• nCoV-2019 ahora es SARS-CoV-2

• La enfermedad causada por él es ahora COVID-19

Introducción

• Virus de ARN envueltos

• Zoonóticos (otrosmamíferos)

• Habitualmente, enfermedad leve

Biología

• Descubiertos en 1965• Por Tyrrell y Bynoe en el Reino Unido

• Cobraron importancia hasta 2003 con el SARS• Anteriormente mayor interés veterinario

• Capacidad de transmisión inter-especies

Pediatr Infect Dis J 2005;24: S223–S227)

Biología

• Poseen el genoma más grandeentre los virus ARN

• 26.2 31.7 kb

• La envoltura tiene al menos 3 proteínas

• Proteína de membrana (M)

• Proteína de envoltura (E)

• Proteína de los picos(espiga/spike) (S)

• Algunos tienen una esterase de hemaglutinina (HE)

Viruses 2012, 4, 1011-1033; doi:10.3390/v4061011

Receptores

• La proteína de los picos le permite la unión a células, a través de receptores no muy conservados

• MERS-CoV – DPP4

• Linaje SARS-CoV – ACE2

bioRxiv preprint first posted online Jan. 22, 2020; doi: http://dx.doi.org/10.1101/2020.01.22.915660.

Capacidad mutagénica

• Diversidad importante

• Baja fidelidad de la ARN polimerasadependiente de ARN

• Genera alrededor de 10−3 a 10−5

sustituciones por sitio por año

• El gran tamaño y la estrategia de replicación del genoma del coronavirus también permite la recombinaciónhomóloga frecuente

• Proceso que permite el intercambio de material genéticodurante la coinfección

Viruses 2012, 4, 1011-1033; doi:10.3390/v4061011

Sin embargo…

• En SARS-CoV

• Sistema de revisión de lectura y corrección de inserciones erróneas

• Proteína no estructural 14/Proteína no estructural 10

• Resistencia a Ribavirina

Wuhan

Coronavirus

Coronavirus

humanos

frecuentes

229E

SARS

MERS

HKU1

NL63

OC43

229E

NL63

OC43

HKU1

Otros

coronavirus

humanos

2019-nCoV

MERS-CoV

2019-nCoV SARS-CoV

Clasificación y patógenos humanos

Int J Infect Dis 2013;17(7):e510-7

Coronavirus: patógenos habituales

SARS-CoV-2

• Familia Coronaviridae

• Subfamilia Orthocoronaviridae

• Género Betacoronaviridae

• Virus ARN

• ARN monocatenario positivo

• Causante de la COVID-19

https://doi.org/10.1101/2020.02.07.937862 doi: bioRxiv preprint

Origen y transmisión

• Se cree que tiene origen zoonótico• Similar a lo ocurrido con SARS-CoV y MERS-CoV• Probable intermediario (serpientes descartado, ¿pangolín?)• Una vez establecida la transmisión entre humanos, no se

requiere de intermediarios

• Transmisión persona a persona sospechada• Gotas respiratorias• No de gran relevancia por asintomáticos hasta el momento,

pero posible

MMWR, 5/Feb/2020

Transmisión

• Principalmente por contacto y gotas• Potencial transmisión por superficie

ocular

• Implementar medidas de precaución, adicionando protección ocular

• ¿Transmisión fecal-oral?• Manejo de excretas de tal forma que

no se produzcan aerosoles

Lancet. 2020 Feb 6:S0140-6736(20)30313-5.

Li Wenliang - Oftalmólogo

¿Dos tipos actualmente?On the origin and continuing evolution of SARS-CoV-2. Xiaolu Tang, Changcheng Wu, Xiang Li, Yuhe Song, Xinmin Yao, Xinkai Wu, YuangeDuan, Hong Zhang, Yirong Wang, Zhaohui Qian, Jie Cui, JianNationalScience Review, nwaa036, https://doi.org/10.1093/nsr/nwaa036 Lu. 03-mar-2020

• Los análisis genéticos de la población de 103 genomas de SARS-CoV-2 indicaron que estos virus evolucionaron en dos tipos principales (designados L y S)

• La intervención humana pudo haber ejercido una presión selectiva más fuerte sobre el tipo L, que podría ser más agresivo y extenderse más rápidamente. Por otro lado, el tipo S, es evolutivamente más antiguo y menos agresivo

Response to “On the origin and continuing evolution of SARS-CoV-2”

Oscar A. MacLean*, Richard Orton, Joshua B. Singer, David L. Robertson.

MRC-University of Glasgow Centre for Virus Research (CVR).

• Esta crítica se refiere a la afirmación de que hay dos "tipos principales" claramente definibles de SARS-CoV-2 en este brote y que tienen tasas de transmisión diferenciables.

• “Dados los defectos en el análisis, creemos que Tang et al. deben retractarse de su artículo, ya que las afirmaciones hechas en él son claramente infundadas y corren el riesgo de difundir información errónea peligrosa en un momento crucial del brote.”

Numeralia

Actualización al 10/marzo/2020:

• 113,702 casos confirmados globalmente

• China:

• 80,924 confirmados, 3140 muertes (3.9%)

• Otros países:

• 32,778 confirmados, 872 muertes (%)

• 109 países

WHO Situation Report #55, 10/Mar/2020

Curva Epidémica, identificados fuera de China, exposición

WHO Situation Report #55, 10/Mar/2020

WHO Sit Report 55 10mar2020

COVID-19: Panorama Nacional, al 10/03/2020

De los SIETE casos CONFIRMADOS seobserva:

• Cinco son hombres (71.4%)

• Mediana de edad: 41 años (19-71 años).

• Los siete casos con evolución satisfactoria ysintomatología leve.

• El CONTACTO de un caso confirmado,residente del Estado de México, conresultado POSITIVO a SARS-CoV-2, continuaconsiderándose como PORTADOR almantenerse sin presencia de signos ysíntomas de la enfermedad.

234Total de casos

NEGATIVOS

7Total de casos confirmados

37Total de casos Sospechosos

Fuente: SSA(SPPS/DGE/DIE/InDRE/Informe técnico.COVID-19 /Mexico-10 de marzo 2020 (corte 13:00hrs)

Fuente: SSA(SPPS/DGE/DIE/InDRE/Informe técnico. COVID-19 /Mexico-10 de marzo 2020 (corte 13:00hrs)

COVID-19: Seguimiento Contactos, al 10/03/2020

CASOS CONFIRMADOS A COVID-19

# CASO CIUDAD NÚMERO DE CONTACTOS

SINTOMAS

SI NO1 CDMX/INER 39 0 392 CDMX/GAM 64 0 643 SINALOA 8 0 84 COAHUILA 15 0 155 CHIAPAS 25 0 256 EDO MEX 2 1 17 CDMX 24 2 22

Total 177 3 174Fecha: 10/03/2020

Hora:15 hrs