INSTITUTO POLITÉCNICO NACIONAL CENTRO DE BIOTECNOLOGÍA GENÓMICA

Año 2012 Vol. 4

Dra. Yoloxóchitl Bustamante Díez

Directora General del Instituto Politécnico Nacional

Dr. Juan Manuel Cantú Vázquez Secretario General

Dr. Jaime Álvarez Gallegos Secretario de Investigación y Posgrado

Dra. Ninfa María Rosas García Directora del Centro de Biotecnología

Genómica

Dr. Gildardo Rivera Sánchez Encargado de la Subdirección Académica

y de Investigación

C.P. Ma. del Carmen Quiroz Herrera Subdirectora Administrativa

1.- Directorio - Contenido 2.- Mensaje de nuestra Directora 3.- Artículos Científicos 4.- Capítulos de Libros 5.- Congresos y Simposios 6.- Premios y Reconocimientos 7.- Eventos Académicos 8.- Eventos de Difusión 9- Avisos

Portada Contraportada

Estimados compañeros y alumnos del CBG, estamos terminando un ciclo escolar con gran entusiasmo y esfuerzo, esto se ve reflejado en la gran variedad de actividades académicas y científicas que hemos realizado y que ahora culminan de manera exitosa. Extiendo mi más sincera felicitación a la alumna Ana Laura Lara Rivera y al Dr. Jesús Gerardo García Olivares y a sus asesores por el merecido reconocimiento que otorgó la Academia Tamaulipeca de Investigación Científica y Tecnológica, A.C. a sus trabajos de tesis. Así como también envío una calurosa felicitación a los alumnos graduados de la generación 2010-2012 a quienes además les deseo éxitos en lo que ahora emprendan. Ahora que inicia nuestro periodo vacacional quiero desearles a todos unas felices vacaciones, reparadoras, reconfortantes y muy merecidas y que podamos regresar todos a nuestros trabajos llenos de energía y entusiasmo para iniciar un nuevo ciclo de actividades académicas y científicas enriquecedoras y fructificantes.

Dra. Ninfa María Rosas García

Molecular characterization and antifungal susceptibility of the Candida parapsilosis species complex of clinical isolates from

Monterrey, Mexico

1Treviño-Rangel RD, 1Garza-González E, 1González JG, 2Bocanegra-García V, 1Llaca JM, 1González GM

1 Departamento de Microbiología, Facultad de Medicina, Universidad Autónoma de Nuevo León , Monterrey, Nuevo

León, México 2 Centro de Biotecnología Genómica del IPN

Journal of Medical Mycology 2012 Apr 12

Abstract

Recently, it was proposed that the opportunistic yeast pathogen Candida parapsilosis was a complex composed of the following three species: Candida parapsilosis sensu stricto, Candida orthopsilosis, and Candida metapsilosis. A set of 344 clinical isolates of Candida parapsilosis from Monterrey, Mexico was re-identified by RFLP. Their antifungal susceptibility to fluconazole, caspofungin, anidulafungin and micafungin was determined using the Clinical and Laboratory Standards Institute M27-A3 protocol. Candida parapsilosis sensu stricto was the most frequent species, and was the only one which showed resistance to antifungals.

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Recent advances in antitubercular natural products

1Garcia, A, 2Bocanegra-Garcia, V, 1Palma-Nicolas, JP, 2Rivera, G,

1 Departamento de Microbiología, Facultad de Medicina, Universidad Autónoma de Nuevo León , Monterrey, Nuevo León, México

2 Centro de Biotecnología Genómica del IPN

European Journal of Medicinal Chemistry 2012 Mar,49:1-23

Abstract

Currently, one third of the world’s population is infected with Mycobacterium tuberculosis and 8.9–9.9 million new and relapse cases of tuberculosis are reported every year. The emergence of new cases, the increased incidence of multi-drug resistant strains of Mycobacterium tuberculosis, and the adverse effects of first and second-line antituberculosis drugs have led to renewed research interest in natural products in the hope of discovering new antitubercular leads. Interestingly, hundreds of natural products, possessing novel, uncommon, and known structural architectures, have been reported to exhibit activity towards non-resistant and multi-drug resistant strains of Mycobacterium tuberculosis. The present review covers literature published during the last five years about those

naturally occurring compounds with reported growth inhibitory activity in vitro towards sensitive and resistant Mycobacterium tuberculosis strains. Compounds with antitubercular properties at minimal inhibitory concentrations (MICs) of less than 50 μg/mL or 60 μM were selected and grouped according to their source of origin (plants, bacteria, fungi, marine organisms, etc) and chemical type (terpenes, steroids, alkaloids, flavonoids, poliketides, peptides, etc). In some cases, the selection covers those structurally relevant natural products with low bioactivity (MICs of ≤128 μg/mL), and also those semisynthetic derivatives with remarkable antitubercular activity (MICs of ≤10 μg/mL). Additionally, this review includes a special section for those natural products that specifically target genes or enzymes of Mycobacterium tuberculosis.

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Análisis del Comportamiento de Cryptolaemus montrouzieri Mulsant durante el Proceso de Depredación de la Cochinilla Rosada

del Hibisco en Campo

1Jesús M. Villegas-Mendoza, 1Gildardo Rivera, y 1Ninfa M. Rosas-García

1 Centro de Biotecnología Genómica del IPN Laboratorio de Biotecnología Ambiental

Southwestern Entomologist Jun. 2012 Vol. 37, No. 2

Resumen Cryptolaemus montrouzieri Mulsant (Coleoptera: Coccinellidae) es un depredador ampliamente utilizado para el control de poblaciones de plagas de cochinilla rosada del hibisco (CRH) Maconellicoccus hirsutus (Green). El estudio sobre el comportamiento de Cryptolaemus montrouzieri durante el proceso de depredación de la CRH, se realizó en campo en el Estado de Nayarit, México, en árboles de majahua (Hibiscus pernambucensis). Los resultados mostraron que el depredador realiza tres eventos

conductuales principales correspondientes a las actividades de búsqueda, manejo y copulación con tiempos definidos para cada evento, con una duración total de 106 min y de un 83-100% de depredación sobre la población existente de cochinilla rosada. Dichos eventos conductuales dependen de la densidad de la plaga y de la etapa de desarrollo de la misma, por lo que el conocimiento detallado de este proceso puede ser de utilidad para planear aplicaciones más eficientes de este depredador contra la CRH.

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Capítulo de Libro

Analysis of Protein Interaction Networks to Prioritize Drug Targets of

Neglected-Diseases Pathogens

1,5Aldo Segura-Cabrera, 1Carlos A. García-Pérez, 2Mario A. Rodríguez-Pérez, 2Xianwu Guo, 3Gildardo Rivera and 4Virgilio Bocanegra-García

1Laboratorio de Bioinformática ,2Laboratorio de Biomedicina Molecular, 3Laboratorio de Biotecnología Ambiental

4 Laboratorio de Medicina de Conservación, Centro de Biotecnología Genómica, Instituto Politécnico Nacional 5U.A.M. Reynosa Aztlán, Universidad Autónoma de Tamaulipas, Reynosa México

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Introduction Many technological, social and biological systems have been modeled in terms of large networks providing invaluable insight in the understanding of such systems. Systems biology is an emerging and multi-disciplinary discipline that studies the interactions of cellular components by treating them as part of an integrated system. Thus, systems biology has shown that functional molecules are involved in complex networks of interrelationships, and that most of the cellular processes depend on functional modules rather than isolated components. Large amounts of biological network data of different types are available, e.g., protein-protein interaction, transcriptional regulatory,

signal transduction, and metabolic networks. Since proteins carry out most biological processes, the protein interaction networks (PINs) are of particular importance. The advancement of the functional genomics and systems biology of model organisms such as Saccharomyces cerevisiae, Caenorhabditis elegans, and Drosophila melanogaster has contributed to the development of experimental and computational methods, and also to the understanding of human complex diseases. The availability of these methods has facilitated systematic efforts at creating largescale data sets of protein interactions, which are modeled as PINs.

3ª Jornada Científica del Doctorado en Ciencias en Biotecnología

Del 16 al 18 de Mayo del 2012 se llevo a cabo en la Cd. de Durango la 3ª Jornada Científica del Doctorado en Biotecnología. Con la participación de: Laboratorio de Biotecnología Industrial Dra. Claudia Patricia Larralde Corona Dr. José Alberto Narváez Zapata Laboratorio de Medicina de Conservación Dr. Miguel Ángel Reyes López Laboratorio de Biotecnología Animal Dr. Gaspar Manuel Parra Bracamonte Alumnos de Doctorado en Ciencias en Biotecnología Regulo Ruíz Salazar Francisco de la Torre González Elizabeth Hernández Mota María Fernanda Jiménez Becerril Ana Laura Lara Rivera María de Jesús López López Luis Alberto Meza García Víctor Inocencio Pacheco Contreras Javier Alfonso Garza Hernández Lihua Wei Wei

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Los días 24 y 25 de mayo de 2012 se llevo a cabo el 24° Encuentro Nacional de Investigación Científica y Tecnológica del Golfo de México, con sede en el Centro de Bachillerato Tecnológico agropecuario No. 12 (CBTa. 12), en Tampico, Tamaulipas.

El Dr. Jesus Gerardo Garcia Olivares participó en dicho encuentro con 2 temas: 1.- Reacción a Macrophonina phaseolina bajo condiciones de invernadero en líneas avanzadas de frijol común. 2.- Estimación de la estabilidad y evaluación agronómica y fisiológica de germoplasma de frijol común, seleccionado por rendimiento de grano y daño por Macrophomina phaseolina.

El Dr. Víctor Ricardo Moreno Medina presentó el tema : 1.- Metabolitos producidos por estrés salino en Macrophomina phaseolina spp.

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Taller del CONAGREN

El 23 de Mayo la Dra. Ana Ma. Sifuentes Rincon y el Dr. Gaspar Manuel Parra Bracamonte asistieron al Taller del CONAGREN denominado “ Avances en las herramientas de selección de ganado “ y reunión del Comité Técnico de la Asociación Charoláis Herdbookde México en Guadalupe , N.L. México.

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En el marco del “ XXIV Encuentro Nacional de Investigación Científica y Tecnológica del Golfo de México “. La Academia Tamaulipeca de Investigación Científica y Tecnológica, A.C. otorgó

los siguientes Premios a mejor tesis en sus respectivas áreas a:

Premio a la mejor Tesis en el Área de Ciencias Agrícolas, Nivel Doctorado

al Dr. Jesús Gerardo García

Olivares

Teniendo como Asesores de Tesis a Dr. Francisco Zavala García y Dr.

Netzahualcoyotl Mayek Pérez

Premio a la mejor Tesis en el Área de Biotecnología Genómica,

Nivel Maestría

Ana Laura Lara Rivera

Teniendo como Asesores de Tesis a Dr. Miguel Ángel Reyes

López y Dr. José Alberto Narváez Zapata

Muchas Felicidades ! ! ! !

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En este trimestre se llevaron a cabo los Seminarios Departamentales por cada uno de los Laboratorios de Investigación de nuestro Centro,

cumpliendo así con el programa de la Maestría en Ciencias de Biotecnología Genómica

Laboratorio de Medicina de Conservación

Laboratorio de Biotecnología Vegetal

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Laboratorio de Biotecnología Industrial

Laboratorio de Biotecnología Ambiental

Laboratorio de Bioinformática

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El 06 de Junio se dio inicio el ciclo de seminarios de la materia Tópicos Selectos de Biotecnología por parte de los alumnos del segundo

semestre de la Maestría en Biotecnología Genómica

• Alma Gabriela Trejo Tapia "Genética del Comportamiento en Ganado Bovino“

• Stephanie Viridiana Laredo Tiscareño "Estructura y función del genoma del virus del Dengue“

• Casandra Treviño Quintero "El frijol común factores que afectan la productividad“

•Nubia Andrea Villota Salazar "El código Epigenetico”

•Lourdes Vital López Rizobacterias promotoras del crecimiento vegetal (PGPR

•Elsa Verónica Herrera Mayorga "Spodoptera frugiperda. Biotipos”

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• Hadassa Yuef Martínez Padrón "Las aflatoxinas en México: problemática y perspectivas”

• Tamar Sarai Garza Romero "Bases genéticas y bioquímicas de la tolerancia al estrés osmótico en el hongo fitopatógeno Machrophomina phaseolina“

• Isela Madai Alba Moreno "Compuestos naturales: La base para el desarrollo de Insecticidas Biológicos novedosos”

•Ricardo Calderón Marcial "Métodos de tipificación de Mycobacterium tuberculosis"

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El 11 de Junio se dio inicio a Seminarios Terminación de TESIS MAESTRÍA EN CIENCIAS EN BIOTECNOLOGÍA GENÓMICA

(Generación 2010-2012)

Nadia Diana Guido Cira

Tema de Tesis: Combinación de toxinas Cry de Bacillus thuringiensis y un baculovirus para el desarrollo de un bioinsecticida de amplio espectro

Comité de Tesis: Director Dra. Ninfa María Rosas García Dr. José Alberto Narváez Zapata Dr. Miguel Ángel Reyes López Dr. Xianwu Guo M.C. Alejandro Sánchez Varela Dr. José Luís Hernández Mendoza (Suplente)

Pascuala Ambriz Morales

Tema de tesis: Secuenciación y análisis del genoma mitocondrial de subespecies de venado cola blanca (Odocoileus virginianus)

Comité de Tesis: Director M.C. Xochitl Fabiola de la Rosa Reyna Director Dr. Gaspar Manuel Parra Bracamonte Dra. Ana María Sifuentes Rincón Dr. Omar Chassin Dr. Xianwu Guo M.C. Cristian Lizarazo Ortega (suplente)

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María Dolores Hernández Ramos

Tema de Tesis: "Clasificación molecular y análisis estructural de las quitinas sintasas” Comité de Tesis: Director Dr. Juan Manuel González Prieto Director M.C. Aldo Segura Cabrera Dr. Xianwu Guo M.C. Sanjuana Hernández Delgado Dr. Raymundo Rosas Quijano M.C. Erick De Jesús De Luna Santillana (Suplente)

José Alberto González Reyes

Tema de Tesis: Análisis metagenómico de hongos en suelos cultivados con maíz en el norte de Tamaulipas

Comité de Tesis: Director Dr. José Luís Hernández Mendoza Director: Dr. Homar René Gill Langarica M.C. Sanjuana Hernández Delgado Dr. Raymundo Rosas Quijano Dr. Juan Manuel González Prieto Dr. Miguel Ángel Reyes López (Suplente)

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Alejandro Díaz Isabal

Tema de Tesis: Caracterización de poblaciones bacterianas en suelos cultivados con maíz en el Norte de Tamaulipas

Comité de Tesis: Director Dr. José Luís Hernández Mendoza Director: M.C. Sanjuana Hernández Delgado Dr. Raymundo Rosas Quijano M.C. Cristian Lizarazo Ortega Dr. Miguel Ángel Reyes López M.C. Erick De Jesús De Luna Santillana (Suplente)

Cristian Patricia Cabrales Arellano

Tema de Tesis: Expresión heteróloga de una proteína Cry1 de B. thuringiensis en Yarrowia lipolytica

Comité de Tesis: Director Dr. Raymundo Rosas Quijano Director: M. C. Erick De Luna Santillana Dr. Juan Manuel González Prieto Dr. José Luis Hernández Mendoza Dr. Xianwu Guo M. C. Sanjuana Hernández Delgado (Suplente)

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Niver Iván Tarquí Callejas

Tema de Tesis: Implementación de un sistema de código de barras para la sistematización del cepario de hongos del Laboratorio de Biotecnología Industrial

Comité de Tesis: Director Dra. Claudia Patricia Larralde Corona Codirector Dr. José Alberto Narváez Zapata Dr. Miguel Ángel Reyes López M.C. Cristian Lizarazo Ortega Dr. Víctor Ricardo Moreno Medina Dra. Ana María Sifuentes Rincón (suplente)

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Curso Propedéutico

Del 23 de Abril al 9 de Mayo se impartió Curso Propedéutico para Presentar examen de admisión a la Maestría en Ciencias en Biotecnología

Genómica

El curso se impartió tanto en forma presencial como en línea , los catedráticos que impartieron el curso fueron:

• M. C. Aldo Segura Cabrera • M. C. Maribel Mireles Martínez • M. C. Williams Arellano Vera • Dr. Netzahualcoyotl Mayek Perez • Dr. Virgilio Bocanegra García

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Ceremonia de Graduación de Alumnos de la Maestría en Biotecnología Genómica

Generación 2010 - 2012

El pasado 15 de Junio se llevo a cabo la Ceremonia de Graduación de los Alumnos de la Maestría en Ciencias en Biotecnología Genómica

Generación 2010-2012

En la Ceremonia estuvieron como invitados de honor: • Dr. Diodoro Guerra Rodríguez Secretario de Educación en el Estado de Tamaulipas • Dra. Ninfa María Rosas García Directora del Centro de Biotecnología Genómica • Lic. Francisco Hernández Montemayor Director del Consejo Tamaulipeco de Ciencia, Innovación y Tecnología • Lic. Adolfo Limas Sánchez Titular del Centro Regional de Desarrollo Educativo • Prof. Alfonso Serratos Sánchez Director de Educación del Municipio • Mtro. Jaime Alberto Arredondo Lucio Presidente del Consejo consultivo de Instituciones de Educación Superior en Reynosa • Dr. Gildardo Rivera Sánchez Encargado de la Subdirección Académica del Centro de Biotecnología Genómica

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Como Invitados especiales estuvieron: • Lic. Manuel Peña Leal Director Administrativo de Sedesol • Ing. Martin Santamaría Valdés Director del Centro de Educación Continua Unidad Reynosa • Prof. Pablo Díaz Ramírez Presidente del Comité Interinstitucional de Vinculación Educativa de la Región

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• Pascuala Ambríz Morales • Cristian Patricia Cabriales Arellano • Wilbet Antonio Chi Chim

• Alejandro Díaz Isabal • José Alberto González Reyes • Nadia Diana Guido Cira

Alumnos Graduados

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• María Dolores Hernández Ramos • Augusto Rey Luzuriaga Neira • Alberto Onofre Sánchez Meza

• Niver Iván Tarquí Callejas • Reyna Cristina Zepeda Gurrola

El alumno Alberto Onofre Sánchez Meza obtuvo el mejor promedio de su generación, recibiendo así una ovación por parte del público presente.

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El Ing. Gastón Gonzalez Sepúlveda, represéntate de la Asociación de Egresados del IPN en Reynosa, tuvo a bien realizar el tradicional Huelum ! A lo que toda la concurrencia se unió dando así muestra de nuestro orgullo de ser Politécnicos.

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Al final de la ceremonia se contó con la participación del Mariachi del Instituto Reynosense para la Cultura y las Artes, A.C. Haciendo de la ceremonia una gran fiesta y así los alumnos graduados tengan recuerdos de ese momento inolvidable.

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El 19 de Junio el M. en C. Leandro Alberto Páramo Aguilera presentó su Examen Doctoral para obtener el título de Doctor en Ciencias de la Biotecnología, siendo el primer egresado de este centro del Doctorado en Ciencias.

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Los sinodales del examen de grado fueron:

• Dr. Miguel Ángel Reyes López • Dra. Ninfa María Rosas García • Dr. Xianwu Guo • Dr. Benjamín Otto Ortega Morales • Dr. José Alberto Narvaez Zapata

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Los sinodales del examen de grado dieron al M. en C. Leandro Alberto Páramo Aguilera la MENCION HONORIFICA por su extraordinaria exposición de su tesis de grado de Doctor.

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Después de su exposición y recibiendo ya la Mención Honorifica, el Dr. Leandro Alberto Páramo Aguilera hizo lectura de los agradecimientos de su tesis de grado, fueron palabras emotivas y llenas de sentimiento.

Felicidades Dr. Leandro y feliz regreso a su país !

El pasado 13 de abril se llevo a cabo la reunión con el Dr. Roberto Hernández Hernández,

Director de Vinculación Regional de la Secretaría de Desarrollo Económico y Turismo del Gobierno del Estado de Tamaulipas

En dicha reunión estuvieron presentes los titulares de laboratorios del CBG, con la finalidad de dar a conocer las actividades científicas de nuestro centro.

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Con motivo de la visita a nuestro Centro por parte del

Ing. Jose Alfredo Bernal Segura

Coordinador del Centro de Asistencia de Asesoría Integral del Consejo Tamaulipeco de Ciencia, Innovación y Tecnología (COTACITEC) se llevó a cabo el pasado martes 29 de mayo a las 12:00 horas en el Aula 2 de nuestro Centro, la impartición de una plática informativa acerca de las actividades, convocatorias, asesorías y operaciones que el Consejo realiza, esta plática fue dirigida al personal académico y estudiantes. Además de la plática impartida por el Ing. Bernal Segura, estuvo apoyando y colaborando en el curso de Bionegocios a cargo del Dr. José Luis Hernández Mendoza, con la finalidad de enriquecer el contenido del curso de acuerdo a la experiencia en las temáticas de propiedad

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El pasado 09 de mayo, llevamos a cabo el evento titulado

“PUERTAS ABIERTAS”

Que fue dirigido a los aspirantes a la maestría en ciencias que nuestro centro ofrece, con la finalidad de dar a conocer los planes de posgrado, requisitos de ingreso, nuestro quehacer académico y científico así como dar un recorrido por las instalaciones e informarles acerca de los proyectos y líneas de investigación que hasta ahora manejamos.

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Visita a Laboratorio Biotecnología Animal

Cabe mencionar que tuvimos 6 participantes que nos visitaron de otra localidad con el interés de venir a conocer el centro y la intención de presentar el examen de admisión al día siguiente.

Se contó con la asistencia de 36 estudiantes provenientes de diversas instituciones educativas y localidades de otros estados, las escuelas de donde nos visitaron fueron: • Universidad Autónoma de Tamaulipas • Instituto Tecnológico de Cd. Victoria • Unidad Profesional Interdisciplinaria de biotecnología de IPN • Universidad México Americana del Norte • UAT Aztlán y Rodhe • Universidad del Valle de México • Universidad Autónoma de Nuevo León

Visita a Laboratorio Biotecnología Industrial

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Visita a Laboratorio Planta Microorganismo

Visita a Laboratorio Biotecnología Ambiental

Visita a Laboratorio Biotecnología Vegetal

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Visita a Laboratorio Medicina de Conservación

Visita a Laboratorio de Medicina Molecular

Visita a Bioinformática

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Tuvimos la visita del personal de la

FUNDACIÓN PRODUCE TAMAULIPAS, A.C.

El pasado 17 de mayo en donde estuvieron presentes:

El Presidente, el Gerente, el Coordinador y Coordinador de Proyectos, así como el Secretario de Desarrollo Rural del Estado de Tamaulipas y el Director del Consejo Consultivo de la Región Norte Quienes impartieron una platica de la misión, objetivos y formas de operación de la fundación, así mismo dieron a conocer la problemática existente en el estado. Por nuestra parte, a través de una exposición por cada titular o representante de laboratorio, se dieron a conocer los proyectos y líneas de investigación, de esta manera los visitantes pudieron captar las capacidades e infraestructura con que cuenta el CBG

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Con motivo de la celebración del 76 aniversario del Instituto Politécnico Nacional, el 21 de mayo se llevó a cabo la impartición de la conferencia

“LA HISTORIA DEL IPN”

por la Maestra Decana DRA. CLAUDIA PATRICIA LARRALDE CORONA.

Cabe mencionar que esta conferencia fue dirigida al personal y estudiantes de nuestro centro. Además de la conferencia, se montó una exposición fotográfica titulada “HECHOS HISTÓRICOS DEL IPN”, en donde se compartieron algunos documentales históricos del IPN por el Decanato, así como la exposición de algunas fotografías de eventos, personal y estudiantes del CBG desde su creación.

Blvd. del Maestro s/n esq. Elías Piña, Col. Narciso Mendoza

Cd. Reynosa, Tamaulipas, México. C.P. 88710

Tels. +52 (899) 924-3627 y 925-1656

Tienes algún comentario? giriveras@ipn.mx y/o ccovarrs@ipn.mx