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Uso de programaslibres en ciencia

JornadasIPErinas 2014

Miguel Sevilla-Callejo<[email protected]> Paleo-IPE research group

Instituto Pirenaico de Ecología – CSIC | 11 Diciembre 2014

M. Sevilla-Callejo 2014 2

mi trabajo en el IPE

● proyectos DINAMO y DINAMO2– secuencias lacustres interior peninsular

● asistencia técnica Paleo-IPE– gestión BD– repositorio de archivos centralizado

● análisis espacial ygeneración cartográfica devariables ambientales


Paleo-IPE sites

~50 registros

32 lagos

VillarquemadoConquezuela


Paleo-IPE DB

modelo lógicode la base dedatos del equipo(lagos)


desde enero 2010

● problemas y dificultades... – equipo potente y SO mediocre– dependencia de las licencias

● uso ya programas libres y de código abierto– Firefox, QGIS, Zotero, Inkscape, LibreOffice, GIMP...

● instalo GNU/Linux (Ubuntu 10.10)● pocos problemas al migrar... soy feliz :-)


software libre

● Free & Open Source Software (FOSS)● fredoom to use, share, study & modify

– libertad para uso– libertad para compartirlo– libertad para examinar su código (cómo funciona)*– libertad para mejorar su funcionamiento (su código)*

● * requiere ser de código abierto (Open Source)


importancia de FOSS en ciencia

23 FEBRUARY 2012 | VOL 482 | NATURE | 485

http://www.nature.com/nature/journal/v482/n7386/abs/nature10836.html


método científico y FOSS

● reproducir y refutar● las publicaciones científicas

– comunicar resultados– convencer a los lectores de que son correstos

● el uso de programas de código abierto garantizan la transparencia de los resultados frente a las “cajas negras” de programas cerrados (privativos)


Quantum GIS

● FOSS desktop GIS● datos vectoriales y ráster● OGC (WMS, WFS, WCS...)● BD espaciales● generación de modelos● producción cartográfica


QGIS – extensiones

● para todos los gustos

– GRASS

– DBManager

– procesamiento

– openlayers● en crecimiento

constante


QGIS – Processing Toolbox

● algoritmos de procesamiento espacial– GRASS– SAGA– GDAL/OGR– R – otros


QGIS – Processing modeler

● heredero del modelador de SEXTANTE● graphical modeler


bases de datos espaciales

● ventajas comparativas a viejos sistemas: rapidez, estabilidad, multiusuario...

● di adios a los “chapefiles” de ESRI● principales sistemas libres

– SpatiaLite (SQLite)● sistema de cliente/servidos en un archivo

– PostGIS (PostgreSQL)● sistema tradicional de servidor y cliente


ejemplos de cartografía


datos en abierto

● servicios OGC:– WMS, WFS, WCS

● portales de descarga– IDEE, IDEAragon...– CNIG-IGN

● openstreetmap.org● petición de datos... ¡no te cortes!


Zotero

● gestión bibliográfica avanzada


Inkscape

● diseño vectorial


R & RStudio

● no comments...


otros programas libres

● programas de calidad listos para un entorno productivo– Navegación web: Firefox– Ofimática: LibreOffice– Edición imágenes: GIMP– Retoque fotográfico: Darktable– y muchos más

M. Sevilla-Callejo 2014 27imagen de cool-retro-term en thefreecountry.wordpress.com

GNU/Linux

tal vez pienses que es esto...

foto de theinfamousgdub en Flickr


Linux Mint 17 – Numix theme

GNU/Linux

… pero en en realidad es esto:


GNU/Linux

y está dentro de esto...

Raspberry Pi Model A

IBM Roadrunner

Google/LG Nexus 5

fotos de Wikipedia


curva de aprendizaje

imagen de Bruno Oliveira en su Google+

SE GEEK

https://plus.google.com/+BrunoOliveira/posts/MGxauXypb1Y?pid=5694023113460433314&oid=102451193315916178828


pero todo esto no es fácil ...


tú solo no... con amigos si!

● gente con entusiasmo yganas de aprender

● lista usuarios Linux IPE-CSIC● amplia documentación en red● soporte en comunidad● cursos gratuitos


Gracias por la atención

Presentación realizada conLibreOffice Impress 4.3

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