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EVOLUCIÓN DE PATRONES EPIGENÉTICOS HISTONAS Evolución Molecular Guillermo Barturen http://bioinfo2.ugr.es/EvolMol/ http://bioinfo2.ugr.es/~guillermo/
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EVOLUCIÓN DE PATRONES EPIGENÉTICOS
HISTONAS
Evolución Molecular Guillermo Barturen http://bioinfo2.ugr.es/EvolMol/ http://bioinfo2.ugr.es/~guillermo/
EVOLUCIÓN DE PATRONES EPIGENÉTICOS MODIFICACIONES DE LAS HISTONAS
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NUCLEOSOMAS Y EMPAQUETAMIENTO DEL ADN
Eirín-López, J.M. et al. (2011)
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CARACTERÍSTICAS COMUNES GENES HISTONAS
• Ausencia de intrones • Expresión coordinada con la división celular • Múltiples copias relativamente homogéneas
• Agrupadas en determinadas regiones del genoma
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DISTRIBUCIÓN DE LOS GENES
Eirín-López, J.M. et al. (2009)
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DISTRIBUCIÓN DE LOS GENES
Eirín-López, J.M. et al. (2009)
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MODELOS EVOLUTIVOS FAMILIAS MULTIGÉNICAS
Eirín-López, J.M. et al. (2011)
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EVOLUCIÓN DE LAS HISTONAS
Eirín-López, J.M. et al. (2011)
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EVOLUCIÓN DE LAS HISTONAS
Eirín-López, J.M. et al. (2011)
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POSICIÓN Y DISTRIBUCIÓN DE NUCLEOSOMAS
Chodavarapu et al. (2010)
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NUCLEOSOMA, METILACIÓN DEL ADN & RNA Pol II
Chodavarapu et al. (2010)
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PROPIEDADES DINÁMICAS DE LOS NUCLEOSOMAS
Philips, T et al. (2008)
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MODIFICACIONES DE HISTONAS
Philips, T et al. (2008)
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ACETILACIÓN DE HISTONAS • Allfrey et al. (1964) Acetilación en Lisinas (Cofactor AcetilCoA) • Acetiltransferasas de Histonas (HATs) • Deacetilasas de Histonas (HDACs)
FUNCIONES • Transcripción Activa • Replicación • Ensamblado nucleosoma • Interacción con otras proteínas
Bannister et al. (2011)
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FOSFORILACIÓN DE HISTONAS • Fosforilación en las colas: Serinas, Treoninas y Tirosinas • Fosforilación en el Core de Histonas • Fosfatasas y Kinasas (Cofactor ATP)
FUNCIONES • Transcripción Activa • Reparación ADN • Apoptosis • Condensación del ADN
Bannister et al. (2011)
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METILACIÓN DE HISTONAS • Lisinas: mono, di o tri-metiladas (HKMT) • Argininas: mono o di-metiladas -simétricamente o asimétricamente- (PRMT)
FUNCIONES • Transcripción Activa o Inactiva • Regulación Estructural
Sims et al. (2003)
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OTRAS MODIFICACIONES
• Deiminación Arginina Citrulina (Neutralización de Carga) • Β-N-Acetilglucosamina Serinas y treoninas (inclusión del azúcar) • ADP ribosilación Glutamato y arginina (reparación ADN?) • Ubiquitinación Gran modificación (Iniciación de la transcripción y elongación) • Eliminación de la cola N-terminal Eliminar cualquier modificación
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EL CÓDIGO DE HISTONAS
COMPLEJO & DINÁMICO
Sims et al. (2003)
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EVOLUCIÓN DE LAS MODIFICACIONES
Woo et al. (2012) ALTA CONSERVACION DE H3K4me3 & H3K27ac en Promotores
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CORRELACIÓN CONSERVACIÓN & ESTABILIDAD
Woo et al. (2012) CORRELACIÓN ENTRE CONSERVACIÓN Y ESTABILIDAD
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EXPRESIÓN Y CONSERVACIÓN
Woo et al. (2012) BAJA CORRELACIÓN CON LA EXPRESIÓN
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COMPOSICIÓN Y CONSERVACIÓN
Woo et al. (2012) ALTA CORRELACIÓN CON LA COMPOSICIÓN
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TFBSs Y CONSERVACIÓN
Woo et al. (2012) CORRELACIÓN CON LA LOCALIZACIÓN DE TFBSs in-vivo
