PROYECTO DOCENTE Informática Aplicada a la Biología Grupo ...

Datos básicos de la asignaturaTitulación: Grado en BiologíaAño plan de estudio: 2009

Curso implantación: 2009-10Centro responsable: Facultad de Biología

Nombre asignatura: Informática Aplicada a la BiologíaCódigo asigantura: 1530002Tipología: TRONCAL / FORMACIÓN BÁSICACurso: 1Periodo impartición: Primer cuatrimestre

Créditos ECTS: 6Horas totales: 150Área/s: Análisis MatemáticoDepartamento/s: Ecuaciones Diferenciales y Análisis Num.

Coordinador de la asignatura

PEREZ PEREZ M. TERESA

Profesorado

Profesorado del grupo principal:

SUAREZ GRAU FRANCISCO JAVIER

Profesorado de otros grupos de la asignatura:

FERNANDEZ ROMERO ANTONIO

MARIN GAYTE IRENE

Objetivos y competencias

OBJETIVOS:

Conocimientos y técnicas básicas de informática con el objetivo de resolver problemas con el

ordenador y tener capacidad para organizar y manipular bases de datos. Manejo básico de la

hoja de cálculo EXCEL (o similar) y del paquete informático MATLAB (o similar).

PROYECTO DOCENTE

Informática Aplicada a la Biología

Grupo de Clases Teóricas Informática Aplicada a la Biología

CURSO 2020-21

Última modificación 03/09/2020 Página 1 de 13

COMPETENCIAS:

Competencias específicas:

1.- Conocimientos y técnicas básicas de informática.

2.- Destrezas prácticas en el manejo de programas informáticos útiles en el ámbito científico.

3. - Capacidad de resolución de problemas con el ordenador.

4. - Capacidad de organizar y manipular bases de datos.

5.- Capacidad de interpretación de resultados obtenidos por ordenador.

6.- Habilidades de presentación ordenada de información y resultados.

7.- Capacidad de autoaprendizaje.

8.- Capacidad de trabajo en grupo.

9.- Capacidad de modelado y simulación de problemas experimentales.

Competencias genéricas:

Capacidad de organizar y planificar

Conocimientos generales básicos

Habilidades elementales en informática

Resolución de problemas

Toma de decisiones

PROYECTO DOCENTE



CURSO 2020-21


Trabajo en equipo

Habilidades para trabajar en un equipo interdisciplinario

Habilidad para trabajar de forma autónoma

Capacidad para aplicar la teoría a la práctica

Habilidades para trabajar en grupo

Capacidad de análisis y síntesis

Habilidades para recuperar y analizar información desde diferentes fuentes

Contenidos o bloques temáticos

1.- Manejo básico de una hoja de cálculo (EXCEL o similar).

2.- Introducción a las bases de datos.

3.- Introducción a algunas herramientas informáticas de cálculo matemático y simulación, de utilidad

en Biología (MATLAB o similar).

4.- Herramientas informáticas para el Cálculo numérico elemental.

5.- Resolución con ordenador de ecuaciones diferenciales.

6.- Introducción al cálculo simbólico.

PROYECTO DOCENTE



CURSO 2020-21


Relación detallada y ordenación temporal de los contenidos

Sesiones de Teoría (26 horas):

Tema 1. Introducción. Bioinformática y Biocomputación. Motivación histórica. (1 hora aprox.)

Parte 1: Bioinformática (15 horas aprox.).

Tema 2. Introducción básica a los ordenadores. Elementos del software. (2 horas aprox.).

Tema 3. Introducción a la programación: Algoritmos y diagramas de flujo. (9 horas aprox.).

Temas 4 y 5. Internet. Bases de datos. (2 horas aprox.)

Tema 6. Sistemas binario y decimal. Errores. (2 horas aprox.)

Parte 2: Biocomputación (aprox. 10 horas).

Tema 7. Introducción a los sistemas dinámicos: Modelado de la realidad.(1 hora aprox.)

Tema 8. Modelos continuos unidimensionales en sistemas biológicos:

Conceptos básicos. Modelos de poblaciones: ecuación logística,

PROYECTO DOCENTE



CURSO 2020-21


modelos de pesca. Otros modelos. (5 horas aprox.).

Tema 9. Modelos continuos bidimensionales en sistemas biológicos:

Conceptos básicos. Modelos de Lotka-Volterra. Otros modelos.

(4 horas aprox.).

Sesiones de Práctica (30 horas):

Tema 0. Introducción (0'5 horas aprox.)

Introducción a la Enseñanza Virtual.

Tema 1. MATLAB 1 (14'5 horas aprox.)

Introducción. Tipos de datos. Operaciones elementales. Introducción al cálculo simbólico.

Funciones matemáticas intrínsecas. Variables. Vectores y matrices. Gráficas.

Cálculo numérico con MATLAB: raíces de ecuaciones.

Introducción a la programación.

Introducción al manejo de cadenas de caracteres.

Tema 2. OpenOffice Calc (10 horas aprox.)

PROYECTO DOCENTE



CURSO 2020-21


Introducción. Fórmulas y funciones. Referencias absolutas y relativas. Gráficas. Funciones

lógicas.

Bases de datos: filtros, ordenación. Funciones de bases de datos.

Tema 3. MATLAB 2 (4 horas aprox.)

Resolución numérica de modelos continuos de sistemas biológicos.

Interpretación de resultados. Ejemplos de modelos aplicados a la Biología.

Tema 4. Bases de datos con interés en Biología. Ejemplos prácticos (1 hora aprox.)

Actividades formativas y horas lectivas

Actividad Créditos Horas

A Clases Teóricas 2,6 26

G Prácticas de Informática 3,4 34

Metodología de enseñanza-aprendizaje

Prácticas informáticas

El alumno trabajará en el ordenador del aula los contenidos teóricos y prácticos que se le vayan

impartiendo.

Se ampliarán explicaciones, soluciones de problemas, dudas, tutorías, seminarios y discusión de las

conclusiones de los grupos de trabajo.

Los alumnos realizarán búsqueda, consulta y tratamiento de la información, elaboración de

PROYECTO DOCENTE



CURSO 2020-21


trabajos en grupo, experimentación y observación.

Clases teóricas

La asignatura incidirá en el manejo del ordenador. El alumno trabajará en el ordenador del aula los

contenidos teóricos que se le vayan impartiendo.

Se realizarán clases magistrales, se ampliarán explicaciones, soluciones de problemas, dudas,

tutorías, seminarios y discusión de las conclusiones de los grupos de trabajo.

Los alumnos realizarán búsqueda, consulta y tratamiento de la información, elaboración de

trabajos en grupo, experimentación y observación.

Actividades académicas dirigidas con presencia del profesor

Se podran proponer cuestiones mas o menos detalladas y relacionadas con la materia

para ser desarrolladas por los alumnos de manera individual o en grupo.

Actividades académicas dirigidas sin presencia del profesor

Investigación, recopilación y concreción de información a partir de los recursos bibliográficos

disponibles.

Sistemas y criterios de evaluación y calificación

Valorando la adquisición de las competencias y conocimientos que persigue la

materia.

Propuestos tanto para las sesiones presenciales como para trabajo individual del alumno.

Examen final del programa completo de la asignatura para los alumnos que no aprueben por

curso y para los de las convocatorias extraordinarias.

PROYECTO DOCENTE



CURSO 2020-21


Se valorará la asistencia a clase.

Criterios de calificación del grupo

La asignatura podrá aprobarse a través de dos vías:

Primera vía: con anterioridad a la primera convocatoria, mediante la realización de dospruebas

parciales de seguimiento.

Cada prueba parcial consistirá en un examen con una parte teórica y otra práctica. Estas pruebas

se realizarán en la fecha, hora y aula a determinar. La convocatoria de dichos exámenes será

publicada con la suficiente antelación en el espacio de la asignatura de la plataforma de Enseñanza

Virtual.

La nota final de cada prueba será la ponderación de la nota de la parte práctica y de la teórica,

de acuerdo a 60% las prácticas y 40% la teoría.

Para superar la asignatura por esta vía, será necesario obtener una calificación igual o superior a5

en cada prueba parcial. Además, se valorará una participación activa en las clases.

La calificación final de la asignatura será la resultante de hacer la media aritmética entre lasnotas

de las dos pruebas parciales.

Segunda vía: si no se ha aprobado usando la opción anterior, deberá hacerse a través de los

exámenes de convocatorias oficiales (ver fechas de exámenes).

El examen final de la 1ª convocatoria (5 de febrero de 2021) constará de dos partes. En cadaparte

se evaluará la materia teórica y práctica correspondiente a cada prueba intermedia y el alumno

podrá examinarse sólo de la parte correspondiente a la prueba parcial que tenga suspensa o de la

asignatura completa. Esto sólo será posible en esta convocatoria.

El alumno que quiera subir nota podrá hacerlo en el examen final de la 1ª convocatoria

examinándose de la asignatura completa.

PROYECTO DOCENTE



CURSO 2020-21


En la 2ª y 3ª convocatorias (15 de septiembre de 2021 y 9 de diciembre 2020, respectivamente) los

alumnos deberán examinarse de la asignatura completa que

también constarán de dos partes.

La calificación final, por esta segunda vía, se obtendrá igualmente con la ponderación de un 60%de

la nota de la parte práctica y un 40% de la teórica. Los alumnos que se examinen de la asignatura

completa no tendrán que sacar una nota mínima en cada parte.

La entrega de todos los exámenes se hará a través de la Enseñanza Virtual, por este motivo, es

requisito imprescindible que el alumno sepa comprimir (en un fichero .zip o .rar) la carpeta creada

con los ficheros generados durante el examen, así como subir dicha carpeta comprimida a través de

la plataforma, por si mismo.

Además del escenario cero, descrito anteriormente, se tendrán en cuenta los siguientes escenarios

--- Escenario A : Reducción de la presencialidad en caso de imposición de medidas sanitarias de

distanciamiento interpersonal.

En este escenario la asistencia de los alumnos a las clases teóricas se ajustará al sistema rotatorio

que disponga la Facultad de Biología. Los días restantes se seguirán las clases on-line, mediante el

uso de la plataforma Blackboard Collaborate Ultra o similar.

En cuanto a las clases prácticas se realizarán en su totalidad en modalidad on-line y mediante el

uso de la plataforma Blackboard Collaborate Ultra o similar.

En todo momento se incentivará una participación lo más activa posible, proporcionando a los

alumnos un programa detallado de los contenidos objeto de estudio, además de material impreso

y/o audiovisual para complementar los aspectos más teóricos de la materia.

PROYECTO DOCENTE



CURSO 2020-21


Se mantiene el sistema de evaluación estándar, realizándose las pruebas parciales y los exámenes

finales de manera presencial.

En el caso de que las condiciones sanitarias y las autoridades académicas no permitan la

realización presencial de los exámenes, introducimos una única modificación: en esta situación, no

tendrán lugar dos exámenes parciales, sino un único examen previo al examen final.

En este contexto de aislamiento más severo, todas las pruebas se realizarán de forma telemática

adoptándose los mecanismos de garantía de autoría del mismo, que la Universidad de Sevilla

determine y ponga a disposición del profesorado.

--- Escenario B : Suspensión total de la actividad presencial

En este escenario todas las clases se impartirán on-line, utilizando la herramienta Blackboard

Collaborate Ultra o similar.

En todo momento se incentivará una participación lo más activa posible, proporcionando a los

alumnos un programa detallado de los contenidos objeto de estudio, además de material impreso

y/o audiovisual para complementar los aspectos más teóricos de la materia.

PROYECTO DOCENTE



CURSO 2020-21


En este contexto, todas las pruebas se realizarán de forma telemática adoptándose los mecanismos

de garantía de autoría del mismo, que la Universidad de Sevilla determine y ponga a disposición del

profesorado. Asimismo, tampoco en esta situación tendrán lugar dos exámenes parciales, sino un

único examen previo al examen final.

Horarios del grupo del proyecto docente

https://biologia.us.es/es/docencia/titulaciones/

Calendario de exámenes

https://biologia.us.es/es/docencia/titulaciones/

Tribunales específicos de evaluación y apelación

Presidente: TOMAS CARABALLO GARRIDO

Vocal: ANTONIO SUAREZ FERNANDEZ

Secretario: ANNA DOUBOVA KRASOTCHENKO

Suplente 1: JUAN CASADO DIAZ

Suplente 2: JOSE ANTONIO LANGA ROSADO

Suplente 3: MARIA ANGELES RODRIGUEZ BELLIDO

Bibliografía recomendada

BIBLIOGRAFÍA GENERAL:

Introducción a la computación.

Autores: Peter Norton

Edición: Ed. McGraw-Hill, 2006

Publicación: libro

ISBN: 9788467628708

Bioinformática: simulación, vida artificial e inteligencia artificial,

PROYECTO DOCENTE



CURSO 2020-21


Autores: R. Lahoz-Beltrá

Edición: Ed. Diaz de Santos, 2004.

Publicación: libro

ISBN: 978-84-368-1924-3

BIBLIOGRAFÍA ESPECÍFICA:

Introducción a la Bioinformática

Autores: Attwood, T.K., y Parry-Smith, D.J

Edición: Prentice-Hall, 2002

Publicación: libro

ISBN: 9788467628708

Bioinformatics for dummies

Autores: Jean-Michel Claverie, Cedric Notredame

Edición: Indianapolis, IN : Wiley Pub., 2007.

Publicación: libro

ISBN: 9788467628708

Resolución de problemas en ingeniería química y bioquímica con POLYMATH, Excel y MATLAB.

Autores: Michael B. Cutlip, Mordechai Shacham

Edición: Ed. Pearson Educación, cop. 2008.

Publicación: libro

ISBN: 9788467628708

Calculus for Biology and Medicine.

Autores: Neuhauser, C.

Edición: 2 ed. Pearson Education.

Publicación: libro

ISBN: 9788467628708

Ecología

Autores: Jaime Rodríguez Martínez y colaboradores.

Edición: Ed. Pirámide - Grupo Anaya, 2013

Publicación: libro

ISBN: 9788467628708

PROYECTO DOCENTE



CURSO 2020-21


OpenOffice.org 3.1: Writer y Calc

Autores: Varios autores

Edición: MAD, 2009

Publicación: libro

ISBN: 9788467628708

HOJAS DE CALCULO 00-CALC

Autores: MARTINEZ PEREZ, FRANCISCO MIGUEL ( Coordinador)

Edición: EDITORIAL CLUB UNIVERSITARIO, 2010

Publicación: e-libro (recurso electrónico)

ISBN: 9788484549703

INFORMACIÓN ADICIONAL

Manual de OpenOffice Calc de Valentín Roldán y Máximo Prudencio:

http://www.um.es/docencia/barzana/PRACTICAS/PDF/OpenOffice_Calc.pdf

Manual de OpenOffice Calc del Grupo Universitario de GNU/Linux de Entre Ríos:

http://www.gugler.com.ar/pdfs/manuales/calc.pdf

OpenOffice Calc a tu alcance de Antonio Roldán Martínez:

http://www.lulu.com/items/volume_66/6166000/6166296/14/print/6166296.pdf

Aprenda Matlab como si estuviera en primero de Javier García de Jalón, José Ignacio Rodríguez,

Jesús Vidal (Univ. Politécnica de Madrid):

http://www.etnassoft.com/biblioteca/aprenda-matlab-como-si-estuviera-en-primero/

PROYECTO DOCENTE



CURSO 2020-21


PROYECTO DOCENTE Informática Aplicada a la Biología Grupo ...

Documents

Transcript of PROYECTO DOCENTE Informática Aplicada a la Biología Grupo ...