Reconstrucción Tridimensional a Partir de Varias...

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Motivaci´ on Introducci´ on Reconstrucci´ on del volumen Reconstrucci´ on de la Superficie Reconstrucci ´ on Tridimensional a Partir de Varias Im ´ agenes Dr. Luis Gerardo de la Fraga E-mail: [email protected] Secci´ on de Computaci´ on Departamento de Ingenier´ ıa El´ ectrica CINVESTAV 22 de noviembre, 2005 Dr. Luis Gerardo de la Fraga Oaxaca. UABJO. Reconstrucci´ on Tridimensional a Partir de Varias Im´ agenes 1/39

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MotivacionIntroduccion

Reconstruccion del volumenReconstruccion de la Superficie

Reconstruccion Tridimensional a

Partir de Varias Imagenes

Dr. Luis Gerardo de la Fraga

E-mail: [email protected] de Computacion

Departamento de Ingenierıa ElectricaCINVESTAV

22 de noviembre, 2005

Dr. Luis Gerardo de la Fraga Oaxaca. UABJO. Reconstruccion Tridimensional a Partir de Varias Imagenes 1/39

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MotivacionIntroduccion

Reconstruccion del volumenReconstruccion de la Superficie

Contenido

Motivacion

Introduccion

Reconstruccion del volumenReconstruccion 3D de macromoleculas biologicasTomografıa de rayos X

Reconstruccion de la Superficie

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MotivacionIntroduccion

Reconstruccion del volumenReconstruccion de la Superficie

Contenido

Motivacion

Introduccion

Reconstruccion del volumenReconstruccion 3D de macromoleculas biologicasTomografıa de rayos X

Reconstruccion de la Superficie

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MotivacionIntroduccion

Reconstruccion del volumenReconstruccion de la Superficie

Contenido

Motivacion

Introduccion

Reconstruccion del volumenReconstruccion 3D de macromoleculas biologicasTomografıa de rayos X

Reconstruccion de la Superficie

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MotivacionIntroduccion

Reconstruccion del volumenReconstruccion de la Superficie

Contenido

Motivacion

Introduccion

Reconstruccion del volumenReconstruccion 3D de macromoleculas biologicasTomografıa de rayos X

Reconstruccion de la Superficie

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MotivacionIntroduccion

Reconstruccion del volumenReconstruccion de la Superficie

Motivacion

La obtencion de una reconstruccion tridimensional a partir deimagenes bidimensionales es un problema importante en diferentescampos, tales como: biologıa, medicina, microscopıa electronica,topografıa, diseno asistido por computadora, simulacion porcomputadora, visualizacion cientıfica, etc.

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MotivacionIntroduccion

Reconstruccion del volumenReconstruccion de la Superficie

Tipos de reconstrucciones 3D

Las tecnicas para obtener una reconstruccion 3D pueden dividirseen:

1. Reconstruccion del volumen: tomografıa, microscopıaelectronica

2. Reconstruccion de la superficie: visualizacion de terrenos,robotica, arqueologıa.

Tambien veremos lo que son la realidad aumentada y la realidadvirtual

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MotivacionIntroduccion

Reconstruccion del volumenReconstruccion de la Superficie

Reconstruccion 3D de macromoleculas biologicasTomografıa de rayos X

Reconstruccion del volumen

I Aplicado a la reconstruccion 3D de macromoleculas biologicas

I Tomografıa de rayos X

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MotivacionIntroduccion

Reconstruccion del volumenReconstruccion de la Superficie

Reconstruccion 3D de macromoleculas biologicasTomografıa de rayos X

Proyecciones

Para realizar la reconstruccion 3D de un volumen es necesariocontar con imagenes de proyeccion del objeto.

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MotivacionIntroduccion

Reconstruccion del volumenReconstruccion de la Superficie

Reconstruccion 3D de macromoleculas biologicasTomografıa de rayos X

Algunos ejemplos de proteınas

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MotivacionIntroduccion

Reconstruccion del volumenReconstruccion de la Superficie

Reconstruccion 3D de macromoleculas biologicasTomografıa de rayos X

Simulacion de una proteına

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MotivacionIntroduccion

Reconstruccion del volumenReconstruccion de la Superficie

Reconstruccion 3D de macromoleculas biologicasTomografıa de rayos X

Simulacion de una proteına

Vista por rebanadas

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MotivacionIntroduccion

Reconstruccion del volumenReconstruccion de la Superficie

Reconstruccion 3D de macromoleculas biologicasTomografıa de rayos X

Simulacion de una proteına

Proyecciones

de la proteına simulada

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MotivacionIntroduccion

Reconstruccion del volumenReconstruccion de la Superficie

Reconstruccion 3D de macromoleculas biologicasTomografıa de rayos X

Un tomografo de rayos X

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MotivacionIntroduccion

Reconstruccion del volumenReconstruccion de la Superficie

Reconstruccion 3D de macromoleculas biologicasTomografıa de rayos X

Un fantasma para pruebas con simulaciones

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MotivacionIntroduccion

Reconstruccion del volumenReconstruccion de la Superficie

Reconstruccion 3D de macromoleculas biologicasTomografıa de rayos X

Resultado de la reconstruccion 3D

Este reconstruccion se obtuvo con el

algoritmo de retroproyeccion.

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MotivacionIntroduccion

Reconstruccion del volumenReconstruccion de la Superficie

Reconstruccion de la Superficie

Se tienen varias situaciones para realizar la reconstruccion:

1. A partir de un solo marco de video

2. A partir de dos imagenes (geometrıa epipolar)

3. A partir de tres imagenes (tensor trifocal)

4. A partir de muchas imagenes

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MotivacionIntroduccion

Reconstruccion del volumenReconstruccion de la Superficie

Reconstruccion a partir de un solo marco de

video

Sistema para reconstruir un paralelepıpedo con solo un marco devideo.

1. Procesamiento digital de imagenesI Adquirir la secuencia de video y extraer los marcos de video.I Suavizar el marco de video.I Segmentar los bordes del paralelepıpedo.I Obtener el esqueleto de los bordesI Reconocer las aristas

2. Vision por computadoraI Obtencion de los parametros intrınsecos y extrınsecos de la

camara.I Recuperacion de las dimensiones del objeto.I Extraccion de las zonas con letras (texturas).I Visualizacion del paralelepıpedo.

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MotivacionIntroduccion

Reconstruccion del volumenReconstruccion de la Superficie

Para construir este sistema se utilizo lo

siguiente:

I Una camara de video digital accesible a traves del puertofirewire.

I Como plataforma de desarrollo se tiene GNU/Linux, OpenGL(Mesa, www.mesa3d.org) y Qt (www.trolltech.com)

I Se utilizo las bibliotecas de KINO para manipular la secuenciade video (cada marco de tamano 720× 576 pixels.

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MotivacionIntroduccion

Reconstruccion del volumenReconstruccion de la Superficie

Resultados - Extraccion

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MotivacionIntroduccion

Reconstruccion del volumenReconstruccion de la Superficie

Resultados - Suavizado

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MotivacionIntroduccion

Reconstruccion del volumenReconstruccion de la Superficie

Resultados - Segmentacion

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MotivacionIntroduccion

Reconstruccion del volumenReconstruccion de la Superficie

Resultados - Esqueleto

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MotivacionIntroduccion

Reconstruccion del volumenReconstruccion de la Superficie

Resultados - Aristas

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MotivacionIntroduccion

Reconstruccion del volumenReconstruccion de la Superficie

Obtencion de los parametros extrınsecos e

intrınsecos de la camara

Y

YX

X

Z

coordenadas dePunto en

la cámara

coordenadas dela imagen

Punto en

Z

X

Y

coordenadas demundo real

Punto en

Mundo real

Posición de la cámaraImagen

X

Y

(Xi, Yi)

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MotivacionIntroduccion

Reconstruccion del volumenReconstruccion de la Superficie

Parametros intrınsecos y extrınsecos de la

camara

λi

ui

vi

1

=

p11 p12 p13 p14

p21 p22 p23 p24

p31 p32 p33 p34

xi

yi

zi

1

P = A[RT ]

A =

fx α ox

0 fy oy

0 0 1

RT =

r11 r12 r13 txr21 r22 r23 tyr31 r32 r33 tz

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MotivacionIntroduccion

Reconstruccion del volumenReconstruccion de la Superficie

Recuperacion de las dimensiones del objeto

I Basado en el trabajo de Jelinek y Taylor (2001) 1

I Encuentra las dimensiones de cualquier tipo de figurageometrica regular que se puede representar con un modeloparametrizado lineal.

x

z

y

L

H

D

P0

P5 P6

P4

P1 P2

P3

P7

1D. Jelinek and C.J. Taylor, Reconstruction of linearly parameterized modelsfrom single images with camera of unknown focal length, IEEE Transactions onPattern Analysis and Machine Intelligence (23) 2001, pp 767-773.

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MotivacionIntroduccion

Reconstruccion del volumenReconstruccion de la Superficie

Recuperacion de las dimensiones del objeto

I Vertice expresado por un vector γ = (LHD)t .

I Conjunto de matrices de tamano 3× n, K1,K2, ...,Kn, y lamatriz Ki representa la posicion del i-esimo vertice.

P1 =

−L/20

D/2

=

−0,5 0 00 0 00 0 0,5

LHD

P3 =

L/2H

D/2

=

0,5 0 00 1 00 0 0,5

LHD

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MotivacionIntroduccion

Reconstruccion del volumenReconstruccion de la Superficie

Resultados - Visualizacion

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MotivacionIntroduccion

Reconstruccion del volumenReconstruccion de la Superficie

Resultados - Visualizacion

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MotivacionIntroduccion

Reconstruccion del volumenReconstruccion de la Superficie

Reconstruccion a partir de dos imagenes

x’

C

x

X

e e’

l’

F

l

π

C’

Geometrıa epipolar

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MotivacionIntroduccion

Reconstruccion del volumenReconstruccion de la Superficie

Reconstruccion de terrenos

-0.4

-0.2

0

0.2

0.4

0.6

0.8

1

-10 -5 0 5 10

f(x)

f (x) = sen(x)x

-10-5

0 5

10-10

-5

0

5

10

-0.4

-0.2

0

0.2

0.4

0.6

0.8

1

f(x,y)

f (x , y) = sen(x)sen(y)xy

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MotivacionIntroduccion

Reconstruccion del volumenReconstruccion de la Superficie

Reconstruccion de terrenos

-10-5

0 5

10-10

-5

0

5

10

-0.4

-0.2

0

0.2

0.4

0.6

0.8

1

f(x,y) 0.8 0.6 0.4 0.2 0

-0.2

f(x,y) 0.8 0.6 0.4 0.2 0

-0.2

-10-5

05

10 -10

-5

0

5

10

-0.4

-0.2

0

0.2

0.4

0.6

0.8

1

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MotivacionIntroduccion

Reconstruccion del volumenReconstruccion de la Superficie

Reconstruccion de terrenos

0.8 0.6 0.4 0.2 0

-0.2

-10 -5 0 5 10-10

-5

0

5

10

-10-5

0 5

10-10

-5

0

5

10

-0.4

-0.2

0

0.2

0.4

0.6

0.8

1

f(x,y)

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MotivacionIntroduccion

Reconstruccion del volumenReconstruccion de la Superficie

Imagen Binaria

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MotivacionIntroduccion

Reconstruccion del volumenReconstruccion de la Superficie

Ejemplo de Aplicacion

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MotivacionIntroduccion

Reconstruccion del volumenReconstruccion de la Superficie

Ejemplo de Aplicacion

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MotivacionIntroduccion

Reconstruccion del volumenReconstruccion de la Superficie

Ejemplo de Aplicacion

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MotivacionIntroduccion

Reconstruccion del volumenReconstruccion de la Superficie

Ejemplo de Aplicacion

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MotivacionIntroduccion

Reconstruccion del volumenReconstruccion de la Superficie

Realidad Aumentada

Se incorporan objetos virtuales a un video en tiempo real.

RealidadVideo Procesar

Objetosvirtuales

aumentada

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MotivacionIntroduccion

Reconstruccion del volumenReconstruccion de la Superficie

Realidad Virtual

I Navegacion en el mapa virtual de Mexico

I Creacion de objetos deformables y su interaccion coninterfaces hapticas

I Sistemas de entrenamiento medico

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MotivacionIntroduccion

Reconstruccion del volumenReconstruccion de la Superficie

Seccion de Computacion del CINVESTAV

Ofrecemos la maestrıa y doctorado enIngenierıa Electrica opcion Computacion.

I Pagina de la Seccion: http://www.cs.cinvestav.mx

I Mi pagina personal: http://delta.cs.cinvestav.mx/˜fraga

I Mi correo electronico: [email protected]

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