Clase 21 Clonamiento 2013

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Clonación de genes

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  • Clonacindegenes

  • ClonacindelDNADNAforneo(secuenciaquesedeseaclonar)Vectordeclonacin(vehculo)Organismohusped(E.Coli)Seleccindevectores

    Vectorhbrido

    http://www.dnatube.com/video/556/Plasmid-Vector-Construction

    http://www.dnatube.com/video/4036/PCRCloning

    UngenAislamientoapartirdelmRNA (yanotieneintrones):usodelatranscriptasa inversaquehacecDNA apartirdelconjuntodemRNA deltejido(LibreradecDNA)

    Fragmentosdelgenomapordigestinconenzimasderestriccin:SeobtieneunaLibreraGenmica,juegocompletodefragmentosclonadosdelgenomadelorganismoFragmentosdePCRamplificadoconpartidoresespecficosparalasecuenciaquesebuscaydesdeelcDNA extradodeltejidoendondeelgenseestexpresando

    Obtencindelasecuenciaqueseclona

  • Libreragenmica

  • AmplificacindeunfragmentoporPCR

    Acta

    Luego de 30 ciclos, una copia del fragmento se ha amplificado 109 veces:

    230 =1.073.741.824 copias del fragmento de inters

  • Vectordeclonamiento

    Caractersticas generales de un vector de expresin(procaritico)

    - promotor fuerte (inducible)

    - sitio de clonamiento multiple (MCS)

    o policonector (sitio con muchas

    secuencias reconocidas por enzimas de

    restriccin)- seal de trmino de la transcripcin

    - sitio de unin del ribosoma (RBS)

    - origen de replicacin

    - marcador de seleccin:

    Los ms usados son los antibiticos

  • ClonacinysecuenciacindelDNA 14

    FormacindelVectorhbridoFragmentosdedistintasprocedenciasqueseuneninvitrotrascortarseconlamismaenzimaderestriccin.Ligasa sellazonahbrida

    VectoresdeclonacinPlsmido(215kb)Fago (Lambda)Csmido

    PlsmidohbridooPlsmidorecombinanteoDNArecombinante

  • Fcildecrecerenmediosdecultivosimples

    Tiempoprpidodecrecimiento,condivisincelularentre2030minutos

    Sugenticaesconocidamuybien,puessesecuencicompletamentesugenoma

    Sepuedeintroducirmaterialgenticoforneoenvectores,plsmidosoADNdefagocomocopiasdematerialextracromosomal

    Husped:E.coli

    Plsmido:resistenciaaantibiticosSeleccindevectoresrecombinantes

  • Cmo reconocer qu bacterias incorporaron el plsmido recombinante y cuales no?

  • Slo crecen las bacterias que tienen la resistencia a la ampicilina (otorgada por el plsmido)

    Obtencindelgendeintersapartirdeunagenoteca

  • Depender del tipo de librera que se utilice (de cDNA o genmica), el tipo de gen que se obtiene: el ADNcopia (cDNA) que ser igual a ARNm, no tiene intrones o el GEN completo, tal como est en ADN y seguramente fragmentado en varias colonias positivas

    Propagacincelular

  • PermiteobtenerlasmximasventajasdegeneseucariotasVectoresdelevaduras:cromosomasartificialesdelevaduras(YACs):Plsmidos+Secuenciareplicadora+centrmerodelevadura+(telmerolevadura)

    Puedeincorporarmsde500kbdeDNA

    Vectoreseucariticos

    OrigendereplicacindelDNAdelevadura(ARS)

    Regincentromrica(CEN)

    Resistenciaaantibitico(p.e.,ampr)

    Origendereplicacinbacteriano(ori)

    CEN ARSampr ori TelmeroTelmero

    Linealizacin(conendonucleasas)yadicindeextremostelomricos

    Caractersticas generales de un vector de expresin(eucaritico)

    - promotor fuerte (inducible)

    - sitio de clonamiento multiple (MCS)

    - seal de trmino de la transcripcin

    - seal de poliadenilacin

    -sitio de unin del ribosoma (RBS)

    - origen de replicacin

    - marcador de seleccin en bacterias y en clulas eucariticas

    PA

    PA

    Invitrogen