Post on 11-Aug-2020
• nCoV-2019 ahora es SARS-CoV-2
• La enfermedad causada por él es ahora COVID-19
Introducción
• Virus de ARN envueltos
• Zoonóticos (otrosmamíferos)
• Habitualmente, enfermedad leve
Biología
• Descubiertos en 1965• Por Tyrrell y Bynoe en el Reino Unido
• Cobraron importancia hasta 2003 con el SARS• Anteriormente mayor interés veterinario
• Capacidad de transmisión inter-especies
Pediatr Infect Dis J 2005;24: S223–S227)
Biología
• Poseen el genoma más grandeentre los virus ARN
• 26.2 31.7 kb
• La envoltura tiene al menos 3 proteínas
• Proteína de membrana (M)
• Proteína de envoltura (E)
• Proteína de los picos(espiga/spike) (S)
• Algunos tienen una esterase de hemaglutinina (HE)
Viruses 2012, 4, 1011-1033; doi:10.3390/v4061011
Receptores
• La proteína de los picos le permite la unión a células, a través de receptores no muy conservados
• MERS-CoV – DPP4
• Linaje SARS-CoV – ACE2
bioRxiv preprint first posted online Jan. 22, 2020; doi: http://dx.doi.org/10.1101/2020.01.22.915660.
Capacidad mutagénica
• Diversidad importante
• Baja fidelidad de la ARN polimerasadependiente de ARN
• Genera alrededor de 10−3 a 10−5
sustituciones por sitio por año
• El gran tamaño y la estrategia de replicación del genoma del coronavirus también permite la recombinaciónhomóloga frecuente
• Proceso que permite el intercambio de material genéticodurante la coinfección
Viruses 2012, 4, 1011-1033; doi:10.3390/v4061011
Sin embargo…
• En SARS-CoV
• Sistema de revisión de lectura y corrección de inserciones erróneas
• Proteína no estructural 14/Proteína no estructural 10
• Resistencia a Ribavirina
Wuhan
Coronavirus
Coronavirus
humanos
frecuentes
229E
SARS
MERS
HKU1
NL63
OC43
229E
NL63
OC43
HKU1
Otros
coronavirus
humanos
2019-nCoV
MERS-CoV
2019-nCoV SARS-CoV
Clasificación y patógenos humanos
Int J Infect Dis 2013;17(7):e510-7
Coronavirus: patógenos habituales
SARS-CoV-2
• Familia Coronaviridae
• Subfamilia Orthocoronaviridae
• Género Betacoronaviridae
• Virus ARN
• ARN monocatenario positivo
• Causante de la COVID-19
https://doi.org/10.1101/2020.02.07.937862 doi: bioRxiv preprint
Origen y transmisión
• Se cree que tiene origen zoonótico• Similar a lo ocurrido con SARS-CoV y MERS-CoV• Probable intermediario (serpientes descartado, ¿pangolín?)• Una vez establecida la transmisión entre humanos, no se
requiere de intermediarios
• Transmisión persona a persona sospechada• Gotas respiratorias• No de gran relevancia por asintomáticos hasta el momento,
pero posible
MMWR, 5/Feb/2020
Transmisión
• Principalmente por contacto y gotas• Potencial transmisión por superficie
ocular
• Implementar medidas de precaución, adicionando protección ocular
• ¿Transmisión fecal-oral?• Manejo de excretas de tal forma que
no se produzcan aerosoles
Lancet. 2020 Feb 6:S0140-6736(20)30313-5.
Li Wenliang - Oftalmólogo
¿Dos tipos actualmente?On the origin and continuing evolution of SARS-CoV-2. Xiaolu Tang, Changcheng Wu, Xiang Li, Yuhe Song, Xinmin Yao, Xinkai Wu, YuangeDuan, Hong Zhang, Yirong Wang, Zhaohui Qian, Jie Cui, JianNationalScience Review, nwaa036, https://doi.org/10.1093/nsr/nwaa036 Lu. 03-mar-2020
• Los análisis genéticos de la población de 103 genomas de SARS-CoV-2 indicaron que estos virus evolucionaron en dos tipos principales (designados L y S)
• La intervención humana pudo haber ejercido una presión selectiva más fuerte sobre el tipo L, que podría ser más agresivo y extenderse más rápidamente. Por otro lado, el tipo S, es evolutivamente más antiguo y menos agresivo
Response to “On the origin and continuing evolution of SARS-CoV-2”
Oscar A. MacLean*, Richard Orton, Joshua B. Singer, David L. Robertson.
MRC-University of Glasgow Centre for Virus Research (CVR).
• Esta crítica se refiere a la afirmación de que hay dos "tipos principales" claramente definibles de SARS-CoV-2 en este brote y que tienen tasas de transmisión diferenciables.
• “Dados los defectos en el análisis, creemos que Tang et al. deben retractarse de su artículo, ya que las afirmaciones hechas en él son claramente infundadas y corren el riesgo de difundir información errónea peligrosa en un momento crucial del brote.”
Numeralia
Actualización al 10/marzo/2020:
• 113,702 casos confirmados globalmente
• China:
• 80,924 confirmados, 3140 muertes (3.9%)
• Otros países:
• 32,778 confirmados, 872 muertes (%)
• 109 países
WHO Situation Report #55, 10/Mar/2020
Curva Epidémica, identificados fuera de China, exposición
WHO Situation Report #55, 10/Mar/2020
WHO Sit Report 55 10mar2020
COVID-19: Panorama Nacional, al 10/03/2020
De los SIETE casos CONFIRMADOS seobserva:
• Cinco son hombres (71.4%)
• Mediana de edad: 41 años (19-71 años).
• Los siete casos con evolución satisfactoria ysintomatología leve.
• El CONTACTO de un caso confirmado,residente del Estado de México, conresultado POSITIVO a SARS-CoV-2, continuaconsiderándose como PORTADOR almantenerse sin presencia de signos ysíntomas de la enfermedad.
234Total de casos
NEGATIVOS
7Total de casos confirmados
37Total de casos Sospechosos
Fuente: SSA(SPPS/DGE/DIE/InDRE/Informe técnico.COVID-19 /Mexico-10 de marzo 2020 (corte 13:00hrs)
Fuente: SSA(SPPS/DGE/DIE/InDRE/Informe técnico. COVID-19 /Mexico-10 de marzo 2020 (corte 13:00hrs)
COVID-19: Seguimiento Contactos, al 10/03/2020
CASOS CONFIRMADOS A COVID-19
# CASO CIUDAD NÚMERO DE CONTACTOS
SINTOMAS
SI NO1 CDMX/INER 39 0 392 CDMX/GAM 64 0 643 SINALOA 8 0 84 COAHUILA 15 0 155 CHIAPAS 25 0 256 EDO MEX 2 1 17 CDMX 24 2 22
Total 177 3 174Fecha: 10/03/2020
Hora:15 hrs