INDICE ENZIMAS: Naturaleza Química- Propiedades Generales- Nomenclatura y Clasificacion- Coenzimas...
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INDICE• ENZIMAS: Naturaleza Química- Propiedades Generales-
Nomenclatura y Clasificacion- Coenzimas y Grupos Prostéticos.• Actividad Enzimática: Unidad de enzima- Actividad específica-
Actividad molecular.• Complejo ES- Ecuación de Michaelis Menten Significado e
importancia de Km Inhibición competitiva y no Competitiva.• Factores que afectan la actividad enzimatica: [Enzima]- pH – T-
[S]• Regulación Enzimática: Enzimas alostéricas (propiedades y
cinética)- Zimógenos- Modulación Covalente• Isoenzimas: Propiedades e importancia.
ENZIMAS
• Transformación de nutrientes simples en moléculas complejas y viceversa
• Extracción de energía desde combustibles por oxidación
• Polimerización de subunidades para formar macromoléculas, etc
CARACTERISTICAS DE LAS ENZIMAS
• PROTEINAS y RNA (Ribozimas): Estructura terciaria y cuaternaria
• SITIO DE UNION AL SUSTRATO: Uniones no Covalentes (puente de hidrógeno, hidrofóbicas, electrostáticas
• NECESITAN DE FACTORES ENZIMATICOS: Inorgánicos (metales) y orgánicos (Coenzimas)
• ESPECIFICIDAD DE SUSTRATO: Estereoespecificidad y especificidad geométrica
• SON REGULABLES: La síntesis de la proteína, su actividad y degradación.
DISTRIBUCION DE LAS ENZIMAS
• COMPARTIMENTALIZACION: Diferentes localización dentro de la célula.
• SISTEMAS MULTIENZIMATICOS: Enzimas relacionadas agrupadas formando verdaderos complejos
• ENZIMAS MULTIFUNCIONALES: Una enzima que presenta distintos sitios catalíticos
Tipos de reacciones catalizadas por enzimas
• Oxido-reducción• Rotura y formación de enlaces C-C• Reorganizaciones internas• Transferencia de grupos• Reacciones de condensación
Cómo se clasifican las enzimas???
1-OXIDORREDUCTASAS
2. TRANSFERASAS
Alcohol deshidrogenasa (EC 1.1.1.1)
Hexoquinasa
(EC 2.7.1.2)
Clase - subclase - subsubclase - nº de orden
Lactato 1 1 1 27 deshidrogenasa
4. LIASAS
5. ISOMERASAS
6. LIGASAS
Piruvato descarboxilasa
(EC 4.1.1.1)
Fumarasa ó malato isomerasa
(EC 5.2.1.1)
Piruvato carboxilasa
(EC 6.4.1.1)
3. HIDROLASAS
Carboxipeptidasa A
(EC 3.4.17.1)
Ejemplos de Enzimas que requieren iones metálicos como cofactores
Citocromo oxidasa
Catalasa
Peroxidasa
Fe++ ó Fe+++
Anhidrasa carbónica Zn++
Piruvato quinasa K+
Hexoquinasa
Glucosa-6-fosfatasa
Piruvato quinasaMg++
ACTIVIDAD ENZIMATICA
• Unidades Internacionales Cantidad de enzima que cataliza la transformación de 1 umol de S por minuto
• Actividad Específica Actividad enzimática por cada miligramo de proteína presente en la muestra
• Actividad Molecular Moléculas de S convertibles en P por unidad de tiempo y por molécula de enzima
¿Cómo funcionan las enzimas?
Sitio activo
Sitio activo
Estado de transición (ES)
Modelo llave-cerradura
Modelo inducido
D-Glucosa
Ejemplo: REACCION CATALIZADA POR LA HEXOQUINASA
Factores que afectan la actividad enzimática
• Concentración de Sustrato
• Concentración de Enzima
• pH
• Temperatura
EFECTO DE LA CONCENTRACION DE SUSTRATO SOBRE LA
VELOCIDAD INICIAL: Ecuación de Michaelis - Menten
Vo
[S]
Km se considera una medida de la afinidad de la enzima por el sustrato
Efecto de la concentración de enzima sobre la actividad
[E]
v
Concentración saturante de sustrato, pH y temp. constantes
Influencia del pH sobre la actividad enzimática
Actividad enzimática
pH
Ejemplos de enzimas con diferentes pH óptimo
Influencia de la Temperatura sobre la actividad enzimática
T(ºC)
Actividad enzimática
T. óptima a
ctiv
idad
por
de
la
tem
pera
tura
de temperatura
provoca
desnaturalización
ISOENZIMAS
Diferentes formas moleculares de una
misma enzima.
Catalizan la misma reacción, actuando sobre
el mismo sustrato para dar el mismo producto
Son sintetizadas por genes diferentes
Tienen diferente composición aminoacídica
por lo que pueden separarse por electroforesis.
Son utilizadas en clínica para determinar
el origen del tejido dañado
Se encuentran ubicadas en diferentes
compartimentos de la célula ó en diferentes
tejidos.
Dos isoenzimas presentan en general
diferentes valores de Km y Vmáx.
Ejemplo de isoenzima: Glucoquinasa y hexoquinasa
Hexoquinasa
Glucoquinasa
Actividadenzimática
Km. hexq Km. glucq [glucosa mmol/l
EJEMPLOS DE ISOENZIMAS
• Regulación de la hexoquinasa y glucoquinasa• La Hexoquinasa y la Glucoquinasa son izoenzimas, es
decir enzimas diferentes que catalizan reacciones de fosforilación, pero poseen diferentes pesos moleculares, diferenTes velocidades de reacción, diferentes Km.
a) Semejanzas: Ambas enzimas son quinasas, es decir fosforilan; mediante este proceso se aseguran que la glucosa no salga al espacio extracelular. Ambas son enzimas ubicadas en el citosol. Utilizan el catión Mg++ como cofactor. Ambas realizan reacciones endergónicas e irreversibles.
• b) Diferencias:
Glucoquinasa• Es específica para la D-Glucosa• Baja afinidad, por lo tanto alta Km=10 mM• Localizada en el hígado y páncreas
Hexoquinasa
Fosforila D-Glucosa, D-Manosa y D-Fructosa
Alta afinidad, por lo tanto baja Km=0,1 mM
Localizada en todos los tejidos
a) La regulación de la hexoquinasa depende de las concentraciones relativas de glucosa y glucosa 6 P, ya que al haber mayor cantidad de glucosa en sangre, la actividad de esta enzima se incrementa, por lo que la velocidad de la glucólisis aumenta proporcionalmente
Sin embargo al disminuir los niveles de glucosa y al aumentar los niveles de glucosa 6P, la actividad disminuye debido a la escasez de sustrato y al aumento de producto. Éste último es un modulador alostérico negativo de la hexoquinasa.
b) La regulación de la glucoquinasa está dada de manera indirecta por las concentraciones de glucosa y glucosa 6P. Al haber mayores concentraciones de glucosa 6P, su transformación en fructosa 6P se favorece. Este producto induce el transporte de glucoquinasa al núcleo, en donde se encuentra su proteína reguladora, la cual se encarga de inactivarla bajo estas condiciones.
Cuando los niveles de glucosa aumentan en la sangre, el GLUT 2 desencadena una cascada rápida en la cual la proteína se desacopla a la glucoquinasa de su proteína reguladora; por lo tanto, puede ser nuevamente llevada al citosol, donde realiza su actividad quinasa.
Energía de activación de una Reacción catalizada y una reacción no catalizada
INHIBICION ENZIMATICA
INHIBICION REVERSIBLE
INHIBICION IRREVERSIBLE
COMPETITIVA
NO COMPETITIVA
ACOMPETITIVA
POR ENLACE COVALENTE
(Análogos del estado de transición)
INHIBIDOR SUICIDA
DIFP Quimotripsina
Alopurinol Xantina oxidasa
Penicilina Transpeptidasa
INHIBICION REVERSIBLE
INHIBICION COMPETITIVA
S
I
EI
I
+
E + S ES E + P
E
E
E
La eficacia depende de las Km de ambos
Ejemplo de Inhibidor competitivo
COO-
(CH2)2
COO-
COO-
CH2
COO-
Succinato + FADH2 Fumarato + FAD+
Succinato deshidrogenasa
Succinato Malonato
v
[S]Km Km ap
Gráfica de M-M
E + S ES E + P
INHIBICION NO COMPETITIVA
+
I
EI
+
I
ESI+ S
II
E
SES
E S
I
I
ES
Km [S]
v
Gráfica de M-M
INHIBICION ACOMPETITIVA
E + S ES E + P
+
I
ESI
E
S
I
E ES
E
Tipo de El Inhibidor Efecto Efecto inhibición se une a s/Vmáx
s/Km
Competitiva E Ninguno Aumenta
No competitiva E y ES Disminuye Ninguno
Acompetitiva ES Disminuye Disminuye
Características de los diferentes tipos de inhibición reversible
INHIBICION ENZIMATICA
INHIBICION REVERSIBLE
INHIBICION IRREVERSIBLE
COMPETITIVA
NO COMPETITIVA
ACOMPETITIVA
POR ENLACE COVALENTE
INHIBIDOR SUICIDA
INHIBICION IRREVERSIBLE
- Acetilcolinesterasa
- QuimotripsinaEnzima inactivada
. Por unión covalente del inhibidor
Diisopropilfluorfosfato (DFP)
Inhibidor suicida
INHIBICION IRREVERSIBLE
Se une al sitio activo de la enzima y ésta cataliza la modificación
del inhibidor a otro compuesto que permanece unido a la enzima.
El ALOPURINOL es un inhibidor suicida que actúa sobre la enzima xantina oxidasa (degradación de purinas).
Se forma el oxopurinol el cual queda unido a la enzima.
REGULACION DE LAS REACCIONES CATALIZADAS POR ENZIMAS
REGULACION DE LA ACTIVIDAD DE LAS ENZIMAS
REGULACION DE LA SINTESIS
DE LAS ENZIMASENZIMAS INDUCIBLES
ENZIMAS ALOSTERICAS REGULACION COVALENTE
REGULACION POR PROTEINAS
REGULACION POR PROTEOLISIS
ENZIMAS ALOSTERICAS
Enzima 1 ENZIMA ALOSTERICA
MODULADORES POSITIVOS MODULADORES NEGATIVOS
Enzima Enzima Enzima Enzima
1 2 3 4
PROPIEDADES DE LAS ENZIMAS ALOSTERICAS
• Poseen un sitio de unión a un metabolito regulador (sitio alostérico)
• La unión del metabolito a la enzima es de carácter reversible y no covalente.
• En general poseen dos o mas sitios reguladores.
• La mayoría posee dos o mas cadenas polipeptídicas o subunidades.
EJEMPLOS DE ENZIMAS ALOSTERICAS
• Hexoquinasa, Fosfofructoquinasa y Piruvato Quinasa Vía glicolítica
• AcetilCoA carboxilasa Biosíntesis de lípidos
• Aspartato Transcarbamilasa Biosíntesis de nucleó tidos pirimidínicos• Glutamato Deshidrogenasa Degradación de aminoácidos• Citrato sintasa, isocitrato y a-cetoglutarato
deshidrogenasas Ciclo de Krebs
REGULACION POR MODIFICACION COVALENTE
Fosforilacion
ADP-Ribosilación
Enzima
Fosfoadenilacion
EnzimaEnzima Enzima
EnzimaEnzima
REGULACION POR PROTEOLISIS
• Por eliminación de una cadena peptídica, enzimas inactivas se convierten en enzimas activas y viceversa.
• Las enzimas digestivas: pepsinógeno y quimotripsinógeno se convierten en las enzimas activas pepsina y tripsina.
• Suele ocurrir una activación secuencial produciéndose una cascada de activaciones. Ej. Coagulación sanguínea.
ZIMOGENOS
REGULACION POR PROTEINAS
• Modifican la actividad de enzimas involucradas en el metabolismo celular. Por ej. Indirectamente activando o inhibiendo la actividad de la glutamina sintetasa.
• RNA polimerasa: Asn, Gln, Glu, Lys y Arg forman enlaces hidrógenos con las bases del DNA