Tema 1. Biología Molecular -...

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Idea Fundamental: La estructura del ADN permite un almacenamiento eficiente de la información genética. Germán Tenorio Biología NM-Diploma BI Tema 1. Biología Molecular 1.6 Estructura del ADN y el ARN

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Idea Fundamental: La estructuradel ADN permite un almacenamientoeficiente de la información genética.

Germán Tenorio

Biología NM-Diploma BI

Tema 1. Biología Molecular1.6 Estructura del ADN y el ARN

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Ácidos nucleicos

Concepto: Biopolímeros no ramificadosformados por la unión de subunidades omonómeros denominados nucleótidos.

Importancia biológica: Contienen lainformación genética, es decir, informacióncodificada que permite a los organismosdisponer de todo lo necesario paradesarrollar sus ciclos biológicos, y no sóloportando el mensaje (genes), sino tambiéncon las instrucciones precisas para su lectura.

Los ácidos nucleicos dirigen y controlan lasíntesis de proteínas, proporcionando lainformación que determinan su especificidady características biológicas.

Existen dos tipos de ácidos nucleicos, elácido desoxirribonucleico (ADN) y elácido ribonucleico (ARN).

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Nucleótidos Unidades básicas (monómeros) que forman a los ácidos nucleicos, es

decir, los ácidos nucleicos ADN y ARN son polímeros denucleótidos.

Ellos mismos son moléculas complejas que resultan de la combinaciónde:

- Una molécula de ácido fosfórico en forma de grupo fosfato (enalgunos nucleótidos puede haber más de un grupo fosfato) con cargasnegativas.

- Un azúcar (pentosa).

- Una base nitrogenada.

IMAGEN: Biología 2ªBachillerato Ed. SM

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Estructura de los nucleótidos Se denomina nucleósido a la molécula resultante de la unión mediante

enlace covalente N-glucosídico entre la pentosa (C1) y la basenitrogenada.

La unión del fosfato,mediante enlace covalentefosfodiéster, a la pentosa(C5) del nucleósido originael nucleótido.

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Estructura de los nucleótidos: Pentosa La pentosa es siempre una aldopentosa, pudiendo ser de dos tipos:

+ ribosa, y en en este caso el nucleótido se denomina ribonucleótido.

+ desoxirribosa, constituyente de los desoxirribonucleótidos.

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Estructura de los nucleótidos: Base nitrogenada La base nitrogenada también puede ser de dos tipos:

- Púricas, derivadas de la purina (2 anillos en su estructura): Adenina(A) y Guanina (G).

- Pirimidínicas, derivadas de la pirimidina (1 anillo en su estructura):Citosina (C), Timina (T) y Uracilo (U).

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Estructura de los nucleótidos Los nucleótidos formados con la ribosa se llaman ribonucleótidos y su

base nitrogenada puede ser Adenina, Guanina, Citosina o Uracilo.

Los nucleótidos formados con la desoxirribosa se llamandesoxirribonucleótidos y su base nitrogenada puede ser Adenina,Guanina, Citosina o Timina.

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HABILIDAD: Diagrama estructura nucleótidos

C2’

C5’

C4’

C3’

C1’Enlace covalente

fosfodiéster Enlace covalente N-glucosídico

OH OH/H

Fosfato Base nitrogenada

(púrica/pirimidínica)

β-D-pentosa

(ribosa/desoxirribosa)P

AzúcarBase

Representación simplificada de un nucleótido

Dibujo de diagramas simples de la estructurade nucleótidos individuales de ADN y ARNusando círculos, pentágonos y rectángulospara representar fosfatos, pentosas y bases.

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Unión entre nucleótidos: Enlace fosfodiéster Los nucleótidos pueden unirse mediante un enlace covalente éster

fosfórico (fosfodiéster), entre el grupo fosfato situado en posición 5’ deun nucleótido y el grupo OH que se encuentra en el carbono 3’ del otronucleótido.

Se trata de una reacción de condensación, en la que se libera unamolécula de agua. La hidrólisis del dinucleótido libera los dosmononucleótidos.

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Se pueden unir más nucleótidos, formándose trinucleótidos, etc. La uniónde muchos de ellos forman largas cadenas denominadas ácidos nucleicos(polinucleótidos).

Los ácidos nucleicos ADN y ARN sonpolímeros de nuclótidos. Si los nucleótidosque se unen son ribonucleótidos, se llamaácido ribonucleico (ARN), y si sondesoxirribonucleótidos se llama ácidodesoxirribonucleico (ADN).

En todos los polinucleótidos existe unextremo, denominado 3’, con una pentosacon el grupo OH del carbono 3’ libre, y otroextremo, denominado 5’, con una pentosacuyo grupo fosfato del carbono 5’ seencuentra libre.

5’ ACGT 3’

Unión entre nucleótidos: Enlace fosfodiéster

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Ácido desoxirribonucleico (ADN) Está constituído por macromoléculas lineales formadas por la

polimerización de desoxirribonucleótidos-5’ monofosfato de adenina(A), guanina (G), citosina (C) y timina (T). No existendesoxirribonucleótidos de uracilo en el ADN.

En medio acuoso, los largosfilamentos de ADN adoptan unaestructura tridimensional quepresenta estructuras primaria ysecundaria.

No obstante, cuando el ADN seasocia a determinadas proteínaspara su empaquetamiento,puede alcanzar niveles de grancomplejidad, que se podríanconsiderar estructura terciaria.

Web3IMAGEN: the-scorpion-and-the-frog.blogspot.com

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Estructura primaria del ADN

Consiste en la formación de largas cadenas de polinucleótidos por la uniónde desoxirribonucleótidos-5’ monofosfato mediante enlace fosfodiéster.

Por tanto, la estructura primaria del ADN es la secuencia de losnucleótidos que lo forman.

La secuencia en que aparecen los cuatro tipos de bases de las moléculas deADN determina las características biológicas de la célula o del individuoque la contiene.

En esta secuenciareside la informaciónnecesaria para lasíntesis de proteínas.

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Estructura secundaria del ADN Existen dos formas de ADN denominadas A y B. La forma A aparece por

deshidratación de la forma B, que es biológicamente más importante.

Su estructura secundaria fue propuesta por Watson y Crick en 1953, yconsite en una doble hélice de ADN dextrógira (ADN-B) formada pordos cadenas de nucleótidos (unidos por enlaces covalentes) enfrentadas yunidas mediante enlaces de hidrógeno entre sus bases nitrogenadas.Esta estructura tiene las siguientes características:

Web3

IMAGEN: http://all-len-all.com

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Estructura secundaria del ADN

1. Las dos cadenas polinucleotídicas son antiparalelascon direcciones opuestas. Una presenta la dirección 5’-3’ y la otra cadena la dirección 3’-5’.

2. Su configuración más establees la de una doble hélice cuyoarmazón es el esqueleto depolidesoxirribosa-fosfato con lasbases nitrogenadas hacia elinterior estableciendo enlaces dehidrógeno entre ellas paramantener la estructura.

Extremo 3’

Extremo 5’

IMAGEN: legacy.hopkinsville.kctcs.edu

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Estructura secundaria del ADN3. Las secuencias de bases de ambas cadenas son complementarias, puesexiste una correspondencia entre las bases de ambas cadenas, de forma quela A solo forma enlaces de hidrógeno con la T (y viceversa) y la G frente a laC (y viceversa).

IMAGEN: Biología 2ªBachillerato Ed. SM

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Estructura secundaria del ADN4. El enrollamiento entre las dos hebrasde la doble hélice es dextrógiro (existeuna tercera forma de ADN denominadaZ que es levógira) y de tipoplectonémico, como si estuvierantrenzadas y no se pueden separar sindesenrrollarlas.

5. La anchura de la hélice es de 2 nm,la longitud de cada vuelta completa esde 3.4 nm y cada 0.34 nm se encuentrauna pareja de bases complementaria,por lo que cada vuelta existen 10 paresde nucleótidos (La forma A tiene 11pares por vuelta).

6. Los planos de las bases nitrogenadasenfrentadas son paralelos entre sí yperpendiculares al eje de la hélice.

Animación1

IMAGEN: Biología 2ªBachillerato Ed. SM

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HABILIDAD: Diagrama estructura del ADN Dibuje un diagrama rotulado para mostrar cuatro nucleótidos de ADN,

cada uno con una base nitrogenada diferente, unidos en dos cadenas.

P

GUANINA

p

TIMINA

H

H

5’

3’

Enlace covalente

fosfodiéster

Fosfato

Base nitrogenada

β-D-desoxirribosaP

ADENINA

P

CITOSINA

H

H3’

5’

Enlaces de hidrógeno

IMAGEN: mind42.com

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NATURALEZA CIENCIAS: Uso de modelos como

representación del mundo real Al igual que los arquitectos usan maquetas para mostrar cual sería el

resultado final de una futura construcción, los científicos usan modelosmoleculares tridimensionales, con objeto de predecir la estructura real deuna molécula.

Los modelos científicos no son siempre tridimensionales (modelo de laestructura del ADN) y no siempre proponen estructuras (modelo atómicode Rutherford), sino que también pueden ser conceptos teóricos y puedenrepresentar sistemas (modelo geocéntrico de Ptolomeo) o procesos.

IMAGEN: http://demiguelasanti.blogspot.com.es/

IMAGEN: lasteorias.weebly.com

Video2

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NATURALEZA CIENCIAS: Uso de modelos como

representación del mundo real Sin embargo, la característica común de todos los modelos, es que son

propuestos para ser comprobados, por lo que los modelos científicos sonfrecuentemente rechazados y remplazados por otros (cambian con eltiempo).

El uso de modelos jugó unpapel crítico en eldescubrimiento de la estructuradel ADN, dado que Watson yCrick usaron la elaboraciónde modelos para descubrirla estructura del ADN.

IMAGEN: http://www.madrimasd.org

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APLICACIÓN: Explicación de Watson y Crick de la

estructura del ADN mediante la elaboración de modelos

El éxito de Watson y Crick en el descubrimiento de la estructura del ADNse basó en el uso de evidencias que les permitió desarrollar posiblesestructuras del ADN, comprobando su viabilidad mediante laconstrucción de modelos.

Las evidencias en las que sebasaron fueron dos, la composiciónquímica del ADN y la imagenmediante rayos X del ADN.

Respecto a la composición delADN, Watson y Crick tuvieron quetener en cuenta para la elaboraciónde su modelo los descubrimientosde Chargaff en 1952, en los que elnúmero de bases púricas essiempre igual al de basespirimidínicas (Ley de Chargaff).

IMAGEN: es.wikipedia.org/wiki/Ley_de_Chargaff

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APLICACIÓN: Explicación de Watson y Crick de la

estructura del ADN mediante la elaboración de modelos Y por otro lado, el análisis de

imágenes de difracción de rayos Xsobre cristales de ADN obtenidas porlos Rosalind Franklin y MauriceWilkins estableció los patrones desimetría de la molécula, lo quepermitió desarrollar un modelo conuna estructura en forma de hélice conlas bases enfrentadas hacia el interior.

IMAGEN: es.wikipedia.org/wiki/Ley_de_Chargaff

IMAGEN: sciencemuseum.org.uk/images/I045/10313925.aspx

IMAGEN: http://www.bio1100.nicerweb.com/

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Estructura del ADN y TdC Tres grupos de investigación, Watson y Crick en Cambridge, Franklin y

Wilkins en el King’s College de Londres y Linus Pauling en USA, intentabandelucidar la estructura del ADN.

¿En que grado es “anticientífica” una investigación llevada en secreto?¿Cuál es la relación entre el conocimiento compartido y el conocimientopersonal en las ciencias naturales?

La historia de la dilucidación de laestructura del ADN ilustra que lacooperación y la colaboraciónentre científicos coexiste con lacompetición entre grupos deinvestigación. ¿En qué medida el“descubrimiento” por parte deWatson y Crick de la estructuratridimensional del ADN dependió deluso de los datos generados porRosalind Franklin, que fueroncompartidos sin el conocimiento ni elconsentimiento de la científica?

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Web5

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Desnaturalización del ADN El plegamiento y la estabilidad de la doble hélice se consigue

fundamentalmente por los numerosos enlaces de hidrógeno entrediferentes regiones de las largas cadenas polinucleotídicas.

Sin embargo, hay otrasfuerzas que se oponeny desestabilizan laestructura, como lascargas negativas quese repelen entre losgrupos fosfatopróximos o la agitacióntérmica de lasmoléculas por efectode la temperatura.

IMAGEN: www.biogeo.iespedrojimenezmontoya.es

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Desnaturalización del ADN Cuando la temperatura (también cambios de pH o elevadas concentraciones

salinas) alcanza un determinado valor (punto de fusión del ADN), laagitación térmica de las moléculas es capaz de separar las dos hebras (alromper los enlaces de hidrógeno) y producir la desnaturalización del ADN.

Este fenómeno esreversible siempreque no haya sidodrástico, es decir, sicalentamos el ADNligeramente porencima del punto defusión y lo dejamosenfriar lentamente yen reposo, es capaz derecuperar su estructurasecundaria inicial dedoble hélice(renaturalización).

IMAGEN: Biología 2ªBachillerato Ed. SM

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Localización del ADN El ADN se encuentra en:

1. El interior de la cápsida de los virus de ADN formando lanucleocápsida.

2. La región del nucleoide del citoplasma de las células procariotas,formando el cromosoma de las mismas.

3. En el citoplasma de algunas bacterias en forma de plásmidos.

4. En el núcleo, mitocondrias y cloroplastos de las células eucariotas.

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Ácido ribonucleico (ARN) Está constituído por macromoléculas

lineales formadas por la polimerización deribonucleótidos-5’ monofosfato deadenina (A), guanina (G), citosina (C)y uracilo (U). No existen ribonucleótidosde timina en el ARN.

Las características químicas que lodiferencian del ADN son:

1. Los nucleótidos del ARN poseen ribosacomo pentosa, lo que hace que los gruposOH en posición 2’ queden libres cuando seencadenan para formar el ARN. Estoorigina tensiones en la estructuraprimaria que hace que el ARN seaquímicamente menos estable que el ADN.

2. Está formado por un solo polímero denucleótidos (monocadaena) a diferenciadel ADN (bicatenario).

IMAGEN: https:biologiacampmorvedre.blogspot.com

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Ácido ribonucleico (ARN)3. Las bases A, G y C son compartidas por los dos ácidosnucleicos, sin embargo, se diferencian en la cuarta base(Timina en el ADN y Uracilo en el ARN).

4. Existen determinados tipos de ARN que manifiestanactividad catalítica, es decir, se comportan comoenzimas. Se llaman ribozimas e intervienen en procesosrelacionados con la hidrólisis o ruptura de las cadenas deARN.

IMAGEN: Sophia.org

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Ácido ribonucleico (ARN)5. Las moléculas de ARN suelen tenerúnicamente estructura primaria. Sóloen algunos casos forman estructurassecundarias (doble hélice) yterciarias.

6. Excepto en los reovirus (que poseenmoléculas de ARN bicatenario), el ARNes monocatenario, aunque en ciertoscasos (ARNt) puede formar estructurade doble hélice.

En todos los tipos de ARN laestructura primaria es similar a la delADN, es decir, queda definida por lasecuencia de nucleótidos (de bases) dela cadena.

Los tipos de ARN son mensajero(ARNm), transferente (ARNt) yribosómico (ARNr) principalmente. IMAGEN: profesores.elo.utfsm.cl

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HABILIDAD: Diagrama estructura del ARN Dibuje un diagrama rotulado para mostrar cuatro nucleótidos de ARN,

cada uno con una base nitrogenada diferente.

P

ADENINA

P

CITOSINA

OH

3’

5’

Enlace covalente

fosfodiéster

Fosfato Base nitrogenada

β-D-ribosa

OH

P

GUANINA

P

URACILO

OH

OH

IMAGEN: mind42.com

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Diferencias entre ADN y ARN

ADN ARN

Composición Pentosa: DesoxirribosaBases: A, T, G y C

Pentosa: RibosaBases: A, U, G y C

Estructura Generalmente bicatenaria. Monocatenaria.

Localización Eucariotas: Núcleo, interior de mitocondrias y cloroplastos.Procariotas: Citoplasma.

Eucariota: Núcleo y citoplasma.Procariota: Citoplasma.

Tipos ADN de copia única y ADN altamente repetitivo.

Varias formas funcionales: ARNm, ARNt y ARNr

Función Portar la información genética.

Intervenir en la síntesis de proteínas.

El ADN difiere del ARN en el número de cadenas presentes, en lacomposición de las bases y en el tipo de pentosa.

Video5