DPTO. DE BIOQUÍMICA Y BIOLOGÍA MOLECULAR · TESIS LEÍDAS.....41 11. ESTANCIAS.....42 12....

46
DPTO. DE BIOQUÍMICA Y BIOLOGÍA MOLECULAR MEMORIA DOCENTE. CURSO 2008-2009 Octubre 2009

Transcript of DPTO. DE BIOQUÍMICA Y BIOLOGÍA MOLECULAR · TESIS LEÍDAS.....41 11. ESTANCIAS.....42 12....

DPTO. DE BIOQUÍMICA Y BIOLOGÍA MOLECULAR

MEMORIA DOCENTE. CURSO 2008-2009

Octubre 2009

Memoria del Departamento de Bioquímica y Biología Molecular. Curso 2008-2009.

1

INDICE

1. COMPOSICIÓN .................................................................................................................... 2 2. ÁREA DE CONOCIMIENTO................................................................................................. 3 3. ACTIVIDAD DOCENTE ........................................................................................................ 4

a. TITULACIONES OFICIALES............................................................................................ 4 b. ESTUDIOS DE POSGRADO ........................................................................................... 7 c. ESTUDIOS DE DOCTORADO ......................................................................................... 8 d. OTRAS ACTIVIDADES DE FORMACIÓN ....................................................................... 8 e. SEMINARIOS INTERDEPARTAMENTALES................................................................... 9 f. SEMINARIOS METODOLÓGICOS................................................................................. 10

4. GRUPOS DOCENTES ....................................................................................................... 10 5. ESTADO DE EJECUCIÓN DEL PLAN DE MEJORA......................................................... 12 6. CONVOCATORIA RECURSOS PARA LA DOCENCIA (Equipamiento) ........................... 12 7. LÍNEAS DE INVESTIGACIÓN............................................................................................ 13 8. ACTIVIDAD CIENTÍFICA (OCTUBRE 2008 A SEPTIEMBRE 2009)................................. 15

a. LIBROS Y CAPÍTULOS DE LIBROS ............................................................................. 15 b. PUBLICACIONES O ARTÍCULOS CIENTÍFICO-TÉCNICOS........................................ 18 c. RESÚMENES PUBLICADOS EN REVISTAS................................................................ 25 d. PONENCIAS Y COMUNICACIONES ORALES PRESENTADAS EN CONGRESOS .. 26 e. COMUNICACIONES EN CONGRESOS........................................................................ 30

9. PROYECTOS CONCEDIDOS............................................................................................ 38 a. ÁMBITO NACIONAL E INTERNACIONAL..................................................................... 38 b. AYUDAS PLAN ANDALUZ DE INVESTIGACIÓN ......................................................... 40 c. AYUDAS DE INVESTIGACION DE LA UNIVERSIDAD DE CÓRDOBA ....................... 40 d. OTRAS AYUDAS............................................................................................................ 41

10. TESIS LEÍDAS.................................................................................................................. 41 11. ESTANCIAS...................................................................................................................... 42 12. PROYECTOS PROFESIONALES FIN DE CARRERA (MODALIDAD INVESTIGACIÓN)................................................................................................................................................ 42 13. ACTIVIDADES DE GESTIÓN........................................................................................... 43 14. ACTIVIDADES DE EVALUACIÓN.................................................................................... 44 15. OTRAS ACTIVIDADES..................................................................................................... 45

Memoria del Departamento de Bioquímica y Biología Molecular. Curso 2008-2009.

2

1. COMPOSICIÓN DIRECTOR José Antonio Bárcena Ruiz

SECRETARIA Carmen Alicia Padilla Peña

PERSONAL DOCENTE E INVESTIGADOR Catedráticos Carmen Pueyo de la Cuesta Emilio Fernández Reyes Francisco Castillo Rodríguez Jesús Díez Dapena Conrado Moreno Vivián

José Antonio Bárcena Ruiz José Manuel Roldán Nogueras Juan López Barea Manuel Tena Aldave

Prof. Titulares de Universidad Antonio Rodríguez Franco Aurora Galván Cejudo Carmen Alicia Padilla Peña Concepción García Alfonso Isaac Túnez Fiñana Fermín Toribio Meléndez-Valdés Francisco Javier Caballero Domínguez Gabriel Dorado Pérez

Jorrín J.V. Caballero JL José Peinado Peinado Muñoz J Mª Emilia Martínez Galisteo Mª Nieves Abril Díaz Pedro Montilla López

Prof. Contratados Doctores Carmen Mª Michán Doña Enriqueta Moyano Cañete José Alhama Carmona José Manuel García Fernández

Juan Jurado Carpio Mª José Prieto Álamo Ana Mª Maldonado Alconada Mª Dolores Roldán Ruiz

Contratados Ramón y Cajal Ángel Llamas Azúa Manuel J. Rodríguez Ortega Contratados Juan de la Cierva Víctor Manuel Luque Almagro Rosario Blanco Portales Contratados Postdoctores cargo a proyectos/grupos Brian McDonagh Francisco Antonio López Lozano Guadalupe Gómez Baena

Julia Ruiz Laguna Lara Paloma Sáez Melero Manuel Tejada Jiménez

PERSONAL DE ADMINISTRACIÓN Y SERVICIOS Inés Mª Molina Moreno. Personal Administrativo Mª del Carmen Jurado Gaytán. Técnico Especialista de Laboratorio Mª del Carmen Molina Gómez. Maestro de Taller Ana Giraldo Polo. Técnico Especialista de Laboratorio Mª Concepción Santos Godoy. Técnico Grado Medio Apoyo Docencia e Investigación Mercedes Domínguez Pérez. Técnico Especialista de Laboratorio Susana Plazuelo Lozano. Personal Aux. Administrativo.

Memoria del Departamento de Bioquímica y Biología Molecular. Curso 2008-2009.

3

BECARIOS PREDOCTORALES Carlos Alberto Fuentes Almagro Ariza D. Mateos Emanuel Sanz Luque Francisco Amil Ruiz Cumplido G. Inmaculada Osuna Jiménez Jessica Estepa Pedregosa Alfonso Olaya Abril

José J. Higuera Sobrino Medina L. Curto M. Ruiz Patricia Aguilar Melero Rodolfo Gómez Cruz Echevarría Zomeño S. Ricardo Fernández Cisnal

ALUMNOS DE POSGRADO Alba Ruiz Ramos Irene Jiménez Munguía Lidia Gómez Gascón

Medina L. Mª Carmen Muñoz Marín

PERSONAL TÉCNICO CONTRATADO Eduardo Chicano Gálvez Eva Mª Pérez Reinado Lourdes Laura Muñoz Gómez

Mª Isabel Macías Gómez García N. Teresa Gómez Fernández

COLABORADORES HONORARIOS José Luis Gómez-Chaparro Moreno Mª Carmen Muñoz Marín Alfonso Olaya Abril Lidia Gómez Gascón Rafael Blanco Moreno Mª Paz Escribano Fernández Rodolfo Gómez Cruz

Bridget Lorena Moreno Suárez Martín Jaime Plascencia Álvarez María del Carmen Montilla Muñoz Mª de Montserrat Feijóo López Inmaculada Tasset Cuevas Francisco Javier Medina Fernández

2. ÁREA DE CONOCIMIENTO Bioquímica y Biología Molecular

Memoria del Departamento de Bioquímica y Biología Molecular. Curso 2008-2009.

4

3. ACTIVIDAD DOCENTE a. TITULACIONES OFICIALES Licenciatura Ciencias Ambientales

ASIGNATURA CURSO/CARÁCTER CRÉDITOS PROFESORADO

Biotecnología ambiental

3º OPT

4T + 1P C. Moreno

M.D. Roldán

Fundamentos de Bioquímica 2º TRO 4T + 2P

N. Abril E. Moyano J. Alhama C. Michán M. J. Prieto J. Jurado

Licenciatura en Veterinaria

ASIGNATURA CURSO/CARACTER CRÉDITOS PROFESORADO

Bioquímica

1º TRO

6T+ 5P

J. López-Barea C. Pueyo J. Díez

C.A. Padilla G. Dorado E. Martínez

J.A. Bárcena J.M. García M.J. Prieto J. Jurado G.Gómez

Química para Veterinarios

1º TRO

4T + 2P

F. Toribio J. Peinado

Ingeniero Agrónomo

ASIGNATURA CURSO/CARACTER CRÉDITOS PROFESORADO

Bioquímica

1º TRO

3,6T + 2,4P

J.V. Jorrín N. Abril

A. Maldonado Tecnología Enzimática 4º OPT 3,6T + 2,4P Tena M.

Biotecnología y Metabolismo

Celular

4º OPT

4,5T + 3P

J.V. Jorrín J. Muñoz

A. Maldonado R. Blanco

Ingeniero de Montes

ASIGNATURA CURSO/CARACTER CRÉDITOS PROFESORADO Bioquímica 1º TRO 3,6T + 2,4P N. Abril

Memoria del Departamento de Bioquímica y Biología Molecular. Curso 2008-2009.

5

Licenciatura en Enología

ASIGNATURA CURSO/CARACTER CRÉDITOS PROFESORADO

Bioquímica enológica

4º TRO

3,6T + 2,4PTena M.

J. Peinado Crianza y envejecimiento de

vinos 5º OPT 3T + 1P

J. Peinado E. Moyano

Licenciatura en Medicina

ASIGNATURA CURSO/CARACTER CRÉDITOS PROFESORADO

Biología molecular 1º TRO 3T + 3P A.Galván M.Tejada

Bioquímica del envejecimiento 1º OPT 1,5T + 1,5P Montilla P.

Bioquímica clínica 4º-6º OPT 2T + 1P

Montilla P.

Bioquímica médica

1º TRO

7T + 7P

Montilla P. Túnez I.

C. Michán J. Alhama

Licenciatura en Biología

ASIGNATURA CURSO/CARACTER CRÉDITOS PROFESORADO

Bioquímica

2º TRO

10T + 4,5P

C. Moreno E. Moyano J. Muñoz

J.L. Caballero M.D.Roldán

V.Luque R. Blanco

J.M. García Bioquímica tisular humana 5º OPT 4T + 1P F. Castillo

Enzimología aplicada

4º OPT

4T + 1P

Tena M. J. Alhama

Biología molecular avanzada

4º OPT

4T + 1P

J. Muñoz J.L. Caballero

Métodos en Bioquímica y

Biología Molecular

5º TRO

5P

M.J. Prieto C. Michán J. Alhama

A. Maldonado J. Jurado

Biotecnología molecular de plantas 4º OPT 3,5T + 1,5P

J. Muñoz J.L. Caballero

R.Blanco

Historia de la Biología

5º OPT

5T F. Castillo

J.Ruiz

Memoria del Departamento de Bioquímica y Biología Molecular. Curso 2008-2009.

6

Licenciatura en Química

ASIGNATURA CURSO/CARACTER CRÉDITOS PROFESORADO

Biología Molecular

3º OBL

4T+ 2P

E. Fernández A. Galván A. Llamas

Bioquímica

2º TRO

5T + 2P

F.J. Caballero N. Abril

E. Moyano M.J. Prieto J. Jurado J. Ruiz

Licenciatura en Bioquímica

ASIGNATURA CURSO/CARACTER CRÉDITOS PROFESORADO Bioquímica Ambiental

4º OPT 3,5T + 1P F.J. Caballero Bioquímica clínica y patología

molecular

5ª TRO

3T + 3P

A. Galván F. Castillo

Bioquímica de los Alimentos

5º OPT

3T + 1,5P

J. Díez J.M. García

A.López

Biosíntesis de macromoléculas y regulación del metabolismo

5º TRO

7T + 3P

C.A. Padilla G. Dorado V.M. Luque

Biotecnología 5º OPT 6,5T + 2,5P E. Fernández A. Llamas

Enzimología 4º TRO 3T + 2P Tena M. Estructura de macromoléculas 4º TRO 2T + 0,5P J.A. Bárcena

Experimentación Bioquímica 5ª TRO

8P

A. Rodríguez C. Michán

Metodología Bioquímica

4º TRO

8P

C. Pueyo J. López-Barea

M.J. Prieto J. Jurado

Análisis de secuencias de proteínas y ácidos nucleicos

5º OPT

1T + 3,5P A. Rodríguez

Toxicología Bioquímica 5º OPT

3,5 T + 1P

J. López-Barea J. Ruiz

Licenciatura en Ciencia y Tecnología de los Alimentos

ASIGNATURA CURSO/CARACTER CRÉDITOS PROFESORADO

Bioquímica

CURSO PUENTE TRO

4T + 2P E. Martínez J.M.García

Biotecnología Alimentaria 5º OPT 3T + 1,5P G. Dorado

Química y Bioquímica de los Alimentos

4º TRO

3T + 1P

E. Martínez

A.López

Memoria del Departamento de Bioquímica y Biología Molecular. Curso 2008-2009.

7

b. ESTUDIOS DE POSGRADO Asignaturas Transversales

ASIGNATURA CARACTER CRÉDITOS PROFESORADO Teoría, Metodología Y

Evaluación de la Investigación Científica

OBL 4T E. Fernández

Ética Aplicada A La Ciencia Y A La Vida Profesional OPT 4 Túnez I.

Máster en Biotecnología Molecular, Celular y Genética

ASIGNATURA CARACTER CRÉDITOS PROFESORADO Introducción a la Bioinformática OBL 4 A.Rodriguez

M.Tejada

Técnicas avanzadas genómica funcional OPT 4PL

C.Pueyo J.L.Caballero

N.Abril E.Moyano J.Jurado

M.J.Prieto

Proteómica OPT

2T + 2P

J.A. Bárcena M. Rodríguez

Biotecnología Ambiental

OPT

4

F. Castillo J. López-Barea

C.Pueyo J.Alhama

Biotenología Vegetal OPT 4

J.Muñoz J.V.Jorrín

A.Maldonado R.Blanco

Biotecnología Eucariotas Unicelulares OPT 4 A.Galván

E.Fernández

Técnicas básicas del DNA Recombinante OBL 2T+2PL

C.Moreno E.Moyano

M.D.Roldán C.Michán

Máster en Producción, Protección y Mejora Vegetal

ASIGNATURA CARACTER CRÉDITOS PROFESORADO

Técnicas básicas del DNA Recombinante OBL 2T+2PL

C.Moreno E.Moyano

M.D.Roldán C.Michán

Memoria del Departamento de Bioquímica y Biología Molecular. Curso 2008-2009.

8

Máster en Agroalimentación

ASIGNATURA CARACTER CRÉDITOS PROFESORADO Avances en Agroalimentación OPT 1 G. Dorado Avance en Bioq. Y Genética

Alimentaria OPT 1 G.Dorado

Máster en Medicina, Sanidad y Mejora Animal

ASIGNATURA CARACTER CRÉDITOS PROFESORADO Métodos Biotec. Invest.

Veterinaria G. Dorado

Genética para la salud animal OBL 1 G.Dorado Máster en Nutrición y Metabolismo

ASIGNATURA CARACTER CRÉDITOS PROFESORADO

Nutrición y Estrés Oxidativo

OPT

1,2 Túnez I.

Montilla P. Máster en Metodología Inv. Ciencias de la Salud

ASIGNATURA CARACTER CRÉDITOS PROFESORADO

Bioetica: Investigación Básica. OPT 1 Túnez I.

c. ESTUDIOS DE DOCTORADO Prog. Doctorado Ciencias Tecnol. Agraria y Alimentación

ASIGNATURA CARACTER CRÉDITOS PROFESORADO

Biotecnol. Mejora Vegetal G.Dorado

Prog. Doctorado Nutrición y Metabolismo

ASIGNATURA CARACTER CRÉDITOS PROFESORADO Biomodulación a través de la

dieta 3 I.Túnez

d. OTRAS ACTIVIDADES DE FORMACIÓN Curso: Ensayos Biotecnológicos de FP. Plan de Formación del Profesorado de Formación Profesional Específica y Enseñanzas Profesionalizadoras en la Comunidad Autónoma de Andalucía, en colaboración con el Centro del Profesorado "Luisa Revuelta" de Córdoba. Profesores: Alicia Padilla (coordinadora), Mª José Prieto Álamo, Juan Jurado Carpio, Enriqueta Moyano Cañete, Mª Dolores Roldán Ruiz y F. Antonio López Lozano. Duración: 30 horas Fechas: 22 - 26 de Junio de 2009.

Memoria del Departamento de Bioquímica y Biología Molecular. Curso 2008-2009.

9

e. SEMINARIOS INTERDEPARTAMENTALES Programa anual de seminarios que se organizan conjuntamente con el Dpto. de Genética y financiados por el Vicerrectorado de Política Científica de la UCO. Este curso han sido tutelados por este Departamento los siguientes: Viernes, 7 de noviembre de 2008, 12:30 Fernando Monje Casas, Centro Andaluz de Biotecnología Molecular y Medicina Regenerativa, Sevilla. [Contacto: Carmen Pueyo de la Cuesta] “Regulación de la asimetría en la localización de los componentes de la ruta de salida de mitosis” Viernes, 13 de Febrero de 2009, 12:30. Aula C6B1 Avihai Danon, Department of Plant Sciences, Weizmann Institute of Science, Rehovot, Israel [Contacto: Emilio Fernández Reyes] "Light & redox signals in stress adaptation" Viernes, 20 de Febrero de 2009, 12:30. Aula C6B2 José Luis Crespo, Instituto de Bioquímica Vegetal y Fotosíntesis. CSIC, Sevilla. [Contacto: Emilio Fernández Reyes] “Conservación evolutiva de la ruta de señalización TOR en eucariotas” Lunes, 23 de Febrero de 2009, 12:30. Aula C6B4 Cristophe Plomion. UMR BIOGECO, Biodiversité Gènes et Communautés, INRA, Equipe de Génétique. [Contacto: Jorrín J. Novo] “Genomics and proteomics of forest tree species” Viernes, 6 de Marzo de 2009, 12:30. Aula C6B2 Enrique Herrero Perpiñán, Dpto. Ciencias Médicas Básicas, Universidad de Lérida [Contacto: J. Antonio Bárcena Ruíz] 'La diversidad estructural y funcional de las glutaredoxinas monotiólicas" Miércoles, 18 de marzo de 2009, 12:30. Aula C6B4 David B. Knaff. Department Chemistry and Biochemistry. Center for Biotechnology and Genomics, Texas Tech University, EEUU [Contacto: Emilio Fernández Reyes] “Nitrite reductase and thioredoxin reductase. A tale of two ferredoxin-dependent enzymes” Viernes, 20 de marzo de 2009, 12:30. Aula C6B2 José Luis Gómez Ariza. Departamento de Química y Ciencia de los Materiales, Universidad de Huelva [Contacto: Juan López Barea] “Nuevos avances en Metalómica Animal” Viernes, 27 de marzo de 2009, 12:30. Aula C6B2 Nicole Tandeau de Marsac, Instituto Pasteur (París) [Contacto: José M. García Fernández) "Microcystis aeruginosa, an ubiquitous hepatotoxic cyanobacterium: from ecology to genomics" Viernes, 15 de mayo de 2009, 12:30. Aula C6B2 Miguel Ángel Moriñigo Gutiérrez. Dpto. de Microbiología, Universidad de Málaga [Contacto: Juan López Barea] “Alimentos probióticos para peces que promueven una mejora de sus mecanismos de inmunidad y resistencia a enfermedades”

Memoria del Departamento de Bioquímica y Biología Molecular. Curso 2008-2009.

10

f. SEMINARIOS METODOLÓGICOS Organizados por la Comisión de Integración de Actividades (CIA) del Departamento: Jueves 23 de octubre de 2008, 12:30. Aula B1C6 Brian McDonagh. Grupo de Investigación BIO-216. “Post-translational modifications and redox proteomics” Jueves 19 de febrero de 2009, 12:30. Aula B4C6 Guadalupe Gómez Baena. Grupo de Investigación BIO-123. “Cromatografía bidimensional” Jueves 17 de septiembre de 2009. 12:30 Aula B4C6 Raquel González Fernández. Grupo de Investigación AGR-164 “Optimización de la extracción de proteína en el hongo fitopatógeno Botrytis cinerea”

4. GRUPOS DOCENTES GRUPO 26 RESPONSABLE Juan José Moreno Vigara CONSTITUYENTES DEL GRUPO Rafael Andrés Peinado Amores, José Peinado Peinado, Enrique Sancho Puebla y Manuel Tena Aldave. OBJETIVO DEL GRUPO Este grupo docente tiene marcado como objetivo principal la implantación de créditos ECTS (experiencia piloto) en la asignaturas de Bioquímica Enológica, Química Enológica y Microbiología del primer curso de Enología. GRUPO 74 El Grupo Docente lo componen 3 Profesores de plantilla del Departamento de Bioquímica y Biología Molecular y 9 Profesores Contratados Doctores y Contratados Postdoctorales de todos los grupos de investigación del Departamento de Bioquímica y Biología Molecular. RESPONSABLE José Antonio Bárcena Ruíz CONSTITUYENTES DEL GRUPO Antonio Rodríguez Franco, Nieves Abril Díaz, Mª José Prieto Álamo, Carmen Michán Doña, Enriqueta Moyano Cañete, José Alhama Carmona, Juan Jurado Carpio, Manuel José Rodríguez Ortega, Mª Dolores Roldán Ruiz, Víctor Manuel Luque Almagro y Ángel Llamas Azúa. OBJETIVO DEL GRUPO Diseño de una asignatura nueva de Introducción a las técnicas "ómicas" y la Biología Molecular de Sistemas, dirigida a las titulaciones de grado de Biociencias. GRUPO 75 RESPONSABLE Carmen Alicia Padilla Peña CONSTITUYENTES DEL GRUPO

Memoria del Departamento de Bioquímica y Biología Molecular. Curso 2008-2009.

11

Jesús Díez Dapena, Carmen Pueyo de la Cuesta, Emilia Martínez Galisteo, Juan López Barea, José Manuel García Fernández y Concepción García Alfonso.

OBJETIVO DEL GRUPO Este grupo docente tiene marcado como objetivo principal la implantación de créditos ECTS (experiencia piloto) en la asignatura de Bioquímica de 1º de Veterinaria que tiene asignada 9,2 créditos ECTS (teoría y prácticas) y unos 250 alumnos matriculados. GRUPO 78: Propuestas al Plan de Estudios de la nueva titulación de Grado “Bioquímica y Biotecnología” RESPONSABLE Emilio Fernández Reyes CONSTITUYENTES DEL GRUPO Isidoro García, Rafael Rodríguez Ariza, Aurora Galván Cejudo, Conrado Moreno Vivián, Eduardo Muñoz Blanco, Victoriano Borau Bolos. Además participarán: Juan López Barea, Teresa Pineda Molina, María de Mar Malagón Poyato, Manuel Tena Sempere y Juan Manuel Fernández Romero. OBJETIVO DEL GRUPO Esta Acción tiene como objetivo el generar propuestas y análisis acerca de la elaboración de un Plan de Estudios de la titulación, concretando asignaturas para cada bloque temático que sustancien los conocimientos, habilidades y competencias específicas y transversales de cada uno de ellos. Este estudio se remitirá para su consideración si lo estima oportuno por parte de la Comisión de Plan de Estudios correspondiente y de los órganos de decisión competentes. El abordaje multidisciplinar e integral de la docencia en este Grado pretende asegurar el carácter generalista y profesional de la formación de grado, utilizando criterios homogéneos para garantizar la calidad de la enseñanza y del aprendizaje. GRUPO 80 RESPONSABLE José Peña Amaro. Dpto. de Ciencias Morfológicas. Universidad de Córdoba CONSTITUYENTES DEL GRUPO Ignacio Mª Jimena Medina, Javier Martín Álvarez, Evelio Luque Carabot, Eloy Girela López e Isaac Túnez Fiñana. OBJETIVO DEL GRUPO Desarrollo de nuevas iniciativas docentes en el marco de la experiencia piloto del sistema de crédito europeo en la titulación de Medicina. GRUPO 131 RESPONSABLE Jesús V. Jorrín Novo CONSTITUYENTES DEL GRUPO Juan Muñoz Blanco, Jose Luis Caballero Repullo, Rosario Blanco Portales, Ana Mª. Maldonado Alconada. OBJETIVO DEL GRUPO Desarrollo de iniciativas docentes en el campo de la Bioquímica, Biología Molecular y Biotecnología Vegetal y Agroforestal. Propuesta y elaboración de programas docentes adaptados al Espacio Europeo de Enseñanza Superior (Grados y Master), cursos monográficos y específicos. Colaboración en el Desarrollo de Masteres Internacionales.

Memoria del Departamento de Bioquímica y Biología Molecular. Curso 2008-2009.

12

5. ESTADO DE EJECUCIÓN DEL PLAN DE MEJORA PERFIL DEL DEPARTAMENTO a. Características generales del Departamento y su evolución

Desarrollar un plan de renovación de la plantilla docente del Departamento que prevea una sustitución con garantías de las bajas por jubilación que pueden producirse de forma bastante concentrada en los próximos años. Han sido acreditados por la ANECA Mª Dolores Roldán Ruíz y José Manuel García Fernández y ya es profesor titular Isaac Túnez Fiñaña. EVALUACIÓN DEL TERCER CICLO b. Evaluación de la enseñanza Los programas de los distintos másteres se han reorganizado programando distintos itinerarios para hacerlos más atractivos a los alumnos. Se ha aprobado el Máster en Investigación Biomédica Traslacional, que empieza el próximo curso. EVALUACIÓN DE UNIDADES DE ADMINISTRACIÓN Y/O GESTIÓN Se ha llevado a cabo la remodelación de los actuales espacios de Secretaría y Biblioteca.

6. CONVOCATORIA RECURSOS PARA LA DOCENCIA (Equipamiento)

El material que se solicitó y fue concedido en esta convocatoria fue el siguiente: Incubador C/Agitación Orbital Mod. 100C COD.6301 Lantechnics: 1 unidad Adaptador P/Erlenmeyer 250ml COD. 6317 Lantechnics: 7 unidades Un total de 1.995,98 euros cofinanciados al 50% el Departamento y el Vicerrectorado de Gestión, Presupuestos y Sociedades de la UCO.

Memoria del Departamento de Bioquímica y Biología Molecular. Curso 2008-2009.

13

7. LÍNEAS DE INVESTIGACIÓN

Grupo PAI BIO-117. Responsable: Francisco Castillo Rodríguez.

Metabolismo del nitrato en bacterias (asimilación del nitrato en Rhodobacter, Rhodococcus y disimilación aeróbica del nitrato en Rhodobacter sphaeroides). Metabolismo de nitrofenoles en bacterias (fotorreducción anaeróbica de dinitrofenol en Rhodobacter y mineralización aeróbica de nitrofenoles en Rhodococcus). Metabolismo del cianuro en bacterias.

Componentes:

Francisco Castillo Rodríguez Fº Javier Caballero Domínguez Conrado Moreno Vivián Manuel Martínez-Luque

Mª Dolores Roldán Ruiz Victor Manuel Luque Almagro Lara Paloma Saez Melero Eva Perez Reinado

Grupo PAI BIO-123. Responsable: Jesús Díez Dapena.

Asimilación del nitrógeno y carbono en la cianobacteria marina Prochlorococcus.

Componentes:

Jesús Díez Dapena José Manuel Roldán Nogueras Fermín Toribio Meléndez José Manuel García Fernández Antonio López Lozano

Guadalupe Gómez Baena Mª Carmen Muñoz Marín Tina Domínguez Martín M. Carmen Jurado

Grupo PAI BIO-128. Responsable: Emilio Fernández Reyes.

Biología molecular de la asimilación de nitrato/nitrito en plantas. Regulación génica del transporte y reducción de nitrato. Señalización de la ruta de asimilación de nitrato. Metabolismo del molibdeno.

Componentes:

Emilio Fernández Reyes Aurora Galván Cejudo Angel Llamas Azúa Manuel Tejada Jiménez José Javier Higuera Sobrino

Emanuel Sanz Luque Alejandro Chamizo Ampudia Zahira González Sánchez Francisco J. Ocaña Calahorro María Isabel Macías Gómez

Grupo PAI BIO-151. Responsable: Juan López Barea.

Daños oxidativos en ADN, lípidos, proteínas y glutatión. Sistemas tiorredoxina y glutarredoxina. Biomarcadores bioquímicos de contaminación. Biomarcadores bioquímicos de estrés.

Componentes:

Alhama Carmona José López Barea Juan

Vioque Fernández Amalia

Memoria del Departamento de Bioquímica y Biología Molecular. Curso 2008-2009.

14

Grupo PAI BIO-187. Responsable: Carmen Pueyo de la Cuesta.

Biología molecular de los mecanismos de respuestas del estrés.

Componentes:

Carmen Pueyo de la Cuesta Nieves Abril Díaz Carmen Michán Doña Juan Jurado Carpio

María José Prieto Álamo Julia Ruiz Laguna Inmaculada Osuna Jiménez Teresa Gómez Fernández

Grupo PAI BIO-216. Responsable: José Antonio Bárcena Ruíz.

Mecanismos moleculares de defensa antioxidante, estudio de proteínas “redoxinas” y “Proteoma Redox”. Búsqueda de candidatos para vacunas en microorganismos patógenos mediante aproximaciones proteómicas.

Componentes: José Antonio Bárcena Ruiz Emilia Martínez Galisteo Carmen Alicia Padilla Peña Concepción Garcia Alfonso José Peinado Peinado

Manuel José Rodríguez Ortega Brian McDonagh Alfonso Olaya Abril Lourdes Laura Muñoz Gómez

Grupo PAI BIO-278. Responsable: Muñoz J.

Biotecnología de la maduración del fruto de fresa. Generación de ests de fruto de fresa. Bases moleculares de la interación planta-planta-patógeno de fresa y olivo. Aislamiento de identificación de nuevos compuestos de origen natural obtenidos de plantas.

Componentes:

Muñoz J Caballero J.L. Repullo Enriqueta Moyano Cañete Blanco R. Francisco Amil Ruiz Cumplido G.

Moreno B. Medina L. Alba Ruíz Ramos Nicolás Garcia Caparrós

Grupo PAI AGR-164. Responsable: Jorrín J.V.

Bioquímica y biología molecular vegetal y agrícola. Cambios adaptativos y reacciones de defensa de las plantas o condiciones ambientales adversas. Proteómica vegetal. Modificaciones postraduccionales: proteoma redox. Metabolismo secundario.

Componentes:

Manuel Tena Aldave Curto M. Rubio Jesús Jórrín Novo Juan Emilio Palomares Maldonado A.M. Alconada Echevarría Zomeño S. Jorge I. Cerrado

Raquel Gónzalez Fernández Valero J. Galván Besma Sghaier Hammami Valledor L. González Martha Hernández de la Torre Gabriel Donoso Ñanculao Francisco Cabello Hurtado

Mª Carmen Molina Gómez

Memoria del Departamento de Bioquímica y Biología Molecular. Curso 2008-2009.

15

Grupo PAI AGR-248. Responsable: Gabriel Dorado Pérez

PCR. Analítica. Genómica. Biotecnología. Células madre. Bioinformática. Envejecimiento. Marcadores moleculares. Matrices de ADN ("microarrays"). Cuantificación de la expresión génica. Fisiopatología del sistema endocrino de la vitamina D.

Componentes:

Alfonso Calañas Continente Almudena Castillo López Antonio Alonso Alonso Arturo Morales Muñiz Damián Fermín de Andrés Cara David Díaz González Elena Rodríguez Jiménez Fernando Luque Recio Francisco Javier Sánchez Sánchez-Cañete Francisco José Esteban Risueño Guillermo Rafael Guerrero Vaca Inmaculada Jiménez Gamero Isabel Cristina Vélez Bermúdez Isabel Rey Fraile Jesús Sáiz Martínez-Acitores

Jorge Enrique Salazar Henao Juan Antonio Caballero Molina Juan Fernando Martínez Leal Luis Meléndez Aganzo Manuel Gálvez Delgado Margarita Pérez Jiménez María Adela Sánchez García Maria Belén Alcaide Alburquerque Nestor Gastón Sepúlveda Bécker Pilar Hernández Molina Plácido Pascual Morales Teresa Rosales Tham Víctor Félix Vásquez Sánchez Wilfredo Huanca López Yoselín Benítez Alfonso

Grupo PAI CTS-047. Responsable: Isaac Túnez Fiñana.

Neurogénesis y neurodegeneración. Modelos experimentales de enfermedades neurodegenerativas y estrés oxidativo. Componentes: Isaac Túnez Fiñana Antonia Díaz Moreno Inmaculada Tasset Cuevas Concha Ruiz Villén

María de Montserrat Feijóo López Francisco Javier Medina Fernández Ana Isabel Giraldo Polo

Grupo PAI CTS-577. Responsable: Pedro Montilla López.

Neuroquímica y neuroendocrinología. Radicales libres y patología experimental. Modelos experimentales de neurotoxicidad similares a procesos neurodegenerativos.

Componentes:

Pedro Montilla López Féliz Gascón Cuevas Manuel Salcedo Espinosa

María del Carmen Muñoz de Águeda Jaime Placencia Álvarez Maria del Carmen Montilla Muñoz

8. ACTIVIDAD CIENTÍFICA (OCTUBRE 2008 A SEPTIEMBRE 2009) a. LIBROS Y CAPÍTULOS DE LIBROS Grupo PAI BIO-128 Fernández E, Llamas A and Galván A. (2009).Nitrogen Assimilation and its Regulation. In: The

Chlamydomonas Sourcebook, Second edition, Vol 2 (Stern D ed). Elsevier Academic Press, New York. ISBN 978-0-12-370875-5. pp. 69-113.

Memoria del Departamento de Bioquímica y Biología Molecular. Curso 2008-2009.

16

Grupo PAI BIO-117 Cabello P., Roldán M.D., Castillo C., Moreno-Vivián C. (2009). Encyclopedia of Microbiology.

Microbial Ecology-Nitrogen cycle. Elsevier. pp. 299-321. Huertas M.J., Luque-Almagro V., Martínez-Luque M., García I., Blasco R., Moreno-Vivián C.,

Castillo F., Roldán M.D. (2009). Biotecnología: III Jornadas de Divulgación de la Investigación en Biología Molecular, Celular y Biotecnología. Biodegradación de cianuro por Pseudomonas pseudoalcaligenes CECT4344. Análisis proteómico. Publicaciones Universidad de Córdoba (Dorado, G., Jorrín, J.V., Tena, M., Fernández, E., (eds.). pp. 3-5.

Grupo PAI BIO-151 Alhama J, Romero-Ruiz A, Jebali J, López-Barea J (2009).Total metallothionein quantification

by reversed-phase high-performance liquid chromatography coupled to fluorescence detection after monobromobimane derivatization. En: Cadmium in the Environment. (Reini G Parvau, ed.), Nova Science Publishers, Inc, pp. X+1 ̶ X+17.

Grupo PAI BIO-123 García-Fernández J.M., Gómez-Baena G., López-Lozano A., Rangel O.A., Toribio F.y Diez

J.(2008). Prochlorococcus marinus: some keys for an ecological success. New Strides in Biotechnology. Center for Integrative Mediterranean Studies revista Italia.

Grupo PAI BIO-216 Bárcena JA, Porras P, Padilla A, Peinado J, Pedrajas JR, Martinez-Galisteo E, Requejo R.

(2008) Patel MS, Packer L.. Redoxin connection of lipoic acid. In Alpha-Lipoic Acid: Energy Production, Antioxidant Activity, and Health Effects . CRC-Press, Taylor Rancis, Boca Ratón, FL..Vol. 24, pp 315-348.

McDonagh B (2009a) Detaction of Ubiquitination in 2DE. In Two Dimensional Electrophoresis Protocols , Sheehan D, Tyther R (eds), 24, pp 377-381. Humana Press

McDonagh B (2009b) Diagonal Electrophoresis for Detection of Protein Disulfide Bridges. In Two Dimensional Electrophoresis Protocols , Sheehan D, Tyther R (eds), 19, pp 305-310. Humana Press

McDonagh B (2009c) Immunoblotting 2DE Membranes. In Two Dimensional Electrophoresis Protocols , 7, pp 103-113. Humana Press

Padilla CA, Martinez-Galisteo E, Peinado J, Rodríguez-Ortega MJ, McDonagh B, Olaya A, Muñoz LL, Bárcena JA. Proteómica para todo: Biomarcadores, Vacunas y Estrés Oxidativo. In: Jurado J, Roldán-Ruiz MD, Llamas A, eds. IV Jornadas de Divulgación de la Investigación en Biología Molecular, Celular y Genética. Córdoba: Universidad de Córdoba, pp. 149-154, 2009.

Bárcena, J.A., McDonagh B., Padilla, C.A. (2008). The Redox Proteone in the scene of biomarker discovery. In New Strides in Biotechnology, Anastasi, G.P.etal, eds.,Sicania, Messina, Italy, pp. 103-111.

Grupo PAI AGR-164

Dorado Pérez, G. Jorrín Novo, J.V., Tena Aldave, M., Fernández Reyes, E. (Eds.). 2009. Biotecnología. Universidad de Córdoba. ISBN : 978-84-691-5270-6, 103 pp. Córdoba, España.

Memoria del Departamento de Bioquímica y Biología Molecular. Curso 2008-2009.

17

Tena Aldave M, Maldonado Alconada A, Palomares Rius Je, Curto Rubio M, Echevarría Zomeño S, Pozo A, Susín R, Castillejo Sánchez Ma, Jorge Cerrudo I, Requejo Aguilar R, Jorrin Novo Jv. Bioquímica Y Proteómica vegetal y agrícola. En Dorado Pérez, G. Jorrín Novo, J.V., Tena Aldave, M., Fernández Reyes, E., Eds. Biotecnología. Pp 55-58. Universidad de Córdoba, Córdoba, España. ISBN : 978-84-691-5270-6, 103 pp.

Navarro Cerrillo R, Ariza Mateos D, Jorrín Novo, J.V., Jorge Cerrudo I, Echevarria Zomeño S. Calvete, J.J, Maldonado, A.M. 2008. Variabilidad intrapoblacional e interpoblacional de la encina (Quercus ilex L.) . En: La dehesa en el norte de Córdoba. Perspectivas futuras para su conservación. Coordinadores Pilar Fernández Rebollo, Mª Dolores Carbonero Muñoz, Angel Blázquez Carrasco. Servicio de Publicaciones de la Universidad de Córdoba. Pp: 163-183. ISBN 978-84-7801-902-1.

Grupo PAI AGR-248

Dorado Pérez G, Jorrín Novo JV, Tena Aldave M, Fernández Reyes E (eds) (2009):

"Biotecnología" (107 paginas). Universidad de Córdoba (Códoba). ISBN: 978-84-691-5270-6.

Tena Aldave M, Dorado Pérez G et al (eds) (2008): "Prácticas Generales de Bioquímica y

Biología Molecular". Universidad de Córdoba (Córdoba). ISBN: 978-84-691-5273-7. Díaz D, Gálvez S, Falgueras J, Caballero JA, Hernández P, Claros G, Dorado G (2009):

Intuitive bioinformatics for genomics applications: Omega-Brigid workflow framework. En: Omatu S, Rocha MP, Bravo J, Fernández F, Corchado E, Bustillo A, Corchado JM (eds): "Distributed Computing, Artificial Intelligence, Bioinformatics, Soft Computing, and Ambient Assisted Living". IWANN 2009, Part II, LNCS 5518, Capítulo X, p 1084-1091. Springer (Berlín). ISBN: 3-642-02480-7 y 978-3-642-02480-1.

Dorado Pérez G, Casado Díaz A, González Domínguez J, Serrano Alférez JI, Calañas

Continente A, Caballero Villarraso J, Santiago Mora R, Luque Recio F, Cuenca Acevedo R, Gutiérrez Mariscal FM, Luna Morales S, García Córdoba B, Quesada Gómez JM (2009): Desarrollo de un sistema de diagnóstico y tratamiento precoz de la osteoporosis, mediante marcadores moleculares, células madre y genómica estructural y funcional. En: Dorado G, Jorrín J, Tena M, Fernández E.(eds): "Biotecnología". Universidad de Córdoba (Córdoba). ISBN: 978-84-691-5270-6.

Dorado G, Díaz D, Claros G, Falgueras J, Caballero JA, Hernández P, Gálvez S (2009):

Desarrollo de herramientas bioinformáticas mediante flujos de ejecución. En: Jurado J, Roldán MD, Llamas A (eds): "IV Jornadas de Divulgación de la Investigación en Biología Molecular, Celular, Genética y Biotecnología", pp 83-87. Servicio de Publicaciones de la Universidad de Códoba (Córdoba). ISBN: 978-84-7801-984-7.

Dorado Pérez G (2008): Aislamiento y visualización de ácidos nucleicos. En: Tena M, Dorado G

et al (eds): "Prácticas Generales de Bioquímica y Biología Molecular", Capítulo 42, p 1-11). Universidad de Córdoba (Córdoba). ISBN: 978-84-691-5273-7.

Dorado Pérez G (2008): Amplificación de DNA mediante PCR (Reacción en Cadena de la

Polimerasa). En: Tena M, Dorado G et al (eds): "Prácticas Generales de Bioquímica y Biología Molecular", Capítulo 44, p 1-18). Universidad de Córdoba (Córdoba). ISBN: 978-84-691-5273-7.

Dorado Pérez G (2008): Bioinformática: bases de datos y software de análisis. En: Tena M,

Dorado G et al (eds): "Prácticas Generales de Bioquímica y Biología Molecular", Capítulo 50, p 1-7). Universidad de Córdoba (Córdoba). ISBN: 978-84-691-5273-7.

Dorado Pérez G (2008): Biomoléculas: lípidos, glúcidos, prótidos y ácidos nucleicos. En: Tena

M, Dorado G et al (eds): "Prácticas Generales de Bioquímica y Biología Molecular", Capítulo 4, p 1-41). Universidad de Córdoba (Córdoba). ISBN: 978-84-691-5273-7.

Memoria del Departamento de Bioquímica y Biología Molecular. Curso 2008-2009.

18

Dorado Pérez G (2008): Clonación del DNA amplificado mediante PCR. En: Tena M, Dorado G et al (eds): "Prácticas Generales de Bioquímica y Biología Molecular", Capítulo 45, p 1-22). Universidad de Córdoba (Córdoba). ISBN: 978-84-691-5273-7.

Dorado Pérez G (2008): Determinación de la actividad enzimática alcohol deshidrogenasa

(ADH) en la mosca de la fruta (Drosophila melanogaster). En: Tena M, Dorado G et al (eds): "Prácticas Generales de Bioquímica y Biología Molecular", Capítulo 34, p 1-9). Universidad de Córdoba (Córdoba). ISBN: 978-84-691-5273-7.

Dorado Pérez G (2008): Polimorfismos proteicos de la enzima alcohol deshidrogenasa (ADH)

en la mosca de la fruta (Drosophila melanogaster). En: Tena M, Dorado G et al (eds): "Prácticas Generales de Bioquímica y Biología Molecular", Capítulo 29, p 1-12). Universidad de Córdoba (Córdoba) ISBN: 978-84-691-5273-7.

Dorado Pérez G (2008): Preparación de medios de laboratorio, cultivo de bacterias y gel de

agarosa. En: Tena M, Dorado G et al (eds): "Prácticas Generales de Bioquímica y Biología Molecular", Capítulo 36, p 1-6). Universidad de Córdoba (Córdoba). ISBN: 978-84-691-5273-7.

Dorado Pérez G (2008): Prevención de riesgos y salud laboral en el laboratorio. En: Tena M,

Dorado G et al (eds): "Prácticas Generales de Bioquímica y Biología Molecular", Capítulo 2, p 1-13). Universidad de Córdoba (Córdoba).ISBN: 978-84-691-5273-7.

Dorado Pérez G (2008): Purificación y análisis de DNA cromosómico bacteriano. En: Tena M,

Dorado G et al (eds): "Prácticas Generales de Bioquímica y Biología Molecular", Capítulo 43, p 1-12). Universidad de Córdoba (Córdoba). ISBN: 978-84-691-5273-7. 2.B.2.4o12

Dorado Pérez G (2008): Purificación y análisis del DNA recombinante. En: Tena M, Dorado G

et al (eds): "Prácticas Generales de Bioquímica y Biología Molecular", Capítulo 46, p 1-16). Universidad de Córdoba (Córdoba). ISBN: 978-84-691-5273-7.

Dorado Pérez G (2008): Secuenciación del DNA. En: Tena M, Dorado G et al (eds): "Prácticas

Generales de Bioquímica y Biología Molecular", Capítulo 47, p 1-35. Universidad de Córdoba (Córdoba). ISBN: 978-84-691-5273-7.

Dorado G (2008): Grupo Docente PAFPU FORMAPROFE. En: Chaparro L (ed): "Buenas

Prácticas de Innovación Docente en la Universidad de Córdoba", Capítulo 1.7, p 36-38. Consejo Social de la Universidad de Córdoba (Córdoba). ISBN: 978-84-691-6347-4.

Dorado G (2008): Advanced Quantifier (AQ) & Intelligent Quantifier (IQ). Installation Guide for

Mac Users (Microsoft Windows on VMware Fusion on Apple Mac OS X). Bio Image Systems (Jackson, Michigan, USA)

b. PUBLICACIONES O ARTÍCULOS CIENTÍFICO-TÉCNICOS Grupo PAI BIO-117 Pérez-Reinado E., Roldán M.D., Castillo F., Moreno-Vivián C. (2008). The NprA nitroreductase

required for 2,4-dinitrophenol reduction in Rhodobacter capsulatus is a dihydropteridine reductase. Environ. Microbiol. 10: 3174-3183.

Luque-Almagro V.M., Huertas M.J., Sáez L.P., Luque-Romero M.M., Roldán M.D., Moreno-

Vivián C., Castillo F., Roldán M.D., Blasco R. (2008) Characterization of the Pseudomonas pseudoalcaligenes CECT5344 cyanase, an enzyme that is not essential for cyanide assimilation. Appl. Environ. Microbiol. 74: 6280-6288.

Memoria del Departamento de Bioquímica y Biología Molecular. Curso 2008-2009.

19

Roldán M.D., Pérez-Reinado E., Castillo F., Moreno-Vivián C. (2008) Reduction of polynitroaromatic compounds: the bacterial nitroreductases. FEMS Microbiol. Rev. 32: 474-500.

Grupo PAI BIO-123 Gómez-Baena G., López-Lozano A., Gil-Martínez J., Lucena JM, Diez J, Candau P y García-

Fernández J.M. (2008) Glucose uptake and its effect on gene expression in Prochlorococcus. Ref. PLoS ONE 3(10) e3416.

Rangel O, Gómez-Baena G., López-Lozano A., Diez J.y García-Fernández J.M. (2009) Physiological role and regulation of glutamate dehydrogenase in Prochlorococcus sp. strain MIT9313.Environmental Microbiology. 56-64.

López-Lozano A., Gómez-Baena G., Rangel O.A., Muñoz-Marín M.C., Diez J.Y García-

Fernández J.M.(2009) Expression of genes involved in nitrogen assimilation and the C/N balance sensingin Prochlorococcus sp. strain SS120. Gene Expression. 279-289

Grupo PAI BIO-128 Tejada-Jiménez M, Galván A., Fernández E, Llamas A (2009). Homeostasis of the

micronutrients Ni, Mo and Cl with specific biochemical functions.Current Opinion in Plant Biology 12:358–363

Castaings L, Camargo A, Pocholle D, Gaudon V, Texier Y, Boutet-Mercey S, Taconnat

L,Renou JP, Daniel-Vedele F, Fernández E, Meyer C and Krapp A (2009). The nodule inception-like protein 7 modulates nitrate sensing and metabolism in Arabidopsis.The Plant Journal 57, 426–435

Fernández E.and Galván A. (2008). Nitrate Assimilation in Chlamydomonas. Eukaryotic Cell,

2008, 7, 555–559. Grupo PAI BIO-151 González-Fernández M, García-Barrera T, Arias-Borrego A, Bonilla-Valverde D, López-Barea J,

Pueyo C, Gómez-Ariza JL (2008). Metal-binding molecules in the organs of Mus musculus by size-exclussion chromatography coupled with UV spectroscopy and ICP-MS. Anal Bioanal Chem, 390: 17-28.

Jebali J, Banni M, Gerbej H, Boussetta H, López-Barea J, Alhama J. Metallothionein induction by Cu, Cd and Hg in Dicentrarchus labrax liver: assessment by RP-HPLC with fluorescent detection and spectrophotometry (2008). Mar Env Res, 65: 358-363.

Romero-Ruiz A, Alhama J, Blasco J, Gómez-Ariza JL, López-Barea J (2008). New metallothionein assay in Scrobicularia plana: heating effect and correlation with other biomarkers. Environ Pollut, 156: 1340-1347.

Gómez Ariza JL, González-Fernández M, García-Barrera T, López -Barea J, Pueyo de la Cuesta C (2008). Integration of metallomics, proteomics and transcriptomics in environmental issues. Chemicke Listy, 102: s303-s308.

García-Barrera T, González-Fernández M, López Barea J, Pueyo C, Gómez Ariza JL (2008). Isolation of Cu-metalloproteins in Mus musculus brain extracts by reverse PHASE-HPLC coupled to ICP-MS. Chemicke Listy, 102: s639-s640.

González-Fernández M, García-Barrera T, Jurado J, Prieto Álamo MJ, Pueyo C, López-Barea J, Gómez-Ariza JL (2008). Integrated application of Transcriptomics, Proteomics and Metallomics in environmental studies. Pure Appl Chem, 80: 2609-2626.

Rodríguez-Ortega MJ, Rodríguez-Ariza A, Gómez-Ariza JL, Muñoz-Serrano A, López-Barea J (2009). Multivariate discriminant analysis distinguishes pollutant- from non-pollutant-related biomarker responses in the clam Chamaelea gallina. Mar Pollut Bull, 58: 64-71.

Memoria del Departamento de Bioquímica y Biología Molecular. Curso 2008-2009.

20

Salas-Leiton E, Cánovas-Conesa B, Zerolo R, López-Barea J, Cañavate JP, Alhama J (2009). Proteomics of juvenile Senegalese sole (Solea senegalensis) affected by gas bubble disease in hyperoxigenated ponds. Marine Biotechnol, 11: 473-487.

Vioque-Fernández A, Alves de Almeida E, López-Barea J (2009). Assessment of Doñana National Park contamination in Procambarus clarkii: integration of conventional biomarkers and proteomic approaches. Sci Tot Environ, 407: 1784-1797.

Vioque-Fernández A, Alves-de-Almeida E, López-Barea J (2009). Biomarker responses and protein expression profile changes in Procambarus clarkii after chlorpyrifos or carbaryl exposure. Biomarkers, 14: 299-310.

González-Fernández M, García-Barrera T, Jurado J, Pueyo C, López-Barea J, Gómez-Ariza JL (2009). Metallomics integrated with proteomics in deciphering metal-related environmental issues. Biochimie, 91: 1311-1317.

Grupo PAI BIO-187 González-Fernández M, García-Barrera T, Arias-Borrego A, Bonilla-Valverde D, López-Barea J,

Pueyo C, Gómez-Ariza J-L. (2008). Metal-binding molecules in the organs of Mus musculus by size-exclusion chromatography coupled with UV spectroscopy and ICP-MS. Analytical and Bioanalytical Chemistry 390.17-28.

González-Fernández M, García-Barrera T, Jurado J, Prieto Álamo MJ, Pueyo C, López-Barea J, Gómez-Ariza JL. (2008). Integrated application of Transcriptomics, Proteomics and Metallomics in environmental studies. Pure and Applied Chemistry 12, 2609-2626.

Gómez Ariza JL, González-Fernández M, García-Barrera T, López -Barea J, Pueyo de la Cuesta C. (2008) Integration of metallomics, proteomics and transcriptomics in environmental issues. Chemicke Listy, 102, s303-s308.

García-Barrera T, González-Fernández M, López Barea J, Pueyo C, Gómez Ariza JL. (2008). Isolation of Cu-metalloproteins in Mus musculus brain extracts by reverse PHASE-HPLC coupled to ICP-MS. Chemicke Listy 102: s639-s640.

Prieto-Álamo M-J, Abril N, Osuna-Jiménez I, Pueyo C. (2009) Solea senegalensis genes responding to lipopolysaccharide and copper sulphate challenges: Large-scale identification by suppression subtractive hybridization and absolute quantification of transcriptional profiles by real-time RT-PCR. Aquatic Toxicology 91. 312-319.

Osuna-Jiménez I, Williams TD, Prieto-Álamo MJ, Abril N, Chipman JK, Pueyo C. (2009) Immune- and stress-related transcriptomic responses of Solea senegalensis with lipopolysaccharides and copper sulphate using heterologous cDNA microarrays. Fish and Shellfish Immunolgy 26. 699-706.

González-Fernández M, García-Barrera T, Jurado J, Pueyo C, López Barea J, Gómez Ariza JL. (2009). Metallomics integrated with proteomics in deciphering metal-related environmental issues. Biochimie 1311-1317.

Michán, C., Daniels, C. y Ramos, J.L.. (2009) “Twenty one important things you should know”. Microbial Biotechnology, 2 (4). 397-400.

Daniels, C., Michán, C. y Ramos, J.L. (2009) “New molecular tools for enhancing methane production, explaining thermodynamically limited lifestyles and other important biotechnological issues”. Microbial Biotechnology, 2 (5). 533-536.

Daniels, C., Michán, C., Krell, T., Roca, A. y Ramos, J.L. (2009) “The heat, drugs, and knock-out systems of Microbial Biotechnology”. Microbial Biotechnology (in press).

Michán C, Pueyo C. (2009) Growth phase-dependent variations in transcript profiles for thioredoxin- and glutathione-dependent redox systems followed by budding and hyphal C. albicans cultures. FEMS Yeast Research 9. 1078-1090.

Memoria del Departamento de Bioquímica y Biología Molecular. Curso 2008-2009.

21

Grupo PAI BIO-216 Discola KF, de Oliveira MA, Rosa Cussiol JR, Monteiro G, Bárcena JA, Porras P, Padilla CA,

Guimaraes BG, Netto LES (2009) Structural aspects of the distinct biochemical properties of glutaredoxin 1 and glutaredoxin 2 from Saccharomyces cerevisiae. J Mol Biol 385(3): 889-901

Doro F, Liberatori S, Rodríguez-Ortega MJ, Rinaudo CD, Rosini R, Mora M, Scarselli M, Altindis

E, D'Aurizio R, Stella M, Margarit I, Maione D, Telford JL, Norais N, Grandi G (2009) Surfome analysis as a fast track to vaccine discovery: identification of a novel protective antigen for Group B Streptococcus hypervirulent strain COH1. Mol Cell Proteomics 8(7): 1728-1737

González-Fernández R, Martínez-Galisteo E, Gaytán F, Bárcena JA, Sánchez-Criado JE (2008)

Changes in the proteome of functional and regressing corpus luteum during pregnancy and lactation in the rat. Biol Reprod 79(1): 100-114

Mcdonagh B, Ogueta S, Lasarte G, Padilla CA, Bárcena JA (2009) Shotgun redox proteomics

identifies specifically modified cysteines in key metabolic enzymes under oxidative stress in Saccharomyces cerevisiae. Journal of Proteomics: 1-13

McDonagh B, Ogueta S, Padilla CA, Lasarte G, Rodríguez-Ortega MJ, Bárcena JA (2008)

Detection of redox modified proteins by gel-free proteomics. Proteómica 1: 48-49 McDonagh B, Sheehan D (2008) Effects of oxidative stress on protein thiols and disulphides in

Mytilus edulis revealed by proteomics: actin and protein disulphide isomerase are redox targets. Mar Environ Res 66(1): 193-195

Peinado J, López de Lerma N, Moreno J (2009) Antioxidant activity of different phenolics

fractions isolated in must from Pedro Ximenez. Food Chemistry, 114-1050-1055 Rodríguez-Ariza A, Monrobel A, Martínez-Galisteo E, Alicia Padilla C, Bárcena JA, Fraga E,

Costán G, Barrera P, Poyato A, Montero JL, López-Cillero P, Muntané J, De la Mata M (2008) Prognostic factors associated with postoperative complications in liver transplant. Revista Española de Enfermedades Digestivas. 100(3): 129-138

Rodriguez-Ortega MJ, Luque I, Tarradas C, Bárcena JA (2008) Overcoming function annotation

errors in the Gram-positive pathogen Streptococcus suis by a proteomics-driven approach. BMC Genomics 9: 588

Silva GM, Netto LE, Discola KF, Piassa-Filho GM, Pimenta DC, Bárcena JA, Demasi M (2008)

Role of glutaredoxin 2 and cytosolic thioredoxins in cysteinyl-based redox modification of the 20S proteasome. FEBS J 275(11): 2942-2955

Grupo PAI BIO-278 Griesser M., Hoffmann T., Bellido M.L., Rosati C., Fink B., Kurtzer R., Aharoni A., Muñoz J.. and

Schwab W. Redirection of flavonoid biosynthesis through the downregulation of an anthocyanidin glucosyltransferase in ripening strawberry(Fragaria x ananassa) fruit. Plant Physiol. 146 2008 (1528-1539) USA

Griesser M., Vitzthum F., Fink B., Bellido M.L., Raasch C., Muñoz J..and Schwab W.. Multi-

substrate flavonol O-glucosyltransferases from strawberry (Fragaria x ananassa) achene and receptacle. Journal Exp Bot. 2008( 2611-2625) USA

Santiago-Domenech N., Jiménez-Bermúdez S., Matas AJ., Rose Jocelyn K, Muñoz J..,

Mercado J.A., Quesada MA.. Antisense inhibition of a pectate lyase gene supports a

Memoria del Departamento de Bioquímica y Biología Molecular. Curso 2008-2009.

22

role for pectin depolymerization in strawberry fruit softening. Journal Exp Bot 2008(2769-2779) USA

García-Limones C., Schnäbele K., Blanco-Portales R., Bellido M. Luz, Caballero J.L., Schwab,

W.,Muñoz Blanco J. Functional Characterization of FaCCD1: a Carotenoid Cleavage Dioxygenase from Strawberry Involved in Lutein Degradation During Fruit Ripening. Journal of Agricultural and Food Chemistry. 2008(9277-9285)

Serrato A.J.,Yubero E.M., Sandalio L.M., Muñoz J.., Chueca A., Caballero J.L., Saharawy M.

(2009) cpFBPaseII, a novel redox-independent chloroplastic isoform of fructose-1,6-bisphosphatase. Plant Cell Environment (811-827) U.K.

Encinas-Villarejo S., Maldonado A.M., Amíl-Ruíz F., de los Santos B., Romero F., Pliego-Alfaro

F., Muñoz J.., Caballero J.L.. 2009. Evidence for a positive regulatory role of strawberry (Fragaria x ananassa) Fa WRKY1 and Arabidopsis At WRKY75 proteins in resistance. Journal of Experimental Botany, (In Press). Journal Experimental Botany. ( 3043- 3065) U.K.

Quesada M.A., Blanco-Portales R., Posé S., García-Gago J.A., Jiménez-Bermúdez S., Muñoz-

Serrano A., Caballero J.L., Pliego F., Mercado J.A., Muñoz J.. 2009. Antisense downregulation of FaPG1 gene reveals an unexpected crucial role for polygalacturonase in strawberry fruit softening. Plant Physiology.(1002-1032) U.K

García-Gago J.A.; Posé Sara; Muñoz J.uan; Quesada Miguel A; Mercado Jose A. The

polygalacturonase FaPG1 gene plays a key role in strawberry fruit softening. Plant Signalling and Behavior. 2009(1-3) U.K. García-Gago J.A.; López-Aranda JM; Muñoz J.;Toro FJ, Quesada MA; Pliego-Alfaro F, Mercado JA.. Postharvest behaviour of transgenic strawberry with polygalacturonase or pectate lyase genes silenced Act Hort. 2009 (573-576) Grupo PAI AGR-164

Pérez-De-Luque A., Fondevilla S., Pérez-Vich B., Aly R., Thoiron S., Simier P., Castillejo MA, Fernández JM., Jorrín J.,Rubiales D., Delavault P. 2009. Understanding broomrape – host plant interaction and developing resistance. Weed Research (in press)Sghaier-Hammami Besma., Noureddine Drira, Jorrín-Novo J.V.. 2009. Comparative 2-DE proteomic analysis of date palm (Phoenix dactylifera L.) somatic and zygotic embryos. Journal of Proteomics. DOI information: 10.1016/j.jprot.2009.07.003.

Encinas-Villarejo S., Maldonado A.M., Amil-Ruiz F., Berta De Los Santos F., Romero F., Pliego-Alfaro F., Muñoz-Blanco,J., Caballero J.L. 2009. Evidence for a positive regulatory role of strawberry (Fragaria x ananassa) FaWRKY1 and Arabidopsis At WRKY75 proteins in resistance. Journal of Experimental Botany 60, 3043-65.

Castillejo Mª Ángeles, Maldonado A.M., Dumas-Gaudot Eliane, Fernández-Aparicio Mónica, Susín Rafael, Rubiales Diego, Jorrín Jesús. 2009. Differential expression proteomics to investigate responses and resistance to Orobanche crenata in Medicago truncatula. BMC Genomics 10: 294.

Jorrín J.V. 2009. Plant proteomics. Editorial. Journal of Proteomics 72. doi: 10.1016/j.jprot.2009.03.002

Jorrín J.V., Maldonado A.M., Echevarría-Zomeño S., Valledor, L.,Castillejo M., Curto M., Valero J., Sghaier, B., Donoso G., Redondo I. 2009. Plant proteomics update (2007-2008). Second generation proteomic techniques, an appropiate experimental design and data analysis to fulfill MIAPE standards, increase plant proteome coverage and biological knowledge. Journal of Proteomics 72: 285-314.(DOI 10.1016/j.jprot.2009.01.026).

Memoria del Departamento de Bioquímica y Biología Molecular. Curso 2008-2009.

23

Sghaier-Hammami B. , Valledor L., Noureddine D., Jorrin J. 2009. Proteomic analysis of the development and germination of date palm (Phoenix dactylifera L.) zygotic embryos. Proteomics 9: 2543-2554.

Sghaier B., Kriaa W., Jorrin J., Noureddine D.. 2009. Effect of ABA, arginine and sucrose on protein content of date palm somatic embryos. Scientia Horticulturae 120:379–385.

García-Limones C., Dorado, G., Navas-Cortés J.A., Jiménez-Díaz R.M., Tena M. 2009. Changes in the redox status of chickpea roots in response to infection by Fusarium oxysporum f.sp. ciceris: apoplastic antioxidant enzymes and expression of oxidative-stress related genes. Plant Biology 11: 194-203 (doi: 10.1111/j.1438-8677.2008.00095.x).

Gómez-Vidal S., Salinas J., Tena M., López-Llorca L.V. 2009. Proteomic analysis of date palm (Phoenix dactylifera L.) responses to endophytic colonization by entomopathogenic fungi. Electrophoresis 30: 2996-3005 (doi 10.102/elps.200900192).

Gómez-Vidal S., Tena M., López-Llorca L.V., Salinas J. 2008. Protein extraction from Phoenix dactylifera L. leaves, a recalcitrant material, for two-dimensional electophoresis. Electrophoresis 29: 448-456.

Maldonado A.M., Echevarria-Zomeno S., Jean-Baptiste S., Hernández M., Jorrin J. 2008. Arabidopsis thaliana leaf proteome. ExPAsy World-2DPAGE Repository.

Maldonado A.M., Echevarría-Zomeño S., Sylvia Jean-Baptiste, Martha Hernández, Jorrín J. 2008. Evaluation of three different precipitation protocols of protein extraction for Arabidopsis thaliana leaf proteome analysis by two-dimensional electrophoresis. Journal of Proteomics 71: 461-472 (DOI 10.1016/j.jprot.2008.06.012).

Ehevarría-Zomeño S., Ariza D., Jorge I., Lenz C., Jorrín J., Navarro Cerrillo R.. 2008. Changes in the protein profile of Quercus ilex leaves in response to drought-stress and recovery. Journal of Plant Physiology. 166 (3): 233-245 (DOI 10.1016/j.jplph.2008.05.008.

Valledor L., Castillejo M., Lenz C., Rodríguez R., Cañal M.J., Jorrín J. 2008. The 2-DE proteome of Pinus radiata needle tissue: analytical, biological variability and protein identification by LC/MS/MS and substitution-tolerant database searching. Journal of Proteome Research 7: 2616–2631.

Castillejo M.A., Maldonado A..M, Ogueta S., Jorrín, J. 2008. Proteomic analysis of responses to drought stress in sunflower (Helianthus annuus) by two-dimensional gel electrophoresis and mass spectrometry. The Open Proteomics Journal 1: 59-71.

Dunn M.J., Gil C., Kleinhammer C., Lottspeich F., Pennington S., Sanchez J.-Ch., Albar J.P., Bini L., Corrales F., Corthals G.L., Fountoulakis M.M., Hoogland C., James P., Jensen O.N., Jiménez C., Jorrín J., Kraus H.-J., Meyer H., Noukakis D., Palagi P.M., Penque D., Quinn A., Rabilloud T. 2008. EuPA achieves visibility — An activity report on the first three years. Journal of Proteomics 1: 11-18.

Navarro Cerrillo R. M., Ariza D., Porras C., Jorge I., Jorrin J. 2009. Evaluación de la resistencia aparente de individuos de encina a Phytophthora cinnamomi Rands. Boletín de Sanidad Vegetal-Plagas. 35, 2009 (en prensa)

Echevarría-Zomeño S, Valero J, Ariza D, Lenz C, Navarro Cerrilo R, Jorrin J. 2008. Proteómica en Quercus ilex: aplicación al estudio de la variabilidad poblacional y la respuesta a estrés hídrico. Proteómica 1: 63-64.

Ariza Mateos D, Navarro Rm, Del Campo A, Ibañez A, Jorrin J. 2008. Análisis proteómico de la respuesta temprana al establecimiento bajo condiciones de estrés hídrico en Pinus halepensis Mill. Proteómica 1: 64-65.

Jorrín J. 2008. Proteómica, una nueva andadura editorial y un reto para la sociedad (editorial). Proteómica 1: 70-72.

Grupo PAI AGR-248 Barbarroja N, Siendones E, Torres LA, Luque MJ, MartÍnez JM, Dorado G, Velasco F, Torres A,

López-Pedrera Ch (2008): MEK inhibition induces caspases activation, differentiation

Memoria del Departamento de Bioquímica y Biología Molecular. Curso 2008-2009.

24

blockade and PML/RARalpha degradation in acute promyelocytic leukaemia. British Journal of Haematology 142: 27-35. DOI: 10.1111/j.1365-2141.2008.07154.x.

Casado-Díaz A, Santiago-Mora R, Jiménez R, Caballero-Villarraso J, Herrera C, Torres A,

Dorado G, Quesada-Gómez JM (2008): Cryopreserved human bone marrow mononuclear cells as a source of mesenchymal stromal cells: application in osteoporosis research. Cytotherapy 10: 460 - 468. DOI: 10.1080/14653240802192644.

Castillo A, Budak, H, Varshney RK, Dorado, G, Graner A, Hernández P (2008): Transferability

and polymorphism of barley EST-SSR markers used for phylogenetic analysis in Hordeum chilense. BMC Plant Biology 8: 97-105. DOI: 10.1186/1471-2229-8-97.

Castillo A, Budak, H, Martín AC, Dorado, G, Börner A, Röder M, Hernández P (2009):

Interspecies and intergenus transferability of barley and wheat D-genome microsatellite markers. Annals of Applied Biology (en prensa).

Dorado G, Hernández P, Luque-Recio F, Sáiz J, Sánchez A, Dorado MP (2008): The best of

science 2007: A Review. The Science Advisory Board - Perspectives 2: 1-2. ISSN: 1944-0065.

Dorado G, Vásquez V, Rey I, Luque F, Jiménez I, Morales A, Gálvez M, Sáiz J, Sánchez A, Hernández P (2008): Sequencing ancient and modern genomes (REVIEW). Archaeobios 2: 75-80.

García-Limones C, Dorado G, Navas-Cortés JA, Jiménez-Díaz RM, Tena M (2009): Changes in

the redox status of chickpea roots in response to infection by Fusarium oxysporum f. sp. ciceris: apoplastic antioxidant enzyme activities and expression of oxidative stress-related genes. Plant Biology 11: 194-203. DOI: 10.1111/j.1438-8677.2008.00095.x.

Pinzi S, Garcia IL, López -Gimenez FJ, Luque de Castro MD, Dorado G, Dorado MP (2009):

The ideal vegetable oil-based biodiesel composition: a review of social, economical and technical implications. Energy & Fuels 23:2325-2341. DOI: 10.1021/ef801098a.

Torres LA, Barbarroja N, Dorado G, Velasco F, López-Pedrera C (2009): VEGF/KDR loop is a

target of AG1296 in acute myeloid leukaemia showing FLT3-internal tandem duplications. British Journal of Haematology 145:836-838. DOI: 10.1111/j.1365-2141.2009.07673.x.

Grupo PAI CTS-047 Muñoz-Castañeda J.R., Túnez I., Herencia C., Cruz A., Espejo I., Ramírez L.M., Arjona A.,

Montilla P., Padillo F.J. , Muntané J. 2008. Melatonin Exerts A More Potent Effect Than S-Adenosyl-L-Methionine Against iron Metabolism Disturbances, Oxidative Stress And Tissue Injury Induced By Obstructive Jauindice In Rats. Chemico-Biological Interactions . 79-87

Vieyra-Reyes P., Myneur Y.S., Picciotto M.R., Túnez I., Vidaltamayo R., Drucker-Colín R..

2008. Antidepressant-Like Effects Of Nicotine And Transcranial Magnetic Stimulation In The Olfactory Bulbectomy Rat Model Of Depression. Brain Research Bulletin. 13-18

Fernández J., Silga-Grigoletto M. Da, Ruano J., Caballero-Villarraso J. , Moreno-Luna R.,

Túnez I.-Fiñana, Tasset-Cueva I., Pérez-Martínez P., López-Miranda J., Pérez-Jiménez F. 2009. Fructose Modifies The Hormone Response And Modulates Lipid Metabolism In aerobic Exercise After Glucose Supplementation. Clinical Science. 137-145.

Jimena I,, Tasset I., López-Martos R., Rubio A.J., Luque E., Montilla P., Peña J. , Túnez I.

2009. Effects Of Magnetic Stimulation On Oxidative Stress And Skeletal Muscle Regeneration Induced By Mepivacaine In Rat. Medicinal Chemistry. 44-49.

Memoria del Departamento de Bioquímica y Biología Molecular. Curso 2008-2009.

25

Feijóo M., Túnez I., Tasset I., Montilla P., Pérez-Guijo V., Muñoz-Gomariz E., Ruiz A., Schiotis R. , Collantes E.. 2009. Infliximab Reduces Myeloperoxidase Concentration In Chronic Inflammatory Joint Diseases. Pharmacology. 211-216.

Feijóo M., Túnez I., Tasset I., Montilla P., Ruiz A., Collantes E. 2009.Infliximab Reduces

Oxidative Stress In Ankylosing Spondylitis. Clinical And Experimental Rheumatology. 167-168.

Fernández J.M., Da Silva-Grigoletto M.E., Túnez I. 2009. Estrés Oxidativo Inducido Por El

Ejercicio. Revista Andaluza De Medicina Deportiva. 19-34. Túnez I., Santamaría A.2009. Modelo De Enfermedad De Huntington Inducido Por Ácido 3-

Nitropropiónico. Revista De Neurología. Vol: Págs. (Año): 48(8): 430-534. Benítez-Sillero J.D., Pérez-Navero J.L., Tasset I., Guillén Del Castillo M. , Gil Campos M.,

Túnez I.2009. Influence Of Intense Stress Exercise On Saliva Glutathione In Prepubescent And Pubescent Boys. European Journal Of Applied Physiology.181-186.

Pérez-Navero J.L., Benítez-Sillero J.D., Gil-Campos M., Guillén Del Castillo M. , Tasset I.,

Túnez I. 2009. Cambios En Biomarcadores De Estrés Oxidativo Inducidos Por La Pubertad. Anales De Pediatría. 424-428.

Tasset I., Medina F.J., Peña J., Jimena I., Muñoz M.C., Salcedo M., Ruiz, Feijóo M., Montilla

P., Túnez I. 2009. Olfactory Bulbectomy Induced Oxidative And Cell Damage In Rat: Protective Effect Of Melatonin. Physiology Research.

Grupo PAI CTS-577 Muñoz-Castañeda J.R., Túnez I., Herencia C., Cruz A., Espejo I., Ramírez L.M., Arjona A.,

Montilla P., Padillo F.J. , Muntané J.2008. Melatonin exerts a more potent effect than S-adenosyl-L-methionine against iron metabolism disturbances, oxidative stress and tissue injury induced by obstructive jauindice in rats. Chemico-Biological Interactions. 79-87

Jimena I., Tasset I., López-Martos R., Rubio A.J., Luque E., Montilla P., Peña J. , Túnez I.

2009. Effects of magnetic stimulation on oxidative stress and skeletal muscle regeneration induced by mepivacaine in rat. Medicinal Chemistry. 44-49.

Feijóo M., Túnez I., Tasset I., Montilla P., Pérez-Guijo V., Muñoz-Gomariz E., Ruiz A., Schiotis

R., Collantes E. 2009. Infliximab reduces myeloperoxidase concentration in chronic inflammatory joint diseases. Pharmacology. 211-216.

Feijóo M., Túnez I., Tasset I., Montilla P., Ruiz A., Collantes E.2009 Infliximab reduces oxidative

stress in ankylosing spondylitis. Clinical and Experimental Rheumatology. 167-168. Tasset I., Medina F.J., Peña J., Jimena I., Muñoz M.C., Salcedo M., Ruiz C., Feijóo M.,

Montilla P., Túnez I. 2009. Olfactory bulbectomy induced oxidative and cell damage in rat: Protective effect of melatonin. Physiology Research.

c. RESÚMENES PUBLICADOS EN REVISTAS Grupo PAI BIO-151 Alves de Almeida E, Vioque-Fernández A, López-Barea J (2008). Proteomic alterations and

biomarker responses in Procambarus clarkii after controlled exposure to chlorpyrifos and carbaryl. Mar Env Res, 66: 101-103.

Memoria del Departamento de Bioquímica y Biología Molecular. Curso 2008-2009.

26

Grupo PAI BIO-216 Padilla CA, Pedrajas JR, McDonagh B, Bárcena JA. Different roles of mitochondrial and

cytosolic glutaredoxin 2 isoforms. Free Radical Research, 43(Suppl.) S78. d. PONENCIAS Y COMUNICACIONES ORALES PRESENTADAS EN CONGRESOS Grupo PAI BIO-117 Roldán M.D., Luque-Almagro V., Huertas M.J., Sáez L.P., Blasco R., Martínez-Luque M.,

Moreno-Vivián C., Castillo F. (2008). Cyanide utilization as N-source by bacteria. 14th Nitrogen cycle meeting: From Nitrogen cycle to Nitrogen Network. S-5: resumen 5.8, p. 30.

Luque-Almagro V.M., Gates, A., Moreno-Vivián C., Ferguson, S.J., Roldán M.D., Richardson,

D.J. (2008). Nitrate and nitrite assimilation in Paracoccus denitrificans: characterization of the nas gene cluster. 14th Nitrogen cycle meeting: From Nitrogen cycle to Nitrogen Network. S-1: resumen 1.3, p. 9.

Castillo F., Luque, V.M., Pérez-Reinado E., Huertas M.J., Sáez L.P., Escribano, M.P., Gómez,

R., Martínez-Luque M., Moreno-Vivián C., Blasco R., Roldán M.D. (2008). Aplicaciones de la genómica a la biorremediación de compuestos nitrogenados tóxicos. XXXI Congreso de la Sociedad Española de Bioquímica y Biología Molecular. R2-1, p. 102.

Moreno-Vivián C., Luque-Almagro V.M., Huertas M.J., Sáez L.P., Escribano, M.P., Martínez-

Luque M., Blasco R., Roldán M.D., Castillo F. (2008). Cianotrofia: Biodegradación y asimilación de cianuro y sus derivados por Pseudomonas pseudoalcaligenes CECT5344. IX Reunión Nacional del Metabolismo del Nitrógeno. S5-T1, p.68.

Huertas M.J., Luque-Almagro V.M, Escribano, M.P., Martínez-Luque M., García I., Blasco R.,

Moreno-Vivián C., Roldán M.D., Castillo F. (2008). Estudio proteómico y aplicaciones biotecnológicas de la biodegradación de cianuro por Pseudomonas pseudoalcaligenes CECT5344. IX Reunión Nacional del Metabolismo del Nitrógeno. S5-O6, p.74.

Gómez-Cruz, R., Pérez-Reinado E., Roldán M.D., Castillo F., Moreno-Vivián C. (2008).

Purificación y caracterización de la nitrorreductasa NprB de Rhodobacter capsulatus. IX Reunión Nacional del Metabolismo del Nitrógeno. S1-O3, p. 13.

Castillo F., Moreno-Vivián C., Caballero, F.J., Martínez-Luque M., Roldán,M.D., Luque-Almagro

V.M, Sáez L.P., Pérez-Reinado E., Gómez, R., Estepa, J., Herrera, R.H., Gutiérrez, O. (2009). Degradación de polinitrofenoles en Rhodobacter capsulatus: regulación y caracterización de los genes de las nitrorreductasas (npr). IV Jornadas de Divulgación de la Investigación en Biología Molecular Celular, Genética y Biotecnología, p. 108.

Luque-Almagro V.M., Estepa, J., Escribano, M.P., Martínez-Luque M., Moreno-Vivián C.,

Castillo F, Roldán M.D. (2009). Bacterial response to cyanide: a proteomic approach. 14th Nitrogen Cycle Meeting. p. 29.

Pérez-Reinado E., Gómez-Cruz, R., Castillo F., Roldán M.D., Moreno-Vivián C. (2009). The

Rhodobacter capsulatus NprA nitroreductase, an enzyme with a great biotechnological potential. 14th Nitrogen Cycle Meeting. p. 30.

Gates, A.J., Roldán M.D., Ferguson, S.J., Butt, J.N., Richardson, D.J. (2009). PVF of soluble

NapC and its interaction with NapAB. 14th Nitrogen Cycle Meeting. p. 34. Grupo PAI BIO-123 Gómez-Baena G., López-Lozano A., Rangel O, Donaldson Rp, García-Fernández J.M. & Diez

J.

Memoria del Departamento de Bioquímica y Biología Molecular. Curso 2008-2009.

27

Oxidative stress in Prochlorococcus: degradation of glutamine synthetase and effect on proteases gene expression International Conference on Free Radicals & Oxidative Stress in Biology and Medicine. Messina, Italia

López-Lozano A., Rangel O, Muñoz-Marín M.C., Diez J.& García-Fernández J.M.. Nitrogen

assimilation and the C/N balance sensing in Prochlorococcus sp. strains SS120 and MIT9313. 14th Nitrogen Cycle Meeting. Alicante 2009

López-Lozano A., Muñoz-Marín M.C., Gómez-Baena G., Rangel O.A., Diez J.& García-

Fernández J.M.. Expresión de genes implicados en el metabolismo del nitrógeno y del carbono en Prochlorococcus.XXXII Congreso de la Sociedad Española de Bioquímica y Biología Molecular. Oviedo.2009

Grupo PAI BIO-128 Fernández E. Transport and homeostasis of molybdate in the eukaryotic alga Chlamydomonas.

VI Gordon conference for molybdenum and Tunsgten celebrada en Lucca (Barga), Italia del 5 al 10 de Julio de 2009

Fernández E, Tejada-Jiménez M, Camargo A, Llamas A, de Montaigu A, Sanz-Luque E,

Higuera J, González-Ballester D, Schnell R, Lefebvre P and Galván A. Nitrate assimilation in Chlamydomonas as a model system to other organisms. 13th International Chlamydomonas Conference. EMBO Workshop on the Cell and Molecular Biology of Chlamydomonas. Hyères-Les-Palmiers, Francia 2008.

Galván A., Mariscal V, Higuera J, Miller A and Fernández E. The Chlamydomonas NRT2 genes

and the complexity of the nitrate/nitrite transport control in a single cell. 13th International Chlamydomonas Conference. EMBO Workshop on the Cell and Molecular Biology of Chlamydomonas. Hyères-Les-Palmiers, Francia 2008.

Fernández Reyes, Emilio; Galvan Cejudo, Aurora; Llamas Azúa, Angel; Tejada Jiménez,

Manuel; Higuera Sobrino, José Javier; González Ballester, David; Montaigu, Amaury; Sans Luque, Emmanuel. Búsqueda de claves esenciales para la asimilación de nitrato en plantas on el Alga verde Chlamydomonas.XXXI Reunión Anual de la Sociedad de Bioquímica y Biología Molecular de Chile celebrada en Termas de Chillán, Chile Septiembre de 2008

Galvan Cejudo A., Mariscal Romero V., Higuera Sobrino J. J., Fernández Reyes E. Los genes

Nrt2 de Chlamydomonas y la complejidad de controlar el transporte de nitrato/nitrito en una célula. XXXI Congreso de la SEBBM celebrado en Bilbao Septiembre de 2008

Fernández Reyes E., Llamas A., Tejada-Jiménez M., Camargo A., Mariscal V., Montaigu A. ,

Sanz-Luque E., Higuera J., González-Ballester D. y Galván A..Transporte y reducción de nitrato y nitrito en Chlamydomonas Universidad de Córdoba. IX Reunión Nacional Del Metabolismo Del Nitrógeno Alicante 2008

Sanz-Luque E., de Montaigu A., Galván A., Fernández E .Una guanilato ciclasa dependiente de óxido nítrico implicada en la regulación negativa de la asimilación de nitrato en Chlamydomonas. IX Reunión Nacional Del Metabolismo Del Nitrógeno Alicante 2008

Galván A., Fernández E, Llamas A, Tejada-Jiménez M, Higuera J, Sanz-Luque E, Macía-

Gómez M, Chamizo A. Metabolismo del nitrógeno inorgánico en algas: Claves esenciales para la asimilación de nitrato en plantas con un alga verde. IV Jornadas de divulgación de la investigación en biología molecular, celular, genética y biotecnología. Universidad de Córdoba (2009)

Grupo PAI BIO-151 Gómez-Ariza JL, González-Fernández M, García-Barrera T, López-Barea J, Pueyo C.

Integration of metallomics, proteomics and transcriptomics in environmental issues.

Memoria del Departamento de Bioquímica y Biología Molecular. Curso 2008-2009.

28

Conferencia Invitada al Congreso Chemistry and Life. Brno (República Checa), 9-11 de septiembre de 2008.

Alhama J, Cánovas-Conesa B, Chicano E, Gómez-Chaparro JL, Salas-Leiton E, Zerolo BR, Cañavate JP, Fernández-Cisnal R, Montes R, Vioque A, López-Barea J. Análisis proteómico de la embolia gaseosa en lenguados (Solea senegalensis) cultivados en esteros bajo condiciones hiperóxicas. Comunicación oral a las IV Jornadas de Divulgación de la Investigación en Biología Molecular, celular, Genética y Biotecnología. Córdoba, 1-2 Abril, 2009. Actas del Congreso, pp. 101.105.

Ghedira J, Chicano-Gálvez E, Fernández-Cisnal R, Banni M, Boussetta H, López-Barea J, Alhama J. Evaluación de la contaminación del litoral tunecino: utilidad de la proteómica ambiental en Carcinus maenas. Comunicación oral a las XVIII Jornadas de la Sociedad Española de Mutagénesis Ambiental. Barcelona (España). 29 de Junio al 1 de Julio de 2009.

Ghedira J, Chicano-Gálvez E, Fernández-Cisnal R, Banni M, López-Barea J, Boussetta H, Alhama J. Utility of Environmental Proteomics to assess pollutant response of Carcinus maenas along the Tunisian coast. Comunicación oral al 14th International Symposium on Toxicity Assessment. Metz, Francia 30 Agosto al 4 de Septiembre de 2009.

Costa PM, Chicano-Gálvez E, Caeiro S, Lobo J, Martins M, Ferreira AM, Caetano M, Vale C, López -Barea J, DelValls A Costa MH. Proteomics in Ecotoxicology: Comparing in situ to laboratory assays using benthic fish for ecological risk assessment. Comunicación oral al 14th International Symposium on Toxicity Assessment. Metz, Francia 30 Agosto al 4 de Septiembre de 2009.

Pueyo C, Ruiz-Laguna J, Prieto-Alamo MJ, Abril N, Jurado J, López-Barea J. Transcriptomics and Proteomics in Mus spretus: new tools for environmental pollution assessment. Conferencia invitada al 10th International Conference on Environmental Mutagens (ICEM), 39th Annual Meeting of the European Environmental Mutagen Society (EEMS) and 18th Annual Meeting of the Italinan Environmental Mutagen Society (SIMA). Florencia, 20-25 Agosto de 2009.

Grupo PAI BIO-278 Encinas Villarejo S, Maldonado A, de los Santos B, Romero F, Pliego-Alfaro F, Muñoz J.,

Caballero. Functional characterization of a strawberry FaWKRY protein and its Arabidopsis homologous at WRKY75 two positive regulators of resistance. VI International Strawberry Symposium ISHS.Pag 58. Huelva (Spain). 2008

Encinas Villarejo S, Maldonado A, de los Santos B, Romero F, Pliego-Alfaro F, Muñoz J.,

Caballero.Functional characterization of a strawberry FaWKRY protein and its Arabidopsis homologous at WRKY75 two positive regulators of resistance. VI International Strawberry Symposium ISHS.Pag 58. Huelva (Spain). 2008

Encinas-Villarejo, S., Maldonado, A., de los Santos, B., Romero-Muñoz F., Pliego.Alfaro, F.,

Muñoz Blanco, J., Caballero J.L. The strawberry (Fragaria x ananassa) FaWRKY PROTEIN AND ITS Arabidopsis homologue, AtWRKY75, act as two positive regulators of resistance. IX Biología Molecular de Plantas. Santiago, julio, España.2008

Grupo PAI AGR-164

Hernández M, Pérez A, Lorenzo J, Carvajal C, Mora M, Natalucci C, Jorrín J. 2009. Proteases expressed in response to in vitro culture of pineapple (Ananas comosus (L.) Merr.). Bio Veg 2009. 7th Internacional Congress on Plant Biotechnology. Tools for Modern Agricultura. Ciego de Avila, Cuba, 11-15 Mayo 2009

Sghaier-Hammami B., Redondo I., Echevarría Zomeño S., Maldonado A.M., Jorrín Novo J.V. 2009. Changes in the Arabidopsis leaves 2-DE protein profile in response to Pseudomonas syringae inoculation; the use of non-depleted and RubisCO depleted leaf extracts. COST FA0603 (Plant Proteomics in Europe)- WG1 Meeting: “Technical Aspects inherent to Plant

Memoria del Departamento de Bioquímica y Biología Molecular. Curso 2008-2009.

29

Proteomics. Classical and Novel Approaches in Plant proteomics” Viterbo, Italy, 5-6 Mayo 2009

Cattaneo C., Bona E., Cavaletto,M., Berta G., Maldonado A.M., Echevarria Zomeño S., Jorrín Novo J.V. 2009. Protein glutathionylation in fern fronds. COST FA0603 (Plant Proteomics in Europe)- WG1 Meeting: “Technical Aspects inherent to Plant Proteomics. Classical and Novel Approaches in Plant proteomics” . Viterbo, Italy, 5-6 Mayo 2009

Gicquel M., Esnault M.E., Jorrín Novo J.V., Cabello Hurtado F.C. 2009. Plant proteomics in response to ionising radiations. COST FA0603 (Plant Proteomics in Europe)- WG1 Meeting: “Technical Aspects inherent to Plant Proteomics. Classical and Novel Approaches in Plant proteomics” . Viterbo, Italy, 5-6 Mayo 2009

Tena M., Jorrín J., Maldonado A.M., Echevarría-Zomeño S., Curto M., Valero J., Hammami-Sghaier B., Valledor L., Donoso G.H., Molina M.C., Redondo I., González R., Sylvia J.B., Cabello F. , De La Canal L., Hernández De La Torre M., Jorge I. 2009. BIOQUÍMICA Y PROTEÓMICA VEGETAL Y AGRÍCOLA (AGR-164) 2007-2009. IV Jornadas de Divulgación de la Investigación en Biología Molecular, Celular, genética y Biotecnología. Dpto de Bioquímica y Biología Molecular, Universidad de Córdoba, 1-2 abril 2009.

Maldonado-Alconada A M., Ogueta-Villareal S., Martínez-Acedo P, Martínez-Ruiz A, Vazquez J, Jorrín-Novo, J. 2009. Identificación de dianas de s-nitrosilación durante la interacción planta-patógeno. I Jornadas Bienales de Proteómica, SEProt. (Sitges, Barcelona. Febrero 2008).

Martínez-Acedo P., Martínez-Ruiz A., Maldonado Alconada A.M., Horcajo-Redondo M., Jorge I, Serrano H., Navarro P., Pérez-Hernández D., Nuñez E., Redondo J., Jorrín J., Lamas S., Vazquez J. 2009. New insights in the study of s-nitrosylation & nitration: strategies and problems. I Jornadas Bienales de Proteómica, SEProt. (Sitges, Barcelona. Febrero 2008).

Yabor Cabrera L, Pozo A, Castillejo Ma, Echevarria S, Valle B, Lorenzo Jc, Hernández M, Jorrin J. 2008. Analisis proteómico de plantas de piña (Ananas comosus) transgénicas. XVI Congreso Científico Internacional del Instituto Nacional de Ciencias Agrícolas. San Jose de las Lajas, la Habana, Cuba, 25-28 de noviembre de 2008

Yabor Cabrera L, Castillejo Ma, Echevarria S, Valle B, Lorenzo Jc, Hernández M, Jorrin J. 2008. Proteomic analysis of transgenic pineaple (Ananas comosus [L.] Merr.) plants. Biotecnología Habana 2008. Abstract book, S7-P31. La Habana, Cuba, 30 noviembre a 5 diciembre 2008

Navarrete C., Curto M., Martínez J.L., Jorrín J., Ramos J. 2008. Biochemical and proteomic approaches to the study of potassium homeostasis in Saccharomyces cerevisiae. 4th Meeting of the Spanish Systems Biology Network (REBS). From genomes to in siico and back.. Abstract book, p. 18. Valencia, 1-2 diciembre 2008.

Jorrín J.V., Navarro Cerrillo R., Valero J. Galván, Ariza D. Mateos, Valledor L. González, Cañal M.J., Rodríguez R. Fernández, Besma Sghaier, Gabriel Donoso, Martha Hernández De La Torre, Lourdes Yabor, Aurora Pérez. Proteómica de especies leñosas de interés agrícola y forestal. Reunión Bianual de la Red de genómica y Diversidad genética Forestal (GEN2FOR). Abstract book, p. 27. Universidad de Málaga, Málaga, 20-21 noviembre 2008

Navarro Cerrillo R., Ariza D. Mateos, Cerrudo J., Echevarría Zomeño S., Valero J., Jorrín J.V. 2008. Estudios de Proteómica aplicados a la caracterización de poblaciones y respuesta a estrés en Quercus ilex L. y Pinus halepensis Mill. Reunión Bianual de la Red de Genómica y Diversidad genética Forestal (GEN2FOR). Abstract book, p. 29.Rectorado de la Universidad de Málaga, Málaga, 20-21 noviembre 2008

Maldonado Alconada A.M., Lindermayr C., Durner J., Jorrín Novo J.V. 2008. Proteomic identification of S-nitrosylated proteins in Arabidopsis thaliana in response to pathogens. II “Plant Proteomics in Europe” Meeting (Working Group 2): Will plant proteomics research help in facing food, health and environmental concerns?. Abstract book, p. 44. Córdoba, Campus de Rabanales, :6-8 febrero 2008.

Grupo PAI CTS-047

Memoria del Departamento de Bioquímica y Biología Molecular. Curso 2008-2009.

30

Cruz C., Jiménez Y., Lora M.P., Delgado N., Túnez I., Pérez F., López J. Dieta, status oxidativo

y síndrome metabólico: II Congreso Internacional Sobre Aceite de Oliva y Salud. CIAS’08. Córdoba-Jaén. 2008. Internacional

Gutiérrez F.M., Yubero E., Cruz C., Marín C., Túnez I., Villalba J.M., Pérez F., López J.. Efecto

del consumo de una alimentación mediterránea suplementada en coenzima Q10 sobre los niveles de P53 en respuesta al daño en el ADN. II Congreso Internacional Sobre Aceite de Oliva y Salud. CIAS’08 Córdoba-Jaén. 2008. Internacional

Túnez I., Tasset I., Villén C., Jiménez Y., García J.M., Roche H., Pérez F., López J.

Postprandial oxidative status alter the intake of diets with different fat composition in patients with metabolic syndrome. II Congreso Internacional Sobre Aceite de Oliva y Salud. CIAS’08. Córdoba-Jaén. 2008. Internacional

Yubero E., Túnez I., Gómez M.J., Pérez P., García A., Villalba J.M., Pérez F., López J.

Influencia del consume de una alimentación mediterránea suplementada en coenzima Q10 sobre el estrés oxidativo celular. II Congreso Internacional Sobre Aceite de Oliva y Salud. CIAS’08. Córdoba-Jaén. 2008. Internacional

Pérez J.L., Benítez J.D., Gil M., Guillén Del Castillo M. , Tasset I. Cuevas, Túnez I. Cambios en

biomarcadores de estrés oxidativo inducidos por la pubertad.58 Congreso de la Sociedad Española de Pediatría. Zaragoza. 2009. Nacional

e. COMUNICACIONES EN CONGRESOS Grupo PAI BIO-117 Huertas M.J., Luque-Almagro V.M., Sáez, L., Escribano, M.P., Martínez-Luque M., García I.,

Blasco R., Roldán M.D., Castillo F., Moreno-Vivián C. (2008). Pseudomonas pseudoalcaligenes CECT5344: degradación de cianuro y producción de bioplásticos. BIOTEC2008: 4th Internacional Meeting on Biotechnology. P-AM22, p. 176.

Pérez-Reinado E., Gómez-Cruz, R., Castillo F., Roldán M.D., Moreno-Vivián C. (2008).

Purificación y caracterización de las nitrorreductasas NprA y NprB de Rhodobacter capsulatus. BIOTEC2008: 4th Internacional Meeting on Biotechnology. P-AM13, p. 167.

Sáez L.P., Huertas M.J., Luque, V.M., Martínez-Luque M., Blasco R., Moreno-Vivián C., Roldán

M.D., Castillo F. (2008). Genes implicados en la utilización de cianato por Pseudomonas pseudoalcaligenes CECT5344. IX Reunión Nacional del Metabolismo del Nitrógeno. S5-P9, p.84.

Luque-Almagro V.M., Huertas M.J., Martínez-Luque M., Blasco R., Moreno-Vivián C., Castillo

F., Roldán M.D. (2008). Papel del oxalacetato y su cinahidrina en la utilización de cianato por Pseudomonas pseudoalcaligenes CECT5344. IX Reunión Nacional del Metabolismo del Nitrógeno. S4-P6, p.66.

Roldán M.D., Pérez-Reinado E., Castillo F., Moreno-Vivián C. (2008). Papel de la

nitrorreductasa NprA en la biosíntesis de aminoácidos aromáticos IX Reunión Nacional del Metabolismo del Nitrógeno. S5-P7, p-.82.

Luque-Almagro V.M., Blasco R., Moreno-Vivián C., Castillo F, Roldán M.D., Martínez-Luque, M.

(2009). Dinitrogen cycle evolution in earth. 14th Nitrogen Cycle Meeting. p. 48. Grupo PAI BIO-123

Memoria del Departamento de Bioquímica y Biología Molecular. Curso 2008-2009.

31

Gómez-Baena G., López-Lozano A., Gil-Martínez J., Lucena JM, Diez J.& García-Fernández

J.M. Glucose uptake and utilization by Prochlorococcus strains 7th European orkshop on Molecular Biology of Cyanobacteria. Ceské Budéjovice, República Checa

Grupo PAI BIO-128 VI Gordon conference for molybdenum and Tunsgten celebrada en Lucca (Barga), Italia del 5 al 10 de Julio de 2009. Poster: Moco biosynthesis in Chlamydomonas reinhardtii: Molybdate transport and Moco insertion in apo-molybdoenzymes. M Tejada, A Llamas, A Galván, E Fernández. IX Reunión Nacional Del Metabolismo Del Nitrógeno Alicante 2008. Posters:

o GENES Nar1 Y ADAPTACIÓN METABÓLICA EN Chlamydomonas Higuera-Sobrino J, Philips G1, Hernschemeier1 A, Happe1 T, Fernández E, Galván A.

o Las proteínas de Chlamydomonas cnx1g, cnx1e y sus quimeras reconstruyen la biosíntesis de cofactor de molibdeno en procariotas Ángel Llamas, Manuel Tejada-Jiménez, Aurora Galván, Emilio Fernández

o Transporte de molibdato en Chlamydomonas Manuel Tejada-Jiménez, Ángel Llamas Azúa, Emanuel Sanz-Luque, Aurora Galván Cejudo y Emilio Fernández Reyes

Grupo PAI BIO-151 García-Barrera T, González-Fernández M, López-Barea J, Pueyo C, Gómez-Ariza JL.

Identification of Cu metalloproteins in Mus musculus brain extracts by reversed phase HPLC coupled with ICP-MS and ESI-qQ-TOF. Poster presentado al Congreso Chemistry and Life, Brno (Rep Checa), 9-11 de Septiembre de 2008

González-Fernández M, García-Barrera T, López-Barea J, Pueyo C, Gómez-Ariza JL. Copper biomolecules occurence in Mus musculus brain as biomarkers of contamination. Use of multidimensional analytical approaches based on ICP-MS (Metallomics). Poster presentado al 6th International Copper Meeting. Copper and related metals in Biology. Cerdeña (Italia), 11-15 Octubre de 2008.

Gómez-Ariza JL, González-Fernández M, García-Barrera T, López-Barea J, Pueyo C. Systems Biology based on the integration of transcriptomics, proteomics and metallomics of copper-biomolecules related to environmental issues. Poster presentado al 6th International Copper Meeting. Copper and related metals in Biology. Cerdeña (Italia), 11-15 Octubre de 2008.

González-Fernández M, García-Barrera T, López-Barea J, Pueyo C, Gómez-Ariza JL. Metallomics study of Cu-Metalloproteins in the brain of the mouse Mus musculus. Poster presentado a las 12as Jornadas de Análisis Instrumental (JAIs), Barcelona, 21-23 Octubre de 2008.

Gómez-Chaparro JL, Muñoz Calero M, Jurado-Gámez B, Ruiz Laguna J, Bonilla Valverde D, Serna Sanz A, Muñoz Cabrera L, Cosano Povedano A, López-Barea J. Aproximación proteómica al síndrome de apneas-hipoapneas del sueño. Poster presentado al Joint Congress of the Spanish Proteomics Society and the Latin American Human Proteome Organization. Pamplona, 10-13 Febrero de 2009.

Gómez-Chaparro JL, Ruiz González MD, Izqueirdo Palomares LN, Rodriguez Torronteras A, Ruiz Laguna J, López-Barea J. 2-DE analysis of será protein expression profiles in earlystages of human neonatal development. A preliminary study. Poster presentado al Joint Congress of the Spanish Proteomics Society and the Latin American Human Proteome Organization. Pamplona, 10-13 Febrero de 2009.

Vioque-Fernández A, Alves de Almeida E, López-Barea J. Proteomic alterations in Procambarus clarkii after controlled exposure to chlorpyrifos and carbaryl. 15th International Symposium on Pollutant Responses in Marine Organisms. Bordeaux, Mayo 17 – 20, 2009.

Vioque-Fernández A, Alves de Almeida E, López-Barea J. Assessment of Doñana National Park contamination in Procambarus clarkii: proteomic approaches. 15th International

Memoria del Departamento de Bioquímica y Biología Molecular. Curso 2008-2009.

32

Symposium on Pollutant Responses in Marine Organisms. Bordeaux, Mayo 17 – 20, 2009.

López-Barea J, Alhama J, Montes R, Pueyo C, Romero A, Vioque A. Environmental Proteomics assessment around Doñana National Park (SW Spain). Poster presentado a la 10th International Conference on Environmental Mutagens (ICEM), 39th Annual Meeting of the European Environmental Mutagen Society (EEMS) and 18th Annual Meeting of the Italinan Environmental Mutagen Society (SIMA). Florencia, 20-25 Agosto de 2009.

Grupo PAI BIO-187 Ruiz Laguna J, Fuentes Almagro CA, Montes Nieto R, Prieto-Álamo MJ, Osuna Jiménez I,

Abril N, Gómez Ariza JL. López Barea J, Pueyo C. El ratón de campo Mus spretus en la monitorización de ecosistemas terrestres: integración de la transcriptómica y proteómica. Ponencia. CICTA 2008. Lisboa (Portugal) 2008.

González-Fernández M, García-Barrera T, Moreno-Roldán F, Pueyo C, López-Barea J, Gómez-Ariza JL. La metalómica ambiental y su integración con la proteómica y genómica. Ponencia. CICTA 2008. Lisboa (Portugal) 2008.

Pueyo C, Ruiz-Laguna J, Fuentes-Almagro CA, Montes-Nieto R, Jurado J, Prieto-Álamo MJ, Osuna-Jiménez I, Abril N, Gómez-Ariza JL, López-Barea J. Renovación tecnológica en los estudios de contaminación ambiental mediante la integración de tecnologías ómicas. Conferencia inagural. XVII Reunión de la SEMA. Sevilla 2008.

Prieto-Álamo MJ, Abril N, Osuna I, Pueyo C. Identificación de genes diferencialmente expresados en lenguado (Solea senegalensis) en respuesta a LPS o CuSO4 mediante la obtención de genotecas substractivas (Supression Subtractive Hybridization PCR). Comunicación oral. XVII Reunión de la SEMA. Sevilla 2008.

Osuna-Jiménez I, Williams TD, Prieto-Álamo MJ, Abril N, Chipman JK, Pueyo C. Análisis de la respuesta hepática de Solea senegalensis al tratamiento con LPS o CuSO4 mediante el uso de microarrays heterólgos. Comunicación oral. XVII Reunión de la SEMA Sevilla 2008.

Aguilar-Melero P, Prieto-Álamo MJ, Pueyo C. Efecto de la inhibición estable de la expresión del gen Prdx1 en la línea de hepatocarcinoma humano HepG2. Comunicación oral. XVII Reunión de la SEMA. Sevilla 2008.

Michán C, Pueyo C. Defensas oxidativas y nitrosativas en Candida albicans: Respuesta a miconazol y macrófagos. Comunicación oral. XVII Reunión de la SEMA. Sevilla 2008.

González-Fernández M, García-Barrera T, López-Barea J, Pueyo C, Gómez-Ariza JL. Identificación de Cu unido a proteínas en extracto de cerebro de Mus musculus mediante (RP)HPLC acoplado a ICP-MS y ESI-Qq-TOF. Poster. GRASEQA 2008. XI Reunión del Grupo Regional Andaluz de la Sociedad Española de Química Analítica. Foro Internacional de Proteínas. Huelva 2008.

González Fernández M, García-Barrera T, Arias-Borrego A, López Barea J, Pueyo C, Gómez-Ariza JL. Characterization of Cu-metalloproteins in the liver and brain of the Mus musculus by reversed phase HPLC coupled with ICP-MS and ESI-Qq-MS. Poster. 4th International Conference on Trace Element Speciation in Biomedical, Nutritional and Environmental Sciences. Munich (Alemania) 2008.

González-Fernández M, García-Barrera T, López-Barea J, Pueyo C, Gómez-Ariza JL. Comparison of cytosolic brain metallome from Mus musculus and the consanguineous aborigine Mus spretus. Poster. 4eme Conference Internationale sur les Metaux et la Genetique. París (Francia) 2008.

Gómez-Ariza JL, González-Fernández M, García-Barrera T, López-Barea J, Pueyo C. Integration of metallomics, proteomics and transcriptomics in environmental issues. Conferencia Invitada. Congreso Chemistry and Life. Brno (República Checa) 2008.

García-Barrera T, González-Fernández M, López-Barea J, Pueyo C, Gómez-Ariza JL. Identification of Cu metalloproteins in Mus musculus brain extracts by reversed phase HPLC coupled with ICP-MS and ESI-qQ-TOF. Poster. Congreso Chemistry and Life. Brno (Rep Checa) 2008.

González-Fernández M, García-Barrera T, López-Barea J, Pueyo C, Gómez-Ariza JL. Copper biomolecules occurence in Mus musculus brain as biomarkers of contamination. Use of

Memoria del Departamento de Bioquímica y Biología Molecular. Curso 2008-2009.

33

multidimensional analytical approaches based on ICP-MS (Metallomics). Poster. 6th International Copper Meeting. Copper and related metals in Biology. Cerdeña (Italia) 2008.

Gómez-Ariza JL, González-Fernández M, García-Barrera T, López-Barea J, Pueyo C. Systems Biology based on the integration of transcriptomics, proteomics and metallomics of copper-biomolecules related to environmental issues. Poster. 6th International Copper Meeting. Copper and related metals in Biology. Cerdeña (Italia) 2008.

González-Fernández M, García-Barrera T, López-Barea J, Pueyo C, Gómez-Ariza JL. Metallomics study of Cu-Metalloproteins in the brain of the mouse Mus musculus. Póster. 12as Jornadas de Análisis Instrumental (JAIs). Barcelona 2008.

Pueyo C, Abril N, Prieto-Álamo MJ, Jurado J, Michán C, Ruiz-Laguna J, Osuna-Jiménez I. Biología molecular de los mecanismos de respuesta a estrés. Ponencia: Análisis global de los patrones de expresión génica del lenguado (Solea senegalensis) en respuesta a LPS o CuSO4 mediante genotecas sustractivas y microarrays heterólogos. IV Jornadas de Divulgación de la Investigación en Biología Molecular, Celular, Genética y Biotecnología. Córdoba 2009.

Pueyo C. Transcriptomics and Proteomics in Mus spretus: New Tools for Environmental Pollution Assessment. Ponencia. 10th International Conference on Environmental Mutagens (ICEM). Florencia (Italia) 2009.

López-Barea J, Alhama J, Montes R, Pueyo C, Romero A, Vioque A. Environmental proteomics assessment around Doñana National Park (SW Spain). Poster. 10th International Conference on Environmental Mutagens (ICEM). Florencia (Italia) 2009.

Jurado J, Fuentes-Almagro, C, Prieto-Álamo MJ, Osuna-Jiménez I, Pueyo C. Identificación de proteínas con tioles sensibles a estrés oxidativo en células HEPA1-6. Comunicación oral. XVIII Reunión de la SEMA. Barcelona 2009.

Grupo PAI BIO-216 Padilla, CA, Pedrajas, JR, McDonagh, B, Bárcena, JA. Different roles of mitochondrial and

cytosolic glutaredoxin 2 isoforms. SFRR Meeting-Europe 2009. Rome, 2009. McDonagh B, Ogueta S, Padilla CA, Lasarte G, Rodríguez-Ortega MJ, Bárcena JA (2008)

Detection of redox modified proteins by gel-free proteomics. I Jornadas Bienales de Proteómica, SEProt. (Sitges, Barcelona. Febrero 2008).

Padilla CA, Martinez-Galisteo E, Peinado J, Rodríguez-Ortega MJ, McDonagh B, Olaya A,

Muñoz LL, Bárcena JA. Proteómica para todo: Biomarcadores, Vacunas y Estrés Oxidativo. IV Jornadas de Divulgación de la Investigación en Biología Molecular, Celular y Genética. Córdoba: Universidad de Córdoba, pp. 149-154, 2009.

Grupo PAI BIO 278 Muñoz J., Caballero JL, Blanco R., Bellido ML, Cumplido G, Moreno B, García C, Amil F,

Encinas S, Bombarely A, Sanchez J, Valpuesta V. Searching for the strawberry genes by funcitional genomic as valuable biotechnological Tools. VI International Strawberry Symposium ISHS. Pag 38 Huelva 2008

Bellido ML, Blanco R., García C, Caballero JL, Muñoz J. MADS-box genes involved in

strawberry fruit ripening and senescence: Identification of putative target genes regulated by FaMADS1 using microarrays. VI International Strawberry Symposium ISHS.Pag 167. Huelva 2008

García C, Schnäbele K, Blanco R., Bellido ML, Schwab W, Caballero JL, Muñoz J.

Characterization of FaCCD1: A carotenoid cleavage dioxygenase from strawberry involved in lutein degradation during fruit ripening. VI International Strawberry Symposium ISHS.Pag 183. Huelva 2008

Memoria del Departamento de Bioquímica y Biología Molecular. Curso 2008-2009.

34

García AJ, Yubero EM, Sandalio LM, Muñoz J, Caballero JL, Chueca A, Sahrawy M. A novel chloroplastic Fructose-1,6-biphosphatase from strawberry: Similitude and differences with other isoforms. VI International Strawberry Symposium ISHS.Pag 224.Huelva 2008

Quesada MA, Posé S, Santiago N, Sesmero R, Molina MC, Mousa S, Pliego-Alfaro F, Mercado

JA, Caballero JL, Muñoz J., Trainotti L, Cassadoro G, García Gago JA, López-Aranda JM. Effect of silencing of cell wall degrading enzymes on strawberry fruit texture. VI International Strawberry Symposium ISHS.Pag 410. Huelva 2008

Soliveri J, Arenas M, Caballero JL, Muñoz J., Copa-Patiño JL . Biocontrol of plant diseases:

Production and testing of novel elicitors inducing plant defense responses. VI International Strawberry Symposium ISHS.Pag 365. Huelva 2008 Amil F, de los Santos B, Pliego-Alfaro F, Romero F, Muñoz J., Caballero JL. Molecular and

Functional Characterization of the Fanpr1 Strawberry Gene, an Arabidopsis thaliana npr1 Homologue. VI International Strawberry Symposium ISHS.Pag 182. Huelva 2008

Amil F, Encinas S., Maldonado A.M.,de los Santos B., Romero F, Pliego F., Muñoz J.,

Caballero J.L.Increasing biomass and productivity of strawberry by transcriptional activation of genes associated with the plant defence response. Environment Workshps-Plant Biomass for food and energy: future and reality (International University of Andalusia- UNIA). UNIA-Baeza, 9-11 octubre, España 2008

Suárez B., Cumplido G., Medina L., Bellido M.L., Caballero J.L., Muñoz J., Blanco R.

Caracterización molecular de genes relacionados en procesos de resistencia a patógenos y en la maduración del fruto de fresa. IX Biología Molecular de Plantas Santiago, julio, España 2008

Amil F., de los Santos B., Alfaro P., Romero F., Muñoz J., Caballero JL. Fanpr1 Strawberry

genes, an Arabidopsis thaliana npr1 homologue. IX Biología Molecular de Plantas. Santiago, julio, España 2008

García C., Schnäbele K., Blanco R., Bellido ML., Cumplido G., Moreno B., Medina L., Moyano

E., García N., Schwab W., Caballero JL, MuñozJ. Caracterización funcional del gen que codifica una dioxigenasa de fresa (FaCCD1) involucrada en la degradación de luteina en fruto de fresa (Fragaria x ananassa). IX Biología Molecular de Plantas. Santiago, julio, España 2008

Cumplido G., Medina L., Moreno B., Bellido ML., García C., García N., Caballero JL, Muñoz

J., Blanco R.. Estudios de expresión y unción fisiológica de una alcohol acil transferasa (FaAAT2) de fruto de fresa (Fragaria x ananassa). IX Biología Molecular de Plantas. Santiago, julio, España 2008

Blanco R., Cumplido G., Moreno B., Medina L., García C., Bellido ML., Moyano E., Caballero

JL, Muñoz J. Estudios funcionales de genes potencialmente reguldores del proceso de maduración de la fresa (Fragaria x ananassa). IX Biología Molecular de Plantas. Santiago, julio, España 2008

Bellido ML., Blanco R., Moyano E., García C., Cumplido G., Moreno B., Medina L., Caballero

JL, Muñoz J. MADS-BOX Genes involved in Strawberry fruit ripening: Identification of putative target genes regulated by FaMADS1 using microarrays. IX Biología Molecular de Plantas. Santiago, julio, España 2008

Medina L., Blanco R., Cumplido G., Moreno B., Bellido ML., García C., García N., Caballero

JL, Muñoz J. Determinación del papel que desempeña el ácido abscísico en la maduración de la fresa, mediante estudios funcionales de los genes NCEDs

Memoria del Departamento de Bioquímica y Biología Molecular. Curso 2008-2009.

35

Grupo PAI AGR-164

Jorrín J.V. Plant proteomics. XVIII Reunión de la SEFV. Zaragoza, 8-11 septiembre 2009.

Jorrín J.V. 2009. Molecuar Techniques for Proteomics. Forest and Water Stress in a Changing Environment: from Cell to Ecosystems. COST FP 0601 (Forest Management and the Water Cycle)/ COST FA 0603 (Plant Proteomics in Europe). Mauro Centritto/Francesco Loreto. Orvieto (Italy), 20-23 May 2009

Jorrín J.V. 2009. Proteomics of drought resistance. Forest and Water Stress in a Changing Environment: from Cell to Ecosystems. COST FP 0601 (Forest Management and the Water Cycle)/ COST FA 0603 (Plant Proteomics in Europe). Mauro Centritto/Francesco Loreto. Orvieto (Italy), 20-23 May 2009.

Jorrín J.V. 2009. Proteomics in the study of plant responses to biotic and abiotic stresses. IUBMB Special Meeting on Plant Stresses/6th FASBMB Congress. Marrakech, Morocco, April 20-24, 2009. Moroccan Society of Biochemistry and Molecular Biology (SMBMB)Jorrín J.V. Bioquímica y proteómica vegetal y agrícola. 1ª Jornada Conjunta GenProt (reunió conjunta de genómica y proteómica dela Xarsa Valenciana y Xarsa Catalana, i de la Secció dela SCB. Peñíscola (Hotel Peñíscola Plaza Suites), 7 y 8 de marzo de 2008.

Jorrín J.V., Maldonado A.M. Alconada. 2008. Análisis de cultivos transgénicos mediante proteómica. Curso de verano Corduba 2008. Células madre, transgénicos y embriogénesis: fundamentos, aplicaciones, legislación y ética. Universidad de Córdoba, Campus de Rabanales, 14 al 18 de julio de 2008

Maldonado A.M. Alconada. 2008. Protein identification of S-nitrosylated proteins in Arabidopsis thaliana in response to pathogen infection. III Meeting of the Spanish Proteomics Society (Joint Congreso of the Spanish Proteomics Society and the Latin American Human Proteome Organization). (Pamplona, 10-13 febrero 2009). Lenz C., Seymour S., Shilov I., Jorrín-Novo J.V. 2008. ProteinPilot: accomodating genetic diversity in mass spectrometry-based plant proteome research. II “Plant Proteomics in Europe” Meeting (Working Group 2): Will plant proteomics research help in facing food, health and environmental concerns? Universidadde Córdoba, Campus de Rabanales, 6-8 febrero 2008.Viterbo 2009-COST FA 0603-WG1 Meeting. Technical aspects inherent to plant proteomics. Classical and novel approaches. Viterbo, Italy, May 5-7.

Sghaier-Hammami B, Redondo I, Echevarría Zomeño S, Maldonado A.M, Jorrín Novo Jv.

Changes in the Arabidopsis leaves DE protein profile in response to Pseudomonas syringae inoculation; the use of non-depleted and RubisCO depleted leaf extracts.

Cattaneo C, Bona E, Cavaletto M, Berta G, Maldonado Am, Echevarría-Zomeño, S, Jorrín Novo

Jv. Protein Glutathionylation In Fern Fronds. 3rd SeProt – 2nd LAHUPO Congress, Pamplona, 10-13 de febrero, 2009.

Besma Sghaier Hammami, Jorrín J.V. And Noureddine Drira. Date palm somatic embryos:

variability in protein expression level assessed by 2-DE and protein identification. Echevarría-Zomeño S, Maldonado Am, Redondo I, Jorrín Novo Jv. S-GLUTATHIONYLATION

IN Arabidopsis thaliana. Tello D., Tarín C., Martínez-Acedo P., Maldonado A.M., Ogueta S., Jorrín J.V., Vázquez J.,

Lamas S., Martínez-Ruiz A. Increasing the sensitivity of proteomic identification of s-nitrosylated proteins: towards the S-nitrosoproteomes in (patho)physiological settings.

Egidi E., Echevarria-Zomeño S., Maldonado Alconada A.M., Redondo I., Jorrín Novo J.V.

Arabidopsis thaliana leaf disulfide proteome. Palomares-Rius F.J., Maldonado Alconada A.M., Gómez-Guillamón M.L., Jorrín Novo J.V.

Proteomic analysis of Cucumis melo L. Phloem as an approach to study resistance to Bemisia tabac i Genn

Memoria del Departamento de Bioquímica y Biología Molecular. Curso 2008-2009.

36

IX Reunión de Biología Molecular de Plantas. Santiago. Julio 2008

Encinas-Villarejo S., Maldonado A.M., De Los Santos B., Romero F., Pliego-Alfaro F., Muñoz ., Caballero J.L. The strawberry (Fragaria x ananassa) FaWRKY protein and its Arabidopsis homologue, AtWRKY75, act as two positive regulators of resistance.

II “Plant Proteomics in Europe” Meeting (Working Group 2): Will plant proteomics research help in facing food, health and environmental concerns? Córdoba, Campus de Rabanales, 6-8 febrero 2008.

Valero galván j, echevarría-zomeño s, ariza d, lenz ch, navarro rm, jorrín j. Proteomics in Quercus ilex and its application to the study of variability among populations and drought stress responses

Yabor L, Castillejo Ma, Echevarría-Zomeño S, Maldonado Am, Valle B, Lorenzo Jc, Hernández M, Jorrín Novo Jv. Proteomic analysis of transgenic pineapple [Ananas comosus (L.) Merr.] plants

I Jornadas Bienales de Proteómica para Jóvenes Investigadores, Sitges, Barcelona, 21-22 de Febrero, 2008.

Echevarría-Zomeño S, Valero Galván J, Ariza D, Lenz Ch, Navarro Rm, Jorrín J. Proteómica en Quercus ilex: aplicación al estudio de la variabilidad poblacional y la respuesta a estrés hídrico

Reunión Bianual de la Red de genómica y Diversidad genética Forestal (GEN2FOR), Málaga, 20-21 de noviembre, 2008.

Navarro Cerrillo Rm, Ariza D, Jorge Cerrudo I, Echevarría-Zomeño S, Valero Galván J, Jorrín Novo Jv. Estudios de Proteómica aplicados a la caracterización de poblaciones y respuesta a estrés en Quercus ilex L. y Pinus halepensis Mill.

Grupo PAI AGR-248 Casado-Díaz A, Anter J, Santiago-Mora R, Luque L, Dorado G, Quesada JM (2008): High

concentrations of hydroxytyrosol and quercetin antioxidants enhance adipogenesis and inhibit osteoblastogenesis in mesenchymal stem cells. 30th Annual Meeting of the American Society for Bone and Mineral Research (ASBMR) (Montreal, Canadá).

Díaz D, Claros MG, Falgueras J, Hernández P, Caballero JA, Dorado G, Gálvez S (2008):

DemAlign/Omega-Jalview: an algorithm/viewer for fast discovering differences in similar sequences. Accelrys Science & Technology Forums 2008 (París, Francia).

Díaz D, Falgueras J, Claros MG, Guerrero DD, Hernández P, Caballero JA, Dorado G, Gálvez

S (2008): Integrating bioinformatics workflow tools: Omega-Brigid and Scitegic Pipeline Pilot. Accelrys Science & Technology Forums 2008 (París, Francia).

Dorado G, Díaz D, Falgueras J, Caballero JA, Hernández P, Claros MG, Gálvez S (2008):

Genome comparisons with Omega-Brigid. Sixth International Conference of Computational Methods in Sciences and Engineering (ICCMSE 2008) (Hersonissos, Creta, Grecia).

Dorado G, Díaz D, Falgueras J, Hernández P, Caballero JA, Claros MG, Gálvez S (2008): Web-

based bioinformatics tool for genome comparisons: Omega-Brigid. 2nd Workshop on TritiGen COST action FA0604: Triticeae genomics for the advancement of essential European crops (Albena, Bulgaria).

Dorado G, Díaz D, Claros MG, Caballero JA, Hernández P, Falgueras J, Gálvez S (2008):

Genome alignments with DemAlign. Sixth International Conference of Computational Methods in Sciences and Engineering (ICCMSE 2008) (Hersonissos, Creta, Grecia).

Dorado G, Díaz D, Claros MG, Hernández P, Caballero JA, Falgueras J, Gálvez S (2008):

Genome comparison tool for long similar sequences: DemAlign. 2nd Workshop on

Memoria del Departamento de Bioquímica y Biología Molecular. Curso 2008-2009.

37

TritiGen COST action FA0604: Triticeae genomics for the advancement of essential European crops (Albena, Bulgaria

Gálvez S, Díaz D, Falgueras J, Claros MG, Hernández P, Caballero JA, Dorado G (2008):

DemAlign: an algorithm to optimize alignment of long similar sequences. International Association for Development of the Information Society (IADIS) International Conference WWW/Internet 2008 (Freiburg, Alemania).

Gálvez S, Díaz D, Falgueras J, Hernández P, Caballero JA, Claros MG, Dorado G (2008):

Omega-Brigid: a Web-based workflow and user-friendly tool to integrate bioinformatics resources. International Association for Development of the Information Society (IADIS) International Conference WWW/Internet 2008 (Freiburg, Alemania).

Membrillo A, Clemente I, Azor PJ, Avilés C, Jiménez AM, Santos E, Rodero A, Dorado G, Molina A (2008): Estudio de la secuencia completa del ADN mitocondrial de 4 razas porcinas para el desarrollo de una herramienta molecular que certifique el origen materno en el ámbito de la norma de calidad del cerdo Ibérico. XIV Reunión Nacional de Mejora Genética Animal (Sevilla).

Díaz D, Gálvez S, Falgueras J, Caballero JA, Hernández P, Claros G, Dorado G (2009):

Intuitive bioinformatics for genomics applications: Omega-Brigid workflow framework. 3rd International Workshop on Practical Applications of Computational Biology & Bioinformatics (IWPACBB'09) (Salamanca, 10th-12th June).

Dorado G, Díaz D, Claros G, Falgueras J, Caballero JA, Hernández P, Gálvez S (2009):

Desarrollo de herramientas bioinformáticas mediante flujos de ejecución. IV Jornadas de Divulgación de la Investigación en Biología Molecular, Celular, Genética y Biotecnología, pp 83-87 (Ponencia oral; Córdoba, 1-2 abril).

Dorado G, Díaz D, Claros G, Falgueras J, Caballero JA, Hernández P, Gálvez S (2009):

Genome analysis with the DemAlign comparison tool. IV Jornadas de Divulgación de la Investigación en Biología Molecular, Celular, Genética y Biotecnología, p 190 (Póster; Córdoba, 1-2 abril).

Dorado G, Díaz D, Claros G, Falgueras J, Caballero JA, Hernández P, Gálvez S (2009):

Genome analysis with the Omega-Brigid workflow tool. IV Jornadas de Divulgación de la Investigación en Biología Molecular, Celular, Genética y Biotecnología, p 190 (Póster; Córdoba, 1-2 abril).

Perez-Jiménez M, Budak H, Alcaide B, Dorado G, Hernández P (2009): Developing a multiplex

set of SSR markers for the analysis of genetic resources in Brachypodium. Joint Workshop of the 19th International Triticeae Mapping Initiative (ITMI) & 3rd Workshop on TritiGen COST action FA0604: Triticeae genomics for the advancement of essential European crops. Session 2 (COST WG1 Divgen, Exploring and exploiting genetic diversity of the Triticeae), Poster ITMI2009_078 (Clermont-Ferrand, Francia; 31 agosto a 4 septiembre).

Pinzi S, Garcia IL, Ruiz JJ, Quintana C, López I, López FJ, Dorado G, Dorado MP (2009): A

sustainable vegetable oil-based biodiesel. VI Conferencia Científica Internacional Medio Ambiente Siglo XXI (MAS XXI 2009), Poster X (Santa Clara, Cuba; 3 a 6 noviembre).

Dorado Pérez G (2008): Grupos de formación del profesorado y experiencias piloto del Sistema

Europeo de Transferencia y Acumulación de créditos (ECTS), en el marco del Espacio Europeo de Educación Superior (EEES). Jornadas sobre Espacio Europeo de Educación Superior e Innovación Docente, Universidad de Jaén (Jaén, 4-5 junio; 2 h).

Grupo PAI CTS-047

Memoria del Departamento de Bioquímica y Biología Molecular. Curso 2008-2009.

38

Ruiz A., Collantes E., E. Muñoz, Túnez I., Feijóo M., Tasset I., Montilla P. Estado de los biomarcadores de estrés oxidativo de pacientes con enfermedad articular inflamatoria crónica. XXXIV Congreso Nacional de la Sociedad Española de Reumatología. La Coruña (España). 2008.Nacional

Feijóo M., Túnez I., Tasset I., Montilla P., Sánchez V., Muñoz E., Ruiz A., Collantes E.. Effect of

infliximab on myeloperoxidase activity and oxidative stress in chronic inflammatory joint disease. Annual European Congress of Rheumatology EULAR 2008 .Paris (Francia). 2008 (aceptado solo para publicar en libro de abstracts). Internacional

Tasset I., Montilla P., Peña J., Feijóo M., Muñoz MC., Medina F.J., Jimena I., Túnez I. Efecto

de la nicotina sobre la depresión, estrés oxidativo y daño celular inducidos por bulbectomía olfatoria. XXXI Congreso Sociedad Española de Bioquímica y Biología Molecular .Bilbao (España), 2008. Nacional

Yubero EM., Túnez I., Gómez M.J., Pérez P., García A., Santos M., Villalba J.M., Pérez F.,

López J. Influencia del consumo de una alimentación mediterránea suplementada con coenzima Q10 sobre el estrés oxidativo celular. VI Congreso de la Sociedad Española de Nutrición Básica y Aplicada . Córdoba (España), 2009. Nacional.

Gutiérrez F.M., Yubero EM., Cruz C., Marín C., Túnez I., Villalba J.M., López-Miranda J.,

Pérez F.Influencia del consumo de una alimentación mediterránea suplementada con coenzima Q10 sobre el estrés oxidativo celular. VI Congreso de la Sociedad Española de Nutrición Básica y Aplicada .Córdoba (España), 2009. Nacional

Grupo PAI CTS-577 Ruiz A., Collantes E., Muñoz E., Túnez I., Feijóo M., Tasset I., Montilla P. Estado de los

biomarcadores de estrés oxidativo de pacientes con enfermedad articular inflamatoria crónica. XXXIV Congreso Nacional de la Sociedad Española de Reumatología. La Coruña (España). 2008. Nacional

Feijóo M., Túnez I., Tasset I., Montilla P., Sánchez V., Muñoz E., Ruiz A., Collantes E. Effect of

infliximab on myeloperoxidase activity and oxidative stress in chronic inflammatory joint disease. Annual European Congress of Rheumatology EULAR 2008 .Paris (Francia). 2008 (aceptado solo para publicar en libro de abstracts). Internacional

Tasset I., Montilla P., Peña J., Feijóo M., Muñoz MC., Medina F.J., Jimena I., Túnez I. Efecto de

la nicotina sobre la depresión, estrés oxidativo y daño celular inducidos por bulbectomía olfatoria. XXXI Congreso Sociedad Española de Bioquímica y Biología Molecular .Bilbao (España), 2008. Nacional

9. PROYECTOS CONCEDIDOS

a. ÁMBITO NACIONAL E INTERNACIONAL

Grupo PAI BIO-128 BFU2008-01798/BMC (Ministerio de Educación y Ciencia) Genómica funcional de la regulación y eficiencia de la asimilación de nitrógeno en Chlamydomonas. Duración: 2009 -2011 Dotación, 321.860.00 €. IP, Emilio Fernández. MOIF-CT-2006-040208 (Proyectos de I+D Internacionales, VI Programa Marco de la UE./Concedidos 2006/Marie Curie)

Memoria del Departamento de Bioquímica y Biología Molecular. Curso 2008-2009.

39

(APOSD).The acclimation of photosynthetic organisms to sulphur deprivation. Duración : 2007- Dotación, 244.368,97 €. IP, Emilio Fernández. HA2006-0064 (Acciones Integradas con Alemania, MEC) H2-Production as a reponse to nutrient deprivation in chlamydomonas reinhardtii diferential response to the absence of nitrogen and sulphur. Duración, 2007-2008. Dotación, 6.695,00 €. IP, Emilio Fernández. INTAS 05-1000008-8004 (Proyectos Europeos de I+D (2002-2006)/INTAS)

(ATAS) Ammonium transporter and ammonium in plant cells Duración, 2006-2008. Dotación,15.000.00 €. IP, Emilio Fernández. Grupo PAI BIO-187

CTM2009-12858-CO2-02; subprograma TECNO.Evaluación genómica y proteómica del estrés medioambiental en organismos de ecosistemas terrestres y acuáticos . Subdirección General de Proyectos de Investigación. Ministerio de Ciencia e Innovación. Convocatoria 2009 (3 años). 255.000 €..

IP, Carmen Pueyo. Grupo PAI BIO-216 BFU2006-02990 (MEC)

Función de Proteinas "Redoxinas" en la Homeostasis Redox Mitocondrial: Caracterización Molecular y Funciones Fisiológicas Duración:01-10-2006/30-09-2009 Dotación:108.900,00 € IP: JA. Bárcena.

SAF2008-00733 (MICINN)

Selección de candidatos proteicos para vacunas contra Streptococcus pneumoniae mediante nuevas estrategias proteómicas. Duración:01/01/2009-31/12/2011 Dotación:100.000€ IP: Manuel J. Rodríguez Ortega

Grupo PAI AGR-164

AGL2009-12243-C02-02. Ministerio de Ciencia e Innovación .Variabilidad, catalogación,

respuesta a estreses y propagación clonal de encina (Q. ilex) (DECOVA)., (2008-2011). (Identificador de solicitud - PIN): 683109671-9671-4-9.

IP Jorrín J.V.

EUI2008-03686. Ministerio de Ciencia e Innovación. Estudio de defensa de las plantas mediante el uso de mutantes T-DNA avirulentos de Botrytis cinerea (BOTBANK). 2009-2011, PLANT-KBBE. IP Jorrín J.V.

BIO-2006.Proteoma redox: nitrosilacion y glutationilacion de proteinas como mecanismos de regulacion de la respuesta de defensa de las plantas a patogenos. DGI-MEC,14790. 2006-2009. IP Jorrín J.V.

Memoria del Departamento de Bioquímica y Biología Molecular. Curso 2008-2009.

40

b. AYUDAS PLAN ANDALUZ DE INVESTIGACIÓN Grupo PAI BIO-128 P08-CVI-042157 (Proyecto de Excelencia Junta de Andalucía)

Chlamydomonas como organismo modelo para el estudio de los transportadores de nitrato/nitrito y la adaptación a las condiciones ambientales. De 14-01-2009 a 13-01-2013 Dotación, 263,923,68 €. IP, Aurora Galván

P06-CVI01609 (Proyecto de Excelencia Junta de Andalucía)

Genómica funcional y proteómica del metabolismo del molibdeno en Chlamydomonas. De 01-05-2007 a 30-4-2010 Dotación, 177.999,88 €. IP, Emilio Fernández

Grupo PAI BIO-187 CVI-3829. Biotecnología ambiental: aplicación integradora de tecnologías ómicas. Incentivos a

Proyectos de Investigación de Excelencia en Equipos de Investigación. Enero 2009 (4 años). 291.923,60 € (total 3 grupos).

Ayudas a grupos de investigación. Junta de Andalucía. Responsable de Grupo (BIO-187). 2009 (1 año). 7.670,71 €.

Grupo PAI BIO-128 BIO-128 (2008)

Metabolismo del nitrógeno inorgánico en algas JA-CICE: GRUPOS PAIDI (Modelo de Financiación)/GRUPOS PAIDI 2008

IP, Emilio Fernández. Dotación, 8.703,37€. Grupo PAI BIO-216 P06-CVI-01611.El proteoma redox comparado.01-06-07/31-05-10. Dotación:144.999,88 €.. PAI, Proyectos de excelencia.IP, J. A. Bárcena BIO-216. Sistemas moleculares de defensa frente al estrés oxidativo y proteómica.2008. 7.271,07 €. PAI Ayuda a grupos de investigación.IP, J.A. Bárcena. c. AYUDAS DE INVESTIGACION DE LA UNIVERSIDAD DE CÓRDOBA Grupo PAI BIO-128 XIV Programa Propio de Fomento de la Investigación. Dotación 14.194,53 €. Grupo PAI BIO-187

XIII Programa Propio de Fomento de la Investigación. Universidad de Córdoba. 2008 (1 año). 12.230,48 €.

Grupo PAI BIO-216

Memoria del Departamento de Bioquímica y Biología Molecular. Curso 2008-2009.

41

XIII P.Propio Mod.1 BIO-216

SISTEMAS MOLECULARES DE DEFENSA FRENTE AL ESTRES OXIDATIVO Y PROTEÓMICA

2008 6.515,95 € Universidad de Córdoba. IP: J.A. Bárcena

d. OTRAS AYUDAS

Programa Propio Universidad de Cordoba, “Ayuda Tipo E Organización de reuniones

científicas, congresos y seminarios en España” IV Jornadas de Divulgación de la Investigación en Biología Molecular, Celular, Genética y Biotecnología. Córdoba, 1-2 Abril 2009 Número de participantes: 119 Dotación: 1.435,00€

Fundación RabanalesXXI

IV Jornadas de Divulgación de la Investigación en Biología Molecular, Celular, Genética y Biotecnología. Córdoba, 1-2 Abril 2009 Dotación: 3.000,00€

OTRI Universidad de Córdoba

IV Jornadas de Divulgación de la Investigación en Biología Molecular, Celular, Genética y Biotecnología. Córdoba, 1-2 Abril 2009 Dotación: 2.000,00€

Fundación Torres Gutiérrez

IV Jornadas de Divulgación de la Investigación en Biología Molecular, Celular, Genética y Biotecnología. Córdoba, 1-2 Abril 2009 Dotación: 435,00€

XIII Programa Propio de Fomento de la Investigación (2008)/Modalidad 2. Organización de

Congresos. Seminarios interdepartamentales curso 2008/2009. Dotación, 6.000,00 €.

Ayuda obras RAM de la Universidad de Córdoba Remodelación y ampliación del espacio de la Secretaría del Departamento. Dotación, 1600,80 €.

Recursos para la docencia de la Universidad de Córdoba. Adquisición de instrumentación para el laboratorio de prácticas del Departamento. Dotación, 998,00 €.

10. TESIS LEÍDAS Valoración del estrés oxidativo producido por el ejercicio físico inducido en dos grupos de varones prepuberales y puberales DOCTORANDO: Juan de Dios Benítez Sillero DIRECTORES: Isaac Túnez Fiñana, Juan Luis Pérez Navero y Manuel Guillén del Castillo ORGANISMO:Facultad de Medicina. Universidad de Córdoba 13 de Junio de 2008 CALIFICACIÓN: Sobresaliente “cum laude” por unanimidad

Memoria del Departamento de Bioquímica y Biología Molecular. Curso 2008-2009.

42

Biomarcadores en cangrejo de río (Procambarus clarkii) para evaluar la contaminación del Parque de Doñana y el Estuario del Guadalquivir por metales y plaguicidas DOCTORANDO: Amalia Vioque Fernández DIRECTORES: J López Barea ORGANISMO: Depto Bioquím Biol Molec Enero 2009 CALIFICACIÓN: Sobresaliente “cum laude” por unanimidad

11. ESTANCIAS a) Estancias realizadas por miembros del departamento Estancia de José Javier Higuera Sobrino en Alemania en el grupo de Tomas Happe (Dept.

Biología y Bioquímica de plantas AG fotobiotecnología. Univ. de Ruhr, 44780 Bochum) (Noviembre a Diciembre de 2008) con motivo de una Acción Integrada con Alemania HA2006-0064

Estancia sabática de Alicia Padilla Peña como investigadora visitante durante 3 meses, en el

Department of Medical Biochemistry and Biophysics (MBB), Medical Nobel Institute for Biochemistry, Karolinska Institute, Estocolmo, Suecia.

b) Estancias realizadas en los grupos del departamento Estancia del Dr. Avihai Danon del Dpartment of Plant Science, Weizmann Institute of Science, Rehoboth, Israel en el grupo BIO-128. Duración de la estancia: una semana, del 9 al 14 de enero de 2009 Actividad desarrollada: realización de RESDA-PCR para la identificación de mutantes de fotosíntesis aislados en su grupo de investigación Estancia de la Dra Marta Villa de la Universidad de Huelva en el grupo BIO-128. Duración de la estancia: una semana, del 13 al 17 de Julio de 2009 Actividad desarrollada: realización de RESDA-PCR para la identificación de mutantes de biosíntesis de carotenoides aislados en su grupo de investigación Rocio Onieva Jiménez, estudiante de Formación Profesional de Técnicas de Laboratorio ha realizado un periodo de practicas de tres meses (30 Marzo al 10 de Junio) en el grupo BIO-128. Estancia de Grabiele Philips en el grupo BIO-128 durante 1 mes, Mayo 2008 con motivo de una Acción Integrada con Alemania HA2006-0064 Estancia de Cristina de Castro Cristiano, Becaria FPI de la Universidad de León, durante 3

meses (Febrero- Abril de 2009) en el grupo de investigación BIO-216.

12. PROYECTOS PROFESIONALES FIN DE CARRERA (MODALIDAD INVESTIGACIÓN)

a. Proyectos fin de máster. - Irene Jiménez Munguía. Efecto del quelante de hierro 2,21-dipiridil en la expresión de proteínas de Streptococcus pneumoniae R6. Dirigido por el Dr. Manuel J. Rodríguez Ortega - Laura Medina Puche. Caracterización funcional de genes reguladores de la biosíntesis de ácido abscísico en el receptáculo del fruto de fresa. Dirigido por el Dr. Juan Muñoz Blanco - Mª Carmen Muñoz Marín. Expresión de genes implicados en el metabolismo del nitrógeno y del carbonoen Prochlorococcus SS120 y MIT9313. Dirigido por el Dr. Jesús Díez Dapena

Memoria del Departamento de Bioquímica y Biología Molecular. Curso 2008-2009.

43

b. Proyectos fin de carrera. Dorado G (Director), Gálvez S (Director) (2008): "Desarrollo de una plataforma 'workflow'

orientada a la biocomputación", por David Díaz González. Escuela Técnica Superior de Ingeniería Informática, Universidad de Málaga; y Departamento de Bioquímica y Biología Molecular, Facultad de Veterinaria, Universidad de Córdoba. Matrícula de Honor (máxima calificación).

ALEJANDRO FERNÁNDEZ GALLARDO. Estudios de variabilidad intra e interpoblacional en bellota de encina (Quercus ilex L.) mediante análisis morfométrico, NIRS y proteómico. Universidad de Córdoba, E.T.S. de Ingenieros Agrónomos y Montes, Dptos Bioquímica y Biología Molecular/Ingenieria Forestal. Directores: Rafael M.Navarro Cerrillo y Jorrín J.V. 26 de junio 2009. Sobresaliente (10), por unanimidad.

SYLVIA JEAN-BAPTISTE. Proteómica aplicada al estudio de la interacción Arabidopsis thaliana-Pseudomonas syringae. Universidad de Córdoba, E.T.S. de Ingenieros Agrónomos y Montes, Departamento: Bioquímica y Biología Molecular. Directores: Maldonado A.M. Alconada y Jorrín J.V. 14 mayo 2009. Sobresaliente (10), por unanimidad.

13. ACTIVIDADES DE GESTIÓN Cargos docentes unipersonales José Manuel Roldán Nogueras. Rector Universidad de Córdoba Jesús Díez Dapena. Director de la Unidad de Coordinación Docente UCO Francisco J. Caballero Domínguez. Secretario Facultad de Ciencias Participación en Comisiones Carmen Pueyo de la Cuesta

- Miembro de la Comisión del Plan de Estudios de Bioquímica. - Asesora académica

Conrado Moreno Vivián

- Miembro de la Comisión del Plan de Estudios de Biología. - Miembro de la Comisión del Plan de Estudios de Bioquímica. - Miembro de la Comisión del Plan de Estudios de Ciencias Ambientales. - Asesor académico

Emilio Fernández Reyes

- Vocal Comisión de Posgrado UCO - Presidente Comité Académico Máster Biotecnología Molecular, Celular y

Genética UCO - Vocal Comité Académico Máster Producción, Protección y Mejora Vegetal UCO - Miembro de la Unidad de Garantía de Calidad del Título de Bioquímica. - Miembro Comisión del Plan de Estudios de Química. - Miembro de la Comisión del Plan de Estudios de Bioquímica.

C. Alicia Padilla Peña

- Miembro de la Comisión del Plan de Estudios de Bioquímica.

Aurora Galván Cejudo - Miembro de la Comisión del Plan de Estudios de Bioquímica.

Memoria del Departamento de Bioquímica y Biología Molecular. Curso 2008-2009.

44

José A. Bárcena Ruiz

- Presidente Unidad Garantía Calidad Máster Biotecnología Molecular, Celular y Genética UCO

- Vocal Unidad Garantía Calidad Máster Producción, Protección y Mejora Vegetal UCO

- Miembro de la Unidad de Garantía de Calidad del Título de Bioquímica. - Miembro de la Comisión Académica del Máster (CAM) de Investigación

Biomédica Traslacional. Juan Muñoz

- Miembro de la Comisión del Plan de Estudios de Biología. Mª Emilia Martínez Galisteo

- Miembro Grupo de Trabajo Interno para la Evaluación Europea de la Licenciatura de Veterinaria.

Ana Mª Maldonado

- Asesora académica Juan López Barea

- Asesor académico Miembros del Claustro Emilio Fernández Reyes Inés Mª Molina Moreno Jesús Díez Dapena José Antonio Bárcena Ruiz José Manuel Roldán Nogueras Juan Muñoz

14. ACTIVIDADES DE EVALUACIÓN Carmen Pueyo de la Cuesta - Secretaria del Comité de Evaluación de Ciencias Experimentales de la ACUM (Agencia de Calidad Universitaria de Castilla-La Mancha). Noviembre 2007. Manuel Tena Aldave - PEI de ANECA. Vocal académico en el Comité Externo de evaluación de la Licenciatura de

Medicina de las Universidades de Alcalá y de Castilla la Mancha. - PEI de ANECA. Presidente en el Comité Externo de evaluación de la Licenciatura de Medicina

de la Universidad de La Laguna. Pertenencia a Comités : Emilio Fernández Reyes - Revision de artículos científicos para las revistas: Journal of Biological Chemistry, Plant Cell, Plant Physiology, Molecular Plant, Eukaryotic Cell, Plant Cell Enviroment, BMC Plant Biology - Miembro del Editorial Board : The Open Plant Science Journal Jesús V. Jorrín Novo - Editor Responsable de “Proteómica: revista de la Sociedad Española de Proteómica (http://www.cbm.uam.es/seprot/revista/revista.htm). - Executive Editor del Journal of Proteomics (http://www.elsevier.com/wps/find/journaldescription.cws_home/713351/description?navopenmenu=-2).

Memoria del Departamento de Bioquímica y Biología Molecular. Curso 2008-2009.

45

- Miembro del Editorial Board de Proteomics (http://www.wiley-vch.de/publish/en/journals/alphabeticIndex/2120/) del The Open Proteomics Journal (http://www.bentham.org/open/toprotj/) - Secretario de la Sociedad Española de Proteómica (SEProt) (http://www.cbm.uam.es/seprot/index.htm) - Miembro del Conference and Communication Comité de la European Proteomics Association (EuPA) (http://www.eupa.org/). - Revision de artículos científicos para las revistas: Journal of Experimental Botany, Phytochemistry, Journal of Plant Physiology, Plant Science, Physiologia Plantarum, Journal of Heredity José Antonio Bárcena Ruiz - Miembro del Consejo Directivo de ProteoRed, Genoma España. Carmen Pueyo de la Cuesta - Miembro del Editorial Board de “The Open Toxicology Journal”.

15. OTRAS ACTIVIDADES

Nombramiento de Doctor Honoris causa por la Universidad de Córdoba al Profesor jubilado de la Universidad de Sevilla, Prof. Dr. Manuel Losada Villasante a propuesta del Departamento de Bioquímica y Biología Molecular

La propuesta se realizó en consideración a los extraordinarios méritos que ha acumulado a lo largo de su carrera con una amplísima actividad docente e investigadora, especialmente, en los estudios sobre Fotosíntesis, Bioenergética, asimilación del nitrato y demás bioelementos primordiales, enegetización del fosfato, bioconversión de energía solar y biotecnología de microalgas, de los que es eximio Maestro, y por su papel relevante en el desarrollo de la Bioquímica y Biología Molecular en España, y en particular en la Universidad de Córdoba

Fue relator, el Prof. Juan López Barea; Objetor, el Prof. Jesús Díez Dapena y Padrino el Prof. Francisco Castillo Rodríguez.

El acto se celebró en el Salón de Actos Juan XXIII del Campus de Rabanales, el 11 de Diciembre de 2008.

Organización de las IV Jornadas de Divulgación de la Investigación en Biología

Molecular, Celular, Genética y Biotecnología. Córdoba, 1-2 Abril 2009 Participación: 119 participantes entre conferenciantes y asistentes. 3 conferencias Plenarias, 3 conferencias de Empresas biotecnológicas; 4 charlas de doctores egresados del Programa de Doctorado Investigación en Biociencias; 20 charlas de sendos grupos de investigaicón de la UCO; 20 pósters. Conferencia Invitada: Prof. Margarita Salas en conmemoración del 50 aniversario de la concesión del Premio Nobel a Severo Ochoa.

Edición del libro Jornadas de Divulgación de la Investigación en Biología Molecular,

Celular, Genética y Biotecnología (4ª edición). Jurado J, Roldán-Ruiz MD, Llamas A, eds. Servicio de Publicaciones de la Universidad de Córdoba, 200 pp, ISBN: 9788478019847 (2009).