Microbiolog%EDa del suelo
-
Upload
chava-zamora -
Category
Documents
-
view
220 -
download
0
Transcript of Microbiolog%EDa del suelo
-
8/7/2019 Microbiolog%EDa del suelo
1/94
MICROBIOLOGIADEL SUELO
Mara Cecilia Escobar Restrepo
-
8/7/2019 Microbiolog%EDa del suelo
2/94
El suelo:El suelo:
Un biotopoprcticamente
ignorado
-
8/7/2019 Microbiolog%EDa del suelo
3/94
EL SUELO
Es el principal medio en el quecrecen las plantas
Es el soporte fsico quecontinuamente les proporciona: Los nutrientes inorgnicos El agua
El entorno gaseoso adecuado paralos sistemas radicales
-
8/7/2019 Microbiolog%EDa del suelo
4/94
Los nutrientes inorgnicos que utilizanlas plantas provienen de la atmsfera,mineralizacin de la materia orgnica yde la meteorizacin de las rocas de lameteorizacin de las rocas de lacorteza terrestrecorteza terrestre
-
8/7/2019 Microbiolog%EDa del suelo
5/94
-
8/7/2019 Microbiolog%EDa del suelo
6/94
Procesos de meteorizacin
desintegracin fsica y descomposicinqumica de los minerales y las rocas
superficiales
producen los materiales inorgnicos que
formarn los suelos
-
8/7/2019 Microbiolog%EDa del suelo
7/94
La meteorizacin implica procesos:
Mecnicos
Congelamiento y descongelamiento Calentamiento y enfriamiento
Qumicos
El agua se introduce entre las partculas ylos materiales solubles se disuelven en
Ella. CO2 de la respiracin y otras sustancias
descomponen las rocas Actividad biolgica
En rocas con fisuras las races de los rboles
pueden invadir estas fisuras y ejercer presin
-
8/7/2019 Microbiolog%EDa del suelo
8/94
Meteorizacin mecnica
El agua y el viento transportan fragmentos deroca a grandes distanciasdesgaste que lasfracciona en partculas ms pequeas
-
8/7/2019 Microbiolog%EDa del suelo
9/94
Meteorizacin qumica (corrosin)
Disuelvenmaterialesmenos solublesH2O + NO2 (NO3)
H2O + SO2cidos
-
8/7/2019 Microbiolog%EDa del suelo
10/94
Meteorizacin orgnica-biolgica
Los cidos producidos por plantas y lasbacterias pueden afectar las rocas
La formacin del suelo puede ocurrir en: El mismo sitio donde la roca es meteorizada
Pueden ser transportados a otros sitios por :
La gravedad El viento
El agua
Los glaciares.
-
8/7/2019 Microbiolog%EDa del suelo
11/94
Horizontes del suelo
-
8/7/2019 Microbiolog%EDa del suelo
12/94
Horizonte A:
La regin mssuperficial y de mayor
actividad fsicaqumica y biolgica.
Contienela mayor partedel material orgnicodelsuelo, vivo o muerto:
Grandes cantidadesdepartes de plantas yhojas muertas
Insectos y otrosartrpodos pequeos
Lombrices de tierra Organismos
descomponedores Nemtodos
-
8/7/2019 Microbiolog%EDa del suelo
13/94
Suelo: Horizonte A
Rocas, silicatos
Desechosorgnicos O2, NH3,CH4, H2SLluvia
Inorgnicos
granuladosResiduosorgnicos, humus
Agua (inundado,mojado)
Gases (disueltosy difusos)
Sistemasbiolgicos (races,insectos,microbios)
O2, N2, CO2
Capa de agua
-
8/7/2019 Microbiolog%EDa del suelo
14/94
En un gramo de suelo del horizonte A puedenhaber:
2500 millones de bacterias
+
medio milln de hongos
+
50 000 algas
+
30000 protozoos
-
8/7/2019 Microbiolog%EDa del suelo
15/94
Horizonte B:
Regin de
acumulacin
-
8/7/2019 Microbiolog%EDa del suelo
16/94
El horizonte B:
Contiene muchomenos material
orgnico y estmenos meteorizadoque el horizontesuperior.
Hay pocosmicroorganismos
Algunos materiales delhorizonte A, llegan al Bpor filtracin del agua atravs del suelo: xido de hierro Partculas arcillosas Pequeas cantidades de
material orgnico
-
8/7/2019 Microbiolog%EDa del suelo
17/94
Horizonte C:
Compuesto por rocas y mineralesCompuesto por rocas y minerales
fragmentados y meteorizados de losfragmentados y meteorizados de loscuales se ha formado el suelocuales se ha formado el sueloverdadero de los horizontesverdadero de los horizontessuperiores.superiores.
Los microorganismos son escasos.Los microorganismos son escasos.
-
8/7/2019 Microbiolog%EDa del suelo
18/94
Factores que afectan el movimiento de losmicroorganismos en el suelo
La poblacin de microorganismos del suelo puedenser:
Microorganismos nativos del suelo Microorganismos no nativos del suelo
Inculos para el control biolgico de plagas
en campos agrcolas Inculos para procesos de biorremediacin
Inculos para incrementar la produccin
agrcola (micorrizas, bacterias fijadoras de
nitrgeno)
-
8/7/2019 Microbiolog%EDa del suelo
19/94
Factores que afectan el movimiento de losmicroorganismos en el suelo
1. Adsorcin de clulas microbianas a partculasde suelo
Adsorcin: Interaccin fsico-qumica de los
microorganismos con partculas de suelo, dependede los siguientes factores:
* Tipo de sueloLa adsorcin de los microorganismos a partculas
de suelo est relacionado con las propiedadesfsicas del suelo
Los principales componentes que afectan la
adsorcin microbiana son la materia orgnica y las
partculas de arcilla
-
8/7/2019 Microbiolog%EDa del suelo
20/94
Los fragmentos de roca y minerales en el suelovaran en tamao:
Partcula Dimetro
en micrmetros
Arena gruesa >200 - 2000
Arena fina >20 - 200
Limo 2 - 20
Arcilla
-
8/7/2019 Microbiolog%EDa del suelo
21/94
Los suelos estn divididos segn su textura:
Arenoso arcillosos: 35% o ms de arcilla y 45% oms de arena
Limo-arcillosos: 40% de arcilla y 40% o ms delimo
Margosos o francos:contienen igual proporcin dearena, limo y arcilla. Ideales para la agricultura.
Factores que afectan el movimiento de losmicroorganismos en el suelo- Tipo de suelo
La textura del suelo influye en las comunidades demicroorganismos porque de ella depende la aireacin
y la disponibilidad de agua
-
8/7/2019 Microbiolog%EDa del suelo
22/94
Los suelos estnformados de materiaslida y espacio
poroso El espacio poroso esocupado pordiferentesproporciones de aire y
agua, dependiendo delas condiciones dehumedad.
Arcilla
Materia orgnica
Pelcula de Agua
BacteriasHifa
Arena
Poro
CO2,H2S,CH4
O2
Factores que afectan el movimiento de losmicroorganismos en el suelo- Tipo de suelo
-
8/7/2019 Microbiolog%EDa del suelo
23/94
Intercambio catinico
Los nutrientes
inorgnicos paramicroorganismosy plantas estnpresentes en la
solucin delsuelo comoiones.
Arcilla -
Na+
Na+
Na+
H+ Ca+ +
Ca+ +
K+
K+ Na+
Cl-
NO3-HCO3
-
OH-
OH-
OH-SO4-2
HCO3-
NO3-HCO3
-
Factores que afectan el movimiento de losmicroorganismos en el suelo- Tipo de suelo
-
8/7/2019 Microbiolog%EDa del suelo
24/94
Intercambio catinico:
Los cationes apresados por laspartculas de arcilla pueden:
Ser reemplazados porotros cationes Ser liberados a la
solucin del suelo para
ser tomados por plantasy microorganismos.
Partculas dearcilla:componentes
esenciales de
los suelos
productivos.
Factores que afectan el movimiento de losmicroorganismos en el suelo- Tipo de suelo
-
8/7/2019 Microbiolog%EDa del suelo
25/94
Los aniones (NO3-, SO4-2,HCO3-, y OH-) sonlixiviados del sueloms rpidamente quelos cationes ya que nopueden fijarse a laspartculas de arcilla.
El fosfato no puede serarrastrado, ya que: Forma precipitados
insolubles Es absorbidoabsorbido o
adsorbidoadsorbido en lasuperficie decompuestos que
contienen hierro,aluminio y calcio.
Factores que afectan el movimiento de losmicroorganismos en el suelo- Tipo de suelo
-
8/7/2019 Microbiolog%EDa del suelo
26/94
* pH del sueloEl suelo no es un medio homogneo y puede
presentar diferentes pH entre microhabitats
Factores que afectan el movimiento de losmicroorganismos en el suelo
* Procesos microbianos activos1. Produccin de polmeros extracelulares y
apndices asociados con la unin de las clulas
a superficies
Arcilla
-
8/7/2019 Microbiolog%EDa del suelo
27/94
- Estos polmeros sirven ademsa las clulas como proteccincontra predacin y desecacin
- Adems tienen un papel vital en laformacin de agregados microbianos
Factores que afectan el movimiento de losmicroorganismos en el suelo- Procesos microbianos activos
-
8/7/2019 Microbiolog%EDa del suelo
28/94
2. Respuesta quimiotactica
Factores que afectan el movimiento de losmicroorganismos en el suelo- Procesos microbianos activos
La acumulacin de clulas a sitios con una alta
concentracin de nutrientes es el resultado de unaQuimiotaxis positiva
La quimiotaxis puede incrementar la velocidad de
adsorcin microbiana a partculas de suelo ms
rpido que cuando no se presenta respuestaquimiotactica
La quimiotaxis puede ser la responsable de la
retencin de microorganismos en la rizosfera
-
8/7/2019 Microbiolog%EDa del suelo
29/94
3. Animales del suelo
La poblacin de animales que habitan
el suelo son principalmente: nemtodos,anlidos (lombriz de tierra) y diferentes
artrpodos (ciempis, caros ect).
Estos animales participan en la
dispersin microbiana por diferentes
mecanismos:
Factores que afectan el movimiento de losmicroorganismos en el suelo
- Los anlidos remueven el suelo aumentando
los poros por donde circula el agua que percola
y por lo tanto una va de dispersin de bacterias
-
8/7/2019 Microbiolog%EDa del suelo
30/94
- Los anlidos pueden ingerir partculas de
suelo y por lo tanto de bacterias, lo que
constituye otra forma de dispersin microbiana
Factores que afectan el movimiento de losmicroorganismos en el suelo
- Los anlidos pueden transportar los
microorganismos sobre su superficie corporal
- Los protozoos son lo principales predadores
de bacterias y existen reportes que evidencianque las bacterias permanecen viables por un
tiempo determinado, lo que constituye otra
forma de dispersin
-
8/7/2019 Microbiolog%EDa del suelo
31/94
4. Dispersin debida a actividades del hombre
- Prcticas agrcolas
Factores que afectan el movimiento de losmicroorganismos en el suelo
Residuos de suelo de un campoinoculado puede adherirse a la
superficie de la maquinaria
utilizada en la agricultura, lo
que se convierte en otra
forma de dispersin
-
8/7/2019 Microbiolog%EDa del suelo
32/94
Factores que afectan el movimiento de losmicroorganismos en el suelo
Las prcticas agrcolas pueden
de manera indirecta la dispersin
microbiana por la alteracin
de su estructura y al utilizaragroqumicos puede alterar
las concentraciones de iones
en el suelo
5. Dispersin debida a otros animales (pjaros,conejos etc.)
6. Dispersin por medio de aerosoles y polvo
-
8/7/2019 Microbiolog%EDa del suelo
33/94
Influencia del ambiente del
suelo en las poblacionesde microorganismos
-
8/7/2019 Microbiolog%EDa del suelo
34/94
Aunque losmicroorganismos sonubicuos, en pocassituaciones existen
poblaciones iguales.
Nunca se dan
condicionesambientales idnticas: Las que favorecen la
reproduccin de un
microorganismo, opermiten lasobrevivencia de otro,pueden serdesfavorables para la
existencia continuadade un tercero.
-
8/7/2019 Microbiolog%EDa del suelo
35/94
Estas diferencias se reflejan en la microflora
Los sueloscultivados y de
jardn tienen
abundancia deoxgeno y agua yson ricos ennutrientesaportados por lasfertilizaciones
El suelo de un pinarsuele ser muy cido y sucontenido en principios
nutritivos es bajo Los terrenos pantanososestn inundados, tienenpoco oxgeno ycontienen abundantemateria orgnica endescomposicin.
-
8/7/2019 Microbiolog%EDa del suelo
36/94
Factores que afectan en mayor grado a las
poblaciones de microorganismos
DISPONIBILIDAD DEOXGENO, AGUA Y
SUSTANCIASNUTRITIVAS
TCNICAS DEMANEJO DEL
SUELO
pH DEL SUELOAcidez-
Alcalinidad
TEMPERATURA
POBLACIONES DE MICROORGANISMOS
-
8/7/2019 Microbiolog%EDa del suelo
37/94
REQUERIMIENTOS NUTRITIVOSREQUERIMIENTOS NUTRITIVOS
Utilizacin deenerga lumnica
Oxidacinquimioautotrficade materiasinorgnicas
Respiracin hetertrofade materiaorgnica
Fermentacinde materia orgnica
-
8/7/2019 Microbiolog%EDa del suelo
38/94
-
8/7/2019 Microbiolog%EDa del suelo
39/94
-
8/7/2019 Microbiolog%EDa del suelo
40/94
El nivel de aporte de oxgeno tambindetermina la forma de metabolizar losnutrientes.
Los anaerobios facultativos metabolizan los
polisacridos aerbicamente en presencia de
oxgeno, descomponiendolos hasta dixido de
carbono y agua con alta liberacin de energa.
Cuando no hay oxgeno lo hacen anaerobicamente,
mediante el proceso de fermentacin, en el cual la
degradacin slo es parcial y con poca liberacin de
energa.
-
8/7/2019 Microbiolog%EDa del suelo
41/94
pH
El pH ptimo para lamayora de las
bacterias, algas yprotozoos estalrededor de 7.
Con pocasexcepciones estos
microorganismos nocrecen por debajo deun pH de 4 o porencima de un pH 9.
-
8/7/2019 Microbiolog%EDa del suelo
42/94
-
8/7/2019 Microbiolog%EDa del suelo
43/94
Las formas vegetativasde las bacterias sonmenos resistentes a la
desecacin que los
hongos o losactinomicetos.
Las endosporastermoestablesproducidas por las
bacterias, como Bacillus
y Clostridium, sonresistentes a la
desecacin.
AGUA
El exceso de agua en el suelo suele causar
encharcamiento y prdida de oxgeno en loscapilares del suelo lo cual hace que
disminuyan los microorganismos aerobios y
aumenten los anaerobios.
-
8/7/2019 Microbiolog%EDa del suelo
44/94
Tcnicas de manejo del suelo
Las poblaciones de microorganismos del suelo, se pueden:
Disminuir o erradicar por perturbaciones importantes del suelo
Favorecer con prcticas adecuadas.
Erradicar por concentraciones txicas de metales
pesados, uso de plaguicidas
Aradas profundas, volteo del suelo y solarizacin.
Sistemas de produccin y explotacin del suelo
(cultivos intensivos sin manejo adecuado
-
8/7/2019 Microbiolog%EDa del suelo
45/94
Materia orgnica del suelo
Origen de la materia orgnica del suelo:
Bacterias, hongos, algas, lquenes,musgos y plantas que crecen sobre oentre los minerales y las rocaserosionadas
Plantas y animales muertos
-
8/7/2019 Microbiolog%EDa del suelo
46/94
Contribuyen a la formacin
de materia orgnicala convierten en cido
carbnico o cidos
orgnicos
disuelven rocas
Controlan la
disponibilidad demuchos nutrientesimportantes para lasplantas
Los microbios en el sueloLos microbios en el suelo
-
8/7/2019 Microbiolog%EDa del suelo
47/94
La gente desconoceque cuando tiene un
gramo de tierra en elhueco de la mano,tiene entre un milln ymil millones de seresvivos en esa mano.
-
8/7/2019 Microbiolog%EDa del suelo
48/94
Una muestra de suelocontiene:
Insectos
Arcnidos Sobretodo filamentos de
hongos y bacterias.
La cuenta degrmenes porsuspensin- dilucinmuestra ms de unmilln de grmenespor gramo de tierraarable
La riqueza de especies y la complejidad dela delgada capa cultivable condicionan lavida sobre la tierra, del mismo modo que lafotosntesis.
-
8/7/2019 Microbiolog%EDa del suelo
49/94
Ciclo de la materia orgnica
CO2
Fotosntesis
Cada de ramas,hojas, frutos..
Mineralizacin Humificacin
Microorganismos del sueloMicrofauna del suelo
Restos vegetalesdesaparecen bajo
la accin de la
microfauna y lamicroflora delsuelo
-
8/7/2019 Microbiolog%EDa del suelo
50/94
Amontonamiento de acculasde varios centmetros.
CO2Fotosntesis
Cada de ramas,hojas, frutos..
Mineralizacin Humificacin
Descomponedores casi ausentes:hongos y bacterias
Microfauna del sueloAcumulacin
Acidez frena actividadmicrobiana
-
8/7/2019 Microbiolog%EDa del suelo
51/94
Papel de la poblacin microbianadel suelo:
Mineralizacin (descomposicin) de la materiaorgnica: proporciona a la planta los nutrientesnecesarios para su desarrollo
-
8/7/2019 Microbiolog%EDa del suelo
52/94
Los residuos orgnicosno consumidos van a serdegradados por lamicroflora. Son los
hongos, en primer lugar,los que van a atacar a lamateria orgnica fresca,y en el siguiente orden:
-
8/7/2019 Microbiolog%EDa del suelo
53/94
Mineralizacin de la materia orgnicaDescomposicin de hojas (Sucesin)
Tiempo (las fases pueden ser simultneas)
Hongos:glucfilos
utilizacin delas
sustancias
hidrosolubles
Hongoscelulolticos:metabolismode la celulosa
Hongoslignolticos :degradacinde la lignina
Bacterias: transforman residuos fngicos yproductos no consumidos por las hifas.
-
8/7/2019 Microbiolog%EDa del suelo
54/94
Plantas y microorganismos
son complementarios: unos
fabrican materias carbonadas,otros liberan minerales
CAPA VEGETAL DEL SUELO
-
8/7/2019 Microbiolog%EDa del suelo
55/94
CO2
H2O
Material mineralno utilizado por losmicroorganismos
CAPA VEGETAL DEL SUELO
Materia inorgnica
Materia orgnica
Races de las
plantas
Hojas de lasplantas
Fotosntesis
Microorganismos
-
8/7/2019 Microbiolog%EDa del suelo
56/94
Proteccin de los microorganismos antedesequilibrios ambientales
Cuando se aade materia orgnica a lossuelos agrcolas, las bacterias consumentodo el carbono disponible.
Consecuencia: rarefaccin, e inclusodesaparicin de los microorganismos.
Para estos casos, la naturaleza ha creadosistemas de proteccin para que losmicroorganismos sobrevivan
-
8/7/2019 Microbiolog%EDa del suelo
57/94
Estructuras de proteccin de los hongos
Clamidospora:clula latente, con paredgruesa y cuyo contenido es rico en reservas
Esclerote: esfera cuyo envoltorio externo estconstituido de hifas muertas de pared gruesa, y
el centro de filamentos vivos ricos en reservas,en estado latente.
-
8/7/2019 Microbiolog%EDa del suelo
58/94
Estructuras de proteccin delas bacterias
Las (Gram+)formanendosporas.
Susceptibles desobrevivirmuchos aos encondicionesdesfavorables.
Las Gram- estn desprovistasde mecanismos de resistencia
Forman agregados biolgicoscuando las condiciones sondesfavorables
La actividad celular y lasdivisiones, se hacen mslentas.
-
8/7/2019 Microbiolog%EDa del suelo
59/94
Numerosos
procariotas paraprotegerse exudan ensu superficiepolisacridosque se
adhieren a lminas dearcilla. Son estructuras que
permiten lasupervivenciade lasbacterias
Seformancuando lascondicionesambientales llegan aserdesfavorables
Desaparecencuandolas condicionespedolgicas vuelven a
seradecuadas
-
8/7/2019 Microbiolog%EDa del suelo
60/94
Aislamiento de
microorganismosdel suelo
-
8/7/2019 Microbiolog%EDa del suelo
61/94
Lagran diversidad de la flora
microbiana representa un gran
problema ante cualquier intento
deenumerar la poblacin viable
totalde microorganismos que hayen una muestra de suelo.
Aislamiento de microorganismos delsuelo
Ai l i d i i d l
-
8/7/2019 Microbiolog%EDa del suelo
62/94
Los mtodos de cultivo
solo nos revelarn
aquellos tipos
nutricionales y
fisiolgicos que puedencrecer en el ambiente
que ofrece el
laboratorio.
Si cultivamos suelo en
agar nutritivo a 35o
C nocrecern:
termfilos obligados
psicrfilos
anaerobios auttrofos
protozoos
y pocas especies algas
y hongos.
Aislamiento de microorganismos delsuelo
Ai l i t d i i d l
-
8/7/2019 Microbiolog%EDa del suelo
63/94
El nmero de microorganismos en una
muestra natural puede ser determinada
por mtodos de cultivo como:
Conteo en placa
Conteo directo al microscopio
Cuando una muestra de suelo se cultiva en el
laboratorio, por cualquiera de los procedimientos
de cultivo, solo se recuperar un pequeo sectorde la poblacin microbiana total que hay en ese
suelo.
Aislamiento de microorganismos delsuelo
Ai l i t d i i d l
-
8/7/2019 Microbiolog%EDa del suelo
64/94
Los mtodos de enumeracin
que involucran el cultivo de
organismos presentan el
problema de que no todas las
bacterias viables crecern
sobre un medio especfico.
Un segundo problema asociado
a todos los mtodos de
enumeracin es que ellos
no indican cuando los
microorganismos
estn activos en el ambiente
Aislamiento de microorganismos delsuelo
Ai l i t d i i d l
-
8/7/2019 Microbiolog%EDa del suelo
65/94
Los recuentos directosal microscopio,
tericamente, permiten
la enumeracin de
todos losmicroorganismos
excepto los virus.
Pero esta tcnica tienetambin sus limitaciones,
basadas especialmente en
la distincin entre
microorganismos vivos y
muertos.
Aislamiento de microorganismos delsuelo
Ai l i t d i i d l
-
8/7/2019 Microbiolog%EDa del suelo
66/94
Tambin pueden
visualizarse los
microorganismosusando tinciones
fluorescentes como
naranjadeacridina que
tie todas las clulas
O usando anticuerpos
fluorescentes o sondas
de DNA para laidentificacin de una
especie en particular
Aislamiento de microorganismos delsuelo
Ai l i t d i i d l
-
8/7/2019 Microbiolog%EDa del suelo
67/94
Un mtodo ms reciente para el
entendimiento de la funcin y
estructura de las comunidades
microbianas involucra la extraccin
directa de DNA (o RNA) de unamuestra natural
El material gentico recobrado es
caracterizado y entonces la comunidad
es descrita.
Este procedimiento evita los cambios
que ocurren en una poblacin como
resultado de subcultivo en medio de
cultivo enriquecido
Aislamiento de microorganismos delsuelo
Aislamiento de microorganismos del
-
8/7/2019 Microbiolog%EDa del suelo
68/94
Los cultivos deenriquecimiento sonusados paraseleccionar microbioscapaces detransformacionesmetablicasparticulares
Esto involucra el usode condicionesselectivas apropiadasen el medio y el usode un inculo quecontiene losmicroorganismos deinters
Aislamiento de microorganismos delsuelo
-
8/7/2019 Microbiolog%EDa del suelo
69/94
La columna de Winogradsky esun ejemplo de un cultivo de
enriquecimiento, en la cual una
comunidad de microorganismos
facilita el crecimiento de otra y
viceversa
Es una clsica demostracin de la
diversidad metablica de los
procariotes, permite observar las
cuatro estrategias bsicas de vidade los microorganismos:
* Fotoauttrofos
* Quimiohetertrofos
* Fotohetertrofos
* Quimioauttrofos
Aislamiento de microorganismos delsuelo - columna de winogradsky
-
8/7/2019 Microbiolog%EDa del suelo
70/94
Inicialmente todos los organismos estn en nmeros
bajos, despus de 2 a 3 meses de incubacin los
diferentes tipos de microorganismos proliferan yocupan distintas zonas de la columna, donde las
condiciones ambientales favorecen sus actividades
especficas y por lo tanto su crecimiento.
Aislamiento de microorganismos delsuelo - columna de winogradsky
-
8/7/2019 Microbiolog%EDa del suelo
71/94
1. La celulosa promueve el crecimiento
rpido de microorganismos, lo que
hace que disminuya el oxgeno enel sedimento y en la columna de
agua, solo la parte superior de la
columna permanece aireada.
Eventos en la columna:
Aislamiento de microorganismos delsuelo - columna de winogradsky
-
8/7/2019 Microbiolog%EDa del suelo
72/94
2. El gnero Clostridium, estrictamente
anaerobio, degradacelulosa a glucosa
y fermenta sta ltima para obtener
energa, produciendo etanol,
cido actico entre otros productos.
3. Desulfovibrio usa sulfatos u otras
formas parcialmente oxidadas de
sulfuro como aceptor terminal de
electrones generando grandes
cantidades de H2S, que reaccionacon hierro del sedimento produciendo
sulfuro ferroso negro; o el H2S difunde
a la parte superior para ser utilizado
por otros organismos
Aislamiento de microorganismos delsuelo - columna de winogradsky
-
8/7/2019 Microbiolog%EDa del suelo
73/94
4. El H2S que difunde es usado por
bacterias anaerobias fotosintticas
(bacterias del azufre verdes y
prpuras), utilizan CO2 como
fuente de carbono5. Las bacterias prpuras no del
azufre crecen en condiciones
anaerbicas, obteniendo energa
de la luz y usan cidos orgnicos
(productos de fermentacin deorganismos anaerobios) como
fuente de carbono (fotohetertrofos)
Aislamiento de microorganismos delsuelo - columna de winogradsky
Ai i i i
-
8/7/2019 Microbiolog%EDa del suelo
74/94
6. En la zona aerobia pueden
crecer 3 tipos principales
de organismos
- Bacterias oxidantes de
sulfuros: oxidan el H2S que
asciende a esta zona a
sulfatos, son por lo tanto
quimiosintticos oquimioauttrofos
- Cyanobacterias fotosintticas
- Bacterias con envoltura
Aislamiento de microorganismos delsuelo - columna de winogradsky
-
8/7/2019 Microbiolog%EDa del suelo
75/94
-
8/7/2019 Microbiolog%EDa del suelo
76/94
Papel de los
microorganismos enlos ciclos biogeoqumicos
-
8/7/2019 Microbiolog%EDa del suelo
77/94
Un camino para tener una mejor comprensin de la gran
diversidad de la vida microbiana del suelo consiste en
considerar los papeles que desempean varios grupos de
microorganismos, para realizar los cambios qumicos que
ocurren en el suelo. El papel ms importante de los microorganismos en el suelo
es su capacidad para realizar cambios qumicos en las
sustancias que hay en el suelo, especialmente la
conversin de compuestos orgnicos de carbono, nitrgeno,
azufre y fsforo en compuestos inorgnicos este proceso seconoce como mineralizacin.
ciclos biogeoqumicos
ciclos biogeoqumicos
-
8/7/2019 Microbiolog%EDa del suelo
78/94
ciclos de nutrientes
Desintegracin de la
materia orgnica y
liberacin de nutrientes
que pueden ser
reutilizados por las
plantas.
Microorganismos y animales
Materia orgnica est
compuesta
principalmente por:
Hojas muertas y otras
partes de las plantas
Animales en
descomposicin.
Plantas y Animales
-
8/7/2019 Microbiolog%EDa del suelo
79/94
Cada elemento tiene unciclo diferente queimplica:Muchos microorganismos(diferentes sistemasenzimticos)
Pero siempre:
Una gran cantidad delelemento es devueltoal suelo, otra partees liberada a la atmsferay el resto es asimiladapor los microorganismos eincorporada en sus tejidos,
proceso llamadoinmovilizacin
ciclos biogeoqumicos
Por lo tanto en el suelose dan dos procesos
concomitantes:mineralizacin-inmovilizacin
ciclos biogeoqumicos
-
8/7/2019 Microbiolog%EDa del suelo
80/94
La geoqumica del carbono tiene un especial significado,en razn del papel clave de este elemento en la
estructura protoplasmtica y de su papel esencial en el
metabolismo energtico de los hetertrofos
CICLO DEL CARBONO
El ciclo conlleva el intercambio del elemento entre laspartes vivientes y no vivientes del ecosistema
El contenido de CO2
de la atmsfera se ha incrementado
a una tasa constante, con relacin a pocas anteriores,
como resultado de la quema de combustibles fsiles
(productos de la actividad fotosinttica de hace millones
de aos) y de la defosteracin
ciclos biogeoqumicos
-
8/7/2019 Microbiolog%EDa del suelo
81/94
Distribucin del carbono en los principales componentesInvolucrados en el ciclo del carbono en el suelo
Componente Cantidad de C x 1012 Kg
AtmsferaMateria orgnica del sueloHumus marinoFormas de vida terrestre
Forma de vida en los ocanosCarbonato-bicarbonato disueltoen ocanosCarbn y petrleoSedimentos
70025003000480
503840
1 x 104
6 x 102
CICLO DEL CARBONO
-
8/7/2019 Microbiolog%EDa del suelo
82/94
Combustiblesfsiles Humus
Plantasterrestres
Plantasacuticas
y algas
Animales ymicroorganismos
CO2disuelto
Animalesacuticos
CO2atmosfrico
Corteza terrestre
Formacin del sueloMuerte y mineralizacin
en los sedimentos
Formacin
de la roca
CICLO DEL CARBONO
NCICLO DEL
-
8/7/2019 Microbiolog%EDa del suelo
83/94
N2 NO
N2O
NO2-
NO3
Nitrobacter
Nitrificacin NO2-
Nitrosomonas
NH2
Asim
ilaci
n
Desnitrificacin
NH3
Fijacin del
nitrgeno
Aerobio
Anaerobio
NITRGENO
Desamin
ac
in
Protenas
Lixiviacin
As
imil
ac
in
Desamin
ac
in
As
imila
ci
n
Fijacin del nitrgeno:
-
8/7/2019 Microbiolog%EDa del suelo
84/94
j g
La permanencia de la vida en la tierra depende de que el nitrgeno extrado de ella
sea continuamente
reemplazado
* Transformacin del nitrgeno atmosfrico (N2, nitrgenolibre) en nitrgeno de un compuesto orgnico o nitrgeno
fijo.* Puede ser bitica, abitica e industrial.
* Aunque la reduccin del N2 puede ocurrir qumicamente, el 85% de lafijacin de nitrgeno es debida a la actividad microbiana.
* La fijacin puede ser llevada a cabo por organismossimbiticos (Rhizobium), que viven en las races de
plantas leguminosas como frjol y arveja y por organismos
no simbiticos que viven libres en el suelo
Impacto ambiental del exceso de fertilizantes nitrogenados:
-
8/7/2019 Microbiolog%EDa del suelo
85/94
p g
Acumulacin de nitratos en el subsuelo, que por lixiviacin
se incorpora a las aguas subterrneas o reservorios
superficiales
Actan como fertilizantes
de la vegetacin acutica
(algas y plantas)
Eutrofizacin
- Elevado consumo de oxgeno- Dificulta incidencia de rayos solares
Disminucin de la capacidad
autodepuradora del medio
Consumo de agua rica
en nitratos
Nitratos pasan a nitritos
por accin de bacterias
del estmago y vejiga
Los nitritos se convierten
en compuestos
cancergenos
(nitrosaminas)
1 2
Fij i d l it
-
8/7/2019 Microbiolog%EDa del suelo
86/94
Las sales de nitrato son muy solubles, por lo que la
posibilidad de que se produzca la lixiviacin del anin
es elevada
El fenmeno de lixiviacin es ayudado por el bajopoder de adsorcin que presentan la mayora de
suelos para las partculas cargadas negativamente
La cantidad de nitratos que se lixivia hacia el subsuelo
depende de: rgimen de pluviosidad y el tipo de suelo Los suelos tropicales adquieren carga positiva y por
tanto una fuerte retensin para los nitratos
Fijacin del nitrgeno:
Oxidacin bacteriana
-
8/7/2019 Microbiolog%EDa del suelo
87/94
Nitrgeno amoniacal
NH3
Nitrgeno
atmosfricoN2
Nitritos
NO2-
Protena animal
N orgnico
Protenas vegetales
N orgnico
Materia
fecalUrea
Nitratos
NO3-
descomp
osicin
bacteri
al
Muertey
Descomposi
ci
n
bacterial
Hidrlisis
Fertiliz
antesp
araplantas
Muer
teydescomposicin
bacterial
Manufactura
qumica
Oxidacin
bacteria
na
Nitr
o
bacter
Red
uccin
ba
cteriana
Fertiliza
nte
paraplan
tas
acuticas
Reduc
cin
Descargaelctrica
Procesosdecombustin
Reduccin bacteriana
Oxidacin bacteriana
Nitrosomonas
Alimento
para animales
-
8/7/2019 Microbiolog%EDa del suelo
88/94
El nitrgeno presente en las aguas residuales frescas est
constituido por protenas y urea que por accin bacterial,
son descompuestas a amonaco
El nitrgeno en la forma de nitratos es despus utilizado por
las algas y dems plantas acuticas.Estas plantas sirven luego de alimento a los animales que
tambin forman su protena animal; una vez se produce la
muerte de plantas y animales se forma de nuevo nitrgeno
amoniacal
El nitrgeno puede existir en forma de in amonio (NH4+) oamonaco segn el pH de la solucin:
NH3 + H2O NH4+ + OH-
pH >7 amonaco
pH
-
8/7/2019 Microbiolog%EDa del suelo
89/94
5. Divisin celularcontinua de planta
y bacteria
Ndulo
Lectina
rizobialPelo de la
raz
1. Reconocimientoy unin
2. Invasin
4. Estadobacteroide
3. La cadenainfecciosa debacterias se
desarrolla haciala raz
Cadena infecciosa Lasclulas invadidas y las
cercanas son estimuladas
a dividirse
Fijacinsim
bitic
adeln
itrg
eno
CICLO DEL AZUFRE
-
8/7/2019 Microbiolog%EDa del suelo
90/94
H2S
SHGrupos deprotenas
Reduccinasimilatoria del
sulfato
Desulfuracin
Reduccin
desasimilatoria
del sulfato
S0
SO4=
BeggiatoaThiothrixThiobacillusSulfolobus
S0
BeggiatoaThiothrix
Thiobacillus
AnaerbicaAaerbica
SHGrupos deprotenas
Reduccinasimilatoria del
sulfato
Desulfuracin
Bacterias fotosintticasanoxignicas
-
8/7/2019 Microbiolog%EDa del suelo
91/94
El azufre se encuentraen la tierra en
sedimentos y rocas,
como:
Sulfato (yeso, CaCO4) Minerales de sulfuro
(Pirita, FeS2)
-
8/7/2019 Microbiolog%EDa del suelo
92/94
El azufre, como el nitrgeno, puede tener variosestados de oxidacin.
Los tres estados de oxidacin ms significativosson: Sulfhidrilos (R-SH) Y sulfuros (HS)
Azufre elemental (S0)
Sulfatos (SO4=).
-
8/7/2019 Microbiolog%EDa del suelo
93/94
El sulfato es usado por
los microorganismos
como fuente de azufre.
Ellos reducen el sulfato
a sulfuro decompuestos orgnicos.
Algunastransformaciones redox
ocurren qumicamente y
otras son mediadas por
microorganismos.
-
8/7/2019 Microbiolog%EDa del suelo
94/94
Las bacterias reductorasdel sulfato:
Desasimilan el sulfato a
sulfuro de hidrgeno en
ambientes anaerobios.
Estos microbios usanlos compuestos
orgnicos o el H2 como
fuente de electrones
para reducir el sulfato.
H2SSO4=
H2