CODIFICACIÓN Binarios • Esmalte de los dientes Liso: 0 Estriado: 1 · • Principio general para...

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CODIFICACIÓN

Binarios

• Esmalte de los dientes

Estriado: 1Liso: 0

1 cm

CODIFICACIÓN

Multiestado

• Proceso descendente del nasal: no desarrollado, corto,largo dividiendo casi completamente la narina, largo y dividiendo completamente la narina

0 1 2

0

1

2• Desordenado / no aditivo

• Ordenado / Aditivo

Multiestado

0

1 2

3

0 1 2 3

Codificación binaria aditiva(cada transformación en una columna separada)

Codificación linear

Multiestado

Matriz binaria

Datos faltantes

Datos no aplicables:

Estructura de los dientes

Cantidad de dedos

Datos faltantesAlineación de secuencias

Gaps : datos faltantes

M Q P I L L LM L R – L L –M K – I L L L M P P V L I L

M Q P I L L LM L R L L M K I L L L M P P V L I L

Análisis de caracteres

• Homología• Enunciación de los caracteres• Codificación

Maddison, 1993; Hawkins et al. 1997

Maddison, 1993; Hawkins et al. 1997

Parsimonia

Máxima verosimilitud

Métodos Bayesianos

Métodosalternativos

CLADÍSTICA

• Principio general para la elección de hipótesis que compiten entre sí para explicar los datos de la forma más simple.

• No es un enunciado sobre evolución

• Se aplica tanto para caracteres morfológicos como moleculares:dadas las secuencias, encontrar el árbol que las explique con el menor número

de cambios

• sinapomorfía: cuanto más caracteres Puedan ser interpretados como sinapomorfías, mayor. Será el soporte a justificación de la monofilia de un grupo

Simplicidad ( parsimonia)

Simplicidad ( parsimonia)

H1 H2 H37 pasos 9 pasos 8 pasos

Simplicidad ( parsimonia)

H17 pasos

Hipótesis más simple

Simplicidad ( parsimonia)

D

C

E G

F

B

A

J

I

KH D

C

E

B

G H

F

J

I

K

A

D

C

B

E G

F

H

A

J

I

K

Grupo monofilético(se reconocen porsinapomorfías)

Grupo parafilético(compartensimplesiomorfías)

Grupo polifilético(similitud debida a homoplasia)

Dentro del paradigma de la taxonomía evolutiva eran muy populares

GRUPO MONOFILÉTICO

GRUPO PARAFILETICO

GRUPO POLIFILÉTICO

H1 H2 H37 pasos 9 pasos 8 pasos

Simplicidad ( parsimonia)

D

C

E G

F

B

A

J

I

KH D

C

E

B

G H

F

J

I

K

A

D

C

B

E G

F

H

A

J

I

K

Grupo monofilético(se reconocen porsinapomorfías)

Grupo parafilético(compartensimplesiomorfías)

Grupo polifilético(similitud debida a homoplasia)

Dentro del paradigma de la taxonomía evolutiva eran muy populares

21

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• Delimitación del grupo (in-group).

• Caracteres, delimitación.

• Codificación y determinación de polaridad a priori (comparación con el grupo externo o criterio ontogenético)

• Construcción de la matriz. Se agrupa por sinapormorfías (cada apomorfíadefine una relación) Búsqueda de la solución más simple

¿Cómo se construye un cladograma?

DESARROLLO HISTÓRICO: ARGUMENTACIÓN HENNIGIANA

Delimitación del grupo (in-group).

• Pueden ser de distinto rango. • Se asume a priori son monofiléticos• No necesariamente deben ser monofiléticos• Conviene seleccionar como in-group un grupo que comparta• Al menos una sinapomorfía

DESARROLLO HISTÓRICO: ARGUMENTACIÓN HENNIGIANA

Determinación a priori de la polaridad

Método ontogenético

Comparación con el grupo externo (out-group)

• El estado de carácter plesiomórfico es aquel que sucede antes en la ontogénia

• El estado de carácter plesiomórfico es aquel presente en el grupo externo al estudiado (out-group)

DESARROLLO HISTÓRICO: ARGUMENTACIÓN HENNIGIANA

Heterocronía (cambios en los tiempos del desarrollo)

Desarrollo Ocurre tempranamente

Ocurretardiamente

Caracteressomáticos

ACELERACION NEOTENIA

Reproducción PROGENESIS HIPERMORFOSIS

Desarrollo Ocurre tempranamente

Ocurretardiamente

Caracteressomáticos

ACELERACION NEOTENIA

Reproducción PROGENESIS HIPERMORFOSIS

RecapitulaciónPaedomorfosis

NEOTENIA

DESARROLLO HISTÓRICO: ARGUMENTACIÓN HENNIGIANA

0110101111111loro

0000101110011caiman

0000011110011serpiente

0000011110011gecko

0000000111111hombre

0000000110011tortuga

0001000110110sapo

0001000110110salamandra

0000000110000celacanto

0000000000000perca

13121110987654321

0110101111111loro

0000101110011caiman

0000011110011serpiente

0000011110011gecko

0000000111111hombre

0000000110011tortuga

0001000110110sapo

0001000110110salamandra

0000000110000celacanto

0000000000000perca

13121110987654321

65

1

7

8 910

2

11,1233

3

4

4

sinapomorfíashomoplasias

DESARROLLO HISTÓRICO: ARGUMENTACIÓN HENNIGIANA

1º Los estados de carácter se organizan en una serie de transformación que sepolariza

2º Se reconocen las sinapormorfías que se utilizan para construir el cladograma

Análisis en dos pasos o restringido

DESARROLLO HISTÓRICO: ARGUMENTACIÓN HENNIGIANA

DicotomíaPolitomía (relación no resuelta)

=/

A EDCB A EDCB

Raiz

Rama interna

CladoNodo A

X

D

C

B

Como se lee un árbol

= =

E CD B AE DC B AA EDCB

Los árboles escalados o no (con o sin longitud de ramas)

A

E

D

C

B

A

E

D

C

B

unidad

Longitud de rama

Filogramas

Los árboles pueden o no tener raíz

A

E

D

C

B

A

E

D

C

Bunidad

A EDCB

Completamente resuelto

A EDCB

No completamente resuelto

A DCB

Balanceado

A DCB

Pectinado

vs

vs