Boletín Informativo - GREBO – Grupo para el control de la Resistencia Bacteriana de ... · 2019....

Número 10, Bogotá, 2019

Resultados de la vigilancia de la resistencia bacteriana

Año 2017

Componente pediátrico y adulto

La niña de la perla

Autor: Alejandra Calpa Imbacuán Estudiante Medicina UNAL

Técnica: cristal violeta, lugol, tinta china, verde de malaquita, azul de lactofenol y rojo carmín sobre papel acuarela

Colección: Celebración 50 años Dpto. Microbiología

Facultad de Medicina Universidad Nacional de Colombia

Boletín Informativo

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Boletín Informativo GREBO

Número 10, Bogotá 2019

Directora:

Aura Lucia Leal Castro

Comité editorial

Carlos Arturo Álvarez

Jorge Alberto Cortés

María Victoria Ovalle

Colaboradores en esta edición

Valeri Sáenz Moncaleano

Francisco Bohórquez

www.grupogrebo.org

Portada

La portada de este boletín fue realizada por Alejandra Calpa Imbacuán, estudiante de pregrado de Medicina de la Universidad Nacional de Colombia, quien participo en la actividad de Bio-Arte, realizada en el año 2018 como parte de la celebración de los 50 años del departamento de microbiología de la Facultad de Medicina.

Ninguno de los autores del boletín declaró conflicto de intereses que lo inhabilitara para participar en el proceso.

La responsabilidad científica sobre la información contenida en el documento está a cargo de los autores.

Nuestro contenido

1. Nuestra red de vigilancia • Componente adulto (Unidad de

Cuidado Intensivo y hospitalización)

• Componente pediátrico (Unidad de Cuidado Intensivo y hospitalización)

2. Nuestras instituciones

Boletín Informativo

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Hemos regresado

Hace 17 años organizamos una red de instituciones interesadas en conocer la magnitud de la resistencia bacteriana a nivel hospitalario en la ciudad de Bogotá. Durante este tiempo, cada año hacíamos entrega de nuestros boletines a ustedes nuestros fieles seguidores. Sin embargo, hace dos años hicimos una pausa para replantearnos el futuro. Y fue gracias a este “tiempo fuera” que vislumbramos lo que significaban estos boletines en la práctica clínica, en la formación de estudiantes de medicina, residentes de infectología, en la toma de decisiones al interior de los comités de infecciones, laboratorios clínicos y en la formulación de políticas de salud pública.

Fue gracias a ese: “Profe, ¿qué pasó con GREBO?”, que tomamos la decisión de regresar. Una decisión que implica casi volver al lugar donde se partió, a reconectar con ustedes nuestras instituciones aliadas y a revisar dos años de información valiosa que estuvo detenida en el tiempo.

Por otra parte, los retos son cada vez mayores, la resistencia a los antimicrobianos plantea una crisis mundial que pone en riesgo un siglo de avances en materia de salud y el logro de los Objetivos de Desarrollo Sostenible (1). Así mismo, el daño económico causado por la resistencia no controlada a los antimicrobianos podría ser comparable al de la crisis financiera mundial de los años 2008-2009, debido al aumento de los gastos en atención sanitaria, al impacto en la producción de alimentos, en la calidad de vida y al aumento de la pobreza y la desigualdad (2).

Por lo anterior, para sensibilizar sobre esta problemática a los estudiantes de medicina, en el año 2018 se realizó un taller de Bio-arte (práctica artística que reúne arte y ciencia utilizando medios biológicos y científicos, así como métodos artísticos para crear obras de arte), en el marco de la celebración de los 50 años del departamento de microbiología de la Facultad de Medicina de la Universidad Nacional de Colombia. Empleamos colorantes que se utilizan de rutina en los laboratorios de microbiología como pintura, y los estudiantes crearon obras, que exploraran e interconectan áreas que al parecer son alejadas: arte, ciencia y comunidad.

Finalmente, la lucha para contener la resistencia a los antimicrobiano debe permear en la comunidad en general, por lo que consideramos que el arte es una forma de comunicación que puede ayudar a lograr este objetivo.

Aura Lucia Leal Castro

Directora GREBO

1. Naciones Unidas. Declaración Política de la reunión de alto nivel de la Asamblea General sobre la resistencia a los antimicrobianos, A/71/L.2. 22 de septiembre de 2016.

2. Banco Mundial. Drug-resistant infections: A threat to our economic future 2017

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Nuestra Red de vigilancia Análisis de la vigilancia de la resistencia bacteriana año 2017.

Aura Lucia Leal. Médico Directora Grupo GREBO

Valeri Sáenz M. Médico Grupo GREBO

La información que se presenta a continuación fue obtenida de los datos proporcionados por los laboratorios de la Red de Hospitales de GREBO que corresponde para el año 2017 a 9 instituciones de Bogotá, y 6 fuera de Bogotá (2 Manizales, 1 Tunja, 1 Neiva, 1 Cundinamarca, 1 Popayán). Este análisis fue realizado utilizando el software Whonet 5.6 y la norma CLSI 2017.

Previo a los análisis realizados en el presente boletín informativo, se realizó un control de calidad de las bases de datos remitidas por cada institución, con el fin de mejorar la calidad de los datos; se excluyeron del análisis los registros de pacientes que no presentaban información completa en relación con el tipo de localización.

El análisis contempla el componente adulto y el componente pediátrico (se incluye el neonatal). Para cada uno de los componentes se discriminó según el tipo de localización UCI (Unidad de Cuidados Intensivos) adultos, pediátrica, neonatal y No UCI (servicio de hospitalización excepto urgencias) y de acuerdo con el microorganismo aislado. Los datos se presentan en número de aislamientos y porcentaje de resistencia (%R).

Tabla No 1. Número de aislamientos obtenidos por la red GREBO 2001-2017

TIPO DE SERVICIO

2001 2002 2003 2004 2005 2006 2007 2008 2009 2010 2011 2012 2013 2014 2015 2016 2017 TOTAL POR SERVICIO

SERVICIOS NO UCI

17346 18886 19947 26375 26779 30947 27710 31271 26674 30202 30752 28766 13888 28600 25879 21528 6613 433691

SERVICIOS UCI

5269 6419 6896 9095 10167 12077 16470 15734 15046 16282 15033 14589 29242 13244 12186 10216 3965 222146

TOTAL POR AÑO

22615 25305 26843 35470 36946 43024 44180 47005 41720 46484 45785 43355 43130 31054 38065 31744 10578 655837

5

Frecuencia de microorganismos y distribución por tipo de muestra en UCI adultos

0 5 10 15 20

Escherichia coliKlebsiella pneumoniaeStaphylococcus aureus

Pseudomonas aeruginosaCandida albicans

Enterococcus faecalisStaphylococcus epidermidis

Proteus mirabilisEnterobacter cloacaeSerratia marcescens

Candida tropicalis

Porcentaje (%)n=2276

Frecuencias de microorganismos en UCI adultos. Año 2017

0 5 10 15 20 25

Sangre

Traquea

Orina

Orina por sonda

Aspirado traqueal

Rectal

Líquido abdominal

Catéter

Esputo

Lavado bronco-alveolar


Frecuencia por tipo de muestra en UCI adultos. Año 2017

6

Perfiles de resistencia en el servicio de UCI adultos

Tabla No. 2. Perfil de resistencia en Enterobacterias y bacilos Gram negativos no fermentadores en los servicios de UCI adultos. GREBO 2017

A/B: BLEE: Betalactamasa de espectro extendido, SAM: ampicilina sulbactam, TZP: piperacilina/tazobactam, CAZ: ceftazidima, CRO: ceftriaxona, CTX: cefotaxima , CEF: Cefepime , ATM: aztreonam, ERT: Ertapenem, IMP: Imipenem, MEM: Meropenem, DOR: Doripenem, AMK: amikacina, GEN: gentamicina, CIP: ciprofloxacina, SXT: trimetoprim/Sulfametoxazol, COL: colistina.

Tabla No. 3. Perfil resistencia en Gram positivos en los servicios UCI adultos. GREBO 2017

A/B: BLEE: GEN: gentamicina, CIP: ciprofloxacina, SXT: trimetoprim/Sulfametoxazol, OXA: oxacilina, CLI: clindamicina, TE: Tetraciclina, ERI: eritromicina, VAN: vancomicina , AMP: ampicilina, GEH: gentamicina alta carga

n %R n %R n %R n %R n %R n %R n %R n %R n %R n %R n %R n %R n %R n %R n %R n %R n %R n %RK. pneumoniae 364 26 372 44 354 29 399 36 368 36 81 37 398 36 60 37 348 17 398 18 386 15 196 16 388 3.4 399 17 399 15 202 29 315 2.5E. coli 478 16 491 33 398 9.5 532 20 490 20 185 24 532 20 63 16 392 2.3 529 2.1 531 1.7 246 2.4 519 0.2 533 15 533 30 296 44 333 0E. cloacae 29 45 57 23 92 19 88 25 88 25 92 11 10 40 88 9.1 92 8.7 88 10 64 6.2 90 5.6 92 11 92 7.6 27 22 84 2.4S. marcensces 51 75 47 23 82 18 77 34 9 22 88 27 10 0 48 31 88 22 86 20 45 18 87 6.9 88 22 88 10 48 10 53 1.9A. baumannii 52 65 46 74 58 59 45 69 8 38 58 69 58 72 10 50 35 51 50 0 30 3.3P. aeruginosa 204 16 219 17 222 11 32 6.2 210 31 221 26 125 14 219 10 220 14 149 3.4

TIGCTX FEP ATM CIPIPM MEM ETP SXT COLAntibióticos

DOR AMK GENAislamientos BLEE SAM TZP CAZ CRO

n %R n %R n %R n %R n %R n %R n %R n %R n %R n %R n %R269 2.6 268 1.9 269 1.1 269 24 218 2.8 269 0 222 16 269 0 269 0

38 0 38 34 38 63 38 18150 0 152 0.7 152 0.7 146 9.6

AMP GEHAntibióticos

GEN CIP SXT OXA CLI LNZ TE ERI

S. aureusE. faeciumE. faecalis

Aislamientos VAN

7

Frecuencia de microorganismos y distribución por tipo de muestra en hospitalización adultos

0 5 10 15 20


Pseudomonas aeruginosaEnterococcus faecalis

Proteus mirabilisStaphylococcus epidermidis

Candida albicansEnterobacter cloacae

Enterococcus faecium


Frecuencia de microorganismos en hospitalización adultos. Año 2017

0 5 10 15 20

OrinaSangre

Líquido abdominalOrina

Orina con sondaSecreciones

TejidoEsputo

Herida quirúrgica


Frecuencia por tipo de muestra en hospitalización adultos. Año 2017

8

Perfiles de resistencia en el servicio de hospitalización adultos

Tabla No. 4. Perfil de Resistencia en Enterobacterias y bacilos Gram negativos no fermentadores en los servicios de hospitalización adultos. GREBO 2017


Tabla No. 5. Perfil resistencia en Gram positivos en los servicios hospitalización adultos. GREBO 2017


n %R n %R n %R n %R n %R n %R n %R n %R n %R n %R n %R n %R n %R n %R n %R n %R n %R n %RK. pneumoniae 710 27,2 724 50,3 646 35,3 788 39,5 683 36,7 283 44,9 785 39,6 176 55,1 617 24,3 786 23,3 771 24,3 305 22,3 744 4,3 788 14,5 790 16,8 516 30,4 580 2,1E. coli 1845 17,1 2008 29.1 1733 5,8 23906 17 2017 17,1 931 18,7 2302 17,1 469 16,2 1673 1,2 2266 1,2 2280 1,5 469 16,2 2233 0,7 2309 14,6 2313 28 1767 28 1412 0E. cloacae 109 45,9 161 19,3 218 25,2 196 31,6 57 31,6 218 12,4 44 18,2 186 8,6 220 7,7 214 10,7 107 7,5 214 7,5 220 13,6 220 10,5 119 21,9 182 2,2S. marcensces 54 77,8 63 23,8 126 12,7 112 22,3 30 43,3 128 13,3 20 45 60 11,7 127 7,9 128 6,2 69 4,3 126 7,1 127 14,2 128 10,9 62 8,1 80 1,2A. baumannii 25 48 18 77,8 27 51,9 20 65 2 100 26 65,4 28 57,1 4 50 6 33,3 28 53,6 23 50 13 0P. aeruginosa 521 13,6 549 16,8 546 11 93 5,4 515 23,5 543 21 291 12,7 526 12,7 545 16,1 369 3,8

CIP SXT TIG COLIPM MEM ETP DOR AMK GENAntibióticos

Aislamientos BLEE SAM TZP CAZ CRO CTX FEP ATM

n %R n %R n %R n %R n %R n %R n %R n %R n %R n %R n %R731 2,7 724 2,6 729 1,2 732 32,5 608 4,3 733 0,3 565 14,5 733 16,1 729 0.1

113 0,0 116 36 115 72.2 106 20410 0,7 414 0,7 412 1,2 406 14.8E. faecalis

S. aureusE. faecium

LNZ TE ERI VAN AMP GEHAislamientos GEN CIP SXT OXA CLIAntibióticos

9

Frecuencia de microorganismos y distribución por tipo de muestra en UCI pediátrica

0 5 10 15 20


Staphylococcus epidermidisHaemophilus influenzae

Pseudomonas aeruginosaEnterobacter cloacae

Streptococcus pneumoniaeStaphylococcus hominis

Candida albicans


Frecuencia de microorganismos UCI pediátrica. Año 2017

0 5 10 15 20

Sangre

Aspirado traqueal

Orina

Traqueal

Rectal

Catéter

Orina, sonda

Heces

Lavado bronco-alveolar


Frecuencia por tipo de muestra UCI pediátrica. Año 2017

10

Perfiles de resistencia en el servicio de UCI pediátrica

Tabla No. 6. Perfil de Resistencia en Enterobacterias y bacilos Gram negativos no fermentadores en los servicios de UCI pediátrica. GREBO 2017


Tabla No. 7. Perfil de Resistencia en Gram positivos en los servicios de UCI pediátrica. GREBO 2017


n %R n %R n %R n %R n %R n %R n %R n %R n %R n %R n %R n %R n %R n %R n %R n %R n %R n %RK. pneumoniae 100 32 96 54,2 92 30,4 109 32,1 107 32,7 22 50 110 32,7 8 37,5 90 6,7 107 7,5 107 8,4 60 5 108 2,8 110 19,1 110 10 50 28 74 2,7E. coli 149 19,5 129 41,1 137 8,8 174 21,3 161 23 49 20,4 174 21,8 20 10 134 1,5 167 1,8 162 1,2 36 4,3 171 0 174 20,1 173 16,8 127 44,9 90 0E. cloacae 16 25 43 7 45 15,6 42 21,4 5 20 45 2,3 3 0 42 2,4 45 4,4 44 2,3 28 3,6 45 2,2 25 2,2 45 0 18 11,1 38 5,3S. marcensces 11 72,7 12 8,3 25 12 24 29,2 3 33,3 25 12 3 33,3 12 8,3 25 4 25 5 11 0 25 8 25 8 25 4 14 7,1 19 5,3A. baumannii 11 45,5 14 35,7 14 35,7 11 36,4 2 50 14 35,7 14 35,7 7 28,6 9 22,6 14 28,6 9 11,1 9 11,1P. aeruginosa 52 5,8 57 14 56 8,9 6 16,7 50 30 57 15,8 29 6,9 57 5,3 57 5,3 40 0



n %R n %R n %R n %R n %R n %R n %R n %R n %R n %R n %R109 2,8 108 1,9 110 3,6 110 30 109 2,8 110 0 64 26,6 110 20 110 0

12 0 12 83,3 12 91,7 12 033 0 33 3 33 3 31 9,7E. faecalis

S. aureusE. faecium

LNZ TE ERI VAN AMP GEHAislamientos GEN CIP SXT OXA CLIAntibióticos

11

Frecuencia de microorganismos y distribución por tipo de muestra en UCI neonatal

0 5 10 15 20

Staphylococcus epidermidis

Escherichia coli

Klebsiella pneumoniae

Staphylococcus aureus

Enterococcus faecalis

Enterobacter cloacae

Staphylococcus hominis

Klebsiella oxytoca

Proteus mirabilis

Candida albicans

Porcentaje (%)n=523

Frecuencia de microorganismos en UCI neonatal. Año 2017

0 5 10 15 20

SangreOrinaOjos

Orina con sondaRectalHeces

CatéterTraqueal

Aspirado traqueal

Porcentaje (%)n=472

Frecuencia por tipo de muestra UCI neonatal. Año 2017

12

Perfiles de resistencia en el servicio de UCI neonatal

Tabla No. 8. Perfil de Resistencia en Enterobacterias y bacilos Gram negativos no fermentadores en los servicios de UCI

neonatal. GREBO 2017

A/B: BLEE: Betalactamasa de espectro extendido, SAM: ampicilina sulbactam, TZP: piperacilina/tazobactam, CAZ: ceftazidima, CRO: ceftriaxona,

CTX: cefotaxima , CEF: Cefepime , ATM: aztreonam, ERT: Ertapenem, IMP: Imipenem, MEM: Meropenem, DOR: Doripenem, AMK: amikacina,

GEN: gentamicina, CIP: ciprofloxacina, SXT: trimetoprim/Sulfametoxazol, COL: colistina. * no se pudo calcular por el escaso numero de aislamientos

Tabla No. 9. Perfil de Resistencia en Gram positivos en los servicios de UCI neonatal. GREBO 2017

A/B: BLEE: GEN: gentamicina, CIP: ciprofloxacina, SXT: trimetoprim/Sulfametoxazol, OXA: oxacilina, CLI: clindamicina, TE: Tetraciclina, ERI: eritromicina,

VAN: vancomicina , AMP: ampicilina, GEH: gentamicina alta carga *no se pudo calcular por el escaso numero de aislamientos

n %R n %R n %R n %R n %R n %R n %R n %R n %R n %R n %R n %R n %R n %R n %R n %R n %R n %RK. pneumoniae 35 17,1 38 26,3 33 12,1 41 19,5 38 21,1 12 25 41 19,5 5 20 32 3,1 41 4,9 40 5 18 11,1 41 0 41 9,8 41 4,9 27 43 26 0E. coli 78 12,8 92 20,7 76 0 100 12 85 1,8 42 14,3 100 13 23 13 77 0 100 0 99 0 23 0 100 0 101 11,9 101 22,8 80 4 68 2,7E. cloacae 10 40 16 12,5 21 9.5 20 15 8 12,5 22 9,1 3 33,3 13 0 21 0 21 4,8 7 0 21 0 22 18,2 22 0 17 12 13 0S. marcensces * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * *A. baumannii * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * *P. aeruginosa * * * * * * * * * * * * * * * * * * * *

Antibióticos

Aislamientos BLEE SAM TZP CAZ CRO CTX FEP ATM IPM MEM ETP DOR AMK GEN CIP SXT TIG COL

n %R n %R n %R n %R n %R n %R n %R n %R n %R n %R n %R40 5 40 5 40 7,5 40 27,5 38 2,6 40 0 18 16,7 40 22,5 124 0

* * * * * * * *29 3,4 30 3,3 30 0 30 16,7

Antibióticos

E. faecalis

GEH

S. aureusE. faecium

CLI LNZ TE ERI VAN AMPAislamientos GEN CIP SXT OXA

13

Frecuencia de microorganismos y distribución por tipo de muestra en Hospitalización pediátrica

0 5 10 15 20

Escherichia coliStaphylococcus aureusKlebsiella pneumoniae

Staphylococcus epidermidisPseudomonas aeruginosa

Proteus mirabilisStaphylococcus hominis

Enterobacter cloacaeCandida albicans

Enterococcus faecalis


Frecuencia microorganismos Hospitalización pediátrica. Año 2017

0 5 10 15 20

OrinaSangre

Orina, chorro medioHeces

Líquido abdominalTejido

CatéterRectal

Aspirado traquealSecreciones

Porcenaje (%)n=2176

Frecuencia por tipo de muestra hospitalización pediátrica. Año 2017

14

Perfiles de resistencia en el servicio hospitalización pediátrica

Tabla No. 10. Perfil de Resistencia en Enterobacterias y bacilos Gram negativos no fermentadores en los servicios de hospitalización pediátrica GREBO 2017

A/B: BLEE: Betalactamasa de espectro extendido, SAM: ampicilina sulbactam, TZP: piperacilina/tazobactam, CAZ: ceftazidima, CRO: ceftriaxona, CTX: cefotaxima , CEF: Cefepime , ATM: aztreonam, ERT: Ertapenem, IMP: Imipenem, MEM: Meropenem, DOR: Doripenem, AMK: amikacina, GEN: gentamicina, CIP: ciprofloxacina, SXT: trimetoprim/Sulfametoxazol, COL: colistina. * no se pudo calcular por el escaso numero de aislamientos

Tabla No. 11. Perfil de Resistencia en Gram positivos en los servicios de hospitalización pediátrica GREBO 2017

A/B: BLEE: GEN: gentamicina, CIP: ciprofloxacina, SXT: trimetoprim/Sulfametoxazol, OXA: oxacilina, CLI: clindamicina, TE: Tetraciclina, ERI: eritromicina, VAN: vancomicina , AMP: ampicilina, GEH: gentamicina alta carga *no se pudo calcular por el escaso numero de aislamientos

n %R n %R n %R n %R n %R n %R n %R n %R n %R n %R n %R n %R n %R n %R n %R n %R n %R n %RK. pneumoniae 156 39,7 154 60,4 125 35,2 168 44 150 42 64 51,6 168 44 25 72 121 16,5 167 15,6 161 16,8 67 6 163 2,5 168 14,9 168 14,9 121 24,2 105 2,9E. coli 778 10,3 737 34,1 527 2,8 911 10,1 805 10,6 505 9,9 903 10,1 143 9,1 508 0,2 892 0,2 894 0,4 135 0 894 0,2 911 18,6 911 14,1 805 45,2 348 0E. cloacae * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * *S. marcensces 6 66,7 9 22,2 22 13,6 20 15 5 20 22 13,6 3 33,3 8 37,5 22 13,6 22 13,6 13 0 22 0 22 13,6 22 4,5 22 13,6 18 0A. baumannii 10 30 11 45,5 11 27,3 10 30 1 0 5 20 11 45,5 5 20 6 50 11 27,3 10 0 10 0P. aeruginosa 95 10,5 113 8 112 3,6 9 22,2 92 14,1 113 9,7 58 6,9 112 1,8 113 3,5 75 0



n %R n %R n %R n %R n %R n %R n %R n %R n %R n %R n %R307 1,3 306 0,3 307 0,7 307 40,7 258 2,7 307 0,3 306 11,1 307 11,1 306 0

17 0 17 35,3 17 70,6 16 12,544 0 43 0 44 0 41 4,9E. faecalis

S. aureusE. faecium

LNZ TE ERI VAN AMP GEHAntibióticos

Aislaminetos GEN CIP SXT OXA CLI

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Grupo GREBO

Aura Lucía Leal Castro

Médico especialista en Microbiología y parasitología médica. Master of Science in Disease Control. Docente del Departamento de Microbiología Facultad de Medicina Universidad Nacional de Colombia. Coordinadora del Grupo de Investigación en Enfermedades Infecciosas de la Universidad Nacional de Colombia y el sistema Nacional de Ciencia y Tecnología, Colciencias. Fundadora y directora GREBO

María Victoria Ovalle Guerrero

Bacterióloga, Especialista en Epidemiología. Coordinadora Laboratorio GREBO.

Valeri Sáenz Moncaleano

Médico especialista en Microbiología médica. Magister en Ciencias Microbiología. Especialista en Bioética. Investigador asociado GREBO

Olga Lucía Segura

Secretaria Grupo GREBO

Otras ciudades

Manizales: Clínica la Presentación Manizales, Clínica Versalles. Neiva : Hospital Departamental Hernando Moncaleano Perdomo E.S.E. Tunja: Hospital San Rafael de Tunja E.S.E Cundinamarca: Hospital San Rafael de Facatativá Popayán: Hospital Susana López

Bogotá

-Fundación Cardio Infantil

-Fundación Santafé de Bogotá

-SubRed Sur occidente: Hospital de Kennedy, Hospital de Fontibón

-Hospital Simón Bolívar

-Clínica Colsubsidio Orquídeas

-Clínica Infantil Colsubsidio

-Hospital Fundación la Misericordia

-Hospital Militar Central

-Hospital Universitario Nacional de Colombia

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Próximamente encontrarás el análisis de percentiles de marcadores de resistencia 2017 y las tendencias de los principales

marcadores de resistencia 2010-2017 en nuestra página web: www.grupogrebo.org

Boletín Informativo - GREBO – Grupo para el control de la Resistencia Bacteriana de ... · 2019....

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