Maestría en Ciencias en Biotecnología Convocatoria 2016-2 · 2017-05-24 · Maestría en Ciencias...

Maestría en Ciencias en BiotecnologíaConvocatoria 2016-2 (PNPC de Conacyt)

a. Perfil de ingreso y egreso.b. Objetivo del programa de posgrado.c. Síntesis del plan de estudios.d. Líneas generación y/o aplicación del conocimiento del programa.e. Núcleo académico básico f. Tutoríag. Productividad académica h. Vinculación con otros sectores de la sociedad.i. Procesos administrativos

a). Perfil de ingreso y egreso La concurrida demanda para prevenir y solucionar problemas de los procesos en los sectores agropecuario, salud e industrial, entre otros, incentiva la incorporación de técnicas de base biotecnológica ligadas a la producción y transformación de satisfactores. Por ello, el profesionista requiere continuar su preparación académica para desarrollar competencias que le permitan participar de manera activa en el desarrollo de procesos biotecnológicos, mediante la construcción y/o aplicación de conocimiento.

Perfil de Ingreso.El aspirante a ingresar a la Maestría en Ciencias en Biotecnología (MCBT) deberá demostrar el siguiente perfil:

• Contrasta conocimientos básicos de microbiología y bioquímica.• Distingue estudios observacionales de los experimentales.• Divide y analiza las partes de un problema.• Demuestra manejo y uso básico de un laboratorio y aplica reglas de seguridad para la disposición

de residuos.• Aplica bases legales y éticas implicadas en el desarrollo y aplicación de las ciencias de la vida.

Actitudes:El aspirante demuestra actitud para adaptarse a nuevas situaciones, para entender el lenguaje y propuestas de especialistas; para autoevaluarse; para reconocer las posibles dificultades en su desempeño y tomar decisiones para subsanarlas, para revisar y valorar las evaluaciones de otros con la finalidad de mejorar su desempeño.

Perfil de Egreso.El egresado de la Maestría en Ciencias en Biotecnología (MCBT) será capaz de diseñar y desarrollar proyectos de investigación básica o aplicada para proponer la optimización de procesos y productos con potencial de aplicación y transferencia de la tecnología en las áreas del sector primario y de manufactura. De manera específica, el egresado:

• Identificará las áreas de oportunidad y desarrollo de los procesos biotecnológicos de importancia económica.

• Relacionará de una forma integrada los problemas desde diferentes perspectivas • Analizará y distinguirá las principales teorías relacionadas con la disciplina de la Biotecnología.• Diseñará experimentos e interpretará los resultados para proponer solución a problemas.

Actitudes: tomará la iniciativa para la toma de decisiones; colaborará con grupos interdisciplinarios; aplicará razonamiento lógico, crítico y creativo; demuestra compromiso con el medio social para la promoción del desarrollo sustentable.

b). Objetivo del programa de posgradoFormar recursos humanos de alta calidad capaces de generar y desarrollar proyectos de investigación aplicada en el campo de la Biotecnología, mediante la utilización de técnicas y metodologías para la resolución de problemas, con la finalidad de proponer la optimización de productos y servicios con potencial de aplicación en el área.

c). Síntesis del plan de estudios La Maestría en Ciencias en Biotecnología se encuentra orientada a la investigación, lo cual significa que los alumnos llevan a cabo actividades de investigación conducidas por el Núcleo Académico Básico del programa (NAB).

El interesado en ingresar a este Programa deberá comprometerse para dedicarse de tiempo completo a estos estudios.

Las líneas de investigación del programa de MCBT están soportadas por dos cuerpos académicos, uno de ellos en proceso de consolidación y el otro en formación. Ambos registrados por el Programa para el Desarrollo Profesional Docente (PRODEP).

Flexibilidad Curricular.El Plan de Estudios de la Maestría en Ciencias en Biotecnología es flexible debido a lo siguiente:

1. El modelo de las Universidades Politécnicas basado en competencias permite una formación en colaboración con otros programas a través de la movilidad académica, que puede tener como propósitos el curso de seminarios o el desarrollo del trabajo experimental. La movilidad permite la incorporación de contenidos temáticos novedosos relacionados con los avances del conocimiento en las diferentes áreas de la Biotecnología que incidan en la formación del estudiante, sin que se requiera un cambio del plan de estudios de la Maestría.

2. El estudiante, en compañía del director de tesis, podrá seleccionar las asignaturas optativas que más se relacionen con el tema de su investigación. El estudiante podrá seleccionar una de las ocho asignaturas optativas de tipo general y dos optativas con orientación 1 o 2, pertenecientes a cada una de las líneas de investigación.

Definición de la estructura general del plan de estudios.El mapa curricular de la MCBT está conformado por tres tipos de seminarios: 1. De columna vertebral; 2. Optativos; y 3. Básicos. Enseguida se describen cada uno:

1. De columna vertebral: estos son 12 seminarios (seis de Tesis y seis de Seminarios de Investigación); como se observa en el mapa curricular, estos seminarios sostienen la mayor parte del plan de estudios. La importancia de estos radica en la formación en dos sentidos: a) el acompañamiento de un comité tutorial para la elaboración de una tesis; y b) la formación para la investigación en el campo de la biotecnología. Con esta distinción se pretende la formación de estudiantes que no sólo se habiliten en la elaboración de una tesis sino que se habiliten como investigadores, mediante el acercamiento con diversos investigadores y por ende, con diversas metodologías y marcos teóricos aplicados a la biotecnología. En la siguiente tabla se muestra una descripción del avance de cada uno de los seminarios de tesis.

2. Seminarios optativos. Estos son tres, los cuales se dividen a su vez en optativos generales y optativos con orientación. Los optativos generales tienen por objetivo ampliar los conocimientos y habilidades en la Biotecnología y apoyan la formación de estudiantes en ambas líneas de investigación, en cambio los optativos con orientación favorecen de manera enfática cada una de las líneas de investigación. Los seminarios optativos generales son: Modelos matemáticos, Análisis instrumental avanzado, Bioingeniería, Biología Sintética, Bioseparaciones, Tecnologías Enzimáticas, Ingeniería Genética y Tópicos de Microbiología y Bioquímica. Los seminarios optativos con

orientación 1 son los que fortalecen la línea de investigación Dinámica de contaminantes y sustentabilidad: Biocombustibles, Biorremediación y Biotecnología Ambiental. Los seminarios optativos con orientación 2 son los que favorecen la línea de investigación Diseño de productos de aplicación biotecnológica para el desarrollo sustentable: Biología y aplicaciones de los bacteriófagos, Fisiología vegetal y Caracterización molecular. Cada estudiante, en acuerdo con su director de tesis podrá establecer su trayectoria ideal para cubrir el total de créditos de la MCBT. Será decisión del estudiante y su director de tesis definir las asignaturas optativas a elegir.

3. Seminarios básicos. Estos tienen por objetivo el desarrollo de conocimientos y habilidades en el uso de la bioestadística, del diseño de experimentos y de la selección y manejo de la información.

Mapa curricular

d). Líneas de Investigación y/o generación de conocimientos del programaEl programa de la MCBT se integra por dos Cuerpos Académicos (CA) que desarrollan diferentes Líneas de Generación y/o Aplicación del Conocimiento (LGAC):

1. Cuerpo Académico Contaminación y Sustentabilidad

Líneas de Generación y/o Aplicación de Conocimiento:

1.1. Dinámica de Contaminantes en el Ambiente.- En esta línea elaboran trabajos para estimar los impactos y riesgos ambientales con el fin de establecer medidas de control, mitigación, restauración o prevención; finalmente, se busca el desarrollo de productos, tecnologías y procesos ambientales sustentables que permitan un manejo integral de los recursos naturales aumentado así, el nivel de competitividad ambiental.

1.2 Sistemas de Gestión Ambiental y Desarrollo Sustentable.- En esta línea se investiga el uso de

diversos residuos agroindustriales como materia prima para la generación de biocombustibles a partir del cultivo de levaduras.

1.3. Biorremediación.- Esta línea se enfoca en generar conocimientos sobre los procesos involucrados en la biodegradación y movilidad de contaminantes en el ambiente, y sobre cómo aprovechar estos conocimientos para la remediación de áreas que presentan un alto grado de contaminación mediante la utilización de microorganismos, especies vegetales o sus productos, para remover, trasformar o mineralizar estos contaminantes en suelos, aguas y aire.

2. Cuerpo Académico Biotecnología Aplicada

2.1. Diseño de nuevos productos de aplicación biotecnológica para el Desarrollo Sustentable.- Esta LGAC abarca el desarrollo de estrategias relacionadas con el control biológico de agentes patógenos en cultivos y ganado, a partir de microorganismos y plantas; el aislamiento, identificación y elucidación estructural por medio de técnicas cromatográficas y espectroscópicas de las sustancias causantes de esa actividad; su modificación semi-sintética y su resolución enantiomérica vía enzimática, con la finalidad de encontrar compuestos análogos, ópticamente enriquecidos, que puedan presentar mayor actividad en el control de los agentes patógenos; así como el diseño y desarrollo de bioplásticos, micro y nanopartículas a partir de polímeros naturales u obtenidos por fermentación bacteriana; y el aislamiento, caracterización y producción de nuevas enzimas de importancia industrial de distintas fuentes; con la ayuda de la biología molecular y la ingeniería de proteínas, se pueden resolver diversos problemas como estabilidad y especificidad de interés para aplicaciones industriales.

e). Núcleo Académico Básico Los Cuerpos Académicos (CA) del programa de la MCBT están soportados por 13 profesores que conforman el Núcleo Académico Básico (NAB), de los cuales 10 son profesores de tiempo completo y 3 de tiempo parcial:

Dra. Rosa Angélica Guillén Garcés Profesor investigador de la Maestría en Ciencias en Biotecnología UpemorProfesor de Tiempo Completo Ingeniería en Tecnología ambientalContacto: [email protected]

LÍNEAS DE INVESTIGACIÓN 1. Dinámica de contaminantes en el ambiente: Se caracterizan los procesos como degradación, adsorción y transporte de contaminantes persistentes y emergentes en el ambiente. También se evalúa la remoción de contaminantes persistentes y emergentes presentes en el agua mediante tecnología no convencionales como biofiltros empacados con soportes turba, tezontle, perlita, pumicita, entre otros sustratos.

2. Gestión y sustentabilidad:Desarrollar tecnología que permita un manejo integral de los residuos agrícolas sólidos y líquidos mediante procesos de compostaje, degradación, desinfección, entre otros para la generación de productos empleados como sustratos o fertilizantes orgánicos y para la recuperación de nutrientes desechados en la agricultura, lo anterior con el fin de desarrollar procesos agrícolas sustentables.

Dra. Gabriela Eleonora Moeller ChávezProfesor investigador de la Maestría en Ciencias en Biotecnología UPEMORProfesor de Tiempo Completo Ingeniería en Tecnología ambientalNivel II del SNIContacto: [email protected]

LÍNEAS DE INVESTIGACIÓN 1. Tratamiento de aguas residuales:En el tema de tratamiento de aguas residuales se ha trabajado en el desarrollo de tecnología nacional para el tratamiento de aguas de tipo municipal en donde ha desarrollado en colaboración con otros investigadores dos patentes que han sido comercializadas por el IMTA. Asimismo se encuentra en examen de fondo otra más en este tema. Para el tratamiento de aguas residuales industriales se encuentra en examen de fondo una patente más enfocada a la remoción de compuestos orgánicos recalcitrantes y /o coloridos. En lo relativo al reúso de aguas residuales tratadas, se han desarrollado metodologías para realizar estudios de reúso que abarcan tanto el factor técnico como financiero aplicados a varias poblaciones y que sirvieron de base para la investigación que se realizó a nivel nacional para hacer un diagnóstico sobre las actividades de reúso en ciudades. Esta investigación fue transferida a la CONAGUA para su difusión en los estados y permitió a industrias privadas determinar el mercado del reúso en la parte norte del país. Asimismo la línea de investigación y trabajo sobre tratamiento y reúso del agua en la industria se ha aplicado en varios proyectos realizados en especial en la industria química y petroquímica, textil, de colorantes y pigmentos.

2. Tratamiento de lodos residuales:Sobre el tema de tratamiento de lodos residuales, realizó investigación básica sobre la digestión anaerobia de lodos, encontrando una manera de mejorar y disminuir el tiempo necesario para llevar a cabo una estabilización adecuada de los lodos residuales, subproductos del tratamiento de las aguas residuales, identificando los microorganismos importantes que permiten obtener una mejor calidad de los lodos estabilizados.

Se trabaja sobre una nueva línea de investigación relativa a la degradación de colorantes por medio de tecnologías no convencionales (tratamiento acoplado químico-biológico, biológicos anaerobio-aerobio, biológico fúngico y enzimático) en donde también se enfoca sobre los mecanismos de degradación de compuestos tóxicos. Asimismo se inició otra nueva línea de investigación sobre el desarrollo de técnicas para la identificación, medición y el tratamiento de contaminantes emergentes.

Dra. Clarita Olvera CarranzaProfesor investigador de la Maestría en Ciencias en Biotecnología UPEMORInvestigador Titular A Instituto de Biotecnología UNAMNivel I del SNIContacto: [email protected]

LÍNEAS DE INVESTIGACIÓN Biosíntesis y aplicaciones de polímeros naturales biocompatibles

1. Biosíntesis de polímeros biocompatibles: El objetivo principal de este proyecto es el aislamiento, clonación y caracterizaciones de enzimas capaces de producir polisacáridos de importancia industrial, principalmente para el área médico-farmacéutica, cosmética y alimenticia. Estas enzimas son obtenidas de fuentes naturales, empleando metodologías genómicas y son expresadas de forma recombinantes para realizar la caracterización enzimática a fondo de estos biocatalizadores. El fin último de este proyectos es producir de forma eficiente biopolímeros como condroitina, queratano, heparina, hialuronano entre otros que tiene amplias aplicaciones industriales. 2. Aplicaciones de polímeros biocompatibles: formación de micro y nanopartículas. El objetivo de este proyecto es la producción de micro y nanopartículas de polisacáridos vía enzimática para acarrear compuestos bioorgánicos de interés farmacéutico, alimentario y cosmético. Para desarrollar este proyecto realizamos análisis de estructura, estabilidad, citotoxicidad de las partículas generadas por los polisacáridos, así como ensayos de encapsulación y liberación de biomoléculas. Actualmente, desarrollamos estudios de estas nanopartículas de polisacáridos como acarreadoras de DNA y proteínas su capacidad de transgénesis en células cancerosas para ser empleadas en un futuro en terapia génica. La generación de micropartículas para ser empleadas en terapia celular también está siendo evaluada. Este trabajo se hace en colaboración con el Instituto Nacional de Salud Pública y la Universidad de Leeds en Inglaterra.

3. Aplicación de Biopolímeros para la generación de tejidos artificiales e implantes (Nanoingeniería de tejidos).En este proyecto estamos interesados en la aplicación de diferentes polisacáridos como soporte para el desarrollo de tejidos artificiales e implantes con miras a ser empleados en medicina regenerativa. Para lograr el desarrollo de tejidos viables es muy importante que el soporte imite las propiedades del entorno extracelular. El objetivo a largo plazo es generar soportes que además de ofrecer a la célula el andamiaje requerido para su proliferación, también le sirva a las células para regular diversas funciones esenciales como adhesión y diferenciación.

PUBLICACIONES RELEVANTES • Avila-Fernandez,A. Cuevas-Juarez,E. Rodriguez-Alegria,M.E. Olvera,C. Lopez-Munguia,A. 2016. Functional characterization of a novel beta-fructofuranosidase from Bifidobacterium longum subsp. infantis ATCC 15697 on structurally diverse fructans Journal of Applied Microbiology, 121, 263-276.

• Raga-Carbajal,E. Carrillo-Nava,E. Costas,M. Porras-Dominguez,J. Lopez-Munguia,A. Olvera,C. 2016. Size product modulation by enzyme concentration reveals two distinct levan elongation mechanisms in Bacillus subtilis levansucrase Glycobiology, 26, 377-385.

• Mendez-Lorenzo,L. Porras-Dominguez,J.R. Raga-Carbajal,E. Olvera,C. Rodriguez-Alegria,M.E. Carrillo-Nava,E. Costas,M. Lopez-Munguia A. 2015. Intrinsic Levanase Activity of Bacillus subtilis 168 Levansucrase (SacB) PLoS ONE, 10, e0143394.

• Pena-Cardena,A. Rodriguez-Alegria,M.E. Olvera,C. Lopez-Munguia A. 2015. Synthesis of Fructooligosaccharides by IslA4, a truncated inulosucrase from Leuconostoc citreum BMC Biotechnology, 15, .

• Cortes-Lopez,N. Montor-Antonio,J. Olvera-Carranza,C. Pena-Castro,J. Del Moral,S. 2014. Metagenómica: una ventana de oportunidad a nuevos genes y genomas microbianos Revista Iberoamericana de Ciencias, 1, 45-58.

• Porras-Dominguez,J.R. Avila-Fernandez,A. Rodriguez-Alegria,M.E. Miranda-Molina,A. Escalante,A. Gonzalez-Cervantes,R. Olvera,C. Lopez-Munguia,A. 2014. Levan-type FOS production using a Bacillus licheniformis endolevanase Process Biochemistry, 49, 783-790.

• Olvera,C. Centeno-Leija,S. Ruiz-Leyva,P. Lopez-Munguia,A. 2012. Design of Chimeric Levansucrases with improved transglycosylation activity Applied and Environmental Microbiology, 78, 1820-1825.

CAPITULOS EN LIBROS • Olvera-Carranza,C. Avila-Fernandez,A. Bustillo-Armendaris,G.R. Lopez-Munguia,A. 2015. Processing of Fructans and Oligosaccharides from Agave Plants en: Preedy,V. Processing and Impact on Active Components in Food. London. Elsevier. pags. 121-129

• Olvera,C. Lopez-Munguia,A. 2014. Agroindustrial synthesis of frutans from sucrose en: Ruiz-Herrera,J. Biotechnology: beyond borders. Pune, India. CSIR National Chemical Laboratory y Cinvestav, Irapuato.. pags. 334-347

• Olvera,C. Castillo,E. Lopez-Munguia,A. 2008. Fructosiltransferasas, fructanas y fructosa en: Lopez-Munguia,A. Una ventana al quehacer científico. Instituto de Biotecnología de la UNAM 25 aniversario, cap 29. Mexico, D.F.. UNAM. pags. 327-345

ARTÍCULOS DE DIVULGACIÓN • Olvera-Carranza,C. Ayala-Aceves,M. 2015. Del gen al producto Biotecnología en Movimiento.Revista de divulgación del Instituto de Biotecnología de la UNAM, 2, 25-26.

• Montor-Antonio,J.J. Olvera-Carranza,C. Reyes-Duarte,D. Sachman-Ruiz,B. Ramirez-Coutino,L. Del Moral S. 2014. Caracterización bioquímica de AmiJ33, una amilasa de Bacillus amyloliquefaciens aislada de suelos cultivados con caña de azúcar en la región del Papaloapan Nova Scientia, 6, 39-59.

Dr. Luis Gerardo Treviño QuintanillaProfesor investigador de la Maestría en Ciencias en Biotecnología Upemor Profesor de Tiempo Completo Ingeniería en Tecnología ambientalNivel I del SNIContacto: [email protected]

LÍNEAS DE INVESTIGACIÓN A nivel de ciencia básica:1.- Caracterización de microorganismos, así como de los procesos moleculares y enzimáticos, involucrados en la degradación de xenobióticos clorados y contaminantes emergentes.2.- Biología de sistemas de la regulación transcripcional de los microorganismos modelo Escherichia coli y Bacillus subtilis.3.- Caracterización de microorganismos, así como de los mecanismos moleculares y enzimáticos, involucrados en la tolerancia a metales pesados como plomo, cadmio y cromo.

A nivel de investigación aplicada:1.-Producción de biodiesel a partir de microorganismos oleaginosas (productores de aceites) y residuos agroindustriales como el bagazo de caña de azúcar o el nejayote (biocombustibles de segunda generación).

PUBLICACIONES RELEVANTES Y PARTICIPACIONES EN CONGRESOS• Miguel A. Ibarra-Arellano, Adrián I. Campos-González, Luis G. Treviño-Quintanilla, Andreas Tauch and Julio A. Freyre-González. 2016. Abasy Atlas: a comprehensive inventory of systems, global network properties and systems-level elements across bacteria. Database. 1-16. Publicado Online. ISSN 1758-0463.

• Cuevas-Reyes E, Carrillo-Morales M, Treviño-Quintanilla LG, Aparicio Fabre R, Hernández-Romano J. 2016. Evaluación de oligonucleótidos para medir expresión genética durante la marchitez bacteriana del jitomate. Revista Fitotecnia Mexicana. Aceptado. ISSN 0187-7380.

• Balderas-Hernández VE, Treviño-Quintanilla LG, Hernández-Chávez G, Martínez A, Bolívar F, Gosset G. 2014. Catechol biosynthesis from glucose in Escherichia coli anthranilate-overproducer strains by heterologous expression of anthranilate 1,2-dioxygenase from Pseudomonas aeruginosa PAO1. Microb Cell Fact. 13(1):136. ISSN 1475-2859.

• Luis Gerardo Treviño-Quintanilla, Julio Augusto Freyre-González and Irma Martínez-Flores. 2013. Anti-Sigma Factors in E. coli: Common Regulatory Mechanisms Controlling Sigma Factors Availability. Current Genomics. 14(8):378-387. ISSN 1389-2029.

• Anne M. Hansen, Luis Gerardo Treviño Quintanilla, Henri Márquez Pacheco, Mariana Villada Canela, Luis Carlos González Márquez, Rosa Angélica Guillén Garcés, Arturo Hernández Antonio. 2013. Atrazina: Un Herbicida Polémico. Revista Internacional de Contaminación Ambiental. 29 (Revisión sobre plaguicidas septiembre 2013): 65-84. ISSN 0188-4999.

• Freyre-González, J. A., L. G. Treviño-Quintanilla, I. A. Valtierra-Gutiérrez, R. M. Gutiérrez-Ríos and J. A. Alonso-Pavón. 2012. Prokaryotic regulatory systems biology: Common principles governing the functional architectures of Bacillus subtilis and Escherichia coli unveiled by the natural decomposition approach. J Biotechnol. 161(3):278-86. ISSN 0168-1656.

CAPITULOS EN LIBROS • Moeller, Gabriela; Guillén A.; Treviño L. y Lizama C. 2016. Reúso de aguas residuales tratadas como fuente directa o indirecta de agua potable. Libro de aguas para reúso de la Asociación Internacional de Ingeniería Sanitaria y Ambiental (AIDIS). Aceptado.

• Carlos Juan Alvarado López, Luis Gerardo Treviño Quintanilla, Laura Stephania Colín Rosette. 2014. Curtobacterium sp. MR2 cepa que presenta dos mecanismos de resistencia al plomo y dependientes de la densidad celular. Libro Biotecnología y Agricultura Sustentable III Simposio Nacional. pp 157 – 162.

ARTÍCULOS DE DIVULGACIÓN • Treviño-Quintanilla L. G. ¿Cómo comer venenos y no morir en el intento? Universidad Politécnica del Estado de Morelos. Gaceta UPEMOR, Revistas de Divulgación Interna. Año 8, No. 21, Junio 2014.

• López-Munguía A. y L. G. Treviño-Quintanilla. La vida Interior. ¿Cómo Ves? Año 9, No. 106: 10-14. (Recuadro “El estudio del metagenoma bacteriano” Interior del articulo principal).

Mtra. Valeria Dávila SolanoProfesor investigador de la Maestría en Ciencias en Biotecnología UpemorProfesor de Tiempo Completo Ingeniería en Tecnología ambientalContacto: [email protected]

Dra. Rosaura Aparicio FabreProfesor investigador de la Maestría en Ciencias en Biotecnología-UpemorProfesor de Tiempo Completo Ingeniería en BiotecnologíaNivel I del SNIContacto: [email protected]

LÍNEAS DE INVESTIGACÓN1.- Dinámica microbiana en la agricultura protegida sustentable Proyectos. 2.- Análisis masivo de secuencias ribosomales 16S, de poblaciones de cultivos de jitomate.3.- Análisis de la dinámica del microbioma durante el proceso de compostaje por PCR en tiempo real.4.- Biofertilización y control biológico del cultivo de jitomate5.- Diagnóstico molecular de microoganismos del suelo

Dr. Manuel Carrillo MoralesProfesor investigador de la Maestría en Ciencias en Biotecnología UPEMORProfesor de Tiempo Completo Ingeniería en BiotecnologíaContacto: [email protected]

LÍNEAS DE INVESTIGACIÓN 1.- Caracterización química y evaluación biológica de metabolitos secundarios con actividad inhibitoria hacia bacterias fitopatógenas.El interés de nuestro grupo de investigación es estudiar metabolitos secundarios de origen vegetal y microbiano que posean actividad inhibitoria contra fitopatógenos de importancia económica, particularmente contra Ralstonia solanacearum y Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis. A partir de plantas con antecedentes de actividad antimicrobiana y de bacterias antagónicas provenientes de la rizósfera, se lleva a cabo la obtención biodirigida de extractos y su subsecuente fraccionamiento y purificación cromatográficos, con el objetivo de aislar a las sustancias biológicamente activas en cantidad y pureza suficientes para su identificación química. Los extractos, fracciones y metabolitos aislados son evaluados frente a los fitopatógenos de interés por medio de pruebas de actividad inhibitoria in vitro. Los metabolitos biológicamente activos son analizados por espectroscopía de resonancia magnética nuclear, en una y dos dimensiones, y espectrometría de masas para la elucidación de su estructura química.

PUBLICACIONES RELEVANTES • “Structural Features of N-benzylated-b-amino Acid Methyl Esters Essential for Enantiodifferentiation by Lipase B from Candida antarctica in Hydrolytic Reactions”. Rangel H., Carrillo-Morales M., Galindo J. M. et al. Tetrahedron: Asymmetry, 2015, 26, 325-332

• “Solvent Engineering: An Effective Tool to Direct Chemoselectivity in a Lipase-Catalyzed Michael Addition”. Priego J., Ortiz-Nava C., Carrillo-Morales M. et al. Tetrahedron, 2009, 65, 536-539

• “Michael Additions of Amines to Methyl Acrylates Promoted by Microwave Irradiation”. Escalante J, Carrillo-Morales M., Linzaga I. Molecules, 2008, 13, 340-347

• “Macrocyclic Diorganotin Complexes of δ-Amino Acid Dithiocarbamates as Hosts for Ion-Pair Recognition”. Cruz-Huerta J., Carrillo-Morales M., et al. Inorganic Chemistry, 2008, 47, 9874-9885

CAPíTULOS EN LIBROS • “Algunos Resultados Interesantes de las Reacciones con Microondas”. Escalante J., Carrillo-Morales M. en Aplicaciones de Microondas en Química y en Biología, Editado por Eusebio Juaristi, El Colegio Nacional 2009, 129-150, ISBN: 978-607-7360-31-9.

Dra. María Inés Chávez BéjarProfesor investigador de la Maestría en Ciencias en Biotecnología UpemorProfesor de Tiempo Completo Ingeniería en BiotecnologíaCandidato del SNIContacto: [email protected]

LÍNEAS DE INVESTIGACIÓN Las líneas de investigación se centran en áreas de ingeniería metabólica, fisiología bacteriana e ingeniería de bioprocesos. Está desarrollando diversos proyectos en la planta piloto de la Upemor en colaboración con el Dr. Jesús Hernández, enfocados a la producción de bacteriófagos por fermentación, útiles en el control biológico empleando como modelo Ralstonia solanacearum y el fago FITL-1. Así mismo, se está estandarizando la purificación de bacteriófagos a escala laboratorio. En sintonía con lo anterior, actualmente trabaja en el aislamiento y caracterización de diversos fagos específicos para aislados clínicos de Pseudomonas aeruginosa. Finalmente, derivado de su estancia postdoctoral en la Facultad de Química (UNAM), está concluyendo el estudio el rol fisiológico de la betaína aldehído deshidrogenasa en P. aeruginosa.

PUBLICACIONES RELEVANTES• Chávez-Béjar, M.I.; Balderas-Hernández, V.E.; Gutiérrez-Alejandre, A.; Martínez, A.; Bolívar, F.; Gosset, G. 2013. Metabolic engineering of Escherichia coli to optimize melanin synthesis from glucose. Microbial Cell Factories. (12)108.

• Chávez-Béjar, M.I.; Báez-Viveros, J.L.; Martínez, A.; Bolívar, F.; Gosset, G. 2012. Biotechnological production of L-tyrosine and derived compounds. Process Biochemistry. (47)1017-1026.

• Chávez-Béjar, M.I., Lara, A.R., López, H., Hernández-Chávez, G., Martinez, A. Ramírez, O.T., Bolívar, F., Gosset, G. 2008. Metabolic engineering of Escherichia coli for L-tyrosine production by the expresión of the genes coding for the chorismate mutase domain from native P-protein and a cyclohexadienyl dehydrogenase from Zymomonas mobilis. Appl. Environ. Microbiol. (74) 3284-3290.

• Chávez, M.I., Martínez, A., Bolívar, F., Gosset, G. 2005. Metabolic pathway engineering for microbial production of aromatic amino acids. Res. Adv. in Food Science. (5) 11-19s

CAPÍTULOS EN LIBROS • Chávez-Béjar, M.I.; Rivera-Corona, J.J.; Hernández-Romano, J. 2016. Metabolic engineering strategies applied to the production of aromatic amino acids. En Advances in Engineering Research. Petrova, V. Ed. Nova Publishers. (12) 65.

Dr. Jesús Hernández RomanoProfesor investigador de la Maestría en Ciencias en Biotecnología UpemorProfesor de Tiempo Completo Ingeniería en BiotecnologíaContacto: [email protected]

LÍNEAS DE INVESTIGACIÓN 1.- Detección, aislamiento y caracterización de fitopatógenos bacterianos en cultivos de importancia económica.

2.- Detección, aislamiento y caracterización de patógenos bacterianos de importancia en sanidad vegetal.

3.- Detección, aislamiento y caracterización de patógenos bacterianos, causantes de infecciones en piel, ojos y oídos.

4.- Aislamiento y caracterización de bacteriófagos específicos para patógenos bacterianos de importancia comercial y clínica.

Dra. Sandra Morales ArrietaProfesor investigador de la Maestría en Ciencias en Biotecnología UpemorProfesor de Tiempo Completo Ingeniería en BiotecnologíaContacto: [email protected]

LÍNEAS DE INVESTIGACIÓN Tecnología enzimática En este grupo se desarrollan proyectos enfocados a la caracterización bioquímica y molecular de enzimas con aplicación industrial, las cuales son obtenidas de diversos orígenes, particularmente trabajamos con el aislamiento y caracterización de β- fructofuranosidasas de Clavibacter michiganensis subsp. Michiganensis, que podrán ser usadas para la hidrólisis de fructanas de origen bacteriano que finalmente tienen el objetivo de aplicarse como un alimento funcional. En ese mismo tenor estamos caracterizando fructanasas a partir de levaduras aisladas en el Estado de Morelos, en ambos casos analizaremos las mejores condiciones para la optimización de su producción así como de su estabilidad y especificidad. También estamos interesados en la búsqueda por análisis bioinformático de inulinasas presentes en hongos y levaduras. Por otro lado, trabajamos en el estudio de la vida de anaquel en zarzamoras recubiertas con biopelículas de almidón termoplástica, enfocados en el análisis microbiológico para alargar su vida de anaquel.

Dr. José Luis Rivera CoronaProfesor investigador de la Maestría en Ciencias en Biotecnología UpemorProfesor de Tiempo Completo Ingeniería en BiotecnologíaContacto: [email protected]

LÍNEAS DE INVESTIGACIÓN 1.- Línea de Generación o Aplicación del Conocimiento LGAC (del cuerpo académico)Diseño de nuevos productos de aplicación biotecnológica para el desarrollo sustentable.

2.- Líneas de Generación o Aplicación Innovadora del Conocimiento (Individuales).• Evaluación de las características fisicoquímicas y mecánicas de películas biodegrables a base de polímeros naturales.• Diseño de bioprocesos para la producción de polímeros por fermentación bacteriana.

Los intereses del laboratorio a nivel de ciencia aplicada, son el desarrollo de materiales plásticos biodegradables a partir de mezclas de polímeros de origen natural o producidos por fermentación bacteriana. Trabajamos con distintos tipos de biomoléculas, de entre las que se destacan el almidón de sorgo, lignina de agave, quitosano y nanoarcillas. Realizamos análisis de las propiedades

mecánicas y de barrera de biopelículas. La aplicación de estos materiales está enfocada al desarrollo de empaques para alimentos que sean amigables con el ambiente y se explora también la aplicación como recubrimiento comestible en frutas y hortalizas básicamente, con el objeto de prolongar su vida de anaquel. Respecto al diseño de bioprocesos para la producción de polímeros por fermentación bacteriana, estamos interesados en la producción y/o aplicación de moléculas como levanas y dextranas, además de polihidroxialcanoatos.

PUBLICACIONES RELEVANTES • Rivera-Corona, J.L., Rodríguez-González, F., Rendón-Villalobos, F., García-Hernández, E., Solorza-Feria, J (2014). Thermal, structural and rheological properties of sorghum starch with cactus mucilage addition. LWT - Food Science and Technology. Elsevier Vol. 59.

• Rivera-Corona, J. L.; Rendón-Villalobos, R.; Solorza-Feria, J. (2014). Mechanical properties of starch-clay-mucilage composite films. International Congress on Applications of Nanotechnology. México, D.F.

• José Luis Rivera-Corona, Javier Solorza-Feria, Edgar García-Hernández, Rodolfo Rendón-Villalobos (2014). Thermal, structural and rheologic behaviour of thermoplastic shorgum starch. 9th Annual European Rheology Conference. Baden-Wurtemberg, Alemania.

• Rivera-Corona, JL; Rendón-Villalobos, R; Flores-Huicochea, E; Rodríguez-Sales, F; Solorza-Feria, J (2013). Rheological behaviour of sorghum starch-cactus mucilage film forming solutions, during strain and temperature ramps. 8th Annual European Biology Conference. Leuven, Bélgica.

CAPÍTULOS EN LIBROS • Chávez-Bejar, M. I., Rivera-Corona, J. L., Hernández-Romano, J., (2016). Metabolic Engineering Strategies Applied to the Production of Aromatic Amino Acids. Advances in Engineering Research. Nova Science Publishers 1st Ed. ISBN 978-1-63484-483-3.

Dr. Jorge Vergara Galicia Profesor investigador de la Maestría en Ciencias en Biotecnología Upemor

Dr. Ramón Cervantes RiveraProfesor investigador de la Maestría en Ciencias en Biotecnología Upemor

f). Sistema de tutorías: El sistema de tutorías se desarrolla en dos modalidades: (1) a través del acompañamiento del director de tesis y (2) a través del acompañamiento del comité tutorial:

(1) La tutoría a través del acompañamiento del director de tesis.El acompañamiento del director de tesis consistirá en asesorar y orientar al estudiante en dos aspectos. El primero de ellos se refiere a la definición de la trayectoria ideal para cada estudiante de acuerdo con sus necesidades; el papel del director de tesis será diagnosticar el perfil del estudiante

para que juntos definan la trayectoria de formación que se seguirá. Esto implica:

a). Ajustar el proyecto de investigación del estudiante a una de las líneas de generación y aplicación del conocimiento de la MCBT.

b). Con base en los exámenes de admisión, la entrevista del proceso de selección y el tema de investigación del estudiante, se deberá definir el plan de formación individual.

c). Determinar otras actividades de formación como la co-dirección de tesis y/o la realización de estancias en institutos o universidades nacionales o extranjeras. De manera que esto represente el fortalecimiento de vínculos académicos o la creación de nuevos.

(2) A través del acompañamiento del comité tutorial.El comité tutorial implica un proceso de acompañamiento colegiado a lo largo del proceso de formación. El comité tutorial será asignado una vez que el aspirante haya sido aceptado al programa, estará compuesto por dos profesores-investigadores además del director de tesis. La razón de ser del comité tutorial se basa en la idea de diversificar la asesoría de tesis con el apoyo de más de un experto en el tema, de esta manera se busca asegurar, desde un inicio del proceso de formación, que el tema de estudio será pertinente y que, de manera sistemática, se apoyará y evaluará el desarrollo de la investigación de cada estudiante.

g). Producción académica relevante Algunas de las publicaciones más recientes son:

Artículos de investigación:• Avila-Fernandez,A. Cuevas-Juarez,E. Rodriguez-Alegria,M.E. Olvera,C. Lopez-Munguia,A. 2016. Functional characterization of a novel beta-fructofuranosidase from Bifidobacterium longum subsp. infantis ATCC 15697 on structurally diverse fructans Journal of Applied Microbiology, 121, 263-276.

• “Structural Features of N-benzylated-b-amino Acid Methyl Esters Essential for Enantiodifferentiation by Lipase B from Candida antarctica in Hydrolytic Reactions”. Rangel H., Carrillo-Morales M., Galindo J. M. et al. Tetrahedron: Asymmetry, 2015, 26, 325-332.

• Rivera-Corona, J.L., Rodríguez-González, F., Rendón-Villalobos, F., García-Hernández, E., Solorza-Feria, J. 2014. Thermal, structural and rheological properties of sorghum starch with cactus mucilage addition. LWT - Food Science and Technology. Elsevier Vol. 59.

• Chávez-Béjar, M.I.; Balderas-Hernández, V.E.; Gutiérrez-Alejandre, A.; Martínez, A.; Bolívar, F.; Gosset, G. 2013. Metabolic engineering of Escherichia coli to optimize melanin synthesis from glucose. Microbial Cell Factories. (12)108.

Capítulos en libros:• Miguel A. Ibarra-Arellano, Adrián I. Campos-González, Luis G. Treviño-Quintanilla, Andreas Tauch and Julio A. Freyre-González. 2016. Abasy Atlas: a comprehensive inventory of systems, global network properties and systems-level elements across bacteria. Database. 1-16. Publicado Online. ISSN 1758-0463.

• Moeller, Gabriela; Guillén A.; Treviño L. y Lizama C. 2016. Reúso de aguas residuales tratadas como fuente directa o indirecta de agua potable. Libro de aguas para reúso de la Asociación Internacional de Ingeniería Sanitaria y Ambiental (AIDIS).

• Chávez-Bejar, M. I., Rivera-Corona, J. L., Hernández-Romano, J. 2016. Metabolic Engineering Strategies Applied to the Production of Aromatic Amino Acids. Advances in Engineering Research. Nova Science Publishers 1st Ed. ISBN 978-1-63484-483-3.

• Olvera-Carranza,C. Avila-Fernandez,A. Bustillo-Armendaris,G.R. Lopez-Munguia,A. 2015. Processing of Fructans and Oligosaccharides from Agave Plants en: Preedy,V. Processing and Impact on Active Components in Food. London. Elsevier. pags. 121-129.

• “Algunos Resultados Interesantes de las Reacciones con Microondas”. Escalante J., Carrillo-Morales M. en Aplicaciones de Microondas en Química y en Biología, Editado por Eusebio Juaristi, El Colegio Nacional 2009, 129-150, ISBN: 978-607-7360-31-9.

h). Vinculación con otros sectores de la sociedad. Los miembros del NAB han realizado diversos acuerdos y convenios de colaboración con el sector público y privado a nivel nacional e internacional. Hasta el momento se han desarrollado 22 convenios que se identifican por la naturaleza de sus objetivos. Cuatro de los convenios están orientados a la realización de proyectos de investigación que se inclina a la obtención de recursos como es el caso de los Fondos Mixtos de Fomento a la Investigación Científica y Tecnológica, el IMTA, INIFAP y Produce Morelos.

Tres de los convenios celebrados se refieren a la contratación de servicios con el objetivo de obtener productos que benefician a la comunidad universitaria y a la sociedad en general. En este caso se encuentran los convenios con INNO-BA y la FESE.

Y finalmente se tiene el registro de 15 convenios celebrados con instituciones en la modalidad de contratos específicos que tienen el objetivo de trabajar en conjunto con la Upemor para promover proyectos de investigación en beneficio del desarrollo tecnológico científico a favor de la sociedad mexicana. En este caso se tiene la participación de las instituciones como IPN, FIRCO, UNAM, UAEM, UNIVERSIDAD REY JUAN CARLOS DE ESPAÑA, UNIVERSIDAD TECNOLÓGICA DEL SUR DEL ESTADO DE MORELOS, SNEMOR Y AGROMAGNESIO.

i). Procesos administrativos.

Requisitos para participar en el proceso de admisiónPrimera etapa: Registro y entrega de documentación solicitada para participar en el proceso de selección.

1. Llenar la cédula de admisión y descargar las fichas de pago de derecho a aplicación de exámenes de conocimientos especializados en Biología y Química y examen psicométrico que salen al final del registro de datos en el siguiente link: http://goo.gl/w2dddk

2. Ingresar a la página de CENEVAL y realizar el proceso de registro y pago para el examen EXANI-III (costo de aplicación nacional) (http://goo.gl/rLp1J0) en la fecha de aplicación señalada en la presente convocatoria.

3. El aspirante deberá acudir en las fechas señaladas en la presente convocatoria a la ventanilla de Servicios Escolares de Upemor ubicada en el edificio principal UD1 con la totalidad de los documentos que se describen a continuación:

a) Cédula de admisión descargada del portal de Upemor.

b) Comprobante de pago de la ficha de derecho a aplicación de exámenes: EXANI-III CENEVAL (costo de aplicación nacional), examen de conocimientos especializados en Biología y Química y examen psicométrico.

c) Título* y certificado de estudios de licenciatura en Ingeniería Química, Biología, Bioquímica, Biotecnología, Ambiental o Agronomía, o afín de acuerdo con la valoración del Consejo Interno de Posgrado con un promedio igual o mayor a 8.0.

*En caso de no contar con título debe presentarse una constancia emitida por la universidad de procedencia donde se indique que el titulo se encuentra en trámite.

d) Cédula profesional de estudios de Licenciatura.

e) Acta de nacimiento.

f) Currículum Vitae con documentos probatorios.

g) Dos fotografías tamaño infantil.

h) Credencial de elector.

i) Carta de exposición de motivos por los cuales desea ingresar al Programa dirigida al coordinador de la MCBT.

j) Carta compromiso para dedicarse de tiempo completo dirigida al coordinador de la MCBT.

k) Dos cartas de recomendación académicas dirigidas al coordinador de la MCBT.

l) Carta del aspirante dirigida al coordinador de la MCBT donde se indique el nombre del tutor propuesto perteneciente al Núcleo Académico Básico de la maestría en ciencias en biotecnología de la Upemor y el proyecto en el que el aspirante participará en caso de ser seleccionado.

m) Presentar una carta que acredite la comprensión de textos del idioma inglés expedida por una institución con validez oficial.

n) En el caso de que los estudios de licenciatura hayan sido realizados en el extranjero, el aspirante deberá gestionar el dictamen técnico de reconocimiento de estudios emitido por la Secretaría de Educación Pública.

Toda la documentación requerida se presentará en original y una copia. Los documentos originales se presentarán sólo para cotejo en el proceso de selección, en caso de ser aceptado al Programa, deberá entregarlos en la Dirección de Servicios Escolares.

Segunda etapa: Proceso de selección 1. El aspirante deberá atender las fechas establecidas por el calendario correspondiente a la presente convocatoria para presentar tres exámenes:

a) Examen de conocimientos EXANI-III. El examen será aplicado en la fecha nacional de aplicación de EXANI-III asignada en la presente convocatoria en las instalaciones de las sedes nacionales autorizadas por CENEVAL (http://goo.gl/QNdFdO).

b) Examen de conocimientos especializados en Biología y Química aplicado en las instalaciones de Upemor.

c) Examen psicométrico aplicado en línea.

2. El aspirante deberá presentarse a una entrevista con el comité de selección integrado por tres miembros del Núcleo Académico Básico de la MCBT en las fechas establecidas en la presente convocatoria. Cada miembro emitirá un informe derivado de la misma respecto a:

a) Las expectativas del aspirante respecto a sus estudios.b) Situación laboral actual para evaluar su disponibilidad para ser estudiante de tiempo completo.c) Trayectoria escolar.d) d) Situación actual (económica, socio-cultural y familiar).

3. El aspirante deberá presentar el análisis de un artículo de investigación científica ante el comité de selección integrado por tres miembros del Núcleo Académico Básico de la MCBT en la fecha indicada en la presente convocatoria.

4. El comité de selección dictaminará si el aspirante cubre los requisitos necesarios para ingresar a la maestría con base en los resultados de (a) Exámenes de conocimientos EXANI-III, conocimientos especializados en Biología y Química y psicométrico, (b) Análisis del artículo científico y (c) Entrevista. El dictamen emitido por el comité de selección será inapelable.

5. El dictamen emitido por el comité de selección será publicado en las oficinas de la Dirección de posgrado y educación continua y en la página de Upemor en los tiempos previstos en la presente convocatoria.

6. A los aspirantes aceptados se les entregará la carta de aceptación en la Dirección de Posgrados y Educación Continua de la Upemor asignándoles un director de tesis y comité tutorial. A los estudiantes no aceptados sólo se les informará la decisión del Comité.

7. Para finalizar su ingreso al programa, el aspirante aceptado deberá realizar el proceso de inscripción al programa en las fechas establecidas en la presente convocatoria, debiendo cumplir con los siguientes requisitos: firmar una Carta de protesta donde acepta cumplir con los procedimientos y disposiciones reglamentarias de la Upemor, carta de dedicación de tiempo completo al posgrado CONACYT, proporcionar su número de CVU CONACYT.

Mapa curricular

Seminario de Tesis

Avances de investigación Contenido del escrito y nivel discusión

El protocolo deberá contener: 1) título, 2) introducción, 3) planteamiento del problema, 4) justificación, 5) objetivos generales y específicos, 6) preguntas de investigación e hipótesis, 7) marco teórico, 8) metodología, 9) cronograma de trabajo y 10) Referencias (bibliográficas o electrónicas).

Definición de metodologías para llevar a cabo el trabajo experimental y primeros experimentos en el laboratorio. Presentación de una parte del trabajo experimental. Exposición de los primeros avances del estado del arte.

Nota: Los requerimientos para la presentación de avances de investigación pueden variar si así lo considera el comité tutorial, tomando en cuenta el perfil del estudiante y el tema de investigación. Los requerimientos expresados en este cuadro sólo son un ejemplo de los avances de investigación acordados por el comité tutorial.

Presentación y discusión de resultados de investigación.

Presentación y discusión de primeras conclusiones.

Presentación del borrador de tesis con el objetivo de atender las posibles correcciones finales (análisis de la congruencia de la investigación).

Estado del arte terminado y la definición de perspectiva teórica para el análisis e interpretación de los resultados.

Protocolo.

Estado del arte y definición de perspectiva teórica.

Definición de metodologías para llevar a cabo el trabajo experimental.

Resultados de investigación.

Conclusiones.

Presentación de la investigación concluida y prospectiva de la investigación.

Tabla 1. Contenido de los avances de investigación en los seminarios de tesis.

Tesis I10%

Tesis II20%

Tesis III40%

Tesis IV60%

Tesis V80%

Tesis VI100%

Mapa curricular

PrimeroSeminario de

tesis I

Seminario de investigación I

Bioestadística

Seminario optativo general

Diseño experimental

Seminario optativo con

orientación 1-2

Seminario optativo con

orientación 1-2

Selección y manejo de

información

Seminario de tesis II

Seminario de investigación II

Seminario de tesis III

Seminario de investigación III

Seminario de tesis IV

Seminario de investigación IV

Seminario de investigación V

Seminario de investigación VI

Seminario de tesis V

Seminario de tesis VI

Segundo Tercero Cuarto Quinto SextoCuatrimestres

Mapa curricular

Calendario de Proceso de Selección MCBT 2016-2

Cuotas

Proceso

Concepto Monto

FechaFecha de emisión y publicación de la convocatoriaFecha de recepción de solicitudes y entrega de documentos Fecha de registro examen EXANI-III CENEVAL* Fecha de entrevistas con comité de selección

Publicación de resultados

Examen EXANI-III (costo aplicación nacional)Examen de conocimientos en BiologíaExamen de conocimientos en QuímicaExamen PsicométricoInscripción cuatrimestralColegiatura cuatrimestral

InscripcionesInicio de clases

Fecha de exámenes de selección:a) Conocimientos en Biología y Química b) Psicométricoc) EXANI-III CENEVAL**

Septiembre 2016

29 agosto - 26 octubre 201618 noviembre 2016

11 diciembre 201615 - 19 diciembre 2016

$464.00$283.00$283.00$453.00

$1,660.00$1,628.00

Enero 2017

18 noviembre 201620 noviembre 201626 noviembre 2016

1 septiembre - 31 octubre 2016

* El registro para la aplicación del examen EXANI-III será directamente en la página CENEVAL. **El lugar de aplicación del examen EXANI-III será en las sedes nacionales establecidas por CENEVAL.

Informes:Universidad Politécnica del Estado de MorelosBoulevard Cuauhnáhuac No. 566 Col. Lomas del Texcal, Jiutepec, Morelos. CP 62550t. directo +52 (777) 229 35 47

Lunes a viernes de 09:00 17:00 hrs. y sábados de 08:00 a 14:00 hrs.

www.upemor.edu.mx

Mapa curricular

Maestría en Ciencias en Biotecnología Convocatoria 2016-2 · 2017-05-24 · Maestría en Ciencias...

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