Tema 6b. Metabolismo

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  • 7/26/2019 Tema 6b. Metabolismo

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    Tema 6b. El metabolismo

    - Ciclo de Krebs

    - Transporte electrnico y fosforilacin oxidativa

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    Ciclo de Krebs, del cido ctrico o

    de los cidos tricarboxlicos

    Metabolismo energtico y mitocondrias

    Formacin del acetil-CoA: el Complejo Piruvato Deshidrogenasa

    Reacciones del Ciclo de KrebsBalance energtico

    Regulacin del Ciclo de Krebs

    Naturaleza anfiblica del ciclo: conexiones con rutas biosintticas

    y reacciones anaplerticas

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    El metabolismo energtico tiene lugar en las mitocondrias

    Membrana

    interna

    mitocondrial

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    En el metabolismo, el acetil-CoA es una encrucijada

    y la piruvato deshidrogenasa una vlvula metablica

    La descarboxilacin oxidativa del piruvato a acetil-CoA es un proceso irreversible.

    El acetil-CoA se dirige bien hacia la obtencin de energa por oxidacin en el ciclo deKrebs o bien hacia el metabolismo lipdico, sin vuelta atrs metablica posible.

    Por tanto, la Piruvato Deshidrogenasa es una vlvula metablica y un enzima claveen el metabolismo celular.

    Enlace tioster de

    alta energa

    !G0 = - 32,2 kJ/mol

    Piruvato

    Deshidrogenasa

    Protenas

    Ciclo de

    Krebs

    energa

    Aminocidos

    Glucosa

    Piruvato

    Acetil-CoA

    Lpidos

    Acidos grasos

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    Complejo Piruvato Deshidrogenasa

    El CPdH est en la matriz mitocondrial, a donde el piruvato entra gracias a un

    transportador especfico que lo intercambia por OH-.

    Est formado por tres enzimas y cinco coenzimas. Es un prototipode otros

    dos complejos: "-cetoglutarato deshidrogenasa (del Ciclo de Krebs) y "-cetocidodeshidrogenasa (de la degradacin de aminocidos).

    Enzimas

    E1: piruvato deshidrogenasa (TPP)

    E2: dihidrolipoil transacetilasa (lipoamida, CoA)

    E3: dihidrolipoil deshidrogenasa (FAD, NAD+)

    Coenzimas

    TPP: tiamina pirofosfato

    LipoatoCoenzima A

    FAD: flavn adenn dinucletido

    NAD+: nicotinamida adenn dinucletido

    En realidad, la descarboxilacin

    oxidativadel piruvato a acetil-CoA est

    catalizada no por un enzima, sino por el

    Complejo multienzimtico Piruvato

    Deshidrogenasa (CPdH).

    cido lipoico

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    Reacciones del Complejo Piruvato Deshidrogenasa

    La piruvato deshidrogenasa es un

    ejemplo claro de canalizacin de

    sustratos, ya que los intermedios

    de la reaccin nunca abandonan la

    superficie del complejo enzimtico

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    El Ciclo de Krebs, del cido ctrico

    o de los cidos tricarboxlicos, es

    clave en la produccin de energa

    Es la va final comn para la oxidacin de las

    molculas orgnicas: aminocidos, cidosgrasos y carbohidratos.

    Tras ser metabolizadas, entran al ciclo como

    acetil-CoA, que es la unidad bsica decombustible para la oxidacin aerbica.

    El ciclo tiene lugar en la matriz mitocondrial,

    e incluye una serie de reacciones redox queconducen a la oxidacin de un grupo acetilo

    hasta dos molculas de CO2.

    La funcin del ciclo es obtener electrones dealta energaa partir del combustible acetil-CoA.

    Estos electrones son transportados por loscoenzimas NADH y FADH2, que luego los ceden

    a la cadena respiratoria. Ello permite la sntesisde ATP por fosforilacin oxidativa.

    El Ciclo de Krebs, junto con la cadena

    respiratoria y la fosforilacin oxidativa, aportan lamayor parte de la energautilizada por las

    clulas aerobias(en torno al 90-95%).

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    Visin y reaccin global del ciclo de Krebs

    Acetil-CoA + 3 NAD++ FAD + GDP + Pi + 2 H2O

    2 CO2+ 3 NADH + FADH2+ GTP + 2 H++ CoA-SH

    Hay una primera condensacinde un grupo acetilo del acetil-CoA

    con el oxalacetato para dar citrato.

    A nivel energtico, por cada

    acetil-CoA oxidado se obtienen4 pares de electrones y un

    enlace fosfato de alta energa.

    Este es convertido en isocitrato, que sufredos descarboxilaciones oxidativas.

    Luego hay una fosforilacin a nivel de

    sustratoy dos oxidacionesms.

    Adems hay procesos

    de hidrataciny

    deshidratacin.

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    Reacciones del

    Ciclo de Krebs

    Los dos C que salen

    en forma de CO2no

    son los que entraron

    como acetil-CoA

    Membrana

    interna

    mitocondrial

    Similar al CPdH

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    El O2no interviene en el ciclo.

    Sin embargo, el ciclo solo funciona en condiciones aerbicas,

    ya que en la mitocondria slo se puede regenerar el NAD+y elFAD mediante la transferencia de electrones al O2.

    Reacciones del ciclo de Krebs

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    Regulacin de la Piruvato Deshidrogenasa y el Ciclo de Krebs

    En el ciclo de Krebs, la regulacin se hace sobre lacitrato sintasa, isocitrato deshidrogenasay -

    cetoglutarato deshidrogenasa.

    El efecto regulador sobre ellas de los niveles de los

    metabolitos clave hace que el flujo a travs del ciclose ajuste a una velocidad que permita mantenerconcentraciones ptimas de ATP y NADH.

    En condiciones normales, las velocidades de laglucolisis y el ciclo de Krebs estnintegradas.

    La adaptacin de la velocidad de la glucolisis sehace no slo a travs de ATP y NADH, sino tambindel citrato, que inhibe la PFK-1.

    El Complejo Piruvato Deshidrogenasaes reguladode forma integradapor interacciones alostricas y por

    modificacin covalente, que a su vez est regulada por

    los niveles de metabolitos.

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    Naturaleza anfiblica del Ciclo de Krebs: implicacin en

    el anabolismo y reacciones anaplerticas o de relleno

    Varios internediarios del

    ciclo son precursoresanablicos, es decir, que

    pueden ser usados pararutas biosintticas.

    Por ello debe haber

    sistemas para generarloscon rapidez si baja su nivel,

    para que el ciclo sigafuncionando normalmente.

    As, hay cuatro posibles

    reacciones anaplerticasque los reponen a partir de

    piruvato o de PEP.

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    Metabolismo glucdico. Puntos de conexin y metabolitos clave

    1.

    Hexoquinasa

    2. Fosfoglucomutasa

    3. Fosfoglucosa isomerasa

    4. Ruta de las Pentosas fosfato

    5. Lactato deshidrogenasa

    6.

    Alanina aminotransferasa

    7. Glucolisis

    8. Gluconeognesis

    9. Piruvato Deshidrogenasa

    10. Ciclo de Krebs

    11.

    Biosntesis de cidos grasos12. Biosntesis de esteroides

    Cuerpos

    cetnicos

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    Cadena de transporte electrnico

    Conversin del flujo de electrones en energa qumica

    Coenzimas y grupos transportadores de electrones

    Cadena de transporte electrnico mitocondrial

    Generacin del gradiente de protones

    Fuerza protn-motriz y fosforilacin del ADP

    Transporte a travs de la membrana interna mitocondrial y

    lanzaderas de sustrato

    Regulacin de la cadena y la fosforilacin

    Balance energtico

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    La relacin del potencial de reduccin E con la variacin de energa libre G,

    y por tanto con la energa aprovechable metablicamente, viene dada por:

    Ecuacin

    de Nernst

    Mediante el transporte electrnico, las reacciones redox biolgicas

    permiten generar enlaces de alta energa en el ATP

    Los electrones fluyen desde los pares redox con potencial de reduccin E

    ms negativoa aqullos con E ms positivo. El valor del potencial dereduccin viene dado por:

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    Potenciales de reduccin estndar Ede algunas

    semireacciones de importancia biolgica

    Muchos movimientos electrnicos entre

    pares redox biolgicos tiene lugar mediante

    pares de electrones

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    Sistemas transportadores de electrones

    Coenzimas principales

    Son hidrosolubles, e intervienen en muchas reacciones redox metablicas:

    NAD+yNADP+: cofactores mviles, se trasladan de un enzima a otro.

    FAD yFMN: son grupos prostticos de flavoprotenas, a las que estnfuertemente unidas.

    Otros sistemas

    Algunos son protenas de membrana, de los tipos protenas ferrosulfuradas(o protenas Fe-S) y citocromos.

    Tambin est la quinona liposoluble Ubiquinona o Coenzima Q, presente entodos los organismos con metabolismo respiratorio. Hay distintas formas, en

    funcin del nmero de unidades de isopreno de su cola. La ms abundante en

    humanos es la CoQ10, que tiene 10 unidades (E0 = - 0,045 V).

    Gracias a su carcter liposoluble, la CoQ est por todas las membranas

    celulares, desarrollando distintas funciones gracias a su capacidad redox.

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    Coenzimas principales

    del transporte de e-en

    las reacciones redox

    biolgicas

    NAD(P)+: nicotinamida adenn

    dinucletido (fosfato)

    Estn unidos covalentemente

    a sus enzimas: son grupos

    prostticos

    Son solubles y transportan

    electrones entre molculas

    FMN: flavn mononucletido

    FAD: flavn adenn dinucletido

    E0 = - 0,22 V (para FAD)

    E0 = - 0,3 V (para FMN)

    E0 = - 0,32 V (para NAD+y NADP+)

    ribitol

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    Nucletidos de nicotinamida en el catabolismo y la biosntesis

    El NAD+es el cofactor de la mayora de las enzimas que actan en la direccin de oxidacin

    de los sustratos (deshidrogenasas), mientras que el NADPHsuele actuar como cofactor para

    las reductasas, que son enzimas que catalizan la reduccindel sustrato.El NAD+se regenera principalmente en el proceso de transporte electrnico.

    El NADPH se genera a partir del NADP+en la Ruta de las pentosas fosfato, o bien a partir

    del NADH mediante la accin de la transhidrogenasa mitocondrial.

    El NADP+se sintetiza a partir del NAD+por un reaccin de una quinasa dependiente de ATP.

    La [NAD+ + NADH] est en torno a 10-5 M, y la de [NADP+ + NADPH] es 10 veces menor.

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    Estructura de los centros Fe-S

    Fe Fe2S2 Fe4S4

    Ferredoxina Fe2S2deAnabaena

    Grupos prostticos de los citocromosProtena

    Hemo A Ferro-protoporfirina IX Hemo C

    Citocromos A Citocromos B Citocromos C

    Tanto los citocromos como las protenas Fe-S intervienen en

    la cadena respiratoria, pero tambin en muchos otros procesosy reacciones, en los que los grupos hemo y Fe-S actan como

    cofactores redox.

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    Componentes de la cadena de

    transporte electrnico mitocondrial

    La CoQ capta los electrones de los Complejos I y II, y

    se los cede al Complejo III.

    El Citocromo cno es parte de un complejo enzimtico.

    Se mueve por el lado exterior de la membrana entre losComplejos III y IV como una protena libremente soluble.

    FADH2

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    Transportadores electrnicos de la

    cadena respiratoria y sus potenciales

    de reduccin estndar

    lado de

    la matrizlado inter-

    membranal

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    Energa producida en la cadena de transporte electrnico

    Hay tres saltos energticos asociados al paso de los electrones del NADH por

    los complejos I, III y IV de la cadena respiratoria.

    Estos saltos energticos se utilizan como fuente energtica para la extrusin de

    protones de la matriz mitocondrial en contra de su gradiente de concentracin.

    Potencial de

    reduccin, E

    !O2+ 2 H++ 2 e- H2O 0,816 v

    NAD++ H++ 2 e- NADH - 0,320 v

    !G = - n F !E

    G = - 2 x 96.480 x 1,136 = 219.202 julios/mol = 219,2 kJ/mol de NADH

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    El transporte de electrones genera un gradiente de protones

    Salida de H+de la matriz mitocondrial debida al flujo por la cadena

    respiratoria de 2 e-cedidos por el NADH (10 H+) o el FADH2(6 H+)

    El paso de e-porlos Complejos I, III y

    IV se acopla a laextrusin de H+de

    la matriz al espaciointermembranoso

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    El coenzima Q es paso obligado de los electrones

    procedentes de varias vas

    ETF: flavoprotena

    de transferencia de

    electrones

    Ciclo deKrebs

    Lanzadera del

    glicerol-3-fosfato

    $-oxidacin delos cidos grasos

    Deshidrogenasas

    NADH

    Complejo I

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    Fuerza protn-motrizEspacio

    intermembranalMatriz

    El flujo de electrones a travs de la cadenarespiratoria provoca la formacin de un gradiente

    de H+

    a travs de la membrana interna, con mayor[H+] en el espacio intramembranal que en la matriz

    y un potencial de membrana negativo en el interior.

    Ello genera un potencial electroqumicollamado p, que desarrolla una fuerza protn-

    motriz que impulsa la vuelta de los H+a la matriz.

    La vuelta se realiza

    a travs del poro de laFoF1ATP sintasa, queusa la fuerza protn-

    motriz para fosforilarADP y obtener ATP.

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    La FoF1ATP sintasa es una ATPasa de tipo F

    Matriz

    Espacio

    intermembranoso

    371 kDa

    8,5 x 10 nm

    La FoF1ATP sintasa de la membrana interna mitocondrial est formada por unas

    25 subunidades y tiene un tamao de 450 kDa. Tambin se llama Complejo V.

    En la subunidad o dominio F1, el ADP y el Pi se unen y el ATP se formafcilmente, quedando unido al enzima: el gasto energtico es para su liberacin.

    El flujo de H+provoca el giro de la unidad mvil formada por el anillo c10de Fo

    y el tallo %&de F1, y las s.u. $van cambiando entre tres conformaciones a medida

    que la s.u. %interacciona con ellas, permitiendo en la tercera la liberacin del ATP.

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    La energa del gradiente de protones !pse

    usa para distintos objetivos en las clulas

    En los sistemas biolgicos, los gradientes de protones constituyen la

    principal divisa interconvertible de energa libre. La fuerza protn-motriz esuna forma sencilla y eficaz de almacenar energa libre porque slo requiere

    una membrana lipdica cerrada que separe dos fases acuosas. Es la fuerzaclave de la la Teora quimiosmtica descrita por Peter Mitchell en los aos 70.

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    Los transportadores de la

    membrana interna mitocondrial

    permiten el transporte de

    metabolitos relacionados con la

    obtencin de ATP

    H+

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    Las lanzaderas de sustrato de la membrana interna transportan

    pares de electrones del NADH desde el citosol a un componente

    de la cadena respiratoria o al interior de la mitocondria

    Lanzadera del glicerol-3-fosfato (cerebro, msculo)

    1,5 ATP por cada 2 e-del NADH + H+

    Lanzadera del malato-aspartato (hgado, rion, msculo cardaco)

    2,5 ATP por cada 2 e-del NADH + H+

    KG: "-cetoglutarato

    Malatodeshidrogenasa

    Malatodeshidrogenasa

    Glicerol 3P dH

    El NADH obtenido en el citosol (de la

    glucolisis y otras rutas) no puede atravesarla membrana interna mitocondrial

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    La velocidad de la cadena respiratoria est ntimamente ligada a la fosforilacin

    oxidativa, de manera que los electrones no fluyen hasta el O2a menos que elADP sea fosforilado simultneamente a ATP. Es decir, a nivel de regulacin

    funcionan como una unidad.

    La velocidad de la fosforilacin oxidativa est controlada por la relacinNADH/NAD+, el Pi,la pO2y el H

    +, pero sobre todo por el nivel de ADP, que se

    denomina control respiratorio o control por aceptor(del Pi). Este sistema decontrol puede llegar a acelerar 10 veces el consumo de O2.

    Este control se extiende hasta el ciclo de Krebs, a travs del consumo de

    NADH y FADH2, y desde el ciclo a la glucolisis. Los electrones no fluyen desdelos combustibles hasta el O2a menos que se necesite sintetizar ATP.

    Regulacin de la fosforilacin oxidativa

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    Produccin de ATP mediante la oxidacin

    completa de la glucosa a CO2y H2O

    En conjunto, se producen 30 32 molculas de ATP por

    molcula de glucosa, lo que comparado con la energa de

    oxidacin de la glucosa supone una eficiencia termodinmica

    en torno al 33%en condiciones estndar.

    En la clula la eficiencia aumenta hasta el 65-70%.

    Las estequiometras del bombeo de H+, consumo de O2y

    sntesis de ATP se hacen en base a estimaciones, por la naturaleza

    difusa de la energa quimiosmtica.

    Se estima que se sintetizan 2,5 ATP por cada 2 e-transferidos

    por el NADH (bombeo de 10 H+), y 1,5 ATP si lo son por el FADH2

    (bombeo de 6 H+). Eso supone un aprovechamiento energtico

    sobre la !G de reduccin en torno al 35%en condiciones estndar.