Pubmed para principiantes

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Concepción Campos Asensio Bibliotecaria-Documentalista Hospital Universitario de Getafe [email protected] Twitter: @biblioGETAFE Blog: http://ccamposhugf.wordpress.com/ 23 de enero de 2013

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Webinar impartido por Concepción Asensio en SocialBiblio el día 23 de Enero de 2013

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Concepción Campos AsensioBibliotecaria-Documentalista Hospital Universitario de [email protected]: @biblioGETAFEBlog: http://ccamposhugf.wordpress.com/

23 de enero de 2013

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•La mayor base de datos mundial de ciencias de la salud

•Indiza 5.600 revistas de ámbito mundial (30.000 revistas editadas en todo el mundo) en 39 idiomas (91% en inglés)

•La cobertura temática de ciencias de la salud, especialmente de biomedicina, abarcando los campos de la medicina, enfermería, odontología, veterinaria, sistemas de salud, ciencias preclínicas, salud pública,…

•Recoge unos 19 millones de referencias bibliográficas, desde 1946 hasta el presente

•83% con resumen escrito por los autores de los artículos

•Los artículos son indizados con el tesauro MeSH

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1.8 millones de citas,la mayoría sin resumen, publicadas con anterioridad a1965

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Hay artículos de revistas que se indizan selectivamente (p. ej.: geología)

Se les asigna la etiqueta [PubMed]

Out-of-scope articles

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PMC

Books & Documents

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PubMed ofrece servicios añadidos para optimizar las búsquedas como:Enlaces a sitios que ofrecen el texto completo de artículos (gratuitos como PMC o de pago)Opciones de búsqueda avanzada como filtros metodológicos “Clinical Queries” y “Special Queries”Enlaces a artículos relacionados o información en “Discovery Ads”Buscador de citas (“Single citation matcher”)Actualización automática de las búsquedas por correo electrónico y RSS, la posibilidad de guardar registros y filtrar los resultados con MyNCBIFunción de corrector ortográficoEnlaces a recursos NCBI de biología molecularNo solo citas de artículos… ahora también incluye referencias de libros y sus capítulos de libros de NCBI Bookshelf

Es la plataforma de acceso a MEDLINE más utilizada

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Ventana deVentana de búsqueda básicabúsqueda básica

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151515

Clinical Queries:Clinical Queries: Buscador especializado que tiene incorporados filtros metodológicos: Buscador especializado que tiene incorporados filtros metodológicos: - Clinical Study CategoryClinical Study Category- Systematic ReviewsSystematic Reviews- Medical GeneticsMedical Genetics

HERRAMIENTAS DE BÚSQUEDA / PubMed ToolsHERRAMIENTAS DE BÚSQUEDA / PubMed Tools

Single Citation MatcherSingle Citation Matcher: : Busca Busca

referencias partiendo de los datos referencias partiendo de los datos

conocidos. Muy útil para localizar conocidos. Muy útil para localizar

referencias incompletas, referencias incompletas,

verificar datos... verificar datos...

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OTROS RECURSOS / More ResourcesOTROS RECURSOS / More ResourcesMESH Database: permite buscar por descriptores/ palabras clave (MESH) que la base de datos ha asignado a los referencias.

Journal Database: incluye todas las revistas indizadas en PubMed, y se pueden localizar por: título, abreviatura, ISSN, especialidades…

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Acrónimo de Medical Subject Headings (MeSH)Vocabulario controlado de términos biomédicos que representan el contenido de cada artículo que se ingresa en la base de datos MedlineEs una característica distintiva de MEDLINEOrganizados de manera jerárquicaAproximadamente 26.000 términos médicosRevisados anualmente1 referencia bibliográfica = 12 términos del Tesauro

http://www.nlm.nih.gov/mesh/MBrowser.html

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1 Identificar los conceptos claves de nuestra búsqueda

2 Escribir nuestros términos o conceptos claves (en inglés) en la ventana de búsqueda.

3 Pinchar en botón Search

4 Borrar

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Auto-Suggest: Podemos seleccionar entre las sugerencias que nos ofrece

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Localiza cualquier término/s presente/s en las referencias

(título, resumen, materia… y mapea)

BÚSQUEDA BÁSICA

Colon cancer

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PubMed automaticamente comprueba lo que hemos escrito frente a varios índices en el orden siguiente:

Subject Translation TableJournal Translation TableAuthor Table

Si lo encuentra, nos buscará por el término del MeSH y en texto libreSi no lo encuentra lo divide en partes y vuelve a intentar el mapeo de cada parteCualquier término que no pueda ser encontrado, lo buscará en ALL FIELDS

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262626

Search details: Nos muestra la verdadera estrategia de búsqueda

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Estrategia de búsqueda con mapeo del término

Lo que hemos escrito en la ventana de búsqueda

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Mapeo automático de términos

Colon cancer

Introducir la palabra o palabras dentro de la ventana de búsqueda y pulsar el botón SEARCH o la tecla ENTER

Recupera los registros en los que encuentra correspondencia con el término

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Vamos a intentar esta búsqueda:

Ejemplo

Buscar artículos sobre la indigestión y el dolor abdominal

Conceptos claves son:

indigestion

abdominal pain

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PARTE CENTRAL:Referencias obtenidas se muestran de 20 en 20, en formato Summary y ordenadas empezando por las

citas más recientes introducidas en PubMed

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Las referencias tienen el enlace “Related Articles”

Es un algoritmo de búsqueda en el que PubMed compara palabras del Title y Abstract de cada cita, así como los encabezamientos MeSH asignados.Los resultados se muestra en orden de relevancia y no por fecha

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Hay muchas razones para refinar nuestra estrategia. Si queremos:

Excluir idiomas que no entendemosBuscamos artículos que han sido publicados en cierto periodo de tiempoRecuperar artículos referentes a una población específica Buscar sólo estudios de investigación clínica

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Afiliación de los autores

Previsualización de imágenes de PMC

Tipo de publicaciónTérminos MeSH LinkOut

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• File:File: Permite guardar las referencias como archivo.Permite guardar las referencias como archivo.• E-mailE-mail: : Permite enviar por correo-e las referencias.Permite enviar por correo-e las referencias.• CollectionsCollections: : Permite guardar las referencias en MyNCBI.Permite guardar las referencias en MyNCBI.• ClipboardClipboard: Portapapeles temporal donde vamos enviando las referencias : Portapapeles temporal donde vamos enviando las referencias

para luego gestionarlas de forma conjunta. El número máximo que se puede para luego gestionarlas de forma conjunta. El número máximo que se puede guardar es de 500 referencias.guardar es de 500 referencias.

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Menú desplegable “Send to”

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PubMed online Training

http://www.nlm.nih.gov/bsd/disted/pubmed.html

PubMed Tutorial

http://www.nlm.nih.gov/bsd/disted/pubmedtutorial/

PubMed help

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK3827/

NLM Technical Bulletin

http://www.nlm.nih.gov/pubs/techbull/tb.html

Non-English Guides to PubMed

http://nnlm.gov/training/resources/intlpubmedlinks.html

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