VIRUS

VIRUS: COMPONENTES• Algunos tienen DNA y otros RNA, pero nunca ambos ácidos nucleicos• En general tienen doble hélice de DNA( doble cadena), pero

pueden ser monocatenarios..• En muchos casos reciben el nombre de la enfermedad que causan

( ej. Virus Polio), o del tejido que afectan (ej.Adenovirus)• Contienen: Acido nucleico central, rodeado de una cubierta

proteica: cápside,cada proteina individual que forma la cápside se llama capsómero

• Formas: las más comunes son : Helicoidal: son largos cilindros, con una estructura central y rodeados de capsómeros.

Icosaedro: (20 caras triang. con 12 vértices.) Son en general virus pequeños de apariencia redondeada.

• Envoltura: son estructuras más complejas que rodean al complejo núcleo-cápside. No todos los virus poseen envoltura

VIRUS• Ser vivo con un elemento genético que contiene DNA o

RNA y que es capaz de alternar entre dos estados distintos:

Extracelular : infeccioso( virus completo para infectar otra célula)

Intracelular : fase replicativa ( donde reproducen los ácidos nucleicos y todos sus componentes para luego salir de la célula a infectar otra célula.)

• Varían de : tamaño, forma, composición, organismos atacados, tipos de daños celulares inducidos.

• Todos son sub- microscópicos ( no se ven con microscopio óptico), sólo pueden verse con microscopio electrónico

Virus : multiplicación• Deben introducirse en una célula viva para inducirla a fabricar

los componentes esenciales de una partícula vírica y debe hacerse de forma adecuada para poder escapar de la célula a infectar otra célula.

• Las fases pueden resumirse en 6 etapas:1. Fijación o adsorción: a la célula huesped

( Hepatocitos del hígado, por ej)2. Penetración en la célula3. Replicación del ácido nucleico en la cél.-huesped4. Producción de capsómeros y otros componentes5. Reunión de ácido nucleico – capside dando lugar

a nuevas partículas víricas6. Liberación de las partículas víricas para infectar

otas células

1-Reproduciéndose en el interior de la célula infectada, utilizando todo el material y la maquinaria de la

célula hospedante.

2- Uniéndose al material genético de la célula en la que se aloja, produciendo cambios genéticos en ella.

Por eso se pueden considerar los virus como agentes infecciosos productores de enfermedades o como agentes genéticos que alteran

el material el material hereditario de la célula huésped.

Los virus pueden actuar de dos formas distintas:

No poseen metabolismo ni organización celular, por lo que se les situa en el límite entre lo vivo y lo inerte.

Interacción Huesped - Virus

• En la naturaleza un virus ataca generalmente organismos relacionados( humanos, aves, plantas, determinados órganos, etc)

• En el Laboratorio pueden infectarse huéspedes que no se infectan naturalmente ( determinadas líneas celulares)

• Especificidad Huesped - Virus : está dada por la especificidad entre el lugar de adsorción del huesped y de fijación del virus

• Daños en el huesped: son variables, desde los virus latentes que por años están mudos de síntomas en el huesped, hasta los extremadamente virulentos como el de la Polio, que disgrega los polirribosomas del huesped produciendo inhibición de la síntesis proteica en éste.

Bacteriofago - Bacteria

Colección y transporte de muestras clínicas

• Tiempo de la toma dentro de la 1ª semana de síntomas

• Medios : solución salina o enriquecida con proteinas (suero o albúmina)

• Temperatura:conservar refrigeradas ( 4- 8 ºC )

• Rotular las muestras con nombre del paciente

• Hisopos: cualquiera sea su procedencia ( faringe, piel, recto,conjuntiva,genitales) deben enviarse dentro de medio de transporte especial.

• Sangre:entera, anticoagulada con EDTA, recogida en forma esteril.

• Suero:Dos sueros sin anticoagulante. El 1º en etapa sintomática y el 2º en convalescencia

VIRUS RESPIRATORIOS

Cuáles son?

Son un verdadero problema sanitario?

Tiene costo beneficio su diagnostico?

Es posible la prevención?

?

?

?

?

?

??

??

?

?

??

Faringitis

Cuántas enfermedades pueden producir?

OtitisOtitis

AAdeno

Causa o contribuye a la muerte de 4 a 5 millones de niños por año en países en vías de desarrollo. En Argentina son causales de un 10% de las muertes en menores de 1 año. Un niño en un área urbana tiene 5 a 8 episodios de enfermedad respiratoria anuales en sus dos primeros años de vida. Son causa de infecciones nosocomiales: pacientes de riesgo (alta mortalidad VRS,ADV,PI3)

personal de salud ( ausentismo- infecciones nosoc.) La gravedad de alguno de ellos en el grupo de 0-4 años es semejante a la de > 65 años.

VIRUS RESPIRATORIOSEn cifras... avaladas por la literatura

A QUIENES PUEDEN AFECTAR??

NIÑOS ***

ANCIANOS***

JOVENES ADULTOS*

PUEDEN DEJARSECUELASGRAVES( ADV)

BQL lactante

Neumonitis

Neumonía

FAMILIA GENERO VIRUSOrthomyxoviridae

Influenzavirus

Influenza tipos A, B y C

Paramyxoviridae

Respirovirus Parainfluenza tipos 1, 2, 3 y 4A y B

PneumovirusMetapneovirus

VSR subgrupos A y BMetapneumovirus humano.

Adenoviridae Adenovirus Adenovirus serotipos 1 a 49 ( 3* y 7 *)

Picornaviridae Rhinovirus >99 tipos Resfrío común

Coronaviridae Coronavirus SARS ( Co-V)

Quiénes son....?

El virusLos viriones están envueltos y contienen ocho segmentos de ARNTienen espículas formadas por dos glicoproteínas: HA y NA.Para el IA se conocen 15 subtipos de HA y 9 de NA.Tienen gran variabilidad antigénica .La población más afectada

INFLUENZA A Y BVirus de la GRIPE

Mayores de 65 años LactantesCardiópatas Enfermedad pulmonar previaInmunosuprimidos Enfermedades debilitantes

Se propaga de persona a persona por gotas de secresiones respiratorias forma indirecta por objetos contaminados. Período de incubación: 1 a 7 días. Sobrevive en secresiones respiratorias secas y en superficies del medio ambiente por 1 o 2 días.Sintomas: cefalea, fiebre, coriza. BQL- NM- Neumonitis> 50 % internaciones y 80% de mortalidad en > 65 años

GRIPE

1918 20.000.000muertes

0102030405060708090

100

ENERO MAYO SEPTIEMBRE

19992000200120022003

GRIPE: INCIDENCIA ESTACIONAL

PREVENCION: Aislamiento respiratorio Vacuna

PROGRAMAS DE VIGILANCIA: GRIPE DE INFECCIONES RESPIRATORIAS AGUDAS VIRALES Anual: recogiendo y publicando la informaciones semanalmente

Centros centinelas

Laboratorios de red de vigilancia

Laboratorio de referencia

CENTROS DE CONTROL

VACUNA ANUAL

Inst.Malbrán

Lab de OMSCDC Atlanta

Htal Garrahan

Marzo-mayo

Médicos de todoel país

A/ Panamá/2007/99 (H3N2)A/New Caledonia/20/99 (H1N1)B/Sichuan/379/99Similares a la cepa B/Yamanashi/166/98Similares a la cepa B/Johannesburg/5/99

Análogo al A/Moscow/10/99 (H3N2) A/Panamá/2007/99 (H3N2)Análogo al A/New Caledonia/20/99 (H1N1)Análogo al B/Sichuan/379/99 B/Guandong/120/2000, B/Johannesburg/5/99 B/Victoria/504/2000

Efectividad aproximada de 80% de prevención Redujo en un 75% las muertes por influenza y las complicaciones en pacientes que requieren hospitalización.

ALTO COSTO BENEFICIO

Cepas circulantes en el año 2001

Vacuna 2002 recomendada por OMS para 2002  A/Nueva A/Nueva

Caledonia/20/99(H1N1)Caledonia/20/99(H1N1)A/Fujian/411/2002(H3N2)A/Fujian/411/2002(H3N2)B/Hong Kong/330/2001B/Hong Kong/330/2001

2004

Contiene una cadena de ARN Parainfluenza 3

Es el más frecuente en nuestro medio PRODUCE: neumonía , bronquiolitis ( < 1 año),

coup, laringits , otitis media aguda (niños 2 – 5 años) Brotes en primavera. Son comunes las reinfecciones. Se elimina de 4 a 7 días. Se transmite de persona a persona

PARAINFLUENZA 1 2 3El virus

Mortalidad: 2.8%

Htal Garrahan

0

5

10

15

20

25

ENERO MAYO SEPTIEMBRE

19992000200120022003

INCIDENCIA ESTACIONAL

Htal Garrahan

PREVENCION: Aislamiento de contacto

Es más pequeño que los Parainfluenza, es envuelto y tiene una cadena de ARN

Es el patógeno respiratorio más importante en niños de 0 – 3 años . Causante de bronquiolitis y neumonitis

3 a 5 % necesita hospitalización. En adultos produce enfermedad del tracto respiratorio superior leve Las reinfecciones son comunes.

VIRUS SINCISIAL RESPIRATORIO

Mortalidad: 2.4%

VSR

Htal Garrahan

INCIDENCIA ESTACIONAL

050

100150200250300350400450500

ENERO MAYO SEPTIEMBRE

19992000200120022003

Htal Garrahan

Factores de riesgo Enfermedad cardíaca y broncopulmonar Inmunosupresión ( Tx MO, leucémicos) Prematuros y lactantes < 3 meses

El período de contagio de 3 a 8 días La transmisión directa o indirecta por fomites perdura en ambiente y secreciones por más de 48hs. Tratamiento Sintomático. Ribavirina ( sólo a inmunocomprometidos). Gammaglobulina hiperinmune. Vacuna?

VSR

PREVENCION: aislamiento de contacto

EL VIRUS: contiene ADN doble cadena , no son envueltos.No lo afectan el pH del estómago, las sales biliares o las enzimas proteolíticas, replica bien en el tracto gastrointestinal.

La transmisión es esporádica y epidémica.Se transmite por agua y fomitesSe mantienen activos a temperatura ambiente durante 7 días.

Los principales serotipos respiratorios son : 1, 2, 3, 5 y 7.

ADENOVIRUS

INFECCIONES Respiratorias Gastrointestinales Miocarditis, pericarditis, encefalitis, meningitis Cistitis hemorrágica.INCUBACION: 2 a los 14 días TRANSMISION: puede ser directa o indirecta

ADENOVIRUS

MORTALIDAD: 22%

EL 90% de los recién nacidos por vía transplacentaria reciben anticuerpos protectores hasta los seis meses de vida. Luego la curva desciende hasta los dos años.Edad: > 6 meses

INFECCION RESPIRATORIA responsables del 80% de los pacientes pediátricos con secuelas respiratorias graves por neumonitis necrotizante

INCIDENCIA ESTACIONAL

0

5

10

15

20

25

30

35

ENERO MAYO SEPTIEMBRE

19992000200120022003

PREVENCIONAislamiento respiratorio

METAPNEUMOVIRUS HUMANO: caracteristicas

Familia Paramixoviridae Genoma ARN Pleomorfico Con envoltura lipídica Glicoproteínas de

superficie – F, G

25% niños entre 6-12 meses 25% niños entre 6-12 meses tienen Actienen Ac Virtualmente todos los niños > Virtualmente todos los niños > 5 años son sero +5 años son sero + “ “EEl virusl virus circula hace medio circula hace medio centenar” centenar” Mayor prevalencia en niños < Mayor prevalencia en niños < 1 año (11.6)1 año (11.6) Sin prevalencia en cuanto a Sin prevalencia en cuanto a sexo y razasexo y raza.. ARGENTINA: 11% en BQL (- ) para otros virus ( CEMIC)

INCIDENCIA ESTACIONAL Año 2003

0

50

100

150

200

250

300

350

400

450

500

EN FEB MZO AB MAY J UN J UL AG SET OCT NOV DICIEMBRE

ADV VSR FLU A FLU B PARA 1 PARA 2 PARA 3

Muestras totales: 5320 Positivos: 24.72%

VSR: n= 910FLU A n=153

ADV n= 151

PARA 3 n = 97

Htal Garrahan

ADV VSR IA PI3

NM 43% 13% 21% 22%

BQL 42% 84% 49% 50%

Distres

86% 23% 78% 43

Presentación clínica

Htal Garrahan 2003

Dias de Htal

Requer. O2

Dias deO2

Requer. UCI

Dias UCI

ADV 30 89 27 31.2 22

VSR 12 93.8 11 13.2 1.4

IA 17 77 11 11 5

PI3 18 84.6 18 25 15

OTROS PARAMETROS EPIDEMIOLOGICOS

COSTO día / cama UCI: 790$ CIM: 490$

Htal Garrahan

Diagnóstico sindromático orienta a la causa solo a veces ¿Cuándo y para qué solicitar un examen virológico confirmatorio? Niño internado, con factores de riesgo. Confirmar Dx Fijar pronóstico Suspender terapéuticas innecesarias Cohortización de pacientes Evitar infecciones horizontales

Infecciones respiratorias virales diagnóstico etiológico

Resultados en el día

DIAGNOSTICO MICROBIOLOGICOEL LABORATORIO LA MUESTRA CLINICA

Exudado faringeo

Aspirado naso faríngeo

El resultado depende de la calidad de la muestra

Bioseguridad

Buena microscopíaCentrífuga

05

101520253035404550

1999200020012002

CUANDO PEDIRLO?PORCENTAJE DE POSITIVOS

Tiene costo beneficio el estudio entre los meses de mayo a setiembre

Metodologías de Metodologías de DiagnósticoDiagnóstico

Cultivo Convencional Cultivo rápidoELISA Inmunifluorescencia (antígenos virales)Biología molecular

Métodos de diagnóstico cuál elegir?

Cultivo convencional

Cultivo rápido

18- 20 díasS: 75% Costo: $ 40

24 – 48 hs S: 80% Costo : $ 30

ADV

Métodos de diagnóstico cuál elegir?

( -)

(+)

2 hsS: > 90%(Salvo ADV)$ : 13

ELISAVSR

FLU A1 hS: > 85 %$ : 30

FLUORESCENCIA

K.E.Irmen, Use of monoclonal antibodies for rapid diagnosis of respiratory viruses in a community hospital, 2000, Clinical and diagnostic laboratory inmunology , 7, 396-403

N=8670 S % E % VPP % VPN %TOTAL 84.2 87.7 70.7 94.0ADV 64.8 99.9VSR 90.6 93.3IA 84.3 95.1IB 82.6 99.0PI1 82.0 99.8PI2 41.3 99.9PI3 87.0 99.6

Valor de los estudios con AC monoclonales fluorescentes

Diagnóstico microbiológicoComparación Fluorescencia Directa / Cultivo viral

Cultivo: ADVEscaso Costo/ beneficio para diagnósticoImportante para colección de cepas para trabajo en vacunas

VSR - FLU A - FLU B -PARA FLU 1 2 3 El cultivo No tiene costo beneficio CDC Atlanta

Amplificación Molecular (PCR)

Gold standard 24- 48 hs > 50$

Métodos de diagnóstico cuál elegir?

El paciente sólo ADV de alta sospecha si dan (-) los otros métodosMetapnemovirus

Estudios de brotesTipificación de cepas

Screening de 7 virus

Algorritmo de trabajo diario11

12

(-) (+)

Identificación

Identificación13 - 14

Recepción de muestras

11.30

INFORME 2- 3 hs

Hora

FLUORESCENCIA CONANTICUERPOS MONOCLONALES

Mas de 1 virus ( VSR +ADV =0.4%)Htal Garrahan

Serv. Epidemiología Htal Garrahan

Aislamiento respiratorio

FLUADV

Aislamiento VSRde contacto PARA 3

Para el paciente Para la Intitución de Salud

Confirmar diagnósticoFijar pronósticoSuspender terapéuticas innecesarias

Cohortización de pacientesEvitar infecciones horizontalesAhorro en TTO ATB y en casos secundarios

OBJETIVOS DEL DIAGNOSTICO MICROBIOLOGICO