Caracterizacion genetica

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CARACTERIZACIÓN GENÉTICA DE MICROORGANISMOS Modelos de trabajo en biología molecular Presentado por : Maritza Tatiana Velasquez Practicas complementarias 2014 - B Universidad de Santander

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CARACTERIZACIÓN GENÉTICA DE MICROORGANISMOS

Modelos de trabajo en biología molecular

Presentado por:

Maritza Tatiana Velasquez

Practicas complementarias 2014-BUniversidad de Santander

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ORGANISMO MODELO

Un organismo modelo son especies altamente estudiadas que han recibido especial atención en la investigación genética y biológica, poseen características especiales como:

Tiempo de generación

corto

Número de descendientes

manejable

Adaptabilidad al ambiente en el laboratorio

Capacidad de ser mantenidos y reproducidos

a bajo costo

Fácil de cultivar

Disponibilidad de variabilidad

fenotípica y genotípica

Fenotipo de interés sencillo de observar o

medir

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Organismos modelo genéticos

Reproducen en grandes cantidades

Tienen un corto tiempo de generación

Generalmente se producen muchas mutaciones

Pueden crear mapas genéticos altamente detallados

Ejemplos:

-Levadura de pan (Saccharomyces cerevisiae)

- La mosca de la fruta (Drosophila melanogaster)

- El gusano nematodo (Caenorhabditis elegans).

Se trata de especies que son susceptibles al análisis genético

Tip

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Organismos modelo experimentales

Ejm: El pollo y las ranas africanas (Xenopus laevis)

Ventajas: producen embriones robustos que se pueden estudiar y

manipular con facilidad

Utilizadas como organismos modelo en la biología del desarrollo

las especies no son genéticamente susceptibles

pueden tener gran numero de generaciones y pobres en mapas

geneticos

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Organismos modelo genómico.

Ocupan una posición central en el árbol evolutivo

Porque ualidatiene alguna cualidad en su genoma que los hace ideales para estudiarlo

Ejemplo:

-Pez globo (Fugu rubripes)

tiene un repertorio similar a los humanos, pero mas perqueno ( 400 millones de pares de

bases en lugar de 3000 millones que es el humano).

Ejemplo:

-Raton el genoma de esta organizado de manera muy similar al del ser humano y sus genes estan dispuestos en el mismo orden.

Tip

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VENTAJAS DESVENTAJAS

Excelente genética Técnicas moleculares de gran alcance Los genes pueden clonarse fácilmente Secuencia completa del genoma Poseer todos los orgánulos básicos de

células eucariotas El control del ciclo celular similar a los

animales

No hay diversidad de tejidos

LEVADURAS

La levadura Saccharomyces cerevisiae es el microorganismo

eucarionte ideal para estudios biológicos y genómicos.

• La simplicidad de manipulación genética de la levadura permite

que sea utilizada convenientemente para analizar la función de los

productos génicos de organismos eucariontes superiores.

• Utilidad: Obtener proteínas recombinantes de uso comercial.

• Ejemplo: - Vacuna recombinante de la hepatitis B

- Producto alimenticio recombinante, RENINA

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VENTAJAS DESVENTAJAS• Excelente genética

Secuencia genoma completo desde el año 2000.

• Tiempo de generación rápida

• Ciclo vida corto• Facil cultivo

• Técnicas moleculares de gran alcance

• Los genes pueden clonarse fácilmente

• Etiquetado de transposones• Los animales transgénicos

se generan fácilmente

• Difícil manipulación embriológica.

• Interrupción génica sigue siendo difícil, aunque posible

Mosca de la fruta.

Drosophila melanogaster.

Los estudios realizados en esta mosca

durante los últimos cien años, han

permitido comprender aspectos

fundamentales de la genética

eucariótica, entre ellos las bases de la

determinación del sexo.

El arsenal de técnicas genéticas

disponibles en la mosca se aplica para

caracterizar y comprender la función de

genes humanos.

Ejemplo:

- se ha podido detectar y conocer

genes involucrados en la enfermedad de

Parkinson.

-Genes supresores de tumores

- El homólogo a la insulina en mosca

- Receptores de hormonas.

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Caenorhabditis elegans

El estudio de esta especie aporta herramientas

prácticas aplicables al tratamiento de

enfermedades causadas por nematodos.

Las técnicas de ingeniería genética puestas a

punto para esta especie permiten realizar

investigaciones sobre diferenciación celular,

neurobiología, desarrollo y evolución, mediante

la comparación de los genomas de levaduras,

gusanos y ratones, entre otros.

VENTAJAS DESVENTAJAS Excelente genética Secuencia completa del

genoma Tiempo de generación

rápidas descripción completa de

su anatomía celular Técnicas moleculares de

gran alcance

Los genes pueden clonarsefácilmente

Etiquetado deTransposones

RNAi eficaz Pocas células: 959 células,

302 neuronas

Morfología totalmentecaracterizada

Todos los linajes de célulasconocidas

Morfología externa

limitada

El análisis detalladode patrones deexpresión génicapuede ser difícil.

Algunasmanipulacionesembriológicos difícil

NEMATODOS

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Pez cebra.

VENTAJAS DESVENTAJAS Vertebrado más simple con

buena genética Homologia genetica con el

hombre 80% del genoma. Análisis del genoma en

marcha Facil mantenimiento y

almacenaje

Fácil examinar los defectos morfológicos

Manipulaciones embriológicos

Sistemas de órganos similares para otros vertebrados (por ejemplo, los ojos, el corazón,

la sangre, tracto gastrointestinal)

El rápido desarrollo de los vertebrados

Todavía no se puede clonar genes

No se puede hacer fácilmente

animales transgénicos

Por su homología con el genoma

del ser humano, permite que los

resultados obtenidos de los

fármacos probados en estos

animales sean potencialmente

extrapolables al ser humano.

• Otra de las ventajas de este

pez es su capacidad

reproductiva.

• pez cebra las preferencias de

los científicos como animal de

laboratorio en el siglo XXI.

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Mus musculus

El ratón ha sido elegido desde los comienzos

de la investigación científica clínica como

especie mamífero modelo dada su cercanía

fisiológica y genética con el humano.

El objetivo de los estudios con ratones es

comprender los efectos que causan

diferentes mutaciones y utilizar esos datos

en la búsqueda de posibles equivalencias en

la especie humana.

Ratones

VENTAJAS DESVENTAJAS Mamíferos, una gran parte

de sus procesos bioquímicos son similares al del humano.

Fácil manejo Se adapta fácilmente a los

animalarios (bioteríos), permitiendo controlar variables ambientales en los experimentos.

Variabilidad Genética Colección grande de

mutantes Construcción de embriones

quiméricos posibles Fuente de células primarias

Cepas definidas Actividad y visión nocturna

Desarrollo y ciclo de vida relativamente lenta (meses)

Manipulaciones embrionarias difíciles

Fenotipos mutantes son difíciles de estudiar.

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Es un organismo modelo universal que se utiliza

en el laboratorio por:

• Su simplicidad

• Facilidad para propagarse y manipular

genéticamente,

• Bajo costo de su cultivo

• Técnicas de transformación son sencillas y son

de uso rutinario en los laboratorios de biología

molecular

Bacteria E. coli

Las células más utilizadas en

este laboratorio son

• E. coli DH5α

• E. coli BL21 (DE3) pLysS

• E. coli Top 10F’

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• E.Coli

Transformación de bacterias

•Tratada previamente con una

solución de cloruro de calcio.

•Preparando así la membrana

para poder internalizar el ADN de

interés.

Hacer células sean

competentes • Mediante chock

térmico sometiendo las bacterias a diferentes temperaturas.

Transformacion

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