Bioquimica

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HISPANOAMERICANA Seriedad y Prestigio Facultad de Ciencias de la Salud Escuela de Nutrición (Sede Aranjuez) Programa de Curso Materia Regular: Profesor a cargo: Coordinador de Cátedra: Cuatrimestre: Código del curso: Créditos: Horas de teoría: Horario: Horas de laboratorio: Sede: Carga académica total: Bioquímica Nu-024 Ing. Adolfo Ulate B. M.Sc. ([email protected]) III C 2012 » 4 3 L: 6 p.m. a 9 p.m. y S: 9 a.m. a 12 p.m. 0 Aranjuez 8 Justificación y Descripción del curso El curso de Bioquímica provee los contenidos teóricos - prácticos para estudiantes que de previo han desarrollado el curso de química general inorgánica y de química orgánica. Dicha materia proporciona los conocimientos necesarios para lograr interpretar por medio de la bioquímica, el funcionamiento normal del cuerpo humano, entre ellos el reconocimiento de los principios de la transferencia de energía en las células, los mecanismos reguladores de las rutas metabólicas, la importancia de las membranas celulares, los ribosomas, y otros elementos estructurales de las células en sus actividades moleculares. Todo lo anterior correlacionado con el campo de la nutrición humana. Requisitos Académicos QL-001, QL-005 *Objetfva-Germral- - > Proporcionar al estudiante los elementos teóricos - prácticos indispensables para la comprensión de _ la bioquímica en el ámbito celular, en el que sus principios de organización se ponen en evidencia con mayor claridad; dando la máxima importancia a los conceptos centrales, en lugar de un tratamiento enciclopédico de detalles biológicos. Objetivos específicos' Repasar el rol del agua en los procesos biológicos, relacionar dicho rol con sus características estructurales y las propiedades fisicoquímicas que estas le confieren. Analizar los procesos bioenergéticos desde el punto de vista termodinámico y estudiar la participación de los mediadores químicos en los intercambios energéticos en los seres vivos. Describir las características y funciones de los principales biocompuestos. Describir los métodos de extracción y análisis cuantitativos, de los principales biocompuestos. Explicar las características termodinámicas y cinéticas de la catálisis enzimática y las variables que las afectan. Determinar las características básicas que permiten conocer el comportamiento cinético de una enzima. Describir de manera general las rutas catabólicas y anabólicas. Describir, con mayor detalle, algunos ciclos y procesos de degradación y biosíntesis de los principales biocompuestos. Proveer una visión integrada del metabolismo celular, su control y la localización celular de sus procesos. Analizar los procesos bioenergéticos y estudiar la participación de los mediadores químicos en los intercambios energéticos en los seres vivos. Estrategias de enseñanza-aprendizaje (metodología) Exposición magistral de ubicación. Investigación bibliográfica. Discusión sobre los conceptos. Charlas magistrales. Grupos de discusión. Mesas redondas. Investigación documental. Discusión dirigida Charlas magistrales. Establecer debates y sesiones plenarias que permitan la comprensión y análisis de los temas. Grupos de discusión. Mesas redondas. Investigación documental. Discusión dirigida Discusión dirigida Universidad Hispanoamericana Página 1

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Programa de curso

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HISPANOAMERICANA Seriedad y Prestigio

Facultad de Ciencias de la Salud Escuela de Nutrición (Sede Aranjuez)

Programa de Curso

Materia Regular: Profesor a cargo: Coordinador de Cátedra: Cuatrimestre: Código del curso: Créditos: Horas de teoría: Horario: Horas de laboratorio: Sede: Carga académica total:

Bioquímica Nu-024

Ing. Adolfo Ulate B. M.Sc. ([email protected])

III C 2012 »

4 3 L: 6 p.m. a 9 p.m. y S: 9 a.m. a 12 p.m. 0 Aranjuez 8

Justificación y Descripción del curso

El curso de Bioquímica provee los contenidos teóricos - prácticos para estudiantes que de previo han desarrollado el curso de química general inorgánica y de química orgánica. Dicha materia proporciona los conocimientos necesarios para lograr interpretar por medio de la bioquímica, el funcionamiento normal del cuerpo humano, entre ellos el reconocimiento de los principios de la transferencia de energía en las células, los mecanismos reguladores de las rutas metabólicas, la importancia de las membranas celulares, los ribosomas, y otros elementos estructurales de las células en sus actividades moleculares. Todo lo anterior correlacionado con el campo de la nutrición humana.

Requisitos Académicos

QL-001, QL-005

*Objetfva-Germral- - >

Proporcionar al estudiante los elementos teóricos - prácticos indispensables para la comprensión de_la bioquímica en el ámbito celular, en el que sus principios de organización se ponen en evidencia con mayor claridad; dando la máxima importancia a los conceptos centrales, en lugar de un tratamiento enciclopédico de detalles biológicos.

Objetivos específicos'

Repasar el rol del agua en los procesos biológicos, relacionar dicho rol con sus características estructurales y las propiedades fisicoquímicas que estas le confieren. Analizar los procesos bioenergéticos desde el punto de vista termodinámico y estudiar la participación de los mediadores químicos en los intercambios energéticos en los seres vivos. Describir las características y funciones de los principales biocompuestos. Describir los métodos de extracción y análisis cuantitativos, de los principales biocompuestos. Explicar las características termodinámicas y cinéticas de la catálisis enzimática y las variables que las afectan. Determinar las características básicas que permiten conocer el comportamiento cinético de una enzima. Describir de manera general las rutas catabólicas y anabólicas. Describir, con mayor detalle, algunos ciclos y procesos de degradación y biosíntesis de los principales biocompuestos. Proveer una visión integrada del metabolismo celular, su control y la localización celular de sus procesos. Analizar los procesos bioenergéticos y estudiar la participación de los mediadores químicos en los intercambios energéticos en los seres vivos.

Estrategias de enseñanza-aprendizaje (metodología)

Exposición magistral de ubicación. Investigación bibliográfica. Discusión sobre los conceptos. Charlas magistrales. Grupos de discusión. Mesas redondas. Investigación documental. Discusión dirigida Charlas magistrales. Establecer debates y sesiones plenarias que permitan la comprensión y análisis de los temas. Grupos de discusión. Mesas redondas. Investigación documental. Discusión dirigida Discusión dirigida

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Este es un curso, en el que se requiere el estudio de gran cantidad de teoría, se combina este con situaciones prácticas en el que el estudiante, con la ayuda del docente lleve a cabo su función. Para que los estudiantes afirmen el conocimiento y logren habilidades y destrezas importantes que pueden aplicar en su profesión, deben realizar estudio de de la bibliografía recomendada por su cuenta. Por ello, el desarrollo del curso demanda la utilización de distintas técnicas activas para la enseñanza y el aprendizaje, entre otras: exposiciones magistrales por parte del docente, guía individualizada del docente en el laboratorio y prácticas de laboratorio.

Recursos Educativos

Charlas magistrales audiovisuales, multimedia, consulta permanente al estudiante, resolución de problemas, consulta bibliográfica.

Estrategias de Evaluación

Evaluar participaciones con exposición de temáticas, exámenes parciales y actividades. Se tomaran en cuenta los conocimientos, habilidades y actividades de cada alumno. En los exámenes se valorará preferentemente la claridad de los conceptos y la coherencia entre los mismos, la amplitud de los conocimientos, así como la capacidad crítica del alumno durante las clases. Se valorará, la asistencia y participación en las ciases y otras actividades, seminarios y conferencias, organizadas durante el curso.

Método de evaluación Ponderación porcentual de escolaridad (100 %)

Primer examen parcial Segundo examen parcial (acumulativo) Examen final (acumulativo) Otras actividades (definidas por el profesor)

25 25 40 10

Total 100

Detalle de la evaluación

1. Los alumnos tienen la obligación de presentar todas las pruebas sumativas.

2. Los estudiantes deben asistir a todas las sesiones teóricas. La pérdida de tres sesiones ocasiona la reprobación del curso. La pérdida de 2 laboratorios automáticamente reprueba el curso. La asistencia al laboratorio es obligatoria, no hay posibilidad de reposición (por espacio en el laboratorio). Quien no asiste al laboratorio pierde ios puntos del informe correspondiente y del su nota de trabajo.

3. Las pruebas sumativas parciales serán realizadas en las fechas propuestas en el programa. Estas fechas planteadas no son negociables. La asistencia a exámenes programados es obligatoria; sólo se podrá faltar en casos muy justificados, quedando a criterio del Profesor la aceptación de la justificación. La justificación deberá ser entregada al profesor en la siguiente sesión de teoría, después de esta fecha No se aceptan justificaciones posteriormente.

Se considerará ausencia la llegada a la lección después de los primeros 15 minutos o la suma de dos llegadas tardías.

El incumplimiento de las normas de asistencia acarrea la pérdida del curso.

El profesor entregará a los alumnos, durante la primera semana del cuatrimestre, un documento que explique las normas de asistencia y los mecanismos de evaluación, pudiendo incluir tareas, exámenes, preguntas en clase en forma oral o escrita y cualquier otra forma de evaluar la dedicación y aprovechamiento del alumno, además del respectivo cronograma.

La evaluación está basada en la presentación de trabajos, pruebas sumativas, trabajo en laboratorio e informes. Si se obtiene un promedio general inferior al 70% reprueba el curso. Un promedio final superior o igual a 70%, aprueba el curso.

4. Nota de aprobación 70; nota mínima para optar por examen extraordinario o ampliación 60 (refiérase a los estatutos de evaluación universitarios). Solamente se realizará de ser necesaria una prueba extraordinaria.

Notas adicionales

2.

Las pruebas sumativas que presenten los alumnos serán entregadas, por el profesor, 8 días naturales posteriores a la realización. Una vez entregadas, el alumno deberá revisar su calificación. Si ésta fuese objeto de reclamos o aclaraciones, el alumno dispondrá hasta tres días hábiles para devolver la prueba con una nota formal de petición de revisión con el formato que ofrece el profesor. NO SE ACEPTAN APELACIONES SIN LAS BASES BIBLIOGRAFICAS CORRESPONDIENTES.

Una vez transcurrido este lapso de tiempo el profesor dará por recibido satisfactoriamente las calificaciones y NO atenderá peticiones posteriores. El profesor revisará las solicitudes que le fuesen entregadas y procederá a devolverlas ocho días naturales después corr las correcciones pertinentes.

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En caso de que el estudiante no estuviese conforme con la respuesta del profesor deberá elevar, por escrito, a la Coordinación de bromatología sus peticiones, la cual resolverá 8 días naturales luego de recibidas. Si el estudiante no respeta las instancias, descritas en el punto anterior, no se considerará válida la apelación.

4. Durante las evaluaciones sumativas queda terminantemente prohibido: materiales, objetos personales incluyendo cartucheras, teléfonos celulares (aunque este se encuentre en silencio o apagado) u otro dispositivo electrónico, salir del recinto una vez iniciada la prueba. La prueba se contestara en el formulario correspondiente con lapicero negro o azul, no se permite el uso del corrector liquido ni lápiz, el uso de cualquiera de estos dos últimos implica la pérdida del ítem y por ende el derecho a apelaciones. Bultos, carteras, salveques y otros artículos de uso personal deberán ser colocados en el lugar asignado para tal fin.

5. En caso de plagio o alteración de los documentos oficiales, se considerara falta grave y se anularan los documentos, obteniendo una nota de 0, asimismo se tomaran las medidas necesarias de acuerdo al reglamento establecido por la universidad.

I Bibliografía

Texto:

Mathews, C.K.; van Holde, K.E.; Ahern, K.G. 2003. Bioquímica. 3ra ed. Pearson Education

Bibliografía de consulta:

Campbell, Mary K y Swan O. Farrel. 2010. Bioquímica. Sexta edición. Cengage learning. México

Conn, E y Stumpf, P. 2000. Bioquímica Fundamental. Edición IX. Editorial Limusa. México. Harvey Lodish et al. 2007. Molecular Cell Biology, 5ta ed. Freeman Jeremy M. Berg, John L. Tymockzo, Lubert Stryer. 2006. Biochemistry, 5ta ed. Freeman Lenhinger, A.L, Nelson D.L,., Cox. M.M. 2004. Principios de bioquímica. 4ta ed. Worth Publishers Inc. (digitalizado) McKee, J.R.; McKee, T.; DePra, P. 2009. Bioquímica: La Base molecular de la vida. 4ta ed. McGraw-Hill Rodney Boyer. 2000. Conceptos de Bioquímica. Internacional Thomson Editores, S.A. de CV. México

Contenido de acuerdo al libro de texto Capí tu lo T í tu lo Páginas 2 Interacciones débiles en medio acuoso Todo 3 Energética de la vida Todo 4 Acidos nucleicos 95-122 • • 5 Nivel primario de la estructura proteica 141-163 * 6 Estructura tridimensional de la proteína Todo • 9 Hidratos de carbono Todo • 10 L íp idos, membranas y transporte celular 353-380 * 11 Enzimas 403-442 • 12 Introducción al metabolismo Todo 13 Metabolismo de los hidratos de carbono I: procesos

aerobios en la generación de energía Todo

14 Procesos oxidativos ciclo del ácido cítrico 541-568 15 Transporte electrónico Todo 16 Biosíntesis Todo § | 18 Metabolismo lipídico 701-727 20 Metabolismo de compuestos nitrogenados Todo

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Cronograma del curso

SEMANA 1 Setiembre 10 -15 Introducción, Enlace Químico, Agua y pH Interacciones débiles en sistemas acuosos. Ionización del agua ácidos y bases débiles. Concepto de pH. Amortiguadores. Ecuación de Henderson-Hasselbach. Química de la respiración

SEMANA 2 Setiembre 17-22 Amino ácidos. Estructura de proteínas y función. Aminoácidos: estructura, formas iónicas, solubilidad, propiedades generales, reacciones químicas. Péptidos y proteínas: Péptidos } biológicamente activos, técnicas de separación de aminoácidos y péptidos. Determinación de la composición de aminoácidos en los péptidos, estructura primaria de los polipéptidos. Análisis secuencial.

SEMANA 3 Setiembre 24 - 29 Proteínas II Visión general sobre la estructura proteica. Estructura secundaria de las proteínas (hélices alfa, hoja plegada beta, giros beta, la estructura del colágeno). Estructura terciaria y cuaternaria de las proteínas (el efecto de los aminoácidos en la cadena, las interacciones Ínter e intra moleculares). Desnaturalización y plegamiento de proteínas

SEMANA 4 Octubre 01 -06 Bioenergética (leyes de la termodinámica). Introducción a las enzimas (Tipos de enzimas y reacciones). Catálisis (Energía'libre, cinética, tipos de catálisis, encaje inducido). Cinética enzimática como método para comprender el mecanismo (Medida de la acción enzimática, concentración de sustrato y velocidad).

SEMANA 5 Octubre 08 -13 Cinética de Michaelis - Menten (Concepto de Km, Vm a x, gráficos de üneweaver-Burk). Inhibición enzimática (Reversible/Irreversible, inhibidores competitivos, no competitivos y alostéricos) Efecto de la temperatura, el pH y la salinidad del medio. Regulación enzimática

SEMANA 6 Octubre 15 -20 Primer examen parcial 25% Sábado 20 de octubre 2 pm

SEMANA 7 Octubre 22 - 27 Algunos conceptos básicos. Estructura de los ácidos nucleicos. Química de los ácidos nucleicos. Otras funciones de los ácidos nucleicos. Ácidos ribonucleicos (Tipos de ARN y estructura, síntesis del ARN mensajero en procariotas, síntesis del ARNm en eucariotas, iniciación de la traducción y síntesis de proteínas

SEMANA 8 Octubre 29 - 03 Lípidos Lípidos de almacenamiento. Lípidos estructurales (Clasificación, propiedades y reacciones). Lípidos como señales cofactores y pigmentos (Eicosanoides, fosfatidilinositol, esteróles, vitaminas A, D, E y K).

SEMANA 9 Noviembre 05 -10 Otros tópicos de lípidos y Membrana Celular Plasma y coagulación. Cascada de la coagulación (prostaglandinas, tromboxanos, leucotrienos). Visión (retinol, retinal). Membranas biológicas (composición y arquitectura).

SEMANA 10 Noviembre 12 - 17 Monosacáridos y disacáridos (Clasificación y propiedades). Enlace glucosídico. Oligosacáridos comunes. Polisacáridos. Derivados con importancia biológica. Glucoconjugados: Glucoproteínas, proteoglucanos y glucolípidos.

SEMANA 11 Noviembre 19 - 24

Segundo Examen 25% Sábado 24 de noviembre 2 pm

SEMANA 12 Noviembre 26 - 01 Glicólisis-Gluconeogénesis Metabolismo de los hidratos de carbono, síntesis de glucógeno, degradación de glucógeno. Gluconeogénesis, metabolismo de fructosa y mañosa, metabolismo de galactosa, metabolismo de las hexosas

SEMANA 13 Diciembre 03 - 08 Fosforilación Oxidativa y Ciclo del ácido cítrico Descarboxilación oxidativa de piruvato, ciclo de Krebs. Cadena respiratoria, Fosforilación oxidativa, mecanismos de lanzadera.

SEMANA 14 Diciembre 10 -15 Metabolismo: ácidos grasos, lipólisis, B-oxidación, metabolismo: rol en los tejidos. Colesterol. Regulación de los metabolismos de hidrato de carbono y lírjiios. Metabolismo de cuerpos cetónicos.

SEMANA 15 Diciembre 17 - 22 Sábado 22 diciembre 2 pm Acumulativo 40%

SEMANA 16 Enero 02 - 08 Examen de Ampliación 100% Sede Aranjuez, Martes 3 de enero 5 p.m.

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