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Instituto deSalud PúblicaMinisterio de Salud

Vigilancia Shigella spp.2010-2015

VIGILANCIA DE LABORATORIO

VOL. 6, NO. 3, MARZO 2016.

3Instituto de Salud Pública de Chile.


VIGILANCIA DE LABORATORIO

1. ANTECEDENTES

Shigella son bacilos gramnegativos, inmóviles, pertenecientes a la familia Enterobacteriaceae, taxonómicamente corresponden a E. coli. El género Shigella incluye cuatro especies: S. dysenteriae, S. flexneri, S. boydii y S. sonnei, denominadas también por grupos: A, B, C y D respectivamente. La inmunidad es serotipo específica. S. dysenteriae 1, también conocido como bacilo de Shiga, se diferencia de las otras especies de Shigella en tres aspectos importantes:

• Produceunacitotoxinapotente(Shigatoxina);

• Causaenfermedadmásgrave,prolongada,conmayorletalidadquelaproducidaporotrasespeciesde Shigella;

• Causagrandesepidemias,amenudoregionales,frecuentementeconaltastasasdeataqueydemortalidad.

Especies y serogrupos del género Shigella

Especies Serogrupos Serotipos

S. dysenteriae A 1 - 15

S. flexneri B 1-6(6serotiposy2variantes)

S. boydii C 1 - 19

S. sonnei D 1

Shigella fuedescubiertahacemásde100añosporelmicrobiólogojaponésShiga.Enladécadade1890, fue reconocida como agente etiológico de la disentería bacilar o shigelosis y fue adoptada como género en la década de 1950.

Ladistribucióngeográficaylasusceptibilidadantimicrobianavaríanconlasdiferentesespecies.(1)En las últimas décadas, las especies de Shigella han presentado mayor resistencia a la mayoría de los

antimicrobianos utilizados. Dicha resistencia varía de región a región, por lo tanto, es importante mantener vigilanciadelaresistencialocaladichosantimicrobianos.(2)

DeacuerdoalosúltimosinformesdelosCentrosparaelControlylaPrevencióndeEnfermedadesdeAtlanta(CDC),lainfecciónporShigellarepresentael28%detodaslasinfeccionesbacterianasentéricas.(3)

La transmisión se produce a través de la vía fecal-oral, por contacto directo de persona a persona o indirectamenteatravésdealimentos,aguaofomitescontaminados.(5)Seconsideracomovectormecánicoa la mosca doméstica pues Shigellaescapazdesobrevivirenellas.(6)

Instituto de Salud Pública de Chile.


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A nivelmundial, se estima queShigella spp. causa entre 80 y 165 millones casos de enfermedad diarreicay600milmuertesalaño.LashigelosisescausadaprincipalmenteporS. sonnei en los países industrializados,mientrasqueS. flexneri prevalece en los países en vías de desarrollo. Las infecciones causadas por S. boydii son infrecuentes, y las causadas por S. dysenteriaesonaúnmásinfrecuentes;sinembargorepresentamásdel25%delasShigella spp. aisladas en África subsahariana y Asia meridional. Shigellaspp.sedetectaenun5%a18%delospacientescondiarreadelviajero.(7)Lasinfeccionessonmásfrecuentesduranteelveranoyprincipiodelotoñoenlasregionestempladasyenépocasdelluviaenlasregionestropicales.(8)

Con respecto a los serotipos circulantes asociados a los episodios de shigelosis en nuestro país, se haestablecidoquetantoS. sonnei como S. flexneri 2a, fueron responsables de aproximadamente 95% de loscasosdetectadosenlaRegiónMetropolitanaenelperíodocorrespondientealosaños2004-2005(9).Sin embargo, se observó una clara prevalencia de S. sonnei en períodos posteriores. De hecho, durante el veranodelaño2009seregistróunbrotedeshigelosisenelpaís,cuyoagenteetiológicofueS. sonnei.(10)

La virulencia en especies de Shigella spp. involucra las formas de codificación cromosómica y la de genescodificadosporplásmidos.LascepasvirulentasdeShigella spp. producen la enfermedad después delainvasióndelamucosaintestinal;elorganismosóloraravezpenetramásalládeestabarrera.

Las cepas de Shigellaproducendistintasenterotoxinas,quecorrespondenacitotoxinasde2gruposprincipales llamados Stx1 y Stx2.

La respuesta del huésped a la infección primaria se caracteriza por la inducción de una inflamación aguda,acompañadaporcélulaspolimorfonucleares(PMN),loqueresultaenladestrucciónmasivadelamucosadelcolon.(1)

La infección entérica por Shigella se confirma a través del cultivo de una muestra de heces o hisopado rectal.LasmuestrasdebenserprocesadasrápidamentedebidoaqueShigella no sobrevive por mucho tiempo en el ambiente. Los aislamientos de Shigellasedebenconfirmaratravésdepruebasbioquímicaspara determinación de la especie, estudio serológico y pruebas de susceptibilidad antimicrobiana para guiareltratamientocuandoésteesrequerido.(7)

El rendimiento de los cultivos es mayor durante el curso de la enfermedad, aumentando si las muestras se procesan inmediatamente después de la recolección. Si el procesamiento se retrasa, se debe utilizar un mediodetransporte(Cary-Blair).(1)

ElLaboratorioNacionaldeReferenciadeAgentesETAs(EnfermedadesTransmitidasporAlimentos)delInstitutodeSaludPúblicadeChile(ISP),segúnloestableceelDecretoSupremodeNotificaciónObligatoria158/2004,confirmalosaislamientosdeShigella realizados por los laboratorios clínicos públicos y privados delpaís,aloscualesselesrealizaconfirmaciónbioquímica,serotipificaciónyestudiodesusceptibilidada antimicrobianos.

2. MATERIALES Y MÉTODOS

Se analizaron las bases de datos correspondientes a las cepas de Shigellaspp.recibidasporelISPentreenero de 2010 y diciembre de 2015.

LosdatossecapturaronyprocesaronenelpaqueteExcel2010yelsoftwareestadísticoStata13.Lasbasessedepuraronasegurandoquecadaregistrocorrespondaauncasoúnicoyseprocesarondeacuerdoasuprocedenciayalañoepidemiológicodelafechadeobtencióndemuestra.

Losresultadossepresentanentablasygráficos.



3. RESULTADOS VIGILANCIA DE Shigella spp. 2010 – 2015.

Enelperiodoenero2010adiciembrede2015,seconfirmaron2.364cepasdeShigella spp. provenientes deaislamientosdeorigenclínico.Enelaño2012seconfirmóelmayornúmerodecepas(644),loquerepresentael27,2%deltotaldelperiodoestudiado,elmenornúmerodecepasconfirmadasseregistróenelaño2014(277),representandoel11,7%deltotal(Figura1).

De acuerdo a la fecha de obtención de las muestras, se observa estacionalidad de las cepas confirmadas, conunmayornúmeroenlosmeseseneroajunio.Destacaelaumentodecepasconfirmadasduranteelprimersemestredelaño2012(543cepas),seguidoporigualperiodoenelaño2015(360cepas)(Figura2).



6

Del total de cepas confirmadas en el periodo de estudio, el 31,1% (734/2.364) procedían de laRegiónMetropolitana,19,5%(460/2.364)delaRegióndeTarapacáyel17,9%(423/2.364)delaRegióndeAntofagasta.DelascepasdelaRegiónMetropolitana,el70%(514/734)proveníandelaboratoriosprivados(Tabla1).

2010 2011 2012 2013 2014 2015Arica 36 81 44 59 38 51 309Privado 0 0 1 8 7 11 27Iquique 19 22 29 18 23 48 159Privado 21 33 42 54 42 109 301Antofagasta 20 13 37 38 32 24 164Otros* 7 0 0 13 19 24 63Privado 23 19 26 33 52 43 196Atacama 1 3 12 0 4 3 23Privado 0 1 1 0 1 0 3Coquimbo 5 1 5 5 0 10 26Privado 1 0 5 0 0 4 10Aconcagua 3 1 1 0 0 3 8Valparaíso - San Antonio 16 6 75 12 0 2 111Viña del Mar - Quillota 8 12 2 10 1 0 33Otros* 0 2 0 0 0 0 2Privado 0 2 16 3 1 4 26Metropolitano Central 4 4 3 2 3 2 18Metropolitano Norte 7 12 25 4 3 3 54Metropolitano Occidente 10 10 30 6 2 2 60Metropolitano Oriente 6 8 10 3 2 1 30Metropolitano Sur 4 1 4 1 1 0 11Metropolitano Sur Oriente 4 6 17 1 0 1 29Otros* 2 2 9 3 1 1 18Privado 76 50 228 41 31 88 514O'Higgins 3 2 2 0 3 2 12Privado 4 1 0 0 1 0 6

Maule Maule 14 2 2 7 0 0 25 25Biobío 29 1 7 3 0 2 42Concepción 6 3 3 3 1 0 16Ñuble 7 0 1 1 2 12 23Talcahuano 6 0 0 0 0 0 6Privado 2 1 2 2 2 1 10Araucanía Sur 1 0 2 1 3 0 7Privado 1 1 2 3 0 0 7

Los Ríos Valdivia 0 0 1 1 0 0 2 2Chiloé 1 0 0 0 0 0 1Del Reloncaví 0 1 0 0 0 0 1Osorno 0 0 0 0 0 2 2Privado 2 1 0 0 1 0 4

Aysén Aysén 2 0 0 0 0 0 2 2Otros* 0 0 0 0 0 1 1Privado 0 0 0 0 1 0 1

0 1 0 0 0 0 1 1351 303 644 335 277 454

Araucanía 14

Total 2364Sin dato

Los Lagos 8

Magallanes 2

Metropolitana 734

O'Higgins 18

Biobío 97

Atacama 26

Coquimbo 36

Valparaíso 180

Arica y Parinacota 336

Tarapacá 460

Antofagasta 423

Tabla 1. Número de cepas confirmadas de Shigella spp. por región y Servicio de Salud de procedencia de la muestra. Chile 2010 -2015.

Región Servicio de Salud Total Total RegiónAños

*Otros:PúblicosnopertenecientesalSistemaNacionaldeServiciosdeSalud.Fuente:LaboratoriodeReferenciadeAgentesETAs.InstitutodeSaludPúblicadeChile.



ParatodoslosañosenestudiolastasasmáselevadasseregistranenlaRegióndeAricayParinacota,seguidadelasregionesdeTarapacáyAntofagasta(Figura3).

Figura 3.Tasa de incidencia de casos confirmados por laboratorio de Shigellaspp.poraño,segúnprocedenciadelacepa.Chile2010-2015.

*Tasaspor100.000habs.enbaseaProyeccióndePoblaciónINE,2014.Fuente:LaboratoriodeReferenciadeAgentesETAs.InstitutodeSaludPúblicadeChile.

Respecto al grupo etario de los cuales proceden las cepas confirmadas de Shigellaspp.,destacaqueel19,7%(465/2.364)correspondenalgrupode5a9años,seguidoporelgrupode0a4añosconel19,2%(454/2.364)deltotal(Figura4).



8

LaFigura5muestraelnúmerodecepasconfirmadasdeShigellaspp.porsexoyaño.Enelperiododeestudio,el51,7%(1.222/2.364)delascepascorrespondenamujeres.



Enelperiododeestudio,el53,6%(1.267/2.364)delascepasconfirmadascorrespondióaS. sonnei, el43%(1.016/2.364)aS. flexneri,el2,8%(66/2.364)aS. boydii, 0,4%(9/2.364) S. dysenteriae y 0,3% (6/2.364)aShigellaspp.sindeterminacióndeespecie(Tabla2).LosserotiposprevalentesdeS. flexneri fueron2acon43,6%(443/1.016),3bcon11,9%(121/1.016)y1bcon11,7%(119/1.016),paraS. boydii, losserotipos2conel71,9%(41/57)yserotipo10 con14%(8/57).De las9cepasanalizadasdeS. dysenteriae,elserotipo2representóel33,3%(3/9),aligualqueelserotipo7,seguidosporelserotipo3con22,2%(2/9)yserotipo6con11,1%(1/9).

Tabla 2.Número de cepas confirmadas por especie de Shigellaspp.poraño.Chile2010–2015.

Resistencia Antimicrobiana

En la Tabla 3 se presentan los resultados del estudio de resistencia antimicrobiana de las cepas de Shigella spp. y las especies prevalentes.

Serealizóestudioderesistenciaa614cepasduranteelperiodo2010-2015,loquecorrespondeal26%(614/2.364)deltotaldecepasconfirmadas.

Elporcentajederesistenciaaampicilinavarióentre46-70%enlascepasdeShigella spp., entre 32-77%paralascepasdeS. sonneiyentre49-69%paralascepasde S. flexneri.

Noseobservaresistenciaacefotaxima,exceptoenelaño2012 enelquese registróun2%.Paraciprofloxacino, la resistencia de Shigellaspp.varióentreel0-7%.

En términos generales, los resultados muestran mayor resistencia de Shigella spp. para ampicilina, cloranfenicol, tetraciclina y trimetroprim-sulfametoxazol. Las cepas de S. sonnei fueronmásresistentesqueS. flexneri a tetraciclina y trimetroprim-sulfametoxazol.



10

Tabla 3.Resistencia de cepas de Shigellaspp.yespeciesprevalentesporaño.Chile2010–2015.

n %R n %R n %R n %R n %R n %RAmpicilina 66% 60% 46% 70% 65% 56%Cloranfenicol 60% 52% 41% 61% 53% 48%Ciprofloxacino 4% 4% 2% 0% 7% 0%Cefotaxima 0% 0% 2% 0% 0% 0%Furazolidona 0% 0% 1% 0% 2% 3%Tetraciclina 81% 94% 84% 88% 74% 69%Trimetoprim sulfametoxazol 68% 76% 77% 70% 61% 40%

n %R n %R n %R n %R n %R n %RAmpicilina 72% 53% 32% 72% 68% 77%Cloramfenicol 72% 47% 22% 66% 61% 60%Ciprofloxacino 0% 3% 0% 0% 10% 6%Cefotaxima 0% 0% 2% 0% 0% 0%Furazolidona 0% 0% 0% 0% 6% 0%Tetraciclina 81% 100% 90% 88% 77% 89%Trimetoprim sulfametoxazol 86% 97% 94% 91% 81% 60%

n %R n %R n %R n %R n %R n %RAmpicilina 62% 63% 60% 69% 63% 49%Cloramfenicol 50% 56% 58% 59% 54% 47%Ciprofloxacino 8% 4% 5% 0% 7% 0%Cefotaxima 0% 0% 2% 0% 0% 0%Furazolidona 0% 0% 2% 0% 0% 5%Tetraciclina 82% 90% 78% 88% 71% 64%Trimetoprim sulfametoxazol 54% 63% 60% 57% 47% 31%

Shigella spp.

Antimicrobiano 2015

94 84 128 83 96 129

2010 2011 2012 2013 2014

Shigella sonnei

Antimicrobiano 2010 2011 2012 2013 2014 2015

43 32 63 32

8850 52 65 51 59

31 35

Shigella flexneri

Antimicrobiano 2010 2011 2012 2013 2014 2015

%R:porcentajedecepasresistentes.Fuente:LaboratoriodeReferenciadeAgentesETAs.InstitutodeSaludPúblicadeChile.

Caracterización Genética

Sedeterminaron los subtipos genéticosmediante la técnica de Electroforesis deCampoPulsado(PFGE)de138cepasdeShigellaspp.aisladasentrelosaños2014(54cepas)y2015(84cepas).Seutilizaron las enzimas de restricción NotI y Xbal para S. flexneri y S. sonnei respectivamente. Los patrones electroforéticos fueron analizados mediante el sistema Bionumerics. De éstas, 98 cepas corresponden a S. flexneriy40aS. sonnei.

Los subtipos genéticos prevalentes en S. flexneri fueron Cl-Sfl-Not-008enelaño2014yCl-Sfl-Not-065 el2015.ParaS. sonnei fueron Cl-Sso-Xba-011enel2014yCl-Sso-Xba-011en2015(Figura6).



CONCLUSIONES

Enelperiodoenero2010ydiciembrede2015seconfirmaron2.364cepasdeShigella spp. El mayor númerodecepasconfirmadas(644)correspondióalaño2012.Deacuerdoalafechadeobtencióndelasmuestras, se observa estacionalidad de las cepas confirmadas, con un mayor número en los meses enero ajunio.

El31,1%(734/2.364)delascepasconfirmadasdeShigella spp. procedían de la Región Metropolitana, principalmentedelosestablecimientosprivados,el19,5%(460/2.364)delaRegióndeTarapacáy17.9%(423/2.364)delaRegióndeAntofagasta.

Seobservópredominodelgrupoetariode5a9añosconel19,7%(465/2.364)delascepasconfirmadasde Shigellaspp.,seguidoporelgrupode0a4añosconel19,2%(454/2.364).

En el periodo de estudio se observó predominio de S. sonnei(53,6%)seguidadeS. flexneri(43%).Serealizóelestudioderesistenciaa614cepasduranteelperiodo2010-2015,loquecorrespondeal

26%(614/2.364)deltotaldecepasconfirmadas.SibienS. flexneri y S. sonnei presentan resistencia a los antimicrobianos: cloranfenicol, tetraciclina y trimetoprim-sulfametoxazol, este fenómeno fue levemente mayor en S. sonnei.

No se observa predominio de ningún subtipo genético en las 138 cepas de Shigella spp analizadas.



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REFERENCIAS

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