Fundamentos y tcnicas de anlisis microbiolgicos Manual Bergey's - 1Laboratorio de Diagnstico Clnico. 2 curso U.T. 12 - 0 Bloque temtico III

Gustavo A. Daz Martn. Profesor Tcnico de Formacin Profesional. Curso 2004-2005I. E. S. Jaime Ferrn Cla. San Fernando de Henares. (28830 Madrid) Cdigo 28038616

Manual de Bergey

En 1923, David Bergey, catedrtico de bacteriologa en la Universidad de Pennsylvania, y cuatrocolaboradores ms, publicaron un manual sobre caractersticas de las bacterias de inters mdicoconocidas hasta entonces, que poda utilizarse para la identificacin bacteriana. Este manual, elBergey's Manual of Determinative Bacteriology, ha sido utilizado en muchos laboratorios deMicrobiologa de todo el mundo y ha ido actualizndose a lo largo de los aos hasta que apareci lanovena y ltima edicin en 1994. (ver historia )

En 1984, se public la primera edicin de un manual enfocado ms a la clasificacin que a laidentificacin: el Bergey's Manual of Systematic Bacteriology. Esta nueva publicacin constaba decuatro volmenes que se fueron publicando en los siguientes cinco aos.

La clasificacin propuesta por esta primera edicin del Bergey's Manual of Systematic Bacteriologyest basada en la tincin de Gram. As, agrupa a todas las bacterias en un solo Reino: elProcaryotae, en el que se reconocen cuatro divisiones: Gracilicutes (procariotas, con pared celular,gramnegativas), Firmicutes (procariotas, con pared celular, grampositivas), Tenericutes(procariotas, sin pared celular) y Mendosicutes (procariotas filogenticamente anteriores a lasdivisiones mencionadas, como las arquebacterias y otras)

En esta primera edicin de la nueva etapa, las bacterias se distribuyen en secciones. Las distintassecciones se han constituido sobre la base de caracteres descriptivos morfolgicos y metablicos,por ejemplo, espiroquetas, cocos y bacilos aerobios gramnegativos, cocos grampositivos, etc.

En cada una de las 33 secciones que lo componen se engloban distintos rangos taxonmicos quevaran considerablemente. Algunos llegan a tratar de divisiones, en tanto que otros se ocupan degneros. Un carcter que se mantiene constante es el estudio de gneros y sus correspondientesespecies, categoras taxonmicas ambas que son fundamentales en su estructuracin. Los que noencajan perfectamente en alguna de las familias o secciones se les denomina gnero de afiliacindudosa o se incluyen en el de otros gneros. Las especies no bien descritas, definidas sin cepatipo, neotipo o de referencia, se catalogan como species incertae sedis.

Las propiedades empleadas para la diferenciacin son: caractersticas morfolgicas microscpicas,morfologa de las colonias y pigmentacin, condiciones de crecimiento y nutricin, fisiologia ymetabolismo, caracteristicas genticas, plsmidos y bacterifagos, estructura antignica,patogenicidad y ecologa. En general, en cada especie se incluye la cepa tipo.

Ha habido un progreso considerable en el campo de la taxonoma bacteriana desde 1984, el ao dela publicacin del primer volumen del Bergey's Manual of Systematic Bacteriology. El nmero deespecies nombrada se ha duplicado, y hay ms de 170 nuevos gneros descritos. En particular, elanlisis del rRNA, del DNA y de las protenas, ha hecho posible el anlisis filogentico de lasbacterias. A consecuencia de ello, la segunda edicin del Bergey's Manual of SystematicBacteriology ser fundamentalmente filogentica en vez de fenotpica, y por consiguiente, muydiferente de la primera edicin.

En 2001 apareci el primero de los cinco volmenes de la segunda edicin del Bergey's Manual ofSystematic Bacteriology. Esta segunda edicin se publicar en cinco volmenes, y contendr msinformacin ecolgica que clnica. Hasta ahora no se han publicado ms volmenes.

Fundamentos y tcnicas de anlisis microbiolgicos Manual Bergey's - 2Laboratorio de Diagnstico Clnico. 2 curso U.T. 12 - 0 Bloque temtico III

Gustavo A. Daz Martn. Profesor Tcnico de Formacin Profesional. Curso 2004-2005I. E. S. Jaime Ferrn Cla. San Fernando de Henares. (28830 Madrid) Cdigo 28038616

A diferencia de la primera edicin la clasificacin se resume en dos dominios, Archaea y Bacteriaque poseen en total 14 Reinos. La nueva edicin no estar disponible en su totalidad hasta dentro dealgunos aos (hasta la fecha solo se ha publicado el Volumen I), pero conocemos la organizacin desu estructura, que transcribiremos a continuacin.

Volumen I:Trata del dominio Archaea, en su totalidad y de algunas bacterias Gram negativas especiales, comolas Cianobacterias. En este volumen no hay casi ninguna bacteria de importancia clnica.

Volumen II:Proteobacterias, bacterias Gram negativas . Dividido en cinco secciones (alfa, beta, delta, gamma ypsilon proteobacterias), el reino Proteobacteria agrupa a la mayor parte de las bacterias Gramnegativas de importancia clnica.Neisseria, Brucella, Legionella, Pseudomonas, Haemophilus, Campylobacter y Enterobacterias,pertenecen a este reino.

Volumen III:Tratar sobre los Gram positivos con bajo contenido en G+C.Aqu aparecern gneros como Staphylococcus, Streptococcus, Enterococcus, Clostridium yBacillus

Volumen IV:Contendr una sola seccin que agrupar a todos los Gram positivos con alto contenido en G+CLos gneros ms conocidos de este volumen sern Mycobacterium y Corynebacterium.

El Volumen V tratar de otras bacterias Gram negativas, agrupadas en ocho secciones diferentes.No tienen ningn factor en comn. Los gneros ms importantes desde el punto de vista clnicosern Chlamydia, Treponema, Borrelia o Bacteroides

A pesar de todos estos cambios y avances en los criterios de clasificacin, la identificacin siguebasndose en la distincin entre gneros y especies, que apenas se han modificado. Por este motivopodemos seguir utilizando sin mayores dificultades la novena edicin del Bergey's Manual ofDeterminative Bacteriology (que adems es el nico que poseemos) hasta que se complete lapublicacin de la segunda edicin del Bergey's Manual of Systematic Bacteriology

A pesar de que no disponemos de ms referencias sobre los restantes volmenes de la segundaedicin, s podemos disponer de la clasificacin "oficial" que en ellos se recoger.

El ltimo ndice publicado de la clasificacin de bacterias se actualiz en abril del 2001 y est avuestra disposicin en la pgina web del Manual Bergey`s.

Una copia de este ndice est a vuestra disposicin en el Laboratorio de Microbiologa, y sobredicha copia debis establecer los rangos taxonmicos del microorganismo que os ha sido asignado.

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Captulo I: Introduccin y uso del Manual

Aunque la novena edicin del Bergey's Manual of Determinative Bacteriology contiene mucha informacinderivada de los cuatro volmenes del Bergey's Manual of Systematic Bacteriology, no debera serconsiderada una versin resumida de ste ltimo. En cambio, trata especficamente de un aspecto detaxonoma bacteriana: la identificacin de las bacterias. Este libro ha sido diseado especialmente paraaquellas personas que estn comprometidas inicialmente en la identificacin de las bacterias, y a las cualesno concierne la clasificacin (ordenacin de microorganismos en taxones). Adems, ha sido actualizado convistas a los diversos cambios de nomenclatura y nuevos taxones que han sido descritos desde que losvolmenes del Bergey's Manual of Systematic Bacteriology fueron publicados.

Aunque este libro contiene muchos datos necesarios para la identificacin bacteriana, no contiene laabundancia de informacin descriptiva sobre gneros y especies que proporciona el Bergey's Manual ofSystematic Bacteriology. Por ejemplo, no contiene informacin detallada de las especies, ni informacinconcerniente a la clasificacin o nomenclatura de las bacterias, o mtodos para el enriquecimiento oaislamiento de diversas especies. Adems, no incluye esquemas de identificacin para ciertos grupos degneros o especies porque alguno de ellos requiere mtodos muy sofisticados para el cultivo y/oidentificacin. (p.ej. las rickettsias) o carecen de suficientes caractersticas diferenciales (p. ej. especies deBacillus).

Cmo usar el Bergey's Manual of Determinative Bacteriology?Asumiendo que el lector tiene un microorganismo aislado y desea identificarlo, los siguientes seis pasosproporcionan una aproximacin a esta tarea.

Paso 1: La naturaleza de los esquemas de identificacin bacterianaEl lector debe leer el captulo II de este libro para familiarizarse con los principios generales usados enidentificacin bacteriana.

Paso 2: El microorganismo aislado es eucariota o procariota?Este manual es usado para la identificacin de bacterias (procariotas). En consecuencia, el microorganismo aidentificar debe ser una bacteria en vez de un eucariota microscpico (moho, levadura, alga o protozoo). Elcaptulo III proporciona una tabla de caractersticas que diferencian procariotas de eucariotas.

Paso 3: A qu categora de bacterias pertenece el microorganismo?De forma prctica, las bacterias pueden dividirse en cuatro grandes categoras:

I. Eubacterias Gram-negativas que tienen pared celularII. Eubacterias Gram-positivas que tienen pared celularIII. Eubacterias carentes de pared celularIV. Arqueobacterias

El captulo IV proporciona caractersticas que permiten la diferenciacin de estas cuatro categoras.

Paso 4: A qu grupo pertenece el microorganismo aislado?Tras la correcta asignacin del microorganismo a su categora bacteriana, el siguiente paso es determinar enque grupo se puede encuadrar el microorganismo.El captulo V proporciona un listado de los grupos que existen en cada una de las cuatro categoras y unabreve descripcin