U0256 Curs: Introducció al programa estadístic R com a...
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Primera sesion en RElementos principales de R
U0256 Curs: Introduccio al programa
estadıstic R com a eina docent. R en la
practica 1
Jose Antonio Palazon Palazon FerrandoDpto. Ecologıa e Hidrologıa
Universidad de Murcia
ICE–U. Lleida, 24 y 25 de Octubre de 2006
[email protected] U0256. R eina docent: en la practica, 1
ContenidosInstalando R
Primera sesion en RElementos principales de R
1 Instalando REn WinXXEn linux
2 Primera sesion en REl arranqueExpresionesFunciones
3 Elementos principales de RAyuda y documentacionVariablesDatos y resultadosObjetos
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Primera sesion en RElementos principales de R
En WinXXEn linux
La pagina principal de R → CRAN
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En WinXXEn linux
Seleccion de mirror
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En WinXXEn linux
Seleccion de sistema operativo
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En WinXXEn linux
Seleccion → base
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En WinXXEn linux
Seleccion del fichero autoinstalable
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En WinXXEn linux
Opciones en la instalacion
Seleccion del idioma (espanol, catalan, . . . )
Seleccion de componentes/perfil de instalacion
Una sola ventana/ventanas separadas
Formato de ayuda: texto plano, html o windows
Tipo de conexion a internet
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En WinXXEn linux
Ligeras variaciones en las distros
Para debian, ubuntu, knoppix, . . .apt-get install r-base-core
Madrake, suse, redhat, vinelinux, . . .
Las distros desarrollan sus propios paquetes de instalacion.
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El arranqueExpresionesFunciones
Desde . . .
winXX linux
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El arranqueExpresionesFunciones
En winXX
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El arranqueExpresionesFunciones
En linux
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El arranqueExpresionesFunciones
Expresiones y operadores
> 3 + 3
[1] 6
> 1:7
[1] 1 2 3 4
[5] 5 6 7
> 1:3^2
[1] 1 2 3 4
[5] 5 6 7 8
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> (1:3)^2
[1] 1 4 9
> 3 > 2
[1] TRUE
> 3 < 2
[1] FALSE
> exp(1)
[1] 2.718282
> round(exp(1),2)
[1] 2.72
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El arranqueExpresionesFunciones
Expresiones y operadores
> 3 + 3
[1] 6
> 1:7
[1] 1 2 3 4
[5] 5 6 7
> 1:3^2
[1] 1 2 3 4
[5] 5 6 7 8
[9] 9
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> 3 > 2
[1] TRUE
> 3 < 2
[1] FALSE
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[1] 2.718282
> round(exp(1),2)
[1] 2.72
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El arranqueExpresionesFunciones
Expresiones y operadores
> 3 + 3
[1] 6
> 1:7
[1] 1 2 3 4
[5] 5 6 7
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[1] 1 2 3 4
[5] 5 6 7 8
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[1] 2.718282
> round(exp(1),2)
[1] 2.72
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Expresiones y operadores
> 3 + 3
[1] 6
> 1:7
[1] 1 2 3 4
[5] 5 6 7
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[5] 5 6 7 8
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[1] 2.718282
> round(exp(1),2)
[1] 2.72
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Expresiones y operadores
> 3 + 3
[1] 6
> 1:7
[1] 1 2 3 4
[5] 5 6 7
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[1] 1 2 3 4
[5] 5 6 7 8
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[1] 2.718282
> round(exp(1),2)
[1] 2.72
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Expresiones y operadores
> 3 + 3
[1] 6
> 1:7
[1] 1 2 3 4
[5] 5 6 7
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[5] 5 6 7 8
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[1] 2.718282
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[1] 2.72
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Expresiones y operadores
> 3 + 3
[1] 6
> 1:7
[1] 1 2 3 4
[5] 5 6 7
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[1] 1 2 3 4
[5] 5 6 7 8
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[1] 1 4 9
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[1] TRUE
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[1] 2.72
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El arranqueExpresionesFunciones
Expresiones y operadores
> 3 + 3
[1] 6
> 1:7
[1] 1 2 3 4
[5] 5 6 7
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[1] 1 2 3 4
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[1] 2.718282
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[1] 2.72
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El arranqueExpresionesFunciones
Expresiones y operadores
> 3 + 3
[1] 6
> 1:7
[1] 1 2 3 4
[5] 5 6 7
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[1] 2.718282
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[1] 2.72
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El arranqueExpresionesFunciones
Expresiones y operadores
> 3 + 3
[1] 6
> 1:7
[1] 1 2 3 4
[5] 5 6 7
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[1] 1 2 3 4
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[1] 2.718282
> round(exp(1),2)
[1] 2.72
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El arranqueExpresionesFunciones
Expresiones y operadores
> 3 + 3
[1] 6
> 1:7
[1] 1 2 3 4
[5] 5 6 7
> 1:3^2
[1] 1 2 3 4
[5] 5 6 7 8
[9] 9
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[1] 1 4 9
> 3 > 2
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[1] FALSE
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[1] 2.718282
> round(exp(1),2)
[1] 2.72
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El arranqueExpresionesFunciones
Expresiones y operadores
> 3 + 3
[1] 6
> 1:7
[1] 1 2 3 4
[5] 5 6 7
> 1:3^2
[1] 1 2 3 4
[5] 5 6 7 8
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[1] 1 4 9
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[1] 2.718282
> round(exp(1),2)
[1] 2.72
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Expresiones y operadores
> 3 + 3
[1] 6
> 1:7
[1] 1 2 3 4
[5] 5 6 7
> 1:3^2
[1] 1 2 3 4
[5] 5 6 7 8
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[1] 2.718282
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[1] 2.72
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Expresiones y operadores
> 3 + 3
[1] 6
> 1:7
[1] 1 2 3 4
[5] 5 6 7
> 1:3^2
[1] 1 2 3 4
[5] 5 6 7 8
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[1] 2.718282
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[1] 2.72
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Expresiones y operadores
> 3 + 3
[1] 6
> 1:7
[1] 1 2 3 4
[5] 5 6 7
> 1:3^2
[1] 1 2 3 4
[5] 5 6 7 8
[9] 9
> (1:3)^2
[1] 1 4 9
> 3 > 2
[1] TRUE
> 3 < 2
[1] FALSE
> exp(1)
[1] 2.718282
> round(exp(1),2)
[1] 2.72
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Expresiones y operadores
> 3 + 3
[1] 6
> 1:7
[1] 1 2 3 4
[5] 5 6 7
> 1:3^2
[1] 1 2 3 4
[5] 5 6 7 8
[9] 9
> (1:3)^2
[1] 1 4 9
> 3 > 2
[1] TRUE
> 3 < 2
[1] FALSE
> exp(1)
[1] 2.718282
> round(exp(1),2)
[1] 2.72
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El arranqueExpresionesFunciones
Operadores
+,−, ∗, / suma, resta, producto, cociente
% %, %/ %, ˆ modulo, cociente entero, potencia
==, ! =, ! igual, distinto, no
>,>=, <, <= mayor que, mayor o igual que, menorque, menor o igual que
|, ||, &, && o, o, y, y
: generar una serie
% ∗ % producto de dos [email protected] U0256. R eina docent: en la practica, 1
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El arranqueExpresionesFunciones
Funciones a discrecion (Base de v2.4.0: 2345)
c() Concatenar los elementos que se indi-can, separados por comas.
seq() Generar una secuencia numerica.rep() Generar un conjunto de valores repe-
tidos.t() Transponer una matriz.sqrt() Raız cuadradaabs() Valor absolutosin(), cos() ... Funciones trigonometricaslog(), exp() Logaritmo y exponencialround() Redondeo de valores numericosls() Relacion de objetos disponiblesrm() Elimina uno o varios objetosfor(), while() Evalua una o un conjunto de expresio-
nes repetitivamenteif(), ifelse() Evalua una expresion condicionalmen-
te
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Ayuda y documentacionVariablesDatos y resultadosObjetos
Funciones de ayuda
help.start()
help() o ? help(mean), ?mean, ?":"
apropos() apropos("plot"), aporpos("[a-Z]")
find() find(x)
library() library(), library(help=base)
demo() demo(), demo(graphics)
data() data()
example() example(persp),example(lm)
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Primera sesion en RElementos principales de R
Ayuda y documentacionVariablesDatos y resultadosObjetos
Elementos de la ayuda
mean package:base Documentation
Arithmetic Mean
Description:Generic function for the
(trimmed) arithmetic mean.
Usage
Arguments
Value
References
See Also
Examples
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Primera sesion en RElementos principales de R
Ayuda y documentacionVariablesDatos y resultadosObjetos
Nombre de variables
Una variable se representa por un nombre
Cada variable contiene un objeto
Los nombres legales se inician por una letra o un punto
R es sensible a mayusculas
Puede utilizarse en los nombre digıtos numericos o “ ”
Deben evitarse nombres coincidentes con funciones
Ejemplos: a, A, resultados, result.rl, a33 dos,
.dat, ...
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Primera sesion en RElementos principales de R
Ayuda y documentacionVariablesDatos y resultadosObjetos
Asignacion de expresiones a variables
<- asigna a una variable, a la izquierda, la expresion de laderecha: a<-3
-> realiza la asignacion situando la expresion a laizquierda y la variable a la derecha: 3->a
Puede sustituirse la primera con el signo “=”: a=3
Puede hacerse asignaciones dobles: 3->a->b; a<-3->b
Un calculo intermedio puede ser asignado a una variable:x<-sqrt(d<-b^2-4*a*c)
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Primera sesion en RElementos principales de R
Ayuda y documentacionVariablesDatos y resultadosObjetos
Lectura de datos
scan()
read.table()
file, header = FALSE, sep = , quote = ”\′”,dec = ".", row.names, col.names,
as.is = FALSE, na.strings = "NA",
colClasses =~NA, nrows = −1, skip = 0,
check.names = TRUE, fill = !blank.lines.skip,
strip.white = FALSE, blank.lines.skip = TRUE,
comment.char = "#", allowEscapes = FALSE
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Primera sesion en RElementos principales de R
Ayuda y documentacionVariablesDatos y resultadosObjetos
Vectores, matrices y arrays
Las variables representan objetos y estos puede sercomplejos
Los vectores son un caso sencillo: un conjunto ordenadode valores
Los elementos del vector, xi , se escriben en R incluyendoentre corchetes el subındice, x[i]
Las matrices son tambien conjuntos ordenados de valorespero cosiderando dos dimensiones, xi ,j que se anotan porx[i,j].
R en general utiliza estructuras llamadas arrays con ndimensiones.
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Primera sesion en RElementos principales de R
Ayuda y documentacionVariablesDatos y resultadosObjetos
Manejo de subındices en vectores
Si x, es un vector, tanto x x[], representan a todos losvalores. Tambien: x[1:length(x)]
Si deseamos asignar un conjunto de valores a x
utilizamos: x<-c(3,9,2,...,6,8)
Si deseamos seleccionar un subcojunto de x:
x[1], el primer elemento de x.x[-1], los elementos de x excluyendo el primero.x[1:5], los 5 primeros elementos de x.x[c(1,3,5)], los elementos primero, tercero y quintode x.x[x % %2==T], los elementos pares de x.
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Ayuda y documentacionVariablesDatos y resultadosObjetos
Manejo de subındices en matrices
El manejo de subındices en matrices es analogo al devectores.
Si x, es una matriz, se puede representar por x[], o por,x[,].
Si deseamos obtener subconjuntos de x:
x[,1], primera columna de la matriz.x[1,], primera fila de la matriz.x[1,1], primer elemento de la primera columna.x[1,1:3], elementos de la primera fila para lascolumnas 1 a 3.
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Ayuda y documentacionVariablesDatos y resultadosObjetos
Tipos de datos simples
Logicos: TRUE,FALSE,T,FEnteros: -10, 1, 1000, . . .Precision doble: -10.1, 6.02310e24, . . . , -Inf, Inf, NaNComplejos: 1+3i, 1+0i, 9i, . . .Caracter: ”Hola”, ”Febrero”, ”sin(x)”, ”pino”,
. . .Perdidos: Na
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Ayuda y documentacionVariablesDatos y resultadosObjetos
Tipos de datos compuestos
Vector conjunto ordenado de datos del mismotipo basico.
Array vector con atributo de dimension, esvalido cualquier numero de dimensio-nes.
Matriz es un array con dos dimensionesFactor Tipo especial de vector en el que se
codifican las clases.Lista conjunto de elementos que pueden ser
de distintos tipos.Estructura de datos mezcla de matriz y lista: data frames
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Ayuda y documentacionVariablesDatos y resultadosObjetos
Funcion read.table()
Supongamos un fichero ASCII, de nombre misdatos.dat
cuyo contenido es:X Y Z
a 1 2 3
b 4 5 6
c 7 8 9
d 10 11 12
Usaremos la siguiente instruccion para disponer los datos enuna matriz de nombre x:read.table("misdatos.dat")->x
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Ayuda y documentacionVariablesDatos y resultadosObjetos
Escritura de resultados
sikn()
write.table()
Librerıa xtable (LATEX y html)
system()
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Ayuda y documentacionVariablesDatos y resultadosObjetos
Un ejemplo de objeto
Un ejemplo: hist(rnorm(1000))->sim.hist
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Ayuda y documentacionVariablesDatos y resultadosObjetos
Nombres y elementos de un objeto
names(hist.norm)
[1] ”breaks” ”counts” ”intensities”[4] ”density” ”mids” ”xname”[8] ”equidist”
hist.norm$counts hist.norm$coun
hist.norm$co hist.norm$c
[ 1] 1 1 5 12 41
[ 6] 98 150 212 186 142
[11] 91 43 12 4 2
plot(hist.norm)
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