1

CURRICULUM VITAE 0. DATOS PERSONALES NOMBRE Santiago Ávila Ríos LUGAR DE NACIMIENTO México, D.F. FECHA DE NACIMIENTO 28 de octubre de 1976 NACIONALIDAD Mexicana ESTADO CIVIL Soltero NOMBRAMIENTO ACTUAL Investigador en Ciencias Médicas D, SNI-II LUGAR DE ADSCRIPCIÓN Centro de Investigación en Enfermedades Infecciosas Instituto Nacional de Enfermedades Respiratorias Calzada de Tlalpan 4502 Colonia Sección XVI, C. P. 14080 México D. F. TELÉFONO OFICINA (+52 55) 5666 7985 ext. 133 CORREO ELECTRÓNICO santiago_avila@yahoo.com.mx santiago.avila@cieni.org.mx 1. FORMACIÓN Doctorado Doctorado en Ciencias Biomédicas. Universidad Nacional Autónoma de México, Centro de Investigación en Enfermedades Infecciosas, Instituto Nacional de Enfermedades Respiratorias, México D. F., 2005-2009. Tesis: “Evolución del virus de inmunodeficiencia humana: Polimorfismos en el gen pol y presión selectiva por antígeno leucocitario humano y terapia antirretroviral en población mexicana”. Mención Honorífica, 02 de diciembre de 2009. Maestría MSc Molecular Medical Microbiology. The University of Nottingham, Nottingham, Reino Unido, 2001-2002. Tesis: “Construction of second-generation phage peptide display libraries for the isolation of mimotopes of the HIV neutralising antibody 2F5”. Pase con distinción, 2002 Licenciatura Química Farmacéutico Biológica. Universidad Nacional Autónoma de México, Ciudad Universitaria, México D. F., 1995-2000. Tesis: “Purificación y caracterización de las triosafosfato isomerasas mutantes de humano y levadura con una cisteína en la posición 14”. Promedio 9.91, pase con mención honorífica 2000 Idiomas INGLÉS Avance: 95% (hablado, escrito, traducción) First Certificate in English, University of Cambridge, 1992 Certificate in Advanced English, University of Cambridge, 1994 International English Language Testing System (IELTS), University of Cambridge / The British Council,

Band 8.0, 2001 JAPONÉS Avance: 70% (hablado, escrito)

Certificate in Japanese Language Proficiency (Nihongo Nouryoku Shiken) Level 3, The Japan Foundation / Association of International Education, Japan, 1997

2. EXPERIENCIA PROFESIONAL Instituto de Fisiología Celular, UNAM. Ciudad Universitaria, México D. F., 2000, 1 año: Trabajo en laboratorio de investigación durante el servicio social y la tesis de licenciatura sobre enzimas de protozoarios parásitos. Tutor: Dr. Ruy Pérez Montfort.

2

The University of Nottingham. Division of Microbiology and Infectious Diseases, Nottingham, Reino Unido, 2002, 6 meses: Trabajo en laboratorio de investigación durante el proyecto de investigación de la maestría utilizando técnicas de expresión de proteínas alógenas en fagos para el estudio de epítopos de anticuerpos ampliamente neutralizantes en el virus de la inmunodeficiencia humana. Tutor: Dr. Jonathan Ball. Instituto Nacional de Salud Pública, Laboratorio de evaluación de vacunas, Cuernavaca, Morelos, Enero 2003 – Septiembre 2004: Trabajo como químico investigador en proyectos relacionados con la evaluación y vigilancia epidemiológica de enfermedades prevenibles por vacunación como poliomielitis, sarampión, rubéola, hepatitis A, hepatitis B. Tutor: Dr. Juan Ruiz Gómez Case Western Reserve University. Center for AIDS Research, Cleveland, Ohio, E. U., Julio 2005 – Octubre 2005: Invitado por la Universidad para realizar estancia corta de investigación en efecto de mutaciones sobre la capacidad replicativa del virus de la inmunodeficiencia humana. Tutor: Dr. Eric Arts. Instituto Nacional de Enfermedades Respiratorias. Centro de Investigación en Enfermedades Infecciosas, Tlalpan, México D. F., Febrero 2004 hasta la fecha: Trabajo en laboratorio de investigación como investigador en ciencias médicas y coordinador de proyecto sobre evolución y epidemiología del virus de la inmunodeficiencia humana en población mexicana, utilizando técnicas generales de Biología Molecular, secuenciación de genes, tipificación de HLA, manejo de muestras biológico-infecciosas, separación de células, ensayos de actividad de linfocitos T citotóxicos, citometría de flujo. Tutor: Dr. Gustavo Reyes Terán Oxford University. Peter Medawar Building for Pathogen Research, Oxford, Reino Unido, 2010, 1 mes: Entrenamiento en técnicas de medición de capacidad replicativa viral mediante la construcción de virus recombinantes. Establecimiento de colaboración para desarrollo de proyecto de investigación multicéntrico. Tutor: Dr. Philip Goulder. 3. DOCENCIA Asignaturas impartidas a nivel licenciatura Bacteriología (Clave 1609), Facultad de Química, UNAM. Desde febrero de 2003 hasta diciembre 2011. 3 horas por semana. Profesor definitivo por examen de oposición desde noviembre de 2009 Estancia Estudiantil en Investigación. Facultad de Química, UNAM. Febrero de 2010 – Diciembre 2011. 320 h. Tutor. Tesis Dirigidas, nivel licenciatura Juan Blanco Heredia. “Evolución del virus de la inmunodeficiencia humana (VIH): Papel del antígeno leucocitario humano (HLA) como presión selectiva sobre el virus en pacientes mexicanos”. Trabajo experimental. Carrera: Biología. Universidad Autónoma Metropolitana, México D. F., 2007 Maribel Soto Nava. “Evolución del virus de la inmunodeficiencia humana (VIH) en México: Impacto de genes HLA de clase I en diferentes regiones de la República Mexicana”. Trabajo experimental. Carrera: Química Farmacéutico Biológica. Universidad Nacional Autónoma de México, México D. F., 2010 Eréndira Rojas Ortega. “Epidemiología Molecular del virus de la inmunodeficiencia humana: Estudio filogenético a partir de secuencias del gen env de virus circulantes en diferentes regiones geográficas de la República Mexicana”. Trabajo experimental. Carrera: Química Farmacéutico Biológica. Universidad Nacional Autónoma de México, México D. F., 2010 Humberto Valenzuela Ponce. “Tipificación HLA y epítopos de CTLs asociados en pacientes VIH positivos del Instituto Nacional de Enfermedades Respiratorias”. Trabajo experimental. Carrera: Biología. Universidad Nacional Autónoma de México, México D. F., 2010 Thalía Alejandra García Téllez. “Prevalencia de resistencia transmitida a inhibidores de integrasa en virus de inmunodeficiencia humana circulante en población mexicana”. Carrera: Química Farmacéutico Biológica. Universidad Nacional Autónoma de México, México D. F., 2012 Selma Nayely Alva Hernández. “Impacto de mutaciones en el gen gag en la capacidad replicativa del VIH en el contexto inmunogenético de la población mexicana”. Trabajo experimental. Carrera: Química Farmacéutico Biológica. Universidad Nacional Autónoma de México, México D. F., 2012 Daniela Tapia Trejo. “Polimorfismos y presión selectiva inmune de la secuencia de proteínas accesorias/reguladoras del VIH circulante en México. Trabajo experimental. Carrera: Química Farmacéutico Biológica. Universidad Nacional Autónoma de México, México D. F., 2012

3

Frida Sommer Obando. “Caracterización del gen gag de VIH-1 circulante en las poblaciones mexicana y guatemalteca”. Trabajo experimental. Carrera: Biología. Universidad Nacional Autónoma de México, México D. F., 24 de enero de 2013. Tania Jimena Escamilla Gómez. “Caracterización de sitios de interacción entre presión selectiva inmune y por fármacos antirretrovirales en la porción terminal Gag de VIH-1”. Carrera: Química Farmacéutico Biológica. Universidad Nacional Autónoma de México, México D. F., 9 de abril de 2013. María Elena Pacheco Martínez. “Análisis genotípico de resistencia a inhibidores de fusión en VIH circulante en las poblaciones mexicana y guatemalteca”. Carrera: Biología. Universidad Nacional Autónoma de México. México D. F., 19 de agosto de 2013. Alma Carolina Rincón Rubio. “Tropismo del virus de la inmunodeficiencia humana en pacientes vírgenes al tratamiento antirretroviral en México”. Química Farmacéutico Biológica, Universidad Autónoma del Estado de México, Toluca, 9 de junio de 2015. Anahí Tania Sánchez León. “Evolución asociada al antígeno leucocitario humano del gen gag del virus de inmunodeficiencia humana circulante en Centroamérica”. Biología, Benemérita Universidad Autónoma de Puebla, Puebla, 13 de mayo de 2016. Tesis Dirigidas, nivel maestría Claudia García Morales. “Resistencia primaria y secundaria de virus libre en plasma e integrado en células mononucleares de sangre periférica en personas con VIH de Guerrero”. Trabajo experimental. Carrera: Química. Universidad Autónoma de Guerrero, Chilpancingo, Guerrero, 2008 Selma Nayely Alva Hernández. “Caracterización del microbioma intestinal de individuos infectados por el virus de inmunodeficiencia humana mediante secuenciación de siguiente generación”. Maestría en Ciencias Biológicas, Universidad Nacional Autónoma de México, México D. F., 28 de agosto de 2015 Thalía Alejandra García Téllez. “Impacto de mutaciones seleccionadas por HLA en la capacidad replicativa del virus de inmunodeficiencia humana circulante en la Región Mesoamericana”. Maestría en Ciencias Biológicas, Universidad Nacional Autónoma de México, México D. F., 21 de septiembre de 2015. Tania Jimena Escamilla Gómez. “Impacto de la presión selectiva ejercida por HLA-I sobre la capacidad replicativa del virus de inmunodeficiencia humana en pacientes bajo tratamiento antirretroviral”. Mastría en Ciencias Biológicas, Universidad Nacional Autónoma de México, México D. F., 19 de enero de 2016. 4. INVESTIGACIÓN Trabajos publicados en revistas arbitradas

1. Téllez Valencia A, Avila Ríos S, Pérez Montfort R, Rodríguez Romero A, Tuena de Gómez Puyou MA, López Calahorra F, Gómez Puyou A. Highly specific inactivation of triosephosphate isomerase from Trypanosoma cruzi. BBRC 295, 958-963, 2002. PMID: 12127988

2. Avila Ríos S, Reyes Terán G, Espinosa E. Cornering HIV: Taking advantage of interactions between selective

pressures. Medical Hypotheses 69, 422-431, 2007. PMID: 17280799

3. Troyer RM, McNevin J, Liu Y, Zhang SC, Krizan RW, Abraha A, Tebit DM, Zhao H, Avila S, Lobritz MA, McElrath MJ, Le Gall S, Mullins JI, Arts EJ. Variable fitness impact of HIV-1 escape mutations to cytotoxic T lymphocyte (CTL) response.PLoS Path Apr;5(4):e1000365, 2009. PMID: 19343217

4. Santiago Avila-Rios, Christopher E Ormsby, Jonathan M Carlson, Humberto Valenzuela-Ponce, Juan Blanco-

Heredia, Daniela Garrido-Rodriguez, Claudia Garcia-Morales, David Heckerman, Zabrina L Brumme, Simon Mallal, Mina John, Enrique Espinosa and Gustavo Reyes-Teran. Unique features of HLA-mediated HIV evolution in a Mexican cohort: a comparative study. Retrovirology 6:72, 2009. PMID: 19664284

5. Ormsby CE, de la Rosa-Zamboni D, Vázquez-Pérez J, Ablanedo-Terrazas Y, Vega-Barrientos R, Gómez-Palacio

M, Murakami-Ogasawara A. Ibarra-Ávalos JA, Romero-Rodríguez D, Avila-Ríos S, Reyes-Terán G. Severe 2009 pandemic incluenza A (H1N1) infection and increased mortality in patients with late and advanced HIV disease. AIDS 2011 Feb 20;25(4):435-9. PMID: 21139486

4

6. Avila-Ríos S, García-Morales C, Garrido-Rodríguez D, Ormsby CE, Hernández-Juan R, Andrade-Villanueva J, González-Hernández LA, Torres-Escobar I, Navarro-Álvarez S, Reyes-Terán G. National Prevalence and Trends of HIV Transmitted Drug Resistance in Mexico. PLoS One, 2011, Nov. 6(11), e27812. PMID: 22110765

7. Avila-Ríos S, Mejía-Villatoro C, García-Morales C, Soto-Nava M, Escobar I, Mendizabal R, Girón A, García L,

Reyes-Terán G. Prevalence and patterns of human immunodeficiency virus transmitted drug resistance in Guatemala. Rev Panam Salud Publica, 2011;30(6):641-8. PMID: 22358416

8. Matthews PC, Koyanagi M, Kloverpris HN, Harndahl M, Stryhn A, Akahoshi T, Gatanaga H, Oka S, Juarez Molina

C, Valenzuela Ponce H, Avila Rios S, Cole D, Carlson J, Payne RP, Ogwu A, Bere A, Ndung’u T, Gounder K, Chen F, Riddell L, Luzzi G, Shapiro R, Brander C, Walker B, Sewell AK, Reyes Teran G, Hecherman D, Hunter E, Buus S, Takiguchi M, Goulder PJ. Differential Clade-Specific HLA-B*3501 Association with HIV-1 Disease Outcome Is Linked to Immunogenicity of a Single Gag Epitope. J Virol 2012 86(23):12643-54, 2012. PMID: 22973023

9. Gisela Barrera-Badillo, MSc, Ernesto Ramirez-Gonzalez, PhD, Rodrigo Aparicio-Antonio, Tatiana Nuñez-Garcia,

Dayanira Arellano-Suarez, Patricia Alcantara-Perez, MSc, Abril Rodriguez- Maldonado, Brisia Rodriguez-Reyes, Claudia Wong-Arambula, Elizabeth Gonzalez-Duran, MSc, Joanna Ortiz-Alcantara, MSc, Alberto Diaz-Quiñonez, PhD, Irma Lopez-Martinez, MSc, Gustavo Reyes-Teran, MPH, Joel Vazquez-Perez, PhD, Santiago Avila-Rios, PhD, Guadalupe Castañeda-Lopez, MD, Armando Robles-Cruz, MD, Hector Montoya-Fuentes, PhD, Victor Borja-Aburto, PhD, Cuitlahuac Ruiz-Matus, MD, Jesus Felipe Gonzalez-Roldan, MD, Pablo Kuri-Morales, MD, Todd Davis, PhD, Julie Villanueva, PhD, Vic Veguilla, MPH, Marc-Alain Widdowson, DVM, Joseph Bresee, MD, Eduardo Azziz-Baumgartner, MD, Jerome Tokars, MD, Timothy Uyeki, MD, Alexander Klimov, PhD, Stephen Lindstrom, PhD, Bo Shu, MD, Nancy Cox, PhD, Alberto Díaz-Quiñonez. Highly pathogenic avian influenza A (H7N3) virus infection in two poultry workers – Jalisco, Mexico, July 2012. MMWR 61(36):726-727, 2012.

10. De la Rosa-Zamboni D*, Vázquez-Pérez JA*, Avila-Ríos S*, Carranco-Arenas AP, Ormsby CE, Cummings CA,

Soto-Nava M, Hernández-Hernández V, Orozco-Sánchez CO, Alvarado-de la Barrera C, Pérez-Padilla R, Reyes-Terán G. Molecular Characterization of the Predominant Influenza A(H1N1)pdm09 Virus in Mexico, December 2011-February 2012. PLoS One 7(11):e50116, 2012. (*Igual contribución al trabajo). PMID: 23209653

11. Hernandez-Leal P, Rios-Flores A, Avila-Rios S, Reyes-Terán G, Gonzalez JA, Fiedler-Cameras L, Orihuela-Espina

F, Morales EF, Sucar LE. Discovering human immunodeficiency virus mutational pathways using temporal Bayesian networks. Artif Intell Med. 2013 Mar;57(3):185-95. doi: 10.1016/j.artmed.2013.01.005. Epub 2013 Apr 3. PMID: 23561488

12. Lopez-Martinez I, Balish A, Barrera-Badillo G, Jones J, Nuñez-García TE, Jang Y, Aparicio-Antonio R, Azziz-

Baumgartner E, Belser JA, Ramirez-Gonzalez JE, Pedersen JC, Ortiz-Alcantara J, Gonzalez-Duran E, Shu B, Emery SL, Poh MK, Reyes-Teran G, Vazquez-Perez JA, Avila-Rios S, Uyeki T, Lindstrom S, Villanueva J, Tokars J, Ruiz-Matus C, Gonzalez-Roldan JF, Schmitt B, Klimov A, Cox N, Kuri-Morales P, Davis CT, Diaz-Quiñonez JA. Highly pathogenic avian influenza A(H7N3) virus in poultry workers, Mexico, 2012. Emerg Infect Dis. 2013;19(9):1531-4. PMID: 23965808

13. Tu E, Swenson LC, Land S, Pett S, Emery S, Marks K, Kelleher AD, Kaye S, Kaiser R, Schuelter E, Harrigan R;

MARCH Laboratory Group and the MARCH Study Group. Results of external quality assessment for proviral DNA testing of HIV tropism in the Maraviroc Switch collaborative study. J Clin Microbiol. 2013 Jul;51(7):2063-71. doi: 10.1128/JCM.00510-13. Epub 2013 Apr 17. PMID: 23596247

14. Leticia Kuri-Cervantes, Gonzalo Salgado-Montes de Oca, Santiago Ávila-Ríos, Ramón Hernández-Juan, and

Gustavo Reyes-Terán. Activation of NK cells is associated with HIV-1 disease progresión. JLB 2014;95. doi:10.1189/jlb.0913514. Epub 2014 Jan 7. PMID: 24399837

15. Yaxelis Mendoza, Gonzalo Bello, Juan Castillo Mewa, Alexander A. Martínez, Claudia González1, Claudia García-

Morales, Santiago Avila-Ríos, Gustavo Reyes-Terán, Juan M. Pascale. Molecular Epidemiology of HIV-1 in Panama: Origin of Non-B Subtypes in Samples Collected from 2007 to 2013. PLoS One 2014;9(1). e85153. PMID: 24454808

16. Mendoza Y, Martínez AA, Castillo Mewa J, González C, García-Morales C, Avila-Ríos S, Reyes-Terán G, Armién

B, Pascale JM, Bello G. Human Immunodeficiency Virus Type 1 (HIV-1) Subtype B Epidemic in Panama Is Mainly Driven by Dissemination of Country-Specific Clades. PLoS One 2014;9(4). e95360. PMID: 24748274

17. Juarez-Molina CI, Payne R, Soto-Nava M, Avila-Rios S, Valenzuela-Ponce H, Adland E, Leitman E, Brener J,

Muenchhoff M, Branch S, Landis C, Reyes-Teran G, Goulder P. Impact of HLA-selection pressure on HIV fitness at a population level in Mexico and Barbados. J Virol. 2014 Sep;88(18):10392-8. doi: 10.1128/JVI.01162-14. Epub 2014 Jul 9. PMID: 25008926

5

18. Juarez-Molina CI, Valenzuela-Ponce H, Avila-Rios S, Garrido-Rodriguez D, Garcia-Tellez T, Soto-Nava M, Garcia-Morales C, Goulder P, Reyes-Teran G. Impact of HLA-B*35 subtype differences on HIV disease outcome in Mexico. AIDS. 2014 Jul 17;28(11):1687-90. doi: 10.1097/QAD.0000000000000322. PMID: 24853499

19. Quiñones-Mateu ME, Avila S, Reyes-Teran G, Martinez MA. Deep sequencing: Becoming a critical tool in clinical

virology. J Clin Virol. 2014 Sep;61(1):9-19. doi: 10.1016/j.jcv.2014.06.013. Epub 2014 Jun 24. Review. PMID: 24998424

20. Avila-Ríos S, García-Morales C, Garrido-Rodríguez D, Tapia-Trejo D, Girón-Callejas AC, Mendizábal-Burastero R,

Escobar-Urias IY, García-González BL, Navas-Castillo S, Pinzón-Meza R, Mejía-Villatoro CR, Reyes-Terán G. HIV-1 Drug Resistance Surveillance in Antiretroviral Treatment-Naive Individuals from a Reference Hospital in Guatemala, 2010-2013. AIDS Res Hum Retroviruses. 2015; 31(4): 401-411. PMID: 25347163

21. Rhee SY, Blanco JL, Jordan MR, Taylor J, Lemey P, Varghese V, Hamers RL, Bertagnolio S, de Wit TF, Aghokeng

AF, Albert J, Avi R, Avila-Rios S, Bessong PO, Brooks JI, Boucher CA, Brumme ZL, Busch MP, Bussmann H, Chaix ML, Chin BS, D'Aquin TT, De Gascun CF, Derache A, Descamps D, Deshpande AK, Djoko CF, Eshleman SH, Fleury H, Frange P, Fujisaki S, Harrigan PR, Hattori J, Holguin A, Hunt GM, Ichimura H, Kaleebu P, Katzenstein D, Kiertiburanakul S, Kim JH, Kim SS, Li Y, Lutsar I, Morris L, Ndembi N, Ng KP, Paranjape RS, Peeters M, Poljak M, Price MA, Ragonnet-Cronin ML, Reyes-Terán G, Rolland M, Sirivichayakul S, Smith DM, Soares MA, Soriano VV, Ssemwanga D, Stanojevic M, Stefani MA, Sugiura W, Sungkanuparph S, Tanuri A, Tee KK, Truong HH, van de Vijver DA, Vidal N, Yang C, Yang R, Yebra G, Ioannidis JP, Vandamme AM, Shafer RW. Geographic and Temporal Trends in the Molecular Epidemiology and Genetic Mechanisms of Transmitted HIV-1 Drug Resistance: An Individual-Patient- and Sequence-Level Meta-Analysis. PLoS Med. 2015 Apr 7;12(6):e1001810. PMID: 25849352

22. Avila-Ríos S, Reyes-Terán G. HIV Phylogeographic Analyses and Their Application in Prevention and Early

Detection Programmes: The Case of the Tijuana-San Diego Border Region. EBioMedicine. 2015 Sep 1;2(10):1296-7. doi: 10.1016/j.ebiom.2015.08.039. eCollection 2015 Oct. PMID: 26629516

23. Avila-Ríos S, García-Morales C, Tapia-Trejo D, Meza RI, Nuñez SM, Parham L, Flores NA, Valladares D, Pineda

LM, Flores D, Motiño R, Umanzor V, Carbajal C, Murillo W, Lorenzana I, Palou EY, Reyes-Terán G. HIV Drug Resistance Surveillance in Honduras after a Decade of Widespread Antiretroviral Therapy. PLoS One. 2015 Nov 11;10(11):e0142604. doi: 10.1371/journal.pone.0142604. eCollection 2015. PMID: 26558396

24. Blanco-Heredia J, Lecanda A, Valenzuela-Ponce H, Brander C, Ávila-Ríos S, Reyes-Terán G. Identification of

Immunogenic Cytotoxic T Lymphocyte Epitopes Containing Drug Resistance Mutations in Antiretroviral Treatment-Naïve HIV-Infected Individuals. PLoS One. 2016 Jan 25;11(1):e0147571. doi: 10.1371/journal.pone.0147571. eCollection 2016. PMID: 26808823

25. TenoRes Study Group. Global epidemiology of drug resistance after failure of WHO recommended first-line

regimens for adult HIV-1 infection: a multicentre retrospective cohort study. Lancet Infect Dis. 2016 May;16(5):565-75. doi: 10.1016/S1473-3099(15)00536-8.

26. Mendoza Y, Castillo Mewa J, Martínez AA, Zaldívar Y, Sosa N, Arteaga G, Armién B, Bautista CT, García-Morales

C, Tapia-Trejo D, Ávila-Ríos S, Reyes-Terán G, Bello G, Pascale JM. HIV-1 Antiretroviral Drug Resistance Mutations in Treatment Naïve and Experienced Panamanian Subjects: Impact on National Use of EFV-Based Schemes. PLoS One. 2016 Apr 27;11(4):e0154317. doi: 10.1371/journal.pone.0154317. eCollection 2016. PMID: 27119150

27. Garrido-Rodríguez D, Ávila-Ríos S, García-Morales C, Valenzuela-Ponce H, Ormsby C, Reyes-Gopar H,

Fernandez-Lopez JC, Reyes-Terán G. Killer cell immunoglobulin-like receptor and human leukocyte antigen gene profiles in a cohort of HIV-infected Mexican Mestizos. Immunogenetics. 2016 Oct;68(9):703-17. doi: 10.1007/s00251-016-0920-3. PMID: 27240860

28. Avila-Rios S, Sued O, Rhee SY, Shafer RW, Reyes-Teran G, Ravasi G. Surveillance of HIV Transmitted Drug

Resistance in Latin America and the Caribbean: A Systematic Review and Meta-Analysis. PLoS One. 2016 Jun 29;11(6):e0158560. doi: 10.1371/journal.pone.0158560. eCollection 2016. PMID: 27355626 Free Article

29. Ormsby CE, Ávila-Ríos S, Reyes-Terán G. Mexico struggles to keep foreign grants. Science. 2016 Jul

8;353(6295):131-2. doi: 10.1126/science.aag1021. No abstract available. PMID: 27387942

30. Ávila-Ríos S, García-Morales C, Matías-Florentino M, Romero-Mora KA, Tapia-Trejo D, Quiroz-Morales VS, Reyes-Gopar H, Ji H, Sandstrom P, Casillas-Rodríguez J, Sierra-Madero J, León-Juárez EA, Valenzuela-Lara M, Magis-Rodríguez C, Uribe-Zuñiga P, Reyes-Terán G; HIVDR MexNet Group. Pretreatment HIV-drug resistance in Mexico and its impact on the effectiveness of first-line antiretroviral therapy: a nationally representative 2015 WHO

6

survey. Lancet HIV. 2016 Sep 14. pii: S2352-3018(16)30119-9. doi: 10.1016/S2352-3018(16)30119-9. [Epub ahead of print] PMID: 27658867

31. Avila-Ríos S, García-Morales C, Matías-Florentino M, Tapia-Trejo D, Hernández-Álvarez BF, Moreira-López SE,

Quant-Durán CJ, Porras-Cortés G, Reyes-Terán G. HIV Drug Resistance in Antiretroviral Treatment-Naïve Individuals in the Largest Public Hospital in Nicaragua, 2011-2015. PLoS One. 2016 Oct 13;11(10):e0164156. doi: 10.1371/journal.pone.0164156. PMID: 27736898

32. Pett SL, Amin J, Horban A, Andrade-Villanueva J, Losso M, Porteiro N, Sierra Madero J, Belloso W, Tu E, Silk D,

Kelleher A, Harrigan R, Clark A, Sugiura W, Wolff M, Gill J, Gatell J, Fisher M, Clarke A, Ruxrungtham K, Prazuck T, Kaiser R, Woolley I, Arnaiz JA, Cooper D, Rockstroh JK, Mallon P, Emery S; Maraviroc Switch (MARCH) Study Group. Maraviroc, as a Switch Option, in HIV-1-infected Individuals With Stable, Well-controlled HIVReplication and R5-tropic Virus on Their First Nucleoside/Nucleotide Reverse Transcriptase Inhibitor Plus Ritonavir-boosted Protease Inhibitor Regimen: Week 48 Results of the Randomized, Multicenter MARCH Study. Clin Infect Dis. 2016 Jul 1;63(1):122-32. doi: 10.1093/cid/ciw207. Epub 2016 Apr 5. PMID: 27048747

33. Rahimi A, Anmole G, Soto-Nava M, Escamilla-Gomez T, Markle T, Jin SW, Lee GQ, Harrigan PR, Bangsberg DR,

Martin J, Avila-Rios S, Reyes-Teran G, Brockman MA, Brumme ZL. In vitro functional assessment of natural HIV-1 group M Vpu sequences using a universal priming approach. J Virol Methods. 2017 Feb;240:32-41. doi: 10.1016/j.jviromet.2016.11.004.

34. Ruiz-Cruz M, Ávila-Rios S, Ormsby CE, Ablanedo-Terrazas Y, Alvarado-de la Barrera C, Kuri-Cervantes L, Reyes-

Terán G. Cytokine Profiles in Aqueous Humor and Plasma of HIV-infected Individuals with Ocular Syphilis or Cytomegalovirus Retinitis. Ocul Immunol Inflamm. 2018;26(1):74-81. doi: 10.1080/09273948.2016.1268170. PMID: 28081374

35. Robbiani DF, Bozzacco L, Keeffe JR, Khouri R, Olsen PC, Gazumyan A, Schaefer-Babajew D, Avila-Rios S,

Nogueira L, Patel R, Azzopardi SA, Uhl LFK, Saeed M, Sevilla-Reyes EE, Agudelo M, Yao KH, Golijanin J, Gristick HB, Lee YE, Hurley A, Caskey M, Pai J, Oliveira T, Wunder EA Jr, Sacramento G, Nery N Jr, Orge C, Costa F, Reis MG, Thomas NM, Eisenreich T, Weinberger DM, de Almeida ARP, West AP Jr, Rice CM, Bjorkman PJ, Reyes-Teran G, Ko AI, MacDonald MR, Nussenzweig MC. Recurrent Potent Human Neutralizing Antibodies to Zika Virus in Brazil and Mexico. Cell. 2017 May 4;169(4):597-609.e11. doi: 10.1016/j.cell.2017.04.024. PMID: 28475892

36. Chaillon A, Avila-Ríos S, Wertheim JO, Dennis A, García-Morales C, Tapia-Trejo D, Mejía-Villatoro C, Pascale JM,

Porras-Cortés G, Quant-Durán CJ, Lorenzana I, Meza RI, Palou EY, Manzanero M, Cedillos RA, Reyes-Terán G, Mehta SR; Mesoamerican Project Group. Identification of major routes of HIV transmission throughout Mesoamerica. Infect Genet Evol. 2017 Oct;54:98-107. doi: 10.1016/j.meegid.2017.06.021. Epub 2017 Jun 20. PMID: 28645708

37. Gatanaga H, Brumme ZL, Adland E, Reyes-Terán G, Avila-Rios S, Mejía-Villatoro CR, Hayashida T, Chikata T, Van

Tran G, Van Nguyen K, Meza RI, Palou EY, Valenzuela-Ponce H, Pascale JM, Porras-Cortés G, Manzanero M, Lee GQ, Martin JN, Carrington MN, John M, Mallal S, Poon AFY, Goulder P, Takiguchi M, Oka S; International HIV Adaptation Collaborative. Potential for immune-driven viral polymorphisms to compromise antiretroviral-based pre-exposure prophylaxis for prevention of HIV-1 infection. AIDS. 2017 Sep 10;31(14):1935-1943. doi: 10.1097/QAD.0000000000001575. PMID: 28650381

38. García-Morales C, Tapia-Trejo D, Quiroz-Morales VS, Navarro-Álvarez S, Barrera-Arellano CA, Casillas-Rodríguez

J, Romero-Mora KA, Gómez-Palacio-Schjetnan M, Murakami-Ogasawara A, Ávila-Ríos S, Reyes-Terán G; HIVDR MexNet Group. HIV pretreatment drug resistance trends in three geographic areas of Mexico. J Antimicrob Chemother. 2017 Nov 1;72(11):3149-3158. doi: 10.1093/jac/dkx281. PMID:28961972

39. Horemheb-Rubio G, Ramos-Cervantes P, Arroyo-Figueroa H, Ávila-Ríos S, García-Morales C, Reyes-Terán G,

Escobedo G, Estrada G, García-Iglesias T, Muñoz-Saucedo N, Kershenobich D, Ostrosky-Wegman P, Ruiz-Palacios GM. High HPgV replication is associated with improved surrogate markers of HIV progression. PLoS One. 2017 Sep 14;12(9):e0184494. doi: 10.1371/journal.pone.0184494. eCollection 2017. PMID: 28910347

40. Gupta RK, Gregson J, Parkin N, Haile-Selassie H, Tanuri A, Andrade Forero L, Kaleebu P, Watera C, Aghokeng A,

Mutenda N, Dzangare J, Hone S, Hang ZZ, Garcia J, Garcia Z, Marchorro P, Beteta E, Giron A, Hamers R, Inzaule S, Frenkel LM, Chung MH, de Oliveira T, Pillay D, Naidoo K, Kharsany A, Kugathasan R, Cutino T, Hunt G, Avila Rios S, Doherty M, Jordan MR, Bertagnolio S. HIV-1 drug resistance before initiation or re-initiation of first-line antiretroviral therapy in low-income and middle-income countries: a systematic review and meta-regression analysis. Lancet Infect Dis. 2018 Mar;18(3):346-355. doi: 10.1016/S1473-3099(17)30702-8. Epub 2017 Dec 5. Erratum in: Lancet Infect Dis. 2017 Dec 15. PMID:29198909

7

41. Soto-Nava M, Avila-Ríos S, Valenzuela-Ponce H, García-Morales C, Carlson JM, Tapia-Trejo D, Garrido-Rodriguez D, Alva-Hernández SN, García-Tellez TA, Murakami-Ogasawara A; International HIV Adaptation Collaborative, Mallal SA, John M, Brockman MA, Brumme CJ, Brumme ZL, Reyes-Teran G; HIV MexNet Group. Weaker HLA footprints on HIV in the unique and highly genetically admixed host population of Mexico. J Virol. 2018 Jan 2;92(2). pii: e01128-17. doi: 10.1128/JVI.01128-17. Print 2018 Jan 15. PMID: 29093100

42. Adland E, Hill M, Lavandier N, Csala A, Edwards A, Chen F, Radkowski M, Kowalska JD, Paraskevis D, Hatzakis A,

Valenzuela-Ponce H, Pfafferott K, Williams I, Pellegrino P, Borrow P, Mori M, Rockstroh J, Prado JG, Mothe B, Dalmau J, Martinez-Picado J, Tudor-Williams G, Frater J, Stryhn A, Buus S, Reyes Teran G, Mallal S, John M, Buchbinder S, Kirk G, Martin J, Michael N, Fellay J, Deeks S, Walker B, Avila-Rios S, Cole D, Brander C, Carrington M, Goulder P. DIFFERENTIAL IMMUNODOMINANCE HIERARCHY OF CD8+ T CELL RESPONSES IN HLA-B*27:05 AND B*27:02-MEDIATED CONTROL OF HIV-1 INFECTION. J Virol. 2018 Jan 30;92(4). pii: e01685-17. doi: 10.1128/JVI.01685-17. Print 2018 Feb 15. PMID: 29167337

43. Valenzuela-Ponce H, Alva-Hernández S, Garrido-Rodríguez D, Soto-Nava M, García-Téllez T, Escamilla-Gómez T,

García-Morales C, Quiroz-Morales VS, Tapia-Trejo D, Del Arenal-Sánchez S, Prado-Galbarro FJ, Hernández-Juan R, Rodríguez-Aguirre E, Murakami-Ogasawara A, Mejía-Villatoro C, Escobar-Urias IY, Pinzón-Meza R, Pascale JM, Zaldivar Y, Porras-Cortés G, Quant-Durán C, Lorenzana I, Meza RI, Palou EY, Manzanero M, Cedillos RA, Aláez C, Brockman MA, Harrigan PR, Brumme CJ, Brumme ZL, Ávila-Ríos S, Reyes-Terán G; Mesoamerican HIV Project Group. Novel HLA class I associations with HIV-1 control in a unique genetically admixed population. Sci Rep. 2018 Apr 17;8(1):6111. doi: 10.1038/s41598-018-23849-7. PMID: 29666450

44. Mendoza Y, García-Morales C, Bello G, Garrido-Rodríguez D, Tapia-Trejo D, Pascale JM, Girón-Callejas AC,

Mendizábal-Burastero R, Escobar-Urias IY, García-González BL, Navas-Castillo JS, Quintana-Galindo MC, Pinzón-Meza R, Mejía-Villatoro CR, Avila-Ríos S, Reyes-Terán G. Evolutionary history and spatiotemporal dynamics of the HIV-1 subtype B epidemic in Guatemala. PLoS One. 2018 Sep 13;13(9):e0203916. doi: 10.1371/journal.pone.0203916. eCollection 2018. PMID: 30212548

5. DIFUSIÓN Capítulos de libro publicados Avila-Ríos S, Reyes-Terán G. Virología del VIH: Buscando nuevas estrategias antirretrovirales. En: Córdoba-Villalobos JA, Ponce de León-Rosales S, Valdespino JL, eds. 25 Años de SIDA en México. Logros, desaciertos y retos. México: Instituto Nacional de Salud Pública. 2008:135-160. Avila-Ríos S. Farmacorresistencia: la importancia del monitoreo. Estudios de genética poblacional y VIH. Biología Molecular: su importancia clínica y en investigación básica. En: Iglesias-Chiesa MC, Moheno R, eds. 30 Años del VIH-SIDA, Perspectivas desde México. México: CIENI / Fundación México Vivo, 2011:123-140. Trabajos presentados en congresos nacionales Poster: “Purificación y caracterización de las triosafosfato isomerasas mutantes de humano y levadura con una cisteína en la posición 14”. Avila-Ríos S, Cabrera N, Pérez-Montfort R XXIII Congreso Nacional de Bioquímica. Acapulco, Guerrero, México. 2000 Presentación oral: “Evolución del virus de la inmunodeficiencia humana (VIH) en México: Impacto del antígeno leucocitario humano (HLA) de clase I como presión selectiva a nivel poblacional. Avila-Ríos S, Valenzuela-Ponce H, Blanco-Heredia J, Garrido-Rodríguez D, Ormsby CE., Reyes-Terán G, Espinosa E. V Congreso Nacional de Virología. Querétaro, México. Octubre 2007 Presentación oral: “Características únicas de la evolución del virus de inmunodeficiencia humana en una cohorte de pacientes mexicanos”. Avila-Ríos S, Valenzuela-Ponce H, Blanco-Heredia J, Garrido-Rodríguez D, Ormsby CE, Espinosa E, Reyes-Terán G. XXXVI Jornadas Médico Quirúrgicas del INER: Atención del Enfermo Respiratorio Crónico. México D. F., México. Septiembre 2008. Presentación oral: “Epidemiología molecular del VIH en México: características únicas de la epidemia en el país”.

8

Garrido-Rodríguez D, Avila-Ríos S, Vázquez-Pérez J, Andrade-Villanueva J, González-Hernández LA, Indiana-Torres I, Méndez-Cardós P, Armenta-Solis A, García-Morales C, Delgado-Lucero M, Wong S, Quiroz-Huerta G, Coronel G, Zimbrón A, Carrasco C, Navarro S, Hernández-Juan R, Quiroz V, Rodríguez E, Preciado M, Demeneghi C, Reyes-Terán G. XXXVI Jornadas Médico Quirúrgicas del INER: Atención del Enfermo Respiratorio Crónico. México D. F., México. Septiembre 2008. Conferencia Megistral: “Epidemiología Molecular y Evolución del VIH en México”. Avila-Ríos S XV Foro Norte de Investigación en Salud Instituto Mexicano del Seguro Social Zacatecas, Zacatecas, México. Julio 2009. Conferencia Magistral: “Epidemiología Molecular y Vigilancia de Farmacorresistencia en VIH en Mexicanos”. Avila-Ríos S. III Foro Intrauniversitario de Investigación en Salud / 6º Foro Interinstitucional de Investigación en Salud 2009 Universidad Veracruzana/Servicios de Salud de Veracruz. Coatzacoalcos, Veracruz, México. Octubre 2009. Póster: “Frecuencias alélicas y haplotípicas de los genes HLA de clase I en pacientes VIH positivos del Centro de México”. Valenzuela-Ponce H, Avila-Ríos S, Ormsby CE, Reyes-Terán G. VI Congreso Nacional de Virología. Mérida, Yucatán, México. Noviembre 2009 Póster: “Análisis de Resistencia transmitida en VIH circulante en México”. García-Morales C, Avila-Ríos S, Garrido-Rodríguez D, Ormsby CE, Reyes-Terán G. VI Congreso Nacional de Virología. Mérida, Yucatán, México. Noviembre 2009 Conferencia Magistral: “Característiicas únicas de la evolución mediada por HLA en el VIH circulante en poblaciones inmunogenéticamente distintas”. Avila-Ríos S. XIX Congreso Nacional de Inmunología Cancún, México. Marzo 2010 Trabajos presentados en congresos internacionales Poster: “Antibody prevalence to poliovirus type 1 in Mexican children: a history of success in the fight against poliomyelitis”. Ruiz-Gómez J, Valdespino-Gómez JL, Olaiz-Fernández GA, Díaz-Ortega JL, Avila-Ríos S, Sepúlveda-Amor J. XI International Congress of Infectious Diseases. Cancún, Quintana Roo, México 2004 Poster: “Antibody prevalence to the measles virus in Mexican children: towards measles eradication in the Americas”. Ruiz-Gómez J, Valdespino-Gómez JL, Olaiz-Fernández GA, Díaz-Ortega JL, Arias-Toledo E, Avila-Ríos S, Sepúlveda-Amor J. XI International Congress of Infectious Diseases. Cancún, Quintana Roo, México 2004 Poster: “Characteristic features of HIV molecular epidemiology in central Mexico”. Garrido D, Vázquez-Pérez J, Avila-Ríos S, Ormsby C, Espinosa E, Torres I, Méndez P, Reyes-Terán G. Keystone Symposia, HIV Pathogenesis. Whistler, Canada. Marzo 2007 Poster: “Unique features of HIV evolution in a Mexican cohort”. Santiago Avila-Rios1, Humberto Valenzuela-Ponce1, Daniela Garrido-Rodriguez1, Juan Blanco-Heredia1, Christopher E. Ormsby1, Enrique Espinosa1, Gustavo Reyes-Teran1. Keystone Symposia, HIV Pathogenesis. Banf, Canada. Marzo 2008. Poster: “Differences in evolution of proviral and plasma HIV sequences in treatment-naïve patients: Impact of HLA class I genes”. Juan Blanco-Heredia1, Santiago Avila-Rios1, Humberto Valenzuela-Ponce1, Daniela Garrido-Rodriguez1, Christopher E. Ormsby1, Enrique Espinosa1, Gustavo Reyes-Teran1. Keystone Symposia, HIV Pathogenesis. Banf, Canada. Marzo 2008 Poster: “Molecular epidemiology of HIV in Mexico”. D. Garrido-Rodríguez, S. Avila-Ríos, J. Vázquez-Pérez, C. E. Ormsby, E. Espinosa, J. Andrade-Villanueva, I. Torres-Escobar, P. Méndez-Cardós, A. Armenta-Solís, G. Reyes-Terán. XVII International AIDS Conference. México D. F., México. Agosto 2008

9

Poster: “HIV evolution in a Mexican cohort: Impact of class I HLA genes”. Santiago Avila-Ríos, Humberto Valenzuela-Ponce, Daniela Garrido-Rodríguez, Juan Blanco-Heredia, Christopher E. Ormsby, Enrique Espinosa, Gustavo Reyes-Terán. XVII International AIDS Conference. Mexico D. F., México. Agosto 2008 Póster: “Clinical features of subjects infected with HIV and H1N1 influenza virus”. Reyes-Terán G, de la Rosa-Zamboni D, Ormsby CE, Vázquez-Pérez J, Ablanedo-Terrazas Y, Vega-Barrientos R, Gómez Palacio M, Murakami-Ogasawara A, Romero-Rodríguez D, Avila-Ríos S. 17th Conference on Retroviruses and Opportunistic Infections 2010. San Francisco, CA, USA. Febrero 2010. Presentación oral y Póster: “National prevalence and trends of HIV transmitted drug resistance in Mexico”. Santiago AVILA-RIOS, Claudia GARCIA-MORALES, Daniela GARRIDO-RODRIGUEZ, Christopher E. ORMSBY, Jaime ANDRADE-VILLANUEVA, Luz GONZALEZ-HERNANDEZ, Indiana TORRES-ESCOBAR, Samuel NAVARRO-ALVAREZ, Lucrecia CEJA-BARRERA, Gustavo REYES-TERAN. 18th Conference on Retroviruses and Opportunistic Infections. Boston, MA, USA. Marzo 2011. Póster: “Impact of HLA-B*35 Subtype Differences on HIV outcome in Mexico”. Juárez-Molina C, Avila-Ríos S, Valenzuela-Ponce H, Soto-Nava M, García-Morales C, Garrido-Rodríguez D, Goulder P, Reyes-Terán G. AIDS Vaccine 2011, Bangkok, Tailandia. Septiembre 2011. Póster: “HIV cornering: Using conflicting selective pressures to limit HIV variation”. Blanco-Heredia J, Avila-Ríos S, Brander C, Reyes-Terán G. Frontiers in HIV Pathogenesis, Therapy and Eradication, Keystone Symposia. Whistler, BC, Canadá. Marzo 2012. Póster: “Impact of HLA class I on HIV disease progression in the immunogenetic context of the Mexican mestizo population”. Valenzuela-Ponce H, Avila-Ríos S, Soto-Nava M, Juárez-Molina C, García-Morales C, Andrade-Villanueva J, Torres-Escobar I, Ormsby C, Murakami-Ogasawara A, Reyes-Terán G. Frontiers in HIV Pathogenesis, Therapy and Eradication, Keystone Symposia. Whistler, BC, Canadá. Marzo 2012. Póster: “Differential expression of Toll-like receptors in HIV infection is associated with disease progression and markers of immune activation”. Kuri-Cervantes L, Salgado-Montes de Oca G, Avila-Ríos S, Murakami-Ogasawara A, Romero-Mora K, Andrade-Villanueva J, González-Hernández LA, Rivera-Martínez NE, Reyes-Terán G. Frontiers in HIV Pathogenesis, Therapy and Eradication, Keystone Symposia. Whistler, BC, Canadá. Marzo 2012. Póster: “Impact of KIR-HLA interactions in HIV control in the immunogenetic context of a Mexican cohort” Garrido-Rodríguez D, Avila-Ríos S, Soto-Nava M, García-Morales C, Valenzuela-Ponce H, Andrade-Villanueva J, González-Hernández LA, Torres-Escobar I, Murakami-Ogasawara A, Reyes-Terán G. HIV Vaccines, Keystone Symposia. Keystone, CO, Estados Unidos. Marzo 2012. Póster: “Novel HLA Associations with HIV Control in a Previously Uncharacterized Immunogenetic Context”. Valenzuela-Ponce H, Avila-Rios S, Soto-Nava M, Garrido-Rodríguez D, García-Tellez T, Quiroz-Morales V, García-Morales C, Hernández-Juan R, Murakami-Ogasawara A, Reyes-Terán G, and the Mexican HIV Molecular Epidemiology Project Group. 20th Conference on Retroviruses and Opportunistic Infections. Atlanta, GA, USA. Marzo 2013. Póster: “The Additive Effect of Specific Activating KIR Interactions with Putative HLA Ligands Protects from HIV Infection and Disease Progression”. Garrido-Rodríguez D, Avila-Rios S, Valenzuela-Ponce H, Garcia-Tellez T, Quiroz-Morales V, Garcia-Morales C, Soto-Nava M, Vázquez-Pérez J, Hernández-Juan R, Reyes-Terán G. 20th Conference on Retroviruses and Opportunistic Infections. Atlanta, GA, USA. Marzo 2013. Póster: “HIV Molecular Epidemiology and Transmitted Drug Resistance Surveillance: Mesoamerican Region”. García-Morales C, Avila-Ríos S, Tapia-Trejo D, Mejía-Villatoro C, Pascale J, Porras-Cortés G, Mendizábal R, Zaldivar Y, Hernández B, Teyes-Terán G, and the HIV Molecular Epidemiology and TDR Surveillance in the Mesoamerican Region Study Group. 20th Conference on Retroviruses and Opportunistic Infections. Atlanta, GA, USA. Marzo 2013. Presentación Oral: “Novel HLA Associations with HIV Control in Two Different Immunogenetic Contexts”. Valenzuela-Ponce H, Brumme CJ, Ávila-Ríos S, Brumme ZI, Garrido-Rodríguez D, García-Téllez T, García-Morales C, Hernández-Juan R, Carlson JM, Brockman M, Shahid A, Reyes-Terán G 22nd Annual Canadian Conference on HIV / AIDS Research. Vancouver, Canadá. Abril 2013. Póster: “Novel HLA Associations with HIV Control in a Previously Uncharacterized Immunogenetic Context”.

10

Valenzuela-Ponce H, Avila-Ríos S, Soto-Nava M, Garrido-Rodríquez D, García-Téllez T, Quiroz-Morales V, García-Morales C, Hernández-Juan R, Murakami-Ogasawara A, Reyes-Terán G. Keystone Symposia, HIV Vaccines, Keystone, CO, USA. Febrero 2013. Presentación Oral: "Haemopoietic stem-cell transplantation and long-term immune suppression in a patient with HIV infection receiving intensified early antiretroviral treatment" Gonzalo Salgado-Montes de Oca, Akio Murakami-Ogasawara, Perla del Río-Estrada, Santiago Ávila-Ríos, Ramón Hernández-Juan, Thalía García-Téllez, Amarante Rivero-Arrieta, Yuria Ablanedo, Claudia Alvarado-de la Barrera, Gustavo Reyes-Terán. What will it take to achieve an AIDS-free world? A translational medicine conference on HIV research San Francisco, CA, USA. Noviembre 2013 The Lancet, Volume 382, Special Issue, S22, 3 November 2013. Póster: “CD38 Expression on HK Cells Predicts HIV Disease Progression”. Kuri-Cervantes L, Salgado-Montes de Oca G, Avila-Ríos S, Reyes-Terán G. Keystone Symposia, Immune Activation in HIV Infection: Basic Mechanisms and Clinical Implications, Breckenridge, CO, USA. Abril 2013 Póster: Peptides including drug resistance mutations could be considered as immunogens in a putative therapeutic HIV vaccine, aiming to immunological-pharmacological control of viral replication. Blanco-Heredia J, Ávila-Ríos S, Brander C, Reyes-Terán G. 20th International AIDS Conference Melbourne, Australia, 2014 Póster: HIV Transmission Networks Among the USA, Mexico, and Central America Santiago Avila-Rios; Joel O. Wertheim; Ann M. Dennis; Gustavo Reyes-Terán; Carlos Mejía-Villatoro; Elsa Y. Palou; Guillermo Porras-Cortes; Juan M Pascale; Marvin Manzanero; Sanjay Mehta Conference on Retroviruses and Opportunistic Infections 2015 Seattle, WA, USA. 2015 Póster: HIV Molecular Epidemiology and Transmitted Drug Resistance in the Mesoamerican Region Claudia Garcia-Morales; Santiago Avila-Rios; Daniela Tapia-Trejo; Carlos Mejía-Villatoro; Juan M Pascale; Guillermo Porras-Cortes; Ivette Lorenzana; Elsa Palou; Marvin Manzanero; Gustavo Reyes- Terán Conference on Retroviruses and Opportunistic Infections 2015 Seattle, WA, USA. 2015 Póster: HIV Drug Resistance Surveillance in Honduras After 10 Years of Widespread ART Claudia Garcia-Morales; Santiago Avila-Rios; Daniela Tapia-Trejo; Rita Meza; Sandra Nuñez-Rubio; Norma Flores; Wendy Murillo; Ivette Lorenzana; Elsa Palou; Gustavo Reyes-Terán Conference on Retroviruses and Opportunistic Infections 2015 Seattle, WA, USA. 2015 Póster: Cytokine Profile in Aqueous Humor of HIV Patients With Ocular Opportunistic Infections Matilde Ruiz-Cruz; Santiago Avila-Rios; Christopher Ormsby; Claudia Alvarado-de la Barrera; Yuria Ablanedo-Terrazas; Gustavo Reyes-Terán Conference on Retroviruses and Opportunistic Infections 2015 Seattle, WA, USA. 2015 Póster: HIV Drug Resistance in Antiretroviral Treatment-Naïve Individuals in the Mesoamerican Region, 2010-2014 S Avila-Ríos, C García-Morales, D Tapia-Trejo, C Mejía-Villatoro, JM Pascale, G Porras-Cortes, I Lorenzana, EY Palou, M Manzanero, G Reyes-Terán XXIV International HIV Drug Resistance Workshop Seattle, WA, USA. 2015 Póster: HIV Drug Resistance Surveillance in Honduras after Ten Years of Widespread ART S Avila-Ríos, C García-Morales, D Tapia-Trejo, R Meza, S Nuñez, N Flores, W Murillo, I Lorenzana, EY Palou, G Reyes-Terán XXIV International HIV Drug Resistance Workshop Seattle, WA, USA. 2015 Presentación Oral: HIV Drug Resistance in Antiretroviral Treatment-Naïve Individuals in the Mesoamerican Region, 2010-2014 Santiago Avila-Ríos1, Claudia García-Morales1, Daniela Tapia-Trejo1, Carlos Mejía-Villatoro2, Juan M. Pascale3, Guillermo Porras-Cortés4, Carlos Quant4, Ivette Lorenzana5, Rita Meza6, Elsa Y. Palou7, Marvin Manzanero8, Gustavo Reyes-Terán1 , for the Mesoamerican Proyect Group Congreso de la Asociación Panamericana de Infectología

11

Quito, Ecuador, 2015 Presentación Oral: HIV Drug Resistance Surveillance in Honduras after Ten Years of Widespread ART Santiago Avila-Ríos1, Claudia García-Morales1, Daniela Tapia-Trejo1, Rita I. Meza2, Sandra Nuñez2, Norma Flores3, Diana Valladares4, Dixiana Flores5, Nadina Romero6, Wendy Murillo7, Ivette Lorenzana7, Elsa Y. Palou7, G Reyes-Terán1 for the Mesoamerican Project Group Congreso de la Asociación Panamericana de Infectología Quito, Ecuador, 2015 Presentación Oral: “Genetic ancestry component proportions are correlated with HIV disease progression”. D Garrido-Rodríguez, S Avila-Ríos, H Valenzuela-Ponce, T García-Tellez, V Quiroz-Morales, C García-Morales, M Soto-Nava, A Murakami-Ogasawara, JC Fernandez-Lopez, G Reyes Terán. 8th IAS Conference on HIV Pathogenesis, Treatment and Prevention Vancouver, BC, Canada. Julio 2015 Presentación Oral: “Impact of HLA-B*35 alleles on HIV disease outcome in Mexico and Central America”. H Valenzuela-Ponce, S Avila-Ríos, D Garrido-Rodríguez, T García-Téllez, M Soto-Nava, T Escamilla-Gómez, C García-Morales, J Cortés-Alvarez, R Hernández-Juan, A Murakami-Ogasawars, C Mejía-Villatoro, J Pascale, G Porras, C Quant, I Lorenzana, R Meza, E Palou, M Manzanero, G Reyes-Terán, Mesoamerican HIV Project Group. 8th IAS Conference on HIV Pathogenesis, Treatment and Prevention Vancouver, BC, Canada. Julio 2015 Póster: “Development of an in vitro assay to assess the function of naturally occurring HIV-1 Vpu sequences without codón optimization” M Soto-Nava, TJ Escamilla-Gómez, G Anmole, K Cobarrubias, R Singh, T Ndung’u, S Avila-Ríos, G Reyes-Terán, ZL Brumme, MA Brockman. 8th IAS Conference on HIV Pathogenesis, Treatment and Prevention Vancouver, BC, Canada. Julio 2015 Póster: “Decreased interferon signature in HIV-1 viremic controllers” J Blanco-Heredia, S Avila-Ríos, DF Nixon, G Reyes-Terán, RA Raposo. 8th IAS Conference on HIV Pathogenesis, Treatment and Prevention Vancouver, BC, Canada. Julio 2015 Póster: “Transmitted Drug Resistance and HIV Molecular Epidemiology in Nicaragua” G Porras-Cortés, S Avila-Ríos, C García-Morales, Daniela Tapia-Trejo, C Quant-Durán, S Moreira-López, B Hernández-Alvarez, G Reyes-Terán. ID Week 2015 San Diego, CA, USA. Octubre 2015 Presentación Oral: “HIV molecular epidemiology and HLA-associated evolution in the Meso-American region” 5th CIENI-INER, CAPASITS Oaxaca HIV Meeting / 10th CIENI-INER HIV Meeting Oaxaca, Mexico, Diciembre 2015 Póster: “HIV Pre-Treatment Drug Resistance in Mexico: a Nationally Representative WHO Survey”. Ávila-Ríos S1, García-Morales C1, Tapia-Trejo D1, Matías-Florentino M1, Quiroz-Morales V1, Casillas-Rodríguez J2, Sierra-Madero J3, León E4, Magis-Rodríguez C4, Reyes-Terán G1, for the HIVDR MexNet Group. Conference on Retroviruses and Opportunistic Infections 2016, Boston, MA, USA, Marzo 2016 Póster: “HIV Pre-Treatment Drug Resistance in Mexico: A Nationally Representative WHO Survey”. Ávila-Ríos S1,García-Morales C1, Tapia-Trejo D1, Matías-Florentino M1, Quiroz-Morales V1, Casillas-Rodríguez J2, Sierra-Madero J3, León E4, Magis-Rodríguez C4, Reyes-Terán G1, for the HIVDR MexNet Group. XXV International HIV Drug Resistance Workshop 2016, Boston, MA, USA, Marzo 2016 Poster: “Identification of major routes of HIV transmission throughout Mesoamerica”. Antoine Chaillon, Joel O. Wertheim, Santiago Avila-Ríos, Ann M. Dennis, Claudia García-Morales, Carlos Mejía-Villatoro, Elsa Y. Palou, Gustavo Reyes-Terán, Sanjay R. Mehta, for the Mesoamerican Proyect Group. Conference on Retroviruses and Opportunistic Infections 2017, Seattle, WA, USA, Febrero 2017 Poster: “Pretreatment drug resistance increase in 3 focal points of Mexico, 2012-2015”. Claudia García-Morales, Santiago Avila-Ríos, Daniela Tapia-Trejo, Verónica S. Quiroz-Morales, Samuel Navarro, Carlos A. Barrera-Arellano, Jesús Casillas-Rodríguez, Akio Murakami-Ogasawara, Gustavo Reyes-Terán, for the HIV MexNet Group Conference on Retroviruses and Opportunistic Infections 2017, Seattle, WA, USA, Febrero 2017

12

Presentación Oral: MOSY0702 – Results from the Mexico HIVDR survey leading to country and regional responses. Sesión: MOSY07 – HIV Drug Resistance and Antimicrobial Resistance: Science and Action. 9th IAS Conference on HIV Science (IAS 2017). París, Francia. 24-26 de julio de 2017. Póster: MOPEA0003 – Ávila-Ríos S, Carlson JM, Soto-Nava M, Valenzuela-Ponce H, García-Morales C, Mejía-Villatoro C, Pascale JM, Porras-Cortés G, Quant-Durán C, Lorenzana I, Palou EY, Manzanero M, Cedillos RA, Tapia-Trejo D, Sánchez-León AT, Zaldívar Y, Brockman MA, Brumme ZL, Reyest-Terán G, for the Mesoamerican HIV Project Group. Impact of HLA-associated HIV adaptation on disease progression in Mesoamerica. 9th IAS Conference on HIV Science (IAS 2017). París, Francia. 24-26 de julio de 2017. Póster: TUPEC0855 – Girón-Callejas A, Ávila-Ríos S, Mendizábal-Burastero R, García-Morales C, Northbrook S, Reyes-Terán G, for the Guatemalan HIVDR Group. HIV pretreatment and acquired drug resistance: results from the first nationally representative survey conducted in Guatemala, 2016. 9th IAS Conference on HIV Science (IAS 2017). París, Francia. 24-26 de julio de 2017. Póster: César N. Cortés-Rubio, Santiago Ávila-Ríos, Gonzalo Salgado-Montes de Oca, Margarita Matías-Florentino, Christopher E. Ormsby, Ana P. Carranco-Arenas, Gustavo Reyes-Terán. Role of LTR methylation in the establishment of residual viremia and proviral load in HIV-infected individuals on suppressive antiretroviral treatment. 7th CIENI/INER-CAPASITS Oaxaca Meeting. Oaxaca, México. 31 de octubre-3 de noviembre de 2017. Póster: Tapia-Trejo D, Ávila-Ríos S, García-Morales C, Mejía-Villatoro C, Pascale JM, Porras-Cortes G, Lorenzana I, Palou EY, Reyes-Terán G for the Mesoamerican Project Group. Transmitted drug resistance trends in individuals with recent infection in the Mesoamerican Region. 7th CIENI/INER-CAPASITS Oaxaca Meeting. Oaxaca, México. 31 de octubre-3 de noviembre de 2017. Póster: Margarita Matías-Florentino, Santiago Avila-Ríos, Gonzalo Salgado-Montes de Oca, Yuria Ablanedo-Terrazas, Perla M. del Río-Estrada, Gustavo Reyes-Terán. Standardizing a method for amplification and sequencing of viral and proviral bulk and clonal nearly full-length HIV genomes. 7th CIENI/INER-CAPASITS Oaxaca Meeting. Oaxaca, México. 31 de octubre-3 de noviembre de 2017. Presentación Oral: Avila-Ríos S. The Growing HIV Drug Resistance Threat: A Global and Local Perspective. Presentación Oral. 7th CIENI/INER-CAPASITS Oaxaca Meeting. Oaxaca, México. 31 de octubre-3 de noviembre de 2017. Presentación Oral: Avila-Ríos S. Weaker HLA footprints on HIV in the unique and highly genetically admixed host population of Mexico. BELIEVE Meeting Oaxaca. Oaxaca, México. 6 de noviembre de 2017. Presentación Oral: Santiago Ávila-Ríos. Next generation sequencing for HIV drug resistance testing: An end-user experience. Mini-symposium on Bioinformatics strategies for next generation sequencing-based HIV drug resistance testing. Winnipeg, Manitoba, Canadá, 21-22 de febrero de 2018. Póster: LTR METHYLATION AND RESIDUAL VIREMIA IN INDIVIDUALS ON SUPPRESSIVE ART. Póster 322. César N. Cortés-Rubio, Santiago Avila-Rios, Gonzalo Salgado-Montes de Oca, Margarita Matías-Florentino, Christopher E. Ormsby, Ana P. Carranco-Arenas, Gustavo Reyes-Terán. Conference on Retroviruses and Opportunistic Infections 2018, Boston, MA, 4-7 marzo de 2018. Póster: PRETREATMENT HIV DRUG RESISTANCE SPREAD WITHIN TRANSMISSION CLUSTERS IN MEXICO CITY. Póster 523. Margarita Matías-Florentino, Antoine Chaillon, Santiago Avila-Rios, Verónica Ruiz, Silvia del Arenal, Manuel A. Becerril-Rodríguez, Alicia Piñeirúa, Florentino Badial Hernandez, Andrea Gonzalez Rodriguez, Sanjay R. Mehta, Gustavo Reyes-Terán. Conference on Retroviruses and Opportunistic Infections 2018, Boston, MA, 4-7 marzo de 2018. Póster: PHYLOGEOGRAPHIC ANALYSIS SUGGESTS GRAVITY MODEL OF HIV TRANSMISSION IN MEXICO. Póster 954. Antoine Chaillon, Santiago Avila-Rios, Ann M. Dennis, Joel O. Wertheim, Claudia García-Morales, Daniela Tapia-Trejo, Sanjay R. Mehta, Gustavo Reyes-Terán. Conference on Retroviruses and Opportunistic Infections 2018, Boston, MA, 4-7 marzo de 2018. Presentación Oral: The public health response to rising pretreatment HIV drug resistance levels in Latin America: the case of Mexico. Santiago Ávila-Ríos. HIV & Hepatitis in the Americas 2018. Ciudad de México, 19-21 de abril de 2018. Póster: HIV pretreatment drug resistance surveillance in eight sub-regions of Mexico: Time to change to first-line regimens without NNRTI? Ávila-Ríos S1, García-Morales C1, Valenzuela-Lara M2, Tapia-Trejo D1, Pérez-García M1, López-Sánchez

13

DM1, Maza-Sánchez LC1, del Arenal-Sánchez SJ1, León-Juárez EA2, Magis-Rodríguez C2, Reyes-Terán G1, for the Mexico HIVDR Surveillance Network. 22nd International AIDS Conference 2018, Amsterdam, Países Bajos. 23-27 julio 2018. 6. CARGOS ACADÉMICO-ADMINISTRATIVOS Químico Instituto Nacional de Salud Pública, Laboratorio de evaluación de vacunas Cuernavaca, Morelos Enero 2003 – Septiembre 2004 Profesor de asignatura definitivo (después de examen de oposición) Facultad de Química, UNAM Departamento de Biología, Bacteriología Ciudad Universitaria, México D. F. Octubre 2009 – Diciembre 2011 Investigador en Ciencias Médicas “B” (Sistema de Investigadores de la Secretaría de Salud) Instituto Nacional de Enfermedades Respiratorias, Centro de Investigación en Enfermedades Infecciosas Tlalpan, México D. F. 1 de enero de 2008 – 31 de diciembre de 2009 Investigador en Ciencias Médicas “C” (Sistema de Investigadores de la Secretaría de Salud) Instituto Nacional de Enfermedades Respiratorias, Centro de Investigación en Enfermedades Infecciosas Tlalpan, México D. F. 1 de enero 2010 - 30 de abril de 2015 Investigador en Ciencias Médicas “D” (Sistema de Investigadores de la Secretaría de Salud) Instituto Nacional de Enfermedades Respiratorias, Centro de Investigación en Enfermedades Infecciosas Tlalpan, México D. F. 1 de mayo 2015 – 30 de abril de 2020 Sistema Nacional de Investigadores, SNI-I CONACyT Enero 2014 - Diciembre 2016 Sistema Nacional de Investigadores, SNI-II CONACyT Enero 2017 – Diciembre 2020

Premios y Distinciones: Mención honorífica por estudios realizados

• Mención Honorífica Centro Universitario México, 1995

• Mención Honorífica, carrera Química Farmacéutico Biológica

UNAM, 2001

• Distinción, MSc Molecular Medical Microbiology The University of Nottingham, 2002

• Mención Honorífica, Doctorado en Ciencias Biomédicas

UNAM, 2009 Premios nacionales o internacionales otorgados por organizaciones académicas del área o disciplina de trabajo

• Reconocimiento mejor promedio de la generación 89-92, nivel secundaria UNAM, 1992

• Reconocimiento Académico Departamento del Distrito Federal, 1994

• Reconocimiento mejor promedio de la generación 92-95, nivel preparatoria

14

UNAM, 1995 • Reconocimiento mejor promedio de la generación 92-95, nivel preparatoria

UNAM, 1995

• Diploma de Aprovechamiento, tres primeros lugares de la carrera Química Farmacéutico Biológica UNAM, 1997

• Diploma de Aprovechamiento, tres primeros lugares de la carrera Química Farmacéutico Biológica

UNAM, 1998 • Diploma de Aprovechamiento, tres primeros lugares de la carrera Química Farmacéutico Biológica

UNAM, 2000 • Diploma de Aprovechamiento, tres primeros lugares de la carrera Química Farmacéutico Biológica

UNAM, 2001 • Diploma de Aprovechamiento, tres primeros lugares de la carrera Química Farmacéutico Biológica

UNAM, 2002

• Keystone Symposia Scholarship Bill & Melinda Gates Foundation, 2008

• Asesoría al proyecto ganador de premio a la mejor experiencia en servicio social Universidad Autónoma Metropolitana, Unidad Xochimilco, 2007

• Reconocimiento por labor en la lucha contra la pandemia por el virus de la influenza A (H1N1)

INER, 2009

• Young Investigator Scholarship Award. 18th Conference on Retroviruses and Opportunistic Infections 2011. Boston, MA, USA. Marzo 2011

7. FINANCIAMIENTOS OTORGADOS Financiamientos Previos CONACyT, SALUD-2013-01-202475 Título: “Epidemiología moleacular, vigilancia de farmacorresistencia y evolución del VIH en la Región Mesoamericana” Papel: Investigador Principal Período: Febrero 2014-Febrero 2016 Financiamientos Actuales CONACyT, Salud-2017-01-289725 Título: “Vigilancia de farmacorresistencia, redes de transmisión y adaptación del virus de inmunodeficiencia humana en la Ciudad de México” Papel: Investigador Principal Período: Marzo 2018-Marzo 2020