Quiz1. Nombre al menos uno de los

aspectos que se subestima al escoger mal el modelo evolutivo

2. ¿Qué hace la corrección AICc?

Bono: ¿Cuál es el segundo nombre de Andrew Crawford?

Introducción a JModelTestSistemática Filogenética Laboratorio

Luisa A. CastellanosFrancisco Gamarra

Modelos EvolutivosIndependencia de mutación ->

Sustitución al azar

Sesgos en el tipo de mutación

Modelos evolutivos

ModelosJukes Cantor

ModelosKimura de dos parámetros

α= Transición

β= Transversión

ModelosHay Muchos

Tasas de heterogeneidad : Distribución gamma

Corrige diferencias en las tasas de sustitución de nucleótidos

Tasas de heterogeneidad : Distribución gamma

La mayoría de posiciones evolucionan lentamente

Tomado de Andrew J. Crawford

JModel Test

• Corre sobre Java• Hierarchical y Dynamical

likelihood ratio tests (hLRT and dLRT)

• Akaike and Bayesian information criteria (AIC and BIC)

• Decision theory method (DT).

Corta los nombresPoco tiempo computancional

◦Se cierra

JModel Test

EntregaDe hoy en ocho antes de las 2:00

p.m