GENETICA 2011
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GENETICA2011
PARTE II: HERENCIATeorica 7
MAPA DE LIGAMIENTO DEL CR 1 HUMANO
Un valor de 1 % de recombinación o entrecruzamiento significa que los genes están
ubicados a una distancia expresada en una unidad llamada centimorgan o una unidad de
mapa del mismo cromosoma
COMO SABER SI GENES ESTAN LIGADOS?PROGENIE RECOMBINANTE Y NO-RECOMBINANTE
A1 y A2 son 2 posibles marcadores de la
enfermedad
En que orden están los genes en un mismo cromosoma?Cruzamientos de 3 puntos
Datos:3 loci ligados (abc).La combinacion menos frecuentes sera la q requiera 2 eventos de CODe 1000 descendientes: 142 sufrieron CO entre a y b . 52 sufrieron CO entre a y c
100 sufrieron Co entre b y c5 sufrieron CO entre a y c
ENTONCES:
•El orden de los genes es a-c-b•Las distancias aproximadas son:
a (5cM)-c-(10cM)-b
MARCADORES MOLECULARES
GENOTIPO FENOTIPO
•GENES•AMBIENTE
MARCADORES MOLECULARES
•RFLP•VNTR
•RAPDs•STRs•AFLP
Permiten evidenciar variaciones en la secuencia de ADN entre 2 individuos distintos y asociarlos con un rasgo fenotipico
Deben ser:Altamente polimorficosNo epistasicosPoco efecto ambiental
ANTES DE SEGUIR, PREGUNTAR:
SABEN LO QUE ES PCR?
RAPDs
AFLP
LOS MARCADORES MOLECULARES SE PUEDEN CONVERTIR EN MARCADORES “PCR ALELO ESPECIFICOS” (STS: sequence tagged sites)(economicos, robustos, sencillos)
Se aisla fragmento
polimorfico de un gel
Se clona Se secuencia Se disenan primers para
esas secuencias
EST: expressed sequence tags
STS (sequence-tagged sites) y EST (expressed sequence tags)
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/gquery?term=dbEST
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/gquery?term=dbEST
NCBI de USA (GenBank)
EBI de EU (EMBL Nucleotide Seq database)
DDBJ de Japon
SwissProt
BASES DE DATOS GENERALES
BIO-INFORMATICA
BIO-INFORMATICA
BUSCADOR ENTREZ
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/gquery
ALINEAMIENTO DE SECUENCIAS
http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi