Taxonomía microbiana
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Taxonomía microbiana
Taxonomía
Se define como la ciencia de la clasificación biológica.
Partes de la taxonomía
Clasificación es la organización de los organismos en grupos o taxones en función de sus semejanzas o de su parentesco evolutivo.
Nomenclatura es la rama taxonomía que se ocupa de la asignación de nombres a grupos taxonómicos de conformidad con normas publicadas.
Identificación constituye el lado práctico de la taxonomía, el proceso de determinar que un aislamiento en particular pertenece a un taxón reconocido.
Evolución y diversidad microbiana
Fig 19.1
Fig. 19.2
Fig.19.3
Dominios
Eucarya: organismos eucariotas con lípidos de membrana formados fundamentalmente por acíl diésteres de glicerol y rRNA eucariótico.
Bacteria: células procariotas con rRNa bacteriano y lípidos de membrana constituidos principalmente por diacil diésteres de glicerol
Archaea: procariotas cuyas membranas están compuestas por lípidos isoprenoides del tipo de diéter de glicerol o tetraéter de glicerol y rRNA arqueano.
Rangos taxonómicos
Fig.19.4
Ejemplos de rangos y nombres taxonómicos
Rango EjemploDominio Bacteria
Phylum Proteobacteria
Clase Proteobacteria
Orden Enterobacteriales
Familia Enterobacteriaceae
Genero Shigella
Especie Shigella dysenteriae
Especie
Especie procariótica es una colección de cepas que comparten numerosas propiedades estables y que difieren de forma significativa de otros grupos de cepas.
Especie (Geneoespecie) es una colección de cepas que tienen una composición de G+C similar y uan similitud de un 70% o superior en base a experimentos de hibridación de DNA
Cepa es una población de organismos que desciende de un único organismo o de un aislamiento en cultivo puro.
Biovariedades Morfovariedad Serovariedad
Género es un grupo bien definido de una o más especies que está claramente separada de otros géneros
Sístema binomial
Nombre genérico + epíteto de especie
Escherichia coli
Streptococcus
Enterococcus y Lactococcus
Streptococcus faecalis (Enrococcus faecalis)
Sistema de clasificación
Clasificación fenética: sistema que agrupa los organismos en función de las semejanzas en sus características fenotípicas
Clasificación filogenética: Sistemas basado en relaciones más que en semejanzas generales
Taxonomía numérica
Principales características aplicadas en taxonomía
Características
Clásicas Moleculares
Morfológicas Proteínas
Fisiológicas Acidos nucleícos
Bioquímicas
Ecológicas
Genéticas
Estudio de la filogenia microbiana
Cronómetros moleculares (Zuckerkandl y Pauling, 1965)
Árboles filogenéticos