METSIM contiene módulos formados por subconjuntos de ecuaciones que describen el diseño y las características de diferentes operaciones unitarias. El sistema utiliza las ecuaciones requeridas por cada modelo o un conjunto de modelos, realizando un análisis particular para cada operación unitaria, para un conjunto de estas, o bien para el sistema global, según la necesidad del usuario. Los datos de entrada, requeridos para solucionar las ecuaciones en cada módulo, son solicitados por el programa y almacenados como variables globales, las cuales se pueden modificar cada vez que el usuario lo desee. El usuario sólo debe definir las corrientes de entrada al proceso, y los parámetros de operación de lo equipos. Para esto puede utilizar datos reales obtenidos de planta, de pruebas experimentales, o de su propio conocimiento. Si una variable ingresada se encuentra fuera del rango de operación, el programa entrega diferentes alarmas que indican claramente el error. Una vez ingresados los datos de entrada, se puede ejecutar el programa obteniéndose como resultado el balance metalúrgico del sistema.