Memoria Anual - CRG Annual Report 2017...das de financiación,una en 2009 (INTERPOD) y otra en 2014...

RESUMEN EJECUTIVO

M e m o r i a A n u a l

© CRG 2018

RealizaDO pOR: Departamento de Comunicación y Relaciones públicas

Centro de Regulación Genómica (CRG)

Dr. aiguader, 88

08003 Barcelona, españa

www.crg.eu

TexTO Y GRÁfiCOs: CientíficosdelCRG,MiembrosdelequipodeAdministracióndelCRG,

Kat arney, Departamento de Comunicación y Relaciones públicas

DiseÑO GRÁfiCO: Ondeuev Comunicació s.l.

fOTOGRafÍa: IvanMarti,científicosdelCRG

vÍDeO: adrià sunyol

DepÓsiTO leGal: B 17125-2018

http://www.crg.eu

pRÓlOGO 4

DesTaCaDOs iNsTiTUCiONales 6

DesTaCaDOs CieNTÍfiCOs 16

Hogar dulce hogar 17

Nadar en un mar de virus 19

Ultracongelación 21

pásalo 23

Clasificar 25

De acuerdo, ordenador 27

Desempaquetandoelgenoma 29

InvestigaciónyServiciosCientíficos 32

investigadores eRC en el CRG 37

DaTOs Y CifRas 38

InfoRMefInAnCIeRo 44

AGRADeCIMIentoS 46

Contenidos

4 - Resumen ejecutivo 2017

prólogo

e steaño,el10deabril,tuvolugarfinalmentelafirmaoficialdelacuerdoparaelestablecimiento

deunanuevasubsededeleMBLenBarcelona.Despuésdemásde20años,eleMBLhaabierto

una nueva subsede en el pRBB en Barcelona, adyacente al CRG. esto mejorará la visibilidad

internacionaldelPRBBycreará, juntoconlaUnidaddeMicroscopiaÓpticaAvanzadadelCRG,una

instalación líder en imagen en europa.

Unodeloshechosmásimportantesquesucedieronen2017fuelacreacióndeunaredentretodos

los institutos y unidades universitarias españolas distinguidas con los premios de excelencia severo

ochoayMaríadeMaeztu.estaalianza(SoMMa,http://somma.es/)sehacreadoconelfindepromo-

ver la excelencia española en investigación y para mejorar su impacto a escala nacional e internacio-

nal.Dehecho,elCRGeselórganoquepresidedichaalianza.

Porloquerespectaalaciencia,duranteelañosellevóacabolaevaluacióndelprogramadeBioinfor-

máticayGenómica.Lavaloraciónfueexcelenteypropiciólacontinuidadyelrefuerzodelabioinfor-

mática en el CRG.

en 2017, tres de nuestros jóvenes investigadores principales pasaron a ocupar cargos en senior otros

institutos.MatthieuLouisestáahoraenelDepartamentodeBiologíaMolecular,CelularydelDesarro-

llodelaUniversidaddeCalifornia,enSantaBárbara,enestadosUnidos;fyodorKondrashovestáen

el Departamento de Genómica evolutiva del instituto de Ciencia y Tecnología (isT austria), en Klos-

terneuburg,Austria,yManuelMendozaesjefedegrupodelInstitutodeGenética,BiologíaMolecular

yCelular(IGBMC)enestrasburgo,francia.finalmente,JamesSharpesetrasladódelCRGparacon-

vertirseeneldirectordelanuevasededeleMBLenBarcelona.estamosenormementesatisfechosde

quetodosocupencargosexcelentes,unhechoquedemuestraeléxitodelCRGenlaformaciónyla

promocióndejóvenescientíficos.Aprincipiosde2017,elvanBokeynicholasStroustrup,queante-

riormentetrabajabanenlaHarvardMedicalSchooldeestadosUnidos,seunieronalCRG.

tambiénalolargodeeseaño,ydeacuerdoconnuestroplanestratégico,hicimoscambiosenlaforma

decontratarnuevosinvestigadoresprincipales.Porprimeravez,anunciamosplazasnoadscritasa

ninguno de los programas relativos a los principales temas de investigación de nuestro plan. Tuvimos

más de 150 solicitudes y, tras la selección y las entrevistas, contratamos a dos nuevos investigadores

Resumen ejecutivo 2017 - 5

principales:evanovoa,del InstitutoGarvandeInvestigaciónMédicadeAustralia,yArnauSebe-Pe-

dros,delWeizmannInstituteenIsrael,quellegaríanalCRGen2018y2019,respectivamente.

encuantoalafinanciación,elCRGsigueatrayendofondoscompetitivos.Cabemencionarquefuimos

galardonadosporsegundavezcomoCentrodeexcelenciaSeveroochoa,distinciónconunavalidez

decuatroañosqueotorgaelMinisteriodeeconomía,IndustriayCompetitividad.Asimismo,cuatro

gruposentraronaformarpartededosplataformastecnológicasnacionalesclavedebioinformática

(Guigó, Gabaldón, Gut) y proteómica (sabidó), con el apoyo del instituto de salud Carlos iii (isCiii). a

escala europea, además de numerosos proyectos colaborativos, es importante destacar dos ayudas:

unaStartingGrantdeleRC(Boke)yunapruebadeconceptodeleRC(Valcárcel),estaúltimaorienta-

daaprobarelpotencialterapéuticodenuevosreactivosparalaterapiadelcáncerdepulmón.enel

ámbito internacional, Roderic Guigó obtuvo dos nuevas ayudas a la investigación, procedentes de los

institutos Nacionales de salud (NiH) de eeUU.

el CRG apoya a la ciencia abierta y, en este sentido, es importante mencionar el proyecto de la Ue

liderado por el CRG: ORiON. se trata de una nueva iniciativa para promover cambios institucionales en

lafinanciacióndelainvestigaciónyenlasorganizacionesparahacerlasmásreceptivasalasnecesi-

dadesdelasociedadyabrazarlosprincipiosdelacienciaabierta.

CabesubrayarqueelCRGnoseríaunlugartanatractivosinelapoyoprofesionalyexcelentedesus

diferentesdepartamentosdeadministraciónque,apesardelaenormecarga,hanconseguidocrear

unfantásticoambienteparatrabajar.Másenconcreto,unadelasrecomendacionesclavedelgrupode

expertos externo en 2016, el proyecto de “gestión de procesos empresariales”, se implementó durante

elañopasadoconelobjetivodeevaluarymejorarelrendimientoylaeficaciadelaadministracióny,

por lo tanto, permitir la mejora continua de los departamentos.

enunañollenoderetos,porprimeravezhemoshechofrentealasalidademuchosgruposalmismo

tiempo, hemos tratado con una crisis política a escala nacional y autonómica y la condición de dedu-

cibilidaddenuestroIVAhaentradoencontroversia,conunimportanteimpactofinancieroyunagran

incertidumbre.Graciasalapoyode todonuestropersonal,hemosminimizadoel impactodeestos

retosyhemosaseguradoelapoyoyel éxitode todosnuestros investigadoresprincipales.elCRG

sigue siendo un lugar ideal para hacer ciencia y tenemos antes nosotros oportunidades y proyectos

emocionantes con vistas al año 2018.

Luis Serrano Director


Destacados institucionales


administraciónelequipoadministrativo(incluyendoelCnAG-CRG)incluyemiembrosde10paísesdiferentesy,en2017,

haprestadoapoyoesencialyespecíficoalacomunidaddelCRGdeacuerdoconlasprioridadesdefini-

dasenelplanestratégico2017-2021yelplandeacciónanualdelinstituto.

Una de las recomendaciones clave del panel externo, el proyecto de “gestión de procesos de negocio”, se

implementóduranteelañopasadoconelobjetivodeevaluarymejorarelrendimientoylaefectividadde

la administración y, por lo tanto, permitir una mejora continua entre los departamentos. Continuaron o se

iniciaronalgunasactividadesparafomentarelespírituyeldesarrollodelequipo,einiciativasdeconciliación

entre la vida laboral y personal del grupo, incluyendo la jornada de administración con trabajo de grupo

sobre el tema de la innovación (dibujos, presentaciones breves, lluvia de ideas conjunta y actividades cien-

tíficas),elprogramadeteletrabajo,evaluacionesanualesderendimientoyactividadesde“cienciafácil”.

elequipoadministrativocontribuyóaalgunasiniciativasparatodoelCRG:laimplementacióndelplande

accióndeigualdaddegénerodeLIBRA,laexcelenciadeRRHHenproyectosdeinvestigación,laprimerareu-

nión de la junta de antiguos alumnos en Barcelona, la contratación de nuevos investigadores principales (pi)

ylapartidafluidadevariosgruposdeinvestigación.estaúltimacoincidióconunaumentosignificativodePI

júniorsqueabandonabanelinstituto,talcomoestáprevistoenlapolíticaderotacióncientífica.enelcontexto

delestablecimientodelaasociaciónlocalentreelCRGyeleMBLyconelapoyofinancierodelMinisteriode

economía,IndustriayCompetitividadespañol,elequipoadministrativoasesoróyprestóapoyoenlarecien-

tementecreadasededeleMBLdeBarcelonaenasuntosrelativosalastIC,prevenciónderiesgoslaborales,

gestión de instalaciones y compras. entre las nuevas iniciativas de prevención de riesgos laborales llevadas a

caboen2017,seencuentraladigitalizacióndeunregistrocentralizadodebioseguridadparaelusodeagen-

tes biológicos, así como la designación de coordinadores de seguridad en los laboratorios como contactos

localescadaunodeellos,loqueaseguraelusoadecuadodenormasdesaludyseguridadenellaboratorio.

Con el objetivo de actuar más allá del CRG, los miembros de la administración siguen compartiendo pun-

tos de vista y se relacionan con otros institutos nacionales y del extranjero, especialmente con institutos

deeU-LIfe.SecelebraronlocalmentemesasredondasenlasquelosinstitutosCeRCApermitieronel

intercambiodeconocimientosybuenasprácticas.Másconcretamente,lagerentefueponenteinvitada

en dos ocasiones y presentó la evaluación de la administración llevada a cabo en 2016 por un panel de

expertosexternosinternacionales,porloquesirviócomomodeloparaotrosinstitutosnacionales.


formaciónAvanzadaLaformaciónavanzadaendiferentesetapasprofesionaleseselnúcleodelasactividadesdelCRG.

Tanto para estudiantes de máster y doctorado como para becarios y grupos de investigación júnior,

elCRGofreceunentornoestimulanteyenriquecedor,unprogramadeformaciónintegralycursos

amedidasobrehabilidadescientíficasytransferibles.

PROgRaMaS aCadéMICOS

el programa internacional de Doctorado del CRG es un emblema del compromiso del CRG con

la formación,ysecaracterizaporunacombinaciónde tutoríay formacióncientíficadedicadaa

apoyarlaindependenciaylacreatividad.Consusmásdediezañosdehistoria,elprogramasigue

siendomuyatractivoycompetitivo;pruebadeesteéxitoesquerecibecadaaño400 solicitudes de

más de 50 países diferentes yqueadmite20-30 estudiantes cada curso.

en el año 2017, el programa internacional de Doctorado siguió atrayendo a jóvenes talentos de

todoelmundofinanciadosporfondoscompetitivosinternosyexternos.Ademásdela convoca-

toria del Doctorado del CRG, junto con el iRB Barcelona, el vHiR y el iDiBaps, llevamos a cabo un

programade formación en investigaciónparamédicosdurante cuatro años, llamadoprograma

PhD4MD.elobjetivodelprogramaa largoplazoesformara lapróximageneracióndemédicos

científicosqueimpulsarálainvestigaciónygeneraráunmayorimpactoenlospacientes.Untotal

de cuatro doctores en medicina se han unido al CRG entre los años 2014 y 2017.

el programa posdoctoral del CRG permite a los jóvenes investigadores trabajar en proyectos muy

colaborativoseinterdisciplinariosendiferentesgruposyunidadesdelCRG.trasconseguirdosron-

dasdefinanciación,unaen2009(INTERPOD) y otra en 2014 (Impulse), el programa de postdocs,

hasidogalardonadoconunaterceraayudadelaCeatravésdeMarieSkłodowska-CurieH2020

COfUND actions para el período 2017-2022 (INTREPiD). el tercer programa COfUND permite co-

laboracionesconotras institucionesacadémicasyde la industria,por loque los investigadores

posdoctoralespuedenestablecerymantenerconexionesqueresultenútilesenlaconstrucciónde

suscarrerasprofesionalesmásalládelCRG.Variosinstitutosdeinvestigación,comoelInstituto

Curie y el instituto de investigación de la vall d’Hebron (vHiR), así como empresas como Novartis

y esteve, se unieron al programa iNTRepiD como socios externos.

el programa INTREPiDincluyeuncurrículumdeformacióndirigidoapotenciarhabilidadesnocien-

tíficasdelosinvestigadores(porejemplo,laéticadelainvestigación,ladivulgaciónyelgéneroen

laciencia)yofreceunapoyoexclusivoparaeldesarrolloprofesional.Laprimeraconvocatoriase

abrió en septiembre de 2017 y se seleccionaron seis nuevos miembros.

por último, la 5ª edición del Programa Internacional de Prácticas de Verano del CRG para estu-

diantesuniversitariossepusoenmarchaenfebrerode2017:seconcedieroncincoprogramasde

prácticas para proporcionar a los estudiantes universitarios la oportunidad de investigar en el CRG

durante el verano (países de origen: Rusia, Dinamarca, Ucrania, italia y la República Checa).

el CRG tiene asimismo varias asociaciones activas con programas de máster para acoger estu-

diantesparaprácticasde investigación:UPf,UB,UPC, facultaddeCienciasde laSaint-Joseph

University(Beirut),MIt(eeUU),etc.esteañohemosaceptadoiniciarunanuevaalianzaconlaUni-

versidad de Richmond (eeUU) para acoger a sus estudiantes universitarios en prácticas intensivas

de investigaciónduranteelveranodelpróximoaño.Seguiremosexplorandootrasalianzaspara

atraer a los mejores investigadores júnior.

elCRG tambiéncontribuyóal desarrollodel nuevoMáster en Investigación Multidisciplinar en

Ciencias Experimentales del BIST, iniciadoenoctubrede2017.fuerondos losestudiantesque

obtuvieronunabecapararealizardichomásterenelCRG.Actualmentetienelugarunanuevaedi-

ción de este máster.


PROgRaMa dE fORMaCIóN

en 2017 se mejoró el Programa de formación avanzada del CRG con varios cursos internacionales

dealtonivelenelmarcodelosCourses@CRG,asícomounaofertamásampliadecursosytalleres

científicosinternos.Comoenañosanteriores,loscursosorganizadosporelCRGestuvieronabier-

tosalascomunidadescientíficaslocaleseinternacionalesyenellosseimpartióformacióndealta

calidadsobrelosúltimosavancescientíficosylastecnologíasmásrecientes.

en2017,laUnidaddeformacióndelCRGorganizóeimpartiósieteCourses@CRG de calidad, un

cursoeMBoyuncursoconjuntoconelfIMM,alosqueasistieron170participantesdeinstitutos

deinvestigaciónde34paísesdiferentes,comoArgentina,Australia,Israel,lasIslasMauricio,Sin-

gapur,SudáfricayestadosUnidos.

- Conformacióncromosómica(f.LeDily)

- Proteómicaavanzada(e.Sabidó)

- Ingenieríadetejidos:Decélulasmadreaorganoides(L.Batlle)

- Modelizacióndecélulascompletas(L.Serrano,M.Lluch)

- nextflow:Genómicain-silicoreproducible(P.Ditommaso,C.notredame)

- C.elegans:CRISPR,RnAiygenética(B.Lehner)

- CRISPR/Cas9:HerramientadeedicióngenéticaCarolis,L.DiCroce)

- eMBo-Proteómicadirigida:Diseñoexperimentalyanálisisdedatos(e.Sabidó)

- epigenéticaen investigaciónclínicay traslacional (L.DiCroceencolaboraciónconelfIMMy

celebradoenHelsinki)

Los Courses@CRG atrajeron el patrocinio/colaboración de Amazon, Bio-Cat, Biogen, IDt, Izasa

Scientific,Leica,nemaMetrix,nikon,SigmaAldrich,Sonidel,StemCelltechnologiesytermofisher.

Unodelospuntosclaveparael2017fueeldesarrollodeunaampliacarteradecursos internos

centrados en habilidades científicas y tecnológicas, así como habilidades transferibles, integri-

dad de la investigación y coachingprofesional.Laformacióninternahaabiertonuevasoportunida-

destantoparalosformadorescomoparalosestudiantes.Lostécnicos,losestudiantesdedocto-

radoylosinvestigadoresposdoctoralesadquirieronexperienciaenlaenseñanzayelintercambio

deconocimientos,asícomoexperienciaconelrestodelacomunidaddelCRG,altiempoquelos

participantessebeneficiabandelamplioabanicodeactividadesdeformaciónqueseofrecieron

durante todoelaño (véasemásadelante).Los23 talleres llegarona todos losnivelesdeprofe-

sionalidadcientíficos,desdelosestudiantesuniversitarioshastalosjefesdegrupo,yasistierona

ellos casi 450 participantes procedentes de todos los programas y ámbitos del CRG y CNaG-CRG.

11tallerescientíficosytécnicos:AlostalleresdeLinux,Clúster,Bioinformática,programaciónen

PythonyR,ysoftwaredelclústerasistieroncasi150participantesdelCRGyCnAG-CRG.

en2017se implementóuna formaciónde libretasde laboratorio electrónicas (eLn)para todos

los estudiantes de doctorado de primer curso del instituto, así como un curso de iniciación sobre

Ciencia abierta e integridad de la investigación.

Desdemayode2017,esobligatorioquetodos losnuevoscientíficosque lleganalCRGrealicen

un curso en línea sobre integridad de la investigación. este curso consta de módulos interactivos,

cuestionarios,vídeosbrevesytutorialessobreéticaeintegridaddelainvestigación.

Casi 300 estudiantes del CRG y CNAG-CRG, posdoctorados, técnicos y jefes de grupo asistieron

a12cursosdefortalecimientodelashabilidadesencomunicacióncientífica,gestión,liderazgoy

emprendimiento.

Aprender haciendo esunainiciativaquepermitealosinvestigadoresdelCRGhacerprácticasen

diferentesdepartamentosdegestióndelCRGparaobtenerexperienciaenlagestióndeproyectos

científicos, lacomunicacióncientíficay laorganizacióndeeventosy formaciónparacientíficos,

profesoresdesecundariaypúblicoengeneral.Seleccionamosadiez investigadorespara lossi-

guientes departamentos: isa, Comunicación y ayudas a la investigación.


Comunicación, divulgación y educación científicasla misión de Comunicación del CRG es promover y proteger la reputación de excelencia del CRG. lo con-

seguimos mediante el desarrollo y la implementación de estrategias claras, coherentes e interesantes

diseñadas para potenciar la comprensión pública de nuestra ciencia y nuestro instituto, sus investigado-

resyelvalorquetienenparalasociedad.

la segunda edición del proyecto de ciencia ciudadana “Saca la lengua” comenzóafinalesde2016.este

proyecto, incluido dentro del ámbito de la ciencia abierta, es el primer estudio sobre el microbioma bucal,

que tienecomoobjetivoestudiar lahuellagenéticadediferentescomunidadesmicrobianasyexplorar

una posible relación con las características ambientales o el estilo de vida. financiado principalmente por

lafundaciónBancaria“laCaixa”yelCRG,lasegundaedicióndelproyectoteníatambiéncomoobjetivo

incorporarnuevasvariablescientíficasypuntosfocales,asícomoabordarnuevosretos,llegaranuevos

públicoseinvolucraryrecogermuestrasdediversaspoblacionesypacientesquesufrendiferentesenfer-

medades.estosobjetivossealcanzaronorganizandounanuevarutaporespaña,ofreciendonuevasactivi-

dadesbasadasenformatosinnovadoresyparticipativosquenospermitierancomprometernosconestos

nuevos grupos diana, comunicar nuestra investigación y sus objetivos, y compartir una respuesta sobre el

proyectoconlosciudadanosqueparticipanenélyconelpúblicogeneral.Graciasaestaestrategiamejora-

da, llegamos a 3.700 personas, 34 centros escolares, 13 asociaciones de pacientes y 21 centros culturales.

Durantetodoelaño,elCRGsiguióofreciendoactividadesparticipativasparaelpúblicogeneralyactividades

deeducacióncientífica.encualquiercaso,algunasdelasiniciativasmerecenunamenciónespecial.enel

marcodeunacolaboraciónconlaempresaminiPCRyelproyecto“Sacalalengua”,fuimosinvitadosaparti-

cipar en el Festival de Ciencias de Cambridge deBostonenabril.fueunaexperienciamuyenriquecedoray

exitosa, y nos dio muchos inputspositivos.tambiéniniciamosconéxitounnuevotallerdirigidoalospadres,

titulado “Vuestros hijos pueden convertirse en científicos”,conelobjetivodeofrecerpistasyconsejosa

lospadresconhijosquetienenquedecidircuálserásutrayectoriaprofesional.tambiénparticipamosen

un nuevo proyecto piloto para la educación junto con mSchools, titulado “La complejidad de la vida”,que

consiste en un conjunto de materiales y recursos diseñados para introducir a los estudiantes en el campo de

lascienciasdelavidamediantetecnologíasmóviles.mSchoolsesunprogramamultimediamultifacéticode

meducationdelMobileWorldCapitalBarcelona,encolaboraciónconlaGeneralitatdeCataluña,elAyunta-

mientodeBarcelonaylaGSMA,quepermitealosestudiantesyprofesoresintegrartecnologíasmóvilesenel

aulayofrecenuevasformasdeenseñanzaydeaprendizajequemejorenloslogrosylassalidaslaborales.el

CRGtambiénfueunodelosinstitutosqueacogióaestudiantesdelaBarcelona International Youth Science

Challenge (BIYSC),organizadoporlafundaciónCatalunya-LaPedrera.elBIYSCesunprogramadeexcelen-

ciainternacionaldedossemanasquetieneporobjetivoestimulareltalentocientíficoentrejóvenesdetodoel

mundoymotivarlosparaquesiganconlainvestigacióncientíficayescojanunacarreraenciencias.

encuantoalastareasdeformación,eldepartamentoacogiócincoinvestigadoresenprácticasenel

marco del programa interno de aprendizaje basado en la práctica “Learning by Doing”,quedesarrolló

pequeñosproyectosrelacionadosconelcompromisopúblico, laeducacióncientíficay lasrelaciones

con los medios de comunicación. Durante el año, hemos contribuido asimismo a dos nuevas iniciativas

institucionales importantes: ORION y SOMMa. ORIONesunproyectoH2020coordinadoporelCRGque

seinicióen2017.eltemaprincipaldelproyectoeslacienciaabierta,yexploralasformasenquelasor-


ganizacionesdeinvestigaciónyfinanciacióndelascienciasdelavidaylabiomedicinapuedenfacilitarel

mododefinanciar,organizaryhacerinvestigación.elequipodeComunicacionesyRelacionesPúblicas

contribuye a llevar a cabo varias tareas de ORiON, en particular el diálogo público y los experimentos

científicosconlaciudadanía.enrelaciónconSOMMa,eslaalianzadelosCentrosSeveroochoayMaría

deMaeztuparapromoverlaexcelenciaespañolaeninvestigaciónypotenciarsuimpactosocialenel

ámbitonacionaleinternacional.LaparticipacióndeComunicacionesyRelacionesPúblicasenSoMMa

secentraenlapromoción,lavisibilidadyladivulgacióndeestaalianza.

Durantetodoelaño, loscientíficosdelCRGse involucraronprofundamenteen lasactividadesde los

medios de comunicación, en relación con los nuevos avances publicados en revistas de alto nivel, así

comoenactividadesinstitucionalesydedivulgaciónquepermitieronpublicarnuevosartículosenme-

diosescritosyenlínea,ytambiénparticiparonenprogramasderadioodetelevisión.elvaloreconómico

deestasaparicionesenlosmediosfuedemásde13millonesdeeuros.

2017fueigualmenteunañomuydensoencuantoalaorganizacióndeseminarios,sesionesysimposios

científicosinternacionales,incluidoslossiguientes:Barcelona NGS’17: Structural Variation & Popula-

tion Genomics,coorganizadaporlaInternationalSocietyforComputationalBiology(ISCB);Enhancing

the Usage of Human Genomics data for the benefit of all. Genotype Tissue Expression, GTEx Project

Meeting; Young Scientist Networking 2017,organizadojuntoconeMBoeIndiaBioScience;el“V Core

Management Workshop: Training the Trainers”;el“16th CRG Symposium: Seventh International Wor-

kshop on Genomic Epidemiology”;el“15th RECOMB Comparative Genomics Satellite Workshop” y el

“CRG Annual Proteomics Symposium 2017: Unveiling the complexity of the cell proteome”.

financiación externasegún los resultados del año anterior, los grupos de investigación del instituto consiguieron el nivel ade-

cuadodefinanciaciónnecesariaparareforzarsuposiciónnacionaleinternacional.

Unavezmás,en2017,lafinanciaciónconseguidoanivelnacionalaumentóconsiderablemente(>10millones

deeuros).elMinisteriodeeconomía,IndustriayCompetitividadespañolgalardonóelliderazgocientíficodelins-

tituto con la nueva distinción de cuatro años como Centro de excelencia severo Ochoa. además, cuatro grupos

entraronaformarpartededosplataformastecnológicasnacionalesmuyimportantesrelacionadasconlabioin-

formática(Guigó,Gabaldón,Gut)ylaproteómica(Sabidó),apoyadasporelInstitutodeSaludCarlosIII-ISCIII.

enelmarcodelnuevoPlanregionalestratégicodeinvestigacióneinnovaciónensalud(PeRIS2016a

2020),seiniciarondosproyectosdecolaboraciónqueinvolucrabanalosgruposdelCnAG-CRGsobre

lamedicinapersonalizada,basadosenelanálisisgenómicoparalatomadedecisionesclínicasenel

ámbitodelaoncología(Gut)ydelasenfermedadesneurológicasrarasnodiagnosticadas(Beltrán).

Lamedicinapersonalizadaes tambiénelobjetivode lasnuevasayudasdecolaboraciónconcedidas

porelH2020,centradasenlaintegracióndedatosmasivosheterogéneos(IASIS/tartaglia,eGA)yen

enfermedadesraras(SoLVe-RD/Beltrán),asícomoenunprogramapilotosobrelamejoradelareprodu-

cibilidad,lareutilizaciónylainteroperatividaddedatos(nubeeuropeadelaCienciaAbierta-eoSCpara

el proyecto piloto sobre investigación).

Aescalaeuropea,entrelosmásdestacadoscabeincluirunaayudaStartingGrantdeleRC(Boke)yuna

ProofofConcepttambiéndeleRC(Valcárcel);elobjetivodeestaúltimaconsisteenprobarelpotencial

terapéuticodelosnuevosreactivosparaeltratamientodelcáncerdepulmón.Además,cincoinvestiga-

doresposdoctoralesobtuvieronunabecaMarieS.Curie(fernández,Audergon,Stik,Rogalska,Schmie-

del),querepresentóuníndicedeéxitodemásdel50%paraelinstituto.

en2017,variosgruposdeinvestigaciónpudieronampliarsusfuentesdeapoyoexternoanivelinterna-

cionalyconsiguieronfinanciaciónprivada.entreotros,contamoscondosnuevasdistincionesenelám-

bitodelainvestigacióndelosInstitutosnacionalesdeSalud-nIH(Guigó)ydelDepartamentodeDefen-

sa-DoD(Serrano/Gill)respectivamente,eneeUU;unaayudaalainvestigaciónconcedidaporfUnDeLA,

dirigidaalaidentificacióndenuevostratamientosparalaesclerosislateralamiotrófica-eLA(DiCroce).


InnovaciónytransferenciadetecnologíaLaoficinadetecnologíayDesarrollodenegocio(tBDo)delCRGtienelamisióndepropiciarlaexplo-

tación de la investigación de la institución para el bien público y ayudar al crecimiento económico del

sectordelascienciasdelavidaennuestraregión.nuestroobjetivoesquelosresultadoscientíficos

generadosenelCRGseconviertanennuevosproductosterapéuticos,diagnósticosydeotrotipoque

contribuyan al bienestar de nuestra sociedad.

Independientementedelafasededesarrollo,ytantosillevamosacabocienciabásicacomociencia

aplicadaenelCRG,desdetBDocreemosfirmementequelosproductosyserviciosmásbeneficiosos

sonelresultadodeavancescientíficosrompedores.esperamosqueestosresultadosgenerenunim-

pactomuchomayorennuestrasociedadsirecibenelapoyoadecuadoysecanalizanatravésdela

estrategiaadecuadadecomercialización.

Porlotanto,durante2017,tBDoreforzósuactividadmedianteencuentrosperiódicosconinvestiga-

dores, con más de 450 reuniones, además de asesorar a los innovadores del CRG en el proceso de

transferenciadetecnologíaconvarioscursosdeformación,comola4aediciónde laBio-Business

School o la 2a edición del curso “From Science to Business”,organizadoporelinstitutoBIStencola-

boraciónconeSADeBusinessSchool,yatravésdediferentesmesasredondasyseminariosconla

industria.

Conelcompromisodepromoverelespírituemprendedor,elequipodetBDodioapoyoactivoalgalar-

donado de la 2a edición de la iniciativa S2B Concept Challenge.Comoresultadodeltrabajoenequipo,

MicroomicsSLseconstituyóconéxitoenseptiembrede2017yactualmentedesarrollayproporciona

soluciones de metagenómica de alta calidad en empresas e institutos de investigación.

asimismo, en 2017 TBDO gestionó siete proyectos bajo su programa Commercialization Gap Fund.

Cabedestacarqueenunodeestosproyectos,eldeJordiHernández,investigadorenellaboratoriode

JuanValcárcelyjovenemprendedorqueparticipaenelprogramadelCRGEntrepreneur-in-Residen-

ce,liderasuproyectoinnovadortambiéngraciasalapoyodelprogramaCaixaImpulse.

tambiéncabemencionarlacantidadderegistrosdeinventosrecibidosyevaluados(30),lasnuevas

patentesprioritariaspresentadas(2,queelevana9elnúmerodefamiliasdepatentesactivasdurante

el2017)yelnúmerodeacuerdosnegociadoconéxitoconlasempresas,queaumentaronenun89%

respecto al año anterior. en cuanto al impacto económico del CRG, TBDO negoció y obtuvo unos

279.000euros(un39%másrespectoalañoanterior).

Duranteelaño2017,elequipodetBDoconsolidósucompromisoenvarioseventosnacionalese

internacionalesrelacionadosconlabiotecnologíaylafarmacia,comolaBio International Convention,

Bio Europe, la 2nd Annual Translational Microbiome Conference, etc., y participó en 153 encuentros

con empresas e inversores para debatir sobre la cartera de tecnologías del CRG y las posibles colabo-

racionesfuturas.

Además,PabloCironifueinvitadoaimpartirconferenciasenlaIeSeBusinessSchoolyaparticiparen

diferentesmesasredondasparadebatirsobrelasestrategiasparacomercializarlasinnovacionesen

unafaseinicial.

en general, 2017 ha sido un año muy positivo, y prevemos un espíritu emprendedor positivo en los

próximos años en el CRG.


Dimensión nacional e internacionalESPaña

SOMMa

Lanuevaalianzade loscentrosSeveroochoay lasunidadesMaríadeMaeztu(SoMMa;www.somma.

es)sepresentóoficialmenteenoctubrede2017.SoMMareúne25centrosy16unidadesacreditadoscon

estospremiosalaexcelenciaypretende:incrementarlavisibilidaddelacienciaenespaña;promoverel

intercambiodeconocimientos,tecnologíaybuenasprácticasentresusmiembros,lacomunidadcientífica

internacionalylosprincipalesgruposdeinterés;colaborarconotroscentrosdeinvestigaciónenespaña

parafortalecerelsistemadeI+D+i,ytenervozenlapolíticacientíficaespañolayeuropea.Lainiciativaha

sidolideradaporeldirectordelCRG,queseconvirtióenelprimerpresidentedeSoMMa,ylapusoenmarcha

elequipoISA.Lasactividadesdeiniciodelaalianzacomprendíanelestablecimientodesupropiagobernan-

za,lapresentacióndelsitiowebylaorganizacióndegruposdetrabajoparaalcanzarlosdiversosobjetivos.

EUROPa

Liderando redes de formación y de investigación colaborativa

elCRGlideravariasredesdeformacióneinvestigacióncolaborativafinanciadasporlosprogramasmar-

codelaComisióneuropeagraciasasuexcelenteesfuerzodeinvestigaciónyalapoyoentregadodel

equipodeAsuntosCientíficoseInternacionales.esteliderazgocontinuadoconllevaunaaltavisibilidad,

unasólidareputaciónyunrendimientocientíficoeinnovadordestacable.

LosproyectosfP7/H2020coordinadosiniciadosoenmarchaen2017incluyen:

- MycoSynVac: Coordinado por luis serrano.

- OPATHY:CoordinadoportoniGabaldón.esunareddeformaciónenlaqueparticipan13investigado-

resjóvenesqueseránacogidosen11institucionesde7paíseseuropeos.

- LIBRA: Coordinado por isabelle vernos. es el proyecto clave para implementar acciones de igualdad

degéneroenlosinstitutosdeinvestigacióneU-LIfe.

- MiniCell: Coordinado por luis serrano.

- CellViewer: Coordinado por pia Cosma.

- DivIDE:Coordinadopor IsabelleVernos.Se tratadeotra redde formaciónen laqueparticipan11

investigadoresjóvenesqueseránacogidosen9institucionesde7paíseseuropeos.

- ORION:CoordinadoporMichelaBertero.Setratadeunanuevainiciativaparapromovercambiosen

las institucionesquefinanciany llevanacabo la investigaciónparahacerlasmásreceptivasa las

necesidadessocialesyparaqueadoptenlosprincipiosdelacienciaabierta.

MásinformaciónsobrelosproyectoscolaborativosencabezadosporelCRGenactivoen:

http://www.crg.eu/content/research/projects/ec-coordinated.

Además,elCRGsigueteniendounapresenciaimportanteenvariasredesrelevantesdeinfraestructuras

paneuropeas,comoeLIXIR(comopartedelnúcleoespañoldelainfraestructura),euroBiolmaging(diri-

giendounmódulodetrabajoenlasegundafasepreparatoriaycomomiembrodelconsejointerino)ylos

proyectosCorbel,eXCeLeRAteyMuGH2020.

Integración europea

EU-LIFE, European Life Sciences Institutes for Excellence, es una iniciativa clave presidida por el CRG

para promover la excelencia en la investigación, consolidar la integración entre los institutos europeos de

investigación en ciencias de la vida y desarrollar y compartir buenas prácticas en investigación, gestión

http://www.somma.es

http://www.somma.es

http://www.crg.eu/content/research/projects/ec-coordinated.


delainvestigaciónyformación.VariosmiembrosdelCRGparticipanactivamenteengruposdetrabajo

deeU-LIfe,yestaparticipaciónhadadolossiguientesfrutosrelevantes(entreotros):

• eU-LIfeactivaenlasdosplataformasdegruposdeinterésdelaCequeexisten(eRAyopenScience)

• 3informesdeposicionamientoeU-LIfe:(declaraciónfP9,informesH2020yfP9)

• CampañaeU-LIfeenocasióndel10ºaniversariodeleRC

• Contribución/feedbackpara8informesdelaCe

• 3consultasCe:evaluaciónintermediaH2020;PrevisiónparafP9(porinvitación);fetfLAGSHIP

• oRIon:PresentacióndelproyectodecienciaabiertaH2020

• ImplementacióndelLIBRACareerDevelopmentCompassdeorientaciónprofesionalparaposdocs

(2 talleres)

• ManualytallerdecontrataciónLIBRA,tallerdeconciliaciónlaboral

• Iniciativatedextechtransfer(6charlasaprofesionalesdeVCy4formaciones)

• 3eventosparacrearcapacidadinstitucional(talleresde“formarelformador”parasolicitudesMSCA;

hacervídeosenelámbitointernoparaladivulgacióncientífica;tallerdecomunicacióndecrisis)

• PresentacióndelprogramadevisitaseU-LIfe

• tallercientíficoeU-LIfe“Principiosdelahomeostasis”

• PósterdecursoseU-LIfeyunsimposioeU-LIfe(fIMM+CRG)

• Sitioweb y boletín: herramientasmejoradaspara investigadores (trabajos, financiación, noticias

científicas)

Los Servicios Científico-técnicos sonmiembros de Core facilities excellence Alliance “Core for Li-

fe”(www.coreforlife.eu),queincluyetambiéneleMBL(Heidelberg,Alemania),elVIB(Gent/Leuven,Bélgi-

ca),MPI-CBG(Dresden,Alemania),VBCf(Viena,Austria),yfGCZ(Zurich,Suiza).CoreforLifepretende

compartiryconsolidarprocedimientos,asícomouniresfuerzosenlaformacióndepersonalylavalida-

ción tecnológica, y compartir el acceso a instalaciones entre institutos..

EN TOdO El MUNdO

AtravésdesuequipodeAsuntosCientíficoseInternacionales,elCRGexploranuevasoportunidades

globalesparaatraeralosinvestigadoresconmástalento,establecercolaboracionescientíficasydar

másvisibilidadasubúsqueda.Lasaccionesinternacionalesmásrelevantesllevadasacaboen2017se

detallan a continuación:.

- Coordinación del proyecto de movilidad CRG-Novartis-África: acogimos tres nuevos estudiantes de

SudáfricaparaquedesarrollaransusproyectosenlasinstalacionesylaboratoriosdelCRG.Actual-

mentecolaboramosconnovartisparagarantizarlacontinuidaddelprogramademovilidad.

- Colaboración con la Fundación Mujeres por África:Acogimoslaprimeracientíficaséniorconelapoyo

delprograma“ellasinvestigan”.LizKizito,directoradelDepartamentodeAgriculturadelaUniversidad

CristianadeUganda,fueacogidaenlaUnidaddeBioinformáticaparaestudiarlavariabilidadgenética

de Solanum aethiopicumenÁfrica.JuntoconlafundaciónMujeresporÁfrica,tambiénorganizamosel

taller“RetosyoportunidadesparalainvestigaciónenÁfrica”,quefomentóundebateinteresanteentre

los ponentes y un gran número de asistentes.

MujeresenlaCienciaenelComitédeIgualdaddeGénero(eninglés,Gender Balance Committee, GBC), presidido por isabelle

Vernos,estánrepresentadastodaslascomunidadescientíficas,asícomoeldepartamentodeRecur-

sosHumanos(véansesuscomponentesenhttp://www.crg.eu/en/content/about-us-women-science/

gender-balance-committee). Losobjetivosdedichocomitésoneliminar el sesgodegénerode los

procesosdeseleccióndepersonal,atraerycaptaramujerescientíficas,mejorarlaconciliacióndela

vidalaboralyfamiliar,fomentareldesarrollodelacarreraprofesional,yestablecerydifundirprácti-

caslaboralessensiblesalascuestionesdegénero.estosobjetivossecorrespondenconelproyecto

http://www.coreforlife.eu

http://www.crg.eu/en/content/about-us-women-science/gender-balance-committee

http://www.crg.eu/en/content/about-us-women-science/gender-balance-committee


LIBRA(LeadingInnovativeMeasurestoReachGenderBalanceinResearch),financiadoporlaUey

coordinado por el CRG.

en2017,lasaccionesimplementadasporelCRGincluíanelPlandeIgualdaddeGénero(GeP),presen-

tado en agosto de 2016 en el marco del proyecto liBRa. las acciones del Gep se centran en cuatro

aspectosprincipales:elprocesodeseleccióndepersonal,eldesarrollode lacarreraprofesional, la

conciliacióndelavidalaboralyfamiliar,ylasdimensionesdesexo/géneroenlainvestigación.

Duranteel2017, losprincipalesobjetivosdelComitédeIgualdaddeGénerofueroneldesarrollode

lacarreraprofesionalyelprocesodeseleccióndepersonal.Acontinuación,sepresentanalgunos

aspectos destacables:

dESaRROllO dE la CaRRERa PROfESIONal

• Se seleccionaron dos investigadoras posdoctorales del CRG para participar en el programa de

orientación profesional LIBRA Career Development Compass, cuyo objetivo es apoyar a las in-

vestigadoras en su camino para convertirse en investigadoras independientes y hacer carrera en

el ámbito académico (http://www.eu-libra.eu/news/20-eu-life-post-docs-their-way-become-pi-first-

milestone-knowing-how-they-want-their-career-be). el programa tuvo una muy buena acogida y

actualmenteLIBRAestudialaposibilidaddemantenerloenfuturasedicionesypermitirlaparticipa-

ción de más investigadoras postdoctorales.

• Después del éxito del programa de becas para mujeres científicas (WOSS, Women Scientists

Support Grant), implementadoporelComitédeIgualdaddeGéneroen2016,sevolvieronaabrir

dosconvocatoriasen2017.elsistemadeayudasWoSSpretendeapoyaramujerescientíficasque

tienenambiciónypotencialparaocuparunaposicióndeliderazgoenelámbitodelainvestigación,

peroqueseenfrentanalosretosasociadosalamaternidad.en2017,cuatromujerescientíficas

obtuvieron apoyo de WOss.

• Comoenelañoanterior,elCRGcelebróelDía Internacional de la Mujerel8demarzo.Sedistri-

buyeronfolletosentreelpersonaldelPRBBdondesedestacabanlastrayectoriasprofesionalesde

cuatroexalumnasdelCRG.el8demarzoseorganizóasimismounactodemediajornadaenelque

seproyectóunapelícula,seguidadeundebate,yquecontóconlaasistenciadeungrannúmerode

personas.

• Paracelebrareldía de Ada Lovelace, a los estudiantes adolescentes del área de Barcelona se les

ofrecióunmódulodidácticodeundíasobreconocimientosdeprogramación,quesellevóacaboen

el CRG (se trató de una iniciativa conjunta del departamento de Comunicación y RRpp e investiga-

doras del instituto).

PROCESO dE SElECCIóN dE PERSONal

Se implementaronvariasaccionesymedidasparagarantizarqueen losprocesosdeselecciónde

personalnoseprodujeransesgosporcuestionesdegénero.estasson:

• Unnuevomodelodeofertadetrabajoqueincluyainformaciónsobrelaigualdaddegéneroylacon-

ciliacióndelavidalaboralyfamiliarenelCRG,yquereflejeunentornodetrabajodiverso.

• Actualmenteseproyectaunvídeosobreelsesgodegénero,porencargodelainstituciónCeRCA,a

todoslosmiembrosdelcomitédeseleccióndejefesdegrupoconelfindeaumentarlasensibilización

conrespectoalosprocedimientosincorrectos.(https://www.youtube.com/watch?v=g978t58geLo)

• tambiénsehadiseñadounfolletoenelqueseenumeranlasventajasqueofreceelCRGasusemplea-

dosconrespectoaunaconciliaciónpositivadelavidalaboralyfamiliar.estasventajassonelacceso

aserviciosdeguardería,abeneficiossociales,aoportunidadesdedoblecarrera,teletrabajo,etc.el

folletosecompartedigitalmenteconcadaunadelascandidatasqueseentrevistanconelCRG.

http://www.eu-libra.eu/news/20-eu-life-post-docs-their-way-become-pi-first-milestone-knowing-how-they-want-their-career-be

http://www.eu-libra.eu/news/20-eu-life-post-docs-their-way-become-pi-first-milestone-knowing-how-they-want-their-career-be

https://www.youtube.com/watch%3Fv%3Dg978T58gELo


DestacadosCientíficos


Hogar dulce hogarelegirellugarperfectoparaviviresimportante,especialmentesieres un retrovirus.

a diferenciadelosviruscomoeldelresfriadocomún,queinfectanlascélulasy,alhacerlo,lasdes-

truyencompletamente,elVIHyotrosretrovirusconviertensuinformacióngenéticaenADnyla

insertanenelgenomadesuhuésped,unacélulacélulainmunehumanaconocidacomo“célulat”.

AlgunascélulasinfectadasutilizanesteADnviralparahacermuchascopiasdelvirus,queluegoinfectana

nuevoshuéspedes.Perootrosentranenunestadodereposo:elADnviralaúnseescondedentrodelgenoma

delacélula,peronoproducevirusnuevos.esloqueseconocecomounainfecciónlatente.estosvirusocultos

latentessereactivaránmásadelanteycomenzaránunainfecciónactivaquepuedeconvertirseenunsidaple-

namente desarrollado.

Hasta10decadamillóndecélulasinmunesdeunpacienteconVIHpuedenalbergarunainfecciónlaten-

te.LostratamientosactualesdelVIHsolofuncionanconvirusactivos,porloquelosinvestigadoreshan

diseñadomedicamentosquepueden“desalojar”losvirusescondidosenelADnyhacerlosvulnerables

alaterapia.enteoría,elVIHpuedeestablecerseencualquierubicacióndelgenoma,ydeberíaserigual

defácileliminarlodecualquierlugar.Peroningunodeestostratamientospuedemovertodoslosvirus

latentes,porloquelainfecciónporVIHtodavíaesimposibledecurarporcompleto.

Ahora,GuillaumefilionysuequipohandesarrolladoenelCRGunaformadelocalizarlaubicaciónexac-

tadelVIHlatenteenelgenoma,yhanreveladopistasimportantessobreporquéenalgunoscasosle

cuestamásreactivarsequeenotros.

“Sabemosdesdelosaños30quealgunosgenessonmásactivosqueotros,segúnsuubicaciónenel

genoma”,explicafilion.“Porlotanto,tienesentidoqueestomismoocurraconelVIH:queleresultemás

fácilintegrarseoreactivarsedesdeciertasubicacionesquedesdeotras”.

Cuando se trata de decidir dónde vivir, la ubicación lo es todo. si uno se traslada a una ciudad viva y

trepidante,probablementeelijaunazonaconcafés,baresytiendas,enlugardeunazonamuertadonde

todoestásiemprecerrado.Segúnhanobservadofilionysuequipo,elVIHtendríalamismaintención

cuandosetrasladaacélulashumanas.


ROMPIENdO El CódIgO dE baRRaS

UnodelosproblemasprincipalesdelestudiodelainfecciónlatenteporVIHesqueunasolacélulapuedetener

variosvirusincrustadosenmuchoslugaresdelgenoma.estohacequeseadifícilidentificarlaubicaciónde

cada virus concreto y averiguar cuáles se reactivan y cuáles permanecen ocultos tras el tratamiento.

eltrucodelnuevométododefilionradicaenun“códigodebarras”genético:unasecuenciaúnicade

ADnquelosinvestigadoresincorporanenelcódigogenéticodelaspartículasdevirusindividuales.Una

vezlosvirussehaninsertadoenelgenomadelacélulahuésped(enestecaso,célulasinmuneshuma-

nascultivadasenellaboratorio),losinvestigadoresextraenelADncelularylosecuencianparalocalizar

dóndeseubicanlosviruslatentes.Ycomocadavirustienesupropiocódigodebarrasúnico,esfácil

verdóndesehaincrustadocadauno.elcódigodebarrastambiénsepuedeutilizarparaversiunvirus

concretosehaactivadoyseestá“leyendo”,deformasimilaralosgenesnormalesdelacélulahuésped.

“Hemospodidoutilizarnuestratécnica,quellamamosB-HIVe,parahacerunmapadeloslugaresadon-

delegustairalVIH”,dicefilion.“tienemuchosprejuiciosyprefierelaszonasactivasdelgenoma:quiere

ir donde está la acción”.

eincluso,entrelaszonasactivasdelgenoma,losinvestigadoreshanobservadoquealgunasáreascon-

cretasdelgenomaleresultanmuchomásatractivasqueotras.Porejemplo,algunas“direcciones”son

100vecesmáspropensasaserunvirusqueotras,aunquelarazónporlaquesontanpopularessigue

siendo un misterio.

Comoeradeesperar,laubicaciónexactadelVIHenelgenomaafectaalaprobabilidaddequeelvirusse

vuelvaaactivar.Losvirusquesehabíanestablecidocercadelos“conmutadoresdecontrol”encargados

deactivarlosgeneseranmuchomásactivosquelosdeotroslugares.Sinembargo,talcomoseñala

filion, todavía hay mucha variabilidad inexplicada.

“PensamosqueellugardeinserciónenelgenomaseríaelprincipaldeterminantedelaactividaddelVIH,

perohemosvistoqueelvirusentraenelmismolugarendiferentescélulasyluegosecomportadeforma

diferente.Asíquehayalgunaotracosaqueaúnnoentendemos”.

aVaNzaNdO

además de detectar patrones en los lugares donde al viH le gusta vivir dentro del genoma, filion y sus

colegastambiénobservarondiferenciasclaveen laformaenque losvirusdeubicacionesconcretas

respondíanadosmedicamentosdereactivación,elvorinostat(VoR)ylafitohemaglutinina(PHA),que

tienendiferentesmecanismosdeacción.Curiosamente,encontraronquelosvirusdeunconjuntode

“direcciones”genómicastendíanareaccionaralVoR,mientrasquelosquesehabíaninsertadoenotras

ubicacionessereactivabanpreferentementeconlaPHA.

estosugierequeuntratamientodirigidoatratarlasinfeccioneslatentesdeberíacombinarnecesariamenteun

cócteldevariosmedicamentosconaccionesdiferentesparaeliminartodoslosvirusinactivos.Conlamejora

delastécnicasgenéticas,esposiblequeenelfuturosepuedadesarrollarlamejorcombinacióndefármacos

dereactivaciónbasándoseenlosdiferentestiposdeubicacionesviralesdentrodelascélulasinmunesdel

paciente,paragarantizarquetodoslosviruslatentesseandesalojadosdetodosloslugaresdelgenoma.

Parafilionysuequipo,elsiguientepasoesversipuedenaplicarsutécnicadelcódigodebarrasparaetiquetar

elADndelVIHlatenteenlascélulasinmunesdeanimales-o,incluso,tomadasdirectamentedepacientes

infectados-,envezdecélulascultivadasenellaboratorio.Cabelaesperanzadequelanuevatecnologíade

edicióndegenes,conocidacomoCRISPR,lohagaposible,aunquetodavíahaymuchotrabajoporhacer.

“elfinaldeljuegoenestecasonoesquehayaunfármacoquepuedacurarelVIH,yquizásnuncaserá

posiblereactivaryeliminartodoslosvirusdelcuerpo”,dicefilion.“Y,loqueesmásimportante,nuestro

trabajonosayudaacomprenderlacomplejarelaciónentreelvirusyelgenomahuésped.Cadaunode

ellosesunaagujamuypequeñaenunpajarmuygrande,peroahorapodemossaberexactamentedónde

se esconden”.

OBRA DE REFERENCIA:

ChenHC,MartinezJP,Zoritae,

MeyerhansA,filionGJ.

“Position effects influence HIV latency

reversal.”

natStructMolBiol,24(1):47-54.doi:

10.1038/nsmb.3328.epub2016nov21.


Nadar en un mar de virusUnanuevatécnicadecribadodeviruspequeñosdelaguademarpuedeayudarenlabúsquedadepatógenoshumanos.

Desde la ventana de su laboratorio en el CRG, Oscar fornas puede ver el mar. lejos, sobre las olas,

los marineros tiran su captura sobre las cubiertas de sus barcos, ya llenas de peces demasiado

grandesparacolarsepor losagujerosde lasredes.Cuantomáspequeñosson losagujeros,

máspequeñossonlosbichosquequedanatrapados.Pero¿cuánpequeñadebeserunaredparaatrapar

cosastanpequeñascomounvirusmicroscópico?

Paraentenderelmundoquenosrodea,losbiólogosquierenaveriguarcómointeractúanlosanimales,

lasplantasylosmicrobios(incluidoslasbacteriasyvirus)paracrearunecosistema.Ylosocéanosson

losecosistemasmásfascinanteseimportantesdelplaneta,conmásvalorparaelclimadelatierraque

las selvas.

“Lamayorpartedeladiversidadbiológicadelplanetaviveenelmar”,dicefornas,jefedelaUnidaddeCito-

metríadeflujoquecompartenelCRGylaUniversidadPompeufabra.“Losorganismosmarinoscomoel

planctonylasbacteriasfijanaproximadamentelamitaddeldióxidodecarbonoenlaatmósferaygeneran

grandescantidadesdeoxígeno.Peromuchosviruslosinfectanypodríandestruirlospotencialmente”.

Dehecho,elocéanoestállenodevirus(tansolounmililitrodeaguamarinapuedecontenerunosdiez

millonesdevirus),perosecalculaquesoloconocemoslaidentidaddeununoporcientodeellos.

CazaR El VIRUS

AmedidaquelasecuenciacióndelADnsehavueltomásrápidaymásbarata,losinvestigadorescap-

turancadavezmásdatosgenéticosparacomprendermejorladiversidaddeespeciesquehabitanen

unecosistema.Pero,mientrasqueobtenerADndeunanimaloplantaconcretoesrelativamentefácil,

cuestamuchomáscaptarbacteriasmicroscópicasindividualesovirusinclusomáspequeños.

Latécnicamáspopularparaanalizargenomasmicrobianossalvajesrecibeelnombrede“meta-genómi-

ca”.Implicaobtenerunamuestradelentorno,comounapaladadetierraounvasodeagua,ypurificar

ysecuenciarunamezcladeADndetodos losmicrobiosquevivenenella.Seutilizanunastécnicas


computacionales muy ingeniosas para separar los genomas de especies individuales, pero los genomas

víricossonmuypequeñosytiendenaperderseentreelrestodedatosdeorganismosmásgrandes.

encolaboraciónconcolegasdeBarcelona,AlicanteyestadosUnidos,fornasqueríaencontrarlama-

neradesepararvirusindividualesdeestamezclademicrobiosparapoderlossecuenciarporseparado.

esteenfoquehatenidoéxitoconcélulasindividualesdetejidosanimalesotumoresyconbacteriasde

muchosentornosdiferentes.Peronuncasehabíahechoconalgotanpequeñocomounvirus,unasmil

vecesmáspequeñoqueunacélulahumanaestándar.

REdUCIéNdOlO

Paracribarlosvirusdelaguasalada,fornasusóunatécnicadelaboratoriomuypopularconocidacomo

separacióndecélulasactivadaporfluorescencia(SCAf),queseutilizaamenudoparasepararcélulas

individualesdeunapoblaciónmezclada.Semarcanlascélulasconuncolorantefluorescenteyseintro-

ducenenunamáquinadondecorrientesdeunlíquidodiseñadocuidadosamentelasenvíanunaaunaa

travésdeunrayoláserparaanalizarlas.entoncesseseparandeformaautomáticaenplacasmicrotitu-

ladoras para el ensayo.

AjustarlamáquinadeSCAfparatratarconalgotanpequeñocomounvirusfuetodounreto.Aunque

fornasysuequipoconsiguieronmarcar losvirususandouncolorantequemanchaelADnvírico, la

fluorescenciaesmuyleveporqueelgenomaesmuypequeño.tambiénhaymuchasotraspartículas

pequeñasenelaguamarina,comoporejemplopartículasdebasuraenbolsasmicroscópicasextruidas

decélulasmásgrandesquepuedencrearconfusiónparalamáquinaseparadora.Ytodoelprocesodebe

quedarlibredecontaminantesquepuedandañarelADnyhacerloimposibledesecuenciar.

encontrar los parámetros correctos supuso muchos meses de hacer pruebas y solucionar problemas.

Ytambiénhuboelpesadoprocesodetodoundíadelimpiezaquehabíaquehacerantesdecadaexperi-

mento,paragarantizarladesaparicióndetodorestodeADnpotencialmentecontaminante.Afortunada-

mente,fornasysuequipoteníanaccesoaunafuentedevirusoceánicosmuycercana,yaqueutilizaban

muestrasdelMediterráneo,queteníanalaspuertasdellaboratorio,paraoptimizarlatécnica.

“el agua de mar es como una sopa”, dice fornas. “Trabajábamos muy cerca de los límites de nuestra

tecnología.Peroajustamoslosláseres,hicimosralentizarelflujodelamáquinayseguimoshaciendo

pruebashastaqueconseguimossepararvirusindividualesconéxito”.

dEl MaR a la SalIVa

Ademásdesusmuestraslocales,fornastambiénaislóvirusdeaguamarinaobtenidosdelasuperficie

ydehasta4kmdeprofundidaddelMediterráneoydelAtlántico.entotal,elequipocribómásde2.000

partículasdelamedidadeunvirus,delasqueobtuvoaproximadamente392secuenciasdegenoma

vírico.44deellasseremitieronparaunasecuenciaciónmásdetallada,ytodasresultaronservirusque

hasta entonces eran totalmente desconocidos para la ciencia.

Además,losvirusqueaparecenmásvecesenelprocesodeobtenciónesmásprobablequeseancomu-

nes,loquenosproporcionaunalecturaaproximadadelaabundanciarelativadediferentesespeciesen

esapartedelocéano.Aunqueencontrartantosvirusnuevosesimpresionante,fornasveesteproyecto

como una prueba de concepto.

“esteproyectodemuestraquepodemosjuntarlaSCAfylagenómicaparavirus”,explica.“Ahoratene-

mosunaherramientaqueutilizamospara identificarnuevosvirusenotrosecosistemas, talescomo

piscinas,lagos,aguapotableoinclusofluidoscorporales;yahemosdemostradoquepodemosutilizar

nuestrométodoparaencontrarvirusenlasaliva.nosabemosquévirushayfueraquepuedanserperju-

diciales para los seres humanos, pero ahora tenemos una herramienta para encontrarlos”.

OBRA DE REFERENCIA:

franciscoMartinez-Hernandez,oscar

fornas,MonicaLluesmaGomez,Benja-

minBolduc,MariaJosedelaCruzPeña,

JoaquínMartínezMartínez,JosefaAn-

ton,JosepM.Gasol,RiccardoRosselli,

franciscoRodriguez-Valera,Matthew

B.Sullivan,SilviaG.Acinas&Manuel

Martinez-Garcia

“Single-virus genomics reveals hidden

cosmopolitan and abundant viruses”

Nature Communications, 8:15892

(2017),doi:10.1038/ncomms15892


UltracongelaciónUnnuevométododecongelación,quesepuedeusarencualquierlugardelmundoyqueconservalascélulassimplesparaelanálisiscientífico.

a quíseplanteaunreto:tomadunpuñadodegominolasdediferentessabores,ponéoslasen

labocaymasticad.Intentadindividualizarcadasabor.Quizáspodréisdistinguirlacereza

oellimónácido,peroprobablementeoscostaráidentificarcadaunodelosotrossabores.

Peroponéoslasenlabocadeunaenunayserásencillodistinguircadasabor.

esteescenarioesmuyparecidoal problemaconqueseencuentran loscientíficosque investigan

loscambiosenlaactividadgenéticaqueseproduceenlascélulassimplesduranteeldesarrollode

enfermedadescomoelAlzheimeroelcáncer.Antes,loscientíficosteníanquetrabajarconmuestras

detejidoqueconteníanmuchosmilesomillonesdecélulasyfijarseenelresultadogeneral:igualque

ponerseenlabocatodounpuñadodegominolasdediferentessabores.

Graciasa lasmejorasen la tecnología,ahora los investigadorespuedenfijarseen lospatronesde

actividadgenéticaenlascélulasindividualesextraídasdetejidosanooanormalyobtenerunalectura

fiabledesu“sabor”individualizado.Peronoesfácilobtenereltipodemuestrascorrectasparaelaná-

lisisdelascélulassimples.

“tenemosqueempezarconcélulasvivasextraídasdematerialfresco”,explicaHolgerHeyn,jefedel

equipodeGenómicaMonocelulardelCnAG-CRG.“AquíenBarcelonaestamosjustoalladodelhos-

pitalytenemostodoelequipamientonecesarioparaseparar lascélulas.Perohaymuchoscentros

médicosodeinvestigaciónquenotienenestaposibilidad”.

enlugardeello,lasmuestrasdetejidodelospacientesnormalmenteseconservanenformaldehídoy

seenvíanaanalizaraotrolugar.Peroesteconservantehacequelascélulassepeguenynosepuedan

separar.Alternativamente,lasmuestrastambiénsepuedencongelarconhielosecoonitrógenolíqui-

do,aunqueesolasdañahastaelpuntodequesedesintegrancuandosedescongelan.Ysincélulas

simples,losinvestigadoresnopuedenanalizarlas.

Porello,Heyndecidiódesarrollarunmétodoalternativoquesepudierautilizarparaconservarlascélu-

lasrecogidasencualquierpartedelmundoyquepermitierasepararlasmásadelante.


MUESTRa y ENfRIaMIENTO

Paradesarrollarelnuevométodo,Heynysuequiposeinspiraronenlacriopreservación.estatécnica

normalmenteseutilizaparaconservarcélulasbiológicasytejidoscomoóvulosoembrionesencen-

trosdefIV,perotambiénalgunosatrevidosdecidencriopreservarsucuerpoosucerebrodespuésde

lamuerte(aunquelatasadeéxitoenladescongelacióndeembrionesfIVesbuena,¡nohayejemplos

dehumanoscriopreservadosquehayanvueltoalavida!).

Durantelacriopreservación,lamuestradetejidosemezclaconunasoluciónespecialquecontieneun

conservantequímicosuavellamadoDMSo,juntoconunsueroricoenproteínasderivadodelasangre,

yseenfríalentamentehasta-80°Cenuncongeladordelaboratorioo-200°Cennitrógenolíquido.Los

primerospasosdelacongelaciónsepuedenllevaracaboenunrefrigeradorportátil,yasísepueden

recogermuestrasenlugaresremotosfueradeunhospital.

Unavezcongeladascorrectamente,lasmuestrascriopreservadassepuedenguardardurantealme-

nosseismeses,paraluegopoderlasdescongelar,trocearydescomponerconenzimasparaobtener

lascélulassimplesquehayqueanalizar.Despuésdeevaluarlatécnicaconcélulasobtenidasenel

laboratorio,muestrasdesangre,deintestinoydecáncer,losinvestigadoresconcluyeronque,aunque

algunascélulasquedandañadasysepierden,hayunaproporciónsignificativaquequedaintacta.

trasperfeccionarlatécnica,ahoraHeynysuequipopuedenrecuperaralrededordel90%delascélu-

lassanguíneascriopreservadas,aunqueestacifraesmásbajaparatejidossólidoscomolostumo-

res.Cabedestacarquehandemostradoqueelprocesodecongelaciónnoafectaalospatronesde

actividadgénicaencélulascriopreservadasencomparacióncon los tejidos frescos, loqueabre la

posibilidaddeanálisisdecélulassimplesaequiposdeinvestigaciónquenotienenunaccesodirecto

a instalaciones tan complejas.

“nuestrométodoesmuyeconómicoyfácil.nonecesitasnadaespecial”,explicaHeyn.“noesperába-

mosquefuncionaratanbien.nohayningunaseñalde“choque”debidoalacongelaciónyestamos

bastantesegurosdequeobtenemosunamuestrarepresentativadeltejidotalcomoeraenvida”.

Como la técnicadecriopreservaciónes tansencilla,ahoramuchoshospitalesoptanpor recoger

lasmuestrasdeestamaneraconlaesperanzadepodercolaborarconHeynoalgúnotrolaborato-

riodegenómicamonocelularenelfuturo.Porejemplo,losmédicospuedenrecogercélulasdeun

tumorenelpuntodediagnóstico,ytomarmásmuestrasamedidaquelaenfermedadrespondeal

tratamientoosedesarrollaunaresistenciayelpacienterecae,utilizandoanálisisdecélulassimples

para identificar todos loscambiosdetalladosen losgruposdecélulasgenéticamentediferentes,

queconformanuntumor.

Además,losinvestigadoresquetrabajanenpaísesenvíasdedesarrollotienenahoralaposibilidadde

recogermuestrasparaproyectosdeinvestigaciónqueimpliquenelanálisisdecélulassimples,loque

era imposible en el pasado.

“todaslasmuestrassoncomplejasyestánformadaspordiferentestiposdecélulas”,diceHeyn.“Pero

esteanálisisdetalladoconrespectoalascélulassimplesnospermitegenerarnuevosconocimientos

sobre loquerealmenteseestáproduciendoen los tejidos internos,cómoestán formadosycómo

funcionan.nuestrométododecriopreservaciónabrirátodounmundodemuestrasdecélulassimples.

Realmente cambiará las reglas del juego”.

OBRA DE REFERENCIA:

AmyGuillaumet-Adkins†,Gustavo

Rodríguez-esteban†,elisabettaMereu†,

MariaMendez-Lago,DiegoA.Jaitin,

alberto villanueva, august vidal, alex

Martinez-Marti,enriquetafelip,Ana

vivancos, Hadas Keren-shaul, simon

Heath,MartaGut,IdoAmit,IvoGutand

Holger Heyn

“Single-cell transcriptome conservation in

cryopreserved cells and tissues”

GenomeBiology,18:45,(2017),https://

doi.org/10.1186/s13059-017-1171-9


pásaloUnequipodeinvestigadoreshadescubiertounaherenciaepigenéticapococomúnquesepuedetransmitirmásde14generaciones.

Muchasfamiliastienenherencias,objetosespecialesquepasandegeneraciónengeneración,

recuerdosvaliososquelesllegandetiempospasados.Paralosdiminutosgusanosnema-

todos,estetesorotomalaformademarcasquímicasenelgenoma,quetransmiteninfor-

mación sobre cómo era la vida en el pasado. sorprendentemente, estos recuerdos celulares se pueden

transmitirhasta14generacionescomomínimo,aunquecomolosgusanosnacen,sereproducenymue-

ren en un espacio de pocos días, esto solo represente algunos meses..

eldescubrimiento,publicadoporeljefedegrupodelCRGBenLehnerencolaboraciónconinvestigadoresdel

InstitutodeInvestigacióncontralaLeucemiaJosepCarreras(IJC)ydelInstitutodeInvestigaciónenCiencias

delaSaludGermanstriasiPujol(IGtP),enuniniciofuecasual.AdamKlosin,estudiantededoctorado,estaba

estudiandounosgusanosC.elegansalosquesehabíaintroducidounchipgenético-unalargacadenadeco-

piasrepetidasdeungenquecodificaunaproteínafluorescenteroja-cuandosediocuentadeunhechoextraño.

Silosgusanossemanteníana20°C,elchiptransgénicoeramenosactivoycreabasolounapequeña

cantidaddeproteínafluorescente;perosilosanimalescambiabanaunclimamáscálidode25°C,la

actividaddelchiptransgénicoaumentabasignificativamenteyhacíaquelosanimalesbrillaranconun

rojointensobajolaluzultravioleta.

y SE PROdUJO UN hEChO INClUSO MáS ExTRañO

Cuando losgusanosvolvíana temperaturasmásbajas,sus transgenesseguíanmuyactivos, loque

sugeríaquedealgunaformatodavíareteníanla“memoria”desupasadomáscálido.Misteriosamente,

lafluorescenciabrillantesetransmitióasussucesivosdescendientesdurantesietegeneracionesque

vivieronatemperaturasmásbajas,apesardequelosanimalesdeorigensolohabíansidoexpuestosa

temperaturas más altas durante un periodo corto de tiempo. sorprendentemente, mantener a los gusa-

nosa25ºCdurantecincogeneracionesconllevóqueelaumentodelaactividadtransgénicasemantu-

vieradurantealmenos14generacionesunavezlosanimalesvolvieronaunavidamásfría.

“esgenial”,diceenLehner.“Setratadeunsistemaartificial,peroelefectoesmuymarcado.teníamosquedescu-

brirquéloprovocaba,asíqueAdamabandonósuproyectodedoctoradoanteriorycomenzóatrabajarenesto.”


haCIENdO UNa MaRCa

Paradescubrirquéprovocabaestepatróndeherenciaextraño,Lehnerysuequipohicieronunanálisis

másdetalladodelchiptransgénico,concentradoenproteínasenformadebola(histonas)quecontienen

ADndentrodelacélula.

Lashistonassepuedenmodificarcon“marcadores”químicos(marcasepigenéticas)devariasformas.

Algunasmarcasepigenéticasseasocianalaactivacióndelosgenes,mientrasqueotrasseasocian

asusilenciamiento.enconcreto,Lehnersecentróenlamodificacióndeunahistonaconocidacomo

trimetilaciónH3K9,queayudaadetenerlaactividadgenética.

Comoeradeesperar,losinvestigadoresdescubrieronquelostransgenesenanimalesquesiempreha-

bíanestadoa20ºCteníanaltosnivelesdetrimetilaciónH3K9.enconsecuencia,sustransgeneseran

menosactivosynoemitíanmuchafluorescencia.Losgusanosqueentoncessepusierona25ºCperdie-

ronlosmarcadores,activaronsuchiptransgénicoycomenzaronabrillar.

Sorprendentemente,esosanimalesconfluorescenciabrillantequehabíancrecidoenelclimamáscálido

mantenían la metilación de la histona reducida cuando se les devolvía a una temperatura más baja, lo

quesugierequeestemecanismotieneunpapelimportanteenelbloqueodelamemoriasobrelatempe-

ratura ambiental en el genoma.

enunanálisisaúnmásdetallado,LehnerysuequipodescubrieronqueunaproteínallamadaSet-25es

laresponsabledemantenerlospatronesdemetilacióndelahistonaenelchiptransgénico.Peroaúnno

sabenexactamentecómoelaumentodetemperaturaconducealapérdidademarcasdemetilaciónen

histonas. Y tampoco saben si los patrones de metilación de la histona son los responsables de transmitir

lamemoriadetemperaturadeunageneraciónaotra,aunqueyasedistinganenloshuevosyelesperma,

yesténpresentesenlosprimerosestadiosdeldesarrollodelosgusanos.

dE gENERaCIóN EN gENERaCIóN

elchiptransgénicofluorescenteseintrodujoenlosgusanosmediantetécnicasdeingenieríagenética,

asíquepodríadarseelcasodequeactuarademaneraextraña.PeroLehnerysuequipotambiéndes-

cubrieronque repetidos fragmentosdelgenomanormalde losgusanosqueseparecíana loschips

transgénicossecomportabantambiéndeunaformasimilar,loquesugeríaqueestefenómenoesgene-

ralizadoynoestárestringidosoloagenesdiseñadosartificialmente.

“estefenómenonoesdeltodosorprendente”,afirmaLehner.“Hayotroselementosrepetitivosenlalínea

germinaldelosgusanosquecambiansuactividadenfuncióndelatemperatura,yparecequeseman-

tieneunremanentedeherenciaalgunasgeneracionesdespués.Perohastaahoranohemosencontrado

ningúngen‘regular’quesecomporteasí”.

Aunqueestefenómenodeherenciaepigenéticasehaobservadoenvariosanimales,incluidosmamífe-

ros,todavíanohaypruebasdelosefectosquepuedeteneralargoplazo.Inclusolosmejoresejemplos,

comoelimpactodelhambreduranteelembarazo,sedisipanalcabodeunpardegeneraciones.eso

hacequelosgusanosdeLehnerseanlamuestramásduraderade“memoria”ambientaltransgeneracio-

nalquesehaobservadoenanimaleshastaeldíadehoy.Pero,peseaserunresultadointrigante,todavía

nosesabeexactamentequéutilidadpuedetenerparalosgusanos.

“nosabemosmuybienporquéseproduceestefenómeno,peropodríaserunaformadeplanificación

anticipadabiológica”,explica.“Losgusanosvivenpocosdías,asíquetalveztransmitenrecuerdosdelas

condicionesvividasparaayudarasusdescendientesapredecirquéambienteencontraránenelfuturo”.

Paraungusano,diezgeneracionesrepresentanmenosdeunpardemeses.Podemospredecirconbas-

tanteexactitud la temperaturaquehabrá lossiguientesquincedías, así quepara losgusanos tiene

sentidointentarcodificarlainformaciónparaayudarasustrastatara-trastataranietos(o,másexacta-

mente,trastatara-trastataragusanos)aprepararseparaelambienteenquedeberáncrecer.Peroescasi

imposiblepredecircómoseráelclimadespuésdemuchasgeneracionesdevidahumana,asíqueeste

tipo de mecanismo probablemente no es útil para especies de vida más larga.

“Porahora,todoestosonespeculaciones”,afirmaLehner.“Perolabiologíaestanextrañaque,siseproduce

algoasí,esprobablequetambiénsehayaproducidoparaotroobjetivoenalgúnotrolugardelanaturaleza”.

OBRA DE REFERENCIA:

adam Klosin, eduard Casas, Cristina

Hidalgo-Carcedo, Tanya vavouri, Ben

lehner

“Transgenerational transmission of

environmental information in C. elegans”

science, 356(6335):320-323 (2017), doi:

10.1126/science.aah6412


Clasificareselcumpleañosdetuamigoyquieresenviarleunregalo.Loenvuelves con cuidado, escribes el nombre en el exterior, pegas un sello y lo mandas por correo. entonces, como por arte de magia, un pardedíasdespuésllegaasucasa.

l amagiatiene lugarcuandolostrabajadoresdeldepartamentodeclasificaciónde laoficinade

correosreconocenelselloyladirección,yluegoenvíanelpaqueteconlasfurgonetasdereparto

alaubicacióncorrecta.Casipasaexactamentelomismodentrodenuestrascélulas,aunaescala

muchomásreducida,yaqueellastambiénempaquetanyenvíanalorganismopaquetesdeproteínas,

comolasenzimasolashormonas.

esta vía de secreción, tal como se denomina, se ha estudiado minuciosamente durante años. ahora

sabemosquelasproteínassecretadasseprocesanenunaespeciede“fábrica”celular,llamada“retículo

endoplasmático”(Re),queluegoseenvíanaunaestructuradenominada“aparatodeGolgi”,dondese

modificanyseempaquetan.Lasproteínasseenvíanallugaradecuadograciasalos“sellos”yalas“di-

recciones”moleculares:pequeñasregionesdelaproteínasecretadaquelamarcanparasuexportación.

“LamayoríadelasproteínassesecretanatravésdelretículoendoplasmáticoydelaparatodeGolgi;esunavía

queconocemosmuybien”,explicaVivekMalhotra,jefedegrupoenelCRG,“perosesecretanotrasproteínas

quenohacenesterecorridoynosabemosqué‘sellos’niqué‘oficinasdeclasificación’losenvíanasusitio”.

UN RECORRIdO NO CONVENCIONal

estahistoriacomenzóen2007,cuandoMalhotraysuequiposedieroncuentadequelascélulasdeleva-

dura y las de hongos mucilaginosos secretan una proteína llamada acb1 bajo la inanición de nutrientes.

PeroresultacuriosoquelaAcb1nopresentaningunadelasseñalescaracterísticasquelaenviaríana

travésdelavíadesecreciónhabitual.

enlugardeesto,unasproteínastransportadorasespecialesseunenylatransportanauna“oficinadeclasifica-

ción” temporal. este es el compartimento para la secreción no convencional de proteínas (CUps, por sus siglas

eninglésdeCompartmentforUnconventionalProteinSecretion),queestáformadoporcomponentesdelRe,

delaparatodeGolgiydepequeñospaquetesllamados“endosomas”,ysoloapareceencondicionesdeestrés.


Malhotraysuequipoteníancuriosidadporsabersihabíaotrasproteínasqueemprendieranestavía

pocoortodoxaparasalirdelacélula,ydecidieronexaminarconmayordetallelasuperóxidodismutasa

1 (SoD1),unaproteínaquenormalmentenosprotegeneutralizandosustanciasquímicas tóxicasdel

organismo.ComolaAcb1,laSoD1notieneel“sello”habitualdeexportaciónquelaconduceatravésdel

ReydelaparatodeGolgi,aunquetambiénlasecretanlascélulas.

LaSoD1estáinvolucradaenlaesclerosislateralamiotrófica(eLA,tambiénconocidacomoenfermedad

deLouGehrigoenfermedaddelasneuronasmotoras),queesunaafecciónneurodegenerativa.esuna

enfermedadqueavanzarápidamenteynotienecura,matalascélulasnerviosasqueseencargandel

movimiento(neuronasmotoras)y,finalmente,provocalaparálisisylamuerte.Cercadeunaquintaparte

delaspersonasquepadeceneLApresentaundefectogenéticoenelgenquecodificalaproteínaSoD1.

LosinvestigadorespiensanquelascélulasadyacentessecretanlaSoD1defectuosayquelasneuronas

motoraslaasimilan,loquedestruyelasvaliosascélulasnerviosasenlugardeprotegerlas.

DebidoalaimportanciadelaSoD1enlaeLA,Malhotraysuequipoquisierondescubrirsitambiénutiliza

lavíadelCUPSparasalirdelascélulas,ydescubrirlaidentidaddel“sello”biológicoqueselaenvía.

INaNICIóN y ClaSIfICaCIóN

Deformasimplificada,loscientíficosempezaronsuinvestigaciónconcélulasdelevadura,quepresentan

víasdesecreciónmuysimilaresalasdelascélulashumanas,perosonmásfácilesdecultivaryanalizar

enellaboratorio.Sedieroncuentadequecuandocultivabanlevaduraconabundanciadenutrientes,las

célulassecretabanalgodeSoD1.Perocuando lascélulastenían inanicióndenutrientes,exportaban

nueve veces más sOD1.

Después,Malhotraysuequipoutilizaron la ingenieríagenéticaparamodificaralgunoscomponentes

molecularesbásicos(aminoácidos)delaSoD1,centrándoseenunazonadelaproteínaqueesigual

tantoenlalevaduracomoenelserhumano.Descubrieronquesolounasecuenciadedosaminoácidos

erasuficienteparaactuarcomo“sello”paraenviarlaproteínaporlavíadelCUPS.Y,principalmente,que

losmismosdosaminoácidosseencuentrantambiénenlaAcb1,laotraproteínasecretadadeformano

convencional,loqueindicaquepodríaserunaseñaluniversaldelCUPS.

finalmente,afindeobservarsiestamismavíafuncionabaduranteeldesarrollodelaeLA,losinvestiga-

doresanalizaronversionessanasyversionesconeLAdelaSoD1encélulashumanasydescubrieron

quetambiénseexportamediantelavíadelCUPScuandolascélulasestánbajolainanicióndenutrientes.

teniendoencuentatodoello,Malhotraconsideraqueesteproyectopruebaquelascélulasensituación

deinaniciónsecretantantolasversionessanascomolasdefectuosasdeSoD1atravésdelavíadel

CUPSyqueelpequeño“sello”dedosaminoácidosessuficienteparaenviárselas.Perotodavíaquedaun

misterio por resolver.

“Muchasproteínaspresentanelmismopatróndedosaminoácidos;dehecho, esmuycomún”,dice

Malhotra. “todavíatenemosquedescubrircómosedetectanconcretamente laSoD1y lasproteínas

equivalentesycómoseenvíanalCUPS,mientrasquenoocurrelomismoconotrasproteínas”.

Malhotrapiensaque,generalmente,encondicionesnormales,el “sello”dedospiezasseescondeen

las proteínas como la sOD1 y la acb1. pero cuando hay algún cambio -por ejemplo, cuando la proteína

esdefectuosaolacélulapresentainanición,loqueafectaalaformadelasproteínas-,entoncesqueda

expuesta. a continuación, aparecen las chaperonas moleculares para evitar más desarrollo, y en lugar de

esoenvíanlaproteínaalCUPSparaquesalgadelacélula.

la identidad de estas chaperonas y la manera exacta de trasladar proteínas a los CUps actualmente

sedesconocen,peroMalhotraysuequiposeestánocupandodelasunto.enconcreto,lesinteresaen-

contrarloqueprovocalasecreciónperjudicialdeSoD1enlospacientesquepadeceneLAy,sobretodo,

descubrir si pueden pararlo.

Diceque“eldescubrimientodeeste‘sello’noconvencionalqueconducelasecrecióndeSoD1esmuyemo-

cionante”.“Actualmente,noexistentratamientoseficacesparalaeLA,asíqueesperoquenuestrosdescu-

brimientospuedanproporcionarlabaseparaeldesarrollo,enelfuturo,detratamientosmuynecesarios”.

OBRA DE REFERENCIA:

Cruz-GarciaD,Brouwersn,DuranJM,

MoraG,CurwinAJ,MalhotraV.

“A diacidic motif determines unconvention-

al secretion of wild-type and ALS-linked

mutant SOD1.”

JCellBiol,pii:jcb.201704056.doi:

10.1083/jcb.201704056.[epubaheadof

print] (2017).


De acuerdo, ordenadorUnnuevo“ordenadorvirtual”hacequeelanálisisdedatos biológicosseamásfiable.

imaginaqueestásanteunacajaenormequecontienecientosdecalculadorasdiferentes.tomala

primera,teclea“2+2=”yobténlarespuestacorrecta.4.Hazlomismoconotracalculadorayobtén

lamismarespuesta,yasísucesivamente.Sigueprobándolastodasycadavezobtieneselmismo

resultado.Pero,derepente,obtienesunarespuestaquenoesperabas:5.Conuncálculotansencillo

esfácilverquealgonohasalidobien.Sihemosintroducidobienlosdatos,estosignificaqueelproce-

sadorquehaydentrodelamáquinahacometidounerror.

Ahoraimaginaqueestáshaciendoelmismocálculocondiferentesgruposenormesdedatosgenó-

micos,analizandomillonesdebitsde informaciónenunordenador.obtienesunarespuestadeun

superordenadorLinuxenelsótanodeuninstitutodeinvestigación,perounpocodiferentedelaque

haobtenidounservidorbasadoenlanubeyobtienesunatercerasoluciónconunMac.entonces,¿por

quésondiferentesycómosabescuáleslacorrecta?

a daTOS MaSIVOS, PROblEMaS MaSIVOS

Loscientíficosquetrabajanconestetipodedatosmasivosyquebuscanpistasparaprevenirotratar

enfermedadeshumanasoaclararprocesosbiológicosfundamentalesnecesitanrespuestasquesean

fiablesyquesepuedanreproducir.estoesespecialmenteimportanteenlanuevaeradelamedicina

deprecisión,enlaquelosmédicostomandecisionessobreeltratamientoquedeberíarecibirunpa-

cienteenfuncióndelainformacióngenética.

“Labiologíaescadavezmáscomputacional”,diceCedricnotredame,jefedegrupoenelCRG.“Hace

veinteañoseramuycarohacerlasecuenciacióndelADn,asíquehabíamuypocainformación.Mi-

rabaslasecuenciaenuntrozodepapelyloanalizabasamano.Ahoraesmuchomáseconómicoy

rápido.Haymuchosmásdatosyporellotenemosqueutilizarordenadoresparaanalizarlos”.

Perohaydiferentesprogramasqueseejecutanendiferentesordenadoresconsistemasoperativos

diferentes,ynosiempredanlasmismasrespuestasapartirdelosmismosdatos.Ycomohaytantas


operaciones y puntos de datos involucrados en estos cálculos a gran escala, es imposible averiguar

quéhasalidomalycómosolucionarlo.Además,dicenotredame,muchagentenisiquierasehadado

cuentadequelallamada“inestabilidadcomputacional”esunproblemaensímisma.

“fuecomounaepifaníacuandonosdimoscuentadequehabíatantainestabilidadcomputacional.

Antes,estonosesabía”,dicenotredame.“esunproblemaporquenosestamosdirigiendohaciauna

épocaenlaquelosmedicamentosylosdiagnósticossebasanendatosgenéticos:elordenadornos

daráunnúmeroynosdiránuestroriesgoconrespectoaunaenfermedadoquémedicamentotomar.

Perotodosebasaenclasificacionesyprobabilidades,porloqueinclusounapequeñavariaciónenel

resultado de los datos podría tener un impacto tremendo en los pacientes”.

algunas empresas de tecnología han intentado resolver este problema de reproducibilidad mediante

lacreacióndecostososcanalesdedatoshechosamedida,quebloqueanalosusuariosenesapla-

taformadesoftwareenconcreto.Peronotredameysuequipooptaronporunenfoquemássencillo.

“Construimosunaplataformadeanálisisconunatécnicallamada‘virtualización’,quecreadeforma

efectivaunordenadorvirtualsimuladoeidénticodentrodecualquiermáquina”,explica.“esexacta-

mentelamismaideaquelosantiguossimuladoresdejuegosdelossalonesrecreativosdelosaños

80quepodemosejecutarenunPC,peroaunaescalamuchomayor”.

este“ordenadordentrodeunordenador”implicaquelosinvestigadorespuedanejecutarcualquiersof-

twaredentrodelentornovirtualyobtenerelmismoresultado,yaquesusdatossiempreseprocesan

delamismaforma,independientementedelamáquinafísicaqueutilicen.

“Somosungrupode investigaciónpequeño,por loquenecesitábamosunasoluciónsencillaque

todospudieranutilizar fácilmente.Ynopodíamos rediseñar todas lasherramientas informáticas

quetenemos.Queríamosseguirutilizandolosprogramasalosqueestamosacostumbrados”,dice

notredame. “nuestra solución es sencilla y rentable porque lo hicimos para solucionar nuestras

propias necesidades”.

NExTflOw al RESCaTE

traslapublicaciónquedescribelanuevaplataformavirtual,conocidacomonextflow,notredamey

suequipodecidieronponerlaalibredisposiciónparaotraspersonas.Milesdeinvestigadoresdescar-

ganelsistemacadamesymuchasorganizacionesdeinvestigaciónlahanadoptado,incluidoselInsti-

tutoPasteurdefrancia,elSangerInstituteenelReinoUnido,laInfraestructuranacionaldeGenómica

de suecia, el Genome institute de singapur y los institutos Nacionales de salud de estados Unidos.

tambiénhasurgidounagrancomunidadenlíneainternacionalparaagruparideasycompartirherra-

mientas,conelapoyodetalleresdecapacitaciónyhackatonescelebradosenelCRG,paraampliarlos

límitesdeloquepuedehacernextflow.

“Meencantaestatecnologíaporqueesútil,perolomásimportanteesquesolucioneproblemas”,dice

notredame,quereflejaeléxitodenextflow.“Lainestabilidadcomputacionalesunproblemagenerali-

zado,peronoteníasoluciónynosepuedecorregir.esmuyemocionantesaberquehemossoluciona-

dounproblemaquelagentetodavíanosabíaniqueexistía,peroquepodríallegaraserenormeahora

queentramosenlaerade‘bigdata’”.

OBRA DE REFERENCIA:

DitommasoP,ChatzouM,flodeneW,

Barja pp, palumbo e, Notredame C.

“Nextflow enables reproducible computa-

tional workflows.”

Nat Biotechnol, 35(4):316-319 (2017).

doi:10.1038/nbt.3820.noabstract

available.


DesempaquetandoelgenomaCadaunadelascélulashumanascontienemásdedosmetrosdeADnenrolladoydensamenteempaquetado;porello,activarlosgenes correctos en el momento correcto es un gran reto.

p rácticamentetodaslascélulasdelcuerpocompartenlasmismasinstruccionesgenéticas,con

alrededorde20.000genescodificadosenlargosfilamentosdeADnllamadoscromosomas.

Peronotodaslascélulassoniguales.Losdistintostiposdecélulasutilizanconjuntosespe-

cíficosdegenesparapoderllevaracabofuncionesconcretasenelcuerpo.Porejemplo,unacélula

hepáticadebeactivargenesquecodifiquenenzimasdigestivasydesactivarlasinstruccionesparala

fabricacióndeneurotransmisores,mientrasqueunacéluladelcerebrotienequehacerlocontrario.

Y,esmás,elADndecadacélulahumanamidemásdedosmetrosdelargo.estáplegado,enrolladoy

metidodentrodelnúcleo,unaestructuramáspequeñaquelacabezadeunalfiler,juntoconunagran

cantidaddeproteínas.Dealgunaforma,enmediodetodoesterevoltijomolecular,lacélulatieneque

encontrar los genes correctos y activarlos en el momento adecuado.

estaorganizacióndelADnenelnúcleosepareceaunovillodelanaenredado.Algunaspartesestán

muycompactadas,mientrasqueenotraselenredoesmáslaxo.encontrarungenespecíficoyacti-

varloescomobuscaruntrozocortoyespecíficodelanaenmediodelcomplicadolío,liberándolode

cualquiercompactaciónyaflojandoelhiloparapoderutilizarlo.

Yasehavistoquelosgenesactivostiendenaestarempaquetadosdeunaformamáslaxaencompartimen-

tos“abiertos”delnúcleoencomparaciónconlosgenesinactivos,perosesabepocosobrecómoseorganizan

estosgenesenesasregionesdiferentesosobrecómocambiasuubicacióncuandoseactivanodesactivan.

entendercómofuncionatodoelloanivelmolecularesunodelosretosmásimportantesdelabiología

yesloquequiereresolverthomasGraf,jefedegruposéniorenelCRG.

haCIa la CUaRTa dIMENSIóN

todocomenzóen2014,cuandoGrafysuscolegasdelCRG,MiguelBeato,GuillaumefilionyMarcA.

Marti-Renom,emprendieronunprocesodecolaboraciónconocidocomo4DGenome(proyectoSyner-


gydeleRC),queinvestigadequéformalaorganizacióndelADncambiaamedidaquelosgenesse

activan y se desactivan.

elequiponosolohaesquematizadolaorganizacióndelADnenelnúcleodelascélulas“enreposo”,

sinoquelosinvestigadorestambiénhandesarrolladonuevastécnicasinnovadorasparahacerelcon-

troldeloscambiosqueseproducenenlaestructuratridimensionaldeloscromosomasdelnúcleoa

lolargodeltiempo(lacuartadimensión)mientraslascélulascambiandeuntipoaotro,seatemporal-

menteodeformapermanente.

estetipodetransiciónseobservaeneldesarrollo,mientraslascélulasmadreembrionariasseespe-

cializangradualmenteentejidosespecíficosenelembriónoelfetoendesarrollo.PeroestavezGraf

estabaespecialmenteinteresadoenverquéocurrecuandolascélulasespecializadas“revierten”en

célulasmadreenunprocesoconocidocomo“reprogramación”.

“Yahabíaquienhabíacomparadolaorganizaciónnucleardelascélulasespecializadasylascélulasmadre,

peronosabíandequéformaseproducíanesoscambioseneltiempo”,diceGraf.“nosotrosqueríamos

observaresoscambiosenelmomentoenelqueteníanlugar,ynospreguntábamossilaorganizacióndel

genomacambiaantesodespuésdequelosgenessehayanactivadodurantelareprogramación”.

Pararetrocedereneltiempo,losinvestigadoresdelCRGrecurrieronaunavariacióndeunatécnica

desarrolladaporelcientíficojaponésypremionobelShinyaYamanaka,quiendescubrióqueuncóctel

formadoporcuatroproteínas(oCt4,SoX2,KLf4yMYC)podíarevertirlascélulasespecializadasen

célulasmadre.estasmoléculasextraordinariasson factoresde transcripciónqueseunenasitios

específicosdelADncercadeliniciodegenesespecíficosdecélulasmadreylosactivan,loquerepro-

gramalacélulaylareviertealestadodecélulamadre.

Desafortunadamente,paramuchostiposdecélulaselmétodonoesmuyeficiente.Porejemplo,solo

unapequeñafraccióndeloslinfocitosBsepuedenreprogramarconestosfactoresllamadosYama-

naka.Sinembargo,Grafysuequipodescubrieronquelaadicióndeotraproteínaantesdelosfactores

Yamanaka,conocidacomoC/eBPalpha,hacíaquealmenosun95%deloslinfocitosBvolvierana

convertirseencélulasmadreenelcursodeochodías.

Cogiendomuestrasdeesascélulascadadosdías,losinvestigadorespodíanrecurriralastécnicas4D

parahacerelseguimientodelaorganizacióncambiantedelADnenlosnúcleosdelascélulasmien-

traspasabandelinfocitosBacélulasmadre.

ExPlICaCIóN dE lOS daTOS

Paradescubrirdequéformavuelvenaorganizarselosgenesdentrodelnúcleodelascélulasdurante

lareprogramación,GrafysuequipousaronunmétodollamadoHi-C.estorevelasihayregionesespe-

cíficasdelADnquesetoquenentresíyreflejasielempaquetamientoeslaxoocompacto.

elequipotambiénrecogiódatossobreelestadodealgunosgenes,siestabanactivadosodesacti-

vados,ycategorizólasmarcasmoleculares(conocidascomomodificacionesepigenéticas)quehay

asociadasalosgenesactivosoinactivos.Lamayorpartedeltrabajoprácticofuellevadoacabopor

RalphStadhouders,investigadorposdoctoral,juntoconelbiólogocomputacionalenriqueVidal.

Laclavedeléxitodelproyectofueelnuevosoftware,conocidocomotADbit,creadoporMarti-Renom

ysuequipo.Paraelnúcleo,esalgoparecidoaunGoogleearthqueagrupatodoslosdatosparaesta-

blecerunmapadetalladodecómoseorganizaelADnencualquierpartedelgenoma.

“Lageneracióndedatosesenciertomodotrivial;suanálisiseslapartedifícilyrequieremuchotiempo

ypotenciainformática”,diceMartí-Renom.“estosexperimentosgeneranmillonesdedatosyrequieren

cientosdemilesdehorasdetiempodecomputación,porloqueelnuevosoftwareeraabsolutamente

claveparaautomatizarelanálisisyhacerloaccesible.”

Comoseríadeesperar,losinvestigadoresdescubrieronquelamayorpartedelosgenesquesehabían

activadoamedidaque los linfocitosBseconvertíanencélulasmadrepasaríanacompartimentos


másactivosdelnúcleo.Sorprendentemente,descubrieronqueestoocurrevariosdíasantesdeque

realmente se activen los genes.

“Laideapredominanteeraquelosgenesseactivancuandoseunenafactoresdetranscripción,como

losfactoresdeYamanaka,yluegopasanaunaregiónactivadelnúcleo”,explicaGraf.“Perodescubri-

mosquemuchosgenessedesplazabanprimeroyseactivabandespués,mástarde.esonoeraloque

seesperaba,perofueundescubrimientointeresante”.

VUElTa al INICIO

Grafcreequeestosdescubrimientosrevelanlaexistenciadeunpapelmásimportantedeloquese

creíapreviamentedelaorganizacióncambiantequetienelugarenelnúcleo,asícomounaposiblenue-

vafuncióndelosfactoresdetranscripción.nosoloseunenalADnyenciendenlosgenes,explica,sino

quecreetambiénquetienenunafunciónindependienteypreviaeneldesempaquetadodelgenomay

eldesplazamientodelosgenesalasregionesactivasdelnúcleo.

“encuanto losfactoresdetranscripcióndesenredanelADnyexponen losgenes,entoncesresulta

fácilencenderlos”,diceGraf. “Ahora,sinembargo, lasgrandespreguntasson:¿cómolohacen,con

quiéntrabajanycuáleselmotorqueimpulsalareorganización?”

Grafyloscompañerosdelequipo4DGenomequierensaberahoracuálessonlasmoléculasquetra-

bajanjuntoconlosfactoresdetranscripciónparadescifrarelADnyreconfigurarlo.Ytambiénquieren

probar y manipular estas interacciones, sea alterando el aDN o bien cambiando las proteínas, para

analizarlasrelacionesexactasentreloscambios4Dquevenenelnúcleoylospatronesresultantes

delaactividadgenética.

“Aprendemoslosprincipiosquerigenlasdecisionesdelascélulassobresudestinoyloquevemosen

nuestrosistemadereprogramaciónesunmodelodelosprocesosquetienenlugarenunembrión”,

diceGraf.“notengoesperaparasaberquépasadurantelosprimerosdíasdevida,cuandonacenlas

primerascélulasmadrepluripotentes”.

OBRA DE REFERENCIA:

RalphStadhouders,enriqueVidal,

françoisSerra,BrunoDiStefano,

françoisLeDily,JavierQuilez,Antonio

Gomez,SamuelCollombet,ClaraBeren-

guer,YasminaCuartero,JochenHecht,

GuillaumeJ.filion,MiguelBeato,Marc

A.Marti-Renom&thomasGraf

“Transcription factors orchestrate dynamic

interplay between genome topology and

gene regulation during cell reprogramming”

Nature Genetics, 50:238–249 (2018),

doi:10.1038/s41588-017-0030-7


bIOINfORMáTICa y gENóMICaLoshitoscientíficosdelprogramadurante2017incluyeneldesarrollodelametodologíaCaptureLong

Seq(CLS)paracaracterizardeformaexhaustivaladiversidaddetranscripcionesdelARnlargonocodi-

ficante;eldesarrollodenextflow,unlenguajededominioespecíficoquepermiteflujosdetrabajocientí-

ficosreproduciblesyescalablesusandocontenedoresdesoftware;eldescubrimientodeunciclosexual

yunaasociaciónrecienteconelhuéspedhumanoenelpatógenofúngicoemergenteCandida glabrata

y el algoritmo Global score para predecir las interacciones de proteínas con grandes transcripciones.

varios grupos del programa participan en diversos proyectos genómicos de gran escala, tales como

enCoDe,Gtex,PanCancer, I5K,f1K,WebofLifee IASIS(primeraayudaenCataluñapara lamedicina

personalizada).

el programa ha seguido usando el european Genome-phenome archive (eGa) y prestándole apoyo en

colaboraciónconeleuropeanBioinformaticsInstitute(eBI).eleGAhasidoseleccionadocomoeLIXIR

CoreDataResourceycomoeLIXIRRecommendedDepositionDatabase.Asimismo, tambiénhasido

seleccionadocomounodelosproyectosdeimpulsodelaGlobalAllianceforGenomicsandHealth(GA-

4GH).LaeGAestambiénunodelosorganismospilotodedemostracióndelaeuropeanopenScience

Cloud (eOsC).

InvestigacionyServiciosCientíficoselamplioabanicodetemáticas,enfoquesytecnologíasenelCRGpermiteabordarunamplioespectrodeaspectosfundamentalesen ciencias de la vida y biomedicina. la investigación en el CRG se organizaencuatroáreasprincipales:regulacióngénica,célulasmadreycáncer;biologíacelularydeldesarrollo;bioinformáticaygenómica;y biología de sistemas. Desde el 1 de julio de 2015, el Centro Nacional deAnálisisGenómico(CnAG-CRG)formapartedeestaestructuradeinvestigación.

Roderic GuigóCoordinador


VivekMalhotraCoordinador

JuanValcárcelCoordinador

bIOlOgía CElUlaR y dEl dESaRROllO en2017,ellaboratoriodeMalhotradescubrióelmotivodiacídiconecesarioparalasecrecióndesuperóxidodismu-tasa(SoD)1,quesesegregasinlavíaendoplasmáticaconvencionalretículo-Golgideexportacióndeproteínas.Lamodulación de esta secuencia podría ayudar a comprender la neurotoxicidad asociada a la sOD1 mutante en la esclerosislateralamiotrófica.estelaboratoriotambiéndescubrióqueunaproteínallamadatAnGo1,requeridaparala exportación de colágenos voluminosos, encaja en un anillo en los lugares de salida del Re, compartimentando asíelReenregionesespecíficasparaeldesarrolloylaexportacióndecolágenosvoluminososdelrestodelRe.otrodescubrimientodeinterésconsiderableeslademostracióndelafuncióndelaesfingomielinaalahoradeorganizarlaformaylafuncióndelasmembranasdeGolgi.ellaboratoriodeIsabelleVernossiguióinspeccionandoelmecanis-modeladinámicadelhusomitóticoydescubrióunnuevosociomitóticodeunmotorespecíficodelakinesinaysufunciónenlaalineacióndemicrotúbulosycromosomas.SebastianMaurerlogróreconstituirlamigracióndeARnenlos microtúbulos in vitro. este descubrimiento tan crucial es el primero de este tipo y supone un avance esencial para entenderelmecanismodeltransportedecargadependientedekinesinaenlosmicrotúbulos.ManuelMendozades-cubrióunnuevomecanismodeprogresióndelciclocelularatravésdeladivisiónasimétrica.ellaboratoriodeJeromesolon proporcionó una primera descripción de las modulaciones evolutivas en el proceso de sellado epitelial entre diferentesespeciesdemoscas.Suequipoencontróunatransiciónevolutivaquecondujoaunasimplificacióndelprocesodeselladoenelcierredorsaleidentificóunafunciónesencialconservadadelcitoesqueletodemicrotúbulosenelselladoepitelial.estosresultadosevidencianelinterésgeneraldeestedepartamentocuandosetratadeabor-darlosmecanismossubyacentesalacompartimentacióncelular,ladivisióncelularylaorganizacióndelostejidos.

elaño2017fuetestigodelasalidadeunjefedelgrupojúnior,ManuelMendoza,quesetrasladócomojefedegrupoalInstitutodeGenéticayBiologíaMolecularyCelular-IGBMC(estrasburgo,francia).DurantesutiempoenelCRG,ellaboratoriodeManuelMendozarevelóunfascinantemecanismodemodulacióndeloscomplejosdelosporosnuclearesduranteladivisióncelularylafuncióndeesteprocesoenelcontroldelaprogresióndelciclocelulardiferencialencélulasmadreehija.Sushallazgostambiénrevelaronunaconexióndesafiantedeexocitosisyabscisión,yelmecanismoporelquelascélulascontrolanlaabscisiónparaasegurarlasegregacióncromosómi-canormal.estamosorgullososdeloslogrosdeManuelyledeseamosunéxitocontinuadoensunuevotrabajoenfrancia.echaremosdemenosdeverdadsucompañerismo,sugenerosidadysusdebatesacadémicos.

finalmente,damoslabienvenidaadosnuevasjefasdelgrupo.elvanBokeseunióaldepartamentocomojefade grupo junior. está liderando el laboratorio de Biología de los Ovocitos y latencia Celular. Durante su posdoc enHarvard,elvandescubrióquelosovocitosagrupabanysegregabanmRnA,mitocondrias,Re,Golgi,endo-somas y los lisosomas, por una gran proteína desordenada, denominada xvelo. la creación mediada por la xvelo de este megasubcompartimento llamado “cuerpo de Balbiani” es un avance importante y puede ser una gran promesa para comprender los principios básicos del desarrollo de los ovocitos y el proceso general de fertilización.LosdescubrimientosyobjetivosprincipalesdeBokeestánreconocidosporlaconcesióndeunaayudaStartingGrantdeleRC.VerenaRuprechtfuecontratadatrassubrillanteinvestigaciónenIStdeAustria.Como posdoc en el isT, verena descubrió cómo la actividad contráctil cortical lleva a una rápida motilidad celu-lar ameboide. este proceso de migración ameboide se ve en numerosas metástasis del desarrollo y de cáncer, pero el mecanismo no está claro. los descubrimientos de verena abrieron un capítulo nuevo en la migración celularyhanpermitidoquepuedahacerseunanálisismoleculardeesteprocesodeimportanciafundamental.LaexperienciadeVerenaenfísicaeimagineríaaportanuevosenfoquesparaabordarlamigracióncelularyesperamosquetambiénparamuchosnuevosdescubrimientos.

REgUlaCIóN géNICa, CélUlaS MadRE y CáNCER entre los hitos más destacados de la investigación en este programa durante 2017, se han producido im-portantes avances en el rol de la disposición tridimensional de la cromatina en la regulación de la expresión genética.Losmiembrosdelproyecto4DGenomeSynergydeleRCinformarondelosrolesfundamentalesdelcontextogenómicolocalenlalatenciadelvirusVIH,delaexpresióndelosgenesencélulasdeDrosophilaydequéinfluenciatienelatopologíagenómicaenlaactividaddelosfactoresdetranscripcióndurantelarepro-gramación celular y viceversa. el trabajo adicional de otros grupos del programa ha desvelado redes transcrip-cionalesconpapelesclaveenlaregulacióndelaidentidaddecélulasmadreembrionarias,reprogramacióncelularyregeneraciónorgánicaporfusióncelular.estosprocesostambiénseestáncaracterizandoconelusodemicroscopíadesuperresolución,conelapoyodelasayudasfet.tambiénseavanzóenlacomprensióndelosmecanismosmolecularesdefármacosantitumoralesdirigidosalmecanismodeempalmeyenlosesfuer-zosparadesarrollarnuevosmoduladoresendichosprocesos,conelapoyodelasayudasdeCaixaImpulseyeRC-PoC.Porúltimo,elgrupodeBernhardPayerhainiciadounacolaboraciónconlaclínicadefertilidadeugin,junto con el CNaG-CRG, para explorar la base molecular del envejecimiento de ovocitos humanos.


bIOlOgía dE SISTEMaS en2017sefuerondosdenuestrosjefesdegrupo.MatthieuLouis,jefedegrupojúnior,setrasladóa

laUniversidaddeCalifornia,enSantaBárbara,yJamesSharpe,jefedegruposénior,seconvirtióenel

primerdirectordeleMBLBarcelona.DuranteeltiempoquepasaronenelCRG,ellaboratoriodeMatthieu

Louis llevóacabounauténtico tour de force en el desarrollo de tecnología para implantar las larvas

de Drosophilacomosistemaprincipalenelqueestudiarcualitativamente lapercepciónsensorialyel

comportamientoanimal.el laboratoriodescubriónuevoscomportamientos,desarrollómétodospara

estudiarlos,elucidóeldiagramadeinstalacióneléctricadelsistemaolfativodelaslarvas,estudiósuevo-

lucióny,medianteelusodeunrastreadoroptogenéticodebuclecerrado,desarrollóyprobóunmodelo

multinivelparasabercómointegraelanimallasseñalesolfativasdinámicas.

ellaboratoriodeJamesSharpehaformadopartedelprogramadesdeelcomienzo,en2006,yJames,

quefuesucoordinadordesde2011hasta2017,contribuyóenormementealprogresodelprogramayal

estilodelacienciaquedesempeñamos.ellogromásimportantedellaboratoriomientrasestabaenel

CRGfuelademostracióndequeelmecanismoqueespecificalosdedosdelosmamíferosesunsistema

de Turing molecular. Tras este gran logro hay un desarrollo tecnológico enorme, y el laboratorio continuó

desarrollandomicroscopiosyestrategiasdemodeladodurantetodoeltiempoqueformópartedelCRG.

tambiénpublicaronuncorpusdetrabajofascinantequeexplorabaelespaciodediseñoderedesgené-

ticasdinámicasy,encolaboraciónconMarkIsalan,exmiembrodelprograma,crearonvariosdeestos

modelosderedesenbacterias.esciertoquetenemoscincodedos,pero¡resultaquehayseismecanis-

mosparaquetresgenesinterpretenungradientemorfogenéticoparacrearunafranja!noshacemucha

ilusiónqueSharpedirijaeleMBLBarcelona.elinstitutosecentraráenlabiologíadelostejidosydelos

órganos,eincorporará6o7laboratoriosdebiologíadesistemasenelPRBB,quedaránlugaralacrea-

ción de una incomparable concentración de laboratorios de biología cuantitativa e integrativa en europa.

estamos muy orgullosos de los logros de los laboratorios de louis y sharpe: la suya es exactamente la cla-

sedecienciacuantitativaoriginal,ambiciosa,difícilyalargoplazoquepretendemosdesarrollarennuestro

programa.Lesdeseamossuerteensusnuevosdestinosyesperamosquesuslaboratorioshagangrandes

cosasdurantemuchosaños.echaremosdemenossuvisióncientífica,suamistadysuapoyo.

2017 ha sido un año muy productivo para el programa. el laboratorio de Ben lehner publicó el descu-

brimientodeunamemoriaepigenéticadelmedioambienteduraderaytransgeneracionalasociadaala

cromatina en C. elegans,asícomoeldescubrimientodequelaedadmaternaesunfactormuyimpor-

tantedevariaciónfenotípicaenestasespecies.estosdosestudiosprolonganelinterésquesiempreha

tenidoellaboratorioparaentenderlascausasdelavariaciónfenotípicaentreindividuosgenéticamente

idénticos.ellaboratoriotambiénmostróquelasfirmasmutacionalesenclústerenmásde1.000tumo-

reshumanossepuedenutilizarparaidentificarlosmecanismosmolecularesquecausanmutaciones,

entrelosqueestáeldescubrimientodeunnuevoprocesomutacionalquedirigelasmutacionespara

activar genes en tumores asociados con la exposición a carcinógenos, entre ellos el consumo de alcohol.

el laboratorio de luis serrano siguió desarrollando el Mycoplasma pneumonia como“chasisterapéutico”.

tambiénpublicaronlaestructuradelcromosomaMycoplasmaaunaresoluciónde10kByusaronmuta-

génesisaleatoriasysecuenciaciónprofundaparadeterminarsecuenciasclavederegionespromotoras

ynotranscritasqueinfluyenenlaeficaciadetranscripciónytraducciónenestabacteria.ellaboratorio

deMaraDierssenprosiguiólostrabajosparacomprenderloscambiosenlaarquitecturaneuronalyen

laconectividadqueinterrumpenlafuncióncorticalehipocámpicaenlostrastornosgenéticos.también

señalaronquelainfusióndeneurotrofina-3rescataeldéficitdeextincióndelmiedoenunmodelodera-

tóndemiedopatológico.ellaboratoriodeManuelIrimiahapublicadolabasededatosmásexhaustiva

deactosdeempalmealternativosaparecidahastaahora.elmismolaboratorioaclaró,también,elpapel

ylaevolucióndelosprogramasdeempalmedependientesdeesrpenlamorfogénesis.Además,carac-

terizandomolecularmenteeldesarrollodeltuboneuraldelosanfioxos,presentaronunnuevomodelo

importanteparalaorganizaciónylaevolucióndelcerebrodelosvertebrados.

Comoreconocimientodesuslogros,ManuelIrimiafueelegidojoveninvestigadordeeMBo,BenLehner

fueelegidomiembrodeeMBoyMaraDierssen recibió lamedallaBigVangyelpremiotrifermedal

impacto social en salud.

Ben lehnerCoordinadorenfunciones


finalmente,nickStroustrupseincorporóalprogramacomojefedegrupojúnior.ellaboratoriodediná-

micadelossistemasvivosdeStroustrupdesarrollarámétodosexperimentalesycomputacionalespara

caracterizardónde,cuándoyporquétienelugarelenvejecimientoydequémanerapodríamosintervenir

eficazmenteensuprogresión.MientrasestuvoenHarvard,Stroustrupdesarrollabala‘MáquinaLifes-

pan’,quepermitequelosinvestigadoresrastreendecenasdemilesdenematodosalolargodetodala

vida,ylautilizóparadescubrirunaleypotencialuniversalsobrelamaneraenlaquelasintervenciones

alteranlaesperanzadevida.nickStroustrupmantienelastradicionesdelprogramadeacogergrupos

conunaperspectivadeingenieríaygruposqueencaranunapreguntabienformuladadesdeunapers-

pectivamuyoriginal(ortogonal).¡Bienvenido,nick!

SERVICIOS CIENTIfICO-TéCNICOSLosServiciosCientífico-técnicosestánformadoactualmenteporsieteunidades:Genómica,Proteómica,Mi-

croscopia Óptica Avanzada, Cribado Biomolecular y tecnología de Proteínas, Citometría de flujo (fACS),

BioinformáticaeIngenieríadetejidos.elprogramaincluyeasimismoelServiciodeHistologíaylaUnidadde

AlmacenamientoyComputación,alosquesolopuedenaccederlosusuariosdelPRBBylosusuariosinternos,

respectivamente.

Todas estas unidades trabajan para implementar nuevas tecnologías y aplicaciones como respuesta tanto

alasnecesidadesdelosusuarioscomoalasfuturasorientacionesensusrespectivoscampos.Lasnuevas

tecnologías más destacables creadas en 2017 incluyen:

• Aislamientodevirusúnicoporcitometríadeflujo(paralagenómicadeunvirusúnicoyelestudiodela

virosferamarina)

• Identificaciónyaislamientodevesículasextracelularesporcitometríadeflujoparaelestudiodelacargade

las vesículas

• Generacióndeepiteliomucociliarpseudoestratificadoapartirdeepiteliobronquialhumanonormalyepite-

liopigmentadoderetinaapartirdecélulasembrionariashumanas

• origenycultivodelosorganoidesintestinales

• nuevoflujodetrabajoparaelesclarecimientodeloscomplejosproteicosylascaracterísticasestructurales

queutilizanretículosquímicos

• Protocoloparalacorreccióndeerroresdelecturadesecuenciacionesparapermitirunaaltasensibilidadde

la detección de mutaciones.

• ProtocolodedisminucióndeglobinaapartirdemuestrasdeARnensangreduranteunapreparaciónnor-

mal de la biblioteca de aRNm

• Implementacióndelamayoríadeloscircuitosdebioinformáticaestándaresanextflow

Parapreverlasnecesidadesfuturasdelainvestigaciónencienciasdelavida,tambiénestamostrabajando

para una mayor integración de las instalaciones mediante la implementación de nuevas metodologías de

servicioscruzadosquerequierenlacolaboracióndevariasunidades.enparticular,estamostrabajandoen

ingenieríagenómicaconCRISPR/Cas9directamenteenembriones,descifrandoelproteomadelasvesículas

extracelularesogenerandounconjuntocompletodeenzimasproducidasinternamenteparalapreparación

de la biblioteca del NGs.

Además,centramosnuestrosesfuerzosenlacolaboraciónconlaindustriaparalaexploracióntecnológica.

en2017realizamoslapruebadeaplicacióndelúltimoobjetivoSteDdeLeicayorganizamosvarioseventos

de exploración para evaluar las últimas tecnologías del mercado.

las instalaciones básicas del CRG no solo están bien establecidas a nivel local, con usuarios procedentes de

diferentesinstitucionesespañolas,sinoquecuentatambiénconsocios reconocidos en iniciativas europeas.

LaunidaddeMicroscopiaópticaavanzadaformapartedelainiciativaeuroBioimaging(euBI)deleSfRIysu

jefe,timoZimmerman,escoordinadornacionaldetécnicasdeimagenbiológica.LasunidadesdeGenómica

yProteómicasonmiembrosdelMeRIL,elconsorciodeinfraestructurasdeinvestigacióneuropeas,quein-

cluye instalaciones relevantes a nivel internacional (el CRG es la única instalación de proteómica en españa).

Los Servicios Científico-técnicos son miembros de la Core facilities excellence Alliance “CoreForLife”

(www.coreforlife.eu),talcomosedescribeenlasección“Dimensiónnacionaleinternacional”.

MònicaMoralesJefa

http://www.coreforlife.eu


CNag-CRgen 2017, el CNaG-CRG ha consolidado aún más su posición. la integración de la Unidad de Genómica

delCRGnoshapermitidoreorganizarlasactividadesyelinstrumental.Así,elCnAG-CRGsecentrará

enlasaplicacionesdegrancalidadyaltoredimiento,mientrasquelaUnidaddeGenómicadelCRGse

centramásenaplicacionestalescomolasecuenciacióndemicroARnyChIP.Juntoshemosseguido

nuestrahojaderutaestratégicaparaprestarelmejorapoyoposibleanuestroscolaboradorespara

sus proyectos de investigación. Continúan siendo de especial atención las áreas de investigación en

tornoalpaciente,comoen loscasosdeenfermedades rarasycáncer.Desdeelpuntodevistade

las aplicaciones, hemos ampliado nuestra experiencia en el análisis unicelular, la epigenómica, las

técnicastraslacionalesylaintegracióndelainformacióndemográfica.Hemosdesarrolladoaúnmás

nuestrascapacidadesanalíticasavanzadas.

esteañohasidotestigodegrandes logros.nuestrosistemadecalidad,quefuncionaconformea la

normaISo17024:2005enelámbitodelanálisisdeADn/ARnmediantelasecuenciaciónmasiva(nGS)

ylacertificaciónISo9001:2015emitidaporlaentidadnacionaldeAcreditaciónespañola(enAC),ha

superadolaspruebasdereacreditaciónyrecertificacióndeformabrillante.Además,despuésdeunpro-

gramadeformaciónriguroso,elCnAG-CRGsehaconvertidoenelprimercentroeuropeoqueobtieneel

programadePrestadordeServicioscertificadodeRocheparaSeqCapeZtargetenrichmentSystems.

estamosañadiendonuevasacreditacionesquefacilitaránlacolaboraciónconlosserviciosclínicos,con-

cretamentepensandoenlamedicinapersonalizada.

en2017incorporamosunsegundoHiSeq4000deIlluminayretiramosalgunosdelosinstrumentosde

secuenciaciónmásviejosquehabíanllegadoalfindesuvidaútil.Sehaninvertidomuchosesfuerzos

enlaresolucióndeproblemastécnicosinherentesalosinstrumentosdesecuenciaciónmásnuevosde

Illumina,quefuncionanconceldasdeflujomoldeadas.Sehaincluidounamodificacióninnovadoraen

losprotocolosdesecuenciaciónquepermitegestionaresteproblema.en lossecuenciadoresoxford

nanoporehemosaplicadounasecuenciacióndirectadelARnqueabrealgunasvíasinteresantespara

proyectosdeinvestigación.Lossecuenciadoresoxfordnanoporesehanconvertidoenuninstrumento

muyfiableeimportanteenlosproyectosdemontajedenovo.

LaplataformaRD-ConnectGenome-PhenomeAnalysisPlatform(GPAP),creadaenCnAG-CRG,seha

puesto a disposición de los investigadores del european international Rare Disease Research Consor-

tium.Yadisponedemásde400usuariosysehautilizadoenmuchosproyectosdeinvestigaciónsobre

enfermedadesraras.ResultóesencialparalaconvocatoriadelosBBMRI-LPC,enlaquesesecuencia-

ron900exomas.enlaRD-ConnectGPAPseanalizarondatosysetransfirieronmuestrasbiológicasal

eurobiobank.AunqueRD-Connectestállegandoasufin,elCnAG-CRGestáreforzandosufunciónenel

ámbitodelasenfermedadesrarasconproyectosinminentestalescomoSolve-RD.en2017,másdela

mitaddelasmuestrasdepacientesanalizadaspropiciaronidentificacionesdegenesdeenfermedades.

elequipodeGenómicaUnicelularhadescubiertounamaneradecriopreservarmuestrasbiológicassin

comprometerlosperfilesdeexpresióngenéticacomparándolosconlasmuestrasacabadasdeprocesar

anivelunicelular.Unresultadoquehasupuestounpuntodeinflexiónporqueelusodelacriopreserva-

cióninfluyeradicalmenteenlaaccesibilidadalasmuestras.Además,elequipoparticipaactivamenteen

elproyectoHumanCellAtlas,quepretendeconstruirunacoleccióndemapasquedescribiránydefinirán

labasecelulardelasaludylaenfermedad.

Lamedicinapersonalizadayacasiestáaquíyelanálisisdelgenomaeslaherramientaprincipalporque

proporciona una resolución sin precedentes para el diagnóstico de los pacientes. en 2017 se iniciaron

nAGen1000,unproyectopilotorealizadoconnavarrabiomedyfinanciadoporelServicionavarrode

Salud-osasunbidea,ydosproyectospilotos(MedPerCanyURDCat)llevadosacabojuntocondiferentes

hospitalesdeBarcelonayfinanciadosporelPeRISdelDepartamentodeSaluddelaGeneralitatdeCata-

luña.estosproyectospretendenintroducirelanálisisgenómicoenlaprácticaclínicaparaelbeneficioin-

mediatodelospacientes.Pensandoenelfuturo,resultaclaroqueelCnAG-CRGdesarrollaráunafunción

claveenlaimplementacióndelamedicinapersonalizadaenlaatenciónsanitaria.nuestraplataforma

desecuenciación,lasofisticaciónenelanálisisdedatosybasesdedatosparaquelosdatosgenómicos

seanmásfácilesdeutilizarnossitúanenunaposiciónprivilegiadaparaapoyarestatareamonumental.

ivo GutDirector


aRChIVO EUROPEO dE gENOMaS y fENOMaS (Ega)eGAesunservicioparaelarchivopermanenteyparacompartirtodotipodedatosgenéticosyfenotípicos

personalmente identificablesresultadodeproyectosde investigaciónbiomédica.Losdatosrecogidosen

eGAprocedendepersonaselacuerdodeconsentimientodelascualesautorizasupublicaciónsóloparaun

usoespecíficoeninvestigaciónoparaelusodeinvestigadores‘bonafide’.estrictosprotocolosdeterminan

cómolainformaciónsegestiona,sealmacenaysedistribuyeporpartedeeGA.

Desdesulanzamiento,investigadoresdetodoelmundohandepositadoyaccedidoalosdatosdemásde

1.000estudiosdediferentetipoeneGA.estosestudiosvandesdeexperimentosdegenotipaciónagranescala

basados en “arrays” sobre miles de muestras en estudios de diseño de casos y controles o estudios de pobla-

ción, a estudios basados en la secuenciación diseñados para comprender cambios en el genoma, el transcrip-

tomaoelepigenoma,tantoentejidosnormalescomoendiversasenfermedades,porejemplo,elcáncer.Como

resultado, eGa ha pasado de tener un volumen de datos de unos 50 TB a 3.500 TB durante los últimos 5 años.

elequipodeeGAestáimplicadoendiversasiniciativasyproyectos,comosongarantizarelalmacenamiento

yladistribucióndedatoshumanospersonales;analizarlasrelacionesentregenomasyfenomas;ymedicina

evolutiva.Alavez,eGAeselproyectodirectordelaGlobalAllianceforGenomicsandHealth(GA4GH);esel

RecursoCentraldeDatosenelmarcodelproyectoeLIXIR,deimportanciafundamentalparalacomunidadde

lascienciasdelasaludylapreservaciónalargoplazodedatosbiológicos;ademásdejugarunpapelrelevante

en los proyectos exCeleRaTe (H2020).

JordiRamblaJefeenfunciones

investigadores eRC en el CRG

Roderic Guigó

MiguelBeato

Ben lehner

fyodor Kondrashov

Juanvalcárcel

Toni Gabaldón

Toni Gabaldón

luis serrano

Guillaume filion

Gian Gaetano Tartaglia elvanBoke

thomasGraf

ManuelMendozaManuelIrimia

JamesSharpe

Marc Marti-Renom (CNaG-CRG)

STaRTINg gRaNTS

adVaNCEd gRaNTS

SyNERgy gRaNT

CONSOlIdaTOR gRaNTS


(*) Nota: los datos globales incluyen los datos del CNag-CRg. El CNag-CRg forma parte del CRg desde el 1 de julio de 2015.

Datosycifras*


publicaciones

financiación(M€)

proyectos

publicaciones Totales

proyectos y Redes activos Totales

ayudas postdoctorales activas Totales

proyectos europeos Coordinados activos

Totales

presupuesto Total

financiación externa concedida en 2017

CRG

son proyectos eRC activos (16beneficiarioseRC)

son otros proyectos de investigación y redes H2020 activos

son proyectos europeos coordinados activos

son proyectos de investigación internacionales activos (no Ce)

CNaG

publicaciones en acceso abierto

publicaciones 1er Cuartil MediafactordeImpacto

225

124 19

7

42,6

34,4

12

18

7

11

8,2

70% 89% 8,8

Nota: Este gráfico incluye los fondos competitivos conseguidos durante 2017 y pendientes de resolución final o del convenio de la ayuda a 31/12/2017.

Pública-Nacional: 40% - 9,3

Pública-Europa: 27% - 6,3

Ventas Externas: 23% - 5,3

Privada-Filantrópica y Patrocinios: 3% - 0,6

Pública-Regional: 5% - 1,1

Pública-Internacional: 2% - 0,4

Privada Transferencia de Tecnología: 1% - 0,3

Total23,3


personal

Total

PERSONal TOTal

INTERNaCIONalIdad

498* * EJC, equivalente jornada

completa: 482

a 31 de diciembre de 2017

Total

nacionalidades representadas

Jefes/asdeGrupo+ Jefes/asdeUnidad

estudiantes de Doctorado

Investigadores/asPostdoctorales Total personal de investigación

Total Total Total

PROgRaMaS dE INVESTIgaCIóN

SERVICIOS CIENTífICO-TéCNICOS

adMINISTRaCIóN y SOPORTE CIENTífICO

gRUPOS dE INVESTIgaCIóN

CRG

CRG CNaG-CRG

CRG CRG CRG

CNaG-CRG CNaG-CRG CNaG-CRG CNaG-CRG

324

41

60% 50%

70% 60%

98 76 28296

419 79

51 72 26

28 47 4 2

Categorías de investigación edad

Staff Scientists 3%

Investigadores/as Postdoc. 41%

Jefes/as de Grupo 11%

Jefes/as de Unidad 5%

Estudiantes de doctorado 40%

>50 años 20 (4%)

40-50 años 111 (22%)

30-40 años 263 (53%)

<30 años 104 (21%)


Género

Jefas de grupo Jefas de Unidad Staff Scientists Investigadoras Postdoctorales

Estudiantes de doctorado

36%

SOlICITaNTES EN PROCESOS dE SElECCIóN

MUJERES PONENTES INVITadaS

CaNdIdaToS/aS SElECCIoNadoS/daS EN PROCESOS dE SElECCIóN

MUJERES POR CaTEgORíaS PROfESIONalES

Mujeres MujeresHombres Hombres

947 34965 2949,5% 54%50,5% 46% Una mejora de casi el 4%

comparado con 2016

eventos

Simposios/CongresosInternacionales seminarios de alto Nivel

10 151

29% 29% 57% 46% 52%


Desarrollo de tecnología y negocio

nuevastecnologíasidentificadasenproceso de evaluación

acuerdos firmados con empresas e inversores en 2017

proyectos Gestionados enProcesodeValorización

Spin-offs (Microomics)

priority pCT National phases

30

34 7 1

2 1 3PaTENTES

formaciónAvanzada

Tesis CURsOs CieNTÍfiCOs

COURses@CRG CURsOs De iNNOvaCiÓNCoMPetenCIAS TRaNsfeRiBles Y DesaRROllO

pROfesiONal

Tesis Doctorales leídas Cursos internos Cursos externos participantes

Cursos internacionales

Cursos

Cursos internos

Participantes* participantes

participantes

23 11 5 300

7 2 11

147 22276

*32 paises diferentes


Relaciones con los medios

Redes sociales

divulgación y educación científicas

Comunicación,divulgaciónyeducacióncientíficas

AparicionesenMedios

Actividadesorganizadas (en 39 categorías de actividadesdiferentes)

PúblicoBeneficiariototal

escuelas y estudiantes

público General

@CRGenomica CRG‘Megusta’enlapágina Visualizaciones Canal

@cnag_eu CNaG-CRG

escritos Online Blogs

Radio Tv

2.567

237 13.807

9.176

4.631

8.761 3.0253.299 142.535

1.653 1.393

272 1.985 276

19 15

SEgUIdORES TwITTER SEgUIdORES lINkEdIN faCEbOOk yOUTUbE


Informefinanciero


Origen y Destinación de los Recursos Operativos Gestionados

ORIgEN RECURSOS OPERaTIVOS EN MIllONES dE EUROS

dESTINaCIóN RECURSOS OPERaTIVOS EN MIllONES dE EUROS

0,12Ingresos financieros

0,3%

17,4financiación Externa

44%17,1

financiación basal

43%

5,3Servicios

13%

ORIgEN RECURSOS OPERaTIVOS

39,9

1,3Otros

3%

30,6Investigación y Servicios Científico-técnicos

77%

3,4administración

9%4,6

alquiler y Mantenimiento Infraestructura

11% dESTINaCIóN RECURSOS OPERaTVOS

39,9


agradecimientos


patrones

financiadores públicos

financiadores privados

ObRa SOCIal “la CaIxa”la fundación Bancaria “la Caixa” da apoyo a varias iniciativas clave en el CRG, tales como el programa inter-

nacionaldeDoctoradodesde2008yotrasactividadescientíficasydedivulgacióndesde2014:laasociación

entreelCRGyeleuropeanBioinformaticsInstitute(eMBL-eBI)paragestionarconjuntamenteeleuropean

Genome-phenome archive (eGa), y la primera iniciativa de ciencia ciudadana del CRG ‘saca la lengua’. en la

primeramitadde2016,lafundacióndecidiófinanciargenerosamentelasegundaediciónde‘SacalaLengua’,

queempezóenoctubrede2016.Duranteel2017,elproyectoorganizóelsegundo‘tour’anivelespañol,abor-

dandonuevosretos,alcanzandonuevospúblicosobjetivoyrecogiendomuestrasdecolectivosdiferentesy

pacientesdediversasenfermedades.

elapoyodenuestrospatrones,yfinanciadorespúblicosyprivadosesclaveparalograrlamisióndelCRG,decaraadescubriryhaceravanzarelconocimientoenbeneficiodelasociedad,lasaludpúblicaylaprosperidad económica.

Nota: los fondos FEdER y FSE han sido instrumentales en los últimos años a través de diferentes esquemas de financiación y en una variedad de actividades en apoyo a nuestra investigación y para mantener nuestras infraestructuras en la vanguardia de la técnica. Para más detalles sobre los proyectos co-financiados con estos fondos, ver la sección ERdF aNd ESF FUNdS aT THE CRG (http://www.crg.eu/en/content/erdf-and-esf-funds-crg) en la web del CRG.

http://www.crg.eu/en/content/erdf-and-esf-funds-crg


fUNdaCIóN bOTíNLafundaciónBotín,atravésdesuáreadeciencia,yencolaboraciónconlaoficinadeDesarrollodenegocio

ytecnologíadelCRG,promuevelatransferenciaalmercadodelosresultadosdelainvestigaciónproducida

enloslaboratoriosdelDr.JuanValcárcel(hasta2016)yelDr.LuisSerrano(2007-2013)almercado.Loconsi-

guenproporcionandorecursoseconómicosydegestiónparaidentificarprometedorasideasyresultadosen

unaetapainicial,evaluandoelpotencialylamejorformadeprotegerlosatravésdelosderechosdepropiedad

intelectual e industrial, y buscando al mismo tiempo los socios tecnológicos e industriales, o los inversores,

parafacilitarlaentradadelastecnologíasolosproductosalmercadoparaelbeneficiofinaldelasociedad.

fUNdaCIóN RaMóN aRECESLafundaciónRamónArecesofreciófinanciacióndetresañosparaun/ajoveninvestigador/apostdoctoralde

gran talento para hacer ciencia en el CRG. la investigadora postdoctoral seleccionada en una convocatoria

competitivafueXianghuaLi,quetrabajóenellaboratoriodelDr.BenLehnerhastaelprimertrimestrede2017.

fUNdaCIó CaTalUNya-la PEdRERaLafundaciónCataluña-LaPedreraapoyalasactividadesdeformaciónprofesionalparalosestudiantes

jóvenesycontalentoconelfindefomentarsuinterésporlacienciayemprenderunacarreracientífica.

LasactividadesprincipalesincluyenestanciasdeveranocientíficasenMónnaturaPirineusyenelCRG,

dondelosestudiantesparticipanenlassesionesyeventoscentradosentemascientíficosconelobjeti-

vode,finalmente,proponerydesarrollarsupropiaideadeproyecto.Desde2016,elCRGtambiénesuno

delosinstitutosqueacogeestudiantesdelaBarcelonaInternationalYouthScienceChallenge(BYISC),

unprogramainternacionaldeexcelenciadedossemanasenveranoquebuscaestimulareltalentocien-

tíficoentrelosjóvenesdetodoelmundoyfomentarsuentusiasmoparadesarrollarunainvestigación

científicayunacarreraenelámbitodelasciencias.

FUNdaCIÓ MaRaTo TV3LafundaciónMaratótV3financiadiversosproyectosdeinvestigacióndirigidosporinvestigadoresdel

CRGrelacionadosconlasdiferentesedicionesdelmaratóntelevisivo:tresproyectosde laediciónde

2012sobre“Cáncer”(thomasGraf,PiaCosmaySusanadelaLuna),dosproyectosdelaediciónde2013

de“enfermedadesneurodegenerativas”(fátimaGebaueryLucianoDiCroce),unproyectodelaedición

de2014sobre“Lasenfermedadesdelcorazón”(GianG.tartaglia)ydosproyectosdelaediciónde2016

sobre“Lesionesmedularesycerebralesadquiridas”(MarcMartí-RenomyMaraDierssen).

NOVaRTISNovartis mantiene una extensa tradición de colaboración con el CRG. De 2003 a 2016, la empresa dio su

apoyoalaorganizacióndelossimposiosanualesdelCRG,ytambiénfinancióunabecaanualparainves-

tigadores/aspostdoctoralesenelcampodelagenómicaentre2004y2012.en2012,secreóelnuevo

programademovilidadCRG-novartis-Áfricaparaavanzarenlainvestigaciónbioinformática,genéticay

genómicaenÁfrica,yacompañarcientíficos/casafricano/asjóvenesyprometedores/as.elprograma

permite,anualmente,acogerhastacuatroinvestigadores/asenestadiostempranosdesucarrerapro-

cedentesdeuniversidadesafricanas,pararealizarunaestanciade6mesesenelCRG,yllevaracabosu

proyectodeinvestigaciónbajolasupervisióndeun/ainvestigador/aprincipaldelCRG.

axa RESEaRCh fUNdLa“CátedraAXAdePrediccióndelRiesgoenenfermedadesrelacionadasconlaedad”fuecreadaen2014por

unperiododequinceañosconunadotacióndeunmillóndeeuros.elDr.BenLehnerfuenombradoprimer

titulardeestacátedraparacontinuarsulaboreneldesarrollodeunamedicinapersonalizadaqueofrezcaa

laspersonasunamayorprotecciónfrentealosriesgosúnicosqueencaranenenfermedadescomoelcáncer.

en2017,elDr.BernhardPayerfuenombradoelsegundotitulardeestacátedraparaunperíodode3años.


fONdaTION JEROME lEJEUNELarelaciónentreelCRGylafundaciónJeromeLejeunecomenzóhacemuchotiempo.Hanapoyado

variasdelasiniciativasdeinvestigacióndeMaraDierssenvinculadasconlaidentificacióndelasbases

molecularesygenéticasendiversaspatologíasacompañadasderetrasomental:elsíndromedeRett,

elsíndromeXfrágil,elsíndromedeWilliam-BeurenyelsíndromedeDown.Dierssenrecibiótambiénel

primerPremioInternacionalSisley-JeromeLejeuneen2010.en2016,otorgaronunabecaalproyecto

deeduardSabidóen laelucidacióndelmecanismodeacciónde laepigalocatequina-3-galatocomo

agenteterapéuticoenelfenotipocognitivoenmodelosderatonesconsíndromedeDown(2015-2017).

Másrecientemente,en2017,aMaraDierssenleconcedieronunnuevoproyecto,titulado‘Generadordel

CambioepigenéticoenSíndromedeDown’(2017-2019).

aECCen los últimos años, la asociación española Contra el Cáncer (aeCC) ha apoyado una serie de proyectos

einiciativasdeinvestigaciónporcientíficosdelCRG.en2015,PedroVizán(enellaboratoriodeLuciano

DiCroce)recibiólaBecadeInvestigaciónoncológicadelaAeCCparaunproyectoquepretendeidentifi-

cary“atacar”lascélulasmadreimplicadasenelcáncer,quefinalizaráen2019.

zIMIN fOUNdaTION Gracias a la zimin foundation, se celebró en Barcelona, durante dos años consecutivos (2016 y 2017),

la School ofMolecular and theoretical Biology (SMtB), organizada por nuestro investigador fyodor

Kondrashov.LaSMtBreunió,durantetressemanasenagosto,ochentaestudiantesdeenseñanzase-

cundariacontalentoeintelectualmenteinquietos,condestacadoscientíficosdetodoelmundo,todos

ellostrabajandojuntosenexperimentoscientíficosrealesquepodríanaportarresultadosinnovadores.

Losestudiantesdedicaronlostresprimerosdíassimplementeadescubrirlosdiversoslaboratoriosque

participanenelcursodeveranoparaqueposteriormentepudieranelegirelproyectocientíficoqueles

interesara. Como acto de clausura, los estudiantes prepararon una sesión de pósters para presentar los

resultados de los proyectos desarrollados durante las semanas anteriores.

fUNdaCIó bbVa en la convocatoria 2016 de las Becas de la fundación BBva para investigadores y creadores culturales,

nievesMartínez,delgrupodeJamesSharpe,fuegalardonadaconunaayudaparasuproyectodeinves-

tigacióntitulado“non-InvasivefacialBiomarkersofMentalDiseases”.elobjetivodelproyectoeracrear

unaaplicacióndeanálisisymodeladofacialconvalordediagnósticoypronósticodeenfermedades

mentalesrelacionadasconalteracionesgenéticasdelDYRK1Aytambiéntraduciblesaotrostrastornos.

ThE VElUx fOUNdaTIONSLasfundacionesVeluxestánfinanciandoelproyectodeinvestigacióntitulado“RegeneratingPhotore-

ceptorsinRetinitispigmentosa”,denuestraPIPiaCosma.Laretinitispigmentosa(RP)esunaenferme-

dadgravequeafectaaunadecada3.500personas,quesufrenunapérdidaprogresivadelavisiónypara

laquenohaycuraactualmente.elobjetivodelproyectoesponerapruebalareprogramaciónmediada

porfusióncelularcomoterapiaenratonesrd10,unmodeloderatónconRP,conelobjetivofinalderege-

nerarlosfotorreceptoresyalcanzarelrescatefuncionaldelavisión.

SwISS NaTIONal SCIENCE fOUNdaTIONLaSnSfestáfinanciandoactualmenteunproyectodenuestroPIJamesSharpetitulado“Reaction-diffu-

sionnetworksUnderlyingpatternformationoflymphoidtissue”.elproyectoexploralosdiversosescena-

riosposiblesdeformacióndepatroneseneltejidolinfoide.


patrocinadores

fUNdaCIóN ESPañOla PaRa El fOMENTO dE la INVESTIgaCIóN dE la ESClEROSIS laTERal aMIOTRófICa (fUNdEla) Nuestro investigador principal luciano Di Croce recibió una ayuda de fUNDela en noviembre de 2017

paraabordarlaidentificacióndenuevasdianasterapéuticasparaeltratamientodelaeLA,medianteel

empleodecribadodefactoresepigenéticos.

glENN fOUNdaTION fOR MEdICal RESEaRCh LaGlennfoundationfinanciaactualmenteelproyecto‘temporalscalingin C. elegans aging’, de nuestro

investigador principal Nicholas stroustrup hasta octubre de 2018.

ThE baRCElONa INSTITUTE Of SCIENCE aNd TEChNOlOgy (bIST)elBIStcontribuyeadiversasiniciativasactivasenelCRG.enprimerlugar,co-financia2becasfIdel

AGAURen los laboratoriosde los Investigadores/asPrincipalesPiaCosmayRodericGuigódurante

cuatroaños.Porotraparte,dosproyectosdelaprimeraConvocatoriaIgnitedelBIStfueronconcedidos

ainvestigadoresdelCRG.elprimerofueparaVictoireneguembor(laboratorioPiaCosma)ysetitula

‘‘GenStormanintegratedapproachtovisualizeandmodelthespatialconformationofgenesatthena-

noscalelevel’(marzo-noviembre2017).elsegundofueparaIshierRaote(laboratorioVivekMalhtora),

parasuproyecto‘‘enlighteningtAnGo”(marzo-noviembre2017).

visita la versión completa en: annualreport2017.crg.eu

http://annualreport2017.crg.eu

Miembros del Patronato:

Miembro de:

Centro de Regulación Genómica

Edificio PRBBDr. Aiguader, 8808003 Barcelona, España

Tel.: +34 93 316 01 00Fax +34 93 316 00 99

[email protected]://www.crg.eu

Visita la versión completa de la Memoria Anual 2017: annualreport2017.crg.eu

http://www.crg.eu

http://annualreport2017.crg.eu

Memoria Anual - CRG Annual Report 2017...das de financiación,una en 2009 (INTERPOD) y otra en 2014...

Documents

Transcript of Memoria Anual - CRG Annual Report 2017...das de financiación,una en 2009 (INTERPOD) y otra en 2014...