Analisis por SRM
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Analisis por SRM HNP
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Analisis por SRM. HNP. Workflow. Secuencia teórica proteína percursora (SwissProt) Digestión in silico y predicción de las mejores transiciones teóricas (MRM Pilot) Determinación peptidos proteotípicos Generación métodos de adquisición con la predicción de transiciones de proteotípicos - PowerPoint PPT Presentation
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Analisis por SRM
HNP
Workflow
• Secuencia teórica proteína percursora (SwissProt)• Digestión in silico y predicción de las mejores transiciones teóricas (MRM Pilot)• Determinación peptidos proteotípicos•Generación métodos de adquisición con la predicción de transiciones de proteotípicos• Digestión en solución de cada extracto proteico• Análisis de cada uno de los extractos con cada método de adquisición (1 por proteína)• Revisión de cromatogramas y predicción de un mayor número de transiciones para los péptidos candidatos (confirmación)• Generación de nuevos métodos de adquisición análisis de cada uno de los candidatos con los nuevos métodos de adquisición
ENSG00000257017 HP haptoglobin [Source:HGNC Symbol;Acc:5141]
ENSG00000198211 TUBB3 tubulin, beta 3 class III [Source:HGNC Symbol;Acc:20772]
ENSG00000087245 MMP2 matrix metallopeptidase 2 (gelatinase A, 72kDa gelatinase, 72kDa type IV collagenase) [Source:HGNC Symbol;Acc:7166]
ENSG00000118898 PPL periplakin [Source:HGNC Symbol;Acc:9273]
ENSG00000167522 ANKRD11 ankyrin repeat domain 11 [Source:HGNC Symbol;Acc:21316]
ENSG00000087258 GNAO1 guanine nucleotide binding protein (G protein), alpha activating activity polypeptide O [Source:HGNC Symbol;Acc:4389]
ENSG00000126602 TRAP1 TNF receptor-associated protein 1 [Source:HGNC Symbol;Acc:16264]
ENSG00000102882 MAPK3 mitogen-activated protein kinase 3 [Source:HGNC Symbol;Acc:6877]
ENSG00000102893 PHKB phosphorylase kinase, beta [Source:HGNC Symbol;Acc:8927]
ENSG00000167526 RPL13 ribosomal protein L13 [Source:HGNC Symbol;Acc:10303]
ENSG00000118900 UBN1 ubinuclein 1 [Source:HGNC Symbol;Acc:12506]
ENSG00000007392 LUC7L LUC7-like (S. cerevisiae) [Source:HGNC Symbol;Acc:6723]
ENSG00000103415 HMOX2 heme oxygenase (decycling) 2 [Source:HGNC Symbol;Acc:5014]
ENSG00000198931 APRT adenine phosphoribosyltransferase [Source:HGNC Symbol;Acc:626]
ENSG00000158545 ZC3H18 zinc finger CCCH-type containing 18 [Source:HGNC Symbol;Acc:25091]
ENSG00000166164 BRD7 bromodomain containing 7 [Source:HGNC Symbol;Acc:14310]
ENSG00000103197 TSC2 tuberous sclerosis 2 [Source:HGNC Symbol;Acc:12363]
ENSG00000135686 KLHL36 kelch-like 36 (Drosophila) [Source:HGNC Symbol;Acc:17844]
ENSG00000140990 NDUFB10 NADH dehydrogenase (ubiquinone) 1 beta subcomplex, 10, 22kDa [Source:HGNC Symbol;Acc:7696]
ENSG00000102910 LONP2 lon peptidase 2, peroxisomal [Source:HGNC Symbol;Acc:20598]
ENSG00000198211 TUBB3 tubulin, beta 3 class III [Source:HGNC Symbol;Acc:20772]
ENSG00000126602 TRAP1 TNF receptor-associated protein 1 [Source:HGNC Symbol;Acc:16264]
ENSG00000257017 HP haptoglobin [Source:HGNC Symbol;Acc:5141]
ENSG00000167526 RPL13 ribosomal protein L13 [Source:HGNC Symbol;Acc:10303]
ENSG00000198931 APRT adenine phosphoribosyltransferase [Source:HGNC Symbol;Acc:626]
