HUELLA DACTILAR DEL DQF-COSY Picos de cruce: 20 Picos de cruce esperados: ¿? V17 L1 A1 T2 A3 A2 T4...

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HUELLA DACTILAR DEL DQF-COSY Picos de cruce: 20 Picos de cruce esperados: ¿? V17 L1 A1 T2 A3 A2 T4 G18 N11 L2 W13 E1 U1 E2 U2 U3 L3 L5 L4 ÉPTIDO PROBLEMA: 1 T2 L3 T4 L5 E6 A7 A8 L9 R10 N11 A12 W13 L14 R15 E16 V17 G18 L19 K20

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HUELLA DACTILAR DEL DQF-COSY

Picos de cruce: 20Picos de cruce esperados: ¿?

V17

L1

A1

T2

A3

A2

T4

G18

N11

L2

W13

E1

U1E2

U2

U3

L3

L5

L4

PÉPTIDO PROBLEMA:K1 T2 L3 T4 L5 E6 A7 A8 L9 R10 N11 A12 W13 L14 R15 E16 V17 G18 L19 K20

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FUENTES DE INFORMACIÓN PARA IDENTIFICACIÓN DE SISTEMAS DE SPIN

Patrones típicos de picos de cruce en TOCSY y COSY para cada sistema de spin.Forma de las señales COSY (constantes de acoplamiento).Desplazamientos químicos típicos.Intensidad de los picos de cruce.

GRUPOS DE SISTEMA DE SPIN PARA IDENTIFICACIÓN:

Gly (1 Gly)Ala, Thr (3 Ala, 2 Thr)Val, Leu, Ile (5 Leu, 1 Val)Tipo J: Ser, Asp, Asn, Cys, Trp, Phe, Tyr, His (1 Asn, 1 Trp)Tipo U: Lys, Arg, Met, Gln, Glu, Pro (Leu) (2 Lys, 2 Arg, 2 Glu)Aromáticos. (1 Trp)Tipo X.

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PÉPTIDO PROBLEMA: ESPECTRO COSY.

Identificación de sistemas de spin de alanina, treonina y glicina.

CH

N

C

CH3

O

H

1

2

Alanina

CH

N

C

C C2H3

H

O1HO

H

1

2

3

A1

T2

A2

A3

T4

Treonina

NOE3CH

N

C

H

O

H

1

2

Glicina

G18

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A1T2

TOCSY. Identificación de sistemas de spin de alanina y treonina.

A3

A2

T4

G18

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CH

N

C

C C

C2H3

C1H3

O

H

1

2 3

3

H

H

H4

42

L1

PÉPTIDO PROBLEMA: ESPECTRO COSY.

Identificación de los sistemas de spin de valina y leucinas.

CH

N

C

C H

C2H3

C1H3

O

H

1

2 3

3

Valina Leucina

V17

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TOCSY. SISTEMAS DE SPIN COMPLETOS DE VALINA Y LEUCINA

V17

L1

A1T2

A3

A2

T4

G18

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TOCSY. OTRA LEUCINA Y SISTEMAS TIPO J

Leu?

V17

L1

A1T2

A3

A2

T4

G18

W13L2

N11

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TOCSY. SISTEMAS DE SPIN COMPLETOS DE TIPO U

V17

L1

A1T2

A3

A2

T4

G18

W13L2

N11

E1

U1 E2

U2U3

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PICOS DE CRUCE COSY PARASISTEMAS DE SPIN DE TIPO U

CH

N

C

C

O

H

1

2

H

H

2…

12

1 2

2211

1

2

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TOCSY. LEUCINAS RESTANTES

V17

L1

A1T2

A3

A2

T4

G18

W13L2

N11

E1

U1 E2

U2U3

L3

L4

L5

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PARTE DE OTROS SISTEMAS DE SPIN DE LEUCINAS

L5

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V17

L1

A1T2

A3

A2

T4

G18

W13L2

N11

E1

U1 E2

U2U3

L3

L4

T2

T2 T2

T2

T2T2

A1A1

A1

L5

L5

L5

L5 L5

L5

L5

L5

L5

L5

L5

L5

L3

L3

L3

L3

L3

L3

L3L3

L1

L1

L1

L1

L1 L1

L1

L1

L1L1

L1

L1

L1

TOCSY: identificación de sistemas de spin completa

W13 W13

W13

L4

L4

L4

L4 L4

L4L4

L4 L4

L1

E1

E1

E1

E1

E1 E1

E1

E1

N11 N11

N11

N11

N11

W13

W13

U1

U1U1

U1

U1

U1U1

U1

U1

U1 U1

U1U1

U1U1

A3A3

A3

E2

E2

E2

E2

E2

E2 E2

E2

A2 A2

A2

V17

V17 V17 V17 V17

V17

V17

V17V17

V17

L2

L2

L2

L2

L2

L2L2

U2

U2

U2

U2

U2

U2 U2

U2

U2U2

U2

U2U2

U2U2

T4

T4

T4

T4 T4

G18

G18

U3

U3U3

U3

U3 U3

U3

U3U3

U3U4

U4

U4

U4

U4

U4

U4

U4

L5

U4

U4

U4

U4

U4

U4U3

L2

U3

U4

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V17

V17

L5L1 L2

L3 L4

L5 U3L1

U4

U2 U1 U3

U4 L1

L5

U1

U2

L5

L3L1

L4 L2

E1

E1

L5

E1

V17U1E2 L1

U4U2

L4

U3

A3

A1

A2

T2

T4L3 L2

T2

T2T4

T4

G18

G18

V17

L1 A1

T2A3

A2

T4

G18

W13L2

N11

E1

U1

E2 U2U3

L3

L4

L5

COSY: identificación de sistemas de spin

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SISTEMA DE SPIN DE ANILLO AROMÁTICO DE W13

3

21

CH2 C

C2

C1 N1

C2

C2

C3 C2

C3

H1 H1

H2

H2

H3

H31 2

3

4NOE1

NOE2

NOE3

NOE4

H3 H3H2H2

H1

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CONEXIÓN SISTEMA TIPO J CON ANILLO EN W13 Y GRUPO AMIDA EN N11. NOESY

NOE2

NOE1CH2

C

C2

C1 N1

C2

C2

C3 C2

C3

H1 H1

H2

H2

H3

H31 2

3

4NOE1

NOE2

NOE3

NOE4

NOE4

W13

H1

H2

H1

N11

NOE 5

CH

N

C

C

O

H

H

H

C

O1

N2 H

HNOE 5 NOE 6

NOE 6

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V17

L1

A1 A3

A2

T4

G18

W13

L2

N11

E1

U1 E2

U2U3

L3

L4

T2

T2

A1A1

A1

L5

L5

L5

L5 L5

L5

L5

L5

L5

L5

L5

L5

L3

L3

L3

L3

L3

L3L3

L1

L1

L1

L1

L1 L1

L1

L1

L1L1

L1

L1

L1

W13 W13

W13

L4

L4

L4

L4 L4

L4

L4 L4

L1

E1

E1

E1

E1

E1 E1

E1

E1

N11 N11

N11

N11

N11

W13

W13

U1

U1U1

U1

U1

U1

U1

U1

U1 U1

U1

U1

A3A3

A3

E2

E2

E2

E2

E2

E2 E2

E2

A2A2

A2

V17

V17 V17 V17

V17

V17V17

V17

L2

L2

L2

L2

L2

L2L2

U2

U2

U2

U2

U2

U2

U2

U2

U2

U2U2

U2

T4

T4

T4

G18

U3

U3U3

U3

U3U3

U3U4

U4

U4

U4

L5

U4

U4

U4

U4U3

L2

U3

T2

T2

T2

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V17

L1

A1 A3A2

T4

G18

W13

L2

N11

E1

U1 E2

U2U3

L3

L4

L5

T2

T2

W13