metodo de separacion de proteinas

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Método de identificación y separación de las proteínas: SESIÓN IV:

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Método de identificación y

separación de las proteínas:

SESIÓN IV:

Page 2: metodo de separacion de proteinas

Describe y explica los diversos métodos

de separación de las proteínas,

experimenta a través del método de la

electroforesis el cálculo de los pesos

moleculares de las proteínas y valora su

importancia en la búsqueda del

conocimiento de la ciencia.

COMPETENCIA

Page 3: metodo de separacion de proteinas

Desde el siglo pasado las separaciones analíticas se

llevaban a cabo por métodos clásicos como son la

precipitación, destilación y extracción. Los esfuerzos

por conocer más sobre la composición y función de las

proteínas han obligado a buscar nuevas técnicas.

Unas tienen que ver con las propiedades físicas y

estructurales de las moléculas que se pretende

separar, otras se derivan de los objetivos del análisis

(sensibilidad, resolución, tiempo de análisis,

necesidad de una detección específica).

Page 4: metodo de separacion de proteinas

El método de selección incluye los pasos necesarios para

la obtención, preparación y posible fraccionamiento de la

muestra. Las técnicas analíticas pueden englobarse en

dos grandes grupos: Técnicas espectroscópicas y las

Técnicas de separación. La primera, proporcionan, para

cada compuesto analizado, una información compleja,

relacionada con sus características estructurales

específicas. La segunda se utilizan para resolver los

componentes de una mezcla y la señal obtenida puede

utilizarse con fines analíticos cuantitativos o cualitativos.

Page 5: metodo de separacion de proteinas

Actualmente las separaciones analíticas se realizan

fundamentalmente por cromatografía y electroforesis.

La cromatografía comprende un conjunto importante y

diversos de métodos que permite a los científicos

separar componentes estrechamente relacionados en

mezclas complejas, lo que en muchas ocasiones

resulta imposible por otros medios. Se pueden separar

moléculas en función de sus cargas, tamaños y masas

moleculares. También a través de la polaridad de sus

enlaces, sus potenciales redox, etc.

Page 6: metodo de separacion de proteinas

La cromatografía no solo permite la separación de los

componentes de una mezcla, sino también su

identificación y cuantificación. El análisis cualitativo

está basado en la medida de parámetros

cromatográficos (tiempos y volúmenes de retención)

mientras que el análisis cuantitativo está basado en la

medida de alturas o áreas de picos cromatográficos

que se relacionan con la concentración. La columna

cromatográfica y la forma con la que se diseña,

constituye el corazón de la separación.

Page 7: metodo de separacion de proteinas

La electroforesis capilar es una técnica

alternativa de la electroforesis convencional y

surge debido a que la velocidad de separación y

resolución de los compuestos mejora a medida

que aumenta el campo eléctrico aplicado.

El mecanismo de separación está basado en las

relaciones carga/masa de los analitos. Su

utilidad está en la separación de proteínas y

péptidos entre otras sustancias (ADN por

ejemplo)

Electroforesis Capilar

Page 8: metodo de separacion de proteinas

En resumen la cromatografía y la

electroforesis son ahora técnicas

ampliamente utilizadas en la

resolución de macromoléculas de

interés en la industria biotecnológica,

biológica y bioquímica.

Page 9: metodo de separacion de proteinas

Electroforesis

1. Se realiza sobre un soporte

sólido o semisólido, para

minimizar efectos de difusión

Muestra

+-2. Se somete el conjunto a un

campo eléctrico constante, a un

pH fijo; las proteínas migran

conforme a su carga eléctrica

3. Terminada la carrera

electroforética, las proteínas se

tiñen con un colorante adecuado

(p.e., Azul de Coomassie)

Page 10: metodo de separacion de proteinas

La palabra Cromatografía significa "escribir en colores",

ya que cuando fue desarrollada los componentes

separados eran colorantes. Las técnicas

cromatográficas se basan en la aplicación de la mezcla

en un punto (punto de inyección o aplicación) seguido

de la influencia de la fase móvil. Existen varios tipos de

cromatografía:

Cromatografía:

Cromatografía en columna

Cromatografía en capa fina.

Cromatografía en papel.

Cromatografía de líquidos de alta eficiencia.

Cromatografía de gases

Page 11: metodo de separacion de proteinas

La Cromatografía en columna.- Utiliza columnas de

vidrio rellenas de Alúmina (Al2O3), Sílica u Oxido de

magnesio. Este método de separación necesita hacer

pasar la mezcla, empleando un disolvente.

La Cromatografía en capa fina.- utiliza una placa de

vidrio recubierta con fase estacionaria (generalmente

del tipo de escrito para la cromatografía en columna

con variantes).

La Cromatografía en papel.- utiliza tiras de papel

cromatográfico los cuales se introducen en la cuba

cromatográfica.

Page 12: metodo de separacion de proteinas

La Cromatografía de líquidos de alta eficiencia (HPLC).-

es parecida a la Cromatografía en columna, sólo que se

aplica el flujo a presión (entre 1500 a 2200 psi), el tamaño

de partícula es entre 3 y 10 micras, la longitud de la

columna es entre 5 y 25 cm y requiere de equipo

sofisticado.

La Cromatografía de gases.- En este tipo de

Cromatografía la fase móvil es un gas llamado gas portador

o acarreador y la fase estacionaria puede ser un sólido o

una película de líquido de alto punto de ebullición

(generalmente Polietilén - Glicol o Silición).

Page 13: metodo de separacion de proteinas

Fundamento de la cromatografía

Muestra:

tres componentes

mezclados

Fase móvil

Fase

estacionaria

Se hace fluir una

fase móvil sobre la

estacionaria

Dependiendo de la

afinidad relativa por

ambas fases, los

componentes de la

mezcla primitiva

se separan

Se dispone una mezcla

sobre una fase

estacionaria

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Page 15: metodo de separacion de proteinas

1. Intercambio iónico

- Separa según carga eléctrica

- Fase estacionaria: grupos cargados unidos a un

soporte insoluble

- Fase móvil: gradiente de sal o de pH

Tipos de cromatografía

2. Partición

- Separa según solubilidad en solventes

- Fase estacionaria: Un solvente sobre un soporte

sólido

- Fase móvil: El otro solvente fluyendo

Page 16: metodo de separacion de proteinas

3. Afinidad

- Separa según la afinidad de la proteína

por un ligando inmovilizado

- Fase estacionaria: ligando unido a

soporte insoluble

- Fase móvil: (1) solución sin ligando (2)

solución con ligando libre.

Page 17: metodo de separacion de proteinas

4. Hidrofóbica

- Separa según hidrofobicidad

- Fase estacionaria: grupos hidrofóbicos

unidos a un soporte insoluble

- Fase móvil: gradiente inverso de sal

5. Exclusión molecular

- Separa según tamaño molecular

- Fase estacionaria: dextrano o agarosa

entrecruzados

- Fase móvil: solución tamponada

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Proteínas adsorbidas

al intercambiador

iónico

A baja concentración

de sal, se desprenden

las proteínas menos

electronegativas

A mayor concentración

de sal se desprenden

las proteínas más

electronegativas

Intercambio iónico

Page 19: metodo de separacion de proteinas

Peso molecular de las proteínas

4. Cálculo directo a partir de

estructura primaria

1. Métodos primitivos: presión osmótica,

ultra centrifugación analítica, etc.

2. Cromatografía de exclusión molecular

3. Electroforesis SDS-PAGE

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Cromatografía de exclusión molecular

Page 21: metodo de separacion de proteinas

ABSORCION a 280 nm

Se fundamenta en la absorción a 280 nm

producida por los aminoácidos

aromáticos Phe, Tyr y Trp

- Sensible y fácil de practicar

- Requiere soluciones puras de proteína;

no es aplicable a mezclas

- Distintas proteínas dan diferente grado

de absorción, dependiendo de su

contenido en aa. aromáticos

Page 22: metodo de separacion de proteinas

INTERÉS CLÍNICO PARA LA

DETECCIÓN ANTICUERPOS ANTI-VIH

El síndrome de inmunodeficiencia

adquirida (SIDA), es una enfermedad

infecciosa de origen viral,

caracterizada por una fuerte

depresión de la inmunidad.

Page 23: metodo de separacion de proteinas

Como se ha reconocido en la mayoría de los agentes

infecciosos, los humanos responden a la infección por

VIH produciendo una antigenemia y anticuerpos. Aun

cuando la dinámica de la respuesta puede diferir, la

mayoría de los individuos producirán una antigenia y

anticuerpos a los productos virales durante el curso

de la infección.

Se han aislado dos tipos de virus relacionados

al grupo de lentivirus, de linfocitos de

pacientes que sufrían SIDA.

Page 24: metodo de separacion de proteinas

El primero conocido como VIH-1 aislado en

Francia y más tarde en USA. El segundo VIH-

2, aislado de dos pacientes que vivían en África

comprobándose era el responsable de un nuevo

foco de SIDA en África Occidental.

Page 25: metodo de separacion de proteinas

PRINCIPIO DE LA PRUEBA

Es una prueba de enzima-inmunoensayo

indirecto para la detección de varios

anticuerpos VIH-1 y VIH-2 en suero o plasma

humano. Su principio está en una fase sólida

recubierta con antígenos purificados (proteína

recombinandte GP-160 y péptidos y

glicoproteínas de envoltura del VIH-1 y VIH-2),

y anticuerpos de cabra anti-IgG e IgM

humanos, purificados por cromatografía de

afinidad y conjugados con peroxidasa.

Page 26: metodo de separacion de proteinas

EL PROCEDIMIENTO DEL ENSAYO INCLUYE

LOS SIGUIENTES PASOS DE REACCIONES:

1.- Las muestras de suero y controles adeterminar se distribuyen en las celdillas de lamicroplaca. Si existen anticuerpos VIH-1 y VIH-2 se fijan al antígeno inmobilizado en la fasesólida.

2.- Luego del período de incubación, se lavanlas celdillas y se añaden anticuerpos anti-IgG eIgM humanos conjugados con la peroxidasa,formando un complejo en la fase sólida enfunción de la captura de fracción de IgG p IgM.

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3.- La presencia de la enzima inmovilizada enel complejo se desarrolla mediante la reacciónpor la adición del sustrato después de que lasfracciones libres del complejo hayan sidoeliminadas

4.- La reacción enzimática separa medianteadición del ácido sulfúrico 4N, y se realiza lalectura en un espectrofotómetro a 492/620 nm

Las absorbancias obtenidas en la lectura de

una muestra permite determinar la presencia

o ausencia de anticuerpos VIH-1 y VIH-2

Page 28: metodo de separacion de proteinas

El Ensayo Wester Blot es el inmunoblot más conocido,

también como ensayo Wester blot(WB), es la prueba

suplementaria más frecuentemente usada para el

diagnóstico de infección por VIH. Este ensayo se usa para

demostrar los anticuerpos de VIH en individuos

asintomáticos o sintomáticos, cuyos resultados del ELISA

(Enzime Linked Inmuno Sorbent Assay) son negativos en

repetidas oportunidades. Las proteínas que son

codificadas por genes estructurales del VIH son

separadas por electroforesis en un gel de poliacrilamida

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El peso molecular de estas proteínas difiere y por lo

tanto migra a diferentes sitios en el gel. Las proteínas de

peso molecular más bajo migra hacia la parte más baja

del gel. Las proteínas derivadas de VIH generalmente

incluyen p17, p24, p31, gp41, p55, p66, gp120 y gp160.

Las proteínas separadas por electroforesis son

transferidas a un papel de nitrocelulosa, el cual es

cortado en tiras para uso en el ensayo. Estas tiras de

proteínas virales se incluyen en kits de WB comercial.

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Representación esquemática de los resultados

de Wester blot (A) resultado positivo.(reactivo

con todos los antígenos (B) resultado negativo

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INFECCIÓN VIRAL POR EL

VIH EN EL LINFOCITO