Habilidades para la búsqueda de información biomédica

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Habilidades para la búsqueda Habilidades para la búsqueda de información biomédica de información biomédica Iñaki Gutiérrez Ibarluzea Servicio de Evaluación de Tecnologías Sanitarias (Osteba) Departamento de Sanidad - Gobierno Vasco

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Habilidades para la búsqueda de información biomédica. Iñaki Gutiérrez Ibarluzea Servicio de Evaluación de Tecnologías Sanitarias (Osteba) Departamento de Sanidad - Gobierno Vasco. Objetivos del taller. - PowerPoint PPT Presentation

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Page 1: Habilidades para la búsqueda de información biomédica

Habilidades para la búsqueda Habilidades para la búsqueda de información biomédicade información biomédica

Iñaki Gutiérrez IbarluzeaServicio de Evaluación de Tecnologías Sanitarias (Osteba)

Departamento de Sanidad - Gobierno Vasco

Page 2: Habilidades para la búsqueda de información biomédica

Objetivos del tallerObjetivos del taller

Dotar a los participantes de los Dotar a los participantes de los conocimientos teóricos y de las conocimientos teóricos y de las

habilidades prácticas necesarios para habilidades prácticas necesarios para elaborar estrategias de búsqueda de elaborar estrategias de búsqueda de información relevante, que resuelvan información relevante, que resuelvan

lagunas de conocimiento específicas en lagunas de conocimiento específicas en biomedicinabiomedicina

Page 3: Habilidades para la búsqueda de información biomédica

Objetivos del tallerObjetivos del taller Aprender a elaborar preguntas de búsqueda Aprender a elaborar preguntas de búsqueda

pertinentes.pertinentes. Conocer la estructura básica de la información Conocer la estructura básica de la información

recogida en las diferentes bases de datos.recogida en las diferentes bases de datos. Aprender a seleccionar y priorizar bases de datos Aprender a seleccionar y priorizar bases de datos

informáticas dependiendo de la pregunta de búsqueda.informáticas dependiendo de la pregunta de búsqueda. Diseñar y testar estrategias de búsqueda adaptadas a Diseñar y testar estrategias de búsqueda adaptadas a

las necesidades de información.las necesidades de información. Realizar un análisis de relevancia de las información Realizar un análisis de relevancia de las información

recuperada.recuperada. Apreciar las limitaciones de la exhaustividad y la Apreciar las limitaciones de la exhaustividad y la

importancia de la precisión en una búsqueda importancia de la precisión en una búsqueda bibliográfica en biomedicina.bibliográfica en biomedicina.

Page 4: Habilidades para la búsqueda de información biomédica

Material cursoMaterial curso

Manuales: Tripdatabase, Pubmed, Manuales: Tripdatabase, Pubmed, Cochrane, Enlaces, ETESA.Cochrane, Enlaces, ETESA.

Hojas de elaboración de preguntas y Hojas de elaboración de preguntas y traducción al lenguaje documental y traducción al lenguaje documental y hoja de enumeración de bases de hoja de enumeración de bases de datosdatos

Page 5: Habilidades para la búsqueda de información biomédica

Necesidad de informaciónNecesidad de informaciónNecesidad de informaciónNecesidad de información

Una información adecuada y de calidad es la base de las decisiones a todos los niveles:

- Investigación básica

- Planificación de estrategias

- Gestión de programas

- Desarrollo de actividades preventivas

Page 6: Habilidades para la búsqueda de información biomédica

Problemática en la Recuperación Problemática en la Recuperación de Información Actualizadade Información Actualizada

Problemática en la Recuperación Problemática en la Recuperación de Información Actualizadade Información Actualizada

Aumento de la documentación científica Aumento de la documentación científica (information overload)(information overload)

Nuevas fuentes de informaciónNuevas fuentes de información– Revistas con resúmenes estructurados y Revistas con resúmenes estructurados y

comentarios clínicoscomentarios clínicos

– Revisiones sistemáticas: Cochrane LibraryRevisiones sistemáticas: Cochrane Library

Acceso a Bases de Datos BibliográficasAcceso a Bases de Datos Bibliográficas

Page 7: Habilidades para la búsqueda de información biomédica

Otros problemas en la Otros problemas en la utilización de la información utilización de la información

científicacientífica

Otros problemas en la Otros problemas en la utilización de la información utilización de la información

científicacientífica• Manejo de la información• Sesgo de publicación• Barreras idiomáticas• Calidad de los estudios• Integración de los resultados• Actualización de los datos• Dispersa ampliamente/poco indizada• La búsqueda ideal es una perdida de tiempo salvo en investigación básica • No es posible saber que hemos encontrado todo

• Manejo de la información• Sesgo de publicación• Barreras idiomáticas• Calidad de los estudios• Integración de los resultados• Actualización de los datos• Dispersa ampliamente/poco indizada• La búsqueda ideal es una perdida de tiempo salvo en investigación básica • No es posible saber que hemos encontrado todo

Page 8: Habilidades para la búsqueda de información biomédica

Sólo en biomedicina: más de 16.000 Sólo en biomedicina: más de 16.000 revistasrevistas

Medline:Medline:16 millones de citas16 millones de citas4 millones desde 19934 millones desde 199340.000 citas nuevas por 40.000 citas nuevas por mesmes

> 4.600 revistas> 4.600 revistas

Gran volumen de Gran volumen de información disponibleinformación disponible

Gran volumen de Gran volumen de información disponibleinformación disponible

Page 9: Habilidades para la búsqueda de información biomédica

““If a man will begin with certainties, he If a man will begin with certainties, he shall end in doubts; but if he will be shall end in doubts; but if he will be content to begin with doubts, he shall content to begin with doubts, he shall end with certainties”end with certainties”

Francis Bacon in “The advancement of learning” (1605)Francis Bacon in “The advancement of learning” (1605)

Page 10: Habilidades para la búsqueda de información biomédica

¿Qué?

¿Cómo?

¿Dónde?

Búsqueda

¿Cuánto?

Page 11: Habilidades para la búsqueda de información biomédica

Búsqueda inicialBúsqueda inicial

Tengo un paciente hipertenso Tengo un paciente hipertenso ¿Lo trataría con fármacos para ¿Lo trataría con fármacos para prevenir un infarto cerebral?prevenir un infarto cerebral?

Page 12: Habilidades para la búsqueda de información biomédica

Pasos en el desarrollo Pasos en el desarrollo de una búsquedade una búsqueda

Page 13: Habilidades para la búsqueda de información biomédica

1-Formular una pregunta clínica o el tema a investigar

2-Identificar las bases de datos adecuadas

3-Definir la estrategia de búsqueda (adaptarnos a la base de datos)

Determinar los operadores booleanos

Usar el tesauro o vocabulario controlado adecuado

Dividir la pregunta en términos de búsqueda

4-Realizar la búsqueda

5-Analizar críticamente los resultados

6-Depurar la búsqueda si fuera necesario

7- Contestar a la pregunta

Page 14: Habilidades para la búsqueda de información biomédica

1-Formular una pregunta 1-Formular una pregunta clínica o el tema a investigarclínica o el tema a investigar

Page 15: Habilidades para la búsqueda de información biomédica

Es preferible acometer Es preferible acometer una evaluación una evaluación aproximada de una aproximada de una buena pregunta que buena pregunta que elaborar la respuesta elaborar la respuesta exacta a una mala exacta a una mala preguntapregunta (Feinstein) (Feinstein)

““Quien no sabe lo que busca, no Quien no sabe lo que busca, no puede interpretar lo que encuentra”.puede interpretar lo que encuentra”.

Page 16: Habilidades para la búsqueda de información biomédica

““La pregunta bien La pregunta bien formulada”:formulada”:

. Intervención o exposición. Intervención o exposición

. condición de interés. condición de interés

. población. población

. outcomes (resultados). outcomes (resultados)

Page 17: Habilidades para la búsqueda de información biomédica

EscenarioEscenario

DiagnósticoDiagnóstico PronósticoPronóstico EtiologíaEtiología Tratamiento o prevenciónTratamiento o prevención Impacto económicoImpacto económico

Page 18: Habilidades para la búsqueda de información biomédica

Formular el problemaFormular el problema

Problema Intervención Comparación Resultados Pacientes o población Patología o

condición

Intervención ó Éxposición

Intervención o exposición alternativa en el caso de existir

Resultados que se quiere considerar para valorar su impacto

¿Cómo describiría un grupo de pacientes similar al mío?

¿Qué intervención principal estoy considerando?

¿Cuál es la alternativa principal con la que puedo comparar la intervención o la exposición?

¿Qué puedo esperar obtener de esta intervención? ó ¿Qué efecto puede causar realmente esta exposición?

Page 19: Habilidades para la búsqueda de información biomédica

EjemploEjemploProblema Intervención Comparación Resultados

Pacientes o población Patología o condición

Intervención ó

Éxposición

Intervención alternativa en el caso de existir

Resultados que se quiere considerar para valorar su impacto

¿En los pacientes con cáncer de estómago localizado y actualmente clínicamente libres de la enfermedad..

….el tratamiento quimioterápico adyuvante…

… …resulta efectivo en términos de incremento de supervivencia y calidad de vida?

Page 20: Habilidades para la búsqueda de información biomédica

¿El tratamiento farmacológico ¿El tratamiento farmacológico de la HTA previene los de la HTA previene los

infartos cerebrales?infartos cerebrales?

Page 21: Habilidades para la búsqueda de información biomédica

En nuestra preguntaEn nuestra pregunta

Problema Intervención Comparación Resultados

Pacientes o población

Patología o condición

ó Éxposición

Intervención alternativa en el caso de existir

Resultados que se quiere considerar para valorar su impacto

¿En los pacientes hipertensos…

….el tratamiento farmacológico…

… …previene los infartos cerebrales?

Page 22: Habilidades para la búsqueda de información biomédica

Traducción al lenguaje Traducción al lenguaje propio de la base de datospropio de la base de datos

Que no al tesauro, ni a Que no al tesauro, ni a descriptoresdescriptores

Page 23: Habilidades para la búsqueda de información biomédica

Problema Intervención Comparación Resultados

¿En los pacientes con cáncer de estómago localizado y actualmente clínicamente libres de la enfermedad..

….el tratamiento quimioterápico adyuvante…

… …resulta efectivo en términos de incremento de sobrevivencia y calidad de vida?

Cáncer de estómago localizado Libres de enfermedad

Quimioterapia adyuvante

Supervivencia Pronóstico Calidad de vida

Gastric cancer, gastric tumour, gastric neoplasm, stomach cancer Free of disease, healed, resected

Adjuvant chemotherapy, anticancer therapy

Survival, prognosis, quality of life, treatment outcome

Page 24: Habilidades para la búsqueda de información biomédica

Problema Intervención Comparación Resultados

¿En los pacientes hipertensos…

….el tratamiento farmacológico …

… …previene los accidentes cerebrovasculares?

Page 25: Habilidades para la búsqueda de información biomédica

Problema Intervención Comparación Resultados

¿En los pacientes hipertensos…

….el tratamiento farmacológico …

… …previene los infartos cerebrales?

hipertensión tratamiento fármacos

prevención infartos cerebrales

Page 26: Habilidades para la búsqueda de información biomédica

Problema Intervención Comparación Resultados

¿En los pacientes hipertensos…

….el tratamiento farmacológico…

… …previene los infartos cerebrales?

hipertensión Fármacos, tratamiento

prevención infartos cerebrales

hypertension Drugs, treatment

prevention stroke

Page 27: Habilidades para la búsqueda de información biomédica

2-Identificar las bases de 2-Identificar las bases de datos adecuadasdatos adecuadas

Page 28: Habilidades para la búsqueda de información biomédica

¿Qué es una base de datos?¿Qué es una base de datos?

Colección organizada de registros de Colección organizada de registros de informacióninformación

¿Qué es una base de datos ¿Qué es una base de datos electrónica?electrónica?

Colección organizada de registros de Colección organizada de registros de información a la que se puede acceder de forma información a la que se puede acceder de forma electrónicaelectrónica

Page 29: Habilidades para la búsqueda de información biomédica

Bases de Datos BibliográficasBases de Datos Bibliográficas

Registros = Referencias = RecordsRegistros = Referencias = Records

Campos = FieldsCampos = Fields

Vocabulario controlado = TesauroVocabulario controlado = Tesauro

Page 30: Habilidades para la búsqueda de información biomédica

Registro / ReferenciaRegistro / ReferenciaNO : 1AU : Bohle B;Schwihla H;Hu HZ;Friedl-Hajek R;Sowka S;Ferreira FAD : Department of General and Experimental Pathology,University of Vienna, AustriaTI : Long-lived Th2 clones specific for seasonal and perennial allergens can be detected in blood and skin by their TCR-hypervariable regions.SB : A M XLA : ENGSO : J Immunol. 1998 Feb 15. 160 (4). P 2022-7MH : Allergens:*BL/*IM. Hay Fever:BL/*IM. Receptors,Antigen,T-Cell *AN/GE. Rhinitis,Allergic,Perennial:BL/*IM. Skin:CH/CY/*IM. Th2 Cells:*IM. Base Sequence. Check Tags:Adult. Human.AB : We investigated the longevity of allergen-specific Th cells derived from patients suffering from either allergic rhinitis or atopic derma titis.........PT : JOURNAL ARTICLEIS : 0022-1767

Page 31: Habilidades para la búsqueda de información biomédica

¿Cómo elegir una base de ¿Cómo elegir una base de datos?datos?

Disponibilidad real o económicaDisponibilidad real o económica Especificidad temática (Cancerlit, AIDsLit,..)Especificidad temática (Cancerlit, AIDsLit,..) Si son genéricas (EMBASE o Medline) Si son genéricas (EMBASE o Medline)

conviene buscar en las dosconviene buscar en las dos Muy importante que tengan lenguaje propio Muy importante que tengan lenguaje propio

de conceptos (tesauro)de conceptos (tesauro) Cuente con información a texto completoCuente con información a texto completo

Page 32: Habilidades para la búsqueda de información biomédica

Bases de Datos Bibliográficas Bases de Datos Bibliográficas BiomédicasBiomédicas

MEDLINEMEDLINE EMBASEEMBASE HealthSTARHealthSTAR Indice Médico EspañolIndice Médico Español Cochrane LibraryCochrane Library LilacsLilacs PascalPascal BiosisBiosis

Page 33: Habilidades para la búsqueda de información biomédica

MEDLINEMEDLINE

National Library of Medicine (NLM)National Library of Medicine (NLM) BiomedicinaBiomedicina 1950-1950- 4.600 revistas4.600 revistas Actualización semanalActualización semanal Tesauro : MeSHTesauro : MeSH Varias formas de acceso (Pubmed, Varias formas de acceso (Pubmed,

Grateful Med,…)Grateful Med,…) 16.000.000 de citas16.000.000 de citas

Page 34: Habilidades para la búsqueda de información biomédica

EMBASEEMBASE

ElsevierElsevier Biomedicina y FarmacologíaBiomedicina y Farmacología 1974-1974- 4.100 revistas4.100 revistas Actualización semanalActualización semanal Tesauro : EMTREETesauro : EMTREE 16.000.000 de citas16.000.000 de citas

Page 35: Habilidades para la búsqueda de información biomédica

Solapamiento entre MEDLINE y Solapamiento entre MEDLINE y EMBASEEMBASE

EMBASE MEDLINE

2.50040.4%

1.60025.8%

2.10033.8%

Page 36: Habilidades para la búsqueda de información biomédica

Indice Médico EspañolIndice Médico Español

CSICCSIC Artículos de revistas biomédicas Artículos de revistas biomédicas

españolasespañolas 1971-1971- 321 revistas321 revistas DescriptoresDescriptores 174.764 registros174.764 registros

Page 37: Habilidades para la búsqueda de información biomédica

Cochrane LibraryCochrane Library

Colaboración CochraneColaboración Cochrane 1992-1992- Revisiones sistemáticas de ECARevisiones sistemáticas de ECA Actualización trimestralActualización trimestral Descriptores y MeSHDescriptores y MeSH De libre acceso en el estado españolDe libre acceso en el estado español Actualmente colaboración iberoamericanaActualmente colaboración iberoamericana

www.cochrane.eswww.cochrane.es

Page 38: Habilidades para la búsqueda de información biomédica

Bases de datos Bases de datos electrónicaselectrónicas

aspectos positivos y negativosaspectos positivos y negativos

Fácil accesoFácil acceso Mejora ediciónMejora edición Inclusión de Inclusión de

abstractsabstracts

Sólo 6000 revistasSólo 6000 revistas Localización de Localización de

ECC dificultosaECC dificultosa Aprox, 60-70% de Aprox, 60-70% de

ECC identificadosECC identificados

+ -

* En España se pierde una tercera parte de ECC sólo usando Medline

Page 39: Habilidades para la búsqueda de información biomédica

Clasificación de los recursos electrónicos

Fuentes bibliográficasFuentes bibliográficas– Bases de datos libres - revistas: Bases de datos libres - revistas:

referencias & abstracts (raramente referencias & abstracts (raramente texto completo)texto completo)

– Bases de datos mediante subscripciónBases de datos mediante subscripción– Catálogos de bibliotecas - título y a Catálogos de bibliotecas - título y a

veces comentarios sobre el contenidoveces comentarios sobre el contenido

Page 40: Habilidades para la búsqueda de información biomédica

Fuentes electrónicasFuentes electrónicas

Fuentes de texto completoFuentes de texto completo– Webs de MBE y guías de práctica clínicaWebs de MBE y guías de práctica clínica– Publicaciones de ETSPublicaciones de ETS– Publicaciones gubernamentales/oficialesPublicaciones gubernamentales/oficiales– Asociaciones profesionales Asociaciones profesionales – Listas y subscripciones de correo electrónicoListas y subscripciones de correo electrónico– Búsquedas generales por internetBúsquedas generales por internet– Revistas que permiten acceso a texto Revistas que permiten acceso a texto

completocompleto– http://www.freemedicaljournals.comhttp://www.freemedicaljournals.com– http://www.freebooks4doctors.com/http://www.freebooks4doctors.com/

Page 41: Habilidades para la búsqueda de información biomédica

Bases de libre accesoBases de libre acceso

(Medline y otras) Pubmed(Medline y otras) Pubmed CancerlitCancerlit Cochrane Library plusCochrane Library plus Databases del CRD - (DARE, NHS Databases del CRD - (DARE, NHS

EED, HTA)EED, HTA) Lilacs (revistas iberoamericanas)Lilacs (revistas iberoamericanas)

Page 42: Habilidades para la búsqueda de información biomédica
Page 43: Habilidades para la búsqueda de información biomédica

Literatura grisLiteratura gris

La que se produce en niveles altos La que se produce en niveles altos de la administración, académicos, de de la administración, académicos, de negocios y en la industria.negocios y en la industria.

Formato electrónico o impreso.Formato electrónico o impreso. No controlada por las grandes No controlada por las grandes

empresas de publicación.empresas de publicación. No convencionales y muchas veces No convencionales y muchas veces

efímerasefímeras

Page 44: Habilidades para la búsqueda de información biomédica

Organismos gubernamentales Organismos gubernamentales u oficiales (literatura gris)u oficiales (literatura gris)

Programas y políticas de saludProgramas y políticas de salud Muchos documentos a texto Muchos documentos a texto

completocompleto Acceso a estadísticas y datos de Acceso a estadísticas y datos de

supervivenciasupervivencia Muchos nuevos accesos menores Muchos nuevos accesos menores

con datos de interéscon datos de interés

Page 45: Habilidades para la búsqueda de información biomédica

Algunos sitios oficiales o Algunos sitios oficiales o gubernamentales de interésgubernamentales de interés Health CanadaHealth Canada US Centers for Disease ControlUS Centers for Disease Control World Health OrganisationWorld Health Organisation UK Department of HealthUK Department of Health US National Cancer InstituteUS National Cancer Institute Australian Dept Health & Aged CareAustralian Dept Health & Aged Care Instituto de salud Carlos IIIInstituto de salud Carlos III

Page 46: Habilidades para la búsqueda de información biomédica

Algunas fuentes de Algunas fuentes de literatura grisliteratura gris

The New York Academy of MedicineThe New York Academy of Medicine

http://www.nyam.org/library/grey.shtmlhttp://www.nyam.org/library/grey.shtml

Page 47: Habilidades para la búsqueda de información biomédica

Internet en general Internet en general

Menor eficienciaMenor eficiencia Evaluar la autoridad (.ac .edu .org)Evaluar la autoridad (.ac .edu .org) Conviene leer las indicaciones Conviene leer las indicaciones

previamentepreviamente Sólo usar cuando se agotan otras Sólo usar cuando se agotan otras

busquedasbusquedas Gran ayuda en los buscadores localesGran ayuda en los buscadores locales De gran utilidad para la literatura grisDe gran utilidad para la literatura gris

Page 48: Habilidades para la búsqueda de información biomédica

BuscadoresBuscadores

Usar el formato Usar el formato

http://www.http://www.nombrenombre que aparece en la que aparece en la otra columna.comotra columna.com

GoogleGoogle AltavistaAltavista NorthernlightNorthernlight Yahoo (regional)Yahoo (regional) MetacrawlerMetacrawler DogpileDogpile

Page 49: Habilidades para la búsqueda de información biomédica

Nuevos buscadores en Nuevos buscadores en construcciónconstrucción

La biblioteca del NHS del Reino UnidoNeHL

National electronic Library for Health

http://www.nelh.nhs.uk

Page 50: Habilidades para la búsqueda de información biomédica

Bases de Datos de la National Bases de Datos de la National Library of Medicine indizadas con Library of Medicine indizadas con Medical Subject Headings (MeSH)Medical Subject Headings (MeSH)

AIDSLINE: Literatura sobre SIDA

AVLINE: Materiales audiovisuales para profesionales

de la salud

BIOETHICS: Literatura sobre ética biomédica

CANCERLIT: Literatura sobre cáncer

HealthSTAR: Planificación y gestión sanitaria

MEDLINE: Literatura biomédica

TOXLINE: Literatura sobre toxicología

Page 51: Habilidades para la búsqueda de información biomédica

Servidores de información Servidores de información ($)($)

OVIDOVID SilverPlatterSilverPlatter EMBASE.comEMBASE.com Trip de pagoTrip de pago

Page 52: Habilidades para la búsqueda de información biomédica

METABUSCADORESMETABUSCADORES

Facilitar al máximo y hacer más eficiente la Facilitar al máximo y hacer más eficiente la búsqueda de información. búsqueda de información.

Buscando en múltiples sitios y entregandoBuscando en múltiples sitios y entregandoun resumen de los artículos relevantesun resumen de los artículos relevantes acerca del tema que se solicitó.acerca del tema que se solicitó.

Diferencia entre ellos es la forma de buscar, Diferencia entre ellos es la forma de buscar, los lugares en que buscan y como los lugares en que buscan y como presentan la información.presentan la información.

Page 53: Habilidades para la búsqueda de información biomédica

Información y guías en castellano en:

http://escuela.med.puc.cl/Recursos/MBE2001/metabuscadores.html

METABUSCADORESMETABUSCADORES

Page 54: Habilidades para la búsqueda de información biomédica

3-Definir la estrategia de 3-Definir la estrategia de búsquedabúsqueda

Page 55: Habilidades para la búsqueda de información biomédica

Separar la pregunta en conceptos Separar la pregunta en conceptos que puedan ser buscados por que puedan ser buscados por separado y combinadosseparado y combinados

Definir la estrategia de Definir la estrategia de búsquedabúsqueda

Page 56: Habilidades para la búsqueda de información biomédica

Determinar los operadores Determinar los operadores booleanosbooleanos

Page 57: Habilidades para la búsqueda de información biomédica

Determinar los operadores Determinar los operadores booleanosbooleanos

AND, OR, NOTAND, OR, NOT Stomach neoplasmStomach neoplasm

– ANDAND

Chemotherapy, adjuvantChemotherapy, adjuvant– ANDAND

survivalsurvival

Operadores de adyacencia Operadores de adyacencia o proximidad (adj)o proximidad (adj)

Page 58: Habilidades para la búsqueda de información biomédica

Otros operadoresOtros operadores

El truncamiento (* o $)El truncamiento (* o $)

recombin*: recombinant, recombin*: recombinant, recombination,..recombination,..

Uso de parentesisUso de parentesis

(((adjuvant chemotherapy or (((adjuvant chemotherapy or antineoplasic agents) and stomach antineoplasic agents) and stomach cancer) or gastric cancer)cancer) or gastric cancer)http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi

Page 59: Habilidades para la búsqueda de información biomédica

En nuestra preguntaEn nuestra pregunta

HypertensionHypertension treatmenttreatment drugsdrugs PreventionPrevention strokestroke

Hypertension AND (treatment OR drugs) Hypertension AND (treatment OR drugs) AND prevention AND strokeAND prevention AND stroke

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi

Page 60: Habilidades para la búsqueda de información biomédica

Utilizar el tesauro Utilizar el tesauro apropiado o el vocabulario apropiado o el vocabulario

controladocontrolado

Page 61: Habilidades para la búsqueda de información biomédica

TesauroTesauro

Vocabulario controlado de términos que Vocabulario controlado de términos que

tienen entre ellos relaciones y que se tienen entre ellos relaciones y que se

aplican a un campo concreto del aplican a un campo concreto del

conocimiento.conocimiento.– DescriptoresDescriptores : términos que pueden : términos que pueden

utilizarse en la indización.utilizarse en la indización.

– No descriptoresNo descriptores: términos prohibidos que : términos prohibidos que

remiten siempre a un descriptor.remiten siempre a un descriptor.

Page 62: Habilidades para la búsqueda de información biomédica

Tesauro o Vocabulario Tesauro o Vocabulario controladocontrolado

En MEDLINE: MeSH y “limitadores”En MEDLINE: MeSH y “limitadores” En EMBASE: EMTREEEn EMBASE: EMTREE En otras bases de datos: En otras bases de datos:

DescriptoresDescriptores

Page 63: Habilidades para la búsqueda de información biomédica

Importancia del TesauroImportancia del Tesauro Diccionario especialDiccionario especial Se utiliza un término para cada Se utiliza un término para cada

conceptoconcepto– simplifica la búsquedasimplifica la búsqueda– elimina la utilización de sinónimos elimina la utilización de sinónimos

(teóricamente)(teóricamente)– recupera términos más específicos recupera términos más específicos

(calificadores)(calificadores)

DeCS DeCS http://decs.bvs.br/http://decs.bvs.br/ Hipertensión AND (tratamiento OR fármacos) Hipertensión AND (tratamiento OR fármacos)

AND prevención AND infartos cerebralesAND prevención AND infartos cerebrales

Page 64: Habilidades para la búsqueda de información biomédica

Problema Intervención Comparación Resultados

¿En los pacientes hipertensos…

….el tratamiento con fármacos …

… …previene los accidentes cerebrovasculares?

hipertensión fármacos antihipertensivos

prevención accidentes cerebrovasculares

hypertension antihypertensive agents

cerebrovascular accident

Page 65: Habilidades para la búsqueda de información biomédica

4-Realizar la búsqueda4-Realizar la búsqueda

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi

Hypertension AND antihypertensive agents AND cerebrovascular accident

Page 66: Habilidades para la búsqueda de información biomédica

ConsideracionesConsideraciones

MeSHMeSH MeSH TreeMeSH Tree Major Headings Major Headings DetailsDetails SubheadingSubheading ExplodeExplode

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi

Page 67: Habilidades para la búsqueda de información biomédica

5-Analizar críticamente los 5-Analizar críticamente los resultadosresultados

Page 68: Habilidades para la búsqueda de información biomédica

Analizar relevancia de los documentos Analizar relevancia de los documentos recuperadosrecuperados

Relación documentos recuperados que responden Relación documentos recuperados que responden a nuestra pregunta frente a documentos a nuestra pregunta frente a documentos recuperados totales (especificidad)recuperados totales (especificidad)

Los artículos no responden a mi preguntaLos artículos no responden a mi pregunta

Pocos artículos recuperados (o ninguno) Muchos artículos recuperados

Valorar críticamente los Valorar críticamente los resultadosresultados

Page 69: Habilidades para la búsqueda de información biomédica

6-Depurar la búsqueda si fuera 6-Depurar la búsqueda si fuera necesarionecesario

Page 70: Habilidades para la búsqueda de información biomédica

Los resultados no sirven Los resultados no sirven para contestar la pregunta para contestar la pregunta

formulada formulada

No se han escogido bien los términos del tesauro La combinación de los términos no es correcta

Page 71: Habilidades para la búsqueda de información biomédica

SinónimosSinónimos

Considerar el uso de sinónimos, o Considerar el uso de sinónimos, o términos de texto libretérminos de texto libre

Considerar sufijos, prefijos, “comodines” Considerar sufijos, prefijos, “comodines” (truncamientos)(truncamientos)

Page 72: Habilidades para la búsqueda de información biomédica

Importancia del uso de Importancia del uso de sinónimos o texto libresinónimos o texto libre

Recuperar palabras no indizadas Recuperar palabras no indizadas que aparecen en títulos o resúmenesque aparecen en títulos o resúmenes

Combinarlas con lenguaje controlado Combinarlas con lenguaje controlado para validar nuestra búsquedapara validar nuestra búsqueda

Page 73: Habilidades para la búsqueda de información biomédica

Pocos artículos Pocos artículos recuperados recuperados (o ninguno) (o ninguno)

Revisar que los términos empleados estén bien escritos.

Intentar identificar otros términos, sinónimos de los utilizados, que sirvan para combinarse entre ellos mediante el operador OR

Buscar un término de tesauro más genérico que el utilizado

No utilizar calificadores

Aumentar la sensibilidad de la búsqueda

Page 74: Habilidades para la búsqueda de información biomédica

““Muchos” artículos Muchos” artículos recuperados recuperados

Tratar de identificar un descriptor adicional y relevante que se pueda combinar mediante el operador AND

Identificar elementos combinados mediante AND que podrían combinarse mediante un operador de adyacencia o proximidad

Identificar términos más específicos en el tesauro (por ejemplo cerebral infarction en vez de cerebrovascular accident en el tesauro EMTREE)

Page 75: Habilidades para la búsqueda de información biomédica

Añadir al descriptor de tesauro un Añadir al descriptor de tesauro un calificador (por ejemplo:calificador (por ejemplo: stomach stomach cancer/Drug therapycancer/Drug therapy ) )

Limitar la búsqueda a un campo Limitar la búsqueda a un campo concretoconcreto

Utilizar los límites permitidos por la Utilizar los límites permitidos por la base de datos base de datos

Utilizar un filtro de búsquedaUtilizar un filtro de búsqueda

““Muchos” artículos Muchos” artículos recuperados (cont.)recuperados (cont.)

Page 76: Habilidades para la búsqueda de información biomédica

Considerar el uso de Considerar el uso de limitadoreslimitadores

Algunas bases de datos Algunas bases de datos permiten limitar la búsqueda permiten limitar la búsqueda a:a:– tipo de artículo, tipo de artículo, – idiomasidiomas– sexosexo– grupos de edad grupos de edad – etc.etc.http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi

Page 77: Habilidades para la búsqueda de información biomédica

Filtros de búsquedaFiltros de búsqueda

Page 78: Habilidades para la búsqueda de información biomédica

FILTROS: ¿Qué son?FILTROS: ¿Qué son?FILTROS: ¿Qué son?FILTROS: ¿Qué son?

Estrategias de búsqueda predefinidas para Estrategias de búsqueda predefinidas para identificar estudios de la mejor calidad identificar estudios de la mejor calidad

de evidenciade evidencia

Buscan investigaciones de calidad Buscan investigaciones de calidad metodológicametodológica

Eliminan las débilesEliminan las débiles

Page 79: Habilidades para la búsqueda de información biomédica

FILTROS: TiposFILTROS: Tipos

Para cada tipo de pregunta clínica:Para cada tipo de pregunta clínica: TerapiaTerapia DiagnósticoDiagnóstico PronósticoPronóstico Etiología y riesgoEtiología y riesgo DañoDaño Revisiones sistemáticasRevisiones sistemáticas Evaluación económicaEvaluación económica

Page 80: Habilidades para la búsqueda de información biomédica

FILTROS: TiposFILTROS: TiposFILTROS: TiposFILTROS: Tipos

““Clinical queries”Clinical queries” Filtros preestablecidosFiltros preestablecidos Se ejecutan directamenteSe ejecutan directamente Pubmed ajusta para Pubmed ajusta para

sensibilidad o precisiónsensibilidad o precisión

Page 81: Habilidades para la búsqueda de información biomédica

Category Optimized For Broad/ Narrow PubMed Equivalent

therapy

sensitive/broad 99%/70%(clinical[Title/Abstract] AND trial[Title/Abstract]) OR clinical trials[MeSH Terms]

OR clinical trial[Publication Type] OR random*[Title/Abstract] OR random allocation[MeSH Terms] OR therapeutic use[MeSH Subheading]

specific/narrow 93%/97%randomized controlled trial[Publication Type] OR (randomized[Title/Abstract]

AND controlled[Title/Abstract] AND trial[Title/Abstract])

diagnosis

sensitive/broad 98%/74%

sensitiv*[Title/Abstract] OR sensitivity and specificity[MeSH Terms] OR diagnos*[Title/Abstract] OR diagnosis[MeSH:noexp] OR diagnostic * [MeSH:noexp] OR diagnosis,differential[MeSH:noexp] OR diagnosis[Subheading:noexp]

specific/narrow  64%/98% specificity[Title/Abstract]

etiology

sensitive/broad 93%/63%risk*[Title/Abstract] OR risk*[MeSH:noexp] OR risk *[MeSH:noexp] OR cohort

studies[MeSH Terms] OR group*[Text Word] 

specific/narrow 51%/95%(relative[Title/Abstract] AND risk*[Title/Abstract]) OR (relative risk[Text Word])

OR risks[Text Word] OR cohort studies[MeSH:noexp] OR (cohort[Title/Abstract] AND stud*[Title/Abstract])

prognosis

sensitive/broad 90%/80%incidence[MeSH:noexp] OR mortality[MeSH Terms] OR follow up

studies[MeSH:noexp] OR prognos*[Text Word] OR predict*[Text Word] OR course*[Text Word]

specific/narrow 52%/94%prognos*[Title/Abstract] OR (first[Title/Abstract] AND episode[Title/Abstract])

OR cohort[Title/Abstract]

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query/static/clinical.html

Page 82: Habilidades para la búsqueda de información biomédica

FILTROS: EfectividadFILTROS: EfectividadFILTROS: EfectividadFILTROS: Efectividad

Revisión manual *

Relevante (gold estándar)

**No relevante

Filtro de búsqueda

Recuperadas a b

No recuperadas c d

a + c b + d *Revisión manual: método utilizado para identificar los registros relevantes y no relevantes.*Revisión manual: método utilizado para identificar los registros relevantes y no relevantes. ** Gold Standard/quasi gold estándar: conjunto de registros relevantes contra el que el ** Gold Standard/quasi gold estándar: conjunto de registros relevantes contra el que el

resultado de la estrategia de búsqueda es testado y validado.resultado de la estrategia de búsqueda es testado y validado.

S = a/(a+c) X 100S = a/(a+c) X 100

P = a/(a+b) X 100P = a/(a+b) X 100

E = d/(b+d) X 100E = d/(b+d) X 100

Page 83: Habilidades para la búsqueda de información biomédica

FILTROS: ChecklistFILTROS: ChecklistFILTROS: ChecklistFILTROS: Checklist

A.A. ObjetivoObjetivo

B.B. DiseñoDiseño

C.C. Gold estándarGold estándar

D.D. EvaluaciónEvaluación

E.E. ValidaciónValidación

F.F. PresentaciónPresentación

G.G. ImplementaciónImplementación

Page 84: Habilidades para la búsqueda de información biomédica
Page 85: Habilidades para la búsqueda de información biomédica

http://www.phru.nhs.uk/casp/filters.htm

Page 86: Habilidades para la búsqueda de información biomédica

ConclusionesConclusiones ¡¡¡¡Cuidado con las estrategias con ¡¡¡¡Cuidado con las estrategias con

terminos muy generales¡¡¡¡terminos muy generales¡¡¡¡ Construir la preguntaConstruir la pregunta Huir del lenguaje natural (cuando sea Huir del lenguaje natural (cuando sea

posible)posible) Preferir siempre las búsquedas Preferir siempre las búsquedas

altamente especificas:altamente especificas: Usar tesauros y descriptoresUsar tesauros y descriptores Filtros metodológicosFiltros metodológicos

Rehacer la búsqueda siempre que sea Rehacer la búsqueda siempre que sea necesarionecesario

Page 87: Habilidades para la búsqueda de información biomédica