TESTS GENÉTICOS ASESORAMIENTO GENÉTICO OTRAS … · ebelosas, ataxia de Friedreich, Huntington,...

SERVICIOSTESTS GENÉTICOS

ASESORAMIENTO GENÉTICO OTRAS CONSULTAS MÉDICAS FORMACIÓN ESPECIALIZADA

RT10

0 2

5/03

/201

3

2/23

El Instituto de Biología Molecular y Celular (IBMC) de la Universidad de Porto es una Asociación sin fi nes de lucro, declarada de ‘utilidad pública’, y un Laboratorio Asociado al Ministerio de Ciencia y Tecnología (MCTES), vinculado a la Universidad de Porto. Entre los asociados al IBMC se encuentran: la Universidad de Porto, el Instituto de Ciencias Biomédicas Abel Salazar (ICBAS), la Cámara Municipal de Porto, entre otros. El IBMC fue constituido como un Centro de Investigación Multidisciplinar en diversas temáticas como: las enfermedades genéticas, las enfermedades infecciosas e inmunología, neurociencias, estrés y biología estructural. Con más de 30 grupos de investigación y con

número superior a los 400 investigadores, el Instituto fomenta la investigación básica que está en el origen de las aplicaciones de la biomedicina y la biotecnología. La mayoría de los investigadores principales están asociados a una de las cinco Facul-tades de la Universidad de Porto y a sus dos Hospitales Universitarios, así como a otras instituciones biomédicas nacionales y de investigación ambiental.

IBMC - Instituto de Biologia Molecular y Celular

“...asociación sin fi nes de lucro, declarada de ‘utilidad pública’...”

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El IBMC actúa en el sector de la Salud a través del Centro de Genética Predictiva e Preven-tiva (CGPP) en el área de los Tests Genéticos Moleculares, Consulta de Diagnóstico de enfermedades hereditarias y Dismorfología, con especial atención en las áreas de Neurología, Psiquiatría, Pediatría, Neurope-diatría, Oftalmología y Hematología y en el Asesoramiento Genético y Genética Predic-tiva para pacientes y familiares en riesgo de enfermedades hereditarias. La Dirección del CGPP, IBMC, está a cargo de Jorge Sequeiros, Médico Genetista y Profesor Catedrático de Genética Médica y de Genética Clínica del ICBAS, Universidad de Porto.

CALIDAD

El CGPP, IBMC, se encuentra en proceso

de Acreditación y ha implementado su Sistema de Gestión de Calidad, en corre-spondencia con las normas ISO9001:2008 e

ISO15189:2007, y con las “OECD Guide-lines For Quality Assurance in Molecular Genetic Testing” y el Marco Normativo nº 8835/2011, referente al Manual de Buenas Prácticas de Laboratorio (MBPL).

EVALUACIONES EXTERNAS DE LA CALI-

DAD

El CGPP realiza evaluación externa de la calidad de sus tests de genética molecular (EQAs), para los tests de ataxias espinocer-ebelosas, ataxia de Friedreich, Huntington, hemocromatosis, Charcot-Marie-Tooth y la enfermedad de Wilson, a través de la Euro-

pean Molecular Quality Genetics Network (EMQN)- que es el administrador de EQA para las ataxias dominantes (SCAs)- y participa en diversas redes y consorcios europeos en el área de la calidad de los tests genéticos.

CGPP - Centro de Genética Predictiva y Preventiva

“...Tests Genéticos Molecula-res, Consulta de Diagnósticode enfermedades hereditar-ias y Dismorfología...Ase-soramiento Genético y Gené-tica Predictiva...”

PERSONAL CLÍNICO Y TÉCNICO

El personal clínico del CGPP, IBMC, está com-puesto por Médicos Genetistas, Neurólogos, Neuropediatras, Hematólogos, Psiquiatras, Psicólogos Clínicos, Profesionales de Asesora-miento Genético, Enfermeros y Técnicos de Servicio Social. El personal técnico del CGPP, IBMC, está compuesto por Técnicos Superiores especial-izados en Genética Molecular.

Apoyo clínico en la selección y orientación de la investigación genética y en

la interpretación de los resultados de los tests genéticos.

Disponibilidad para la observación o discusión clínica de los pacientes

Consulta de Asesoramiento Genético de pacientes y familiares

Sesiones clínicas y discusión de casos clínicos en los hospitales

Apoyamos al Médico a través de nuestro personal clínico de Médicos Genetis-tas y otros especialistas

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Enseñanza pre y posgraduada, en colaboración con el ICBAS.

Tests genéticos

Biobanco para ADN, líneas celulares y otros productos biológicos.

Apoyo a la investigación básica y clínica especializada en enferme-dades genéticas en el IBMC.

Para pacientes y familiares en riesgo de enfermedades hereditarias.

Consulta de Diagnóstico

Servicios

De enfermedades genéticas, en particular en las áreas de Neurología, Pediatría, Neuropediatría y Hema-tología.

Consulta de Asesoramiento Genético

En particular en las áreas de Neu-rología, Pediatría, Neuropediatría y Hematología.

Formación científi ca, clínica y en competencias de labo-ratorio a profesionales de la salud.

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El Biobanco permite el almacenamiento de las muestras para análisis genéticos y/o de in-vestigación posteriores cuando sean posibles nuevos tests. Además, es posible establecer, mantener y preservar líneas celulares linfo-blastoides para estudios posteriores,investigación clínica, estudios funcionales y ensayos terapéuticos. La muestra restante es propiedad del pacien-te y se puede recoger en cualquier momento conforme a la petición del médico solicitante.

En los casos debidamente autorizados, aumenta la posibilidad de determinar el dia-gnóstico, fomenta la colaboración científi ca y permite un mayor conocimiento sobre el espectro de mutaciones característico de la población portuguesa y la variabilidad fenotípica asociada a estas enfermedades genéticas.

Coutinho P et al.: Survey of hereditary ataxias and spastic paraplegias in Portugal: a population-based prevalence study. Archives of Neurology (in press).

Loureiro JL, et al. :Autosomal dominant spastic paraple-gia: a review of 89 Portuguese families. Archives of Neurology (in press).

Barros J, et al.: Cerebellar ataxia, hemiplegic migraine and related phenotypes due to a CACNA1A missense mutation: 12 year follow-up of a large Portuguese family. Archives of Neurology doi:10.1001/jamaneu-rol.2013.591. (in press).

Paneque, M., Sequeiros, J., Skirton, H. Quality assess-ment of genetic counselling process in the context of presymptomatic testing for late-onset disorders: a thematic analysis of three review articles. Genet Test Mol Biomarkers 16(1): 36-45, 2012.

Martindale JE et al.: Spinocerebellar ataxias: an example of the challenges associated with genetic databases for dynamic mutations. Human mutation 33:1359-65, 2012.

García-Murias M et al.: ‘Costa da Morte’ ataxia is spino-cerebellar ataxia 36: clinical and genetic characteriza-tion. Brain 135:1423-35, 2012.

Ramos EM, et al.: Intergenerational instability in Hun-tington disease: extreme repeat changes among 134 transmissions. Movement disorders 27:583-585, 2012.

Pereira MC, et al.: Alu Elements Mediate Large SPG11 Gene Rearrangements: Further Spatacsin mutations. Genetics in Medicine 14:143-51, 2012.

Varga et al: Defi nitions of genetic testing in European legal documents. J Community Genet 3:125-141, 2012.

Sequeiros J, et al.: EMQN Best Practice Guidelines for molecular genetic testing of SCAs. European Journal of Human Genetics 18:1173-6, 2010.

Sequeiros J, et al: Large normal and reduced pen-etrance alleles in Huntington disease: instability in families and frequency at the laboratory, at the clinic and in the population. Clinical Genetics 78:381-7, 2010.

Gazulla J, et al.: Sensory neuronopathy in ataxia with oculomotor apraxia type 2. Journal of the Neurological Sciences 298:118-20, 2010.

Spears MD, et al: Ataxia and Progressive Encephalopa-thy in a 4-Year-Old Girl. Laboratory Medicine 41:5-9, 2010.

Pinto-Basto J, et al.: Scope of defi nitions of genetic test-ing: evidence from a EuroGentest survey. J Community Genet. 2010 Mar; 1:29-35.

Ponemos a su dis-posición un Biobanco para el almacenamen-to de muestras paraestudios posteriores

Continuamos elestudio genético en laetapa de investig-ación, siempre quese desee

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Usamos las metodologías queaseguran el diagnóstico molecularmás completo y preciso

La metodología aplicada refl eja la sensibili-dad del test; por lo tanto, mientras más sensi-ble el método o combinación de los métodos utilizados, más preciso es el diagnóstico

genético. Al mismo tiempo, menores serán los recursos empleados por el Hospital, con tests y exámenes complemetarios, para iden-tifi car el diagnostico preciso.

8/23

MLPA (multiplex ligation-dependant probe amplifi cation)Un ejemplo de la aplicación de esta metodología es el caso de la enfermedad de Parkinson juvenil PARK2, en que aproxi-madamente el 30% de los alelos mutados presenta grandes deleciones. Lo mismo se observa en el caso del gen SPG11 la forma de paraplejia recesiva más común en Portugal, en que deleciones de uno o varios exones representan aproximada-mente el 20% de los alelos mutados.TP-PCR

El empleo de esta metodología es particularmente importante para la SCA2 y SCA7 donde están descritas expansiones de gran tamaño, generalmente asociadas a casos con inicio de le enfermedad en etapas muy tempranas.

Secuenciación completa del gen (región codifi cante y regiones intrónicas de fl anqueo)

Secuenciar todo el gen aumenta la sensibili-dad del test, en detrimento de la pesquisade mutaciones más frecuentes que causa un aumento del número de tests no orientadose innecesarios. La pesquisa de las mutacio-nes más frecuentes teniendo como base lo descrito en la literatura, en la mayoría de las enfermedades, no representa el espectro mutacional de la población de pacientes portugueses.

Secuenciación completa del gen + MLPA(ex. SPG4, SPG11, NF1, PARK2, AOA1, AOA2)

El MLPA permite la identifi cación de grandes reajustes génicos (deleciones y/o duplicacio-

nes) en heterocigosis, que no son detectables por la técnica estándar de la secuenciación,ni generalmente por la pesquisa de mutacio-nes más frecuentes.La conjugación de la Secuenciación con MLPA permite un diagnóstico lo más com-pleto posible, a la luz de los conocimientos técnicos actuales.

Análise de Fragmentos + TP-PCR (ex. SCAs, HD)

En la pesquisa de expansiones oligonucle-otídicas, es crucial complementar el test genético con la técnica de TP-PCR y garan-tizar la detección de expansiones de gran tamaño, que pueden no ser ampliadas en el análisis de fragmentos tras PCR convencional.

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Servicios - Consultas Médicas

GENÉTICA MÉDICA

Diagnóstico de enfermedades hereditarias

Dismorfología

ASESORAMIENTO GENÉTICO

Asesoramiento a pacientes y familiares

Protocolo de test predictivo para enfermedades neu-rológicas de inicio tardío

Asesoramiento preconcepción

ASESORAMIENTO REPRODUCTIVO

De la adopción al Diagnóstico prenatal y Diagnóstico gené-

tico preimplantación

HEMATOLOGÍA NEUROLOGÍA NEUROPEDIATRÍA

La consulta de Genética Médica tiene como objetivo el diagnóstico y prevención de enfermedades genéticas, y está

indicada para la intervención en áreas como:

• pacientes o familiares con enfermedad hereditaria;• asesoramiento genético para parejas en edad reproductiva e historia familiar de enfermedades genéticas;• asesoramiento genético preconcepción para cualquier pareja en edad reproductiva (con o sin consanguinidad);• diagnóstico etiológico en menores con atraso en el desarrollo o síndromes dismórfi cos;• contribución para el diagnóstico molecular de enfermedades neurológicas degenerativas, del niño o del adulto;• sordera y ceguera con posibles causas genéticas;• utilidad e interpretación de los estudios genéticos en la etapa pre y posanalítica.

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Instrucciones generales

- Marcar cada tubo con nombre completo y fecha de nacimiento (DD/MM/AAAA) para una identifi -cación de manera inequívoca;- Las recogidas se deben siempre realizar en condiciones de estricta esterilidad, usando tubos (de vacuo, preferentemente) con EDTA;- Los tubos de sangre deben ser mantenidos y transportados a temperatura ambiente, en un plazo que no debe exceder las 48h;-La muestra de sangre debe ir acompañada de los documentos necesarios, incluyendo la propia hoja de solicitud, con identifi cación personal, información clínica y familiar y términos de consentimiento apropriados;- La muestra deberá ser debidamente acondicionada y (en caso de ser enviada por correo) el embalaje deberá indicar: “mantener a temperatura ambiente”; “urgente - material biológico perecible”; “sangre no infecciosa para uso de laboratorio”, con la dirección:

Centro Genética Preditiva e Preventiva (CGPP) | IBMC

R. do Campo Alegre, 823 | 4150-180 Porto, PORTUGAL

Muestras

Enviar vellosidades coriónicas o líquido amniótico y (idealmente) muestra desangre de cada progenitor (obligatorio: madre para exclusión de contami-nación materna; padre si está afectado o es portador)

Importante: Contactar previamente al laboratorio

Diagnóstico

TIPO DE TEST INDICACIONES

Condiciones de recogida y envío de las muestras

Adultos: 5-10mL de sangre en tubo con EDTA o 300-400uL de ADN (100ng/uL)

Niños: 2-5mL de sangre en tubo con EDTA

5-10mL de sangre en tubo con EDTA o 300-400uL de ADN (100ng/uL)

2 muestras de sangre recogidas en momentos diferentes

Implica consulta previa de Asesoramiento Genético

Presintomático

Prenatal

Tests Genéticos

12/23

TEST PLAZO (meses, máxº)

MÉTODO

ATAXIAS DOMINANTES

Enfermedad de Machado-Joseph/SCA3 (ATXN3)

SCA1 (ATXN1)

Deg. dentato-rubro-pálido-luisiana, DRPLA, (ATN1)

SCA2 (ATXN2)

SCA6 (CACNA1A)

SCA7 (ATXN7)

SCA5 (SPTBN2)

SCA8 (ATXN8)†

SCA10 (ATXN10)

SCA11 (TTBK2)

SCA12 (PPP2R2B)

SCA13 (KCNC3)

SCA14 (PRKCG)

SCA15 (ITPR1)†

SCA17 (TBP)

SCA18 (IFRD1)

SCA27 (FGF14)

ATAXIAS RECESIVAS

Ataxia de Friedreich, FRDA (FXN)

Ataxia con apraxia oculomotora, AOA1 (APTX)

Ataxia con apraxia oculomotora, AOA2 (SETX)

Ataxia espástica de Charlevoix-Saguenay, ARSACS (SACS)

Ataxia con défi cit vitamina E, AVED (TTPA)

Ataxia com défi cit de coenzima Q10 (CABC1)

Ataxia telangectasia, AT (ATM)

Abetalipoproteinemia, ABL (MTTP)

Ataxia esp. c/ neuropatia axonal (SCAN1) (TDP1)

SCA11 (SYT14)

ATAXIAS EPISÓDICAS, EA:

EA-1 / EA con mioquimias (KCNA1)

EA-2 (CACNA1A)

AF + TP-PCR

AF + TP-PCR

AF + TP-PCR

AF + TP-PCR

AF + TP-PCR

AF + TP-PCR

Secuenciación

Análisis de fragmentos

AF + RP-PCR

Secuenciación

AF + TP-PCR

Secuenciación

Secuenciación

MLPA

AF + TP-PCR

Secuenciación

Secuenciación

AF + TP-PCR

Sec + MLPA

Sec + MLPA

Secuenciación

Secuenciación

Secuenciación

Sec + MLPA

Secuenciación

Secuenciación

Secuenciación

Sec + MLPA

Sec + MLPA

1

1

1

1

1

1

3

1

1

1,5

1

1,5

1,5

2

1

1,5

1,5

1

1,5

3

3

1,5

1,5

5

1,5

1,5

1,5

1,5

5

ALTERACIONES DE LA MIGRACIÓN NEURONAL

Polimicrogiria (GPR56)†

Heterotopia periventricular (FLNA)

Secuenciación

Sec + MLPA

2

3

ATAXIAS ESPINOCEREBELOSAS (SCAs)

13/23

ALTERAÇÕES DA MIGRAÇÃO NEURONAL

Lisencefalia (LIS1)†

Lisencefalia (DCX)

Lisencefalia (TUBA1A)†

Lisencefalia con ambigüedad genital (ARX)†

Lisencefalia tipo Norman-Roberts (RELN)†

Lisencefalia con hipoplasia cerebelosa (VLDLR)†

Sec + MLPA

Sec + MLPA

Secuenciación

Secuenciación

Secuenciación

Secuenciación

3

1,5

1,5

1,5

5

3

TEST MÉTODO

Paramiloidosis, PAF ATTR V30M (TTR Met 30)

Paramiloidosis, PAF, Secuenciación do gene TTR

Amiloidosis de tipo fi nlandés (GSN)

Apolipoproteína A1 (APOA1)

Cadena Alfa de fi brinógeno (FGA)

Lisozima (LYZ)

RFLP

Secuenciación

Secuenciación

Secuenciación

Secuenciación

Secuenciación

1,5

1,5

1,5

1,5

1,5

1,5

CADASIL - mutaciones más frecuentes (NOTCH3)

CADASIL - secuenciación completa (NOTCH3)

CARASIL (HTRA1)

Secuenciación

Secuenciación

Secuenciación

1,5

1,5

1,5

ENFERMEDAD DE ALZHEIMER FAMILIAR, AD:

AD3 (PSEN1)

AD4 (PSEN2)

AD1 (APP)

AD2 (ApoE)

DEMENCIA FRONTOTEMPORAL, DFT:

DFT y ALS (C9ORF72)

DFT con parkinsonismo, FTDP-17 (MAPT)

DFT - progranulina (PGRN)

DFT - valosina (VCP)

Demencia priónica (Creutzfeldt-Jacob) (PNRP)

Demencia con cuerpos de Lewy (SNCA, SNCB)

Sec + MLPA

Secuenciación

Sec + MLPA

Secuenciación

AF + RP-PCR

Sec + MLPA

Sec + MLPA

Secuenciación

Secuenciación

Secuenciación

1,5

1,5

3

1

1

1,5

1,5

1,5

1,5

1,5

Acondroplasia (FGFR3)

Displasia tanatofórica (FGFR3)

Hipocondroplasia(FGFR3)

Secuenciación

Secuenciación

Secuenciación

1,5

1,5

1,5

AMILOIDOSIS

CADASIL Y CARASIL

DEMENCIAS

DISPLASIAS ÓSEAS

PLAZO (meses, máxº)

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MÉTODO

Osteopetrosis (CLCN7)†

Osteogénesis imperfecta de tipo 1 (COL1A1, COL1A2)

Sec + MLPA

Sec + MLPA

3

3 a 5

Distonía de torsión, DYT1 (DYT1)

Distonía dopa-sensible, DYT5 (GCH1)

Distonía dopa-sensible AR; Sínd. Segawa (TH)

Distonía de torsión, DYT6 (THAP1)

Distonía mioclónica, DYT11 (SGCE)

Distonía mioclónica, DYT11 (DRD2)

Distonía-parkinsonismo, DYT12 (ATP1A3)

Discinesia paroxística induz. ejercicio, DYT18 (SLC2A1)

Discinesia paroxística cinesigénica (PRRT2)

Distonía-parkinsonismo infantil (SLC6A3)

Secuenciación

Sec + MLPA

Sec + MLPA

Secuenciación

Secuenciación

Sec + MLPA

Secuenciación

Sec + MLPA

Secuenciación

Secuenciación

1,5

1,5

1,5

1,5

1,5

1,5

1,5

1,5

1,5

1,5

Distrofi a facioescapulohumeral, FSHD (D4Z4)†

Distrofi a miotónica tipo 2 (ZNF9)†

Distrofi a muscular oculofaríngea (PABPN1)†

Enfermedad de Kennedy, SMBA (AR)†

Enfermedad de startle, Hiperecplexia hered. (GLRA1)†

Enfermedad de startle, Hiperecplexia hered. (GLRB)†

Enfermedad de startle, Hiperecplexia hered. (SLC6A5)†

Síndrome miasténicos congénito (CHRNE)

Síndrome miasténicos congénito (SCN4A)

PARÁLISIS PERIÓDICAS:

Parálisis periódica hipercaliémica (SCN4A)

Parálisis periódica hipocaliémica de tipo 1 (CACNA1S)

Parálisis periódica hipocaliémica de tipo 2 (SCN4A)

Síndrome de Andersen-Tawil (KCNJ2)

MIOTONÍAS NO DISTRÓFICAS :

Miotonía congén. (AD-Thomsen/AR-Becker) (CLCN1)

Paramiotonia congénita (SCN4A)

Miotonía del canal de sodio (SCN4A)

Southern-blot

AF

AF + Sec

AF + TP-PCR

Secuenciación

Secuenciación

Secuenciación

Secuenciación

Secuenciación

Secuenciación

Secuenciación

Secuenciación

Sec + MLPA

Sec + MLPA

Secuenciación

Secuenciación

2

2

2

1

2

2

2

1,5

3

3

3

3

1,5

1,5

3

3

DISTONÍAS Y DISCINESIAS

ENFERMEDADES NEUROMUSCULARES

DISPLASIAS ÓSEAS

Enfermedad de Huntington (HTT)

HUNTINGTON-LIKE, HDL:

AF + TP-PCR 1

ENFERMEDAD DE HUNTINGTON (HD) Y HD-LIKE

15/23


MÉTODO

Park1/4 (SNCA)

Park2 (PARK2)

Park5 (UCHL1)

Park6 (PINK1)

Park7 (DJ1)

Park8 (LRRK2)

Park9 (Sínd. Kufor-Rakeb) (ATP13A2)

Park15 (FBX07)

Sec + MLPA

Sec + MLPA

Secuenciación

Secuenciación

Secuenciación

Secuenciación

Secuenciación

Secuenciación

1,5

1,5

1,5

1,5

1,5

1,5

1,5

1,5

Enfermedad de Lafora (EPM2A, EPM2B)

Epilepsia mioclónica de Unverricht-Lundborg (CSTB)†

Epilepsia nocturna del lóbulo frontal AD, de tipo 1 (CHRNA4)†

Epilepsia nocturna del lóbulo frontal AD, de tipo 3 (CHRNB2)†

Epilepsia nocturna del lóbulo frontal AD, de tipo 4 (CHRNA2)†

Síndrome de Dravet (SCN1A); GEFS+ de tipo 2 (SCN1A)

GEFS+ de tipo 1 (SCN1B)

GEFS+ de tipo 3 (GABRG2)

GEFS+ de tipo 5 (GABRD)

GEFS+ de tipo 7 (SCN9A)

Cataplexia (HLA-DQB1*0602)†

Sec + MLPA


Secuenciación

Secuenciación

Secuenciación

Sec + MLPA

Secuenciación

Secuenciación

Secuenciación

Secuenciación

Secuenciación

1,5 a 3

2

3

3

3

3

1,5

1,5

1,5

3

2

ENFERMEDAD DE PARKINSON

EPILEPSIS

HDL1 (PRNP)

HDL2 (JPH3)

DRPLA (ATN1)

SCA17 / HDL4 (TBP)

Neuroferritinopatía (FTL)

Corea benigna (NKX2-1/TITF1)

Neuroacantocitosis (VSP13A)

AF


AF + TP-PCR

AF + TP-PCR

Secuenciación

Secuenciación

Secuenciación

1

1

1

1

1,5

1,5

5

DOENÇA DE HUNTINGTON (HD) E HD-LIKE

Enfermedad de Wilson, WD (ATP7B) Sec + MLPA 1,5

ENFERMEDAD DE WILSON

FHM1 (CACNA1A)

FHM2 (ATP1A2)

FHM3 (SCN1A)

Sec + MLPA

Secuenciación

Sec + MLPA

5

1,5

3

MIGRAÑA HEMIPLÉJICA FAMILIAR

16/23


MÉTODO

ALS DOMINANTES:

ALS1 (SOD1)

ALS4, juvenil (SETX)

ALS6 (FUS/TLS)

ALS8, SMA de tipo Finkel (VAPB)

ALS9 (ANG)

ALS10 (TARDBP)

ALS y Demencia Frontotemporal (C9ORF72)

ALS RECESIVAS:

ALS2 (ALS2)

ALS ligada al gen de SPG11 (SPG11)

ALS ligada al gen de SPG20 (SPG20)

Secuenciación

Sec + MLPA

Secuenciación

Secuenciación

Secuenciación

Secuenciación

AF + RP-PCR

Secuenciación

Sec + MLPA

Secuenciación

1,5

3

1,5

1,5

1,5

1,5

1

3

3

1,5

Enfermedad de Pelizaeus-Merzbacher (PLP1)

Leucoencefalopatía con desaparición de sustancia blanca (EIF2B1)





Sec + MLPA

Secuenciación

Secuenciación

Secuenciación

Secuenciación

Secuenciación

1,5

1,5

1,5

1,5

1,5

1,5

NBIA1 - Distrofi a neuroaxonal juvenil; ex. S. de Hallervorden-Spatz (PANK2)

NBIA2A - Distrofi a neuroaxonal infantil; Doença de Seitelberger (PLA2G6)

NBIA2B - Distrofi a neuroaxonal atípica; Síndrome de Karak (PLA2G6)

NBIA3 - Neuroferritinopatía (FTL)

Sec + MLPA

Sec + MLPA

Sec + MLPA

Secuenciación

1,5

1,5

1,5

1,5

ESCLEROSIS LATERAL AMIOTRÓFICA

LEUCODISTROFIAS

NEURODEGENERESCÊNCIA COM ACUMULAÇÃO CEREBRAL DE FERRO

Esclerosis tuberosa (TSC1 y TSC2) Sec + MLPA 1,5 a 3

ESCLEROSIS TUBEROSA

NEUROPATÍA HEREDITARIA SENSIBLE A LA PRESIÓN, HNPP:

Deleción de PMP22

Secuenciación de PMP22

CHARCOT-MARIE-TOOTH (CMT)

MLPA

Secuenciación

1

1

NEUROPATÍAS HEREDITARIAS

17/23


MÉTODO

CMT DE TIPO 1, CMT1:

CMT1A (duplicación de PMP22)

CMT1B (MPZ)

CMT1C (LITAF)

CMT1D (EGR2)

CMT1E (PMP22)

CMT1F (NEFL)


CMT2A2 (MFN2)

CMT2B (RAB7A)

CMT2B1 (LMNA)

CMT2B2 (MED25)

CMT2D (GARS)

CMT2E (NEFL)

CMT2F (HSPB1)

CMT2I/2J (MPZ)

CMT2K (GDAP1)

CMT2L (HSPB8)

CMT2N (AARS)


CMT4A (GDAP1)

CMT4C (SH3TC2)

CMT4D (NDRG1)

CMT4E (EGR2)

CMT4F (PRX)

CMT LIGADO AL X, CMTX:

CMTX1 (GJB1)

Neuropatía hereditaria motora de tipo IIA (HSPB8)

Neuropatía hereditaria motora de tipo VB (BSCL2)

Neuropatía hereditaria motora distal de tipo IIB (HSPB1)

Neuropatía hereditaria motora de tipo VIIB (DCTN1)

Neuropatía hereditaria motora de tipo VA (GARS)

Neuropatía hereditaria sensitiva y autonómica de tipo 1A (SPTLC1)

Neuropatía hereditaria sensitiva y autonómica de tipo 1C (SPTLC2)

MLPA

Sec + MLPA

Secuenciación

Secuenciación

Secuenciación

Secuenciación

Sec + MLPA

Secuenciación

Sec + MLPA

Secuenciación

Secuenciación

Secuenciación

Secuenciación

Sec + MLPA

Secuenciación

Secuenciación

Secuenciación

Secuenciación

Secuenciación

Secuenciación

Secuenciación

Secuenciación

Sec + MLPA

Secuenciación

Secuenciación

Secuenciación

Secuenciación

Secuenciación

Secuenciación

Secuenciación

1

1,5

1,5

1,5

1,5

1,5

2

1,5

1,5

1,5

1,5

1,5

1,5

1,5

1,5

1,5

1,5

1,5

1,5

1,5

1,5

1,5

1,5

1,5

1,5

1,5

3

1,5

1,5

1,5

NEUROPATÍAS HEREDITARIAS

Neurofi bromatosis de tipo 1 (NF1) Sec + MLPA 5

NEUROFIBROMATOSIS

18/23


MÉTODO

SPGS DOMINANTES:

SPG3A (ATL1)

SPG4 (SPAST)

SPG6 (NIPA1)

SPG8 (KIAA0196)

SPG10 (KIF5A)

SPG13 (HSP60)

SPG17 (BSCL2)

SPG31 (REEP1)

SPG42 (SLC33A1)

SPGS RECESIVAS:

SPG5 (CYP7B1)

SPG7 (SPG7)

SPG11 (SPG11)

SPG15 (SPG15)

SPG20 (SPG20)

SPG21 (SPG21)

SPG39 (PNPLA6)

SPG48 (KIAA04151)

SPG LIGADA AL X:

SPG2 (PLP1)

Sec + MLPA

Sec + MLPA

Sequenciação

Secuenciación

Secuenciación

Secuenciación

Secuenciación

Sec + MLPA

Secuenciación

Secuenciación

Sec + MLPA

Sec + MLPA

Secuenciación

Secuenciación

Secuenciación

Secuenciación

Secuenciación

Sec + MLPA

1,5

1,5

1,5

3

3

1,5

1,5

1,5

1,5

1,5

3

3

1,5

1,5

1,5

1,5

1,5

1,5

Discondrosteose de Leri-Weill (SHOX)†

Síndrome cardio-facio-cutâneo (BRAF, CBL, KRAS, NRAS,MAP2K1, MAP2K2, PTPN11, RAF1, SHOC2, SOS1)

Síndrome de Costello (HRAS)

Síndrome de Carney (PRKAR1A)

Síndrome de Cohen (COH1)†

Síndrome de def. del transportador de glucosa, de tipos 1 e 2 (SLC2A1)

Síndrome de Ehlers-Danlos (COL3A1)†

Síndrome de Ehlers-Danlos (COL5A1, COL5A2)

Sec + MLPA

Secuenciación

Secuenciación

Secuenciación

Secuenciación

Sec + MLPA

Secuenciación

Secuenciación

2

1,5/gene

1,5

1,5

3

1,5

1,5

3

SÍNDROMES DISMÓRFICOS/RETRASO MENTAL

NF1-like / Síndrome de Legius (SPRED1)

Neurofi bromatosis de tipo 2 (NF2)

Schawnnomatose (SMARCB1)

Sec + MLPA

Sec + MLPA

Sec + MLPA

1,5

1,5

1,5

NEUROFIBROMATOSIS

PARAPLEJIAS ESPÁSTICAS HEREDITARIAS

19/23


MÉTODO

Síndrome de Gorlin (PTCH1)†

Síndrome de Marfan (FBN1)

Síndrome de Loeys-Dietz (TGFBR1, TGFBR2)

Síndrome de Noonan (KRAS, BRAF, NRAS, PTPN11, RAF1, SOS1)

Síndrome de Noonan (SOS1)

Síndrome de pterigium múltiple (CHRNA1)†

Síndrome de pterigium múltiple (CHRND)†

Síndrome de pterigium múltiple (CHRNG)†

Síndrome de Sotos (NSD1)

Síndrome de Stickler (COL2A1)†

Sindrome de Weill-Marchesani (AD) (FBN1)

Sindrome de Weill-Marchesani (AR) (ADAMTS10)†

Síndrome LEOPARD (BRAF)

Síndrome LEOPARD (PTPN11)

Síndrome LEOPARD (RAF1)

Síndrome macrocefalia-autismo (PTEN)

Secuenciación

Sec + MLPA

Secuenciación

Secuenciación

Secuenciación

Secuenciación

Secuenciación

Secuenciación

Sec + MLPA

Sec + MLPA

Sec + MLPA

Secuenciación

Secuenciación

Secuenciación

Secuenciación

Sec + MLPA

2

5

1,5 a 3

1,5/gene

3

3

3

3

3

3

5

3

1,5

1,5

1,5

1,5

Sordera congénita - conexina 26 (GJB2)

Sordera congénita - conexina 30 (GJB6)

Sordera congénita - deleciones (GJB2, GJB6, GJB3, POU3F4, WFS1)

Sordera congénita ligada al X (POU3F4)

Sordera cong. mitocondrial (MTRNR1, MTTS1 mut + freq)

Sordera congénita no-sindrómica, DFNB1 y DFNA3 (GJB2, GJB6)

Sordera congénita no-sindrómica, DFNA3 (GJB6)

Sordera congénita no-sindrómica, DFNB1 (GJB6)

Sordera congénita no-sindrómica, DFNB9 (OTOF)

Sordera congénita no-sindrómica, DFNB4 (SLC26A4)

Sec + MLPA

Sec + MLPA

MLPA

Sec + MLPA

Secuenciación

Sec + MLPA

Sec + MLPA

Sec + MLPA

Secuenciación

Sec + MLPA

1,5

1,5

1,5

1,5

1,5

1,5

1,5

1,5

5

1,5

SORDERA

SÍNDROMES DISMÓRFICOS/RETRASO MENTAL

Rett clásico (MECP2)†

Rett atípico (CDKL5)†

Variante congénita (FOXG1)†

Sec + RD-PCR

Secuenciación

Sec + MLPA

3

1,5

3

SÍNDROME DE RETT

Enfermedad de Rendu-Osler-Weber (ACVRL1)

Enfermedad de Rendu-Osler-Weber (ENG)

Enfermedad de Rendu-Osler-Weber (SMAD4)

Secuenciación

Secuenciación

Secuenciación

1,5

1,5

1,5

TELANGIECTASIAS HEREDITARIAS

20/23


MÉTODO

Hemocromatosis (HFE, C282Y; H63D; S65C)

Hemocromatosis juvenil - hepcidina (HAMP)

Hemocromatosis - secuenciación de gen HFE (HFE)

Hemocromatosis juvenil - hemojuvelina (HJV)

Hemocromatosis - ferroportina (SLC40A1)

Hemocromatosis (TFR2)

Hibridación

Secuenciación

Secuenciación

Secuenciación

Secuenciación

Secuenciación

1

1,5

1

1,5

1,5

1,5

Fibrosis quística (CFTR)

Fibrosis quística (mucoviscidosis) (CFTR)

Fibrosis quística (mucoviscidosis) (CFTR)

Defi ciencia de alfa1-antitripsina (SERPINA1)†

Defi ciencia de 21-hidroxilasa (CYP21A2)

MODY1 (HNF4A)†

MODY2 (GCK)†

MODY3 (HNF1A)†

Glaucoma juvenil (MYOC)†

Retinitis pigmentaria (RHO)†

Seudohipoaldosteronismo de tipo 1 (SCNN1A)†

Seudohipoaldosteronismo de tipo 1 (SCNN1B)†

Seudohipoaldosteronismo de tipo 1 (SCNN1G)†

Síndrome de Liddle (SCNN1B)†

Síndrome de Liddle (SCNN1G)†

Secuenciación

delF508

mutaciones + frec

Secuenciación

Sec + MLPA

Sec + MLPA

Secuenciación

Sec + MLPA

Secuenciación

Secuenciación

Secuenciación

Secuenciación

Secuenciación

Secuenciación

Secuenciación

3

1

1,5

2

1,5

2

2

2

2

3

2

2

2

2

2

† Ensayo a realizar en lab. subcontratado

Sec ou Secuenciación: secuenciación completa del gen (región codifi cante y regiones intrónicas fl anqueantes) MLPA: multiplex ligation-dependant probe amplifi cation para la detección de deleciones/duplicaciones AF + TP-PCR e AF + RP-PCR: análisis de fragmentos y TP-PCR / RP-PCR para la detección de expansiones nucelotídicas

Casos familiares: 1 mes (tiempo de resposta máxº) Tests presintomáticos: 1 mês (máxº), en caso de mutación(es) conocida (s)Tests prenatales: 1,5-3 semanas (máxº), en caso de mutación(es) conocida (s)

HEMOCROMATOSIS

OTROS ESTUDIOS

Anemia refractaria c/ def. hierro, IRIDA (TMPRSS6)

Anemia sideroblástica (ALAS2)

Secuenciación

Secuenciación

1,5

1,5

ANEMIAS

SERVICIOS COMPLEMENTARIOS:

Recogida de sangreExtracción de ADN y almacenamientoCultivos celulares

OTROS TESTS - CONTACTAR AL LABORATORIO

22/23

Colaboradores del CGPP son miembros de varios organismos nacionales e internaciona-les, entre los que se destacan los siguientes:

Presidencia de la Comisión Nacional de Genética Médica, Dirección-General de Salud, Ministerio de Salud

Presidencia de la Comisión de Ética de la Universi-dad de Porto

CNECV, Consejo Nacional de Ética para las Ciencias de la Vida

Dirección del Colegio de la Especialidad de Genética Médica, Orden de los Médicos

Dirección de la European Society of Human Genet-ics (ESHG)

PPPC (Public and Professional Policies Committee) e Education Committee de la ESHG

Equipo nacional de ORPHANET: the Portal for Rare Diseases and Orphan Drugs

Dirección del Programa Nacional de Test Predictivo y Asesoramiento Genético de la Enfermedad de Machado-Joseph y Otras Enfermedades Neurológicas de Inicio Tardío

Participación en OrganizacionesNacionales e Internacionales

EHDN - European Huntington Disease Network (co-ord. G.B. Landwehrmeyer)

EHDN Genetic Testing Group on Huntington Disease (coord. R. MacLeoad and A. Tibben)

HD-MAPS – HD Modifi ers in Age of Onset in Pairs of Siblings (coord. R. Myers)

SPATAX – Raiseau Européen de Ataxies et Paraplegies Spastiques (coord. A Dürr)

RIBERMOV – Ibero-American Multidisciplinary Net-work for the Study of Movement Disorders - Parkinson’s Disease and Spinocerebellar Ataxias (coord. A Matilla)

Eurogene – “a European reference portal for genetic medicine that brings together and catalogues a wide variety of multimedia learning resources produced by world-leading geneticists”

European Network of Genetic Nurses and CounsellorsWork-package leader do “EuroGenetest2 - Harmoni-zing Genetic Testing in Europe” (Network of Excelence do 7º Programa Quadro, da Comissão Europeia)

Organizador y tutor de “SCAbase – an evidence-based online resource in the fi eld of the spinocerebellar ataxias”

23/23

Equipo administrador de EQA (External Quality Assessment) para el diagnóstico genético molecularde las ataxias espinocerebelosas para EMQN (“The European Molecular Quality Genetics Network”)

Co-chair del Genetic Counsellors and Nurses Division del European Board of Medical Genetics

Colaboradores del CGPP, IBMC fueron miem-bros de otros organismos nacionales e internacionales, entre los que se destacan los siguientes:

Presidencia del Colegio de la Especialidad de Gené-tica Médica, Orden de los Médicos (OM)

Presidencia de la Comisión Nacional de Evaluación de Idoneidades Formativas para el Colegio de Gené-tica Médica, OM

Presidencia de la Sociedad Portuguesa de Genética Humana (SPGH)

Presidencia del Grupo de Trabajo para la creaciónde la Red de Referencia de Genética Médica,Dirección-General de Salud, Ministerio de Salud Dirección-General de Salud, Ministerio de Salud Coor-

dinación del Grupo de Trabajo de preparacióndel Decreto-Reglamentario de la Ley 12/2005,

Dirección-General de Salud, Ministerio de Salud Steer-ing Committee e work-package leader do “EuroGene-test- Harmonizing Genetic Testing in Europe”, Network of Excelence del VII Programa Marco, de la Comisión Europea

SAFE (Special Non-Invasive Advances in Fetal and Neonatal Evaluation), Network of Excelence do 7º Programa Quadro, de la Comisión Europea

Euro-Wilson, European Network on Wilson Disease

EASAC (European Academies Science Advisory Council) e FEAM (Federation of European Academies of Medicine) – “Working Group on Direct-to-Consumer Genetic Testing”

Genetic Testing Working Group, Comisión Europea

Organizador, EMQN Best Practice Meeting for Best Practice Guidelines for Molecular Genetic Testing of Spinocerebellar Ataxias

Coordinador, EMQN Best Practice Guidelines for Molecular Genetic Testing of Spinocerebellar AtaxiasGrupo Directivo para las OECD Guidelines For Qual-ity Assurance in Molecular Genetic Testing (OECD)

CGPP - Centro de Genética Predictiva y PreventivaIBMC - Instituto de Biologia Molecular y Celular

Rua do Campo Alegre, 823 | 4150-180 Porto, PORTUGALTel: +351 22 607 49 42 Fax: +351 22 600 29 23

[email protected]

TESTS GENÉTICOS ASESORAMIENTO GENÉTICO OTRAS … · ebelosas, ataxia de Friedreich, Huntington,...

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