Universidad Nacional Autónoma de México · 2. Regulación genética en eucariontes 2.1. Conocerá...

48
Universidad Nacional Autónoma de México Curso de Genética y Biología Molecular Licenciatura Química Farmacéutico Biológica (1630) Química en Alimentos (0144) (Optativa) Facultad de Química Dra. Herminia Loza Tavera Profesora Titular de Carrera Departamento de Bioquímica Laboratorio 105, Edificio E 5622-5280 [email protected]

Transcript of Universidad Nacional Autónoma de México · 2. Regulación genética en eucariontes 2.1. Conocerá...

Page 1: Universidad Nacional Autónoma de México · 2. Regulación genética en eucariontes 2.1. Conocerá el papel de la cromatina y de los nucleosomas en la regulación genética. X 2.2.

Universidad Nacional

Autónoma de México

Curso de Genética y Biología Molecular

Licenciatura

Química Farmacéutico Biológica (1630)

Química en Alimentos (0144) (Optativa)

Facultad de Química

Dra. Herminia Loza TaveraProfesora Titular de Carrera

Departamento de BioquímicaLaboratorio 105, Edificio E

5622-5280

[email protected]

Page 2: Universidad Nacional Autónoma de México · 2. Regulación genética en eucariontes 2.1. Conocerá el papel de la cromatina y de los nucleosomas en la regulación genética. X 2.2.

VII. REGULACIÓN DE LA

EXPRESIÓN GENÉTICA

• Objetivo general

– El alumno identificará los diferentes mecanismos

que operan en la regulación de la expresión

genética en procariontes y eucariontes

Page 3: Universidad Nacional Autónoma de México · 2. Regulación genética en eucariontes 2.1. Conocerá el papel de la cromatina y de los nucleosomas en la regulación genética. X 2.2.

Objetivos particulares

El alumno... Conoci-

miento

Compren-

sión

Aplica-

ción

1. Regulación

genética en

procariontes

1.1. Conocerá los distintos niveles de regulación genética. X

1.2. Identificará las diferencias entre regulación positiva y

negativa.

X

1.3. Comprenderá el concepto de inducción y represión. X

1.4. Conocerá el concepto de operón, genes reguladores,

genes estructurales, promotor, reguladores en cis y trans.

X

1.5. Comprenderá el funcionamiento del operón lac. X

1.6. Comprenderá el modelo de represión catabólica: AMPc y

CAP.

X

1.7. Conocerá los sistemas de regulación por atenuación:

operón del triptófano.

X

2. Regulación

genética en

eucariontes

2.1. Conocerá el papel de la cromatina y de los nucleosomas

en la regulación genética.

X

2.2. Conocerá las características de los factores de

transcripción y su papel en la regulación de la expresión

genética.

X

2.3. Conocerá el papel de las hormonas esteroides en la

regulación de la expresión genética.

X

2.4. Conocerá la importancia del control post-transcripcional de

la expresión genética (microRNAs).

X

Page 4: Universidad Nacional Autónoma de México · 2. Regulación genética en eucariontes 2.1. Conocerá el papel de la cromatina y de los nucleosomas en la regulación genética. X 2.2.

1. REGULACIÓN DE LA

EXPRESIÓN GENÉTICA

EN PROCARIOTES

Page 5: Universidad Nacional Autónoma de México · 2. Regulación genética en eucariontes 2.1. Conocerá el papel de la cromatina y de los nucleosomas en la regulación genética. X 2.2.

La regulación de la expresión de los genes se establece de la necesidad de controlar

la actividad de las enzimas o de las proteínas en general, en momentos

precisos de la vida de la célula

REGULACIÓN

DE LA

ACTIVIDAD

ENZIMÁTICA

CELULAR

ALOSTERISMO

POSITIVO O NEGATIVO

REGULACIÓN COVALENTE

a) MODIFICACIONES POST-TRADUCCIONALES

b) ZIMÓGENOS

POR PRODUCTO,

RETROALIMENTACIÓN

ISOENZIMAS

CANTIDAD DE

ENZIMA

SÍNTESIS

DEGRADACIÓN

Page 6: Universidad Nacional Autónoma de México · 2. Regulación genética en eucariontes 2.1. Conocerá el papel de la cromatina y de los nucleosomas en la regulación genética. X 2.2.

Transcripción

DNA

mRNA

PROTEÍNA

Traducción

Regulación a nivel de:

• Transcripción

• Traducción

Page 7: Universidad Nacional Autónoma de México · 2. Regulación genética en eucariontes 2.1. Conocerá el papel de la cromatina y de los nucleosomas en la regulación genética. X 2.2.

Los genes se expresan con diferente

eficiencia y se regulan por distintos

mecanismos

Regulación transcripcional

Aumenta el número de transcritos

Resultando en un aumento en la cantidad de proteína

Page 8: Universidad Nacional Autónoma de México · 2. Regulación genética en eucariontes 2.1. Conocerá el papel de la cromatina y de los nucleosomas en la regulación genética. X 2.2.

A B B B B

BBBB

B B B B

BBBB

Regulación traduccional

Los genes se expresan con diferente

eficiencia y se regulan por distintos

mecanismos

Page 9: Universidad Nacional Autónoma de México · 2. Regulación genética en eucariontes 2.1. Conocerá el papel de la cromatina y de los nucleosomas en la regulación genética. X 2.2.

En bacterias, el principal nivel de

regulación es el transcripcional

GENE CON

Regulación positiva (+)

El gene “se enciende”

(se empieza a transcribir o se

transcribe más)

GENE CON

Regulación negativa (-)

El gene “se apaga”

(no se transcribe o se

transcribe menos)

Page 10: Universidad Nacional Autónoma de México · 2. Regulación genética en eucariontes 2.1. Conocerá el papel de la cromatina y de los nucleosomas en la regulación genética. X 2.2.

El modelo del Operón lac

F. Jacob J. Monod A. Lwoff

Expresión inducible

Page 11: Universidad Nacional Autónoma de México · 2. Regulación genética en eucariontes 2.1. Conocerá el papel de la cromatina y de los nucleosomas en la regulación genética. X 2.2.

La b galactosidasa también convierte parte de la lactosa en alolactosa

La lactosa es hidrolizada por la

b-galactosidasa para generar

glucosa y galactosa

Alolactosa

Page 12: Universidad Nacional Autónoma de México · 2. Regulación genética en eucariontes 2.1. Conocerá el papel de la cromatina y de los nucleosomas en la regulación genética. X 2.2.

La b-galactosidasa se encuentra en niveles muy bajos dentro de la célula si no hay lactosa en el medio.

Su producción se induce cuando se agrega lactosa al medio y se elimina la glucosa de éste.

La síntesis de la b-galactosidasa se

induce cuando hay lactosa en el medio

Page 13: Universidad Nacional Autónoma de México · 2. Regulación genética en eucariontes 2.1. Conocerá el papel de la cromatina y de los nucleosomas en la regulación genética. X 2.2.

En bacterias los genes están organizados

en operones por lo que la expresión es

coordinada

DNA

RNA polimerasa

Page 14: Universidad Nacional Autónoma de México · 2. Regulación genética en eucariontes 2.1. Conocerá el papel de la cromatina y de los nucleosomas en la regulación genética. X 2.2.

P: promotor de los genes estructurales E1, E2, E3 y E4

R: gen regulador (codifica una proteína represora que

regula la transcripción de los genes estructurales)

O: operador (secuencia reconocida por la proteína

represora que impide la transcripción)

Componentes de un operón

Un operón es un conjunto de genes, localizados contiguamente en el DNA, que obedece a las mismas señales de encendido o apagado.

DNA

RNA polimerasa

Page 15: Universidad Nacional Autónoma de México · 2. Regulación genética en eucariontes 2.1. Conocerá el papel de la cromatina y de los nucleosomas en la regulación genética. X 2.2.

Los operones están formados por genes

estructurales y una región de control

Galactosidasa Permeasa Transacetilasa

Page 16: Universidad Nacional Autónoma de México · 2. Regulación genética en eucariontes 2.1. Conocerá el papel de la cromatina y de los nucleosomas en la regulación genética. X 2.2.

El represor unido al sito operador

previene la transcripción de los

genes z, y, a

Cuando no hay lactosa en el medio,

el operón lac está apagado

Page 17: Universidad Nacional Autónoma de México · 2. Regulación genética en eucariontes 2.1. Conocerá el papel de la cromatina y de los nucleosomas en la regulación genética. X 2.2.

El Operon lac se activa para poder

utilizar a la lactosa como fuente de

carbono

Genes estructurales

Gen regulador

Page 18: Universidad Nacional Autónoma de México · 2. Regulación genética en eucariontes 2.1. Conocerá el papel de la cromatina y de los nucleosomas en la regulación genética. X 2.2.

Normalmente, hay una expresión baja del

operón lac lo que permite que haya un poco

de b-galactosidasa en la célula

Page 19: Universidad Nacional Autónoma de México · 2. Regulación genética en eucariontes 2.1. Conocerá el papel de la cromatina y de los nucleosomas en la regulación genética. X 2.2.

La lactosa es convertida a alolactosa

por la b galactosidasa. La alolactosa

es el inductor del operón lac.

Page 20: Universidad Nacional Autónoma de México · 2. Regulación genética en eucariontes 2.1. Conocerá el papel de la cromatina y de los nucleosomas en la regulación genética. X 2.2.

La activación del operón lac requiere, además de que el represor se despegue del operador, la

participación de un activador: CRP o CAP

Activador CRP. cAMP receptor protein

También se le llama CAP: Catabolite Activator Protein.

Si los niveles de glucosa son altos, hay poco cAMP.

Si los niveles de glucosa son bajos, hay mucho cAMP.

CRP une cAMP

Este activador regula la expresión con base en los niveles de glucosa presentes en el sistema

Page 21: Universidad Nacional Autónoma de México · 2. Regulación genética en eucariontes 2.1. Conocerá el papel de la cromatina y de los nucleosomas en la regulación genética. X 2.2.

Cuando los niveles de cAMP se incrementan, éste se une a la CRP

El complejo CRP-cAMP se une al promotor del operón de lactosa y causa un giro en el DNA que facilita la unión de la RNA

polimerasa al promotor, activándolo.

Page 22: Universidad Nacional Autónoma de México · 2. Regulación genética en eucariontes 2.1. Conocerá el papel de la cromatina y de los nucleosomas en la regulación genética. X 2.2.

El complejo CRP-cAMP se une al promotor del operón de

lactosa facilitando la unión de la RNA polimerasa al

promotor e incrementando 50 veces la transcripción

Page 23: Universidad Nacional Autónoma de México · 2. Regulación genética en eucariontes 2.1. Conocerá el papel de la cromatina y de los nucleosomas en la regulación genética. X 2.2.

RNApol

No se transcribe

¿Cómo se regula el operón lac cuando hay

glucosa en el medio?

Regulación

negativa

Represor

+ glucosa– lactosa

Page 24: Universidad Nacional Autónoma de México · 2. Regulación genética en eucariontes 2.1. Conocerá el papel de la cromatina y de los nucleosomas en la regulación genética. X 2.2.

Regulación del operón de lactosa

Regulación Negativa

Cuando hay glucosa y no hay lactosa, el represor está activo y el operón está apagado, no hay transcripción y no hay bgalactosidasa

Page 25: Universidad Nacional Autónoma de México · 2. Regulación genética en eucariontes 2.1. Conocerá el papel de la cromatina y de los nucleosomas en la regulación genética. X 2.2.

+ glucosa+ lactosa

Debido a la presencia de lactosa el represor se inactiva, por lo

que el operón se transcribe, aunque a un nivel bajo (transcripción

basal).

¿Qué le pasa al operón lac en

presencia de lactosa aún cuando

exista glucosa?

inductor (lactosa)

La célula prefiere usar la glucosa que otro azúcar

RNApol

Page 26: Universidad Nacional Autónoma de México · 2. Regulación genética en eucariontes 2.1. Conocerá el papel de la cromatina y de los nucleosomas en la regulación genética. X 2.2.

Cuando hay lactosa y hay glucosa los niveles de cAMP son bajos. La síntesis del mRNA lac es pobre.

Page 27: Universidad Nacional Autónoma de México · 2. Regulación genética en eucariontes 2.1. Conocerá el papel de la cromatina y de los nucleosomas en la regulación genética. X 2.2.

Regulación

positivaLa transcripción es alta

Activador

¿Qué le pasa al operón lac

cuando hay lactosa en el medio y

no hay glucosa?- glucosa+ lactosa

Page 28: Universidad Nacional Autónoma de México · 2. Regulación genética en eucariontes 2.1. Conocerá el papel de la cromatina y de los nucleosomas en la regulación genética. X 2.2.

Regulación positiva.

Inducción.

Cuando hay lactosa y la glucosa es baja, los niveles de cAMP son altos. El cAMP se une con la CRP que activa a la RNApol

para transcribir al operón lac. Por lo tanto, se sintetiza mucho mRNA lac.

Page 29: Universidad Nacional Autónoma de México · 2. Regulación genética en eucariontes 2.1. Conocerá el papel de la cromatina y de los nucleosomas en la regulación genética. X 2.2.

- glucosa- lactosa

¡No hay transcripción!

¿Qué le pasa al operón lac cuando no

hay glucosa ni tampoco lactosa?

Como el represor está unido al promotor

RNApol

Aunque los niveles de cAMP sean altos y el activador esté presente....

Page 30: Universidad Nacional Autónoma de México · 2. Regulación genética en eucariontes 2.1. Conocerá el papel de la cromatina y de los nucleosomas en la regulación genética. X 2.2.

Regulación negativa

En presencia de lactosa y ausencia de glucosa

En presencia de glucosa y ausencia de lactosa

Page 31: Universidad Nacional Autónoma de México · 2. Regulación genética en eucariontes 2.1. Conocerá el papel de la cromatina y de los nucleosomas en la regulación genética. X 2.2.

Regulación positiva

[glucosa]

[AMPc]

+ lactosa

Page 32: Universidad Nacional Autónoma de México · 2. Regulación genética en eucariontes 2.1. Conocerá el papel de la cromatina y de los nucleosomas en la regulación genética. X 2.2.

Represión por catabolito del operón lac(Elección del mejor azúcar a metabolizar)

CAP= Catabolite activator protein

Activación del operón lac

Prefiere glucosa sobre otros

azúcares

Page 33: Universidad Nacional Autónoma de México · 2. Regulación genética en eucariontes 2.1. Conocerá el papel de la cromatina y de los nucleosomas en la regulación genética. X 2.2.

El operador actúa en cis y regula a los genes que

están ligados, adyacentes a éste

Page 34: Universidad Nacional Autónoma de México · 2. Regulación genética en eucariontes 2.1. Conocerá el papel de la cromatina y de los nucleosomas en la regulación genética. X 2.2.

El gen I actúa en trans

El gen I codifica una proteína que actúa reconociendo al operador (represor), por lo que el gen I no necesita estar al lado de un operador para regularlo.

Page 35: Universidad Nacional Autónoma de México · 2. Regulación genética en eucariontes 2.1. Conocerá el papel de la cromatina y de los nucleosomas en la regulación genética. X 2.2.

Secuencia del operador lac al que se une el

represor I

Sitio del promotor lac al que se une CAP

Page 36: Universidad Nacional Autónoma de México · 2. Regulación genética en eucariontes 2.1. Conocerá el papel de la cromatina y de los nucleosomas en la regulación genética. X 2.2.

• Operón lac, operón inducible, la presencia de una sustanciaespecífica (en este caso la lactosa) induce la transcripción de losgenes estructurales.

• Operón lac también se encuentra bajo control positivo. Cuando en elmedio hay glucosa, la bacteria metaboliza este monosacáridoignorando cualquier otra fuente de carbono disponible. Cuanto menores la concentración de glucosa en el medio, mayor es laconcentración de cAMP, el cual tiene influencia en la activación deloperón lac.

• El cAMP actúa uniéndose a una proteína que une cAMP denominadaCAP (proteína activadora por catabolito). Cuando la concentración deeste complejo es alta (poca glucosa), el CAP-cAMP se fija a un sitioespecífico del promotor lac, aumentando la afinidad de la regiónpromotora por la RNA polimerasa, lo que estimula la transcripción deloperón.

• Para que se exprese el operón lac deben darse dos condiciones en el medio: que esté presente la lactosa y que la concentración intracelular de glucosa sea baja.

Regulación del Operón lac

Page 37: Universidad Nacional Autónoma de México · 2. Regulación genética en eucariontes 2.1. Conocerá el papel de la cromatina y de los nucleosomas en la regulación genética. X 2.2.

Operón de triptófanoEste operón incluye cinco genes de enzimas involucradas en la biosíntesis de triptófano. Bajo control del promotor (Ptrp) y del operador (Otrp).

En este sistema los genes se están transcribiendo activamente, cuando no hay triptófano en el medio.

Page 38: Universidad Nacional Autónoma de México · 2. Regulación genética en eucariontes 2.1. Conocerá el papel de la cromatina y de los nucleosomas en la regulación genética. X 2.2.

En este sistema el represor es inactivo, no se une al operador a menos que una molécula, el co-represor, se una a él.

El co-represor es el triptófano el cual se une al represor y forma un complejo activo que se une al operador reduciendo la transcripción 70 veces aproximadamente.

Page 39: Universidad Nacional Autónoma de México · 2. Regulación genética en eucariontes 2.1. Conocerá el papel de la cromatina y de los nucleosomas en la regulación genética. X 2.2.

El Operón Trp

De manera normal, Escherichia coli está expresando su operón Trp. En este caso el represor codificado por el gen regulador, es inactivo.

Sin triptófano en

el medio

Page 40: Universidad Nacional Autónoma de México · 2. Regulación genética en eucariontes 2.1. Conocerá el papel de la cromatina y de los nucleosomas en la regulación genética. X 2.2.

Regulación negativa

Complejo Represor-Corepresor

+ Triptófano en el medio

¿Qué ocurre cuando hay

triptófano en el medio?

El triptófano (correpresor) se une al represor, activándolo. Ahora el represor se puede unir al operador impidiendo la transcripción del operón trp.

Page 41: Universidad Nacional Autónoma de México · 2. Regulación genética en eucariontes 2.1. Conocerá el papel de la cromatina y de los nucleosomas en la regulación genética. X 2.2.

OPERÓN Lac OPERÓN Trp

Operón inducible, se expresa enpresencia de lactosa.

Operón reprimible, se expresaen ausencia de triptófano.

La lactosa es el inductor El triptófano es el co-represor

El represor se sintetiza en formaactiva uniéndose a su DNAblanco (operador lac).

El represor se sintetiza en formainactiva, se une a su DNA blancoen presencia del co-represor(trp).

Las enzimas codificadas por losgenes de este operón participanen un vía catabólica

Las enzimas codificadas por losgenes de este operón participanen un vía anabólica

Comparación entre Operón Lac y Operón Trp

Page 42: Universidad Nacional Autónoma de México · 2. Regulación genética en eucariontes 2.1. Conocerá el papel de la cromatina y de los nucleosomas en la regulación genética. X 2.2.

Regulación de la expresión

genética a nivel traduccional

Page 43: Universidad Nacional Autónoma de México · 2. Regulación genética en eucariontes 2.1. Conocerá el papel de la cromatina y de los nucleosomas en la regulación genética. X 2.2.

Atenuación del operón Trp

Se basa en la existencia de secuencias específicas en el mRNA policistrónico Trp, en la región 5’ del mRNA, que al ser traducidas por el ribosoma y dependiendo de la presencia de tRNATrp, pueden controlar la transcripción.

Page 44: Universidad Nacional Autónoma de México · 2. Regulación genética en eucariontes 2.1. Conocerá el papel de la cromatina y de los nucleosomas en la regulación genética. X 2.2.

En el operón de triptófano hay una región

atenuadora en la que dos codones para Trp se

encuentran muy juntos

Cuando los niveles de Trp son altos, el ribosoma traduce rápidamente el mRNA incluyendo los dos codones de Trp. Esto favorece la formación de un tallo-asa que provoca la terminación de la transcripción.

Cuando los niveles de Trp son bajos, el ribosoma se detiene en los codones de Trp, por lo que no se forma el tallo-asa y la transcripción continua.

Page 45: Universidad Nacional Autónoma de México · 2. Regulación genética en eucariontes 2.1. Conocerá el papel de la cromatina y de los nucleosomas en la regulación genética. X 2.2.

Mecanismo de atenuación

Se inhibe la transcripción y traducción del resto del operón

+ triptófano tRNA-Trp El ribosoma NO se detiene

Se basa en la presencia de 4 secuencias invertidas repetidas en el mRNA capaces de formar tallos-asa que pueden pausar la traducción y la transcripción.

En presencia de trp hay mucho tRNAtrp

por lo que la traducción es rápida, esto hace que se forme un tallo-asa en la región 3-4 que bloquea la transcripción.

Page 46: Universidad Nacional Autónoma de México · 2. Regulación genética en eucariontes 2.1. Conocerá el papel de la cromatina y de los nucleosomas en la regulación genética. X 2.2.

La transcripción y traducción del resto del operón se lleva a cabo

Mecanismo de atenuación

– triptófano tRNA-Trp El ribosoma SE DETIENE

En ausencia de trp hay poco tRNAtrp

por lo que la traducción es lenta. Esto hace que se forme un pasador en la región 2-3 que permite que la transcripción del resto del operón continúe.

Page 47: Universidad Nacional Autónoma de México · 2. Regulación genética en eucariontes 2.1. Conocerá el papel de la cromatina y de los nucleosomas en la regulación genética. X 2.2.

Regulación del operón trp

Page 48: Universidad Nacional Autónoma de México · 2. Regulación genética en eucariontes 2.1. Conocerá el papel de la cromatina y de los nucleosomas en la regulación genética. X 2.2.

Regulación por posición del gen

en el operón

Traducción más eficiente Traducción menos eficiente

Regulación por Shine-Dalgarno

Traducción más eficiente

Traducción menos eficiente