Informe 2010-11 – Nodo IBUNAM y colaboración con … · especialmente los que tenemos datos...
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Informe 2010-11 – Nodo IBUNAMy colaboración con CBOL
Red Temática del Código de Barras de la Vida en México
Patricia Escalante P., Patricia Rosas E. y Lidia Cabrera M.Instituto de Biología, UNAM
2005-2007
V. León participa en la 1ª Conferencia Internacional del Código de Barras de la Vida en Londres, UK
A su regreso presenta un Seminario del proyecto en el IB.
Hace gestiones para que el IB se adhiera al Consorcio del Código de Barras de la Vida.
La CONABIO recibe solicitudes de apoyo a proyectos piloto, por parte del IB se apoya un proyecto de las plantas de 5 familias incluidas en la NOM-059-ECOL y otro de anfibios y reptiles.
Antecedentes
P. Escalante participa en el Taller Neotropical de las campañas ABBI y FishBOL en Buenos Aires, Argentina, y hace una presentación del potencial de México para una campaña del código de barras molecular de las aves.
A su regreso hace dos reuniones con la comunidad académica para expresar su interés e invitar a más académicos a iniciar proyectos.
Invita a P. Hebert a dar una Conferencia en el IB, la cual se lleva a cabo en abril del 2007. El Dr. Paul Hebert recorre nuestras colecciones y aprecia el potencial institucional para el proyecto y nos invita a participar en la reunión organizativa que tendría lugar en Guelph, en junio del 2007.
V. León y P. Escalante participan por parte del IB en el Taller Inaugural, de organizacion y financiamiento del proyecto iBOL en Guelph, Ontario del 17 al 20 de junio del 2007. Se llega al acuerdo que P Escalante será la coordinadora del nodo IBUNAM en la Red MexBOL.M Elías y P Escalante son invitados a formar parte del Consejo Científico de iBOL.
Y cada nodo organiza su taller. Para nuestro taller invitamos entre otros a Rob DeSalle (AMNH), Paul Hebert (Guelph), y otros invitados, también los de casa participamos, especialmente los que tenemos datos moleculares o de códigos de barras.
A fines del 2008 se emite la invitación a pedir la sede de la Tercera Conferencia Internacional del Código de Barras de la Vida y decidimos buscar la sede.
Recibimos la visita de evaluación como sede potencial en febrero del 2009, unas semanas después nos informan que ganamos la sede.Se forma en Comité Organizador Local (8 investigadores del IB, además de otros 12 de otras instituciones ).
Talleres PreConferencia en el IBUNAM: Presentación de Junko Shimura (CCDB), participantes de todo en mundo, en estas imágenes, Brasil, Europa.
Publicación de la Memoría del Simposio Mesoamericano de la Tercera Conferencia en mitochondrial DNA en la Revista Mitochondrial DNA número especial.
Mantenimiento del Blog del nodo IBUNAM de la Red MexBOL
56 suscripciones,11,794 hits hasta el momento
LaboratorioLaboratorio
•Adquisición del TissueLyser (Qiagen). Adquisición del TissueLyser (Qiagen). Molido de tejidos para la extracción. Molido de tejidos para la extracción. Aparato disponible a la comunidad.Aparato disponible a la comunidad.
•22 placas = 2090 muestras de tejido 22 placas = 2090 muestras de tejido enviadas a secuenciar al Biodiversity enviadas a secuenciar al Biodiversity Institute of Ontario, CanadáInstitute of Ontario, Canadá
Entrenamiento en el Laboratorio
Llenado de placa con tejidos de avesLlenado de placa con etanol
Entrenamiento en extracción de ADN
Selección de material para llenado de placas
Selección de material para llenado de placas
Asesoramiento
Llenado de base de datos
Subiendo datos e informacion al sistema BOLD
Llenado de las placas con muestras de animales
Llenado de las placas con muestras de plantas
Organización en la hoja de carga y los ejemplares
Organización de los ejemplares y toma de
fotografías
Talleres y Congresos
Taller en el Congreso Mexicano de Botánica
Participación en la 1ª Reunión del Grupo de Insectos - MexBOL
Patricia Rosas en el 1er. Taller del nodo IBUNAM
Lidia Cabrera en el 1er. Taller del nodo IBUNAM
Participantes en el 1er. Taller del nodo IBUNAM
Taller Grupo Perso-nas
Instituciones Productos
General Directores de grupos 30 IBUNAM, FES-Iztacala, INECOL, UDG, UAEH, CONABIO, INIFAP, MazatánUNAM
Diversos proyectos, Taller de Plantas y Reuniión satélite Congreso Nacional de Botánicoa
Hongos Micólogos 35 IBUNAM, FES-Iztacala, FC-Medicina, Inst. Geología, UAEH, UDG, FC-Ciencias, UAT ,UABC, UV, IPN
Proyectos de Códigos de Barras y un segundo taller
General Taxónomos y otros especialistas
25 UAEH, FES-Iztacala, UDG Proyecto Código de Barras de la biota de Hidalgo
General Taxónomos y otros especialistas sobre la biota de la Estación Biológica Chamela
23 IBUNAM, UAEH, IPN Proyecto Código de Barras de la biota de la Estación Biológica Chamela
Artrópodos Entomólogos (insectos) 9 IBUNAM, ECOSUR Consolidación y planeación de la Campaña de Insectos
Hongos Micólogos 15 IBUNAM, INECOL, UATlx Proyectos de Códigos de Barras
Plantas Vasculares
Botánicos 6 IBUNAM, UDG, ECOSUR, FC-Ciencias, UANL, UAMex
Preparación para Reunión Satélite
Plantas Vasculares
Botánicos 55 Divesas istituciones del país y algunos extrangeros
Información, discución y consolidación de la campaña de Plantas Vasculares
8 talleres (ago-nov)
3 Generales, 2 Hongos, 2 Plantas Vasculares, Artrópodos
198 asistentes
Mas de 18 instituciones del país (investigadores y estudiantes)
Diversos proyectos taxónomicos o bioticos
Projecto (código) Avance Investigadores/Estudiantes No. Spp.
matK/rbcL No. Barco-des
Apoyo
Five critical groups of the Mexican flora (ACCCO)
Análisis de datos y preparación para publicar
D. Gernandt, G. Salazar, S. Arias, F. Vergara, V. Sosa, J. Reyes, L. I. Cabrera, P. Rosas, M. L. Kuzmina
226 211/222 226 CONABIO
Pines of North and Central America (PNCA)
Colectando, generando base de datos y fotografías
D. Gernandt, P. Rosas, S. Hernández, M. Grabiel
63 52/50 147 MexBOL (Parcial)
DNA barcode of the Orchidaceae of Mexico, part 1: Orchidoideae (MXBOR)
Colectando, generando base de datos y fotografías
Gerardo Salazar, Lidia I. Cabrera, Luis Sanchez, Masha L. Kuzmina
400 0/0 950 MexBOL (Parcial)
DNA barcode of Orchidaceae of Mexico, part 2: Epidendroideae. (MXBEP)
Colectando, generando base de datos y fotografías
Gerardo Salazar, Lidia I. Cabrera, Masha L. Kuzmina
400 0/0 950 MexBOL (Parcial)
DNA Barcode of Orchidaceae of Mexico, part ·3: Cypripedioideae an Vanilloideae. (MXBCY)
Colectando, generando base de datos y fotografías
Gerardo Salazar, Lidia I. Cabrera, Masha L. Kuzmina
400 0/0 950 MexBOL (Parcial)
Barcode of Asclepiadaceae of Mexico (MXASC)
Colectando, generando base de datos y fotografías
Veronica Juarez, Lidia I. Cabrera, M. Paniagua, Masha L. Kuzmina, Gerardo Salazar
194 0/0 380 MexBOL (Parcial)
Barcode of Aracea of Mexico (MXARA)
Colectando, generando base de datos y fotografías
Gerardo Salazar, Lidia I. Cabrera, Masha L. Kuzmina
100 0/0 285 MexBOL (Parcial)
Proyecto (código) Avance Investigadores/Estudiantes No. Spp.
matk/rbcL No. Barcodes
Apoyo
DNA barcode of the flora of Calakmul, Yucatan Peninsula, México (CALAK)
Análisi de datos G. Salazar, L. I. Cabrera, E. Martínez, C. Ramos, F. Chiang, M. Sousa, M. L. Kuzmina
572 424/699 950 MexBOL (Parcial)
DNA barcode of the tree flora of the tropical rain forest of the Los Tuxtlas (MXBT)
Generando secuencias, Tesis de licenciatura
G. Salazar, K. B. Hernández, G. Ibarra, A. Campos, M. Ricker, R. I. Coates, L. I. Cabrera, M. L. Kuzmina
179 70/171 294 MexBOL (Parcial)
DNA barcode of the flora of Zimatan, Oaxaca, Mexico (MXBZI)
Generando secuencias, Tesis de licenciatura
G. Salazar, D. Hernández, L. I. Cabrera, M. L. Kuzmina, S. H. Salas
583 0/112 950 MexBOL (Parcial)
DNA barcode of te flora of the Jaguaroundi Ecological Park, Veracruz, Mexico (JAGUA)
Colectando, generando base de datos y fotografías
G. Salazar, M. Ricker, L. I. Cabrera, M. L. Kuzmina
300 0/0 950 Pemex
Barcode of the Flora of Pedregal, Mexico City. Mexico. Responsablre (MXPED)
Colectando, generando base de datos y fotografías
G. Salazar, D. Hernadez, K. B. Hernandez, V. Trejo, L. I. Cabrera, M. L. Kuzmina
150 0/0 285 MexBOL (Parcial)
Vascular plants of Chamela, Jalisco, Mexico (MXBPV)
Colectando, generando base de datos y fotografías
G. Salazar, L. I. Cabrera, P. Rosas, M. L. Kuzmina
450 0/0 950 MexBOL (Partial)
Campaña Aproxi-mación
No. Investigadore/Estudiantes
No. Spp.
Marcadores
No. Barcodes
Apoyo
Plantas Vasculares = 13 proyectos
Florístico Taxonómico
21/5 = 26 4017 757 (matK)/1180 (rbcL)
8267 MexBOL (Parcial), CONABIO, PEMEX
Resumen
Código de Barras de AnimalesCódigo de Barras de AnimalesPatricia RosasPatricia Rosas
BeeBOL Lepidoptera Formicidae Mammals
Polar Mosquito Coral Reef Marine All Birds
HealthBOL Trichoptera
FishBOL Sponge
Projecto (código) Avance Investigadores / Estudiantes
Barcodes Apoyo
Earthworms of Mexico [EWMEX]
Base de datos y generación de secuencias
Carlos Fragoso, Adriana Casallas y Gabriela Cervantes
200 INECOL
Birds of Mexico [BOM] Colecta, base de datos y generación de secuencias
Patricia Escalante, Marco Gurrola, Thonathiu Sanabria, Luis Fernando López y otros
1700 CONABIO Y Red MexBOL
Birds of Guatemala [BOG] Base de datos y generación de secuencias
Patricia Escalante 95 CONABIO Y Red MexBOL
Nymphalidae of Central Mexico [NCM]
1ª. parte finalizada con una publicación y la 2ª. parte en generación de secuencias
Adolfo Ibarra, Patricia Escalante y Patricia Rosas
500 UNAM y Fundación BANORTE
Cicadellidae de Mexico [CCM]
Base de datos, imágenes y generación de secuencias
Julieta Ramos-Elorduy y José Manuel Pino
500 CONABIO Y Red MexBOL
Freshwater fishes of the Panuco-Tamesi system [FFPTR]
Base de datos y generación de secuencias
Omar Mejia 311 CONABIO
Amphibians and reptiles of Mexico [MXHER]
Base de datos Virginia León, Oscar Flores, Adrián Nieto y Jonathan Campbell
550 CONABIO
Projecto (código) Avance Investigadores / Estudiantes Barcodes Apoyo
Helminths of amphibians and reptiles of Mexico [HELMX]
Base de datos y generación de secuencias
Virginia León 580 CONABIO
Bees of México [RABM] Base de datos y generación de secuencias
Ricardo Ayala y Laurence Parker
82 BeeBOL y Presupuesto operativo IBUNAM
Bees of the world. Mexico [BOFWM]
Base de datos y generación de secuencias
Ricardo Ayala, Laurence Packer, Carlos Vergara y Bob Minckley, Ricardo Ayala, Laurence Parker y Sheila Dumesh
904 BeeBOL, Presupuesto operativo IBUNAM, Proyecto Mutual
Bees of the world. Mexico II [BOWMT]
Base de datos y generación de secuencias
Ricardo Ayala, Laurence Parker y Sheila Dumesh
95 Proyecto Mutual, York University, Presupuesto operativo. Proyecto Vulnerabilidad
Código de barras de esponjas marinas (Porifera) del Pacífico mexicano
Colecta y base de datos
José Antonio Cruz, José Luis Carballo y Axayacatl Rocha-Olivares
~500 -
Projecto (código) Avance Investigadores / Estudiantes Barcodes Apoyo
Barcodng Arachnids of Mexico (All Arachnida, except Scorpiones & Acari) [ARMXB]
Colecta, base de datos y generación de secuencias
Griselda Montiel, Oscar Francke, Alejandro Valdez, César Durán, Jesús Cruz López, Gabriel Villegas, Mirna Hernández y Fernando Álvarez
65 sp. Red MexBOL
Barcoding Arachnids of Mexico (Subclase Acari) [MXBAC]
Colecta, base de datos y generación de secuencias
Tila María Pérez Ortiz, Griselda Montiel, Ricardo Paredes León, Oscar Francke Ballvé, Gabriel Villegas, María del Carmen Guzmán Cornejo, Margarita Vargas, Tania Palafox y Jesús Alberto Lugo
50 sp. Red MexBOL
Barcode of arachnids of Mexico (Order: Scorpiones) [MXBSC]
Colecta, base de datos y generación de secuencias
Oscar Francke, Carlos Santibañez, Jesús Cruz, Griselda Montiel, Javier Ponce y Gerardo Contreras
50 sp. Red MexBOL
Caddisfly diversity of Hidalgo, Mexico [TRHGO]
Colecta, base de datos y generación de secuencias
Atilano Contreras, Xin Zhou, María Razo, Munira Yasmin, y Rob Tabone
665 Posgrado C. Biológicas-UNAM, IB-UNAM, Red MexBoL
UNAM Trichoptera 1 [UNAMA] Colecta Xin Zhou, Atilano Contreras, Karl Kjer y Steffen Pauls
100 -
Projecto (código) Avance Investigadores / Estudiantes
Barcodes Apoyo
Brown lacewings (Neuroptera: Hemerobiidae) of Mexico [HEMMX]
Colecta, base de datos y generación de secuencias
Atilano Contreras-Ramos, Xin Zhou y María Razo
200 IB-UNAM y Red MexBoL
Doryctinae (Braconidae) of Mexico [ASDOR]
Finalizado y publicado Alejandro Zaldívar, Alex Smith y José Fernandez
791 CONABIO
Lepidoptera from Chamela, Mexico [MXBLP]
Colecta, base de datos y generación de secuencias
Alejandro Zaldívar, Alex Smith y José Fernandez
1000-2000 -
Microgastrinae from Chamela, Mexico [MXBMC]
Colecta, base de datos y generación de secuencias
Alejandro Zaldívar, Alex Smith y José Fernandez
1000-2000 -
Quicke Braconidae [ASQBR]
Colecta, base de datos y generación de secuencias
Alejandro Zaldívar, Alex Smith y José Fernandez
1000-2000 -
Quicke Ichneumonidae [ASQIC]
Colecta, base de datos y generación de secuencias
Alejandro Zaldívar, Alex Smith y José Fernandez
1000-2000 -
World Doryctinae [DORYC] Colecta, base de datos y generación de secuencias
Alejandro Zaldívar, Alex Smith y José Fernandez
1000-2000 -
Envio de Placas a Guelph
Se enviaron placas con tejidos de animales y ejemplares voucher
Representan ~4 000 registros