МИНИСТЕРСТВО ОБРАЗОВАНИЯ И НАУКИ РОССИЙСКОЙ ФЕДЕРАЦИИ

федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего

профессионального образования

«ИРКУТСКИЙ ГОСУДАРСТВЕННЫЙ УНИВЕРСИТЕТ»

ФГБОУ ВПО «ИГУ»

Кафедра зоологии беспозвоночных и гидробиологии

УТВЕРЖДАЮ

И.о. проректора по учебной работе

Вокин А.И.___________

“____”______________2015 г.

Рабочая программа дисциплины

Наименование дисциплины Б1.Б.3 Компьютерные технологии в биологии

Направление подготовки 06.04.01 "Биология"

Квалификация выпускника - магистр

Форма обучения – дневная

Согласовано с УМК

Биолого-почвенного факультета

Протокол № 5

от 28 октября 2015 г.

Председатель ____________А.Н. Матвеев

Рекомендовано кафедрой:

Протокол № 3

от 18 ноября.2015 г.

Зав. кафедрой ____________ И.Б. Книжин

Иркутск 2015 г.

2

Содержание

стр.

1. Цели и задачи дисциплины (модуля) 3

2. Место дисциплины (модуля) в структуре ООП. 3

3. Требования к результатам освоения дисциплины (модуля) 3

4. Объем дисциплины (модуля) и виды учебной работы 4

5. Содержание дисциплины (модуля)

5.1 Содержание разделов и тем дисциплины (модуля)

5.2 Разделы дисциплины (модуля) и междисциплинарные

связи с обеспечиваемыми (последующими) дисциплинами

(модулями)

5.3 Разделы и темы дисциплин (модулей) и виды занятий

5

6. Перечень семинарских, практических занятий и лабораторных работ. 8

7. Примерная тематика курсовых работ (проектов) (при

наличии)

8

8. Учебно-методическое и информационное обеспечение дисциплины

(модуля):

а) основная литература;

б) дополнительная литература;

в) программное обеспечение;

г) базы данных, поисково-справочные и информационные

системы

9

9. Материально-техническое обеспечение дисциплины (модуля). 10

10. Образовательные технологии 11

11. Оценочные средства (ОС). 11

3

1. Цели и задачи дисциплины (модуля):

Цель. Освоение методов обработки компьютерной графики, создание презентаций

и сайтов с использованием собственных материалов.

Задачи.

Создание нового изображения в программе Adobe Photoshop.

Инструменты рисования и ретуши.

Работа с выделенными областями.

Работа со слоями.

Работа с текстом.

Цветовая и тоновая коррекция изображений.

Сохранение изображения в форматах для Web.

Создание комбинированных изображений.

Использование растровых изображений в веб-дизайне.

2. Место дисциплины в структуре ООП:

Дисциплина «Компьютерные технологии в биологии» относится к блоку 1

«Дисциплины» учебного плана по магистерской программе «Ихтиология и

гидробиология» и является обязательной дисциплиной, изучается в 1-2 семестрах.

Содержание дисциплины базируется на предшествующей подготовке бакалавров по

направлению «Биология» (дисциплина «Информационные технологии в биологии»).

Данная дисциплина помогает решить технические и методические проблемы при

написания выпускной квалификационной работы и может пригодиться в дальнейшей

профессиональной деятельности.

3. Требования к результатам освоения дисциплины (модуля):

Процесс изучения дисциплины (модуля) направлен на формирование следующих

компетенций:

ОПК-7 - готовность творчески применять современные компьютерные технологии

при сборе, хранении, обработке, анализе и передаче биологической информации

для решения профессиональных задач

ОПК-9 - способность профессионально оформлять, представлять и докладывать

результаты научно-исследовательских и производственно-технологических работ

по утвержденным формам

ПК-2 - способность планировать и реализовывать профессиональные мероприятия

(в соответствии с направленностью (профилем) программы магистратуры)

В результате изучения дисциплины студент должен:

знать: основные виды компьютерной графики, принципы ее организации;

источники получения и механизмы поиска текстовой и графической информации в

сети интернет (ОПК-7);.

уметь: создавать качественные презентации с использованием современных

средств редактирования, уметь создавать сайты по материалам собственных

исследований (ОПК-9, ПК-2).

владеть: методами обработки графической и текстовой информации (ОПК-7,9).

4

4. Объем дисциплины и виды учебной работы (разделяется по формам обучения)

Очно-заочная форма обучения

Вид учебной работы

Всего

часов /

зачетных

единиц

Семестры

1 2 – –

Аудиторные занятия (всего) 34 18 16 – –

В том числе: - -

Лекции – –

Практические занятия (ПЗ) 34 18 16 – –

Семинары (С) – –

Лабораторные работы (ЛР) – –

КСР 2 1 1

Самостоятельная работа (всего) 38 18 20 – –

В том числе: - -

Курсовой проект (работа) – –

Расчетно-графические работы – –

Другие виды самостоятельной работы (создание

презентаций, подготовка к зачёту)

36 18 18 – –

Контактная работа 34 18 16

Вид промежуточной аттестации (зачет, экзамен) зачет зачет – –

Общая трудоемкость

зачетных единицы

72 36 36 – –

2 1 1 – –

5. Содержание дисциплины (модуля)

5.1. Содержание разделов и тем дисциплины (модуля)

1. Векторное и растровое изображение – отличия, недостатки и преимущества.

Разрешение и глубина цвета – параметры, влияющие на размер файла. Расширения

графических файлов, форматы растровой графики, применяемые в биологических

исследованиях. Способы получения растровых изображений: сканеры, цифровые камеры,

библиотеки готовых изображений, интернет. Авторские права на изображения.

2. Интерфейс программы Adobe Photoshop

Обзор интерфейса программы Adobe Photoshop. Главное меню и предназначение

раскрывающихся меню. Палитры и группы палитр. Наиболее часто использующиеся

палитры. Формирование собственных групп палитр. Панель инструментов. Панель

свойств инструментов. Строка состояния. Восстановление стандартного расположения

палитр. Настройка программы с помощью команды Preferences.

3. Создание нового изображения

Команда New. Размеры изображения. Заполнение фона. Создание прозрачного

фона.

5

4. Инструменты рисования и ретуши

Установка цвета кисти. Цвет переднего и заднего плана. Палитра. Числовые

значения цвета в модели RGB. Выбор кисти. Набор кистей. Редактор кисти. Понятие

диффузности кисти. Расстояние между штрихами. Форма кисти. Рисование кистью.

Ластик.

Инструменты для ретуши: Локальное размытие, Локальная резкость, Локальная

растушевка, Локальное осветление, Локальное затемнение, Локальное изменение

насыщенности цвета, Штамп.

5. Работа с выделенными областями.

Понятие выделенной области как объединения пикселей в группу. Граница

выделенной области; понятие размытой (диффузной) границы выделенной области.

Инструменты выделения - прямоугольник и эллипс. Добавление и вычитание

выделенных областей. Инструменты выделения типа лассо. Лассо, полигональное лассо,

магнитное лассо. Параметры магнитного лассо. Сглаживание. Рекомендации по

использованию инструментов. Инструмент выделения "Волшебная палочка". Работа с

инструментом, установка толерантности. Неразрывная и разрывная области выделения.

Изменение выделенной области: перемещение, расширение, сжатие, придание

диффузности границе выделенной области. Трансформирование выделенной области -

сжать, растянуть, повернуть, исказить.

6. Работа со слоями

Общие представления о слоях. Понятие активного слоя. Изменение порядка слоев.

Спрятать/показать слой. Перемещение слоя. Прозрачность слоя. Создание слоев. Создание

нового слоя в результате команды Paste. Перенос выделенной области на новый слой с

помощью команды Layer via Copy.

Трансформация объектов в слое: изменение размеров, вращение, искажение,

перспективные искажения.

Стиль слоя (эффекты в слоях). Использование готовых стилей. Создание

собственного стиля. Эффекты тени, фаски и рельефа, наложение контуров, создание

собственных контуров. Слияние нескольких слоев. Слияние всех слоев. Сохранение

изображения в формате PSD.

7. Работа с текстом

Понятие о гарнитурах, способах начертания шрифтов. Инструмент «Текст» и его

варианты. Понятие о текстовом слое, как встроенном векторном изображении.

Растрирование текста. Изменение размеров, начертания и цвета шрифта. Трансформация

надписей. Эффекты слоев в приложении к текстам. Инструмент деформации текста.

8. Редактирование изображения в целом

Анализ возможных недостатков растрового изображения. Кадрирование

изображения. Обрезка и поворот изображения с помощью инструмента Crop. Отмена

сделанных операций. Отмена выполненной операции с помощью команды Undo. Отмена

операций с помощью палитры History. 6. Изменение размеров изображения

Изменение размеров изображения путем изменения разрешения, путем прямого

задания ширины и высоты изображения. Сохранение и искажение пропорций.

Необходимость интерполяции при изменении размера изображения.

Баланс яркости и контрастности изображения. Цветовой баланс изображения.

6

9. Сохранение изображения в форматах для Web

Сохранение изображения в форматах BMP, GIF, JPEG. Команды Save, Save As…

Сохранение изображения для Web. Команда Save for Web. Диалоговое окно. Оптимизация

GIF, изменение числа цветов, подбор палитры. Сохранение с прозрачностью.

Оптимизация JPEG.

10. Создание комбинированных изображений.

Принципы создания коллажей. Выбор размеров изображения и нужного

разрешения. Выбор исходного материала. Копирование и вставка изображений на

«холст». Трансформация и подгонка слоев. Тонкая обработка элементов коллажа.

Применение эффектов смешивания слоев. Работа в режиме «быстрой маски». Добавления

текста в коллаж. Отладка и сохранение изображения.

11. Использование растровых изображений в веб-дизайне.

Подготовка изображений для включения в презентации. Работа с программой

Power Point. Подготовка изображений для размещения в интернете. Создание web

страниц. Работа с программой Dreamweaver.

7

5.2. Разделы дисциплины и междисциплинарные связи с обеспечиваемыми

(последующими) дисциплинами

№

п/п

Наименование обеспе-

чиваемых (последую-

щих) дисциплин

№ № разделов и тем данной дисциплины, необходимых

для изучения обеспечиваемых (последующих) дисциплин

(вписываются разработчиком)

1 ВКР 1-11

5.3. Разделы и темы дисциплин (модулей) и виды занятий

№

п/п

Наименование

раздела Наименование

темы

Виды занятий в часах

Лекц. Практ.

зан. Семин

Лаб.

зан. СРС Всего

1. Векторное и

растровое

изображение

- 1 - – 1 2

2. Интерфейс

программы

Adobe

Photoshop

- 1 - – 1 2

3. Создание

нового

изображения

- 1 - – 1 2

4. Инструменты

рисования и

ретуши

- 1 - – 1 2

5. Работа с

выделенными

областями

- 2 - – 2 4

6. Работа со

слоями

- 2 - – 2 4

7. Работа с

текстом

- 2 - – 2 4

8. Редактирован

ие

изображения в

целом

- 4 - – 4 8

9. Сохранение

изображения в

форматах для

Web

- 1 - – 1 2

10. Создание

комбинирован

ных

изображений

- 8 - – 10 18

11. Использовани

е растровых

изображений

в веб-дизайне

- 11 - – 11 22

8

6. Перечень семинарских, практических занятий и лабораторных работ

№

п/п

№ раздела и

темы

дисциплины

(модуля)

Наименование семинаров,

практических и лабораторных работ

Трудо

емкос

ть

(часы

)

Оценочные

средства

Форм

ируем

ые

компе

тенци

и

1 2 3 4 5 6

1. 1. Векторное и растровое изображение 1 Проверка

правильности

выполненных

работ

ОПК-7,

ОПК-9,

ПК-2 2. 2. Интерфейс программы Adobe

Photoshop 1

3. 3. Создание нового изображения 1

4. 4. Инструменты рисования и ретуши 1

5. 5. Работа с выделенными областями 2

6. 6. Работа со слоями 2

7. 7. Работа с текстом 2

8. 8. Редактирование изображения в

целом 4

9 9 Сохранение изображения в

форматах для Web 1

10 10 Создание комбинированных

изображений 8

11 11 Использование растровых

изображений в веб-дизайне 11

7. Примерная тематика курсовых работ (проектов) (при наличии):

не предусмотрены.

9

8. Учебно-методическое и информационное обеспечение дисциплины (модуля):

а) основная литература:

Коноплева, И. А. Информационные технологии [Электронный ресурс] / И. А.

Коноплева, А. Хохлова, В. Денисов. - Москва : Проспект, 2014. - 328 с. - Режим доступа:

ЭБС "Айбукс". - Неогранич. доступ. - ISBN 978-5-392-12385-8 : Б. ц.

Каменская, Марина Александровна. Информационная биология [Текст] : учеб.

пособие для студ. вузов / М. А. Каменская ; Под ред. А. А. Каменского. - М. : Академия,

2006. - 361 с. ; 22 см. - (Высшее профессиональное образование: Естественные науки). -

Библиогр.: с. 347-351. - Предм. указ.: с. 352-357. - ISBN 5-7695-2580-0 : 340.34 р., (8 экз.)

б) дополнительная литература:

Информатика. Базовый курс [Текст] : учеб. пособие для студ. высш. техн. учеб.

заведений / ред. С. В. Симонович. - 3-е изд. - СПб. : Питер, 2014. - 637 с. : ил. ; 24 см. -

(Учебник для вузов. Стандарт третьего поколения). - ISBN 978-5-496-00217-2 : 262.43 р.,

(5 экз.)

Левин В. И. Популярная энциклопедия информатики и компьютера. Вып. 2 / В. И.

Левин. – М. : Равновесие, 2006. - 1 эл. опт. диск (CD-ROM)

Солоницын, Юрий. Photoshop 7 для подготовки web-графики [Text] / Ю.

Солоницын. - СПб. : Питер, 2002. - 334 с. : ил. ; 24 см. - (Учебный курс). - ISBN 5-94723-

335-5 : (2 экз.)

Могилев, Александр Владимирович. Информатика [Text] : учеб. пособие для

студ. высш. пед. учеб. заведений, обуч. по спец. "Информатика" / А. В. Могилев, Н. И.

Пак, Е. К. Хеннер. - 2-е изд., стер. - М. : Академия, 2003. - 810 с. : ил. ; 24 см. - (Высшее

образование). - Библиогр. в конце гл. - ISBN 5-7695-0330-0 :Экз-ры: нф А575820;

междфак 18310(97 экз.); междфак 18310(47 экз.)

10

в) программное обеспечение:

1. DreamSpark Premium Electronic Software Delivery (3 years) Renewal (Windows 10

Education 32/64-bit (Russian) - Microsoft Imagine, Windows 7 Professional with Service

Pack 1 32/64-bit (English) - Microsoft Imagine, Windows Server 2008 Enterprise and

Standard without Hyper-V with SP2 32/64-bit (English) - Microsoft Imagine, Access 2016

32/64-bit (Russian) - Microsoft Imagine, Access 2010 32/64-bit (Russian) - Microsoft

Imagine). Договор №03-016-14 от 30.10.2014г.

2. Kaspersky Endpoint Security для бизнеса - Стандартный Russian Edition. 250-499. Форус

Контракт №04-114-16 от 14ноября 2016г KES. Счет №РСЦЗ-000147 и АКТ от 23ноября

2016г Лиц.№1B08161103014721370444.

3. Microsoft Office Enterprise 2007 Russian Academic OPEN No Level. Номер Лицензии

Microsoft 43364238.

4. Microsoft Windows XP Professional Russian Upgrade Academic OPEN No Level. Номер

Лицензии Microsoft 41059241.

5. Office 365 профессиональный плюс для учащихся. Номер заказа: 36dde53d-7cdb-4cad-

a87f-29b2a19c463e.

г) базы данных, информационно-справочные и поисковые системы:

«Издательство Лань», Адрес доступа http://e.lanbook.com/.

ЦКБ «Бибком», адрес доступа http://rucont.ru/

ООО «Айбукс», адрес доступа http://ibooks.ru

ООО «РУНЭБ», адрес доступа http://elibrary.ru/

ФБГУ «РГБ». Адрес доступа: http://diss.rsl.ru/

«Электронное издательство Юрайт», адрес доступа: http://biblio-online.ru/ http://www.psd.ru/ - Анатомия Adobe Photoshop

http://dreamweaver.net.ru/index.php - Adobe Dreamweaver

http://ru-mambo.ru/ - Mambo.ru Бесплатная система управления контентом

9. Материально-техническое обеспечение дисциплины (модуля):

Компьютерный класс (учебная аудитория) для лекционных и практических

занятий, групповых и индивидуальных консультаций, текущего контроля и

промежуточной аттестации, организации самостоятельной работы

Аудитория оборудована: специализированной (учебной) мебелью на 20 посадочных мест,

доской меловой; оборудована техническими средствами обучения:

Системный блок Pentium G850, МониторBenQ G252HDA-1 шт.;

Системный блокAthlon 2 X2 250, МониторBenQ G252HDA – 8 шт.;

Системный блок Pentium D 3.0 GHz, Монитор Samsung 740N – 3 шт.;

Моноблок IRU T2105P – 2 шт.;

Системный блок Pentium G3250, Монитор BenQG955 – 1 шт.;

Системный блок Pentium G3250, Монитор BenQ GL2250 – 1 шт.;

Системный блок Pentium G3250, Монитор Samsung T200 HD – 1 шт.;

Системный блок Pentium G3250, Монитор Samsung T190N – 1 шт.;

Системный блок Pentium G3250, Монитор Samsung 740N – 1 шт.;

с неограниченным доступом к сети Интернет; Проектор BenQ MX503; экран

ScreenVtdiaEcot.

Помещения для хранения и профилактического обслуживания учебного оборудования.

Аудитория оборудована:

Стол письменный- 4 шт., Стулья- 4 шт., Шкаф- 8 шт.

Холодильник торговый “Inter -501T” – 1 шт.

Монитор ЛОС– 1 шт.

Компьютер DNS Office Celeron E1400 – 1шт.

Ноутбук Lenovo G580 – 1 шт.

11

Ноутбук Lenovo T61 – 1 шт.

Проектор Epson EB-X03 – 1 шт.

10. Образовательные технологии:

Практические занятия в компьютерном классе, освоение навыков работы с программами,

поиска информации в интернете.

Самостоятельная работа студентов по созданию цифровых изображений, презентаций,

сайтов, приближенных к задачам биологии.

11. Оценочные средства (ОС):

11.1. Оценочные средства для входного контроля.

Собеседование на вводном практическом занятии.

11.2. Оценочные средства текущего контроля. В качестве оценочных средств для текущего контроля (ТК) знаний студентов используются

контроль выполнения практических заданий, защита практических работ (оформление результатов

практических занятий в виде сохраненных изображений в различных форматах и в форме

презентации). Назначение оценочных средств ТК - выявить сформированность компетенций:

ОПК-7, ОПК-9, ПК-2.

Тематика заданий для самостоятельной работы:

1. Подготовка своих изображений для размещения в презентации и на сайте.

2. Работа над созданием учебной презентации.

11.3. Оценочные средства для промежуточной аттестации (в форме зачета). Вопросы для подготовки к зачету:

1. Поиск информации биологического содержания в интернете.

2. Источники получения цифровых изображений.

3. Векторное и растровое изображение – отличия, недостатки и преимущества.

4. Типы сканеров и принципы сканирования плоских и объемных материалов.

5. Подготовка растровой графики для размещения в презентациях и в интернете.

6. Общие принципы работы с PowerPoint.

7. Специальные возможности Power Point для создания качественных презентаций.

8. Обработка изображений в Adobe PhotoShop

Разработчик:

___________________ доцент В.Г. Шиленков

(подпись) (занимаемая должность) (инициалы, фамилия)

Программа рассмотрена на заседании кафедры зоологии беспозвоночных и

гидробиологии 9 октября 2015 г. Протокол № 2.

Зав. кафедрой_____________________И.Б. Книжин

12

13