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MODELOS DE CRECIMIENTOMICROBIANO

CLASIFICACIN

MICROBIOLOGA PREDICTIVA

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MICROBIOLOGA PREDICTIVA (MP)

Microbiologa Predictiva di!ci"li#a $%e co&bi#aele&e#to! de &ate&'tica! e!tad!tica !i!te&a!i#or&'tico! i#ge#iera $%&ica * ecologa &icrobia#a"ara de!arrollar &odelo! $%e de!cribe# * "redice# elco&"orta&ie#to de lo! &icroorga#i!&o! ba+oco#dicio#e! e,"eri&e#tale! (Parra -../)0

Modelo Microbiol1gico Predictivo e,"re!i1# &ate&'tica$%e de!cribe el creci&ie#to la !%"ervive#cia lai#activaci1# o "roce!o bio$%&ico de %# &icroorga#i!&ode orige# ali&e#tario (Mcdo#ald * 2%# 3///)0

La! a"licacio#e! "r'ctica! de la MP !e e#c%e#tra#relacio#ada! co# el &e+ora&ie#to de la! t4c#ica!tradicio#ale! "ara gara#ti5ar la !eg%ridad ali&e#taria6ello i&"lica la eval%aci1# de rie!go! &icrobiol1gico! o laeval%aci1# de "roce!o! de elaboraci1# de ali&e#to!tradicio#ale! o i##ovadore!0

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Cla!i7caci1# de lo! rie!go! "ara la !al%di#d%cido! "or lo! ali&e#to! * e# %#ci1# de

la gravedad i#cide#cia * "eriodo de

i#c%baci1#.

30 E#er&edade! &icrobia#a! tra#!&itida! "or lo!ali&e#to!

-0 Tra!tor#o! o de!e$%ilibrio! #%tricio#ale!80 Co#ta&i#a#te! a&bie#tale!90 2%!ta#cia! to,ica! #at%rale! "re!e#te! e# lo!

ali&e#to!

:0 Alteracio#e! "rovocada! "or alg%#o! ali&e#to!biotec#ol1gico!;0 Aditivo! ali&e#tario!0

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Cla!i7caci1# de lo! &odelo! "redictivo! delcreci&ie#to&icrobia#o

Funcionamiento Matemtico &odelo! e&"rico! * &eca#ici!ta!0

1. Modelos Em!"icos de!arrollado! a "artir de dato! obte#ido!e,"eri&e#tal&e#te6 de!cribe# lo! dato! de creci&ie#to ba+oco#dicio#e! e!"ec7ca!

. E+e&"lo! de &odelo! e&"rico! &odelo de Go&"ert5

&odelo de ra5 c%adrada * !%! &odi7cacio#e! &odelo! de ec%acio#e! "oli#1&ica!0.

late#cia (LDP) "ar'&etro! e# %#ci1# de co#dicio#e! e,"eri&e#tale!(te&"erat%ra ">)0

#. Modelos Mecanicistas$ "arte# de %#a ba!e te1rica biol1gica lac%al obliga al &odelo a ada"tar!e a la realidad biol1gica &edia#te%#a ?i"1te!i! deter&i#ada

. E,"lica# co# &'! e,actit%d lo! dato! e,"eri&e#tale! a%#$%e #o !ea+%!te# co# ta#ta e,actit%d co&o lo! &odelo! e&"rico! a lo! dato!%tili5ado! "ara la ge#eraci1# del &odelo0

.

E+e&"lo! de &odelo! $%e "redice# la ta!a de creci&ie#to e# %#ci1# de la te&"erat%ra

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Cla!i7caci1# de lo! &odelo! "redictivo! delcreci&ie#to&icrobia#oModelos se%&n la Finalidad &odelo! e# ci#4tico! *

"robabil!tico!01. Modelos Cin'ticos de creci&ie#to de !%"ervive#cia o de

i#activaci1# "ara deter&i#ar el #@&ero de &icroorga#i!&o! e#%#ci1# del tie&"o0 E,"lica# el creci&ie#to de &icroorga#i!&o! e# t4r&i#o! de

variable! a&bie#tale! te&"erat%ra "> actividad de ag%a0 P%ede# i#cl%ir!e otra! variable! co&o la at&o!era ga!eo!a

la ?%&edad relativa el co#te#ido de #%trie#te! * la!"ro"iedade! a#ti&icrobia#a!0

Modelo! @tile! "ara e,"licar el co&"orta&ie#to de lo!

&icroorga#i!&o! d%ra#te el tie&"o de "roce!o oal&ace#a&ie#to Re$%iere# de gra# ca#tidad de dato! de rec%e#to!

&icrobia#o!0

#. Modelos ("o)a)il!sticos e&"leado! "ara e!ti&ar lo! l&ite!de creci&ie#to#o creci&ie#to o "rod%cci1##o "rod%cci1# de

to,i#a

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Lo! &odelo! de creci&ie#to &icrobia#o trata# de re"re!e#tarel i#cre&e#to e# la "oblaci1# &icrobia#a d%ra#te diere#te!eta"a! del "roce!o ("roce!a&ie#to di!trib%ci1#al&ace#a&ie#to)0

Modelo %# #@&ero i#icial de bacteria! (= i) !e &%lti"lica "aradar co&o re!%ltado %# #@&ero 7#al de &icroorga#i!&o! (=)debie#do co#!iderar lo! actore! $%e reg%la# * co#dicio#a# elcreci&ie#to bacteria#o ("> te&"erat%ra actividad de ag%a)0

Ti"o! de &odelo! "ara a#ali5ar el creci&ie#to &icrobia#o

a) Pri&ario! de!cribe# la evol%ci1# de la "oblaci1# de&icroorga#i!&o! a lo largo del tie&"o ba+o deter&i#ada!co#dicio#e!

b) 2ec%#dario! tie#e# e# co#!ideraci1# la variabilidad $%e"%ede oc%rrir e# el "erodo ba+o a#'li!i! e# c%a#to a !%!

co#dicio#e! a&bie#tale!

o! &o e o! "re c vo! ecreci&ie#to

&icrobia#o0 Pro"%e!ta de Pi#Bara#*iModelo! Pri&ario! 2ec%#dario! Terciario!0

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Modelos Matemticos ("edicti*osTe"cia"ios

Modelos Te"cia"ios De!de %# "%#to de vi!ta "r'ctico co# el7# de tra#!erir e i&"%l!ar el %!o de lo! &odelo! "redictivo!"or "arte de %#iver!idade! * e&"re!a! e! i&"orta#te $%e lo!&odelo! "ri&ario! * !ec%#dario! !e i#tegre# e# or&a de"a$%ete! i#or&'tico! i#teractivo! * de 'cil %!o0 Modelo!

Terciario! "redictivo! di!"o#ible! Pat?oge# Modeli#g Progra& &odelo! de creci&ie#to e

i#activaci1# de diere#te! "at1ge#o! Co&Ba!e ba!e de dato! i#ter#acio#al $%e recoge *

act%ali5a dato! !obre creci&ie#to &icrobia#o e# diere#te!

co#dicio#e!0 Per&ite reali5ar "rediccio#e! e# co#dicio#e!di#'&ica! de te&"erat%ra 2eaood 2"oilage a#d 2ae Predictor "redice la vida @til * el

creci&ie#to de lo! &icroorga#i!&o! e!"ec7co! dedeterioro ?i!ta&i#a * de L0 &o#oc*toge#e! e# diere#te!

"rod%cto! de la "e!ca a te&"erat%ra co#!ta#te o e#co#dicio#e! de %ct%aci1# de te&"erat%ra0

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Modelo matemtico "edicti*o Te"cia"io

?tt""&"0errc0ar!0%!da0govPMP>o&eOvervieF0a!",

Pathogen Modeling Program (PMP)

http://pmp.errc.ars.usda.gov/PMPHome/Overview.aspxhttp://pmp.errc.ars.usda.gov/PMPHome/Overview.aspx

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Modelo matemtico "edicti*o Te"cia"ioPathogen Modeling Program (PMP)

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Modelo Go&"ert5

Ecuacin de Gompertz modificada: modelo no lineal sigmoidal con cua!"o

Coe#icien!es

Y= A+C exp{-exp[-B(t-M)]}

2&bolo De!cri"ci1#Lo% N Rec%e#to 7#al (Log de

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Modelo Go&"ert5

$!!%s:&is$"'(o"d%"ess'comsa&

$!!%s:&is$"'(o"d%"ess'comsasada!a&

T? t t i FSA b i t ll d R t

https://fishr.wordpress.com/fsa/https://fishr.wordpress.com/fsa/fsadata/https://fishr.wordpress.com/fsa/fsadata/https://fishr.wordpress.com/fsa/fsadata/https://fishr.wordpress.com/fsa/https://fishr.wordpress.com/fsa/http://www.rforge.net/FSAhttp://www.rforge.net/FSA

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T?e &o!t rece#t ver!io# o FSAca# be i#!talled ro& Rorge0#etor

ro& Git?%ba! de!cribed beloF0 2ee t?i! =E2 7le or t?e &o!t

rece#t c?a#ge!0

R%# t?e olloFi#g code i# R to i#!tall ro& Rorge0#et0

!o%rce(J?tt"FFF0rorge0#et2AI#!tall2A0RJ)

R%# t?e olloFi#g code i# R to i#!tall ro& Git>%b (re$%ire! R v80.0-

or later a#d a# i#!tallatio# o RTool!)0

i (Kre$%ire(devtool!))

i#!tall0"acage!(devtool!)

re$%ire(devtool!) devtool!i#!tallNgit?%b(drogle#c2A)

http://www.rforge.net/FSAhttps://github.com/droglenc/FSAhttps://github.com/droglenc/FSA/blob/master/NEWS.mdhttp://cran.r-project.org/bin/windows/Rtools/http://cran.r-project.org/bin/windows/Rtools/https://github.com/droglenc/FSA/blob/master/NEWS.mdhttps://github.com/droglenc/FSAhttp://www.rforge.net/FSA

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Modelo matemtico "edicti*o delc"ecimiento de Escherichia coliO1+, en

ca"ne *acuna

Ob+etivo &odelar el creci&ie#to &icrobia#o de Escherichia coliO3: e# car#e vac%#a co&o "arte de %#a eval%aci1#c%a#titativa de rie!go!0

Modelo! "redictivo! de creci&ie#to del "at1ge#o e# car#e e#%#ci1# de la te&"erat%ra * do! &odelo! "redictivo! terciario!0

2e ge#eraro# dato! !obre el tie&"o de late#cia () * ta!a decreci&ie#to (Q) e# %# ra#go de te&"erat%ra! (:C 89C) * ">(:; S ;:) obte#i4#do!e la relaci1# li#eal e#tre cada "ar'&etro* te&"erat%ra0

Modelo! "ara "redicci1# del creci&ie#to de E. coli ec%acio#e!

lage,"o#e#cial * Go&"ert50 La &etodologa "er&ite i#cl%ir diere#te! co#dicio#e!

a&bie#tale! "re!e#te! e# la car#e a lo largo del "roce!oco#!idera#do la variabilidad * la! i#certid%&bre! de lo!"ar'&etro! $%e caracteri5a# el creci&ie#to &icrobia#o0

Modelo &icrobiol1gico Go&"ert5 ge#er1 &e+ore! re!%ltado! *a$%e al co#!iderar la co#ce#traci1# de bacteria! $%e alca#5a# la