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LEHNINGER
PRINCIPLES OF BIOCHEMISTRYQuinta Edicin
David L. Nelson and Michael M. Cox
2008 W. H. Freeman and Company
CAPTULO 4La Estructura 3D de Protenas
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Quimotripsina
Glicina
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La conformacin de una protena o su estructura 3D esdescrita por su estructura secundaria, terciaria, y cuaternaria.
Todas estas estructuras dependen de la estructura primaria.
Interacciones dbiles, no covalentes, estabilizan esta
arquitectura que determina la forma general de la protena.
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El oxgeno del cabonilo tiene una carganegativa parcial y el nitrgeno una carga
positiva parcial creando un pequeo dipolo.
Los enlaces pptidos ocurren en
configuracin trans.
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Grfica Ramachandran para L-Ala
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Resumen
Cada protena tiene una estructura 3D que refleja su funcin.
La estructura proteca se estabiliza por mltiples interacciones
dbiles. Las interacciones hidrofbicas son los principales
contribuyentes para estabilizar la forma globular de muchas
protenas solubles; las enlaces de hidrgeno y las interacciones
inicas se optimizan en las estructuras termodinmicas mas estables.
Los enlaces covalentes en el esqueleto polipptidico confieren
restricciones a la estrcutrua. El enlace pptido tiene caracter de
doble enlace lo que mantiene al grupo pptido consistente en 6
tomos en una configuracin rgida y planar. El enlace NC y elC C pueden rotar para definir los ngulos dihyedrales y,
respectivamente.
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Estructura Secundaria
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Estructura Secundaria:
Se refiere al arreglo de aminocidos adyacentes en
patrones regulares y recurrentes.
Algunas estructuras secundarias comunes son la -
Hlice, confomracin , -turn, y la hlice de
colgeno.
Estas estructuras se forman, en parte, en respuesta a
interacciones no-covalentes entre aminocidos
vecinos. Son estables, porque se maximiza la
formacin de enlaces de hidrgeno y la repulsin seminimiza en estas conformaciones.
Algunos aminocidos son compatibles con esta
estructura.
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Mioglobina
(Ala, Leu, Met, Phe, Glu, Gln, Lys, Arg, His)
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yy
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Paralela
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Antiparalela
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Antiparalela
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Triose phosphate isomerase
C t l d t d t
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Conecta los dos extremos de segmentos
adyacentes en la antiparalela
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UV
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Pelo
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Colgeno
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Protena fibrona: seda y tela de araas
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Estructura Terciaria:
arreglo 3D de la cadena de aminocidos
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Mioglobina
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Grupo Heme
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Estructura 3D de hemoglobina
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Estructura cuaternaria:
cuatro cadenas polipptidas
Estructura Cuaternaria
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Estructura Cuaternaria
El arreglo tridimensional de las subunidades separadas de una
protena se conoce como su estructura cuaternaria.
Interacciones entre las subunidades individuales son estabilizadas
por las mismas interacciones debiles, no-covalentes, que estabilizan
lad estructuras secundarias y terciarias.
Ejemplo bien conocido: Hemoglobina
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Cpsidas
virales
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BSE:Bovine Spongiform Encephalopathy;
