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diagnóstico de procesos digestivos en porcino

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diagnósticode procesos digestivos en porcino

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Los procesos digestivos en la especie porcina tienen gran importancia por las pérdidas económicas que conllevan, tanto por la mortalidad de los lechones como las derivadas del retraso del crecimiento, desigualdad de lotes, etc.

El diagnóstico de procesos diarreicos no es sencillo por diferentes razones:

La sintomatología es inespecífica. Los signos clínicos permiten tener un diagnóstico presuntivo pero es necesario confirmarlo enviando muestras a analizar.

Los procesos digestivos suelen ser multifactoriales (especialmente las diarreas neonatales), encontrándose más de un agente etiológico implicado.

Algunos agentes productores de diarreas, como Escherichia coli o Clostridium perfringens, forman parte de la microbiota digestiva. El hecho de hallarlo en la explotación no significa que sean la causa de diarreas.

Resulta imprescindible realizar un estudio diferencial completo que permita detectar todos los agentes implicados y determinar cuál o cuáles son más importantes en el proceso.

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Es fundamental una buena anamnesis y selección de muestras a enviar al laboratorio. El éxito del diagnóstico depende de que las muestras sean representativas y se encuentren en buen estado de conservación.

Las mejores muestras son paquetes intestinales de animales de pocos días de vida que presenten las diarreas características del proceso. También se pueden enviar hisopos rectales y heces de animales diarreicos, pero en este caso no será posible realizar el diagnóstico histopatológico.

Seleccionar 4 o 5 animales de diferentes camadas: así se obtiene una buena representación de la explotación.

Animales en fases iniciales de la diarrea característica del proceso. En animales con diarreas de varios días de evolución, la presencia de agentes secundarios dificulta valorar la causa desencadenante del proceso.

Animales no tratados. El tratamiento antibiótico puede impedir el aislamiento de agentes bacterianos como Escherichia coli o Clostridios.

Animales sacrificados. Evitar muestras de animales que lleven varias horas muertos ya que la autolisis del intestino se produce rápidamente.

toma de muestras

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técnicas de diagnóstico

cultivo microbiológico

permite la obtención de la cepa para realizar estudios de sensibilidad antibiótica, tipado, autovacunas, etc.

concentración mínima inhibitoria (CMI)

muestra la concentración más pequeña de antibiótico que impide la multiplicación de la bacteria. nos permite conocer cuál es el antibiótico más efectivo en la dosis adecuada, evitando subdosificar o sobredosificar

antibiograma

realizado mediante la técnica de Kirby Bauer (antibiograma en disco) dónde se indica si una bacteria es sensible, resistente o tiene sensibilidad intermedia frente a un antibiótico

real time PCR

permite confirmar la presencia de virus y bacterias implicadas

histopatología

de gran interés para valorar la importancia de cada uno de los agentes implicados en el complejo respiratorio ovino

tipado de cepas

se puede realizar el tipado por qPCR tanto de las cepas aisladas como directamente de la muestra obtenida del digestivo. El tipado es de gran interés a la hora de realizar estudios epidemiológicos en la explotación, elección de vacunas o diseños de autovacunas

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oferta de diagnóstico

factores de virulencia de Escherichia coli

toxinotipo de Clostridium perfringens

qPCR: gen eae, AIDA, F4, F5, F6, F41, F18, STa, STb, Stx2e, LT, EAST, E. coli total

qPCR: toxinas alpha, beta, beta-2, epsilon, iota, enterotoxina

panel digestivo lactante

cultivo microbiológicoqPCR: Rotavirus A, Rotavirus C, PEDV, TGE, Eimeria sp., Isospora suis, Clostridium perfringens, Clostridium difficile

antibiograma de bacterias de interés

panel digestivo cebo y adulto

cultivo microbiológicoqPCR: PEDV, TGE, Lawsonia intracelullaris, Clostridium perfringens, Brachyspira hyodysenteriae, Brachyspira pilosicoli, Brachyspira intermedia, Salmonella enterica

antibiograma de bacterias de interés

panel digestivo transición

cultivo microbiológico qPCR: factores de virulencia de Escherichia coli, Rotavirus A, PEDV, TGE

antibiograma de bacterias de interés

panel disentería

cultivo microbiológico de Brachyspira qPCR: Brachyspira hyodysenteriae

CMI de Brachyspira sp

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casos clínicos

caso 2: diarrea neonatal por Clostridium perfringens

caso 1: colibacilosis neonatal

caso 3: diarrea postdestete por Escherichia coli verotoxigénico

caso 4: diarrea neonatal, caso mixto de Escherichia coli + Clostridium difficile

caso 5: disentería por Brachyspira hyodysenteriae

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muestras recibidas observaciones macroscópicas

5 lechones recién nacidos

Los animales presentan signos de diarrea.

Hay sospecha de colibacilosis, están sin tratar.

Todos los lechones presentan intestino delgado congestivo y contenido muy líquido y amarillento.

Los lechones 3 y 4 presentan además ciego con contenido compacto y color verdoso.

Resto de órganos sin lesiones aparentes.

colibacilosis neonatalcaso1

diagnóstico solicitado: panel digestivo lactante

cultivo microbiológico

crotal

ID 1

ID 2

ID 3

ID 4

ID 5

identificación

Escherichia coli***

Escherichia coli***

Escherichia coli***

Escherichia coli***

Escherichia coli***

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antibiograma: Bacteria y crotal: Escherichia coli aislada en ID 2

Antibiótico Resultado Diámetro (mm) Referencia (mm)

D-Amoxicilina Resistente 0 14 21

D-Ampilicina Resistente 0 13 17

D-Penicilina Resistente 0 29 29

D-Bacitracina Resistente 0 8 13

D- Trimetoprim/sulfametoxazol Resistente 0 10 16

D-Tetraciclina Resistente 0 18 23

C-Apramicina Resistente 14,6 19 23

C-Gentamicina Sensible 17,7 12 16

C-Neomicina Intermedia 15,8 12 17

C-Espectinomicina Resistente 9,9 10 14

C-Estreptomicina Resistente 8,9 11 15

C-Amoxicilina + ácido clavulánico Intermedia 14,4 13 18

C-Florfenicol Resistente 15,8 18 22

C-Tianfenicol Resistente 0 12 18

C-Cefalotina Intermedia 16,1 14 18

C-Clindamicina Resistente 0 14 21

C-Eritromicina Resistente 7,9 13 23

C-Gamitromicina Intermedia 12,6 11 15

C-Tilmicosina Resistente 0 11 11

C-Tiamulina Sensible 10,5 9 9

B-Cefquinoma Sensible 26,7 18 22

B-Ceftiofur Sensible 25,6 17 21

B-Colistina-sulfato Sensible 13,5 8 11

B-Enrofloxacina Resistente 0 18 23

B-Marbofloxacina Resistente 0 14 20

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real time PCR

determinaciones

Rotavirus tipo A

Rotavirus tipo C

PEDV

TGE

Eimeria sp.

Isospora suis

Clostridium perfringens

Clostridium difficile

muestras

ID 1-5

Neg.

Neg.

Neg.

Neg.

Neg.

Neg.

Positivo (32,3)

Neg.

comentario del caso

Con el panel digestivo básico se obtuvieron los siguientes resultados positivos:

E. coli aislado en cultivo masivo en todas las muestras estudiadas.

C. perfringens en concentración baja.

No se ha detectado la presencia de virus ni protozoos.

Para llegar a un diagnóstico certero se recomendó el estudio histopatológico de las lesiones, de gran interés en casos con presencia de varios agentes patógenos (E. coli, clostridios) para poder valorar cual es el agente primario de las lesiones y de esta manera orientar el tratamiento y prevención.

histopatologíadiagnóstico emitido por Micros Veterinaria

Las lesiones observadas en los cinco animales son histológicamente iguales. Se aprecia una ligera-moderada congestión de vasos de la mucosa y submucosa. Además, se observa una ligera enteritis con presencia de linfocitos y neutrófilos en las vellosidades intestinales que provocan el engrosamiento y acortamiento de las mismas. Con la tinción de Gram se observan grupos de bacterias Gram negativas, algunas de ellas adheridas a la membrana de las vellosidades, y en menor número Gram positivas de morfología bacilar.

El estudio histopatológico de las muestras indica la presencia de enteritis catarral asociada principalmente a bacterias Gram negativas (Escherichia coli).

Una vez identificado Escherichia coli como el principal agente implicado en las diarreas, se procedió a la comparación fenotípica de cepas de Escherichia coli y a la detección de factores de virulencia.

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factores de virulencia de Escherichia coli

gen eae

AIDA

F4

F5

F6

F41

F18

STa

STb

Stx2e

LT

EAST

Escherichia coli

Neg.

Neg.

Neg.

Neg.

Neg.

Neg.

Neg.

Neg.

Neg.

Neg.

Neg.

Neg.

Positivo

Neg.

Neg.

Neg.

Neg.

Neg.

Neg.

Neg.

Neg.

Neg.

Neg.

Neg.

Neg.

Positivo

determinaciones

ID 1-5 Cepa 5

muestras

comparación fenotópica de cepas de E. coli

Se valoró la diversidad de cepas de E.coli. Para ello se analizaron 15 aislamientos de E. coli de la analítica actual (3 aislamientos por muestra analizada) y se compararon con las cepas encontradas en una analítica anterior.

La línea de puntos representa el punto de corte, todos los aislamientos que formen un grupo (o cluster) a la derecha de esta línea pertenecen a la misma cepa. En este caso tenemos 8 grupos, es decir, 8 cepas.

En la analítica actual se encontraron 5 cepas (cepas 1, 2, 3, 5 y 8), de las cuales la cepa 5 es la mayoritaria (engloba 10 de los 15 aislamientos) y está presente en 4 de las 5 muestras analizadas. Las cepas de la analítica actual son distintas de las cepas encontradas en la analítica anterior.

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comentario del caso

revisión del caso

Escherichia coli es el principal agente implicado en las diarreas de los lechones. Mediante comparación fenotípica se ha localizado una cepa mayoritaria presente en 4 de las 5 muestras estudiadas. No se detectaron factores de virulencia ni en la cepa localizada ni testando directamente las muestras recibidas; se han reportado casos de colibacilosis donde no se localizan cepas portadoras de los genes de virulencia asociados, hasta el momento, con diarrea neonatal (Kim et al., 2010).

Mediante diagnóstico diferencial:

Se descartó la presencia de Rotavirus y PEDV

Se descartó la presencia de Isospora suis e Eimeria sp

Se detectó mediante qPCR Clostridium perfringens en baja concentración sin observarse lesiones asociadas

Se descartó la presencia de Clostridium difficile

En este caso, se recomendó al veterinario responsable el envío de nuevas muestras para confirmar el diagnóstico y valorar el realizar una posible autovacuna.

El cuadro de diarreas neonatales disminuyó considerablemente tras la aplicación de la autovacuna de E. coli. Sin embargo, siguieron apareciendo diarreas de menor gravedad en camadas de primerizas. Tras el envío de las muestras para hacer una nueva valoración del proceso mediante un diagnóstico completo (resultados no mostrados) se encontró una gran variedad de cepas de E. coli, sin aparecer ninguna cepa mayoritaria, sin embargo seguía presente la cepa mayoritaria encontrada en el caso anterior. No se detectaron factores de virulencia de E. coli en las muestras estudiadas.

Las muestras eran positivas a Rotavirus mediante PCR. El estudio histopatológico indicó lesiones compatibles con etiología vírica como principal causa de las diarreas.

La conclusión es que los casos de diarreas esporádicas en camadas de primerizas se deben, probablemente, a la presencia de rotavirus.

Tras la aplicación de la autovacuna, las diarreas colibacilares se controlaron, si bien los animales siguen portando la cepa de E. coli mayoritaria incorporada en la autovacuna.

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caso2diarrea neonatal por Clostridium perfringens

muestras recibidas

observaciones macroscópicas

digestivos de dos lechones de 3-4 días de vida

tres hisopos rectales de otros animales infectados

Lechón 1:

Asas del intestino delgado muy congestivas

Ganglios linfáticos mesentéricos congestivos

Resto de órganos sin lesiones aparentes

Lechón 2:

Asas del intestino delgado congestivas con contenido líquido amarillento

los animales han sido vacunados frente a Escherichia coli y Clostridios

diagnóstico solicitado: panel digestivo lactantes

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cultivo microbiológico

crotal

His – 1

His – 2

His – 3

ID – 1

ID – 2

identificación

Escherichia coli***

Escherichia coli***

Escherichia coli***

Escherichia coli*Clostridium perfringens**

Escherichia coli**Clostridium perfringens**

real time PCR

determinaciones

Rotavirus tipo A

Rotavirus tipo C

PEDV

TGE

Eimeria sp.

Isospora suis

Clostridium perfringens

Clostridium difficile

muestras

ID 1-2

Positivo (36,08)

Neg.

Neg.

Neg.

Neg.

Neg.

Positivo (20,05)

Neg.

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factores de virulencia de Escherichia coli

gen eae

AIDA

F4

F5

F6

F41

F18

STa

STb

Stx2e

LT

EAST

Escherichia coli

Neg.

Neg.

Neg.

Neg.

Neg.

Neg.

Neg.

Positivo (32,84)

Positivo (31,99)

Neg.

Positivo (32,72)

Neg.

Positivo (24,19)

determinaciones

ID 1-2

muestras

histopatologíadiagnóstico emitido por Micros Veterinaria

Animal nº1.

Intestino delgado:Moderada autolisis, con pérdida completa del epitelio. Longitud de las vellosidades normal.No se aprecia proliferación de bacterias en las muestras examinadas.

Colon:Proliferación de bacilos gram positivas de tamaño intermedio (2-3 micras) compatible con Clostridium sp.

Animal nº2.

Intestino delgado:No se observa otro tipo de lesiones ni proliferación de bacterias.

Colon:Moderada congestión de mesocolon.Notable proliferación de bacilos gram positivos (2-3 micras) en contacto con el epitelio e incluso invadiendo la superficie de la mucosa (compatible con Clostridium sp.)

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comentario del caso

Escherichia coli: a pesar de haber detectado E. coli en todas las muestras, los resultados descartan una colibacilosis:

No hay evidencias de cepas patógenas, ya que aunque detectamos genes codificantes de toxinas (Sta, Stb y LT) no hay E. coli portadores de fimbrias necesarias para unirse al epitelio, proliferar y liberar toxinas.

No se observan lesiones histopatológicas compatibles con colibacilosis.

Rotavirus: se detecta Rotavirus tipo A mediante qPCR. Sin embargo, no hay lesiones compatibles, lo que descarta que tenga una implicación primaria en la diarreas.

Clostridium perfringens: se ha aislado en ambas muestras de intestino delgado en cultivo masivo. Histológicamente se observan lesiones compatibles señalándolo como agente primario de las diarreas.

El toxinotipo de la cepa aislada corresponde con C. perfringens tipo A, positivo a toxina ß2. Al realizar la detección de genes codificante directamente sobre las muestras de intestino delgado descartamos la presencia concomitante de otros toxinotipos de C. perfringens (como C. perfringens tipo C).

C. perfringens tipo A forma parte de la flora intestinal y puede producir diarreas amarillentas en los primeros días de vida, especialmente aquellas cepas positivas a toxina ß2.

En este caso se recomendó medidas de manejo y profilácticas para el control de Clostridium perfringens tipo A.

toxinotipo de Clostridium perfringens

toxina Alpha

toxina Beta

toxina Epsilon

toxina Iota

Enterotoxina

toxina Beta-2

Positivo (27,89)

Positivo (32,01)

Neg.

Neg.

Neg.

Neg.

determinaciones

ID 1-2

muestras

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diarreas postdestete por Escherichia coli verotoxigénicocaso3

muestras recibidas

observaciones macroscópicas

un lechón que llevaba una semana en el cebadero

tres hisopos de cerdos recién introducidos al cebadero

Lechón:

Asas del intestino delgado muy congestivas

Ganglios linfáticos mesentéricos congestivos

Resto de órganos sin lesiones aparentes

cebos de 8 semanas

a la semana de la entrada presentan diarrea no muy líquida, pastosa y oscura

tratados con colistina en agua y enrofloxacina inyectable a los dos días

diagnóstico solicitado: panel digestivo cebo - adulto

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antibiograma: Bacteria y crotal: Escherichia coli beta haemolítico

Antibiótico Resultado Diámetro (mm) Referencia (mm)

D-Amoxicilina Resistente 0 14 21

D-Ampilicina Resistente 0 13 17

D-Penicilina Resistente 0 29 29

D-Bacitracina Resistente 0 8 13

D- Trimetoprim/sulfametoxazol Resistente 0 10 16

D-Tetraciclina Resistente 0 18 23

C-Apramicina Resistente 16,1 19 23

C-Gentamicina Sensible 19,3 12 16

C-Neomicina Intermedia 16,5 12 17

C-Espectinomicina Intermedia 11 10 14

C-Estreptomicina Intermedia 12,3 11 15

C-Amoxicilina + ácido clavulánico Sensible 19,6 13 18

C-Florfenicol Intermedia 21,3 18 22

C-Tianfenicol Resistente 10,5 12 18

C-Cefalotina Intermedia 14,8 14 18

C-Clindamicina Resistente 0 14 21

C-Eritromicina Resistente 9,8 13 23

C-Gamitromicina Intermedia 13,2 11 15

C-Tilmicosina Resistente 0 11 11

C-Tiamulina Sensible 9,5 9 9

B-Cefquinoma Sensible 28,2 18 22

B-Ceftiofur Sensible 25,5 17 21

B-Colistina-sulfato Sensible 13,5 8 11

B-Enrofloxacina Intermedia 20,1 18 23

B-Marbofloxacina Sensible 21 14 20

cultivo microbiológico

crotal

H – 1 H – 2H – 3

ID

C

identificación

Escherichia coli beta hemolítico***Escherichia coli beta hemolítico***Escherichia coli beta hemolítico***

Escherichia coli beta hemolítico***

Escherichia coli beta hemolítico***

Page 19: diagnóstico de procesos digestivos en porcinoCon la tinción de Gram se observan grupos de bacterias Gram negativas, algunas de ellas adheridas a la membrana de las vellosidades,

real time PCR

determinaciones

Salmonella enterica

Lawsonia intracellularis

Clostridium perfringens

Brachyspira hyodysenteriae

Brachyspira pilosicoli

Brachyspira intermedia

PEDV

muestras

H 1-3

Neg.

Neg.

Positivo (36,7)

Neg.

Neg.

Neg.

Neg.

factores de virulencia de Escherichia coli

gen eae

AIDA

F4

F5

F6

F41

F18

STa

STb

Stx2e

LT

EAST

Escherichia coli

Neg.

Neg.

Positivo (30,5)

Neg.

Neg.

Neg.

Positivo (13,96)

Positivo (13,77)

Positivo (16,33)

Positivo (19,96)

Positivo (15,34)

Neg.

Positivo (15,47)

Neg.

Neg.

Neg.

Neg.

Neg.

Neg.

Positivo (18,48)

Positivo (18,23)

Positivo (21,02)

Neg.

Positivo (19,96)

Neg.

Positivo (19,92)

determinaciones

H 1-3 ID

muestras

Page 20: diagnóstico de procesos digestivos en porcinoCon la tinción de Gram se observan grupos de bacterias Gram negativas, algunas de ellas adheridas a la membrana de las vellosidades,

comentario del caso

Se enviaron muestras al laboratorio para confirmar la sospecha clínica de diarrea postdestete por colibacilosis. Los veterinarios responsables querían además descartar otras causas infecciosas de diarreas.

Para ello realizamos el panel digestivo de animales de cebo/adulto:

Por qPCR se descartó la presencia de Salmonella entérica, Lawsonia intracellularis, Brachyspira hyodysenteriae, Brachyspira pilosicoli, Brachyspira intermedia y PEDV.

Clostridium perfringens se detectó por PCR en concentraciones muy bajas ya que Cl. perfringens forma parte de la microbiota normal del digestivo, por lo que no justifica la clínica de los animales.

Se obtuvo un cultivo masivo de Escherichia coli beta hemoítico en todas las muestras analizadas.

Se realizó la detección de genes de factores de virulencia de Escherichia coli relacionados con diarreas postdestete y enfermedad de los edemas:

En la muestra de I. delgado encontramos un patrón de E. coli enterotoxigénico (ETEC) siendo positivo a F18, Sta, Stb y LT.

En el pool de los 3 hisopos rectales de animales con diarreas encontramos los factores presentes en la muestra de I. delgado. Además se detectaron en menor concentración (Valor Cq más alto) la fimbria F4 (relacionada con diarreas posdestete) y Stx2e (shigatoxina causante de enfermedad de los edemas).

Estos resultados confirman la presencia de ETEC en las muestras estudiadas confirmándose la diarrea postdestete por colibacilosis. Además nos indica la presencia de cepas minoritarias de E. coli portadores de genes de Stx2e, lo que nos alerta del riesgo de cuadros de enfermedad de los edemas en la explotación.

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muestras recibidas

observaciones macroscópicas

5 lechones de 3-4 días de vida que presentan diarreas neonatales

Todos los lechones presentan lesiones similares:

Zona perineal manchada de heces

Estómago repleto de leche

Intestinos delgados e intestinos gruesos congestivos con contenido semifluido de color amarillento

diarrea neonatal, caso mixto Escherichia coli + Clostridium difficilecaso4

diagnóstico solicitadopanel digestivo lactantes

cultivo microbiológico

crotal

ID – 1

ID – 2

ID – 3

ID – 4

ID – 5

IG – 1

IG – 2

IG – 3

IG – 4

IG – 5

identificación

Escherichia coli**

Escherichia coli***

Escherichia coli*

Escherichia coli***

Escherichia coli***

Escherichia coli**

Escherichia coli**Clostridium difficile**

Escherichia coli**Clostridium difficile*

Escherichia coli**Clostridium difficile**

Escherichia coli***

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antibiograma: Bacteria y crotal: Escherichia coli aislada en ID2

Antibiótico Resultado Diámetro (mm) Referencia (mm)

D-Amoxicilina Resistente 0 14 21

D-Ampilicina Resistente 0 13 17

D-Penicilina Resistente 0 29 29

D-Bacitracina Resistente 0 8 13

D- Trimetoprim/sulfametoxazol Sensible 34,3 10 16

D-Tetraciclina Resistente 8,1 18 23

C-Apramicina Resistente 17,1 19 23

C-Gentamicina Sensible 22,5 12 16

C-Neomicina Sensible 19,5 12 17

C-Espectinomicina Sensible 20,8 10 14

C-Estreptomicina Resistente 9,3 11 15

C-Amoxicilina + ácido clavulánico Intermedia 13,5 13 18

C-Florfenicol Intermedia 21 18 22

C-Tianfenicol Intermedia 13,2 12 18

C-Cefalotina Intermedia 17,7 14 18

C-Clindamicina Resistente 0 14 21

C-Eritromicina Resistente 9,6 13 23

C-Gamitromicina Intermedia 15 11 15

C-Tilmicosina Resistente 8,3 11 11

C-Tiamulina Sensible 11,7 9 9

B-Cefquinoma Sensible 33,4 18 22

B-Ceftiofur Sensible 28 17 21

B-Colistina-sulfato Sensible 14,6 8 11

B-Enrofloxacina Intermedia 22,5 18 23

B-Marbofloxacina Sensible 24,6 14 20

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histopatología

Animal nº1

Intestino delgado. No se observan lesiones macroscópicas ni microscópicas. Histológicamente se observa un acortamiento y ensanchamiento de las vellosidades, con leve aplanamiento del epitelio y proliferación leve de bacilos gram negativas en el contenido.

Colon. No se observan lesiones macroscópicas. Histológicamente se aprecia leve congestión de vasos del mesocolon.

Animal nº2

Intestino delgado. No se observan lesiones macroscópicas ni microscópicas.

Colon. No se observan lesiones macroscópicas ni microscópicas.

Animal nº3

Intestino delgado.No se observan lesiones macroscópicas ni microscópicas.

Colon. No se observan lesiones macroscópicas. Histológicamente se observa abundante moco sobre la superficie del epitelio y proliferación de bacilos gram positivos en el contenido. Congestión de vasos del mesocolon.

Animal nº4.

Intestino delgado. No se observan lesiones macroscópicas ni microscópicas. Longitud de las vellosidades normal.

Colon. No se observan lesiones macroscópicas. Histológicamente se observa abundante moco sobre la superficie del epitelio, proliferación de bacilos gram positivos en el contenido y congestión de vasos del mesocolon.

Animal nº5.

Intestino delgado. No se observan lesiones macroscópicas. Moderada autolisis de la mucosa que impide una valoración de las posibles lesiones.

Colon. No se observan lesiones macroscópicas. Histológicamente se observa abundante moco sobre la superficie del epitelio y proliferación de cocos gram positivos en el contenido.

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comparación fenotópica de cepas de E. coli

Dado el interés del veterinario en la posible aplicación de una autovacuna se procedió al estudio de variabilidad de cepas presentes en la muestra. Se analizaron 15 aislamientos de E. coli (3 aislamientos por muestra analizada)

La línea de puntos representa el punto de corte. Todas las cepas o aislamientos que formen un grupo (o cluster) a la derecha de esta línea pertenecen a la misma cepa y cada uno de ellos aparece representado en un color distinto (salvo las representadas en gris, constituidas por una única cepa).

Se encontraron varias cepas distintas siendo las mayoritarias:

Cepa 5 (azul) engloba dos aislamientos, presente únicamente en la muestra 2

Cepa 6 (naranja) engloba seis aislamientos, presente en muestras 3 y 4

Cepa 7 (roja) engloba 3 aislamientos, presente en muestras 1 y 5.

real time PCR

determinaciones

Rotavirus tipo A

Rotavirus tipo C

PEDV

Eimeria sp.

Isospora suis

Clostridium perfringens

Clostridium difficile

muestras

ID 1-5

Positivo (22,5)

Neg.

Neg.

Neg.

Neg.

Positivo (30,50)

Positivo (22,0)

Page 25: diagnóstico de procesos digestivos en porcinoCon la tinción de Gram se observan grupos de bacterias Gram negativas, algunas de ellas adheridas a la membrana de las vellosidades,

factores de virulencia de Escherichia coli

gen eae

AIDA

F4

F5

F6

F41

F18

STa

STb

Stx2e

LT

EAST

Escherichia coli

Neg.

Neg.

Positivo (20,3)

Neg.

Positivo (32,0)

Neg.

Neg.

Positivo (21,0)

Neg.

Neg.

Neg.

Neg.

Positivo (19,8)

Neg.

Neg.

Positivo

Neg.

Neg.

Neg.

Neg.

Positivo

Neg.

Neg.

Neg.

Neg.

Positivo

Neg.

Neg.

Neg.

Neg.

Neg.

Neg.

Neg.

Neg.

Neg.

Neg.

Neg.

Neg.

Positivo

Neg.

Neg.

Neg.

Neg.

Neg.

Neg.

Neg.

Neg.

Neg.

Neg.

Neg.

Neg.

Positivo

determinaciones

ID 1-5 Cepa 6Cepa 5 Cepa 7

muestras

comentario del caso

En este caso los resultados apuntan a un proceso mixto por varios patógenos:

Se ha detectado Escherichia coli en todas las muestras. La comparativa de Escherichia coli muestra muy poca variabilidad de cepas en los lechones que presentan lesiones, evidenciando la presencia de 3 cepas mayoritarias. Una de ellas (cepa 6) es una cepa enterotoxigénica (portadora de la fimbria F4 y la toxina termoestable Sta).

Tres animales son positivos a Clostridium difficile. Las lesiones a nivel histológico junto con el resto de resultados laboratoriales indican que Clostridium difficile juega un papel muy importante en este caso y se ha confirmado que las cepas aisladas son toxinogénicas (productoras de toxinas A+B).

Se detectó la presencia de Clostridium perfringens mediante qPCR en concentración media-baja, sin embargo histológicamente no se observaban lesiones en el intestino delgado de estos animales, no considerándolo, por tanto, un agente primario.

En cuanto a Rotavirus tipo A solo se han detectado lesiones compatibles en uno de los 5 lechones analizados (Animal 1). Si bien es importante tenerlo en cuenta de cara a la prevención de la diarrea, no se considera el agente con más peso en el proceso.

Se descarta la implicación de PEDV y Coccidios.

En este caso se recomendó, entre otras medidas de manejo, el uso de una autovacuna combinada frente a Clostridium difficile y Escherichia coli

Page 26: diagnóstico de procesos digestivos en porcinoCon la tinción de Gram se observan grupos de bacterias Gram negativas, algunas de ellas adheridas a la membrana de las vellosidades,

disentería por Brachyspira hyodysenteriaecaso5

muestras recibidas

heces de hembras adultas

A las tres semanas tras el destete comienzan con diarreas, algunas de ellas con restos de sangre.

Se sospecha clínica de disentería, por lo que se solicitó un diagnóstico diferencial.

diagnóstico solicitado: panel disentería

cultivo microbiológico

crotal

H – 1 H – 2H – 3

identificación

Brachyspira hyodysenteriae***Brachyspira hyodysenteriae***No hay aislamiento de Brachyspira sp.

Page 27: diagnóstico de procesos digestivos en porcinoCon la tinción de Gram se observan grupos de bacterias Gram negativas, algunas de ellas adheridas a la membrana de las vellosidades,

concentración mínima inhibitoria (CMI): Bacterial y crotal: Brachyspira hyodysenteriae aislada en Heces 2

Antibiótico Resultado Sensible

D- Doxiciclina 4 ≤0,5

C- Lincomicina 25 ≤50

C- Tilvalosina 2 ≤1

C- Tylosin Tartare 50 ≤16

C- Tiamulina 8 ≤1

C- Valnemulina 2 ≤0,125

real time PCR

determinaciones

Rotavirus tipo A

Rotavirus tipo C

PEDV

Eimeria sp.

Isospora suis

Clostridium perfringens

Clostridium difficile

muestras

ID 1-5

Positivo (22,5)

Neg.

Neg.

Neg.

Neg.

Positivo (30,50)

Positivo (22,0)

comentario del caso

Los resultados de las pruebas realizadas confirmaron que los animales estaban sufriendo un cuadro de disentería por una cepa de Brachyspira hyodysenteriae resistente a la mayoría de los antibióticos indicados frente a ella, siendo sensible solamente a Lincomicina pero a concentraciones altas, cercana a concentraciones consideradas resistentes.

Se descarta el resto de agentes implicados en diarreas de animales destetados.

Se establecieron medidas de manejo para el control ayudándose de una autovacuna frente a Brachyspira hyodysenteriae.

Page 28: diagnóstico de procesos digestivos en porcinoCon la tinción de Gram se observan grupos de bacterias Gram negativas, algunas de ellas adheridas a la membrana de las vellosidades,

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