METODOLOGÍA DE ANÁLISIS DE LA INFORMACIÓN HEREDITARIA Dra. Adriana Mimbacas.
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METODOLOGÍA DE ANÁLISIS METODOLOGÍA DE ANÁLISIS DE LA INFORMACIÓN DE LA INFORMACIÓN
HEREDITARIAHEREDITARIA
Dra. Adriana MimbacasDra. Adriana Mimbacas
HISTORIAHISTORIA
CRONOLOGIACRONOLOGIA
CITOGENETICA
1866: Mendel describe las unidades fundamentales
de la herencia
1925: se descubre que la actividad del gen está
relacionada con su posición en el cromosoma.
1953: se propone la estructura en doble hélice del ADN
1956: Tijo y col.: Nº real de cromosomas = 46
1959: Lejeune y col. describieron la primera aberración
cromosómica numérica (síndrome de Down)
inclusión en parafina y cortes con micrótomo,
técnica de aplastado
cultivo celulares "in vitro".
METODOS DE ESTUDIOS
esterilidad, medios de cultivos apropiados y
sus aditivos, dispositivos apropiados para el
cultivo, temperatura, pH, tensión del gas.
Existen múltiples factores que inciden en la obtención exitosa de un cultivo:
CULTIVOS IN VITRO Permiten obtener células en el estadio de metafases en la división mitótica
Se observan diferentes regiones:
estrechamientos o constricciones. Primarias Secundarias
MORFOLOGÍA DE LOS CROMOSOMAS METAFÁSICOS
HUMANOS: Centrómero localizadoCentrómero difuso: holocéntrico (ej: insectos, arácnidos primitivos).
CONSTRICCION PRIMARIA
Estrechamientos constantes en posición y tamaño.
En ciertos casos están íntimamente relacionadas al organizador nucleolar (evidenciadas por hibridización "in situ" con ARN ribosomal)
CONSTRICCIONES SECUNDARIAS:
segmento cromosómico presente entre el organizador nucleolar y el telómero
(grupo D humano).
SATELITES
Caracterizan a una especie. Se evidencian fundamentalmente en metafase. Las más importantes son:
CONSTANTES CROMOSOMICAS
número cromosómico
el complemento somático diploide (2n) del ser humano es 46 formado por el aporte haploide de cada gameto
(23 cr=n) (n23+n23=2n46).
característico de cada especie.
Se tiene en cuenta la longitud relativa con respecto a la suma de la longitud de un conjunto cromosómico haploide
tamaño cromosómico
morfología cromosómica
• Presentan 2 brazos cromosómicosPresentan 2 brazos cromosómicos– Brazo corto: pBrazo corto: p– Brazo largo: qBrazo largo: q
• Se clasifican de acuerdo a la Se clasifican de acuerdo a la posición del centrómero en:posición del centrómero en:– MetacéntricosMetacéntricos– SubmetacéntricosSubmetacéntricos– AcrocéntricosAcrocéntricos– Telocéntricos (no existen en el Telocéntricos (no existen en el hombre)hombre)
CENTROMERO
BRAZO LARGO
BRAZO CORTO METACENTRICOCENTROMERO CENTRAL
CENTROMERO
SUBMETACENTRICOBRAZOS DESIGUALES
CENTROMEROACROCENTRICOCENTROMERO EN POSICION SUBTERMINAL(UN BRAZO MUY CORTO)
Morfología cromosómica
Es un arreglo sistematizado de los cromosomas de una célula la cual es fotografiada y ordenada de acuerdo a las normas establecidas (tamaño, morfología). Es característico de un individuo y no cambia.
CARIOTIPO
Bandas transversales claras y oscuras .
Localización fija,
Su nombre se debe a que la tinción se realiza con Giemsa
Corresponden a:1) genes de replicación tardía ricas en AT
(oscuras)2) Genes de replicación temprana ricas en GC
(claras)
BANDEO G:
1
2
3
Es la representación en forma de diagrama del cariotipo y su construcción se realiza en base a valores promedios.
IDIOGRAMA:
métodos salinos,
enzimáticos (tripsina, pronasa),
técnicas varias en las que se incluyen sustancias como urea, permanganato de potasio).
Los métodos de obtención e bandas cromosómicas son variados y pueden agruparse en:
Bandeo G:Bandeo G:
• Es el bandeo que Es el bandeo que se utiliza en la se utiliza en la nomenclatura de nomenclatura de los cariotiposlos cariotipos
NOMENCLATURANOMENCLATURA
Sigue ciertas normas establecidas por convenciónSigue ciertas normas establecidas por convención
Número de cromosomas seguidos de una comaNúmero de cromosomas seguidos de una coma
cromosomas sexuales, seguidos de una comacromosomas sexuales, seguidos de una coma
alteraciones encontradas:alteraciones encontradas: del = deleccióndel = delección
t = translocaciónt = translocación
ins = inserciónins = inserción
I = isocromosomaI = isocromosoma
r = anillo r = anillo
Seguidos de paréntesis cromosoma involucrado(s), bandas afectadas
ejemplosejemplos
mujer normal: 46, XXmujer normal: 46, XX
hombre normal 46, XYhombre normal 46, XY
mujer con alteración numérica: mujer con alteración numérica: 45, XX, -845, XX, -8
hombre con alteración estructural: hombre con alteración estructural: 46, XY, t(8,14)46, XY, t(8,14)
mujer con alteración estructural: 46, mujer con alteración estructural: 46, XX, del(9p12)XX, del(9p12)
El complemento cromosómico puede experimentar variaciones debido a:
ALTERACIONES DEL COMPLEMENTO CROMOSOMICO
•modificaciones en el número de los cromosomas que lo constituyen: alteraciones numéricas
•Modificaciones en la estructura de los cromosomas: alteraciones estructurales
HETEROPLOIDIA: cualquier alteración en el número normal del cariotipo
1. HAPLOIDIA:
1 sólo juego crom. (monoploide)
2. POLIPLOIDIA: aumento por duplicación
del complemento
cromosómico entero
(poliploide)
3. ANEUPLOIDIA: organismos o células que
tienen uno o más
cromosomas que el número
básico de la especie.
ANOMALIAS NUMERICAS
AneuploidíaAneuploidía
MonosomíasMonosomías: : ausencia de un cromosoma ausencia de un cromosoma del par de homólogos = 2n - 1 (viable 45 del par de homólogos = 2n - 1 (viable 45 X0)X0)
TrisomíasTrisomías: : presencia de más de un presencia de más de un
cromosoma en el par de homólogos = 2n cromosoma en el par de homólogos = 2n +1 (producen abortos aunque existen +1 (producen abortos aunque existen algunas que son viables con diferente algunas que son viables con diferente grado de sobrevida: tri 21, tri 13, tri 18, grado de sobrevida: tri 21, tri 13, tri 18, 47XXY)47XXY)
Mosaicos: Mosaicos: coexistencia de células normales coexistencia de células normales y alteradasy alteradas
Anomalias numéricas
Síndrome de Down 47, XX, + 21
Síndrome de Patau: 47,XX, + 13
Síndrome de Edwards: 47, XY, +18
Síndrome de Turner 45, X0
Mujer tri-X: 47, XXX
Síndrome de Klinefelter: 47, XXY
ANOMALIAS ESTRUCTURALESANOMALIAS ESTRUCTURALES
IN TR AC R O M O S O M IC A
IN TE RC R O M O S O M IC A
N O R M A L ID A D
R E U N IO NC O R R E C TA
S IN P E R D ID AD E M A TE R IA L
C O N P E R D ID AD E M A TE R IA L
A N O M A L IA SE S TR U C TU R A L E S
R E U N IO NIN C O R R E C TA
R U P TU R AC R O M O S O M IC A
ALTERACIONES ESTRUCTURALES
Los cambios de la estructura cromosómica pueden ser agrupados en dos grandes categorías:
cromáticas cuando afectan a una sola de las cromátidas y
cromosómicas cuando afectan a ambas cromátidas en el mismo punto.
cambios submicroscópicoscambios submicroscópicos: :
mutación génica o puntualmutación génica o puntual
• cambios microscópicos:cambios microscópicos:
afectan el número y/o el arreglo afectan el número y/o el arreglo de losde los
loci de los genesloci de los genes
pérdida de un segmento pérdida de un segmento
aumento de un segmentoaumento de un segmento
reordenamiento intracromosómicoreordenamiento intracromosómico
reordenamiento intercromosómico reordenamiento intercromosómico
DELECION
Cri du Chat: 46, XX, del (5p14)
ISOCROMOSOMAS
MECANISMO NORMAL
INVERSION
fracturas con giro de 180º del fragmento intersticial.
En el hombre las inversiones más frecuentes son las que afecta las regiones heterocromatínicas del 1, 9, 16
pueden no causar alteraciones en el individuo, pero pueden provocan alteraciones en la descendencia.
Se clasifican en:
SIMPLES: un sólo segmento invertido y según su relación al centrómero pueden ser:- pericéntrica: si el fragmento involucra el centrómero- paracéntrica: si no lo involucra
COMPLEJASCOMPLEJAS::
se invierten se invierten simultáneamente simultáneamente varios segmentos de varios segmentos de un mismo cromosomaun mismo cromosoma
SI LA INVERSION OCURRE EN LOS PRECURSORES DE LOS GAMETOS PUEDE PRODUCIR GENOMAS ANORMALES EN LA PROGRESION A TRAVES DE LA MEIOSIS.
LA RECOMBINACION ENTRE HOMOLOGOS EN EL CUAL UNO DE ELLOS TENGA UNA INVERSION Y EL OTRO NO PUEDE RESULTAR EN ANOMALIAS CROMOSOMICAS
CROMOSOMA EN ANILLO
DUPLICACION
TRANS. NO BALANCEADA
TRANS. BALANCEADA
Anormalidades Cromosómicas Amniocentesis en Población General
Anormalidades Cromosómicas Amniocentesis en Población General
Rearreglos
Otras Aneuploidías
Otros Mosaicos
Mosaicos X&Y
Trisomía 21
Aneuploidías X & Y
Trisomía 13, 18
Rearreglos
Otras Aneuploidías
Otros Mosaicos
Mosaicos X&Y
Trisomía 21
Aneuploidías X & Y
Trisomía 13, 18
18.518.5
3.33.34.04.0 2.42.4
53.953.9
24.024.0
22.122.1
N = 354.341 amniocentesis; 5.802 anormalidades (1.64%)N = 354.341 amniocentesis; 5.802 anormalidades (1.64%)
71.971.9
Anormalidades CromosómicasPoblación de Edad Materna Avanzada
Anormalidades CromosómicasPoblación de Edad Materna Avanzada
Rearreglos
Otras aneuploidías
Otros mosaicos
Mosaicos X&Y
Trisomía 21
Aneuploidías X&Y
Trisomía 13, 18
Rearreglos
Otras aneuploidías
Otros mosaicos
Mosaicos X&Y
Trisomía 21
Aneuploidías X&Y
Trisomía 13, 18
1.91.9
3.53.5 1.21.2
14.814.8
63.663.6
17.017.019.419.4
N=88.800 amniocentesis; 1.833 anormalidades (2.08%)N=88.800 amniocentesis; 1.833 anormalidades (2.08%)
78.578.5
Estudios en:• sangre periférica• líquido amniótico• Vellosidades coriales• Sangre o tejidos neoplásicos
APLICACION DEL ANALISIS CITOGENETICO
TÉCNICAS PARA DETECTAR TÉCNICAS PARA DETECTAR CAMBIOS CAMBIOS SUBMICROSCOPICOSSUBMICROSCOPICOS
Técnicas molecularesTécnicas moleculares
Fue originalmente descripta en 1969 Fue originalmente descripta en 1969
utilizando sondas marcadas con utilizando sondas marcadas con 3232P P
radioactivo (Gall y Pardue, 1969).radioactivo (Gall y Pardue, 1969).
HIBRIDIZACION IN SITU
SONDA: fragmento de ADN que es “marcado “ con métodos radioactivos o por inmuno-histoquímica
Estas sondas se unen a su ADN complementario localizado en cromosomas fijados en un portaobjeto
DEFINICION DEFINICION
• La La hibridización "in situ"hibridización "in situ" es una es una
detección directa de ácidos detección directa de ácidos
nucleícos en el material celular en el nucleícos en el material celular en el
cual se puede realizar a la vez, un cual se puede realizar a la vez, un
análisis morfológico. (análisis morfológico. (Herrington y Herrington y
McGee, 1994)McGee, 1994)
APLICACIONESAPLICACIONES
Rápida identificación de Rápida identificación de cromosomas humanos específicos cromosomas humanos específicos en híbridos celulares somáticosen híbridos celulares somáticos
Identificación de cromosomas Identificación de cromosomas marcadores en metafases marcadores en metafases cromosómicascromosómicas
Mapeo de genes en la investigación Mapeo de genes en la investigación del genoma.del genoma.
Búsqueda de aberraciones Búsqueda de aberraciones cromosómicas en estudios de cromosómicas en estudios de dosimetría de radiación.dosimetría de radiación.
Identificación de cambios Identificación de cambios cromosómicoscromosómicos
Estas sondas se obtienen de Estas sondas se obtienen de genotecas de ADN recombinante genotecas de ADN recombinante producidos a partir de producidos a partir de cromosomas específicos aislados cromosomas específicos aislados por medio de un clasificador por medio de un clasificador celular y clonados en vectores celular y clonados en vectores (fago lambda o plásmido pBR)(fago lambda o plásmido pBR)
Se marcan con fluoroforosSe marcan con fluoroforos
WHOLE CHROMOSOME WHOLE CHROMOSOME PAINTINGPAINTING
Utiliza como sonda fragmentos que Utiliza como sonda fragmentos que
contienen secuencias homólogas de contienen secuencias homólogas de
ADN a lo largo de todo un ADN a lo largo de todo un
cromosomacromosoma
Deleción del 22q11.23Sonda Dual Color DiGeorge/VCFS TUPLE 1
Microdeleción Prader-Willi / Angelman Sonda LSI SNRPN/ CEP 15/ PML
•FISH detecta la deleción de la región 15q11-13.
Traslocación del SRY al Xp
Mezcla de sondas:
LSI SRY SpectrumOrange – región delecionada
CEP X SpectrumGreen
– sonda control
DUPLICACION
APLICACIONESAPLICACIONES
Rápida identificación de cromosomas Rápida identificación de cromosomas humanos específicos en híbridos celulares humanos específicos en híbridos celulares somáticossomáticos
Identificación de cromosomas marcadores Identificación de cromosomas marcadores en metafases cromosómicasen metafases cromosómicas
Mapeo de genes en la investigación del Mapeo de genes en la investigación del genoma.genoma.
Búsqueda de aberraciones cromosómicas Búsqueda de aberraciones cromosómicas en estudios de dosimetría de radiación.en estudios de dosimetría de radiación.
Identificación de cambios cromosómicosIdentificación de cambios cromosómicos
GENOMAGENOMA
DEFINICIÓNDEFINICIÓN
• 1920: set de cromosomas de una célula 1920: set de cromosomas de una célula haploide de un organismo. haploide de un organismo.
• 1970: suma total de genes. (no se conocía aún 1970: suma total de genes. (no se conocía aún la existencia secuencias no codificantes). la existencia secuencias no codificantes).
• Hoy: es un sistema estructural, funcional y Hoy: es un sistema estructural, funcional y evolutivo. (Es mucho más que la suma de sus evolutivo. (Es mucho más que la suma de sus partes: regiones codificantes 3% del total y no partes: regiones codificantes 3% del total y no codificantes). codificantes).
UnUn marcador “genético” marcador “genético” es una es una característica genética discreta y característica genética discreta y segregante que caracteriza a una segregante que caracteriza a una población por virtud de su presencia, población por virtud de su presencia, ausencia, alta o baja frecuenciaausencia, alta o baja frecuencia (Crawford, (Crawford, 1973).1973).
Marcador genéticoMarcador genético: corre: correspondesponde a un a un lugar específico en el genoma con lugar específico en el genoma con segregación demostrable y de confiable segregación demostrable y de confiable determinación que presenta variación determinación que presenta variación (polimorfismo) en las poblaciones.(polimorfismo) en las poblaciones.
ASPECTOS CITOGENTICOS Y ASPECTOS CITOGENTICOS Y MOLECULARES DE TUMORESMOLECULARES DE TUMORES
LLas diferencias cruciales entre cas diferencias cruciales entre céélulas lulas normales y cnormales y céélulas cancerosas se lulas cancerosas se encuentran en los cambios discretos encuentran en los cambios discretos que se producen en genes especque se producen en genes especííficos ficos que controlan la proliferacique controlan la proliferacióón y n y homeostasis tisularhomeostasis tisular
Esos genes cuando son activados Esos genes cuando son activados conducen a una proliferaciconducen a una proliferacióón celular n celular
desregulada.desregulada.
Existen tres tipos de cambios que Existen tres tipos de cambios que ocurren cuando una célula comienza ocurren cuando una célula comienza la tumorogénesisla tumorogénesis
• Inmortalización:Inmortalización: crecimiento crecimiento indefinidoindefinido
• Transformación:Transformación: describe los fallos describe los fallos que se observan en el crecimiento que se observan en el crecimiento normalnormal
• Metástasis:Metástasis: capacidad de las células capacidad de las células tumorales de invadir otros tejidostumorales de invadir otros tejidos
Existen dos clases de genes en los Existen dos clases de genes en los cuales las mutaciones pueden cuales las mutaciones pueden inducir la transformacióninducir la transformación
• ONCOGENESONCOGENES
• GENES SUPRESORES DE GENES SUPRESORES DE TUMORTUMOR
ONCOGENESONCOGENES
• Inicialmente identificados como Inicialmente identificados como genes portados por virus que causan genes portados por virus que causan transformación en las células blancotransformación en las células blanco
• La mayoría de los oncogenes virales La mayoría de los oncogenes virales tiene su contrapartida celular tiene su contrapartida celular involucrada en funciones normales involucrada en funciones normales de la célula (protoncogenes)de la célula (protoncogenes)
Son genes dominantes, (protooncogenes) que en
el genoma normal, codifican proteínas, las
cuales funcionan como:
• factores de crecimiento,
• receptores de factores de crecimiento,
• señales de traducción de proteínas
• proteínas nucleares involucradas en regulación
transcripcional.
La generación de un oncogen representa una
ganancia de función en la cual un protooncogen
celular está inapropiadamente activado.
Esto puede involucrar:• un cambio mutacional en la proteína, • o activación constitutiva, • sobre-expresión • o falla en el apagado de la expresión en el tiempo
adecuado.
La activación de oncogenes, actuando en forma dominante, es un paso importante en la cascada de eventos que finalmente conducen al desarrollo de un cáncer invasivo
La transformación puede ocurrir: •espontáneamente
•o puede ser causada por la infección de ciertos virus tumorales.
VIRUS ONCOGENICOSVIRUS ONCOGENICOS
• la región temprana del virus utiliza splicing la región temprana del virus utiliza splicing alternativos para sintetizar proteínas (T-alternativos para sintetizar proteínas (T-antígenos) que son requeridos para la antígenos) que son requeridos para la expresión de la región tardía y para la expresión de la región tardía y para la replicación del ADN viral.replicación del ADN viral.
• Se integran al genoma de la célula huésped Se integran al genoma de la célula huésped produciendo transformaciónproduciendo transformación
• Los virus humanos equivalentes al SV40 y Los virus humanos equivalentes al SV40 y al polioma son los virus BK y JC. El BK puede al polioma son los virus BK y JC. El BK puede transformar ctransformar céélulas en cultivo pero no se ha lulas en cultivo pero no se ha asociado a ningasociado a ningúún cn cááncer humano en ncer humano en concreto.concreto.
Poliomas (ADN)Poliomas (ADN)
• Provoca tumores epiteliales Provoca tumores epiteliales generalmente benignos pero también generalmente benignos pero también se asocian a cánceres cervicales (E6, se asocian a cánceres cervicales (E6, E7)E7)
• Las proteínas producidas inmortalizan Las proteínas producidas inmortalizan las células blancolas células blanco
Papiloma (ADN) HPV,
• Comprende un gran grupo de virus Comprende un gran grupo de virus relacionadosrelacionados
• En humanos generalmente se asocia En humanos generalmente se asocia a enfermedades respiratoriasa enfermedades respiratorias
• Las células transformadas ganan una Las células transformadas ganan una parte de la región temprana del virus parte de la región temprana del virus que contienen los gene E1A y E1B que contienen los gene E1A y E1B que codifican para proteque codifican para proteíínas nas nucleares.nucleares.
• Ej: Epstein bar virus: carcinomas Ej: Epstein bar virus: carcinomas nasofaringeo nasofaringeo
Adenovirus (ADN)
Retrovirus (ARN)Retrovirus (ARN)
La transformación mediante
retrovirus es más complejo que la de
los virus a ADN
Su ciclo de vida básico no incluye
proteínas con actividad
transformante.
ELEMENTOS GENETICOS DEL PROVIRUS Y DE LOS PRODUCTOS GENICOS DEL VIRUS
ESQUEMA DEL CICLO DE VIDA DE UN RETROVIRUS
Ciclo de vidaCiclo de vida• 2 moléculas de ARN unidas por 2 moléculas de ARN unidas por
enlaces no covalentesenlaces no covalentes• Cada molécula tiene un ARNt unidoCada molécula tiene un ARNt unido• Cada virión contiene alrededor de Cada virión contiene alrededor de
50 moléculas de transcriptasa 50 moléculas de transcriptasa inversainversa
• En el citoplasma la transcripción En el citoplasma la transcripción inversa utiliza el ARNt como cebador inversa utiliza el ARNt como cebador para iniciar la síntesis de ADN para iniciar la síntesis de ADN
MECANISMO DE TRANSCRIPCION INVERSA
• Después de la transformación, Después de la transformación, el transcripto inverso migra el transcripto inverso migra hacia el núcleo donde se hacia el núcleo donde se circulariza y se integra al circulariza y se integra al genoma del huéspedgenoma del huésped
INTEGRACIÓN DE UNA MOLÉCULA DE ADN CIRCULAR DEL RETROVIRUS
• El ADN integrado (provírico) se El ADN integrado (provírico) se convierte en el molde para la convierte en el molde para la síntesis de ARNsíntesis de ARN
• Las secuencias de promotor e Las secuencias de promotor e intensificador y las señales de intensificador y las señales de poliadenilación están en el LTRpoliadenilación están en el LTR
• Ambas LTR poseen secuencias Ambas LTR poseen secuencias idénticas pero la 5’ promueve idénticas pero la 5’ promueve la transcripción y la la transcripción y la 3’especifica el sitio del poli(A)3’especifica el sitio del poli(A)
• 11a a evidencia de virus transductores: evidencia de virus transductores: virus de sarcoma de Rous contiene virus de sarcoma de Rous contiene
secuencias de nucleótidos que no se secuencias de nucleótidos que no se encuentran en retrovirus muy encuentran en retrovirus muy relacionados pero no transformantes relacionados pero no transformantes (secuencia (secuencia srcsrc))
• Esta secuencia fue encontrada luego en Esta secuencia fue encontrada luego en los vertebrados en el ADN normallos vertebrados en el ADN normal
• Un gen que es capaz de producir Un gen que es capaz de producir transformación celular puede surgir transformación celular puede surgir de un gen celularde un gen celular
• Por lo tanto la inducción del cáncer Por lo tanto la inducción del cáncer puede implicar la acción de genes puede implicar la acción de genes normales normales
• Los oncogenes se denominan con Los oncogenes se denominan con
letras cursivas letras cursivas scrscr
• El gen en un retrovirus se indica El gen en un retrovirus se indica
con el prefijo v (v-scon el prefijo v (v-scrcr) )
• El equivalente en el gen celular El equivalente en el gen celular
normal o proto-oncogen se indica normal o proto-oncogen se indica
con el prefijo c (c-con el prefijo c (c-scrscr))
• Los retrovirus transductores surgen como Los retrovirus transductores surgen como resultado de reordenamientos complejos resultado de reordenamientos complejos después de la integración del retrovirus después de la integración del retrovirus cerca de un protoncogen celularcerca de un protoncogen celular
• La actividad transformante es La actividad transformante es proporcionada por la información genética proporcionada por la información genética celular adquirida, los elementos genéticos celular adquirida, los elementos genéticos que permiten que los oncogenes se que permiten que los oncogenes se expresen y se transfieran de cél en cél se expresen y se transfieran de cél en cél se hereda del retrovirus madrehereda del retrovirus madre
¿Cómo un protooncogen se ¿Cómo un protooncogen se convierte en oncogen?convierte en oncogen?
• Cuando un gen celular normal se Cuando un gen celular normal se convierte en un oncogen de un convierte en un oncogen de un retrovirus se altera significativamenteretrovirus se altera significativamente
• Existen 3 tipos de alteraciones las Existen 3 tipos de alteraciones las que pueden afectar a la región de que pueden afectar a la región de codificación del gen o la expresión del codificación del gen o la expresión del mismomismo
• 1) un oncogen de un retrovirus es 1) un oncogen de un retrovirus es transcripto en cantidades más elevadas transcripto en cantidades más elevadas y en una gama diferente de células que y en una gama diferente de células que su protooncogen normalsu protooncogen normal
• 2) pérdida de parte de los genes 2) pérdida de parte de los genes celulares; la eliminación de segmentos celulares; la eliminación de segmentos podría desrregluar la actividad de una podría desrregluar la actividad de una proteína que, expresada a altos niveles proteína que, expresada a altos niveles transformaría célulastransformaría células
• 3) mutaciones puntuales deferencian 3) mutaciones puntuales deferencian protooncogenes celulares de oncogenes protooncogenes celulares de oncogenes
CONSECUENCIAS DE LAS CONSECUENCIAS DE LAS ALTERACIONESALTERACIONES
• A) Cambio cuantitativo a nivel de A) Cambio cuantitativo a nivel de la proteína codificadala proteína codificada
• B) Cambio cualitativo de la B) Cambio cualitativo de la proteína en si mismaproteína en si misma
RETROVIRUS HUMANOSRETROVIRUS HUMANOS
• VIRUS DE INMUNODEFICIENCIA VIRUS DE INMUNODEFICIENCIA ADQUIRIDA (VIH): destruyen los ADQUIRIDA (VIH): destruyen los linfocitos Tlinfocitos T
• HEPATITIS C HEPATITIS C
• VIRUS DE LA LEUCEMIA DE LAS VIRUS DE LA LEUCEMIA DE LAS CELULAS T HUMANAS (HTLV):su CELULAS T HUMANAS (HTLV):su infección se asocia a un tumor infección se asocia a un tumor linfocítico-T linfocítico-T
Los eventos tumorogénicos pueden Los eventos tumorogénicos pueden ser también causados por:ser también causados por:
• MutacionesMutaciones• TranslocacionesTranslocaciones• AmplificaciónAmplificación
Todas involucran un proto-oncogenTodas involucran un proto-oncogen
MUTACIONESMUTACIONES: : ej.ej. c-ras c-ras
• Variantes oncogénicas de Variantes oncogénicas de c-ras c-ras son son encontradas en varios tumores encontradas en varios tumores primarios.primarios.
• Los protoncogenes c-ras se Los protoncogenes c-ras se transforman en oncogénicos por una transforman en oncogénicos por una única mutación,única mutación,
• las mutaciones observadas en varios las mutaciones observadas en varios tumores humanos es causado por tumores humanos es causado por una sustitución de un aa, (posición 12 una sustitución de un aa, (posición 12 o 61) en una de las proteínas Raso 61) en una de las proteínas Ras
• Si se sustituye “in vitro” la glicina de la Si se sustituye “in vitro” la glicina de la posición 12 por otro aa excepto posición 12 por otro aa excepto prolina, el gen prolina, el gen c-rasc-ras mutado mutado transforma las células cultivadas (los transforma las células cultivadas (los diferentes aa cambian la capacidad diferentes aa cambian la capacidad transformante)transformante)
• En la posición 61 (ocupada por En la posición 61 (ocupada por glutamina) crea un gen con actividad glutamina) crea un gen con actividad transformante (ác. glutámico y prolina transformante (ác. glutámico y prolina no afectan)no afectan)
EXPERIMENTOS “IN VITRO”
• La proteína Ras es una unión La proteína Ras es una unión monomérica del nucleótido guanina monomérica del nucleótido guanina que se activa cuando se une a GTP y que se activa cuando se une a GTP y es inactiva cuando se une al GDP.es inactiva cuando se une al GDP.
COMO FUNCIONA?
RAS GTP FORMA ACTIVA
RAS GDP FORMA INACTIVA
• Proteína GAP estimula la capacidad de Proteína GAP estimula la capacidad de
Ras para hidrolizar GTP, convirtiendo a Ras para hidrolizar GTP, convirtiendo a
Ras de activa a inactiva. Ras de activa a inactiva.
RAS GTP
GAP
HIDROLISA
RAS GDP SE INACTIVA RAS
• Proteínas GNRF estimulan el Proteínas GNRF estimulan el
reemplazo de GDP por GTP, reemplazo de GDP por GTP,
reactivando a la proteína reactivando a la proteína
RAS GDP
GNRF
RAS GTP SE ACTIVA RAS
• Una activación constitutiva de Ras Una activación constitutiva de Ras puede ser causada por una puede ser causada por una mutación lo que hace que Ras sea mutación lo que hace que Ras sea refractario a la interacción con refractario a la interacción con GAP. GAP.
• La incapacidad de hidrolizar GTP La incapacidad de hidrolizar GTP causa que Ras permanezca en una causa que Ras permanezca en una forma activada permanentemente forma activada permanentemente
TRANSLOCACIONESTRANSLOCACIONES
• La ubicación en un nuevo cromosoma La ubicación en un nuevo cromosoma puede activar un oncogenpuede activar un oncogen
• Se descubrió mediante la conección Se descubrió mediante la conección entre los loci que codifican Ig y la entre los loci que codifican Ig y la ocurrencia de ciertos tumores (desde ocurrencia de ciertos tumores (desde linfocitos B no diferenciados).linfocitos B no diferenciados).
• En el hombre, la translocación en los En el hombre, la translocación en los tumores de células B involucra al tumores de células B involucra al crom. 8 (portador de crom. 8 (portador de c-mycc-myc) y el cr. ) y el cr. 14 (portador del locus IgH) (10%) o 14 (portador del locus IgH) (10%) o crom. 2 (locus kappa) o crom 22 crom. 2 (locus kappa) o crom 22 (locus lambda).(locus lambda).
• En los tumores a células T involucra En los tumores a células T involucra al 8 y al 14 (locus TcR al 8 y al 14 (locus TcR ))
• Cuando el Cuando el c-mycc-myc está translocado con el está translocado con el locus Ig, el nivel de expresión está locus Ig, el nivel de expresión está aumentadoaumentado
• Por qué se activa?Por qué se activa?
A) se altere la estructura de A) se altere la estructura de c-mycc-myc
B) en la nueva posición hay B) en la nueva posición hay genes muy activosgenes muy activos
• La sobreexpresión de La sobreexpresión de c-mycc-myc apagaría el apagaría el proceso de diferenciación de los linfocitosproceso de diferenciación de los linfocitos
• En algunos casos la translocación En algunos casos la translocación genera un gen híbrido en el cual la genera un gen híbrido en el cual la unidad de transcripción activa unidad de transcripción activa cambia: los exones de un gen se cambia: los exones de un gen se conectan con los de otro gen.conectan con los de otro gen.
• Ejemplo: cromosoma filadelfia Ejemplo: cromosoma filadelfia (Ph1) presente en pacientes con (Ph1) presente en pacientes con leucemia mieloide crónica (LMC)leucemia mieloide crónica (LMC)
AMPLIFICACIONESAMPLIFICACIONES• Secuencias endógenas pueden ser Secuencias endógenas pueden ser
producidas por amplificación de una producidas por amplificación de una secuencia existente. (Generalmente son secuencia existente. (Generalmente son rearreglos en tandem)rearreglos en tandem)
• Un gen contenido dentro de los repetidos en Un gen contenido dentro de los repetidos en tandem no necesariamente es expresado por tandem no necesariamente es expresado por todas las copias pero su expresión tiende a todas las copias pero su expresión tiende a aumentar con el número de copias.aumentar con el número de copias.
• Son provocados por resistencia a ciertos Son provocados por resistencia a ciertos agentesagentes
• Ej: Ej: c-myc, c-abl, c-myb, c-erbB, c-k-ras, c-myc, c-abl, c-myb, c-erbB, c-k-ras, mdm2mdm2
• Estos tandem pueden existir en en Estos tandem pueden existir en en
dos formas dentro de la célula.dos formas dentro de la célula.
• UNIDAD EXTRACROMOSOMICAUNIDAD EXTRACROMOSOMICA
se hereda en forma irregularse hereda en forma irregular
• UNIDAD INTEGRADA AL GENOMAUNIDAD INTEGRADA AL GENOMA
• En las líneas estables las En las líneas estables las
amplificaciones pueden ser vistas a amplificaciones pueden ser vistas a
nivel cromosómico en forma de regiones nivel cromosómico en forma de regiones
de tinción homogénea (HSR= de tinción homogénea (HSR=
homogeneously staining region)homogeneously staining region)
En líneas inestables los elementos En líneas inestables los elementos
adicionales también pueden ser adicionales también pueden ser
observados y se comprueba mediante observados y se comprueba mediante
tinción con Hoechsttinción con Hoechst
Doble diminutos
GENES SUPRESORESGENES SUPRESORES
• La pérdida o inactivación de ciertos genes pueden
también ser importantes pasos en el camino que
conduce a cánceres invasivos.
• Su función normal es suprimir la proliferación celular,
funcionan como barreras fisiológicas en contra de la
expansión clonal.
• Son "genes recesivos" : deben ocurrir mutaciones o
deleciones en ambos alelos antes de que la
transformación celular ocurra.
La pérdida de la función de los genes supresores puede ocurrir por el daño provocado al genoma a través de
RETINOBLASTOMARETINOBLASTOMA
• Es un enfermedad infantil que Es un enfermedad infantil que involucra un tumor de retinainvolucra un tumor de retina
• Puede ocurrir con una forma Puede ocurrir con una forma heredable o en forma esporádicaheredable o en forma esporádica
• Está asociado con delecciones en Está asociado con delecciones en la banda q14 del cromosoma 13 la banda q14 del cromosoma 13 (13q14)(13q14)
La pérdida de RB está involucrada en La pérdida de RB está involucrada en otras formas de cáncer otras formas de cáncer
• Ej: osteosarcomas y cáncer pulmonar a Ej: osteosarcomas y cáncer pulmonar a
células pequeñascélulas pequeñas
• RB es una fosfoproteína nuclear que tiene RB es una fosfoproteína nuclear que tiene
influencia en el ciclo celularinfluencia en el ciclo celular
• Durante G0/G1 del ciclo celular RB no está Durante G0/G1 del ciclo celular RB no está
fosforilado.fosforilado.
• Durante el ciclo RB es fosforilado por el Durante el ciclo RB es fosforilado por el
complejo cdk/ciclina (final de G1)complejo cdk/ciclina (final de G1)• Se desfosforila durante la mitosisSe desfosforila durante la mitosis
• La forma no-fosforilada de RB La forma no-fosforilada de RB
específicamente se une a varias proteínas específicamente se une a varias proteínas
(ocurre sólo durante parte del ciclo: fase S)(ocurre sólo durante parte del ciclo: fase S)
• La fosforilación suelta las proteínas las La fosforilación suelta las proteínas las
cuales están accesibles nuevamentecuales están accesibles nuevamente
• Estas proteínas incluyen el grupo E2F de los Estas proteínas incluyen el grupo E2F de los
factores de transcripción, los cuales activan factores de transcripción, los cuales activan
genes blanco cuyos productos son esenciales genes blanco cuyos productos son esenciales
para la fase Spara la fase S
• Su unión con RB inhibe la capacidad de Su unión con RB inhibe la capacidad de E2F de activar la transcripción:E2F de activar la transcripción:
• RB indirectamente evita la entrada en RB indirectamente evita la entrada en fase Sfase S
• El complejo RB-E2Fdirectamente El complejo RB-E2Fdirectamente reprime algunos genes blanco, su reprime algunos genes blanco, su discociación permite que ello se discociación permite que ello se expresen. expresen.
• Ciertos antigenos tumorales virales se Ciertos antigenos tumorales virales se unen especificamente a la forma no unen especificamente a la forma no fosforilada de RBfosforilada de RB
Antioncogen p53Antioncogen p53
• MMúúltiples cltiples cáánceres humanos muestran nceres humanos muestran
ausencia de la proteausencia de la proteíína p53 o na p53 o
mutaciones en el genmutaciones en el gen
• Mapea en el Mapea en el brazo corto del cromosoma brazo corto del cromosoma
17 (17p13). 17 (17p13).
• La proteLa proteíína p53 codificada por este gen na p53 codificada por este gen
es unaes una fosfoprote fosfoproteíína nuclear de 53 kd na nuclear de 53 kd
el control del ciclo celular, el control del ciclo celular,
la reparación y síntesis del ADN, la reparación y síntesis del ADN,
la diferenciación celular la diferenciación celular
la muerte celular programada la muerte celular programada
HHa sido relacionada cona sido relacionada con::
• la proteína p53 normal regula la la proteína p53 normal regula la
transcripción a través de uniones transcripción a través de uniones
secuencia-específicas con el ADN secuencia-específicas con el ADN
mientras que mutaciones en el gen mientras que mutaciones en el gen
anulan esta actividad de activación en anulan esta actividad de activación en
trans resultando una proliferación trans resultando una proliferación
celular no controladacelular no controlada
• la protela proteíína p53 inducirna p53 induciríía la transcripcia la transcripcióón de n de
diferentes genes que presenten una diferentes genes que presenten una
secuencia de ADN especsecuencia de ADN especíífica en la regifica en la regióón n
reguladora corriente arriba ("upstream"). reguladora corriente arriba ("upstream").
Ejemplos:Ejemplos:
OncOnc.. mdm-2mdm-2 (murine double minute), (murine double minute),
gen creatin-kinasa del músculo y el gen creatin-kinasa del músculo y el
GADD45 (growth arrest DNA damage GADD45 (growth arrest DNA damage
inducible) inducible)
gen gen bcl-2bcl-2
El efecto de la proteína p53 sobre la El efecto de la proteína p53 sobre la transcripción de un gen puede estar transcripción de un gen puede estar influenciado por influenciado por ::
• modificaciones en el gen en si mismo, modificaciones en el gen en si mismo,
• mmodificaciones post-transcripcionalesodificaciones post-transcripcionales
((como fosforilacióncomo fosforilación))
• interacciones con otras proteínas tanto interacciones con otras proteínas tanto
celulares como virales celulares como virales
• Normalmente, cuando existe un daño en el Normalmente, cuando existe un daño en el
ADN se activa el p53ADN se activa el p53
• Dependiendo del estadio en que se Dependiendo del estadio en que se
produzca el daño existen 2 caminosproduzca el daño existen 2 caminos
• 1) temprano: activa la maquinaria que 1) temprano: activa la maquinaria que
previene la futura propagación del daño previene la futura propagación del daño
hasta que éste es reparadohasta que éste es reparado
• 2) tarde: p53 dispara los mecanismos de 2) tarde: p53 dispara los mecanismos de
apoptosisapoptosis
irradiación
Interacción de genes Interacción de genes supresores de tumor en el supresores de tumor en el ciclo celularciclo celular
Ciclina A,B
Cdc2 G0Cd4,6
Ciclina D
p16
p53
p27
p21cdk2
ciclinaE
CITOGENETICACITOGENETICA
origen clonalorigen clonal
• por lo menos dos células por lo menos dos células contienen la misma aberración contienen la misma aberración cromosómica cromosómica
• se utiliza para la se utiliza para la nomenclatura el cariotipo nomenclatura el cariotipo compuesto "composite compuesto "composite karyotype" (ISCN). karyotype" (ISCN).
Ejemplo:Ejemplo:
58-68,XX(p+)Y,-1x3,i(1p),58-68,XX(p+)Y,-1x3,i(1p),
i(1q),+2,-3,del(3)(q21),-4,+5,i(1q),+2,-3,del(3)(q21),-4,+5,
del(5)(q31),-8,-9,del(9)(q22),del(5)(q31),-8,-9,del(9)(q22),
-11,del(11)(q14),-12,-13,-11,del(11)(q14),-12,-13,
-14x2,-15,-17x2,-14x2,-15,-17x2,
ins(17;3)(p13;q21q29),ins(17;3)(p13;q21q29),
i(17q)x2,-19,i(17q)x2,-19,
-21,-22x2,m-21,-22x2,m22 [cp12]. [cp12].