proteínas y Estructura-DNA-2015
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definiciones y estructura
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Aminocidos y Protenas
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Cadena lateral
-
Aminocidos codificados
por el ADN
-
Ismeros
Los ms
abundantes
Son los
ismeros L
-
Los aminocidos se unen por enlaces peptdicos
Nota : el enlace
Debe ser Trans
y por lo tanto
El H debe ir
hacia abajo
Estructura primaria:
Secuencia de
Aminocidos
En una cadena
Polipeptdica
Principal enlace:
-enlace peptdico
-
Los aminocidos se unen por enlaces peptdicos
Nota : el enlace principal
En esta estructura es
Por puente de hidrgeno
Estructura secundaria:
Conformacin local que
permite formar patrones
De plegamiento regular en
una cadena polipeptdica,
Es decir, la forma que
adquiere la cadena
polipeptdica al plegarse
sobre s misma
Principal tipo de
plegamiento:
-Hlice alfa
-Lmina beta
Hlice alfa
-
Estructura
secundaria
Alfa hlice
Fuerzas importantes:
Enlaces por
-Puentes H cada 3.6 aa
-Fuerzas Van
Der Waals
-Interacciones
Hidrofbicas
-
Estructura secundaria
Lmina beta
Fuerzas importantes:
-Puentes H entre aa. alejados
-Fuerzas Van Der Waalls
-Interacciones Hidrofbicas
-
Estructura terciaria
Plegamiento
entre una misma
Cadena de
Polipptido
Se pliegan
Las cadenas
Alfa y las
Lminas beta
Se unen por
-Puentes
disulfuro
Puentes disulfuro
-
Estructura cuaternaria
Plegamiento
entre distintas
Cadenas de
polipptido
-
Resumen de las estructuras
Primaria, secundaria,
Terciaria y cuaternaria
de las protenas
-
Las protenas pueden desnaturalizarse
Desnaturalizacin:
Prdida de la estructura
Secundaria, terciaria
Y cuaternaria de una protena
Los factores que desnaturalizan
A una protena son:
Temperatura
pH
Fuerza inica
-
Las protenas pueden
desnaturalizarse
Desnaturalizacin:
Prdida de la estructura
Secundaria, terciaria
Y cuaternaria de una
protena
Los factores que
desnaturalizan
A una protena son:
Temperatura
pH
Fuerza inica
-
fin
-
Estructura y
Propiedades de las
Molculas portadoras
De la informacin
Gentica:
Los cidos nuclicos
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James Watson y Francis Crick
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Estructura qumica de las purinas y pirimidinas,
constituyentes del RNA y DNA
Bases
nitrogenadas
Componente bsico de los cidos nuclicos
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BASES NITROGENADAS
Principales caractersticas qumicas:
HIDROFOBICIDAD
La naturaleza aromtica de los anillos hace que las bases tengan
Un carcter marcadamente apolar, que sean hidrofbicas e insolubles
En agua.
Absorcin de Luz UV.
La absorcin de luz UV es una caracterstica de las bases puricas y
Pirimdicas por su carcter aromtico. Absorben a 260 nm. Esta
Propiedad sirve para cuantificar c. nuclicos, nucletidos y
Nuclesidos.
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Estructura qumica de
ribosa y 2-desoxirribosa, constituyentes del
RNA y DNA
Azcar
pentosa
Componente neutro de los cidos nuclicos
El OH presente en la posicin 2 del azcar en el RNA lo hace mas inestableQue el DNA.
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COMPONENTE CIDO DE LOS CIDOS NUCLICOS
El grupo fosfato
Propiedades qumicas importantes:
Hidroflco
Su pka es de 6 , es decir que
A pH fisiolgico se relaciona con
Protenas con carga positiva como
Lys y Arg.
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La estructura del DNA
Base nitrogenada + azcar pentosa = Nuclesido
Base nitrogenada + azcar pentosa + grupo fosfato = Nucletido
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Estructura y nombres de los nucletidos y nuclesidos
De DNA y RNA
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Estructura primaria
Unin de los nucletidos mediante enlaces fosfodister
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La estructura del DNA
Notacin abreviada de una hebra de DNA
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Apareamientos
De bases A-T
G-C
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La estructura del DNA
DNA-B estructura que prevalece In vivo
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La estructura del DNA
Los monmeros del DNA son
Los nucletidos.
Existen 3 fuerzas que estabilizan
Una doble hlice:
1. Enlaces por puente de H
2. Interacciones hidrofbicas
por apilamiento de bases.
3. Interacciones con el agua
por el carcter hidrflico del
grupo fosfato.
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Resmen de las principales caractersticas de
la doble hlice
1.- Antiparalelismo
2.- complementariedad
3.- helicidad (dextro o levo)
4.- Paso de la hlice (por cada vuelta hay 10.4 pb)
5.- Altura del paso de la hlice (3.4 nm)
6.- Separacin entre bases apiladas dentro de la hlice=0.34 nm
7.- Dimetro de la hlice= 2 nm
8.- Existen tres fuerzas que estabilizan la doble hlice.
9.- Hay un surco mayor y un surco menor
10.- El apilamiento de bases es casi perpendicular al eje de la doble
hlice.
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DNA-APrevalece bajo
condiciones
De alta salinidad o
deshidratacin
11 pb por vuelta
Dimetro de la
vuelta = 23
Angstroms
Hlice dextrgira
No hay surco mayor
ni menor
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La estructura del DNA
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Superempaquetamiento de
El DNA
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Cada tres nucletidos
Codifican para un
aminocido
Replicacin:
Copia de DNA a DNA
Transcripcin:
Copia de DNA a RNA
Traduccin:
Copia de RNA a protena
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Cdigo gentico
Describe la correlacin entre dos lenguajes:
La secuencia de nucletidos en el RNAm y la secuencia de aminocidos
en un polipptido.
George Gamow......cada aminocido de un polipptido est codificado por tres nucletidos (codn o triplete)
George Gamow... El cdigo se lee de una manera no superpuesta. Esto es que cada nucletido forma parte de
un solo codn.
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El cdigo gentico
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El cdigo es redundante (degenerado)
Se entiende por
Degeneracin el
Hecho de que un
Aminocido est
Codificado por
Ms de un codn.
A los codones que
Codifican el mismo
Aminocido se les
Llama codones
Sinnimos.
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El cdigo gentico es casi Universal
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Caractersticas del cdigo gentico
-Cada tres nuclltidos (codn) codifican para un aminocido.
-Total de codones = 64, de los cuales solo 61 codifican para
Aminocidos.
-Tres de los codones (UAA, UAG, UGA) no especifican ningn
Aminocido porque son seales de terminacin de la traduccin.
-El codn de inicio de la traduccin (AUG) especifica para una
Metionina en eucariotas y para una formil-metionina en
procariotas.
-Es casi Universal.
-Es redundante (degenerado).
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Cdigo gentico
