Taxonomía microbiana

Taxonomía

Se define como la ciencia de la clasificación biológica.

Partes de la taxonomía

Clasificación es la organización de los organismos en grupos o taxones en función de sus semejanzas o de su parentesco evolutivo.

Nomenclatura es la rama taxonomía que se ocupa de la asignación de nombres a grupos taxonómicos de conformidad con normas publicadas.

Identificación constituye el lado práctico de la taxonomía, el proceso de determinar que un aislamiento en particular pertenece a un taxón reconocido.

Evolución y diversidad microbiana

Fig 19.1

Fig. 19.2

Fig.19.3

Dominios

Eucarya: organismos eucariotas con lípidos de membrana formados fundamentalmente por acíl diésteres de glicerol y rRNA eucariótico.

Bacteria: células procariotas con rRNa bacteriano y lípidos de membrana constituidos principalmente por diacil diésteres de glicerol

Archaea: procariotas cuyas membranas están compuestas por lípidos isoprenoides del tipo de diéter de glicerol o tetraéter de glicerol y rRNA arqueano.

Rangos taxonómicos

Fig.19.4

Ejemplos de rangos y nombres taxonómicos

Rango EjemploDominio Bacteria

Phylum Proteobacteria

Clase Proteobacteria

Orden Enterobacteriales

Familia Enterobacteriaceae

Genero Shigella

Especie Shigella dysenteriae

Especie

Especie procariótica es una colección de cepas que comparten numerosas propiedades estables y que difieren de forma significativa de otros grupos de cepas.

Especie (Geneoespecie) es una colección de cepas que tienen una composición de G+C similar y uan similitud de un 70% o superior en base a experimentos de hibridación de DNA

Cepa es una población de organismos que desciende de un único organismo o de un aislamiento en cultivo puro.

Biovariedades Morfovariedad Serovariedad

Género es un grupo bien definido de una o más especies que está claramente separada de otros géneros

Sístema binomial

Nombre genérico + epíteto de especie

Escherichia coli

Streptococcus

Enterococcus y Lactococcus

Streptococcus faecalis (Enrococcus faecalis)

Sistema de clasificación

Clasificación fenética: sistema que agrupa los organismos en función de las semejanzas en sus características fenotípicas

Clasificación filogenética: Sistemas basado en relaciones más que en semejanzas generales

Taxonomía numérica

Principales características aplicadas en taxonomía

Características

Clásicas Moleculares

Morfológicas Proteínas

Fisiológicas Acidos nucleícos

Bioquímicas

Ecológicas

Genéticas

Estudio de la filogenia microbiana

Cronómetros moleculares (Zuckerkandl y Pauling, 1965)

Árboles filogenéticos