces, por desplazamiento de electrones hacia los átomos electronegativos, o bien, lejos de los átomos electropositivos. Los grupos que aceptan electrones aumentan la acidez, mientras que los que ceden electrones la reducen.A modo de resumen, un ión trisustituído es más ácido porque a la resonancia del ión se le suma el efecto inductivo, lo cual aumenta la estabilidad y permite el desplazamiento de los electrones.

13) Porqué es más ácido el ion carboxilato que el fenóxido?Es más ácido el ión carboxilato porque la deslocalización de la carga no es tan grande en el fenóxido como en el carboxilato, esto se debe a que los contribuyentes para el hibrido de resonancia no son equivalentes.Porque la amida 1º determina una estructura plana?La amida 1º es el constituyente básico de las proteínas, la misma determina una estructura plana porque el enlace C-N se comporta como un doble enlace restringiendo la rotación.14) Porque las bases aromáticas son menos básicas que los cicloalcanos?Las bases aromáticas son más ácidas (menos básicas) que los cicloacanos debido a la deslocalización del par electrónico no compartido que tiene lugar en las bases aromáticas, y no en los cicloalcanos.

15) Porque la amina es una base fuerte y la amida débil?Las aminas son bases más fuertes que las amidas o, lo que es lo mismo, las amidas son ácidos mucho más fuertes que las aminas, porque la carga negativa del ion amidato se puede deslocalizar por resonancia. Otra causa, es que el nitrogeno de la amida, tiene una carga parcial positiva, lo que hace que pierda fácilmente el protón que tiene unido, que también es positivo.

16) Porque un componente heterociclico de 5 miembros se comporta como un benceno?

(Pag. 396 Hart)

El furano, por ejemplo, es una estructura plana, pentagonal, en la cual cada átomo del anillo presenta una hibridación sp2. Cada carbono, al igual que en el benceno, utiliza un orbital sp2 para formar un enlace  en el plano del anillo, con un átomo de hidrogeno, y tiene un electrón en el orbital p, perpendicular al plano del anillo. Analizando el oxigeno, éste presenta un par de electrones sin compartir en el orbital sp2 (en el plano del anillo) y dos electrones en un orbital p, perpendicular al plano del anillo. Estos dos electrones en el orbital p, se solapan con los electrones de los átomos de carbono, formando asi, una nube de 6 electrones  por encima y por debajo del anillo, exactamente igual que en el benceno.

17) Explique el crecimiento por pasos de la polimerización, dé la formula y las condiciones principales.

(Pag. 422 Hart)Los polímeros con crecimiento por pasos generalmente se producen por medio de una reacción entre dos monómeros, cada uno de los cuales tiene por lo menos dos grupos funcionales, con la perdida de alguna molécula. Por lo que en la molécula(polímero) final no se encuentran todos los átomos de los monómeros. La mayoría de ellas se puede representar por medio de la ecuación que se muestra a continuación:

En donde A-A y B-B son moléculas con dos grupos funcionales en las que los grupos A y B pueden reaccionar entre sí, A podría ser un grupo OH y B un grupo COOH; en este caso, A-A sería un diol, B-B, un ácido dicarboxilico y -A-B- sería un éster, el polímero sería un poliéster.Consideremos la formación de un poliéster, a partir de un diol y de un diácido. En el primer caso, el producto será un éster con un grupo alcohol en un extremo y un ácido en el otro:

En el paso siguiente, el alcohol-éster-ácido puede reaccionar con otro diol, con otro ácido o bien con otra molécula igual, con tres grupos funcionales.

18) Como se forma ATP en la cadena respiratoria

(Pág. 97 Eynard, 164 De Robertis)Se forma mediante el proceso de Fosforilación Oxidativa.Los electrones provenientes de las oxidaciones producidas en el ciclo de Krebs son tomados por el NAD+ y la Coenzima Q y transportados a la cadena respiratoria, la cual está formada por un sistema multienzimatico, compuesto de trasportadores de electrones. Estas enzimas  realizan  el transporte de electrones como tales o como átomos de hidrogeno, mediante mecanismos de óxido-reducción. Estas reacciones redox, son exergónicas, es decir, liberan energía, la cual es capturada por un proceso endergónico, en el cual se produce la fosforilación del ADP, produciendo así, ATP.Esta etapa se llama fosforilación oxidativa porque da lugar a oxidaciones acopladas con fosforilaciones.

19) Explique la estructura alfa-hélice de la proteína

(Pág. 40 Blanco, Curtis)Las proteínas son macromoléculas formadas por largas cadenas de aminoácidos. Frecuentemente la disposición de la cadena determina su enrollamiento sobre un eje central, como si estuviese envolviendo un cilindro. El giro se hace en el sentido de las agujas del reloj, y por ello se dice que la hélice es dexergónica o derecha.

Esta hélice mantiene su forma por la presencia de los puentes de hidrógeno, dichos puentes se forman entre los átomos de oxígeno del grupo carbonilo de un aminoácido y el átomo de hidrógeno del grupo amino de otro aminoácido situado a cuatro aminoácidos de distancia en la cadena.Los grupos R se extienden hacia afuera desde la hélice.

20) En el modelo doble hélice de los ácidos nucleicos: a) como se organizan las cadenas?b) describa mediante qué tipo de enlace se aparean las bases entre sí y el ácido ortofosfórico con la ribosa.(Pág. 26, 27 De Robertis; 118, 119 Blanco)a)La molécula de ADN está formada por dos cadenas de ácidos nucleicos helicoidales, con giro a la derecha, que componen una doble hélice, en torno de un mismo eje central. Las dos cadenas son anti paralelas, lo cual significa que sus uniones 3’,5’-fosfodiester siguen sentidos contrarios, y complementarias.b) Las bases se encuentran unidas mediante puentes de hidrogeno, 2 para el caso de la Adenina y la Timina y 3 para la Guanina y la Citosina.El ácido ortofosfórico y la ribosa se encuentran unidas mediante enlaces fosfodiester cargados negativamente.

21) Coenzimas: naturaleza y función. Ubiquinona: indique la función de la quinona y la de la cadena lateral isoprenoide durante la fosforilación oxidativa.

(Pág. 146 Blanco)Las Coenzimas son moléculas de NATURALEZA NO PROTEICA de tamaño relativamente pequeño y participa en reacciones oxidoreductasas, transferasas, isomerasas y ligasas, experimentando cambios que compensan las trasformaciones de sustrato.La Ubiquinona o Coenzima Q, ES UNA BENZOQUINONA CON UNA LARGA CADENA LATERAL ISOPRENIODE, la cual le permite alojarse en la zona apolar de la bicapa lipídica, debido a que esta cadena es hidrófoba. Es un integrante libre de la cadena respiratoria que no está unida a proteínas y actúa como “portador móvil” de electrones.La quinona es la forma oxidada de la Ubiquinona.23) Explique mediante un gráfico de energías el mecanismo de reacción de las enzimas. Indicar como se ve afectada la velocidad y el equilibrio

(Pág. 141, 151 Blanco)

24) Cual es la función del ARNt y como es su estructura? Explique

(Pág. 127 Blanco)El ARN de Transferencia participa en la síntesis de proteínas transportando aminoácidos libres del citosol hasta el lugar de ensamble. Actúa como molécula adaptadora, que asegura la ubicación de cada aminoácido en el sitio correspondiente.Esta molécula presenta una estructura trilobulada.

25) Función de la Co-Q en la formación de ATP

(Pág. 174 Blanco)La Co-Q o ubiquinona actúa como un portador móvil de electrones.  Este transporte de electrones libera energía que es utilizada para la fosforilación del ATP.

26) Metabolismo de Glúcidos: Ciclo de Krebs. Las siguientes reacciones muestran la oxidación de alfa-cetoglutarato. Explique cómo se conserva la energía de oxidación en la primera y en la segunda reacción. Cuáles son las enzimas involucradas y que tipo de fosforilación se produce.

(Pág. 161-165 De Robertis; 270-275 Blanco)

Este tipo de fosforilacion es la fosforilacion a nivel sustrato.

26)a-Metabolismo de Glúcidos: Una vez establecido el gradiente de potencia, esquematice y explique la formación de ATP

El ATPasa es una enzima incluida en la membrana interna que actúa como “llave” la cual se abre cuando se alcanza el gradiente de potencia para liberar los protones del EIM lo cual genera trabajo otorgando energía para fosforilar el ADP con Pi.

27) Metabolismo de Glúcidos: La glucogenina es una enzima muy particular en la síntesis de glucogeno, que función tiene? Describa una de ellas y como se inicia la síntesis de Novo.

(Pág. 260 Blanco)La función de la glucogenina es de primer o molde para comenzar la polimerización de una cadena de glucogeno. Además sirve como enzima para la unión de los primeros 5 residuos de glucosa hasta formar una cadena de 6 a 7 glucosas una vez que se llego a los 8 residuos continua la acción de la glucogenosintetasa.

La Glucogenina cataliza tambien la adición sucesiva de unidades hasta formar una cadena lineal de 6 a 7 glucosas en enlaces . Sobre esta cadena “anclada” en glucogenina, continúan actuando el glucógeno sintasa y la enzima ramificante para dar al polímero su estructura característica.Cada molécula de glucogeno esta covalentemente ligada a una molécula de glucogenina, razón por la cual el número de partículas de glucogeno en la célula depende de la disponibilidad de glucogenina.

La síntesis de Novo de ácidos grasos se lleva a cabo a partir de Acetil CoA (CoA), en el espacio extramitocondrial, por un grupo de sintetasas. Este proceso está gobernado por la enzima acetil-CoA carboxilasa, que convierte acetil-CoA en malonil-CoA. Una serie de unidades de malonil-CoA se van añadiendo en una cadena de ácidos grasos para terminar en la formación de ácido palmítico (C16:0). A partir de este momento, por elongaciones y desaturaciones, se van creando ácidos grasos más complejos

28)Metabolismo de aminoácidos: La siguiente reacción en clave para la trasferencia del grupo , diga a donde se lleva a cabo esta reacción y cual es su importancia. Indique el nombre de la enzima involucrada.

(Pág. 334, 335 Blanco)La reacción es la Desaminación del glutamato para formar α-cetoglutarato que es el sustrato más frecuentemente comprometido en las transamianciones.El grupo nitrogenado del glutamato, puede ser separado por Desaminación oxidativa, catalizada por el glutamato deshidrogenasa. Esta enzima, utiliza las coenzimas NAD y NADP, formando así, -cetoglutarato y amoníaco ().Esta reacción se lleva a cabo en la matriz mitocondrial, ya que es donde se encuentra el glutamato deshidrogenasa, el cual es activado cuando el nivel de ADP es alto, por lo que se comienza a producir el -cetoglutarato que alimenta al ciclo de Krebs para producir ATP.

29) Síntesis de Triglicéridos: Detalle la formación del glicerol 3 fosfato en hepatocitos (células del hígado) y mocitos (célula muscular) antes de comenzar la esterificación de ácidos grasos.

(Pág. 299 Blanco)La utilización de glicerol exige activación previa por fosforilación, razón por la cual solo metabolizan glicerol libre los tejidos que poseen gliceroquinasa. Esta enzima se encuentra en el hígado, el riñón, el intestino y la glándula mamaria lactante. De esta forma se cataliza la conversión de glicerol en L-glicerol-3-fosfato, donde el grupo fosfato es codudo por una molécula de ATP. La reacción es prácticamente irreversible.

30)Marque que enzimas participan en la degradación de un fosfolípido

(Pág. 318 Blanco)Glicerofosfolípidos:Fosfolipasa A2: cataliza la hidrólisis de la unión éster del ácido graso en posición 2.Fosfolipasa B: Cataliza la liberación del ácido graso en la posición 1 por hidrólisis.Hidrolasa: Separa la base (colina, etanol amina) y deja glicerol-3-fosfato.Fosfolipasa A1: Cataliza la hidrólisis de la unión éster del ácido graso en la posición 1.Fosfolipasa C: Actúa sobre la unión éster del fosfato en la posición 3Fosfolipasa D: Actúa sobre la unión del fosfato con la base.

31) Explique brevemente las etapas de biosíntesis del colesterol

(Pág. 319-321 Blanco)La biosíntesis del colesterol inicia con la conversión de 3 acetatos en mevalonato (ácido melvalonico), por acción de la tiolasa y la 3-hidroxi-3-metilglutaril-CoA sintasa.Posteriormente por la pérdida del carboxilo, el melvalonato origina unidades isoprenoides de 5 carbonos, que por sucesivas condensaciones forman escualeno, que es un hidrocarburo terpénico de 30 átomos de carbono.Finalmente, por ciclización y otros cambios, el escualeno dará lugar al colesterol.Entonces, la biosíntesis del colesterol de divide en tres etapas:

        1º) Conversión de Acetatos en Mevalonato        2º) Conversión de Mevalonato en Escualeno        3º) Conversión de Escualeno en Colesterol

34) Cuales son las diferencias entre una β-oxidación de un ácido graso par (saturado) y otro impar (insaturado)?

(Pág. 303 Blanco)En la CADENA PARse repite el ciclo de b-oxidación con el Acil-CoA hasta degradarlo por completo. El acetil-CoA generado por la b-oxidación ingresa al ciclo de Krebs.La CADENA IMPAR tambien es sometida a b-oxidación, pero en el último ciclo ingresa un acil-CoA de 5 carbonos y los productos finales son acetil-CoA y propionil-CoA. El propionil-CoA puede ingresar a gluconeogénesis o entrar en ciclo de Krebs mediante conversión a succionil-CoA

35) Describa el proceso de replicación de ADNLa topoisomerasa, la helicasa y otras enzimas estabilizadoras se encargan de desdoblar la cadena de ADN y separar las hebras. La ADN polimerasa actúa sobre las hebras en dirección 3` 5` generando entonces la nueva cadena en dirección 5`3`. Sobre la cadena que acompaña al complejo se desplaza rápidamente mientras que sobre la otra lentamente, y de a intervalos.La ADN polimerasa no puede colocar nucleótidos de un comienzo, por ello la ARN polimerasa provee a la cadena colocando aproximadamente 10 ribonucleicos y cediendo el paso a la ADN polimerasa. Cuando la ADN polimerasa se encuentro con los ribonucleótidos, los reemplaza por desoxirribonucleicos. Sobre la cadena no retardada, la ARN polimerasa actúa una sola vez.La telomerasa coloca un telómero (secuencia de ADN no codificante) en el extremo donde las bases colocadas por la ARNp no sean removidas por la ADNp para evitar la pérdida de información genética.

36) Defina transcripción de ADN y dé diferencias y similitudes con replicación.

(Pág. 300, 301 De Robertis)La transcripción de ADN puede entenderse también como la Síntesis de ARN mensajero, mediante el mismo principio de apareamiento de bases que se produce en la replicación del ADN.Las diferencias entre la replicación y la transcripción se deben a que el ADN es una molécula doble, y no simple como el ARN.

En la síntesis del ARN, el ADN se transcribe solo en los sectores que corresponden a los genes activos, mientras que en la replicación no queda ningún sector de ADN sin duplicar.Contrariamente a lo que sucede en la replicación, en la transcripción, el ARN copia una sola de las dos cadenas de ADN y, conforme progresa la transcripción, se despega de la cadena que le sirve de molde.Finalmente, la replicación, exige un numero considerablemente mayor de enzimas que la trascripción.La enzima que cataliza la transcripción (RNA polimerasa) no requiere de un cebador para comenzar la síntesis de ARN, ya que es capaz que iniciar una nueva cadena uniendo dos ribonucleótidos.

38) Describa la fase de activación de la síntesis de proteínas.

Activación(de los aminoácidos y formación de aminoAcil-ARNt): Se produce en el citoplasma, primero se tienen los aminoácidos esteríficados enzimáticamente con su correspondiente ARNt a expensas de ATP(energía).El aminoácido reacciona con el ATP para la formación de un complejo aminoAcil-AMP-enzima se libera ppi, hidrolizado por pirofosfatasa                          Ppi (se libera)Aminoácido + ATP----aminoAcil-AMP-enzima

Luego se transfiere al aminoácido activado al extremo 3`de ARNt, liberando AMP-enzima formando: aminoAcil-ARNt (se dirige al sitio de síntesis)39)¿Cómo se produce a unión de los ….. en la fase de elongación? La unión se da mediante el enlace poli peptídico formado por el ataque de un nucleósido al grupo amina de aminoacil-ARNt ¿de donde saca energía la enzima de esa reacción? La energía la obtiene por la ruptura de la unión aminoacil- ARNt (2 ATP) ¿de que enzima se trata? Peptidil-transferasa 40) ¿Cómo es la regulación génica?Dicha regulación se lleva a cabo por:Operon: Secuencia de ADN que lleva genes que codifican, son promotores y secuencias regulatorias. Tienen sitios de unión de operadores. Existe el operon Lac y Trip:

 SITIODE ACTIVACION                                                 OPERADOR |  |  |promotor|  |  |////////////////| A  |B  |CSECUENCIAS                                   REGULADORES           GENES TRANSCRIPTOSOperon Lac: Es un sistema inducible que está bajo control negativo de manera que la proteína reguladora es un represor que impide la expresión de los genes en ausencia del inductor.Ausencia- reprimido:LactosaPresencia- inducido: LactosaEl AMPc es necesario para la transcripción de los genes estructurales

GlucosaAMPcLactosaTranscripciónBajaAltaPresenteAltaAltaBajaPresenteNo

Operon Trip: Es un sistema represible negativo. Posee 5 genes que expresan las 5 enzimas que catalizan.Regulación negativa por 2 mecanismos: represión y atenuación.

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En la desesperación y afán de aprobar química orgánica y biológica,  me puse a estudiar todo de los libros y me di cuenta que… no hay chances.Asi que hice una super recopilación de preguntas... es todo lo que hay dando vueltas...creo

·Explicar halogenación de alcanos

·Graficar y explicar el enlace simple de los alcanos y explica su liberación

·Enlace y estructura de alqueno

·Porque está restringida la rotación en los alquenos?

·Explique el modelo orbital del benceno

·Explicar nitración del benceno. Que obtengo?

·Defina energía y valor de resonancia y explicar que pasa en el benceno

·Porque la reacción SN2 está impedida o con velocidad reducida en los alquinos terciarios?

·Formación de hemiacetal y acetal

·Porqué los ácidos carboxílicos  son más ácidos que los alcoholes?

·Porqué es más ácido el ion carboxilato que el fenóxido?

·Porqué un ión tri-sustituido de un ácido genera acidez mucho mayor? (efecto inductivo)

·Explicar enlace amidas y comparar con aminas

·Porque la amina es una base fuerte y la amida débil?

·Porque un componente heterocíclico de 5 miembros se comporta como un benceno?

·Explique el crecimiento por pasos de la polimerización, dé la formula y las condiciones principales.

·Explique la estructura alfa-hélice de la proteína, que tipo de estructura representa en una proteína completa

·En el modelo doble hélice de los ácidos nucleicos:

a) como se organizan las cadenas?b) describa mediante qué tipo de enlace se aparean las bases entre sí y el ácido ortofosfórico con la ribosa.

·Esquematice una molécula de ARNt indique en que extremo se une al aminoácido , donde y como está determinado el sitio de unión al ARNm

·Cual es la función del ARNt

·Enzimas: La conversión de treonina a isoleucina es catalizada por una secuencia de 5 enzimas (E1 a E5). Explique que tipo de regulación se observa sobre esta via biosintetica y como se denomina tal regulación

HOOC—CH(H2-N)—CH(OH)—CH3 -->A-->B-->C-->D--> HOOC—CH(H2-N)—CH(CH3)—CH3(la primera gilada es Treonina, la otra Isoleucina, debajo de cada --> dice En  / n peteneciente [1,5] el loco le metía un aire matematico jaja)

·Coenzimas: naturaleza y función. Ubiquinona (coenzima Q): indique la función de la quinona y la de la cadena lateral isoprenoide durante la fosforilación oxidativa.

·Explique mediante un grafico de energías el mecanismo de reacción de las enzimas. Indicar como se ve afectada la velocidad y el equilibrio

·Cinetica Enzimatica. En el siguiente grafico (grafico 8-9 B de la pagina 136 del Blanco)

¿Qué representan las curvas? ¿Qué tipo de inhibición se trata?¿como varian las constantes cineticas en cada una de ellas?

·Clasificación de enzimas

·enzimas: explicar inhibicion-competencia. Graficar

·Como se forma ATP en la cadena respiratoria

·Función de la Co-Q en la formación de ATP

·Cadena respiratoria: esquematice como funciona la bomba de protones

·fosforilacion oxidativa ¿Cuál es la fuerza impulsora de la formación de ATP acoplada a la cadena respiratoria?

·4 diferencias y 4 similitudes entres fotofosforilacion y fosforilacion oxidativa.

·metabolismo de glucidos: glucogenesis: esquematice la conversion del lactato muscular en glucosa

·Metabolismo de Glúcidos: Ciclo de Krebs. Las siguientes reacciones muestran la oxidación de alfa-cetoglutarato. Explique como se conserva la energía de oxidación en la primera y en la segunda reacción. Cuales son las enzimas involucradas y que tipo de fosforilación se produce.

·Metabolismo de Glúcidos: La glucogeninia es una enzima muy particular en la síntesis de glucogeno, que función tiene? Describa una de ellas y como se inicia la síntesis de nuevo.

·Metabolismo de glucidos: escriba la primera etapa del ciclo de las pentosas-P. explique su funcion

·Degradación del glucogeno: como se lleva a cabo la ruptura de las uniones alfa 1-6 del glucogeno. Cual es el producto y la enzima involucrada (reaccion)

· En el ciclo de la úrea, ¿qué reacciones catalizan la Carbamil-fosfato-sintetasa y la arginin-succinato-sintetasa?¿cuál es la energía involucrada en la reacción?¿dónde se llevan acabo?

· Describa como el glicerol 3 fosfato da origen a los triglicéridos y glicéridofosfolípidos en el hígado y el músculo

·Completar la reacción ¿qué enzima la cataliza?¿ qué mecanismo es?¿ dónde se lleva a cabo y por qué?

Era la desaminación oxidativa del glutamato, nos daba todos los dibujitos sin nombres

·Síntesis de Triglicéridos: Detalle la formación del glicerol 3 fosfato en hepatocitos (células del hígado) y mocitos (célula muscular) antes de comenzar la esterificación de ácidos grasos.

·Metabolismo de lipidos: escriba en detalle la biosintesis de fosfatidil-colina a partir del glicerol

·Marque que enzimas participan en la degradación de un fosfolípidos

·Explique brevemente las etapas de biosíntesis del colesterol

·Cuales son las diferencias entre una -oxidación de un acido graso par (saturado) y otro impar (insaturado)?

·Degradacion de acidos grasos: detalle las reaciones de b-oxidacion de un acido graso de cadena par y el balance energetico

·Completar los tres pasos de la beta oxidación para los ácidos grasos de cadena impar

·Describa el proceso de replicación de ADN

·Metabolismo de Acidos Nucleicos ¿Cómo se lleva a cabo la duplicación de ADN en el nucleo celular?

·Metabolismo de Acidos Nucleicos. Describa trasnscripcion de ARNm nombrando las modificaciones (creo que dice eso) transcripcionales implicadas

·Biosíntesis del adn: a) escriba la reaccion catalizadas por las adn-polimerasas b) expique en que se diferencian las de tipo 1 y 2 en las procariotas

·Defina transcripción; cite 3 semejanzas y 3 diferencias con la replicación de DNA

·Describa la replicación ADN según el grafo

(ponele que el grafo sea  http://www.prodiversitas.bioetica.org/images/nota6633.gif )

·Describa la fase de activación de la síntesis de proteínas.

·Biosintesis de proteínas: explicar la etapa de elongacion. que enzima une aminoacidos y de donde obtiene energia

·Sintesis de proteínas Describa el balance energetico para la formación de cada enlace peptídico ¿Cuál es la razón de costo?

·¿Cómo se produce a unión de los polipeptídico en la fase de elongación? La unión se da mediante el enlace polipeptídico formado por el ataque de un nucleósido al grupo amina de aminoacil-ARNt

¿de donde saca energía la enzima de esa reacción? La energía la obtiene por la ruptura de la unión aminoacil- ARNt (2 ATP)¿de que enzima se trata? Peptidil-transferasa

·Transduccion de señales: compare los dos modelos de receptores: receptor acoplado a

Canal (creo que dice eso) y receptor acoplado a proteína G

·Transduccion de señales: Describa el gradiente electroquimico observado en una neurona indicando la estructura involucrada en mantenerlo

·Metabolismo de aminoacidos: escriba en detalle el ciclo de la urea e indique cual es su funcion

·metabolismo de aminoacidos: describa las reacciones de desaminacion oxidativa y no oxidativa de ejemplos

·biosintesis del arn: escriba la reaccion catalizada por la arn-polimerasa y sus requerimientos

·catabolismo de a.a: como pasa el alfacetoglutarato a glutamato

·¿Cómo es la regulación génica? ·operon lac: que pasa cuando aumetna AMPc y glucosa

·Regulacion metabolica: defina y esquematice un Operon ¿Dónde se ubican los genes reguladores en el operon

·Regulación metabolica: Las siguiente figura esquematiza un mecanismo de regulación metabolica genica

a) Indique de que mecanismo se trata y que tipo de regulación es

b)explique el efecto observado con ambas condiciones celulares(la verdad que busque la imagen en el blanco y en el Lehninger y no sale..)

·biosintesis del grupo HEM, primera etapa ·como actúa la variacion de AMPc en la sintesis de glucogeno.

·Porfirinas: explique los 5 enlaces de (no se que mierda dice termina en -ación )del Fe en el grupo HEM ¿Dónde se une O2?

·Describir la ruta mediante la cuál los receptores asociados a proteína G rinden AMPcíclico para activar la Proteín-Quiinasa-A

PREGUNTAS PRIMERA MESA DE DICIEMBRE 2011 (textual como dijo un amigo jeje)

-definir y clasificar enlace covalente(esta la tomaron en julio, si no me avisaban no la sabia)-estructura de aminoacidos, xq son anfóteros?(creo q la palabra era anfóteros, eso d q se comportan como ácidos y bases segun el medio)-como se forma el enlace peptidico en la fase d elongacion,de donde saca energia, q enzima lo cataliza, y otra huevada mas que no me acuerdo-comparar las estructuras del benceno y del furano, eso de la nube seis pi-como actuan el amp y atp en la regulación de la glucólisis y gluconeogénesis (en realidad preguntaba como afectaba a unas enzimas,creo q eran fosfofructoquinasa y 1-6 nosequebosta, pero era de glucolisis y glucogenensis)-reaccion por pasos de polimerizacion-q enzimas catalizan la degradacion de fosfolipidos(igual q en el 2ndo parcial, dada un dibujo con 4 flechitas y habia q poner una enzima en c/u)-habia q explicar una cosa del operon lac, daba un dibujo igual al q sale en la guia, con un esquema del operon con baja y alta glucosa-esta no me la acuerdo bien, era comparar receptores de canal con receptores asociados a vitamina g o algo asi, fijatePREGUNTAS SEGUNDA MESA MARZO 20121-Comparar conformacion de silla y bote en cicloalcanos y decir cual es mas estable2-Estructura de ADN, describir todo lo que puedas de la doble helice3-sustitucion nucleofilica: decir el orden de estabilidad de carbocationes4-Te daban un furano y pedian que dijeran porque se comportaba como el benceno (ojo aca puse lo que decia el preguntero de esta pagina y me pusieron medio punto u.u)5-Caracterizar la fosfatidilcolina, decir q tipo de lipido es, tipos de enlace, etc etc ah y para que funcionaba (importante en membrana)6-HEMO: daban una molecula de hemoglobina calculo, donde tenias que poner las cosas que se unian en sus enlaces. y donde se unia el CO2.7-Porque la neurona es polarizada.8-Caminos de la glucosa: glucogenogenesis, camino de las pentosas y glucolisis. Describir brevemente diciendo importancia, donde pasaban y para que.9-balance energetico en la formacion de enlace peptidico en traduccion.

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26) Metabolismo de Glúcidos: Ciclo de Krebs. Las siguientes reacciones muestran la oxidación de alfa-cetoglutarato. Explique como se conserva la energía de oxidación en la primera y en la segunda reacción. Cuales son las enzimas involucradas y que tipo de fosforilación se produce.1era reaccion

CH2_CO_O-                                                                                 CH2_COO-|                    alfacetoglutarato deshidrogenasa                       |CH2             ------------------------------------------->                   CH2           +

CO2|                     NAD (entra)                  NADH2 (sale)               |CO_COO-                                                                                     CO_S_CoA

alfacetoglutarato                                                                             succinil_CoA2da reaccion                                 succinato tioquinasa                    CH2_COO-succinil_CoA     -------------------------------------->          |                   + CoA.SH                         GDP(entra) Pi        GTP(sale)          CH2_COO-                                                                                         succinatoBUENO en la reaccion 1 es un proceso catalizado por un sistema multienzimatico denominado "complejo alfacetoglutarato deshidrogenasa" (se llama completo porq esta formado por varias cosas que juntas actuan como una enzima, ese complejo por ejemplo esta formado por: pirofosfato de tiamina, acido lipoico, CoA y FAD).los productos de esta reaccion son CO2 y NADH2succinil coa es un resto dicarboxilico de 4C unido a CoA por enlace tioester de alta energia.En esta reaccion la energia se obtiene por fosforilacion exidativa es decir que la energia se obtiene en la cadena respiratoria.en la reaccion 2 la succinil coa es convertida a succinato y CoA libres por accion de la succinato tioquinasa.esta reaccion requiere GDP y pI (pirofosfato).esta es la unica etapa del ciclo donde se genera una unión fosfato de alta energia a nivel de sustrato.a partir del GTP se puede formar ATP en reaccion catalizada por "nucleosido difostato quinasa".