1.- Estructura y caractersticas de los cidos grasos

Son cidos carboxlicos de cadena larga, suelen tener n par de carbonos (14 a 22), losms abundantestienen 16 y 18 carbonos. Los cidos grasos sonsaturadoscuando no poseen enlaces dobles, son flexibles y slidos a temperatura ambiente. LosInsaturadoso poliinsaturados si en la cadena hay dobles o triples enlaces, rgidos a nivel del doble enlace siendo lquidos aceitosos.Propiedades fsicas.A)Solubilidad. Son molculas bipolares o anfipticas (del griegoamphi, doble). La cabeza de la molcula es polar o inica y, por tanto, hidrfila (-COOH). La cadena es apolar o hidrfoba (grupos -CH2- y -CH3terminal).

B)Punto de fusin. En los saturados, el punto de fusin aumenta debido al n de carbonos, mostrando tendencia a establecer enlaces de Van der Waals entre las cadenas carbonadas.

Los Insaturados tienen menos interacciones de este tipo debido al codo de su cadena.

Propiedades qumicas.A)Esterificacin. El cido graso se une a un alcohol por enlace covalente formando un ester y liberando una molcula de agua.

B)Saponificacin. Reaccionan los lcalis o bases dando lugar a una sal de cido graso que se denomina jabn. El aporte de jabones favorece la solubilidad y la formacin de micelas de cidos grasos.

Gracias a este comportamiento anfiptico los jabones se disuelven en agua dando lugar a micelas monocapas, o bicapas si poseen agua en su interior.Tambin tienen un efecto espumante cuando la monocapa atrapa aire y detergente o emulsionante si contienen pequeas gotas de lpido.

Un cido graso es una biomolcula de naturaleza lipdica formada por una larga cadena hidrocarbonada lineal, de diferente longitud o nmero de tomos de carbono, en cuyo extremo hay un grupo carboxilo (son cidos orgnicos de cadena larga). Cada tomo de carbono se une al siguiente y al precedente por medio de un enlace covalente sencillo o doble. Al tomo de su extremo le quedan libres tres enlaces que son ocupados por tomos de hidrgeno (H3C-). Los dems tomos tienen libres los dos enlaces, que son ocupados igualmente por tomos de hidrgeno ( ... -CH2-CH2-CH2- ...). En el otro extremo de la molcula se encuentra el grupo carboxilo (-COOH) que es el que se combina con uno de los grupos hidroxilos (-OH) de la glicerina o propanotriol, reaccionando con l. El grupo carboxilo tiene carcter cido y el grupo hidroxilo tiene carcter bsico (o alcalino).En general, se puede formular un cido graso genrico como R-COOH, en donde R es la cadena hidrocarbonada que identifica al cido en particular.Los cidos grasos forman parte de los fosfolpidos y glucolpidos, molculas que constituyen la bicapa lipdica de todas las membranas celulares. En los mamferos, incluido el ser humano, la mayora de los cidos grasos se encuentran en forma de triglicridos, molculas donde los extremos carboxlico (-COOH) de tres cidos grasos se esterifican con cada uno de los grupos hidroxilos (-OH) del glicerol (glicerina, propanotriol); los triglicridos (grasas) se almacenan en el tejido adiposo .Los cidos grasos constan de unacadena alqulicacon un grupocarboxilo(COOH) terminal; la frmula bsica de una molcula completamente saturada es CH3(CH2)nCOOH. Los cidos grasos de losmamferostienen estructuras relativamente sencillas, pero los de otros organismos pueden ser muy complejos, con anillosciclopropanoo abundantes ramificaciones.1

Molcula decido esterico, uncido graso saturado, representada de manera esquemtica.

La misma molcula con el grupocarboxilodisociado.Son frecuentes loscidos grasos insaturados(con dobles enlaces), casi siempre deconfiguracin cis; cuando hay ms de un doble enlace por molcula, siempre estn separados por un grupometileno(CH2). Los cidos grasos comunes en los seres vivos tienen un nmero par detomosdecarbono, aunque algunos organismos sintetizan cidos grasos con un nmero impar de carbonos. Algunos animales, incluido elser humano, tambin producen cidos grasos ramificados, con uno o varios gruposmetilo(CH3) a lo largo de la cadena, como es el caso de las estructuras deecolocalizacinde loscetceosen que se hallan grandes cantidades decido isovalrico.1Propiedades[editar]Los cidos grasos son molculasanfipticas, es decir, tienen una regin apolarhidrfoba(la cadena hidrocarbonada) que repele elaguay una reginpolarhidrfila(el extremo carboxlico) que interacta con el agua(H2O). Los cidos grasos de cadena corta son ms solubles que los cidos grasos de cadena larga porque la regin hidrfoba es ms corta.Si se colocan cidos grasos enaguao en otro disolvente polar forman una capa superficial debido a su bajadensidad; formarn una pelcula con sus colas (la parte no polar) orientadas hacia arriba, fuera del agua, de manera que no quedan en contacto con la misma y la cabeza polar dentro del agua. Si se agita, las colas tienden a relacionarse entre s medianteinteracciones hidrofbascreando ambientes donde no hay agua, como es el caso de unamicelaya sea monocapa obicapa.Nomenclatura[editar]Los tomos de carbono de los cidos grasos se numeran de dos maneras: Nmeros arbigosEmpezando por el carbono carboxlico (COOH), que recibe el nmero 1; el carbono 2 es el que queda inmediatamente tras el 1 y as sucesivamente. Alfabeto griegoEl carbono carboxlico no recibe letra. Se empieza a nombrar desde el carbono 2, al cual se le asigna la letra ; al carbono 3 se le otorga la letra (de donde proviene el trmino-oxidacin, que es laruta metablicade degradacin de los cidos grasos en lamatriz mitocondrial). Independientemente del nmero de carbonos del cido graso, el ltimo carbono es el del extremometilo(CH3), al que se le asigna la letra (omega, la ltima letra delalfabeto griego).El modo oficial de denominar los cidos grasos consiste en el nmero de tomos de carbono seguido por dos puntos y el nmero de dobles enlaces; la localizacin de los mismos se designa por el nmero del tomo de carbono donde empieza, contando a partir del extremo carboxlico. As, elcido oleicose designa 18:1(9); el nmero 18 nos indica el nmero de carbonos, el 1 tras los dos puntos, el nmero de dobles enlaces y el 9 entre parntesis que este doble enlace comienza en el 9 carbono (est entre el 9 y el 10), contando desde el extremo COOH.No obstante, se usa otro modo de designacin de los cidos grasos insaturados, que ha adquirido bastante popularidad: la posicin que ocupan los dobles enlaces se indica con respecto al ltimo carbono de la cadena (el extremo CH3), o sea, el carbono ; de ah derivan las denominaciones de-3,-6, etc. Un cido graso -3 ser el que tenga su primer doble enlace entre los carbonos3y 4, y un cido graso -6 tendr el primer doble enlace entre los carbonos6y 7, siempre a contar desde el extremo CH3.Dado que el primer mtodo empieza a contar desde el extremo COOH y el segundo desde el extremo CH3, puede producirse cierta confusin.Ejemplos de cidos grasos saturados

Nombre trivialNombre IUPACEstructuraNmero lipdico

cido propinicocido propanoicoCH3CH2COOHC3:0

cido butricocido butanoicoCH3(CH2)2COOHC4:0

cido valricocido pentanoicoCH3(CH2)3COOHC5:0

cido caproicocido hexanoicoCH3(CH2)4COOHC6:0

cido ennticocido heptanoicoCH3(CH2)5)COOHC7:0

cido caprlicocido octanoicoCH3(CH2)6COOHC8:0

cido pelargnicocido nonanoicoCH3(CH2)7COOHC9:0

cido cpricocido decanoicoCH3(CH2)8COOHC10:0

-cido undecanoicoCH3(CH2)9COOHC11:0

cido luricocido dodecanoicoCH3(CH2)10COOHC12:0

-cido tridecanoicoCH3(CH2)11COOHC13:0

cido mirsticocido tetradecanoicoCH3(CH2)12COOHC14:0

-cido pentadecanoicoCH3(CH2)13COOHC15:0

cido palmticocido hexadecanoicoCH3(CH2)14COOHC16:0

cido margricocido heptadecanoicoCH3(CH2)15COOHC17:0

cido estericocido octadecanoicoCH3(CH2)16COOHC18:0

-cido nonadecanoicoCH3(CH2)17COOHC19:0

cido araqudicocido eicosanoicoCH3(CH2)18COOHC20:0

-cido heneicosanoicoCH3(CH2)19COOHC21:0

cido behnicocido docosanoicoCH3(CH2)20COOHC22:0

-cido tricosanoicoCH3(CH2)21COOHC23:0

cido lignocricocido tetracosanoicoCH3(CH2)22COOHC24:0

cido pentacosanoicoCH3(CH2)23COOHC25:0

cido certicocido hexacosanoicoCH3(CH2)24COOHC26:0

-cido heptacosanoicoCH3(CH2)25COOHC27:0

cido montnicocido octacosanoicoCH3(CH2)26COOHC28:0

-cido nonacosanoicoCH3(CH2)27COOHC29:0

cido melsicocido triacontanoicoCH3(CH2)28COOHC30:0

-cido henatriacontanoicoCH3(CH2)29COOHC31:0

cido laceroicocido dotriacontanoicoCH3(CH2)30COOHC32:0

cido pslicocido tritriacontanoicoCH3(CH2)31COOHC33:0

cido gdicocido tetratriacontanoicoCH3(CH2)32COOHC34:0

cido ceroplsticocido pentatriacontanoicoCH3(CH2)33COOHC35:0

cido hexatriacontlicocido hexatriacontanoicoCH3(CH2)34COOHC36:0

Ejemplos de cidos grasos insaturados

Nombre trivialEstructura qumicaxC:Dnx

cido miristoleicoCH3(CH2)3CH=CH(CH2)7COOHcis-914:1n5

cido palmitoleicoCH3(CH2)5CH=CH(CH2)7COOHcis-916:1n7

cido sapinicoCH3(CH2)8CH=CH(CH2)4COOHcis-616:1n10

cido oleicoCH3(CH2)7CH=CH(CH2)7COOHcis-918:1n9

cido elidicoCH3(CH2)7CH=CH(CH2)7COOHtrans-918:1n9

cido vaccnicoCH3(CH2)5CH=CH(CH2)9COOHtrans-1118:1n7

cido linoleicoCH3(CH2)4CH=CHCH2CH=CH(CH2)7COOHcis,cis-9,1218:2n6

cido linoelidicoCH3(CH2)4CH=CHCH2CH=CH(CH2)7COOHtrans,trans-9,1218:2n6

cido -LinolnicoCH3CH2CH=CHCH2CH=CHCH2CH=CH(CH2)7COOHcis,cis,cis-9,12,1518:3n3

cido -LinolnicoCH3(CH2)4CH=CHCH2CH=CHCH2CH=CH(CH2)4COOHcis,cis,cis-6,9,1218:3n6

cido puncicoCH3(CH2)3CH=CH-CH=CH-CH=CH(CH2)7COOHcis,trans,cis-9,11,1318:3n5

cido araquidnicoCH3(CH2)4CH=CHCH2CH=CHCH2CH=CHCH2CH=CH(CH2)3COOHNISTcis,cis,cis,cis-58,11,1420:4n6

cido eicosapentaenoicoCH3CH2CH=CHCH2CH=CHCH2CH=CHCH2CH=CHCH2CH=CH(CH2)3COOHcis,cis,cis,cis,cis-5,8,11,14,1720:5n3

cido ercicoCH3(CH2)7CH=CH(CH2)11COOHcis-1322:1n9

cido docosahexaenoicoCH3CH2CH=CHCH2CH=CHCH2CH=CHCH2CH=CHCH2CH=CHCH2CH=CH(CH2)2COOHcis,cis,cis,cis,cis,cis-4,7,10,13,16,1922:6n

Clasificacin[editar] cidos grasos saturados. Son cidos grasos sin dobles enlaces entre carbonos; tienden a formar cadenas extendidas y a ser slidos a temperatura ambiente, excepto los de cadena corta. Cadena corta (voltiles) cido butrico(cido butanoico) cido isobutrico(cido 2-metilpropionico) cido valrico(cido pentanoico) cido isovalrico(cido 3-metilbutanoico) Cadena larga: cido mirstico, 14:0 (cido tetradecanoico) cido palmtico, 16:0 (cido hexadecanoico) cido esterico, 18:0 (cido octadecanoico)cidos grasos esenciales (AGE)[editar]Artculo principal: cido graso esencialSe llaman cidos grasos esenciales a algunos cidos grasos, como el linoleico, linolnico o el araquidnico que el organismo no puede sintetizar, por lo que deben obtenerse por medio de la dieta.Tanto la dieta como la biosntesis suministran la mayora de los cidos grasos requeridos por el organismo humano, y el exceso de protenas y glcidos ingeridos se convierten con facilidad en cidos grasos que se almacenan en forma de triglicridos.No obstante, muchos mamferos, entre ellos el hombre, son incapaces de sintetizar ciertos cidos grasos poliinsaturados con dobles enlaces cerca del extremo metilo de la molcula.1 En el ser humano es esencial la ingestin de un precursor en la dieta para dos series de cidos grasos, la serie del cido linoleico (serie -6) y la del cido linolnico (serie -3).Papel biolgico de los cidos grasos[editar]Funcin energtica[editar]Los cidos grasos son molculas muy energticas y necesarias en todos los procesos celulares en presencia deoxgeno, ya que por su contenido en hidrgenos pueden oxidarse en mayor medida que losglcidosu otros compuestos orgnicos que no estnreducidos.Cuando es demasiado bajo el nivel deinsulinao no hay suficienteglucosadisponible para utilizar como energa en los procesos celulares, el organismo quema cidos grasos para ese fin y origina entoncescuerpos cetnicos, productos de desecho que causan una elevacin excesiva del nivel de cido en lasangre, lo que podra conducir a lacetoacidosis, un problema importante y muchas veces ignorado o pospuesto hasta otra vez. Los sntomas de esta enfermedad van desde la presencia de un aroma aquitaesmalteen el aliento, hasta la aparicin de pequeas manchas de color amarillento (o verduzco) sobre lapiel, y la ligera acidificacin delsemen, que conlleva un cierto dolor al eyacular. o (Vase tambin:Cetoacidosis diabtica).Funcin estructural[editar]Los cidos grasos son componentes fundamentales de losfosfolpidosyesfingolpidos, molculas que forman labicapa lipdicade lasmembranasde todas lasclulas.Funcin reguladora[editar]Algunos cidos grasos son precursores de lasprostaglandinas,tromboxanosyleucotrienos, molculas con una gran actividad biolgica, que intervienen en la regulacin y control de numerosos procesos vitales, como larespuesta inflamatoria,regulacin de la temperatura corporal, procesos decoagulacinsangunea,contraccindelmsculo liso, etc.

2.2 Estructuras lipdicasEstructuras lipdicas

Fosfolpidos organizados enliposomas,micelasybicapa lipdica.Lasestructuras lipdicasson conformaciones que le dan forma a lasmembranas plasmticas. Sus componentes principales son loslpidos, los cuales presentan caractersticas especiales que estn condicionadas por factores termodinmicos como latemperatura. Una de las tcnicas experimentales ms utilizadas para el estudio de estas estructuras es ladifraccin de rayos X, ya que debido a las caractersticas de este tipo deradiacin electromagnticase pueden inferir propiedades de la materia.

7.1. Introduccin. Definicin y funciones de los Lpidos 7.1.a. Definicin. Es un grupo de molculas estructuralmente heterogneas, ampliamente distribuidas en animales y vegetales, que tienen como caracterstica comn la propiedad fsica de ser insolubles en agua y solubles en solventes orgnicos, no polares como ter, benceno, cloroformo, etc., esto se explica por la escasa polaridad de sus molculas. Existe gran variedad de lpidos en diferentes estados de agregacin. Sus propiedades qumicas son diversas.Estructural. Los lpidos forman todas las membranas celulares y de organelos. Los complejosde lipoprotenas tambin se forman para transportar los lpidos en la sangre.

Caractersticas de los AminocidosAprendamos ahora un poco mas acerca de los aminocidos, las unidades bsicas de las protenas. Como ya se mencion, los aminocidos difieren entre s primeramente por la estructura de su grupo 'R', o cadena lateral. Dos grupos importantes de aminocidos son considerados en esta serie de lecciones: los aminocidos aromticos (fenilalanina, tirosina y triptfano) y los aminocidos de cadena lateral ramificada (leucina, valina e isoleucina). Las estructuras moleculares se muestran en las Figuras 4 y 5, respectivamente. Observe que los trminos 'ramificada' y 'aromticos' describen de manera adecuada los grupos 'R' respectivos.Ambos tipos de aminocidos son producidos en rutas metablicas con actividades enzimticas estrictamente controladas. Debido a que las plantas deben producir todos los 20 aminocidos requeridos para la sntesis de protenas, cualquier producto qumico que inhiba la produccin de aminocidos tendr propiedades herbicidas.Principio del formularioA que se debe esto? :Qu le pasara a una planta que no puede producir uno o mas aminocidos? Qu sntomas se presentaran en esa planta?Final del formulario

En la Tabla 1 se presentan algunos herbicidas comerciales importantes que inhiben la sntesis de aminocidos. El primer grupo de estos herbicidas ser explicado en detalle en esta leccin. Los otros dos grupos sern explicados en otra leccin aparte.

Para mas detalles sobre esta Tabla, consulte el sitio internet de la Sociedad Americana de Malezas(http://www.weedscience.com)

Tabla 1.Modo de AccinClasificacin qumicaNombre qumico comnNombre comercial ***Clasificacin del modo de accin

Inhibidores de la sntesis de aminocidos aromticosNo clasificadosGlifosatoRoundup(Monsanto)Touchdown(Syngenta)G*9**

Inhibidores de la sntesis de aminocidos de cadena ramificadaSulfonilureas Imidazolinones TrizolopirimidinasChlorosulfuronImazethapyrFlumetsulamTelar (DuPont) Pursuit (BASF) Broadstrike (Dow)B* 2**

Inhibidores de la sntesis de glutaminaNo clasificadosGlufosinatoRelyLibertyAventisCrop ScienceH* 10**

Aminocidos.

Se hablara ahora de las propiedades fsicas y qumicas de los aminocidos, ya que estos constituyen el alfabeto de la estructura de las protenas y determinan muchas propiedades importantes de las protenas.

H

R-C- COOH

NH2

sta es la estructura general de los 20 aminocidos hallados regularmente o corrientemente en las protenas, llamados tambin aminocidos corrientes. Excepto la prolina, todos ellos tienen como denominadores comunes un grupo carboxilo libre y un grupo amino libre e insustituido en el tomo de carbono . Difieren entre s en la estructura de sus cadenas laterales distintivas, llamados grupos R.

Se han propuesto varios mtodos para clasificar los aminocidos sobre la base de sus grupos R. El ms significativo se funda en la polaridad de los grupos R. Existen cuatro clases principales:

Grupos R no polares o hidrofbicos.

Polares, pero sin carga.

Grupos R con carga positiva y

Grupos cargados negativamente (a pH 6-7, que es la zona del pH intracelular).

Los aminocidos se suelen designar mediante smbolos de tres letras. Recientemente se ha adoptado tambin un conjunto de smbolos de una letra para facilitar la comparacin de las secuencias aminocidas de las protena homlogas.

- Aminocidos con grupos R no polares o hidrofbicos

Existen 8 aminocidos que contienen grupos R no polares o hidrofbicos. Aqu se encuentran la alanina, la leucina, la isoleucina, la valina, la prolina, la fenilalanina, el triptfano y la metionina. Estos aminocidos son menos solubles en el agua que los aminocidos con grupos R polares. El menos hidrfobo de esta clase de aminocidos es la alanina, la cual se halla casi en la lnea fronteriza entre los aminocidos no polares y los que poseen grupos R polares.

- Aminocidos con grupos R polares sin carga.

Estos aminocidos son relativamente ms solubles en el agua que los aminocidos anteriores. Sus grupos R contienen grupos funcionales polares, neutros que pueden establecer enlaces de hidrgeno con el agua. La polaridad de la serina, la treonina y la tirosina se debe a sus grupos hidroxilos; la de la aspargina y la glutamina, a sus grupos amdicos y de la cistina a la presencia del grupo sulfhidrilo (-SH). La glicola, a veces se clasifica como una aminocido no polar. La cistina y la tirosina poseen las funciones mas polares de esta clase de aminocidos, sus grupos tilo e hidroxilo fenlico tienden a perder mucho ms fcilmente protones por ionizacin que los grupos R de otros aminocidos de esta clase.

- Aminocidos con grupos R cargados positivamente.

Los aminocidos en los que los grupos R poseen carga positiva neta a PH 7, poseen todos seis tomos de carbono. Aqu se encuentran la lisina, la arginina y la histidina. Esta ltima tiene propiedades lmite. A pH 6 ms del 50 % de las molculas de la histidina, poseen un grupo R cargado positivamente, pero a pH 7 menos del 10 % de las molculas poseen carga positiva.

- Aminocidos con grupos R cargados negativamente.

Los dos miembros de esta clase son los cidos asprtico y glutmico, cada uno de los cuales posee un segundo grupo carboxilo que se halla completamente ionizado y por tanto cargado negativamente a pH 6 y 7.

- Caractersticas de los aminocidos.

Los aminocidos son compuestos slidos; incoloros; cristalizables; de elevado punto de fusin (habitualmente por encima de los 200 C); solubles en agua; con actividad ptica y con un comportamiento anftero.

La actividad ptica se manifiesta por la capacidad de desviar el plano de luz polarizada que atraviesa una disolucin de aminocidos, y es debida a la asimetra del carbonoAminocidos y protenas, ya que se halla unido (excepto en la glicina) a cuatro radicales diferentes. Esta propiedad hace clasificar a los aminocidos en Dextrogiros (+) si desvian el plano de luz polarizada hacia la derecha, y Levgiros (-) si lo desvian hacia la izquierda.

El comportamiento anftero se refiere a que, en disolucin acuosa, los aminocidos son capaces de ionizarse, dependiendo del pH, como un cido (cuando el pH es bsico), como una base (cuando el pH es cido) o como un cido y una base a la vez (cuando el pH es neutro). En este ltimo caso adoptan un estado dipolar inico conocido como zwitterin.

El pH en el cual un aminocido tiende a adoptar una forma dipolar neutra (igual nmero de cargas positivas que negativas) se denomina Punto Isoelctrico. La solubilidad en agua de un aminocido es mnima en su punto isoelctrico.Enlace peptdico

Formacin de un dipptido por la unin de dos aminocidos mediante un enlace peptdico.Elenlace peptdicoes un enlace entre el grupoamino(NH2) de unaminocidoy el grupocarboxilo(COOH) de otro aminocido. Lospptidosy lasprotenasestn formados por la unin deaminocidosmediante enlaces peptdicos. El enlace peptdico implica la prdida de una molcula deaguay la formacin de un enlace covalente CO-NH. Es, en realidad, un enlaceamidasustituido.Podemos seguir aadiendo aminocidos al pptido, pero siempre en el extremo COOH terminal.Para nombrar el pptido se empieza por el NH2terminal por acuerdo. Si el primer aminocido de nuestropptidofueraalaninay el segundoserinatendramos el pptido alanil-serina.

Caractersticas estructurales del enlace[editar]

Un tripptido.Esto hizo pensar que no poda haber giro libre en todos los enlaces; y efectivamente, mediante difraccin de Rayos X se vio que el enlace peptdico era ms corto que un enlace sencillo normal, porque tiene un cierto carcter (60%) de enlace doble, ya que se estabiliza por resonancia.

Enlpep3.jpgPor esa razn no hay giro libre en torno a este enlace. Esta estabilizacin obliga a que los 4 tomos que forman en enlace peptdico ms los dos carbonos que se encuentran en posicin a (marcado con a en la ilustracin) con respecto a dicho enlace, se encuentren en un plano paralelo a ello:

Enlace peptdico.Trans-Peptide Bond.pngEsta ordenacin planar rgida es el resultado de la estabilizacin por resonancia del enlace peptdico. Por ello, el armazn est constituido por la serie de planos sucesivos separados por grupos metileno sustituidos. Esto impone restricciones importantes al nmero posible de conformaciones que puede adoptar una protena.

El O carbonlico y el hidrgeno amdico se encuentran en posicin trans (uno a cada lado del plano); sin embargo, el resto de los enlaces (N-C y C-C) son enlaces sencillos verdaderos, con lo que podra haber giro. Pero no todos los giros son posibles.

Si denominamos "" al valor del ngulo que puede adoptar el enlace N-C, y "" al del enlace C-C, slo existirn unos valores permitidos para y (ver grfico de Ramachandran); y depender en gran medida del tamao del grupo R.

Se producen nuevamente restricciones al giro libre, debido a las caractersticas de los grupos R sucesivos.Definicin: El enlace peptdico es un enlace amida que se establece entre dos aminocidos. En la formacin del enlace amida se produce una reaccin qumica entre el grupo amino (-NH2) de un aminocido y el grupo carboxilo (-COOH) del otro, formndose un enlace covalente entre el tomo de carbono y el de nitrgeno (-OC-NH-), con la prdida de un grupo OH y un H para forman una molcula de agua. El ribosoma cataliza la formacin sucesiva y ordenada de una serie de enlaces peptdicos entre distintos aminocidos en el proceso de la sntesis de protenas. Esta sucesin de enlaces peptdicos fija la secuencia primaria de una protena y su configuracin. Cualquier variacin de esta secuencia requiere de la rotura del enlace peptdico.

Los aminocidos se caracterizan por tener un grupo amino y un grupo carboxilo unidos a un mismo tomo de carbono, el carbono alfa. Adems del grupo amino y del grupo carboxilo el carbono alfa tiene unido un tomo de hidrgeno y la llamada cadena lateral que es variable y caracteriza a cada tipo de aminocido.

El enlace peptdico, a pesar de ser un enlace simple, tiene cierto carcter de enlace doble. Este carcter parcial de doble enlace hace que los tomos que participan en este enlace (carbono, nitrgeno, oxgeno e hidrgeno) no puedan moverse unos con respecto a otros y queden en un mismo plano. Sin embargo, los enlaces que se establecen entre los tomos del plano (carbono o nitrgeno) y los carbonos alfa de los aminocidos enlazados s tienen carcter de enlace simple y permiten cierto grado de giro.

Un tomo de carbono que slo establezca enlaces simples, como es el carbono alfa, presenta estos enlaces dispuestos en una geometra tetradrica, donde el ncleo atmico est en el centro del tetraedro y cada enlace va desde el centro hacia un vrtice. Esta visin de la geometra del tomo de carbono es relevante para comprender que la sucesin de aminocidos no es una lnea recta en el espacio y que el giro entre el carbono alfa y un plano de enlace peptdico es el responsable de la conformacin que adquiere la secuencia lineal de aminocidos para establecer la estructura tridimensional (configuracin) de la protena. El giro que puede realizar cada uno de estos enlaces depender en gran medida de las cadenas laterales y las posibles interacciones que haya entre ellas y del medio en el que se encuentre la molcula.