Estructura de nucleósidos y nucleótidos Transporte a...

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1 2010 Enrique Castro Estructura de nucleósidos y nucleótidos Transporte a través de membranas Transporte a través de membranas Química-física del transporte Difusión: ley de Fick Bioenergética Potencial de membrana: ecuación de Nernst Clasificación y tipos de transporte Distinciones bioenergéticas y cinéticas (mecanismos) Difusión facilitada Permeasas: Glut e intercambiador Cl - /HCO 3 - Canales iónicos: estructura, función y regulación ATPasas de membrana: Bombas iónicas Estructura y clasificación P-ATPasas: mecanismo, ejemplos y funciones V-ATPasas Transportadores ABC/Mdr1/CFTR Mecanismos de transporte acoplado Intercambiadores: mecanismo y bioenergética Transporte transepitelial: trabajo conjunto 2 2010 Enrique Castro Membranas biológicas Membranas biológicas Funciones Definen límites c elulares / compartimentos Regulan transporte molecular Organizan secuencias complejas de reacciones PROPIEDADES ESPECÍFICAS INSOLUBLES FLEXIBLES AUTOENSAMBLANTES SELECTVAMENTE PERMEABLES Resistentes, aguantan presiones Deformables, acompañan crecimiento y movimiento Autoreparación Transporte de metabolitos generación de energía generación de señales

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12010 Enrique Castro

Estructura de nucleósidos y nucleótidosTransporte a través de membranasTransporte a través de membranas

Química-física del transporte• Difusión: ley de Fick • Bioenergética• Potencial de membrana: ecuación de Nernst

Clasificación y tipos de transporte• Distinciones bioenergéticas y cinéticas

(mecanismos)

Difusión facilitada• Permeasas: Glut e intercambiador Cl-/HCO3

- • Canales iónicos: estructura, función y regulación

ATPasas de membrana: Bombas iónicas• Estructura y clasificación• P-ATPasas: mecanismo, ejemplos y funciones• V-ATPasas• Transportadores ABC/Mdr1/CFTR

Mecanismos de transporte acoplado• Intercambiadores: mecanismo y bioenergética• Transporte transepitelial: trabajo conjunto

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22010 Enrique Castro

Membranas biológicasMembranas biológicas

Funciones

Definen límites celulares / compartimentos

Regulan transporte molecular

Organizan secuencias complejas de reacciones

PROPIEDADES ESPECÍFICAS

● INSOLUBLES

● FLEXIBLES

● AUTOENSAMBLANTES

● SELECTVAMENTE PERMEABLES

Resistentes, aguantan presiones

Deformables,acompañan crecimiento y movimiento

Autoreparación

Transporte de metabolitosgeneración de energía generación de señales

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32010 Enrique Castro

Agua H2O

Gases O2, CO2,

NO, CO, N2

polares ureapequeñas etanol, glicerolsin carga Ác. Acético

Hidrófobas Ác. grasospequeñas Esteroides

polares glucosa grandes sacarosasin carga

iones K+, Na+, Ca2+, Mg2+

Cl-, HCO3-, H

2PO

4-

polares aminoácidoscargadas glucosa--6-P

ATP, nucleótidos

Permeabilidad de las membranasPermeabilidad de las membranas

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42010 Enrique Castro

Coeficiente de reparto aceite/agua

Hidrofobicidad

Co

efi

cie

nte

de

pe

rme

ab

ilid

ad

, c

m/h

Pe

rme

ab

ilid

ad

Permeabilidad ∝ hidrofobicidad

Permeabilidad e HidrofobicidadPermeabilidad e Hidrofobicidad

-12 -10 -8 -6 -4 -2 Log P

Na+

K+

Cl+

glucosa trp

urea

indol

H2O

Coeficiente de permeabilidad, cm/s

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52010 Enrique Castro

Difusión libre: leyes de FickDifusión libre: leyes de Fick

Difusión: camino al azar (relaciones de Einstein)

Flujo a través de una frontera: 1º ley de Fick

Variación temporal: 2ª ley de Fick

Movimiento browniano

⟨ x ⟩=0

⟨ x2⟩=2D⋅t

d=2D⋅t

[D ]=L2

T=cm2

s

D= coeficiente de difusión(depende del tamaño)

En tres dimensiones

r=6D⋅t

1 2

c1

c2

dndt

⋅1A=J=−D⋅

dcdx

, [J ]=M

L2⋅T=

mol

cm2⋅s

dcdt

=−dJdx

=D⋅d 2 c

dx2

c x , t =n2⋅ Dt ⋅ e

−x 2

4Dt

C

-3 -2 -1 0 1 2 3X

t=1

t=4

t=16t=64

Flujo proporcional al gradiente de concentración

Distribución gausiana

2∙n

D=k BT

6 r

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62010 Enrique Castro

J =−D⋅dcm

dx= −D⋅

cm

=cim

cis ; ci

m=⋅cis ; cm=⋅ c s

J =−D⋅

⋅ cs

J =−P⋅ cs

[P ]= L2⋅T−1⋅1L = cm

s

β=1

β=0.5

β=0.2

β=2

c1S

c2S

c1m

c2m

δ

0 x δ

Difusión a través de membranaDifusión a través de membrana

P= D⋅

Coeficiente de permeabilidad• Coeficiente de reparto• Coeficiente de difusión (√Mr)• Espesor de la membrana

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72010 Enrique Castro

Energía libre y transporteEnergía libre y transporte

equilibrio

G = RT⋅l n[N a+ ]de st i no[N a+ ]orig en

zF⋅ Em

componentequímico

componenteeléctrico

Em=Ed es t in o−Eorig en

R = 8.315 J·mol-1·K-1 (1.987 cal∙mol-1∙K-1)

F = 96480 Cb·mol-1 ( J·mol-1·V-1 )(23059 cal∙mol-1∙V-1)

1 cal = 4.184 J

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82010 Enrique Castro

Difusión de iones: potencial de membrana

Difusión de iones: potencial de membrana

NaCl15 mM

NaCl150 mM

0

-60 +60

Em= 0 mV

Membrana impermeable Membrana permeable a Na+

Membrana permeable a Cl- Membrana permeablea Na+ y Cl-

Em= -59 mV

ΔV= 0 ΔV≠ 0 constante

ΔV≠ 0 constante ΔV≠ 0 transitorio

Em= +59 mV P

Na>P

Cl

NaCl15 mM

NaCl150 mM

0

-60 +60

⊖ ⊕⊖ ⊕

Cl+

NaCl15 mM

NaCl150 mM

0

-60 +60

⊕ ⊖⊕ ⊖

Na+

NaCl15 mM

NaCl150 mM

0

-60 +60

Na+

Cl+

Separación de cargas

=potencial de membrana

Membrana = Condensador eléctricoC=Q/VC = 0,8-1 μF/cm2

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92010 Enrique Castro

InicioE

m=0

Potencial de equilibrioPotencial de equilibrio

Ecuación de Nernst

EquilibrioE

m=E

eq

R = 8.315 J·mol-1·K-1 (1.987 cal∙mol-1∙K-1)

F = 96480 Cb·mol-1 ( J·mol-1·V-1 )

Ee q = - R⋅Tz⋅F ⋅l n[N a+ ]des t i n o[N a+ ]ori gen

G = RT⋅l n[Na+ ]des t i n o[N a+ ]orig en

zF⋅Em

En el equilibrio G = 0 y Em = Ee q

Walther Nernst1864-1941

Premio Nobel 1920

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102010 Enrique Castro

Em=R⋅TF ⋅ln

pK⋅[K+ ]o pNa⋅[Na

+ ]o pCl⋅[Cl-]i

pK⋅[K+]i pNa⋅[Na

+ ]i pCl⋅[Cl- ]o

Na+Na+

K+ K+

Cl- Cl-

Membrana permeable a varios ionesMembrana permeable a varios iones

Em≠E

K

Em≠E

Cl

Em≠E

Na

JK≠ 0

JCl≠ 0

JNa≠ 0

∆G≠ 0no equilibrio

Ecuación de Goldman-Hodgkin-Katz

Em=R⋅TF ⋅ln

[K + ]o⋅[Na+ ]o[K + ]i⋅[Na+ ]i

=p N ap K

∑ Ii=∑ z i⋅Ji= 0

Ji= p i⋅f Em−E i

∑ Ii=∑ z i⋅p i⋅f Em−R⋅Tz i⋅F

⋅l n[X i ]e

[ X i ]i= 0

Haciendo

Estadoestacionario

Transporte de carga nulo

Puesto que

Sustituyendo Ei por la

expresión de Nernst

y despreciando la contribución de Cl -

Simplificada, sólo para Na+ y K+

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112010 Enrique Castro

Equilibrio de Gibbs­DonnanEquilibrio de Gibbs­Donnan

Varios iones difusibles+

un ión no difusible asimétrico

Iones no difusibles intracelularescausan entrada continua de agua

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122010 Enrique Castro

Solución osmótica en no­excitablesSolución osmótica en no­excitables

Cuasi-equilibrio Gibbs-Donnan doble• Simetrización del sistema• Na+ funcionalmente impermeable (PNa << PK)

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132010 Enrique Castro

Química-física del transporte• Difusión: ley de Fick • Bioenergética• Potencial de membrana: ecuación de Nernst

Clasificación y tipos de transporte• Distinciones bioenergéticas y cinéticas

(mecanismos)

Difusión facilitada• Permeasas: Glut e intercambiador Cl -/HCO3

- • Canales iónicos: estructura, función y regulación

ATPasas de membrana: Bombas iónicas• Estructura y clasificación• P-ATPasas: mecanismo, ejemplos y funciones• V-ATPasas• Transportadores ABC/Mdr1/CFTR

Mecanismos de transporte acoplado• Intercambiadores: mecanismo y bioenergética• Transporte transepitelial: trabajo conjunto

Estructura de nucleósidos y nucleótidosTransporte a través de membranasTransporte a través de membranas

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142010 Enrique Castro

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152010 Enrique Castro

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162010 Enrique Castro

Tipos de transportadoresTipos de transportadores

Usualmente iones

Usualmentemol. orgánicas

Permeasas

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172010 Enrique Castro

IonóforosIonóforos

Valinomicina (K+)

monensina (Na+)nonactina

gramicidina

En solventehidrófobo

En bicapa lipídicaHélice 6.3 hueca

dímero cabeza-cabeza

Canal de gramicidina

transportadores

canales

Complejovalinomicina-K+

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182010 Enrique Castro

Química-física del transporte• Difusión: ley de Fick • Bioenergética• Potencial de membrana: ecuación de Nernst

Clasificación y tipos de transporte• Distinciones bioenergéticas y cinéticas

(mecanismos)

Difusión facilitada• Permeasas: Glut e intercambiador Cl-/HCO3

- • Canales iónicos: estructura, función y regulación

ATPasas de membrana: Bombas iónicas• Estructura y clasificación• P-ATPasas: mecanismo, ejemplos y funciones• V-ATPasas• Transportadores ABC/Mdr1/CFTR

Mecanismos de transporte acoplado• Intercambiadores: mecanismo y bioenergética• Transporte transepitelial: trabajo conjunto

Transporte mediado por endocitosis• Clasificación y tipos• Potocitosis: transporte de folato• Endocitosis mediada por receptor• Transcitosis

Ósmosis y fenómenos osmóticos• Ley de van't Hoff• Tonicidad de disoluciones: coeficiente de reflexión• Equilibrio Gibbs-Donnan• Regulación del volumen celular

Estructura de nucleósidos y nucleótidosTransporte a través de membranasTransporte a través de membranas

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192010 Enrique Castro

Intercambiador Cl­/HCO3­ :

banda 3/pAE1 del eritrocitoIntercambiador Cl­/HCO3

­ :banda 3/pAE1 del eritrocito

Capilares sistémicosalta pCO2, baja pO2

(metabolismo tisular)

Capilares pulmonaresbaja pCO2, alta pO2

(ventilación)

eritrocito

eritrocito

hemoglobina

Efecto Bohr

Proteína AE1

Anhidrasa carbónica

Anhidrasa carbónica

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202010 Enrique Castro

Canales iónicosCanales iónicos

Activados por ligando(R. Ionotrópicos)

Activados por cNMP

Unión deligando

Unión denucleótido

No sensibles a Em

Componentes funcionales• Bocas: externa e interna (Fick)• Poro• Filtro selectivo• Sensor• Compuerta

Topología transmembrana• Básico: 2TM/P• Componentes adicionales

Boca externa

Boca interna

Sensor

Filtro

compuerta

poro

Saturablebaja ΔG‡ alto nº recambio

(>107 ion/s)

Bucle P

TM

sensibles a Em

INa, IK, ICa

IK ir

IK (Ca) big IK (rep)

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212010 Enrique Castro

Canales iónicos: selectividadCanales iónicos: selectividad

Poroiónico

Vista superior

Filtro selectivo

compuerta

Canal de K+:estructura del poro

Bucle P

extracelular

citosol

Selectividad= compensar desolvatación

Buenajuste

malajuste

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222010 Enrique Castro

Mecanismos de compuertaMecanismos de compuerta

Receptores ionotrópicos• fam. nAchR• fam. iGluR• fam. P2X

Canales dependientesde voltaje

• Na+, Ca2+

• K+ etc.

Canales dep. cAMP(olor, gusto)

Canales dep. cGMP(vista)

Canales dep. ATP(célula β)

Canales dependientesde voltaje

• Ca2+

• K+ etc. IK(M)

Canales dependientes de voltaje y Ca2+

• IK(Ca)

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232010 Enrique Castro

Acuaporinas: Estructura y funciónAcuaporinas: Estructura y función

Acuaporinas: canales de H2O• 6TM (3+3 invertido)• Tetrámeros• Impermeable a iones y mol. pequeñas

Acuaporinas: localización y funciones

localización funciónAQP-1 ubicua: rinón, pulmón,

ojo, plexos coroideosReabsorción de agua en túbuloscolectores; secreción de fluido en humoracuoso y líquido cefalorraquideo;homeostasis de agua en el pulmón

AQP-2 Rinón: Túbulo colector Reabsorción de agua (diabetes insípida)

AQP-3 Rinón: Túbulo colector Retención de agua

AQP-4 cerebro: vellosidadesaracnoideas

Reabsorción de líquido cefalorraquideo enSNC. Regulación del edema cerebral

AQP-5 glándulas salivares,lacrimales y epitelioalveolar

secreción de fluido

A B C A' B' C'

directo

invertido

citosol

extracelular

CHIP 28 kDa

Columna de H2O

en poro

Transporte 5·108 s-1

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242010 Enrique Castro

Química-física del transporte• Difusión: ley de Fick • Bioenergética• Potencial de membrana: ecuación de Nernst

Clasificación y tipos de transporte• Distinciones bioenergéticas y cinéticas

(mecanismos)

Difusión facilitada• Permeasas: Glut e intercambiador Cl -/HCO3

- • Canales iónicos: estructura, función y regulación

ATPasas de membrana: Bombas iónicas• Estructura y clasificación• P-ATPasas: mecanismo, ejemplos y funciones• V-ATPasas• Transportadores ABC/Mdr1/CFTR

Mecanismos de transporte acoplado• Intercambiadores: mecanismo y bioenergética• Transporte transepitelial: trabajo conjunto

Estructura de nucleósidos y nucleótidosTransporte a través de membranasTransporte a través de membranas

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252010 Enrique Castro

Transporte activo primario:ATPasas de Membrana

Transporte activo primario:ATPasas de Membrana

ATPasas tipo P• Tetrámeros 2α/2β • Asp-P (vanadato)• m. plasmática y r. endoplásmico• Na+, K+, H+, Ca2+ (y otros)

ATPasas tipo V y F• Muy complejas

3 integrales 8 periféricas• Exclusivamente H+ • D. integral: canal de H+

• D. periférico: unión de ATP• Intracelular

ATP-sintasa mitocondrialLisosomas vesículas sinápticas

ATPasas tipo "transportadores ABC"• 4 dominios 2T+2A• Estructura diversa

(mono-, di-, tetraméricas)• Membrana plasmática• Iones y compuestos orgánicos

asp-P P-asp

Canal de H+

F0, V

0

ATPF

1,

V1

F: mitocondria

V: vesículas

citosol

extracelular

citosol

matrizcitosol

ATP ATP

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262010 Enrique Castro

Na+/K+­ATPasa de membranaNa+/K+­ATPasa de membrana

Estructura• Tetrámero 2α/2β • Sitio de unión de ATP intracelular• Asp-P

Función• Transporte vectorial• 3 Na+ / 2K+ / 1ATP• Inhibida por vanadato• Inhibida por cardiotónicos

(ouabaina digoxina)

Subunidad β:• esencial para plegamiento• 3 N-glicosilada• 1 TM• 40 kD

Subunidad α:• Centro activo• No glicosilada• 10 TM• 120 kD

citosol

asp-P

P-asp

citosol

extracelular

➢Actividad biológica● control del volumen celular

● control del pHi

● control de [Ca2+]i

● importación de metabolitos(cotransporte)

● excitabilidad eléctrica

citosol

extracelular

25-30% consumo ATP>60% en cerebro

Gradiente Na+/K+

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272010 Enrique Castro

Mecanismo de la Na+/K+­ATPasaMecanismo de la Na+/K+­ATPasa

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282010 Enrique Castro

CardiotónicosCardiotónicos

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292010 Enrique Castro

ATPasas "transportador ABC"ATPasas "transportador ABC"

Estructura• 4 dominios 2T+2A• Estructura diversa

(mono-, di-, tetraméricas)

Función• Membrana plasmática• Exportación de mol. hidrófobas (MDR1)• Canal de aniones (CFTR)

MDRCFTR

2T+2A fusionados12 TM

Destoxificacióninterferencia antitutorales

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302010 Enrique Castro

Fármacos quimioterápicos y MDRFármacos quimioterápicos y MDR

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312010 Enrique Castro

Estructura del CFTREstructura del CFTR

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322010 Enrique Castro

Química-física del transporte• Difusión: ley de Fick • Bioenergética• Potencial de membrana: ecuación de Nernst

Clasificación y tipos de transporte• Distinciones bioenergéticas y cinéticas

(mecanismos)

Difusión facilitada• Permeasas: Glut e intercambiador Cl -/HCO3

- • Canales iónicos: estructura, función y regulación

ATPasas de membrana: Bombas iónicas• Estructura y clasificación• P-ATPasas: mecanismo, ejemplos y funciones• V-ATPasas• Transportadores ABC/Mdr1/CFTR

Mecanismos de transporte acoplado• Intercambiadores: mecanismo y bioenergética• Transporte transepitelial: trabajo conjunto

Estructura de nucleósidos y nucleótidosTransporte a través de membranasTransporte a través de membranas

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332010 Enrique Castro

Familias de transportadores Familias de transportadores 

F. co-transportador Na+-glucosa• 14 TM• 1-2 Na+:1 sustrato• Intestinal (SGLT1), renal (SGLT2)

Sitio de permeasa

F. co-transportador Na+/Cl- de neurotransmisores• 12 TM• cotransporte Cl- obligado (antiporte K+)• 2 Na+:1 Cl-:1 sustrato+ • GABA, monoaminas, Gly/Pro, NTT4

F. co-transportador de glutamato• 8 TM• antiporte K+ obligado• 1Na+:1Glu-/1K+:HO- • Exclusivamente Glu sináptico

F. antiportador Na+/Ca2+ • 12 TM• 3 Na+:1 Ca2+

F. transportador dependiente de H+ • 12 TM• Antiporte 2 H+:1 sustrato+ • Vesículas sinápticas y lisosomas (neurotransmisores)

Reserpina, extasis(ΔH+)

Cocaina, anfetas, tricíclicoscitosol

exterior

citosol

exterior

citosol

exterior

citosol

Luz vesícula

F. co-transportador Na+-glucosa• 14 TM• 1-2 Na+:1 sustrato• Intestinal (SGLT1), renal (SGLT2)

F. co-transportador Na+/Cl- de neurotransmisores• 12 TM• cotransporte Cl- obligado (antiporte K+)• 2 Na+:1 Cl-:1 sustrato+ • GABA, monoaminas, Gly/Pro, NTT4

F. co-transportador de glutamato• 8 TM• antiporte K+ obligado• 1Na+:1Glu-/1K+:HO- • Exclusivamente Glu sináptico

F. antiportador Na+/Ca2+ • 12 TM• 3 Na+:1 Ca2+

F. transportador dependiente de H+ • 12 TM• Antiporte 2 H+:1 sustrato+ • Vesículas sinápticas y lisosomas (neurotransmisores)

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342010 Enrique Castro

Transportadores de membrana y regulación del pHi

Transportadores de membrana y regulación del pHi

glucosa

glucosa

CO2 HCO3-

H+

lactato

H+

Na+

HCO3-

Cl-

Na+

HCO3-

Cl-

HO-

Antiportador Cl-/HO-

acidificación

Antiportador Na+/H+

alcalinizaciónActivado por H+

intercambiador Cl-/HCO3

-

acidificacióninhibido por H+

Intercambiador Cl-/HCO3

-

dependiente de Na+

alcalinizaciónactivado por H+

pH intracelular

ve

loc

ida

d r

ela

tiv

a,

% intercambiador Cl-/HCO

3-

intercambiador Na+ Cl-/HCO

3-

antiportadorNa+/H*

Dependencia del pH de los transportadores de H+ y HCO3

-

amilórido

DIDS, SITS

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352010 Enrique Castro

Transporte transepitelial de glucosaTransporte transepitelial de glucosaluz intestinal

• [Na+] alta (dieta, secretado)• [glucosa] baja

sangre• [Na+] alta• [glucosa] media (5.5 mM)• [K+] baja (5 mM)

citosol• [Na+] baja

(12 mM)• [glucosa] alta • [K+] alta

(150 mM)gluc

activocontra

gradiente

pasivoa favor degradiente

glucosa

glucosa

glucosa 2 Na+

2 Na+

2 K+

Cl-

Cl-

Cl-2 K+3 Na+

ATP

ADPP

i

Glut2(permeasa)

Na+/K+-ATPasa(activo)

SGLT(activo) canal Cl-

(pasivo)

canal K+

(pasivo)

gluluz+2Na+luz glucit+2Na+

cit

glucit

glusangre

3Na+cit+2K+

sangre+ATP 3Na+sangre+2K+

cit+ADP+Pi

K+cit

K+sangre

Cl-luz

Cl-cit

Cl-cit Cl-sangre

Gluluz

+ Na+luz

+ Cl-luz

+ATP glusangre

+ 2Na+sangre

+ Cl-sangre

+ ADP+Pi

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