BOLETÍN MENSUAL DICIEMBRE 2010DEPARTAMENTO DE BIOQUÍMICA Y BIOLOGÍA MOLECULAR

FACULTAD DE CIENCIAS - UAEM

Este boletín inicia entre nosotros, profesores y estudiantes, con la intención de compartir lo que hacemos día a día y de nutrirnos de información relevante para el desarrollo de nuestro trabajo. En los últimos años nuestra área ha gozado de un importante incre-mento en el número de alumnos que ingresan, este aumento debe ir acompa-ñado de una creciente unión entre todos nosotros para fortalecer nuestras activi-dades como Profesores-Investigadores pero también como estudiantes, estudiantes que vean que lo verdaderamente importante no es pasar materias sino acumular herramien-tas que les permitan como profesionales descubir, entender y manipular procesos biológicos.

Si tienes alguna información que consi-deres incide para fortalecernos como depar-tamento envíalo a duncker@uaem.mx para publicarlo en este boletín, que es de profe-sores y alumnos.

ARTICULOS CIENTÍFICOS DE INTERÉS

TOP 7 EN INMUNOLOGÍA haz click

Stress in Biomedical Research:Six Impossible ThingsDouglas R. GreenMolecular Cell 40, October 22, 2010Link a un interesante y divertido artículo que habla sobre el estrés que causa ser un investigador biomédico (enviado por Dra. Nina Pastor).

KL Olszewski et al. Branched tricarboxylic acid metabolism in Plasmodium falci-parum. Nature 466, 774-778 (5 August 2010).En la mayor parte de los seres vivos, varios de los procesos químicos princi-pales involucrados en convertir los nutri-entes en energía estan unidos a través del ciclo tricarboxílico. Recientemente se ha descubierto que el parásito Plasmo-dium falciparum que causa la malaria usa

una vía metabólica ramificada en vez de un ciclo, esta vía no ha sido detectada previamente en otros organismos.

EVENTOS CIENTÍFICOS 2011

Keystone Symposia

Gordon Conferencesl

Eventos del Laboratorio Europeo de Biología Molecular

Curso- Taller, "Detección de Organismos Genéticamente Modificados (OGM)". UAM-Iztapalapa. 10-17 Enero

BIOINFORMATICS 2011 - International Conference on Bioinformatics Models, Methods and AlgorithmsRoma, Italia. 26-29 Enero

RNAi2011 Oxford, UK. 29-31 Marzo

The 21st Annual Meeting of the Society for Virology. Freiburg, Alemania23-26 Marzo

18th Plant Biology Symposium. Univer-sity Park, USA. 18-21 Mayo

16th edition of the European Carbohy-drate Symposium (EUROCARB)Sorrento, Italia. 3-7 Julio

15th International Congress of Mucosal Immunology. París, Francia. 5-9 Julio

Plant Biology 2011Minneapolis, USA. 6-11 Agosto

pXVth International Congress of Virology. Sapporo, Japón. 11-16 Septiembre

12th International Congress of Human Genetics. Montreal, Canadá. 11-15 Oct

7th International Conference on Proteo-glycans. Sidney, Australia. 16-21 Octubre

13th IUBMB Conference and 3rd National Meeting of the Signal Transduction Branch of the Sociedad Mexicana de Bio-química. Cell Signaling Networks Confe-rence Mérida, Yucatan. 22-27 Octubre

LA VIDA EN LOS LABSLABORATORIO DE VIROLOGÍADr. Ramón González García CondePágina webLic. en C. Elizabeth Castillo. Doctorado en Ciencias. FC- UAEM. Análisis del mecanismo de exportación selectiva de los mRNA virales tardíos, en células no transformadas, infecta-das con adenovirus.Lic. en C. Margarita Valdés. Maestría en Ciencias Bioq. IBT-UNAM. Reorganización de estructuras celulares como consecuencia de la infección por Ad5 en células humanas no transformadas.Azul Guzmán. Tesis de Licenciatura. Fac. de Ciencias Biológicas, UAEM. Papel de la fosforilación de la E1B 55 kDa en el ciclo de replicación de adenovirus.Melissa Navarro. Tesis de Licenciatura. Facultad de Ciencias, UAEM. Señalización de IRF3 en la activación de PML en células infectadas con adenovirus. Paloma Hidalgo. Tesis de Licenciatura. Facultad de Ciencias, UAEM. Análisis de ácidos nucleicos en los centros de replicación de adenovirus.Dipl. biol. Melanie Schmid. Doctorado. Estancia de Investigación. Department of Molecular Virology. Heinrich-Pette-Institut Alemania. Vía de exportación selec-tiva de los mRNA virales por las E1B 55 kDa y E4 Orf6 de adenovirus.Beatriz Roncero. Licenciatura. Estancia de Investigación. Universidad Pablo de Ola-vide, España. Análisis de proteínas en los centros de replicación de adenovirus.Vacantes para estudiantes de Maestría o Doctorado.-Diseño y construcción de recombinantes de adenovirus con alteraciones dirigidas en los oncogenes E1B y E4.-Regulación postranscripcional por los oncogenes E1B y E4 de adenovirus.d

LABORATORIO DE HEMOGLOBINASDr. Raúl Arredondo PeterPágina webMariel Ruiz Kubli. Tesis de Licenciatura Facultad de Ciencias, UAEM. Análisis de la estructura y expresión de los genes de hemo-globina 3 y 4 del arroz (Oryza sativa) var. Mo-relos.

Fernando Martínez. Tesis de Licenciatura Facultad de Ciencias, UAEM. Análisis de los genes de hemoglobina en el genoma del musgo Physcomitrella patens. Saraí Castro Bustos. Tesis de Licenciatura. Facultad de Ciencias Biológicas, UAEM. Detección de iso-hemoglobinas en los órga-nos del arroz (Oryza sativa) mediante enfoque isoeléctrico y Western blot. Gustavo Rodríguez Alonso. Tesis de Licenciatura. Facultad de Ciencias-UAEM. Determinación de la variabilidad de los genes de hemoglobina 1 a 5 en el arroz (Oryza sativa) var. Morelos.

LABORATORIO DE GLICOBIOLOGÍADr. Iván Martínez DunckerPágina webM.B. Roberta Salinas MarínDoctorado en Ciencias - UAEMEfecto del Knock down del gen que codifica para el transportador de CMP-Ácido siálico sobre el perfil de sialilación celular en la línea celular de hepatocarcinoma humano Hep G2Lic. en C. Enrique Villanueva CabelloDoctorado en Ciencias - UAEMEfecto de la hiperamonemia sobre la siali-lación celular en Linfocitos T CD4+ murinos.L. en C. Tania Villanueva Cabello Maestría en Ciencias Bioq. IBT-UNAMEstudio Integral de la maquinaria de siali-lación celular durante la activación y polar-ización de linfocitos humanos T CD4+ naive.Kathya Gutiérrez HuanteMaestría en Ciencias - UAEMCaracterización funcional de la proteína humana SLC35B4 en el transporte de GDP-Fucosa en el Retículo endoplásmico.Alejandro Olea. Tesis de LicenciaturaEfecto de la hiperamonemia sobre la siali-lación celular en neutrófilos humanosVacantes para Tesis de LicenciaturaRegulación de la enzima GNE durante la acti-vación de linfocitos T CD4+ naive humanos

LABORATORIO DE INMUNOLOGÍADra. Angélica Santana CalderónLic. en M. Ariel Galindo Albarrán. Doc-torado en Ciencias. FC- UAEM. Regulacíon epigenética durante la activación de linfocitos T CD8 neonatalesLic. en C. Otoniel Rodríguez Jorge. Mae-stría en Ciencias. FC-UAEM. Caracter-ización de la expresión de Receptores tipo Toll (TLRs) en membrana plasmática de linfocitos T de neonato y adulto. Un enfoque en la regu-lación de su expresión por las señales de CD43 y el efecto que esto tiene sobre la función de los linfocitos T.Zeferino Galarza Brito. Maestría. Inmuno-biología de linfocitos T neonatales. Caracte-rización de la proliferación, proporcion de ERT y repertorio inmunológico de linfocitos T neo-natales en comparación con linfocitos T de adultos.Rosario Labastida Conde. Tesis de Licen-ciatura. Facultad de Ciencias, UAEM. Localización en la membrana celular de los receptores TLR5, IL-4Ra, el TCR e IFNgRa en función de las señales del (co-receptor) CD43 en linfocitos T de neonatos y adultos huma-nos.Vacantes. Consultar Boletín Enero 2011

LABORATORIO DE FISIOLOGÍA Y DESARROLLO VEGETALDra. Verónica Lira Ruan (Katerina)Kenya León Carbajal. Licenciatura. Facul-tad de Ciencias Biológicas, UAEM. Empleo del musgo Physcomitrella patens para la expresión heteróloga de proteínas; el caso de la peroxidasa versátil de Bjerkandera adusta.

Tenemos sitio para 1-2 estudiantes de licen-ciatura para que desarrollen investigación en un proyecto sobre la generación y efecto del óxido nítrico en el desarrollo del musgo Physcomitrella patens.

El interés del laboratorio es estudiar la gen-eración enzimática del gas óxido nítrico (NO) en plantas. El NO es un gas que fun-ciona como regulador del crecimiento y el desarrollo en plantas y animales.

Sin embargo, el origen enzimático del NO en las plantas es un tema de debate, ya que no ha sido posible establecer sin lugar a dudas cuantos y cuales enzimas participan en la generación de NO en las plantas superiores. Además, la manera en que el NO actúa durante el crecimiento y el desarrollo de las plantas es una materia de gran desarrollo en la actualidad. En mi laboratorio abordamos estos temas con un enfoque nuevo, investiga-mos los orígenes y función del NO en musgos que son los representantes actuales de las primeras plantas terrestres. Esto agrega un elemento evolutivo al desarrollo de esta línea de investigación que la hace aún más intere-sante.LABORATORIODra. Nina Pastor ColónHay dos líneas de investigación:a) reconocimiento específico entre pro-teínas y DNA: en colaboración con Javier Aguilar y Verónica Narváez, se busca un(a) estudiante de licenciatura interesado(a) en ingeniería de proteínas. Se trata de hacer mutaciones puntuales en la proteína de unión a la caja TATA (TBP), para lograr un cambio de especificidad, y que reconozca cajas TATA diferentes en una o dos posicio-nes. Estas mutaciones fueron predichas en la tesis doctoral de César Millán, y ahora se trata de hacerlas en el laboratorio.En colaboración con Carlos Amero, inicia-mos un proyecto sobre la dinámica de dos recombinasas (la de Cre y la del fago lambda), las cuales son homólogas estruc-turales pero aparentemente tienen dinámi-cas diferentes. Para este proyecto se solici-tan estudiantes de licenciatura o posgrado interesados en aprender a hacer dinámicasmoleculares y a analizar las propiedades estructurales y dinámicas de proteínas.

b) plegamiento y estabilidad de proteí-nas: en colaboración con Alejandro Fernán-dez de la Fac. de Medicina-UNAM, estudia-mos la estabilidad y ruta de plegamiento del dominio variable de cadena ligera de inmu-noglobulinas humanas. Estos dominios se expresan en exceso en pacientes con

LA VIDA EN LOS LABS

amiloidosis de cadena ligera, formando fibras amiloides que se depositan en corazón, riñón e hígado, matando al paci-ente al año del diagnóstico. No se sabe por qué este dominio cambia de conformación, y el proyecto busca caracterizar la estruc-tura y dinámica de las semillas de estas fibras. En el laboratorio hacemos simulacio-nes de la ruta de desplegamiento, y en la Fac. de Medicina se hacen los experimentos de biología molecular y bioquímica correspon-dientes. Se buscan estudiantes de licencia-tura o posgrado, que les gusten las proteí-nas y las computadoras. Es indispensable que sepan linux (o alguno de sus seme-jantes ... no Windows), y que les apasionen las estructuras y los mecanismos molecula-res.

LABORATORIO DE BIOLOGÍA DELDESARROLLODr. Javier Aguilar Fuentes

Ulises Moreno Celis. Facultad de Nu-trición, UV. Búsqueda de grupos de neuronas que inervan el corazón en líneas trangénicas de Drosophila.Eutimio Fernando Aponte Sánchez. Fac-ultad de Ciencias, UAEM. Bases genéticas de la función neuronal que controla el ritmo y la frecuencia cardíaca.Sandra Rivera Gutiérrez. Facultad de Arquitectura, UAEM. La Arquitectura Neuro-nal que regula el ritmo y la frecuencia car-diaca de Drosophila.Erick Fernando Sánchez Castillo. Facultad de Ciencias Biológicas, UAEM. Bases gené-ticas y moleculares de la regeneración.Rogelio Pérez Reyes. Facultad de Ciencias Biológicas, UAEM. Búsqueda de fármacos antiarritmicos utilizando a la optogenética.Marco Antonio Rosales Vega. Facultad de Ciencias, UAEM. Control optogénico de la función neuronal que regula el ritmo y frecuencia cardiaca.Lic en C Genómicas Sofía González Sali-nas. Estudiante de Doctorado. Instituto de Neurociencias, UNAM. Drosophila siente el miedo de igual manera que el humano.

Biól. Raúl García Sánchez. Técnico aca-démico, UAEM. Generación de líneas mu-tantes de Drosophila mediante la movili-zación de tranposones.

Se solicitan estudiantes para desarrollar tesis de licenciatura y posgrado en los temas antes mencionados y en los que se enlistan a continuación:“Secuenciación de sitios que aumentan los niveles de transcripción de genes neuronales (“enhancers”) en el genoma de Drosophila”.“Neuropéptidos que despiertan una atracción sexual casi fatal.

Una de la principales causas de muerte en los países desarrollados y en México son las enfermedades del corazón (cardiopatías). El mal pronóstico de las cardiopatías y la falta de opciones tera-péuticas o un mal tratamiento para esta-bilizar la salud del individuo llevan a una muerte anticipada. Existen evidencias que sugieren que las cardiopatías son causadas por defectos genéticos. Sin em-bargo, las dificultades inherentes a hacer experimentos genéticos en modelos de mamíferos restringen fuertemente la po-sibilidad de identificar a estos genes.

Además, las arritmias adquiridas y he-reditarias de los mamíferos conducen a una muerte súbita haciendo el estudio de las interacciones genéticas o enferme-dades poligénicas muy difícil. Reciente-mente se han empezado a incluir en estos estudios a C. elegans y Drosophila (la mosca de fruta). El corazón de la mosca ha sido un excelente modelo para el estu-dio del desarrollo del sistema cardiovas-cular. En este modelo se descubrió el gen maestro tinman que determina el desar-rollo del corazón. Interesantemente, tam-bién el gen homólogo a tinman en el humano es el factor determinante del de-sarrollo del corazón.

LA VIDA EN LOS LABS

Además, Drosophila posee la mayoría, si no es que todos, los neurotrans-misores y moléculas involucradas en la liberación y reciclaje de vesículas sináp-ticas, los receptores y canales involucrados en la neurotransmisión y en los me-canismos de transducción de señales relacionados con la función neuronal y cardíaca en vertebrados. Lo anterior prueba que la arquitectura molecular del sistema nervioso y cardíaco de vertebrados e invertebrados se comparte am-pliamente. Aún cuando se sabe que hay muchas proteínas y metabolitos homólogos entre un modelo animal como la mosca de la fruta y el humano se desconoce mucho de las bases genéticas de las funciones celulares. Por tal razón nuestro grupo de trabajo tiene como objetivo fundamental descubrir las bases genéticas y moleculares de la función neuronal que controla el ritmo y frecuencia cardiaca.

Por otra parte, la susceptibilidad a determinados fármacos depende de facto-res genéticos y ambientales, así como a las complejas interacciones entre éstos. El componente genético es posiblemente multigénico y heterogéneo, ha-ciendo que la identificación de “genes específicos de respuesta ante fármacos“ sea una tarea difícil. Esta complejidad aunada al alto costo de los estudios en humanos ha llevado a la implementación de modelos animales para evaluar el efecto de fármacos. Los estudios con modelos mamíferos han permitido la identificación de blancos moleculares, sistemas neuroquímicos y regiones cerebrales que regulan algunas de las propiedades de los fármacos. En la ac-tualidad se han empezado a incluir en estos estudios a animales invertebrados como Drosophila. La mosca de la fruta provee información sobre los mecanis-mos básicos del efecto de los fármacos debido a una fácil manipulación gené-tica, anatomía simple y a su similitud molecular con los mamíferos. Además, el análisis farmacológico de un gran número de animales genéticamente idénti-cos reduce la variabilidad y permite encontrar observaciones que alcanzan la significancia estadística. Por tales motivos otro objetivo de nuestro laboratorio es buscar masivamente compuestos derivatizados de fármacos antiarrítmicos ya existentes y fármacos no caracterizados con un efecto antiarrítmico en la mosca de la fruta.

¡Suerte a todos en sus examenes departamentales!

!Ricas Vacaciones y Feliz Año!

Nos vemos en Enero 2011

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LA VIDA EN LOS LABS