Sistema Nacional de Vigilancia Epidemiolgica Fitosanitaria

(Informe 2009)

(Nombre Producto)Producto 15

(Productos adicionales)

Sistema Nacional de Vigilancia Epidemiolgica Fitosanitaria

(Informe 2009)

(Productos adicionales) (Nombre Producto)Producto 15

PRODUCTOS ADICIONALES

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Introduccin

SINAVEF tiene como deber difundir las alertas fitosanitarias para la proteccin de la riqueza agrcola en Mxico as como informacin cientfica al personal especializado que lo solicite, esto de la manera ms sencilla y rpida posible, gracias a los avances tecnolgicos esto se hace ms natural de hacer a travs de un portal web, es por ello que nace la plataforma informtica de SINAVEF con personal especializado, adems del hardware y software que sigue las ltimas tendencias en cuanto a innovacin tecnolgica, no solo para dar hospedaje a la pgina web sino tambin resolver las necesidades de clculo especializado como en la realizacin de modelos, comunicacin entre las instituciones involucradas (FTP), y la conjuncin de varias bases de datos.

Para todo esto se requiere una fuerte plataforma de hardware dada por servidores dedicados (Servidores en rack de 2U con 2 procesadores Intel Xeon de 4 ncleos) instalados en el Datacenter de la UASLP donde se encuentran las condiciones climticas y de seguridad necesarias, adems de las conexiones de red de fibra ptica para garantizar la comunicacin. Toda esta informacin digital se encuentra hospedada segn las necesidades de cada producto

Hardware-servidores

Servidor de base de datos

2 Terabytes de capacidad de almacenamiento, pudiendo almacenar por lo tanto millones de datos vinculados al SINAVEF, esta caracterstica en especial nos permite almacenar principalmente las bases de datos a nivel nacional.

2 procesadores Intel Xeon Quad Core de 64 bits a 2.26 GHz, con lo cual tiene una velocidad de procesamiento ms que optima para atender y procesar las distintas peticiones referentes a las Bases de Datos del SINAVEF,

Memoria RAM tipo DDR3 de 16 Gigabytes, para garantizar el mayor rendimiento.

Servidor web

300 Gigabytes de capacidad de almacenamiento, soportando en forma mas que satisfactoria los datos requeridos para la pagina WEB de SINAVEF.

2 procesadores Intel Xeon Quad Core de 64 bits a 2.26 GHz, con lo cual tiene una velocidad de procesamiento ms que optima para atender y procesar las distintas peticiones referentes a la pagina WEB del SINAVEF.

Memoria RAM tipo DDR3 de 16 Gigabytes, para garantizar el mayor rendimiento.

Servidor de aplicaciones

2 Terabytes de capacidad de almacenamiento, ya que las aplicaciones manejadas requieren trabajar con gran cantidad de datos.

2 procesadores Intel Xeon Quad Core de 64 bits a 2.26 GHz, con lo cual tiene una velocidad de procesamiento ms que optima, especialmente por que las aplicaciones asi lo demandan.

Memoria RAM tipo DDR3 de 16 Gigabytes, para garantizar el mayor rendimiento.

Servidor SCOPE

2 Discos duros tipo SATA de 500Gigabytes cada uno, con capacidad total de un Terabyte de almacenamiento.

Tecnologa Raid tipo 1, para garantizar la fiabilidad de los datos.

Procesador Quad Core AMD opteron a 2.3 GHz.

Memoria RAM tipo DDR2 SDRAM de 8GB, para garantizar el mayor rendimiento.

Cada uno de estos servidores cuenta con las siguientes tecnologas

RAID tipos 1 y 5. se realiza un respaldo automtico permanente de los datos almacenados.

Fuente redundante (2 fuentes de alimentacin) , el servidor seguir funcionando sin interrupcin aun cuando se requiera quitar una de las fuentes.

Estas 2 tecnologas nos permiten garantizar la fiabilidad e integridad de los datos aun en caso presentarse un fallo.

Switch Cisco Catalyst 3750

Este switch es necesario para tener acceso a los servidores dentro del dataCenter de la UASLP, ya que se tendrn 3 servidores dentro del Rack o gabinete con pantalla de configuracin.

Protocolo de trasmisin de datos Giga bit Ethernet

Cantidad de puertos :12

Tecnologa de conectividad: Wired (cableada).

Memoria interna 128MB

Dispositivo de alimentacin: Fuente de alimentacin interna

Caractersticas: Conector de sistema de alimentacin redundante (RPS)

Software informtico

Portal web

Sistema Operativo Linux Ubuntu Server versin 9.10.

Entorno de desarrollo en Adobe Flex Builder 3

Lenguaje de servidor PHP

Bases de datos sobre MySQL

Entorno de desarrollo para consultas: Eclipse GALILEO

Biblioteca digital

Sistema operativo Windows Server 2003

Base de datos en SQL Server 2008

Tecnologa Web ASP.NET

Entorno de programacin Visual Studio 2008

Portal SINAVEF

El SINAVEF como una institucin cientfica y gubernamental al generar sus resultados de prevencin epidemiolgica necesita un medio de difusin rpido y oportuno, de ah surge la necesidad de la creacin del portal web (http://portal.sinavef.gob.mx) donde se encuentren publicados los mapas de riesgo, boletines de alerta, fichas tcnicas de plagas as como las metodologas que se utilizan para la generacin de estos productos, haciendo uso de las herramientas de internet en los tiempos actuales permite no solo la difusin del monitoreo epidemiolgico sino tambin se vuelve un medio de interaccin con el pblico especializado en el tema y en el usuario comn.

Haciendo una analoga con APHIS cuya pgina est hospedada en la Universidad de Carolina, el SINAVEF se encuentra hospedado en el centro de datos de la Universidad Autnoma de San Luis Potos, mientras ellos usan la plataforma NAPPFAST para su modelado, el SINAVEF usa la plataforma SCOPE, cuyos desarrolladores pertenecen a la empresa norteamericana ZedX Inc.

Como soporte interno se cre la biblioteca digital que engloba toda la informacin de SINAVEF incluyendo informacin en formato digital como son imgenes de satlite, documentos generados por los investigadores, y otros bancos de datos sobre informacin de plagas tomadas de las bibliotecas cientficas del CABI, Spring Linker entre otros.

Los avances tecnolgicos hoy en da se aceleran a pasos agigantados. Es por eso que el portal de Sinavef es creado con tecnologa informtica de ltima generacin (hardware y software) que se adapte rpidamente a todos estos cambios de la web. Esta tecnologa requiere de complementos as como las ltimas versiones de navegadores web.

Diseo y Programacin de Plataforma SINAVEF

Nuestra diseo y programacin web describen el concepto de SINAVEF; esto es logrado con Adobe Flex ; un framework de desarrollo de aplicaciones web interactivas ricas en contenido (RIA)

La interaccin web y las bases de datos se logran desarrollando sobre el entorno Eclipse Galileo PHP, esto para consultas y respaldos de la BD de SINAVEF.

El portal Sinavef se divide en dos, su sitio pblico (fig1) y su sitio privado (fig2) como se muestran en el siguiente diagrama

Portal SINAVEF en su parte pblica.

Alertas nacionales de plagas.

En esta seccin se muestran las alertas nacionales sobre alguna plaga que est presente en nuestro pas o una nueva alerta de plaga que est afectando.

Top 7 plagas.

En esta seccin se enlistan las 7 plagas que ms afectan a nuestro pas, donde se da una breve explicacin de sus caractersticas y situacin actual en Mxico, su impacto econmico, mapas de distribucin y su boletn.

fig 1.

Inventario Nacional de Plagas.

En esta seccin se muestra informacin detallada del inventario de plagas clasificadas por su reglamentacin, grupo comn, categorizacin y observaciones, adems de poder descargar el archivo del inventario para uso propio.

Priorizacin.

Esta seccin se dedica a Identificar problemas fitosanitarios para priorizar programas, necesidades de investigacin y transferencia de tecnologa.

Climatologa

La seccin de climatologa contiene imgenes y links a sitios de inters, boletn climtico e informacin relacionada.

Regionalizacin.

Se muestra informacin para la deteccin de rutas migratorias y establecer la regionalizacin epidemiolgica de dispersin de plagas y requerimientos bioclimticos, as como su metodologa.

Mapas.

En esta seccin de la pgina se muestran los diferentes tipos de mapas (modelo biolgico, NDVI, Condiciones ambientales ptimas, hospederos, ndice de confort y riesgos) por cada una de las 7 plagas, con la facilidad de descargar las imgenes para su propio uso.

Fichas Tcnicas.

Cada plaga cuenta con una ficha tcnica que describe de manera detallada las caractersticas fsicas, biolgicas, distribucin geogrfica y los sistemas producto que puede afectar.

Percepcin Remota.

Seccin orientada al uso de la percepcin remota como herramienta importante en el diagnstico y monitoreo de hospederos. Brinda informacin de la metodologa usada en la aplicacin de la misma en la vigilancia fitosanitaria.

Biblioteca Digital Fitosanitaria.

La biblioteca de SINAVEF proporciona los recursos que se encuentran disponibles en formato digital (pdf, doc, imgenes, formatos, etc.), accesible por medio de la computadora. Esta plataforma integra la informtica y la comunicacin entre el personal que tenga acceso.

Portal SINAVEF en su parte privada.

Base de datos de inventario nacional de plagas.

En esta seccin es posible consultar, agregar y modificar informacin de la base de datos del inventario de plagas, esta seccin va dirigida especficamente a gente especializada (cientficos) para darle un uso correcto y actualizacin de nuestro inventario.

Base de datos de los sistemas producto. fig 2.

En esta seccin se puede consultar por estado y/o municipio los hospederos con informacin por ao sobre las superficies sembradas, cosechadas, su produccin total y su valor en pesos, as como tambin se pueden consultar por el top 7 de plagas nacionales a los cultivos que afecta, su rendimiento y valor.

Consulta de boletines actuales de plagas

En esta seccin es posible consultar los boletines actualizados para que gente especializada tenga acceso a ellos con el fin de asegurarse que tengan el visto bueno para as ser publicadas a los usuarios en general.

Sistema de alertas SINAVEF

Seccin exclusiva para la retroalimentacin de los usuarios hacia el sistema; en esta parte se puede dejar un mensaje, alerta o comentario para que la gente especializada vea el mensaje y dependiendo de la complejidad, se tomen las medidas requeridas.

Bases de Datos SINAVEF

Las Bases de Datos en SINAVEF almacenan una coleccin de registros (datos o archivos) que relacionados lgicamente, componen un banco de datos para proveer informacin necesaria para uno o mltiples usuarios, inclusive a personas externas a SINAVEF, con la seguridad necesaria que con lleva el permitir accesos externos.

La arquitectura de la Base de Datos de SINAVEF se basa en un modelo relacional para la conectividad entre registros; gracias a este modelo de datos es posible conjuntar e interconectar una o ms tablas estructuradas en registros, para que estas se vinculen entre si y as poder determinar la identidad de los datos y que tipo de informacin se puede almacenar en la Base de Datos, un ejemplo del de las Bases de Datos de SINAVEF es:

Nombre de la Tabla

Identificador

Atributos o campos

Este tipo de modelo permite que las bases de datos sean accesibles de forma ms eficaz, segura y adems de garantizar la normalizacin en los datos que esta contenga, como puede ser:

Redundancia en registros o datos (ej. No permite datos duplicados)

Proteccin en la integridad en los datos (ej. cada registro debe contener un identificador nico)

Evitar el redisear por completo la estructura de la BD, cuando se requiere agregar solo algn campo o atributo de uno o ms tablas.

Libre de cualquier anomala al momento de la actualizacin de la BD

El modelo hace la BD ms informativa a los desarrolladores.

La base de datos de SINAVEF est centralizada, es decir se encuentra fsicamente en un solo lugar controlada por una sola computadora, con esto la mayora de las funciones se llevan a cabo ms fcilmente con una BD centralizada. Con esto podemos garantizar que es posible ubicar todos los datos que se necesitan en un solo lugar, adems mejora la relacin entre costo efectividad y autonoma.

(BDInternet)

En SINAVEF manejamos dos grandes Bases de Datos para el funcionamiento interno de SINAVEF como es la biblioteca virtual y nuestro portal de Internet.

Las bases de datos de SINAVEF conjuntan toda aquella informacin generada y recopilada para que el usuario final puede tener acceso a ella, como por ejemplo el consultar el boletn de una plaga, informacin sobre la plaga y hasta poder aportar mayor informacin de una o varias plagas sobre nuestro portal privado.

Toda esta coleccin de informacin agrupada en la base de datos la conforman infinidad de registros recopilados a partir de una categorizacin en la informacin que actualmente se maneja en SINAVEF. Toda esta informacin la conforman dos grandes bases de datos en SINAVEF.

La primera gran Base de Datos es la del Portal SINAVEF, en ella podremos encontrar informacin o tablas unidas relacionalmente, que darn el potencial para mostrar toda aquella informacin relevante a nuestro portal. Esta base de datos esta enriquecida de informacin (tablas, registros y campos) principalmente por:

Datos del Inventario Nacional de Plagas: toda aquella informacin relevante a una plaga como puede ser su estatus, nombre comn, nombre cientfico, claves NAPPO y EPPO. Adems de una actualizacin constante a esta.

Datos Productos / Hospederos: informacin relevante a todos aquellos cultivos que pudiera estar afectados por una o varias plaga.

Informacin sobre exportaciones e importacin y puertos para tener la ubicacin de aquellos lugares donde pudiera entrar o salir una plaga de Mxico.

Datos de Estados / Municipios e inclusive informacin a nivel distrital, para tener un mayor exactitud sobre el monitoreo y vigilancia de una plaga.

El manejo de toda esta informacin hace que sea posible en SINAVEF dar resultados precisos, sobre exactamente donde se est dando una plaga y atacarla en el momento.

La segunda gran Base de Datos de SINAVEF es la Biblioteca Virtual que proporciona los recursos que se encuentran disponibles en formato digital (pdf, doc, imgenes, formatos, etc.), accesible por medio de la computadora. Esta biblioteca integra la informtica y la comunicacin entre el personal que labora en SINAVEF y la informacin digital.

El concepto de la biblioteca virtual de SINAVEF es un espacio que refleja la forma en la que se puede explotar la tecnologa como el internet para tener acceso a la informacin de forma flexible y a la demanda de quien la consulta, adems de fortalecer el manejo de la informacin interna para un mejor resultado. En esta base de datos la conforman informacin de tipo documental, presentaciones, archivos de Word, PDFs, Videos, Imgenes de Satlite y Software. Toda esta informacin proviene de diversas fuentes como son:

Fuentes bibliogrficas y Bases de Datos ya existentes con informacin relacionada a plagas como:

Springer Link

CABI

CabDirect

Crop Protection

As como publicaciones en fuentes de:

PLOS publicaciones

ACS publicaciones

Normas y Legislaciones

Y por supuesto toda esa informacin generada por nuestro personal en SINAVEF, como pueden ser:

Boletines de Plagas

Artculos reglamentados de plagas

Mapas de boletines

Climatologa

Software geogrfico

Imgenes de Satlite

NOA

SPOT

LANDSAT

Presentaciones SINAVEF

Artculos de SINAVEF

Grandes bases de datos requieren un buen manejo de software. Para ellos las bases de datos en SINAVEF son administradas en dos Manejadores de Bases de Datos.

El Portal SINAVEF corre bajo el manejador MySQL.

Un manejador potente en la manipulacin de bancos de datos, con acceso mltiple a diversas bases de datos. Este manejador es multiplataforma, la cual permite ser instalado en Sistemas Operativos como Linux. Es un Software bajo GNU/GPL, siendo as un Software Libre.

La Biblioteca Virtual de SINAVEF corre bajo SQL Server 2008.

Manejador de Datos producido por Microsoft corp. Siendo este un Software de Licencia. Es un administrador de Base de Datos capaz de poner a disposicin toda su informacin a uno o miles de usuarios simultneamente, permitiendo conexiones remotas y una seguridad e integridad nica en la informacin.

Toda la manipulacin en la informacin de nuestras Bases de Datos es por medio del lenguaje de programacin SQL y Sistemas Operativos como Ubuntu Server y Windows Server.

(WindowsServer)

BIBLIOTECA DIGITAL SINAVEF

Objetivo

La biblioteca de SINAVEF proporciona los recursos que se encuentran disponibles en formato digital (pdf, doc, imgenes, formatos, etc.), accesible por medio de la computadora. Esta plataforma integra la informtica y la comunicacin entre el personal que labora en SINAVEF.

El concepto de la biblioteca digital de SINAVEF es un espacio que refleja la forma en la que se puede explotar la tecnologa como el internet para tener acceso a la informacin de forma flexible y a la demanda de quien la consulta.

Bases de Datos

Toda la informacin existente en la biblioteca se conforma de un banco de datos de diversas fuentes para integrar la biblioteca digital SINAVEF. Toda esta informacin es relacionada a temas agropecuarios, plagas, priorizacin, mapas, imgenes de satlite compuestas, software, etc..

Integracin de la Base de Datos

La principal informacin que integra la BD de BVS son:

Creative

CABI

Springer Link

CabDirect

Crop Protection nueva y antigua versin

PLOS Publicaciones

ACS Publicaciones

Libros electronicos (CABI)

Normas y Legislaciones

Informacin ya existente de SINAVEF

La BD de la Biblioteca SINAVEF actualmente cuenta con alrededor 250, 000 archivos almacenados y creciendo.

El sistema operativo utilizado para la biblioteca digital es Windows Server La Biblioteca SINAVEF 2010 esta creada bajo plataforma Microsoft .NET y legnuajes de programacin como C# y comandos SQL

Nuestro banco de datos es almacenado sobre manejadores de base de datos ricos en manipulacin de informacin y alta seguridad.

Las plataformas .NET hace que la integracin con otros software sea posible gracias a libreras que se comparten, debido a que se ejecutan sobre sistemas operativos Windows.

Como resultado final, tenemos la biblioteca digital SINAVEF

(Pantalla de inicio Biblioteca digital SINAVEF)

(Pantalla de buscador archivos ) (Pantalla de buscador de imgenes de satlite)

MUESTREOS SINAVEF

Objetivo

Conjuntar todas aquellas actividades que se realizan en SINAVEF hacia un proceso informtico.

Estos procesos Informticos pueden cooperar en las actividades de SINAVEF, simultneamente en un o mas procesos con un fin determinado.

La informacin de muestreo contiene las siguientes modalidades.

Langosta

Adulto solitario

Adulto gregario

Ninfas solitarias

Ninfas gregarias

El proceso para el muestreo de langosta es el siguiente:

1. Adqisicin de la informacin

2. Procesamiento de la informacin

3. Resultado

4. Creacin de mapa por medio de ArcGis

Proceso de depuracin usuarioNuevo proceso de depuracin usuario

Este resultado se logra con la integracin de Microsoft SQL server con ArcGIS.

El Proceso de Muestreo se encuentra integrado en la biblioteca digital SINAVEF.

SISTEMA DE ALERTAS SINAVEF

Objetivo

El Sistema de Alerta SINAVEF proporciona informacin actualizada sobre situaciones de plagas de importancia para nuestro pas y el extranjero.

El propsito de este sistema es facilitar la toma de conciencia sobre las plagas, su deteccin, prevencin y manejo, as como informar sobre cambios en nuestro portal y actualizaciones de informacin.

La informacin disponible de losboletines fitosanitariosque genera el sistema de alertas te orientan en la toma de decisiones para la deteccin oportuna de las plagas y enfermedades y planes de accin requeridos.

Modo de operacin

Darse de alta en el registro SINAVEF

Se recibe un correo de bienvenida al sistema de alertas.

Peridicamente se estar enviando boletines, informacin, actualizaciones de archivos, cambios en el portal sinavef y nueva informacin agregada al portal.

Para ser usuario del sistema de alertas es necesario registrarte en el sistema de alertas que se encuentra en nuestro portal SINAVEF (http://portal.sinavef.gob.mx/).

A continuacin, es necesario llenar un formulario de datos personales y agregar el correo electrnico al cual sern enviadas las alertas fitosanitarias.

Para finalizar, es necesario aceptar los trminos y condiciones

Trminos y condiciones acceso a la pagina privada SINAVEF.

Al acceder a este sitio, el usuario se compromete a aceptar estas condiciones. Nos reservamos el derecho de modificar estos Trminos y condiciones peridicamente.

Todos los derechos de propiedad intelectual de la informacin y de los contenidos de este sitio web pertenecen al SINAVEF.

El acceso y la utilizacin de la seccin privada de la pgina web del SINAVEF, obliga al usuario la aceptacin de los Trminos y Condiciones de Uso y Privacidad.

A travs del Portal, el usuario acceder y/o utilizar diversos servicios y contenidos.

El usuario tendr acceso a los servicios privados de la pgina web, dando una utilizacin adecuada de la misma.

Se prohbe la modificacin, reproduccin, publicacin o transferencia de cualquier contenido a otras personas, o su uso para fines comerciales. Excepto en la medida en que la ley vigente lo permita, est prohibido desensamblar, descompilar, aplicar ingeniera inversa o intentar por cualquier medio romper la proteccin del contenido.

Cuando el usuario se registro en el sistema de alertas SINAVEF, inmediatamente recibir un correo electrnico dando la bienvenida al usuario.

Sistema de alertas SINAVEF mensajes

Objetivo

El Sistema de Alerta SINAVEF mensajes brinda la opcin de la retroalimentacin de los usuarios registrados a SINAVEF, que tengan la capacidad de generar una alerta o comentario hacia nosotros, para as analizar la situacin y de ser necesario emitir una alerta fitosanitaria.

Modo de operacin

Generar el mensaje de alerta.

El mensaje es recibido por el comit (va email).

El comit decide lo que se tiene que hacer para aprobar el mensaje de alerta.

Si la alerta es de gran importancia, esta deber de ser enviada a todos los usuarios inscritos al sistema de alertas SINAVEF.

Para ingresar al sistema de alertas SINAVEF mensajes, es necesario entrar al portal sinavef en su parte privada (http://portal.sinavef.gob.mx/).

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