ATP-sintasa
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Bendita tú eres entre todas las enzimas….
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Bendita tú eres entre todas las enzimas…. ATP-sintasa. Estructura de la ATP-sintasa. Matriz mitocondrial. Membrana mitocondrial interna. …danos hoy nuestro ATP de cada día. - PowerPoint PPT Presentation
Transcript of ATP-sintasa
Bendita tú eres entre todas las enzimas….
Matriz mitocondrial
Membrana mitocondrial interna
…danos hoy nuestro ATP de cada día
Con nuestros conocimientos de la ATP-sintasa (y nuestros desconocimientos) quisimos modelar el funcionamiento de esta enzima a partir de lo aprendido acerca de ratchets, específicamente el de la quinesina de una cabeza.
• Potencial dado por las cargas negativas del anillo• Entrada de protones que apaga el potencial• Asimetría del potencial dada por distintos sitios de anclaje a la membrana
-25 -20 -15 -10 -5 0 5 10 15 20 25-200
0
200
400
600
800
1000
Posición
Pote
ncia
l
-5 -4 -3 -2 -1 0 1 2 3 4 50
100
200
300
400
500
600
700
Posición
Nº
de e
nzim
as
E= 0,338
-5 -4 -3 -2 -1 0 1 2 3 4 50
100
200
300
400
500
600
700
Posición
Nº
de e
nzim
as
E= 0.3313
-5 -4 -3 -2 -1 0 1 2 3 4 50
100
200
300
400
500
600
700
Posición
Nº
de e
nzim
as
E= 0.346
-5 -4 -3 -2 -1 0 1 2 3 4 50
100
200
300
400
500
600
700
Posición
Nº
de e
nzim
as
E= 0.291
-5 -4 -3 -2 -1 0 1 2 3 4 50
100
200
300
400
500
600
700
Posición
Nº
de e
nzim
as
E =0.339
-5 -4 -3 -2 -1 0 1 2 3 4 50
100
200
300
400
500
600
700
800
Posición
Nº
de e
nzim
as
E = 0.144
T=6
-5 -4 -3 -2 -1 0 1 2 3 4 50
100
200
300
400
500
600
700
800
Posición
Nº
de e
nzim
as
T=8
E= 0.167
-5 -4 -3 -2 -1 0 1 2 3 4 50
100
200
300
400
500
600
700
800
Posición
Nº
de e
nzim
as
E = 0.018
Potencial menos asimétrico
-5 -4 -3 -2 -1 0 1 2 3 4 50
100
200
300
400
500
600
700
800
Posición
Nº
de e
nzim
as
E= -0.005
Potencial simétrico
-25 -20 -15 -10 -5 0 5 10 15 20 25-200
0
200
400
600
800
1000
Posición
Pot
enci
al
-25 -20 -15 -10 -5 0 5 10 15 20 25-200
0
200
400
600
800
1000
Posición
Pot
enci
al
-5 -4 -3 -2 -1 0 1 2 3 4 50
50
100
150
200
250
300
350
400
Posición
Nº
de e
nzim
as
dx= 8
E= 0.014
Pudimos determinar un tiempo óptimo de difusión.
Realizando varias corridas del mismo ratchet, observamos que se obtenían resultados similares
Modificando el tiempo de difusión respecto del óptimo (aumentándolo y disminuyéndolo), la asimetría del potencial y el dx, disminuye la eficiencia
Nos parece que el modelo de trinquete difusivo de la quinesina de una cabeza se aplica bastante bien al funcionamiento de la ATP-sintasa. Sin embargo, la eficiencia no nos parece muy alta.
Las modificaciones efectuadas (tiempo de difusión, simetría,etc) disminuían la eficiencia, como era de esperar de acuerdo a lo aprendido para este tipo de ratchet.
Sin embargo…
Existen algunas diferencias entre el modo de funcionamiento real de la ATP-sintasa y lo planteado por nosotros en la práctica….
• Las cargas negativas impiden la rotación hacia la membrana hidrofóbica (potencial)•La entrada de protones apaga el potencial.• Distinta probabilidad de entrada de protones a cada canal, debido a la diferente concentración de protones (potencial asimètrico)
A Julio Washington…
A Mari por la picada…
